徐州师范大学就实时荧光定量PCR仪、全自动凝胶成像系统、变性梯度凝胶电泳仪招标采购项目进行公开招标
提取鼠肠道内微生物基因组DNA的方法研究
提取鼠肠道内微生物基因组DNA的方法研究李丽婷;许文涛;郭星;姚业成;黄昆仑【摘要】通过改进鼠肠道微生物基因组DNA提取方法以期更全面地反映鼠肠道茵群的真实情况.采用CTAB和SDS结合的方法裂解细胞,同时改进了传统的酚/氯仿抽提方法,提取全过程控制在2 h以内.通过紫外分光光度计,细菌通用引物PCR,总菌群实时定量PCR,变性梯度凝胶电泳(DGGE)对改进方法及两种试剂盒法提取DNA的结果进行比较,评价了所建立的高效提取方法.与试剂盒相比,改进的方法DNA得率较高,简便快速,成本低廉.同时后续的PCR鉴定及DGGE菌群多样性分析显示,改进的方法可以更好地揭示鼠肠道菌群分布和特性.【期刊名称】《中国粮油学报》【年(卷),期】2010(025)001【总页数】6页(P122-127)【关键词】鼠肠道微生物;DNA提取方法;CTAB/SDS实时定量PCR;变性梯度凝胶电泳【作者】李丽婷;许文涛;郭星;姚业成;黄昆仑【作者单位】中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京,100083;中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京,100083;中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京,100083;中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京,100083;中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京,100083;中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京,100083;中国农业大学食品科学与营养工程学院,北京,100083【正文语种】中文【中图分类】Q-33鼠肠道内是一个复杂的生态体系,含有 500~1 000种细菌,总数高达 1013~1014,其包含的基因数目是自身基因组的 100倍[1]。
肠道微生物群落与宿主个体的健康和疾病状况息息相关,它不仅能降解食物中不可消化的营养成分、提供宿主维生素等营养物质,还能促进肠上皮细胞的分化与成熟、激活肠道免疫系统以及调节宿主能量存储与代谢[2]。
因此,越来越多的研究人员已经认识到肠道微生态研究的重要意义。
中温大曲在发酵和贮存过程中微生物群落结构分析
中温大曲在发酵和贮存过程中微生物群落结构分析唐贤华;田伟;张崇军;周文;舒学香【摘要】通过聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术解析中温大曲在不同发酵期和贮存期的微生物群落结构,获得表征中温大曲细菌和真菌群落结构的DGGE指纹图谱.结果表明,中温大曲细菌有19种,其中芽孢杆菌属(Bacillus)和乳酸菌属(Lactobacillus)均属于优势菌群;真菌共13种,其中根霉属(Rhizopus)和酵母属(Saccharomyces)均属于优势菌.大曲微生物总体的变化趋势是发酵开始时微生物数量较少,发酵中期(4~8 d)微生物数量达到顶峰,大量细菌和真菌旺盛繁殖,发酵后期(12 d)微生物群落逐渐减少并趋于稳定;贮存期内,微生物的种类的趋于平稳,数量变化较大.【期刊名称】《中国酿造》【年(卷),期】2019(038)006【总页数】6页(P113-118)【关键词】中温大曲;细菌;真菌;聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳【作者】唐贤华;田伟;张崇军;周文;舒学香【作者单位】四川工商职业技术学院,四川都江堰 611830;中国测试技术研究院,四川成都 610021;四川工商职业技术学院,四川都江堰 611830;四川工商职业技术学院,四川都江堰 611830;四川工商职业技术学院,四川都江堰 611830【正文语种】中文【中图分类】TS261.1我国传统白酒的酿造是依靠大曲中菌系的繁殖代谢而进行的[1]。
参与酿酒发酵的微生物种类很多,包括细菌、霉菌、酵母菌等。
追踪其来源,主要是大曲发酵过程中网罗自然界的微生物,因而通过研究大曲中的微生物,了解大曲中微生物数量、种类和分布规律,从而明白白酒的发酵原理是很有必要的[2-5]。
中温大曲是清香型大曲酒的糖化发酵剂,由于其发酵最高品温一般在50℃以下,故称中温大曲。
大曲的质量与培养、贮存过程有着密切的关系,主要体现在微生物的差异上,不同时期曲坯的微生物结构和数量有显著区别,影响着糖化酶、液化酶和蛋白酶等多种酶类以及有机酸等代谢产物的生成[6]。
运用生物信息学分析牛奶中细菌菌群
运用生物信息学分析牛奶中细菌菌群目前,对于环境中微生物菌群的研究主要分为培养和非培养的方法。
