分子标记在黄瓜遗传育种中的研究进展
分子标记技术在黄瓜遗传育种中的研究应用
为 80b 多态性 片段,经 F 代群体 15 5 p 3 个单 株验 证 , 片段稳定 出现 , 单J 该 在 I 生结实植株 中表现 为无带,
在 非 单性结 实植 株 中表 现 为有 带,可 以作为 鉴 别单
普 遍 。分 子 标 记 技 术 的 出现 ,很 大 程 度 提 高 了遗 传 育 种 的 有 效 性 。 因而分 子标 记 技 术 在黄 瓜 的遗
性结实与非单陛结实的标记引物。潘俊松等 将黄 瓜 始 花 节位 性 状 控 制 基 因定位 在 第 9条连 锁 群 上 , 与两侧标记的距离分别为 1.c 2 M。王全等 03 M、.c 1 J 对 黄瓜叶 色突变 的遗 传规律 进行 研究 ,并利用 分子
标 记技 术筛选 与叶色突变基 因紧密连 锁的分 子标 记 , 结 果表 明: 叶片 绿 色对 黄 色 为完 全显性 ,叶片 黄 色 由 1 隐 陛基因控制 。杜辉 对黄 瓜果实光泽 D 性 对
状与果 刺大 小 S 性状 进行 了定位 分析 ,结 果表 明 D S
传育种领域备受 重视。文章综述了分子标记技术 在 黄 瓜 育 种 中的应 用 研 究 现 状 , 旨在 为 今后 的 黄
瓜 育种 提 供 理论 指导 。
1 利 用 分子标 记 进行基 因定 位
在植 物 遗 传育 种 的研 究 中,重要 基 因的准 确 定
与 S 定位在 固定标记 连 锁 图的第 6连 锁群上 ,D与 S S R标记 C TN 1 S MC 7 的距离为 2 . c 58 M,S 和 D 间 S 距 l. c 1 M。李楠 将黄瓜对 3种病毒 Z 7 YMV C - H、
P S- R V W、wMV的 抗J 眭基因定位在 整合 遗传 图谱 的
黄 瓜 的第 6染色体上 。崔洪 宇等 将黄 瓜 白粉病 抗 性 相关 基因的一 个共显J AF 陛 LP标 记 成功 地转换 为
用SRAP标记分析黄瓜品种遗传多样性及鉴定品种
分子植物育种,2006年,第4卷,第5期,第702-708页MolecularPlantBreeding,2006,Vol.4,No.5,702-708研究报告ResearchReport用SRAP标记分析黄瓜品种遗传多样性及鉴定品种李丽1郑晓鹰1*柳李旺21北京市农林科学院蔬菜研究中心,北京,100097;2南京农业大学园艺学院,南京,210095*通讯作者,zhengxiaoying@nercv.com摘要利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术对35份不同类型的黄瓜品种进行了指纹图谱遗传多态性分析,从38对引物组合中筛选出3个多态性高的引物组合,此3对引物扩增得到的图谱可将35份黄瓜品种完全区分开来。
依据SRAP指纹图谱聚类分析结果确定了品种之间的遗传距离以及鉴别的难易程度。
用SRAP分子标记技术得到了两个黄瓜品种杂交组合F1与亲本的指纹图谱中的鉴别条带,可以用于黄瓜杂交种的纯度检测。
关键词黄瓜,指纹图谱,品种鉴定,SRAPAnalysisofGeneticDiversityandIdentificationofCucumberVarietiesbySRAPLiLi1ZhengXiaoying1*LiuLiwang21BeijingVegetableResearchCenter,BeijingAcademyofAgricultureandForestySciences,Beijing,100097;2NanjingAgriculturalUniversityHorti-culturalInstitute,Nanjing,210095*Correspondingauthor,zhengxiaoying@nercv.comAbstractGeneticfingerprintanalysisfor35cucumbervarietiesfromallovercountrysiderevealedbySRAPmarkerswasamplifiedforidentificationandregisterofvarieties.Inthisstudy38primercombinationswerescreenedfor35varieties.Threeprimercombinationsgeneratedhighpolymorphicfragments,whichcandistinguishallof35cucumbercultivars.Thestudydemonstratedthatmolecularmarkerswillprovidesmoreefficiencyevi-denceforidentificationvarietiesreality.KeywordsCucumber(Cucumissativus),Fingerprint,Identificationofvarieties,SRAP黄瓜是营养价值高的蔬菜之一,在世界范围内广泛种植。