培养法是利用不同的选择性培养基结合生化反应鉴定细菌的种类。
该方法具有一定的针对性,但是费时耗力,且只能获得可培养微生物的信息,对于那些不可培养的细菌则无能为力[11-13]。
非培养的方法主要是通过分子生物学技术,直接从环境中提取细菌基因组DNA,再用分子生物学的方法进行分析研究,如聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PolymeraseChainReaction-DenaturingGradientGelElectrophoresis,PCR-DGGE)、核酸杂交(Hybridization)、高通量测序(High-throughputsequencing)等。
目前分析细菌的16SrRNA序列已经成为细菌菌种鉴定的金标准。
16SrRNA全长为1.5~1.6kb,包括9个高度可变区,其中V3区(nucleotides433-497)的位点456-479在细菌间的比对中获得最多的单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphisms,SNPs),能够鉴定110多种细菌[14]。
研究者已经利用16SrRNA-V3区结合PCR-DGGE、测序等技术对环境中的细菌进行鉴定及菌群分析研究[9,15],其中包括对牛奶中细菌的鉴定和菌群分析[11],并发现牛奶中存在多种细菌,具有较高的菌群多样性。
本研究中,我们从市售的常温牛奶和巴氏消毒牛奶中提取细菌基因组DNA,利用通用引物扩增牛奶中细菌的16SrRNA-V3区,荧光实时定量PCR测定样品中细菌总数;通过克隆、测序,获得16SrRNA-V3区的序列信息,再进行序列比对、鉴定菌种。
分析不同品牌牛奶中的细菌数量、菌群分布,推测生奶的奶源环境、储存时间及奶牛的健康情况。
1、材料和方法1.1材料与试剂1.1.1样品收集:从超市购买了4个品牌的5种牛奶,包括高温灭菌奶(常温保质期30天)和巴氏消毒牛奶(2℃~6℃保质期7天),分别标记为A、B、C、D、E。
基于16孔5通道的PCR仪光路系统研制
光纤 LED
光纤板 制冷片
PD
图 1 16 孔 5 通道 PD 架构光学系统 Fig.1 16-hole 5-channel PD architecture optical system
如图 1 所示是 PD 结构的光学系统 [3],由激发光系统 与检测光系统组成。激发光系统由 LED 灯、滤光片、光 纤组成,检测光系统由 PD、滤光片、光纤、多元镜组成。 选择激发波长范围 380nm ~ 780nm 的 LED 灯经过滤光 片传到前端光纤,到反应孔,经过光纤孔板上的荧光试 剂,再经过后端光纤、滤光片和镜头,最后 PD 将荧光
第 41 卷
数字技术与Байду номын сангаас用
对运放输出进行了分压,使单片机最大接收电压不超过 3V,满足各芯片对电压的需求。
2.3 PD 板设计 选用滨松品牌规格为 S6931,滨松生产的 PD 批次 间较好,还具有响应速度快、灵敏度高、噪声低的优点。 光谱响应范围为 320nm ~ 1000nm,暗电流只有 20pA, 上升时间 0.5us。 输出电流 IOUT=IDARK+IPD,IDARK 为 PD 感光电流,IPD 为暗电流(噪声)。光电二极管有两种工作模式,分别为 光伏、光电导,在光伏模式工作时,二极管无偏置,暗 电流可以达到最小 ;光电导模式工作时,需要施加一个 外部反向电压,可以提高响应速度。本文基于对光电二 极管的应用速度、暗电流的考虑,选择光电二极管在光 伏模式下工作。 3 光学下位机软件设计 光路板单片机上电初始化(开启时钟、ADC1 外设 6 通道使能,DMA1 将 AD 采集数据存储到指定内存、电 机复位等),判断是否接收到采光指令,没有收到继续等 待,如果收到正确信息启动电机运动、开始采集处理荧 光数据、电机运动一圈回到原点或者采光过程中复位超 时、电机超 3200 步,关闭电机、原点标志复位、处理好 光路和状态数据发送给中位机。 4 光路实验 对 PD 结构的光学系统进行光路实验,验证光学系 统能否工作。进行 5 色实验时,光学系统需要借助温度 控制模块、中位机(带液晶屏的平板),分别测试 5 个通 道 FAM、VIC、ROX、CY5、CY5.5 的 16 孔 位 数 据, 如表 1 所示。 测 试 4 个 通 道 FAM、VIC、ROX、CY5 的 A1、A4、 B5、B8 孔位数据、测试第五通道 CY5.5 的 A5、A8、B1、 B4 孔位数据。FAM 通道(测试 A1、A4、B5、B8 孔位): 3103-6706,扩增效率 :2.16 ;VIC 通道(测试 A1、A4、 B5、B8 孔 位 数 据 :3738-8288, 扩 增 效 率 :2.22 ;ROX 通道(测试 A1、A4、B5、B8 孔位):1997-9976,扩增效率 : 5.00 ;CY5 通道(测试 A1、A4、B5、B8 孔位):25438402,扩增效率 :3.30 ;CY5.5 通道(测试 A5、A8、B1、
分娩方式对新生儿后期肠道菌群的影响论文
section and
seven
born vaginally).Stool specimens were collected
on
the
28th day after birth and bacterial genomic DNA was extracted and examined by PCR
April to August in 20 1 3,thirty healthy urban full—term neonates in Nanj ing City were enrolled in the study, including fifteen exclusive breastfed ones(seven born of caesarean section and eight born vaginally)and fifteen mixed feeding ones(eight bom of
were
significantly lower than those born vaginally[9.71±4.27
VS
15.12±4.19,2.13±0.39
VS
2.61±0.32,both
D01:10.3760/cma.j.issn.1007—9408.2016.03.007
作者单位:210096南京,东南大学学习科学研究中心(钱丽娟、周冬蕊、蒋犁);210009南京,东南大学附 属中大医院儿科东南大学医学院(钱丽娟、谢佳丽、康树敏、蒋犁) 通信作者:蒋犁,Email:jiangli77777@126
C01TI
万方数据
中华围产医学杂志2016年3月第19卷第3期 P<O.05],but
无标题 - 徐州师范大学
经济学院 美术学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 生命科学学院 体育学院 体育学院 体育学院 体育学院 体育学院 体育学院 体育学院 物理与电子工程学院 物理与电子工程学院 物理与电子工程学院 物理与电子工程学院 物理与电子工程学院 物理与电子工程学院 物理与电子工程学院 物理与电子工程学院 物理与电子工程学院
仪器名称 天象仪 ARCGIS(软件) Supermap系列软件 电力自动化及继电保护 过程控制实验装置 过程控制实验装置 电力自动化及继电保护 物流系统 ERP软件 接收机 绘图仪 全站仪 GPS接收机 地下管线探测仪 全站仪 全站仪 全数字摄影测量系统 全数字摄影测量系统 一秒全站仪 电子水准仪 电子水准仪 5秒免棱镜全站仪 5秒免棱镜全站仪 全数字摄影测量系统 全数字摄影测量系统 遥感影像处理软件 GPS接收系统 全站仪 付里叶变换核磁共振 恒电位恒电流仪 气质联动仪 电子天平
56580 56580 1447837.86 62000 57000 51000 51000 51000 51000 170700 302700 200000 100000 100000 62280 241080.43 114698.54 88195.8 198370 90800 58000 415520 101760 51685.6 327860 363240.15 145517.45 74624 1770300 60840 67600 84500 65000
PE2400Ⅱ 365225.12 Tensor 27 164172.8 1100 185900 6.92 185900 Emrys TM Creator EXP 461370 TJ270-30A 81020 LC-1000 68000 LC-1000 68000 2010I 145567.2 FTIR-8101 110043.85 GBC932AA 375450.5 GC-14B 184780.33 CRY-2P 64989 CHI 660B 51739.5 TP511 105406 JDY-4 53360 19JPC 104550 XH-714 376000 HED-ZIS 70000 HED-ZIS 70000 QDS-1型 68000 802S+XK50 112000 INV306 120000 802S+CK06 88000 DSP-4300 65500 * 59400 DSP4000+DSP+FIK 72000 MG1420 103000 HZ-034 117300 J1118 160500 Y32-100 74000 BY60100C 74000 CDVB 6000B 121000
医院数字PCR检测系统需求说明
医院数字PCR检测系统需求说明一、项目概况中心医院数字PCR检测系统的供货、安装、调试、技术服务、相关文件的提交、与技术规格一致的产品图表及资料、维修服务等。
二、货物一览表三、适用范围病原体绝对定量,低丰度定量检测研究、结核检测、检测待测样本拷贝数变异、稀有突变检测、基因相对表达研究、转基因检测、二代测序结果验证、测序前样本建库、肿瘤液体活检、无创产前诊断、靶向测序等。