有关黄瓜分子标记的标准_概述说明以及解释
有关黄瓜分子标记的标准概述说明以及解释1. 引言1.1 概述黄瓜(Cucumis sativus)是一种重要的蔬菜作物,具有广泛的经济和营养价值。
随着对黄瓜基因组的深入研究,分子标记技术逐渐成为黄瓜遗传育种、种质鉴定和基因功能解析的重要工具。
本文旨在综述有关黄瓜分子标记的标准,并对其进行概述、解释和说明。
1.2 文章结构本文共分为五个部分:引言、黄瓜分子标记的标准概述、黄瓜分子标记的具体要点解释、黄瓜分子标记的实验技术指南以及结论。
通过依次展开这些内容,我们将全面介绍黄瓜分子标记领域的最新进展和关键问题。
1.3 目的本文旨在提供一个全面而清晰的理解黄瓜分子标记方法和技术的框架,探讨其在黄瓜遗传育种中的应用前景,并提出相关建议,以进一步推动该领域的发展。
通过对现有知识和实践经验进行归纳总结,我们希望为黄瓜分子标记领域的科研人员和从业者提供参考和指导。
以上是关于“1. 引言”部分的内容,将介绍黄瓜分子标记的概述、文章结构以及本文的目的。
2. 黄瓜分子标记的标准概述2.1 什么是黄瓜分子标记:黄瓜分子标记是指在黄瓜(Cucumis sativus)植物中使用一种特定的方法或技术,在其基因组中标记和检测目标序列或特定位点的过程。
这些分子标记可以是DNA片段、蛋白质、RNA、酶等,通过与黄瓜基因组中的特定区域结合,并以不同的方式进行可视化或检测。
2.2 分子标记的重要性:黄瓜分子标记在现代遗传学和生物学研究中起着至关重要的作用。
通过使用分子标记,可以更精确地确定黄瓜基因组上感兴趣的特定位点,比如某个基因、一个DNA序列或一个调控区域。
此外,分子标记还可以帮助区分不同类型的黄瓜品种、进行亲缘关系分析以及遗传地图构建等。
2.3 研究现状和问题:目前,已经有多种黄瓜分子标记技术被开发出来并广泛应用于黄瓜相关领域的研究。
然而,在黄瓜分子标记的标准化方面仍存在一些问题。
例如,不同实验室使用不同的分子标记方法和技术,导致数据结果难以互相比较和验证。
美国农业部黄瓜分子育种研究简介
美国农业部黄瓜分子育种研究简介翁益群(威斯康星大学园艺系,美国农业部农业研究署蔬菜作物研究室,1575Linden Dr.,Madison,WI 53706,USA)摘要:美国农业部黄瓜研究实验室隶属于美国农业部农业研究署(USDA-ARS )蔬菜作物研究室(VCRU ),挂靠于威斯康星大学园艺系。
该实验室黄瓜育种项目始于1968年。
过去50年中,该实验室在黄瓜遗传育种方面取得了丰硕的成果,并对美国及世界黄瓜育种起到了重要的推动作用。
本文简要介绍了实验室的历史及研究成果,着重概括了2008—2018年本实验室在以下方面所做的研究及取得的成绩:(1)黄瓜应用基因组学工具的开发;(2)黄瓜重要经济性状分子标记的开发,基因及主效QTL 的克隆与功能研究;(3)黄瓜染色体的起源与进化分析,以及栽培黄瓜的驯化与种质资源的遗传多样性研究。
同时,对所取得的各项成果在黄瓜育种中的潜力进行了评价。
最后对今后实验室的工作进行了展望。
关键词:黄瓜;分子育种;QTL ;基因克隆;染色体进化;驯化中图分类号:S642.2;S32文献标识码:ADOI 编码:10.3969/j.issn.1006-6500.2019.06.002Molecular Breeding Research in USDA-ARS Cucumber Improvement Program-Past,Present and Future WENG Yiqun(USDA-ARS,Vegetable Crops Research Unit,Horticulture Department,University of Wisconsin,Madison,WI 53706,USA)Abstract :The cucumber improvement program of the USDA-ARS Vegetable Crops Research Unit (VCRU)dedicates to cucumber germplasm enhancement research.This program was established in 1968.In the last 50years,accomplishments made in this lab con ⁃tributed significantly to US cucumber productions with also impacts to cucumber breeding around the world.This review gave a brief introduction of the history of this lab,and major achievements in cucumber genetics and breeding research with focus on work in 2008—2018in the following four areas.