四、技术和性能参数1.环境要求:工作电源AC 220V±10%,50Hz,温度15-30℃,相对湿度≤85%。
2.液滴生成及检测方式2.1液滴生成方式:仪器采用压力动力产生油包水液滴,非纳米孔固态分区,非振动注射或界面振动微滴阵列技术,有效避免气溶胶污染。
2.2液滴检测方式:采用拍照成像技术(CMOS检测器),非流式液滴分析技术,无需参入额外本底荧光即可识别阴性液滴。
且具有后台实时液滴质控机制,自动记录并剔除质量不合格的液滴,保证检测结果的可靠性,并且有可追溯功能。
3.为了更好的满足实验室分区要求,液滴生成仪和PCR扩增仪为两台设备分别独立使用,符合临床核酸扩增样本处理,PCR扩增要求独立空间布局的规定。
4.反应体系(样本量):≤15μL(为了节约标本使用量,样本量不能大于15μL)。
5.光源:≥7个独立LED光源。
6.检测器参数:CMOS检测器,成像器呈现真实的二维,相机的分辨率4096*3000,像素单元的分辨率为3.5μm左右。
7.灵敏度:≤0.1%,能检测到单拷贝基因。
8.液滴制备量:单个样本生成总液滴数30000个。
9.液滴体积:≤1nL。
10.最低检测限:0.1 copies/μL。
11.样本处理数:样本制备仪可同时1-32个芯片生成液滴。
12.样品处理:支持探针法和染料法。
13.浓度动态范围:5 个数量级。
14.精确度:≤±10%。
15.生物安全风险控制:样本液滴生成、PCR扩增、读取等检测过程全密封,无需额外转移液滴,避免操作误差。
实时荧光定量PCR仪大型仪器设备购置论证报告审批稿
实时荧光定量P C R仪大型仪器设备购置论证报
告
YKK standardization office【 YKK5AB- YKK08- YKK2C- YKK18】
大型仪器设备购置论证报告
仪器设备名称实时荧光定量PCR仪
项目名称生态环境科技平台
项目负责人陈建荣
填表日期2017年4月12日
实验室管理处制
填表说明
1.单价10万元及以上仪器设备的申购均需填写此表,并与申购计划一起上报有关部门。
2.所在学院(部门)组织3—7人单数技术专家进行论证,并通知项目经费管理、设备管理等部门参加论证。
申请单一来源采购的需3人以上单数非本校专家参加论证;未列入全省统一论证进口产品范围的进口产品需5人以上单数非本校专家参加论证。
3.论证会由专家组组长主持,主要程序为:申购人报告、现场考察、专家质询与讨论、专家组形成论证意见并签名。
4.专家论证同意,经学院(部门)、项目经费管理部门签字并盖章后,报本科教学部(实验室管理处)网上公示一周无异议后实施。
5.此表一式1份(如设备为进口设备,请提交2份)。
菌种鉴定方法大全
菌种鉴定⽅法⼤全⼀、⾦开瑞菌种鉴定服务简介在细菌/真菌的16/18SrDNA中有多个区段保守性,根据这些保守区可以设计出细菌/真菌通⽤引物,扩增出细菌/真菌的16/18SrDNA⽚。
因此,16/18SrDNA可以作为细菌/真菌群落结构分析最常⽤的系统进化标记分⼦。
该鉴定⼿段试⽤于单种鉴定或者少量混杂菌种鉴定。
⾦开瑞拥有多种配套的通⽤菌种鉴定引物,实验周期短,可以帮您快速实现菌种鉴定。
服务流程引物设计合成—PCR扩增16/18S rDNA/ITS—PCR产物纯化—测序,序列⽐对分析客户提供基因组DNA:要求基因组DNA的浓度≥100 ng/µl,总体积≥20 µl,且⽆明显降解;平板或斜⾯:经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜⾯。
最终交付测序结果,BLAST⽐对得到细菌种属名称服务内容及说明服务名称服务周期(⼯作⽇)原核⽣物/16SrDNA 5-7真核⽣物/18SrDNA 5-7真菌ITS序列分析 5-7⼆、菌种鉴定⽅法介绍(1)常规鉴定常规鉴定内容有形态特征和⽣理⽣化特征。
形态特征包括显微形态和培养特征;理化特性包括营养类型、碳氮源利⽤能⼒、各种代谢反应、酶反应等。
(2)BIOLOG碳源⾃动分析鉴定BIOLOG鉴定系统以微⽣物对不同碳源的利⽤情况为基础,检测微⽣物的特征指纹图谱,建⽴与微⽣物种类相对应的数据库。
通过软件将待测微⽣物与数据库参⽐,得出鉴定结果。
该系统已获美国FDA认可,已逐步应⽤于⾷品和饮品企业、环保、海洋⽣物/⽔产品、制药、农业微⽣物、⽣物治理、化妆品、临床等领域的微⽣物鉴定试验中。
BIOLOG是⼀种微⽣物菌种快速鉴定系统,涉及⾰兰⽒阴性菌、⾰兰⽒阳性菌、厌氧菌、酵母、丝状真菌在内近2000种微⽣物。
(3)分⼦⽣物学鉴定应⽤分⼦⽣物学⽅法从遗传进化⾓度阐明微⽣物种群之间的分类学关系,是⽬前微⽣物分类学研究普遍采⽤的鉴定⽅法。
CICC拥有微⽣物菌种分类鉴定的分⼦⽣物学实验室,配有PCR仪、⾼速冷冻离⼼机、电泳仪、HPLC、凝胶成像系统、紫外控温分析系统等先进仪器设备,以及DNAMAN、BIOEDIT、CLUSTALX、TREEVIEW等序列分析软件。
26凝胶成像仪URS
XXXXXX有限责任公司质检中心URS文件文件号:SB-01-026
目录
1. 目的 (4)
2. 范围 (4)
3. 参考文件 (4)
4. 术语 (4)
5. 设备/ 系统描述 (4)
6. 用户需求标准 (4)
7. 文件修订变更历史 (8)
1.目的
用于描述编写本用户需求说明的目的。
2.范围
用于描述编写本用户需求说明的范围。
3.参考文件
用于描述本用户需求说明适用和参考的法律、法规、行规、公司指南、手册、公司标准操作规程、项目资料等名称。
4.术语
用于对本用户需求说明中用到的专业术语、缩略语进行解释、说明。
5.设备/ 系统描述
用于描述设备/ 系统功能、结构、性能、原理、材质、安装区域等
6.用户需求标准
7.文件修订变更历史
在具体实施过程中,如本文件有不适之处,可以对本文件进行相应的修改,但对本文件及其附件中的任何内容进行任何修改都必须通过已制定的变更程序,经审核和取得有关部门批准后才能修改和执行。
大鼠死后肠道菌群演替规律
大鼠死后肠道菌群演替规律李欢;刘睿娜;张思若;袁璐;徐纪茹【摘要】目的初步探索尸体肠道菌群的时序性变化用于死亡时间推断.方法利用棉签擦拭颈椎脱臼处死大鼠肠道取样,通过提取肠道菌群DNA,选取16S rRNA V3区通用引物进行PCR,PCR产物进行变性梯度凝胶电泳,对得到的图谱进行组间菌群多样性与相似性分析,并对从变性梯度凝胶电泳切下的条带进行纯化、PCR、测序后获得各组厚壁菌门的主要菌群所占百分比.结果处死后大鼠第1~30天的菌群多样性呈现减少趋势(P<0.05),组内相似性呈现下降趋势(P<0.05),第1天指纹图谱条带数、组内相似性系数(similarity coefficient,Cs)高于其他组(P<0.05),第5天与第25、30天组内Cs比较差异有统计学意义(P<0.05).在属水平,处死后第1、5天肠道菌群以肠球菌属(Enterococcus sp.)为主,第10、15、20天以苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringienssis)为主,第25、30天以粪肠球菌(Enterococcus faecalis)为主.结论肠道菌群随大鼠处死后时间的延续,其组成、结构都出现了明显的变化,肠道菌群的演替与死亡时间相关.【期刊名称】《法医学杂志》【年(卷),期】2018(034)005【总页数】5页(P482-486)【关键词】法医病理学;DNA指纹法;变性梯度凝胶电泳;大肠菌群;死亡时间;大鼠【作者】李欢;刘睿娜;张思若;袁璐;徐纪茹【作者单位】西安交通大学医学部基础医学院,陕西西安710061;西安交通大学医学部法医学院,陕西西安710061;西安交通大学医学部基础医学院,陕西西安710061;西安交通大学医学部基础医学院,陕西西安710061;西安交通大学医学部基础医学院,陕西西安710061【正文语种】中文【中图分类】DF795.1死亡时间(postmortem interval,PMI)推断方法较多,但利用微生物学方法推断PMI相对很少。
徐州师范大学正置显微镜、化学发光凝胶成像系统、紫外可见分光光度计
徐州师范大学正置显微镜、化学发光凝胶成像系统、紫外可见分光光度计招标采购文件(No:2012H08014)第一部分投标人须知一、总则1. 本招标文件仅适用于徐州师范大学组织的招标活动。
2. 凡符合资质要求的供应商均可参与投标。
3. 无论投标结果如何,投标人自行承担因投标所产生的全部费用。
4. 本次招标活动及由本次招标产生的合同受国家法律制约和保护。
5. 凡参与此采购项目的投标供应商,除投标供应商有特别说明外,均视为接受并遵守本招标文件。
6. 本次招标活动细则由徐州师范大学招投标办公室负责解释。
二、招标工作程序1. 发布招标公告;2. 投标供应商获取招标文件;3. 投标供应商咨询了解本项目基本情况,制作投标书;4. 招标方接受投标书,同时收取标书费、投标保证金;5. 开标、述标;6. 评标定标,等额退还未中标供应商的投标保证金;7. 中标供应商签署供货合同,执行合同。
三、对投标供应商的要求投标供应商除具备公告中的资质要求外,还应满足下列要求:1. 必须为独立法人;2. 必须具有《中华人民共和国消费者权益保护法》所规定的售后服务的能力。
中标供应商必须派出技术人员提供现场服务及有关技术培训;3. 提供的设备必须附有原始生产厂家的质保书及产品合格证,如提供假冒伪劣产品,招标方将根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的规定要求赔偿;如供应商提供虚假的资质证明文件,一经查实,将以无效投标文件处理并处以一定的经济处罚。
四、投标文件的要求1. 投标文件的构成:(1) 报价表:自做报价表,注明型号、规格、技术指标。
如果是进口设备,因我校享受进口免税政策,可以以欧元或美元CIP南京(或徐州)报价(免税价格);如不能办理免税,则以人民币报价。
如所投产品指标与谈判文件要求有偏离的必须在响应文件中注明。