(1)Development of applied genomics resources for cucumber molecular breeding.(2)Molecu ⁃lar mapping and cloning of economically important genes and QTL in cucumber.(3)Origin and evolution of cucumber chromosomes,and domestication and genetic diversity in USDA cucumber collection.This paper also discussed the impacts on cucumber breeding and future directions of our work.Key words :cucumber;molecular breeding;QTL;gene cloning;chromosome evolution;domestication收稿日期:2019-03-12基金项目:USDA-NIFA-SCRI (2011-51181-30661,2015-51181-24285);USDA-BARD (IS -4341-10);USDA -NIFA -AFRI (2013-67013-21105,2017-67013-26195);USDA-ARS-CRIS (5090-21000-062-00D )作者简介:翁益群(1964—),男,江苏泰兴人,研究员,教授,博士,主要从事黄瓜育种相关研究。
黄瓜果实长度遗传分析及分子标记的开题报告
黄瓜果实长度遗传分析及分子标记的开题报告【题目】黄瓜果实长度遗传分析及分子标记【背景】黄瓜(Cucumis sativus L.)是葫芦科(Cucurbitaceae)的一种蔬菜作物,经济价值较高。
黄瓜果实长度是农民种植黄瓜时非常重要的性状之一,在黄瓜产业中具有重要的经济意义。
黄瓜果实长度的遗传基础已经引起人们的广泛关注,研究表明,果实长度是由多个基因控制的复杂性状。
基因型对果实长度的影响是相对稳定的,而环境因素(如温度、光照、水分等)则会对果实长度产生一定的影响。
研究黄瓜果实长度遗传基础和分子机制,有助于提高黄瓜的产量和质量,促进黄瓜产业的发展。
【研究目的】本研究旨在探究黄瓜果实长度的遗传基础和分子机制,构建黄瓜果实长度的遗传图谱,并开发相关的分子标记,为黄瓜产业的发展提供科学依据。
【研究内容】1. 黄瓜果实长度的遗传分析:选择不同长度的黄瓜品种或变异品系作为亲本,进行交叉试验,得到第一代、第二代等后代,统计各代黄瓜果实长度的数据,进行遗传分析,推断果实长度的遗传模式。
2. 构建黄瓜果实长度的遗传图谱:根据遗传分析结果,筛选出相关基因,开展基因定位和连锁分析,构建黄瓜果实长度的遗传图谱,为后续分子标记的研发提供理论基础。
3. 分子标记的开发和应用:根据遗传图谱开发与黄瓜果实长度相关的分子标记,如SSR、SNP等,对黄瓜品种进行鉴定和评价,为黄瓜杂交育种和品种筛选提供有效工具。
【研究方法】1. 遗传分析:选择不同长度的黄瓜品种或变异品系作为亲本,进行交叉试验,得到第一代、第二代等后代,统计各代黄瓜果实长度的数据,采用遗传学分析方法进行遗传分析。
2. 基因定位和连锁分析:采用分子标记技术进行基因定位和连锁分析,通过PCR扩增和电泳检测等手段,分析不同基因间的连锁关系和分离频率,构建黄瓜果实长度的遗传图谱。
3. 分子标记的开发和应用:根据遗传图谱开发与黄瓜果实长度相关的分子标记,设计引物,采用PCR技术进行扩增和分离纯化,通过PCR-SSCP、PCR-RFLP等分析技术进行检测和鉴定。
分子标记技术在瓜类蔬菜育种中的研究进展_苏长跃
山东农业科学2014,46(4):136 139Shandong Agricultural Sciences收稿日期:2013-07-30基金项目:山东省农业良种工程重大课题:山东设施名产蔬菜及食用菌新品种选育(2011LZ06);以生物技术为主要手段的蔬菜种质资源创新利用研究作者简介:苏长跃(1986-),男,硕士研究生,研究方向为蔬菜育种。
E -mail :changyaona@163.com *通讯作者,E -mail :zigaojiao5@163.com分子标记技术在瓜类蔬菜育种中的研究进展苏长跃1,焦自高2*,史庆华1,董玉梅2,王崇启2,肖守华2(1.山东农业大学园艺科学与工程学院,山东泰安271018;2.山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心,山东济南250100)摘要:本文综述了分子标记技术及其应用于瓜类蔬菜种质资源亲缘关系和遗传多样性分析、分子标记辅助选择、品种纯度鉴定、遗传图谱构建及基因定位等方面的研究进展,对目前分子标记技术应用于瓜类蔬菜育种中存在的问题进行了探讨,并对其应用前景做了展望,以期为今后瓜类蔬菜高效分子育种技术的建立提供参考。