详细的交货清单;特殊工具及备件清单;(2) 相关服务:明确最快供货时间、产品技术服务和售后服务的内容及措施;(3) 投标书附件:由投标人根据各自情况自行编制,规格幅面与正文一致,主要内容包括:产品主要技术性能和结构的详细描述;提供必要的数据;产品制造、安装、验收的执行标准;投标人资格证明文件:单位简介(包括组织机构、人员、经营规模、经营特色、对企业员工的业务培训情况、经营场地使用性质、主要负责人简历介绍等);企业法人营业执照复印件;税务登记证明复印件;组织机构代码证;近三年主要经营业绩等背景资料复印件,所有复印件均需加盖相应的有效印章,经营业绩须按附表一的表格形式填写(见下);如供应商提供虚假的资质证明文件,一经查实,将以无效投标文件处理并处以一定的经济处罚。
自然发酵乳中粪肠球菌和屎肠球菌的4种鉴定方法的比较
自然发酵乳中粪肠球菌和屎肠球菌的4种鉴定方法的比较李梅花;王芳;孙婷;张家超;孙春玲;刘文俊;包秋华;孙天松【摘要】采用传统生理生化鉴定方法,16SrRNA基因序列分析技术,16S-23SrRNA间区序列多态性分析技术,变性梯度凝胶电泳技术(DGGE),对分离于自然发酵乳中的9株粪肠球菌和6株屎肠球菌进行鉴定,并对4种鉴定方法进行比较和评价。
结果表明,16S-23SrRNA间区序列多态性分析技术和DGGE技术不但可以快速、精确地区分粪肠球菌和屎肠球菌,而且能够将粪肠球菌和屎肠球菌种内的不同基因亚型区分开,而传统生理生化鉴定方法和16SrRNA基因序列分析技术较以上两种方法区分效果略差。
%In order to accurately identify Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium isolated from natural fermented dairy products, in this study, four identification methods, namely traditional physiological and biochemical identification methods, 16S rRNA gene analysis, 16S -23S rRNA Intergenic spacer region polymorphism and Denaturing Gradient Gel Electrophoresis were carried out to differentiate the tested strains. Meanwhile, the identification of these four methods was compared with evaluated ability. The results showed that except for the methods of the traditional physiological and biochemical identification methods and 16S rRNA gene analysis, 16S- 23S rRNA Intergenic spacer region polymorphism and Denaturing Gradient Gel Electrophoresis not only were competent, but also could divide Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium into different kinds of gene isoforms.【期刊名称】《食品与发酵工业》【年(卷),期】2011(037)009【总页数】6页(P98-103)【关键词】粪肠球菌;屎肠球菌;分类鉴定;基因亚型【作者】李梅花;王芳;孙婷;张家超;孙春玲;刘文俊;包秋华;孙天松【作者单位】内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018;内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018;内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018;内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018;内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018;内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018;内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018;内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特010018【正文语种】中文【中图分类】TS214.2肠球菌归属于硬壁菌门杆菌纲乳杆菌目肠球菌科肠球菌属,其细胞呈球形或卵圆形,在液体培养基中呈成对或短链状。