关键词:瓜类蔬菜;分子标记技术;辅助育种;研究进展中图分类号:S642.036文献标识号:A文章编号:1001-4942(2014)04-0136-04瓜类蔬菜在我国蔬菜生产中占有重要地位。
分子标记是以个体间遗传物质核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA 水平上遗传多态性的直接反映[1]。
分子标记技术的出现,使植物育种的“间接选择”成为可能,大大提高了遗传分析的准确性和选育品种的有效性[2]。
近年来,随着分子生物学的迅猛发展,分子标记技术在蔬菜育种中的作用越来越受到重视[3]。
本文综述了几种常见的分子标记技术在瓜类蔬菜育种中的研究进展,以期为瓜类蔬菜高效分子育种体系的建立提供参考。
1分子标记技术种类Bostein 等(1980)最早利用限制性长度片段多态性(Restriction fragment length polymorphism ,RFLP )作为遗传标记构建了遗传连锁图谱,开创了直接利用DNA 多态性发展遗传标记的新阶段[4]。
黄瓜霜霉病及其分子标记辅助育种研究
安徽农业科学 , u l f r u A Si2O ,67 :84— 1, 2 J ma0  ̄ i .c. 83 ( )21 2 52 7 a A O 8 8
责任编辑
刘月娟
责任技对 马君叶
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激 动素溶液 的棉花保湿 , 一 ℃条件下 , 在 5 可保存病 叶 3 l。 0 6 dJ 143 低温冷 冻保存 。Si .. h 等研 究表 明 , 体 叶片冷 冻保存 离 1 个月 的霜霉 菌仍 然具 有致病 力 , 致病 力下 降 , 指数 O 但 病情 仅为 1 0而 对照病情 指 数达 9 .; . , 6 62 低温 ( 2 一 0℃) 降低 霜 可
s I1。a d teg n t eitn erg lt na d rss c re igaan t uu e o y mi e wee¥lnai ,teq et n npee tpo u t n t is n e ei rss c e uai n e it eb dn g is c mb r wn l w r 1n kl  ̄ r h c a o ma e c d d 1 - z h u si si rs n rd c o o i
a dsu isweea al e n te rsa c i cin i ftr r rsne n tde r n v da d h ee rh dr t z e o n uuewee pee td, Ke r s C c mb r y wa d u u e ;Do n le w y mi w;Moeue mak r d lc l r e;Re itn ebe dn ss c re ig a
得 了明显进展 。
生物技术用于黄瓜遗传育种
生物技术用于黄瓜遗传育种张圣平1 顾兴芳1 许文连2 王烨1(1中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京 100081;2山东省成武县蔬菜局,成武 274200)摘 要: “十五”期间,生物技术在黄瓜遗传育种上的应用更加广泛,分子标记辅助育种、单倍体育种以及黄瓜基因工程改良取得了重要进展。
本文综述了黄瓜基因分子标记、遗传图谱构建、基因定位、基因克隆与表达、品种DNA 指纹图谱分析、分子技术鉴定病害、单倍体和三倍体培养、遗传转化体系建立及基因工程改良方面的最新进展,并讨论了存在的问题和前景。
关键词: 生物技术 黄瓜 遗传育种Application of Biotechnology on G enetics and B reeding of CucumberZhang Shengping Gu Xingfang Xu Wenlian Wang Ye(1I nstit ute of V egetables and Flowers ,Chinese A cadem y of A g ricult ural S ciences Bei j i ng 100081;2V egetable B ureau of Chengw u Count y in S handong Province ,Chengw u 274200)Abstract : The application of biotechnology on genetics and breeding research of Cucumber during "The Tenth Five 2years Plan"went deeper into.Molecular marker 2assisted breeding ,haploid breeding and genetic engineering improvement in cucumber were gained significant development.The recent progress of gene molecular markers ,mo 2lecular genetic map construction ,gene locating ,gene clone and expression ,DNA fingerprinting analysis ,identifying diseases using molecular technology ,haploid and triploid culture ,genetic transformation system and genetic engi 2neering improvement in cucumber were summed up.And the problems to be solved and prospects of were discussed.K ey words : Biotechnology Cucumber Genetics and breedieg “十五”期间,黄瓜育种研究首次被列入国家“863”项目,育种方法和技术得到了快速发展。
黄瓜重要性状相关分子标记研究进展_胡丽芳
目前,分子标记辅助选择的快速发展,大大提高了 遗传分析的准确性和选育的有效性。综合国内外文献
基金项目:国家自然科学基金“黄瓜脂氧合酶基因 CsLOX1 参与性别分化的研究”(31060262);江西省自然科学基金“黄瓜 AG subfamily 基因 CsMADS24 在花器官发育中的功能分析”(20122 BAB214017);江西省自然科学基金“黄瓜脂氧化酶基因参与性别分化的研究”(2009GQN0034);江西 省教育厅项目“黄瓜 EST-SSR 新标记的开发及染色体定位”(GJJ10111);江西农业大学自由项目“茉莉酸参与黄瓜性别分化的研究”(2009)。 第一作者简介:胡丽芳,女,1979 年出生, 湖南常德人,助理研究员,博士,研究方向:植物分子生物学。E-mail:LFHu_Hn337@。 通讯作者:刘世强,男,1978 年出生,广西玉林人,讲师,博士,研究方向:植物分子生物学。通信地址:330045 江西省南昌市昌北经济技术开发区志敏 大道 1101 号,Tel:0791-83813574,E-mail:LSQ_hn306@。 收稿日期:2013-10-17,修回日期:2013-12-26。
摘 要:综述了不同分子标记技术在黄瓜重要病害(白粉病、霜霉病、枯萎病、黑星病、炭疽病、病毒病)、果
分子标记技术在蔬菜遗传育种中的应用
异显著的栽培番茄和野生醋栗番茄杂交产生的 142 个 F2 单株为作图群体,应用 SSR 标记构建了番茄的遗传连 锁图谱,图谱共包含 112 个标记,总长度 808cm,标记平 均间距 7.22cm。Wang 等(1997)利用 AFLP 技术构建了 甜瓜(Cucumis melo L.)的遗传连锁图,含有 197 个 AFLP 位点、6 个 RAPD 位点与 1 个微卫星位点,覆盖了 1942cm 遗传距离,并发现 AFLP 标记在甜瓜图谱构建中 比 RAPD 及 SSR 标记更有效。在我国,张宝玺等(2003) 以 辣 椒 胞 质 雄 性 不 育 的 保 持 系 Yolowonder、 恢 复 系 Perennial 及其 F1 构建的 DH 群体与不育系 77013A 测 交的群体为供试材料,用 AFLP 分子标记技术构建了包 括 43 个标记 8 个连锁群的辣椒分子遗传图谱。
植物育种中分子标记辅助选择是通过分析与目标 基因紧密连锁的分子标记来判断目标基因是否存在的。 通过不同分子标记技术的分析可筛选出与目标基因性 状紧密连锁的 DNA 片段,这样可以作为辅助育种的分 子标记。应用这些分子标记进行间接选择,将得到事半 功倍的作用,因为 MAS 不受植物生长发育的时期及环
境的影响,如抗病育种不需要创造选择环境进行筛选鉴 定等,从而显著提高育种效率。
基于SNP分子标记构建黄瓜指纹图谱
基于SNP分子标记构建黄瓜指纹图谱目录一、内容概要 (3)1. 研究背景与意义 (4)2. 国内外研究进展概述 (4)3. 研究内容与方法 (5)二、材料与方法 (6)1. 材料收集与处理 (8)黄瓜品种选择 (9)样本采集与保存 (10)DNA提取与纯化 (10)2. SNP分子标记开发 (12)遗传学原理与技术路线 (13)SNPs筛选与验证 (14)分子标记数据整合 (16)3. 花纹图谱构建 (17)条形码技术与数据编码 (17)图谱构建与优化 (19)图谱验证与比较 (19)三、结果与分析 (20)1. SNP位点分布与多样性 (21)SNPs数量与分布规律 (22)遗传多样性分析 (23)物种鉴定与分类 (24)2. 