变性梯度凝胶电泳 DGGE
变性梯度凝胶电泳Denaturing Gradient Gel Electrophoresis变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)的方法应用于探究微生物的多样性,使得DGGE技术迅速成为了一项简单、可行的微生物多样性检测手段。
DGGE技术是根据长度相同但序列不同的DNA片段特点,在含有变性剂梯度的凝胶上,因其解链的变性浓度的不同而导致迁移率不同的原理而将DNA片段分离开的一种方法。
理论上DGGE能将仅存在一个碱基差异的DNA片段分开,而实际上,其分辩率较低且操作重复性差使得该方法仍然存在一些问题。
更重要的是,随着科技的突飞猛进,DGGE技术已逐渐被高通量测序所取代。
一、试剂与仪器1. 材料1.1 实验试剂表1.1 实验试剂一览表Table 1.1 The list of reagents试剂来源或生产公司EDTA Genebase®,Genebase Gene-Tech公司去离子甲酰胺分析纯,上海凌峰化学试剂有限公司十二烷基磺酸钠Genebase®,Genebase Gene-Tech公司Tris碱Genebase®,Genebase Gene-Tech公司APS Genebase®,Genebase Gene-Tech公司TEMED Genebase®,Genebase Gene-Tech公司N,N’甲叉双丙烯酰胺Genebase®,Genebase Gene-Tech公司Gel-red染色液Biouim,美国氯化钠,二氯甲烷,甲醇等江苏永华精细化学品有限公司1.2 主要仪器设备表3.2 实验仪器一览表Table 3.2 The list of instruments and equipments仪器名称来源或出厂公司DGGE电泳仪Bio-Rad公司,美国EL 104电子天平梅特勒-托利多仪器有限公司pH计梅特勒-托利多仪器有限公司-20℃低温冰箱海尔公司Milli-Q纯水系统Millipore公司,美国G-560E型旋涡混合器Eppendorf公司,德国5810D型低温冷冻离心机Eppendorf公司,德国全套微量移液器Eppendorf公司,德国1.3 相关溶剂及试剂配制(1) EDTA溶液(0.5 M,pH 8.0):取1000 mL的烧杯加约800 mL超纯水,称取186.1 g EDTA逐量加入并用磁力搅拌器搅拌加速其溶解,随后用NaOH调节溶液的pH值至8.0,然后用1000 mL的容量瓶定容至1000 mL。
应用于微型PCR荧光检测仪的光学系统设计
应用于微型PCR荧光检测仪的光学系统设计李润芝;杨波;郭彩虹;袁旭军【摘要】针对实时微型PCR荧光检测仪系统的核心一光学模块目前仍然存在系统灵敏度低、能量利用率低、聚焦光斑大等问题.文中采用在原共聚焦型光路系统基础上改进元器件的方法,利用全反射透镜收集准直光线,采用非球面透镜进行光线会聚,优化材料选择.搭建实验系统进行实验,实验结果表明,此系统解决了原系统存在的问题,检测灵敏度达到0.01 ng/mL(荧光素),比原系统提高了10倍,可在实际检测中使用.【期刊名称】《电子科技》【年(卷),期】2017(030)011【总页数】4页(P34-37)【关键词】非成像光学;PCR荧光检测仪;全反射准直透镜;非球面;光学系统设计【作者】李润芝;杨波;郭彩虹;袁旭军【作者单位】上海理工大学光电信息与计算机工程学院,上海200093;上海理工大学光电信息与计算机工程学院,上海200093;上海科源电子科技有限公司,上海201101;上海科源电子科技有限公司,上海201101【正文语种】中文【中图分类】TN247聚合酶链式反应(Polymerize Chain Reaction,PCR)是一种在体外特异性扩增已知序列的核酸片段的技术[1],具有快速方便、特异性高等优点,目前已在生命科学、医学工程、遗传工程等领域得到了广泛应用,成为传染病和遗传病的主要检测手段[2-3]。
与传统的PCR仪相比,本文所述PCR微芯片具有体积小、反应速度快、操作简便、便于集成化等特点[4]。
由于微型PCR仪采样样品少,需进一步提高其灵敏度;为满足其便携性,仪器需更微型化、集成化。
本文针对上述问题,采用自由曲面折反射系统与非球面聚焦透镜,优化设计光学系统。
目前,通常用于荧光检测的光路系统有:共聚焦型光路、正交型光路[5]、斜入射式和平行式光路。
共聚焦型光路系统的激发光会聚系统和荧光收集准直系统都由同一个透镜完成,其聚焦光斑和光阑分别位于此透镜的共轭焦点[6],只有聚焦光斑处样品发出的荧光才能到达检测窗,其它部位非特异信号被选择性地屏蔽,受外界杂散光影响较小,结构相对简单。
招标货物一览表样本