花纹图谱特征提取 (25)图谱特征参数选取 (26)图谱相似性计算 (27)花纹模式识别 (28)3. 综合分析与评价 (28)不同品种间差异分析 (29)花纹图谱的稳定性与重复性评估 (30)分子标记在黄瓜指纹图谱中的应用价值 (31)四、讨论与展望 (32)1. 研究成果总结 (33)SNP分子标记在黄瓜指纹图谱构建中的优势 (34)花纹图谱在黄瓜品种鉴定中的应用前景 (35)2. 研究局限与不足 (35)技术方法的局限性 (36)数据来源的局限性 (37)3. 未来研究方向与展望 (38)深入挖掘SNP标记信息 (40)开发新型分子标记技术 (41)推广黄瓜指纹图谱在农业生产中的应用 (42)一、内容概要本文档旨在介绍基于单核苷酸多态性(SNP)分子标记构建黄瓜指纹图谱的方法和技术流程。
黄瓜指纹图谱是一种利用基因组中特定SNP位点的多态性,为黄瓜个体提供独特遗传标识的技术。
通过构建黄瓜指纹图谱,可以更有效地进行黄瓜种质资源的鉴定、评价和利用,推动黄瓜遗传育种和种业发展。
SNPID与引物的设计与筛选:根据黄瓜基因组中的SNP位点信息,设计并筛选出适用于指纹图谱构建的特异性引物。
分子标记技术在黄瓜育种上的应用
性。在第一组 1 品系中, F P标 记反映 了与 同工酶 分析 6个 RL
一
连锁图谱。Srun等 利用重组 近交系构 建 了由 7 eq e 7个 R P AD
标记和三个基 因组成的 8 O个 位点 的黄瓜遗 传罔谱 , 分属 9个
的多态性确定亲 本组 合, 建立作图群体 ; 群体中不 同植株或 品
系的标 记基 因型的分析 ; 标记 问连锁群 的确定。其 中构建 永 久性分离群体是作 成功和高效的关键。 近年来 , 分子 标 记 已用于 黄瓜 的遗 传 作 图。K n ad等 e nr
育种 中应用的几个主要方面。
1 亲缘关系和遗传多样性的研究
分子标记是进行种质 亲缘关 系分析和检测种 质资 源多样 性的有效工具。对玉米、 大麦、 小麦等作物 的研究表明, 利用分
利用 R I 、 A D、 F R P 同工酶 、 态和抗病 性 所产 生的标 记, P 形 进
行了黄瓜遗传图谱的构 建, 到 5 得 8个位 点的遗传 图谱 , 属 分 1 0个连锁群, 图谱覆盖 的基 因组 总长 度约为 7 6c 标记 该 6 M, 问平均距离约为 2 M。Ie 利用 R P 1c , 等 e A D在黄瓜 的杂交 F 2
从 2 0个 1 基 的 随 机 引 物 中 筛 选 出 2 0 0碱 O个 用 于 P R 反 应 , C
3 利 用分子 标 记可 以对 基 因进 行定 位
标记 目标性状基 因的方法 目前 丰要有两 种: 一是 利用 近
等 基因系 或 Mi e oe (9 1 提 出的分 离群 体分组 分析 c l r 等 19 ) hm
黄瓜主要农艺性状分子标记研究进展
中国瓜菜2023,36(10):1-9,15收稿日期:2023-06-17;修回日期:2023-09-03基金项目:河北省高等学校科学技术研究项目青年基金项目(QN2022068);河北省自然科学基金青年项目(C2022407038)作者简介:李亚航,男,在读硕士研究生,研究方向为黄瓜抗病分子标记辅助选择体系的建立。
E-mail :*******************通信作者:崔浩楠,男,讲师,研究方向为葫芦科作物分子遗传改良。
E-mail :******************.cn黄瓜(Cucumis sativus L.)是葫芦科甜瓜属一年生植物,普遍种植于世界上各个国家和地区,是很常见的蔬菜作物。
另外,黄瓜具有较高的营养价值,含有蛋白质、钙、磷、铁、钾、胡萝卜素、维生素B2、维生素C 、维生素E 及烟酸等营养素。
常食黄瓜对人体有许多益处,能够起到抗衰老、降血糖等功效[1]。
研究发现,黄瓜起源于印度,而中国是次级起源中心之一,可分为华北型、华南型、欧洲温室型、欧美加工型等类型[2]。
分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA 水平遗传多态性的直接反映[3]。
其主要可分为四大类,第一大类是基于分子杂交的方法,主要指RFLP 。
第二大类是基于PCR 的DNA 扩增方法,又可分为两类,一类是使用随机引物,以RAPD 为代表;而另一类是利用特定引物或引物对扩增的标记,主要有SCAR 、STS 、SSR 、TRAP 、SRAP 、EST-SSR 等分子标记。
第三大类是通过PCR 与酶切相结合的方法,主要有AFLP 以及CAPS 。
第四大类是基于单个核苷酸多态性的DNA 标记,目前是指SNP [4]。
分子标记技术黄瓜主要农艺性状分子标记研究进展李亚航,施艳娥,丁卓,崔浩楠(河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室·河北科技师范学院园艺科技学院河北秦皇岛066000)摘要:黄瓜(Cucumis sativus L.)是一种重要的蔬菜作物,在世界各地广泛种植。