招标货品一览表招标文献:CZYZC(2023)第5号一、设备名称:可调式移液器二、设备用途:加样和移液三、配置规定:ThermoFisher Labsysterns0.5~10ul,5~50ul,20~200ul,100~1000ul各一只;一套4只四、技术参数规定:1、连续可调单道移液器,2、使用标准配备工具,可在实验室方便快捷地进行校准和维修;3、AVG液量联动装置,实现微调和粗调完美的结合,可快速容量设立,液量联动装置,避免了手部温度对移液精确度的影响。
4、双控按钮设计,顶部旋转式按钮帽保证流畅稳定的移液,底部液量调节按钮用于精细的移液操作,有效防止移液中间的误操作。
5、低于50ul量程的移液器双活塞设计,保证移液器具有强吹出能力6、白色背景,黑色超大数字显示,带微量刻度尺;7、采用极佳的耐热材质,可整支高温高压灭菌,无需拆卸。
并且可整支紫外消毒;8、具有ISO9001:2023 和ISO 13485:2023证书,具有CE认证9、方便在实验室校准,提供网上在线校准软件;10、配有ID标签,涉及3枚预置标签和空白标签,方便区分使用实验室和项目;一、设备名称:8道可调式移液器二、设备用途:加样和移液三、设备配置规定:ThermoFisher Labsysterns0.5~10,5~50ul,50~300ul,各一只;一套3只四、技术参数规定:1、连续可调单道移液器的量程:,2、使用标准配备工具,可在实验室方便快捷地进行校准和维修;3、AVG液量联动装置,实现微调和粗调完美的结合,可快速容量设立,液量联动装置,避免了手部温度对移液精确度的影响。
4、双控按钮设计,顶部旋转式按钮帽保证流畅稳定的移液,底部液量调节按钮用于精细的移液操作,有效防止移液中间的误操作。
5、低于50ul量程的移液器双活塞设计,保证移液器具有强吹出能力6、白色背景,黑色超大数字显示,带微量刻度尺;7、采用极佳的耐热材质,可整支高温高压灭菌,无需拆卸。
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采购公告:2011H51109 实时荧光定量PCR仪、全自动凝胶成像系统、变性梯度凝胶电泳仪招标
文章作者:发布时间:2011-11-15浏览次数:
徐州师范大学就实时荧光定量PCR仪、全自动凝胶成像系统、变性梯度凝胶电泳仪招标采购项目进行公开招标,欢迎符合资质要求的供应商前来投标。
1、项目编号:2011H51109
2、项目名称:徐州师范大学实时荧光定量PCR仪、全自动凝胶成像系统、变性梯度凝胶电泳仪招标采购
3、项目概况:
(1)采购内容:
标段一:实时荧光定量PCR仪,一台;
标段二:全自动凝胶成像系统,一台;
标段三:变性梯度凝胶电泳仪,一台;
技术要求详见招标文件。
(2)安装地点:徐州师范大学校内,具体安装位置由学校指定。
4、资质要求:
(1)具有独立承担民事责任的能力;
(2)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;
(3)具有履行合同所必需的设备和专业技术能力;
(4)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;
(5)参加采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录;
(6)法律、行政法规规定的其他条件。
供应商除应当符合上述《中华人民共和国政府采购法》第二十二条的规定外,应同时且具备下列条件:
必须是具有独立法人资格、良好信誉的原生产厂家或者是该生产厂家的指定/
授权代理商,投标时必须携带原始生产厂商针对该项目的有效授权证明;
所投产品须具有产品质量检验、检测报告。
5、招标文件获取:
即日起可在“徐州师范大学招标网”网站下载,无需提前购买采购文件。
招标文件如有补充说明或答疑、更改公告,也将于11月22日(含)前在招标网上进行公布,请供货商自行关注,招标方将不再另行通知。
6、投标有关费用:
(1)招标文件售价。
本项目按标段收取标书费为:一标段300元,二、三标段各100元。
在送达投标文件时现金缴纳,售后不退。
(2)投标保证金。
不论投标方投标项目内容和数量多少,统一收取投标保证金为5000元。
在送达投标文件时缴纳。
收取方式仅限为现金或汇票(投标保证金请提前用信封密封好,并骑缝签名或盖章)。
7、接受投标文件时间及地点:
(1)接受投标文件时间:2011年12月6日14:00至14:30 ,过时不候。
(2)接受投标文件地点:江苏省徐州市铜山区上海路101号14号楼408室。
8、开标时间及地点:
2011年12月6日14:30整,在徐州师范大学招标办会议室(14号楼406室)公开开标。
届时请参加投标的供应商法定代表人或其授权人准时参加。
9、供应商最好携带产品彩页介绍以便查阅。
其余事项详见招标采购文件。
10、联系方式:
联系地址:江苏省徐州市铜山新区上海路101号14号楼407室
邮政编码:221116
电话:(0516)83536659
传真:(0516)83536959
联系人:李老师
电子邮箱:lxp@
网址:/。