黄瓜分子生物学研究进展
黄瓜分子生物学研究进展摘要:文中综述了近年来国内外关于黄瓜分子生物学方面的研究进展,一是揭示黄瓜遗传多样性和系统分类的分子标记研究;二是全面解析黄瓜分子网络的基因组、转录组和蛋白质组研究;三是以培育优质高抗品系为目标的代谢和发育调控相关基因的分离、克隆和功能研究;最后讨论了目前研究的不足和黄瓜未来分子生物学研究的方向。
关键词:黄瓜;分子标记;基因组;转录组;蛋白组;功能基因黄瓜(Cucumis sativus Linn.),也称胡瓜、青瓜,属葫芦科植物。
黄瓜原产印度,目前广泛分布于中国各地,并且为主要的温室产品之一。
由于黄瓜是世界性的大宗蔬菜,近年来国内外利用各种分子生物学手段全面开展了关于黄瓜遗传多样性、系统分类、组学和功能基因等多项研究。
这些研究为深入阐明黄瓜的生长发育机理、改善品质、提高产量等奠定了基础。
1 分子标记和遗传多样性分析黄瓜是葫芦科中重要的蔬菜,有7条染色体,其分子标记研究越来越受到人们的关注。
张素勤等(2008)、宋晓飞等(2009)对黄瓜 AFLP 反应体系进行了优化。
柴丹丹等(2008)、王振国等(2007)优化了黄瓜 SRAP 反应体系。
王桂玲等(2007)建立了优化的 SSR 反应体系。
王佳等(2006)利用正交设计优化了黄瓜 ISSR 体系。
分子标记开发方面,李效尊等(2007)开发了 118 个 SCAR 标记,引物多态性比例在 10 %以上。
由于 SSR 标记的开发需要投入大量的人力和物力,成本较高,关媛等(2007)、胡建斌和李建吾(2008)利用黄瓜 EST 序列开发了一批 EST-SSR 标记,与基因组 SSR 标记相比,它提供了基因表达信息,为功能基因提供绝对标记。
基于测序结果,中国农业科学院蔬菜花卉研究所开发了2100 多对 SSR 引物(Ren et al.,2009)。
在遗传图谱的构建与基因定位方面,我国科研工作者构建了多份黄瓜遗传连锁图谱,包括首张黄瓜高密度 SSR 遗传图谱(Ren et al.,2009)、一张整合图谱(李楠,2008)、其他遗传图谱(Yuan et al.,2008;杜辉,2008;稽怡,2008;宋慧等,2009)。
dna分子标记技术在瓜类蔬菜遗传育种中的应用
dna分子标记技术在瓜类蔬菜遗传育种中的应用DNA分子标记技术是通过检测和分析DNA分子的遗传多态性来实现基因定位、分离、克隆和转化的一种先进的遗传分析技术。
在瓜类蔬菜遗传育种中,DNA分子标记技术已广泛应用,为育种工作提供了重要的辅助手段。
DNA分子标记技术的应用可以帮助育种者快速、准确地鉴定目标基因或遗传性状。
通过利用已知的DNA分子标记进行筛选,可以直接筛选出目标基因或遗传性状的携带者,避免了传统育种方法中的大量回交和后代分析,节省了时间和资源。
例如,对于瓜类蔬菜中的苦味基因,利用DNA分子标记技术可以通过筛选比对标记位点来判断植株是否携带苦味基因,从而避免了食用苦味果实的风险。
通过DNA分子标记技术的应用,可以实现育种材料的品质鉴定和分类。
对于瓜类蔬菜来说,育种者通常通过品质性状、抗病性等指标来对种质资源进行评价和分类。
而DNA分子标记技术可以根据已知的标记位点来鉴定和分类材料,为后续的杂交配组提供有力的依据。
例如,在甘薯中,利用已知的DNA分子标记可以鉴定甘薯的花色、抗病性和主要品质性状,从而为育种者提供了更准确的育种方向。
DNA分子标记技术还可以用于建立遗传图谱和构建遗传连锁图。
通过对不同品种间的杂交后代进行分子标记分析,可以获得遗传图谱,用于确定分子标记之间的遗传连锁关系。
这些遗传连锁图可以为育种者提供分子标记选择的依据,促进目标基因的定位和选择。
在瓜类蔬菜中,通过构建遗传连锁图,可以确定各种性状和抗性基因之间的遗传关系,为相关基因的选择和转化提供了重要的依据。
DNA分子标记技术还可以辅助进行分子辅助选择和分子设计育种。
通过分析和筛选DNA分子标记,可以实现对目标基因的快速选择和背景基因的消除,以加速育种速度和提高育种效果。
分子设计育种利用已知的分子标记和遗传信息,结合功能基因组学等技术,可以实现对目标性状的精确改良和设计。
在瓜类蔬菜中,利用DNA分子标记技术和分子辅助选择,可以改良和设计果实大小、抗病性、耐寒性等重要性状,提高瓜类蔬菜的品质和产量。
黄瓜植株高度遗传分析及其分子标记
第3卷第5 9 期
20 0 8年 5 月
文 章编 号 10 — 3 9 20 ) 5 0 3 一 5 0 5 96 (0 80 — o4 O
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基金项 目:国家 8 3项 目(O 6 AlZ B ) 6 2 o A 0 l 9 ;黑龙江省科技攻关
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黄瓜植株高度遗传 分析及其分子标记
辛 明,秦智伟 ,周秀艳
( 北 农业 大 学 园艺 学院 ,哈 尔 滨 10 3 东 50 0)
摘
要 : 以 19 9 1 2 、D 4 9和 62 0 6 0 、D 4 2共 4个 黄 瓜 品 种 为 亲本 ,按 照 G i n 法 I 制 双 列 杂 交组 合 ,对 rf g方 f i 配
栽 培 ,而 露 地 则需 要 矮 株 无 架 栽 培 。因 此 ,根 据
( ) 矮 。将 4个 亲本按 照完 全 双列 杂交设 计 (2配制 p)
组合 ,得到 1 6个 F 代。选 出其 中一份 F 代分别 。 自交 ,获得 F 世代。所得全部参试世代为 P、P、 2 2
F 、F 共 3个 世代 。黄 瓜 品种 由东北 农业 大学 1 ( ) 0 ( ) I 2 2 ( 、D 4 9 高 、6 2 矮 、DM6
黄瓜果实发育相关性状的分子调控研究进展
黄瓜果实发育相关性状的分子调控研究进展一、果实发育的分子调控基础1.1 基因表达调控果实发育的过程中,基因的表达调控是一个关键的环节。
研究表明,一些转录因子家族在果实发育过程中发挥着重要的作用,如MYB、NAC、bHLH、WRKY等。
这些转录因子能够调控果实的生长发育、色素的合成和积累、抗氧化物质的积累等过程。
1.2 激素调控激素在果实发育过程中起着重要的调控作用。
赤霉素、乙烯、赤霉素和脱落酸等激素对果实的生长发育、成熟和品质具有重要影响。
研究发现,激素信号转导途径中的关键基因和调控因子对果实的发育过程起着重要作用。
1.3 代谢通路调控果实的发育和成熟过程伴随着多种代谢通路的激活和调控。
糖代谢通路、蛋白质合成与分解通路、脂质合成通路等,这些代谢通路的调控关键基因在果实的生长发育和品质形成过程中发挥着重要作用。
以上三个方面的分子调控基础为黄瓜果实发育相关性状的研究提供了重要的理论基础和研究方向。
酶类基因在果实发育过程中起着重要的调控作用。
乙烯合成酶基因、木质素合成关键酶基因等,这些酶类基因的表达水平和活性对果实的发育和品质具有重要影响。
近年来,研究人员通过基因克隆和功能分析等手段,对黄瓜果实中一些酶类基因的调控机制进行了深入研究,为进一步揭示果实发育的分子调控机制提供了重要依据。
2.2 蛋白质和基因的组学研究2.3 分子标记辅助育种利用分子标记技术对果实发育相关性状进行分子标记辅助育种,是目前的研究热点之一。
通过对果实的形态性状、品质性状以及抗逆性状进行分子标记辅助选择,可以高效地培育出优质、高产、抗逆的新品种。
近年来,研究人员利用分子标记技术对黄瓜果实的发育相关性状进行了研究,并取得了一些重要的进展。
三、展望随着分子生物学和生物技术的不断发展,对黄瓜果实发育相关性状的分子调控研究将会取得更多的进展。
未来的研究方向可能包括以下几个方面:1. 深入研究果实发育相关基因的功能和调控机制,揭示果实发育过程中的关键基因和信号转导途径。
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分子标记在黄瓜遗传育种中的研究进展作者:张新俊梁改荣来源:《河南农业·综合版》 2013年第10期河南农业职业学院张新俊开封县农业局梁改荣摘要:分子标记技术在黄瓜遗传育种中应用广泛,一是黄瓜遗传图谱的构建;二是种质资源的遗传多样性和亲缘关系;三是分子标记辅助育种;四是品种纯度鉴定。
并对分子技术在黄瓜育种上的应用进行了展望。
关键词:分子标记;黄瓜;遗传育种;应用;展望生物技术的发展给黄瓜遗传育种研究提供了新的手段,分子标记作为一种基本的分析手段,是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种新的较为理想的遗传标记形式。
分子标记技术作为一项新技术,已开始广泛应用于黄瓜遗传育种的研究。
以下就目前分子标记在黄瓜遗传育种中的应用及展望综述如下。
一、黄瓜遗传图谱的构建遗传图谱是黄瓜遗传育种及分子克隆应用研究的理论依据和基础,由于形态标记和生化标记数目较少,且特殊遗传材料培养困难及细胞学研究工作量大等原因,应用这些标记得到较为完整的黄瓜遗传图谱很少。
分子标记可提供大量的遗传标记,而且可显著提高构建遗传图谱的效率。
(一)遗传图谱构建的步骤第一,根据遗传材料之间的多态性确定亲本组合,建立作图群体。
第二,群体中不同植株或品系的标记基因型的分析。
第三,标记间连锁群的确定。
(二)遗传图谱构建的研究进展黄瓜具有7条染色体(2n=2x=14),黄瓜连锁图应具有7个连锁群,总长度为750~1 000 cm。
黄瓜遗传基础狭窄,更接近于自花授粉作物,因此,黄瓜遗传图谱的构建进展缓慢。
黄瓜遗传图谱的构建为黄瓜品种资源的研究、育种中亲本材料的选择选配、育种方案的制定提供了依据,以及为基因定位、物理图谱的构建、基因克隆等奠定了基础。
由众多研究结果可以看出:黄瓜的遗传图谱构建仅仅是连锁图谱的构建,基因组图谱的构建却没有报道;黄瓜是蔬菜中研究较深入的一种,但却没有对基因组进行研究。
水稻基因组图谱已于2001完成,国际茄科基因组计划也已开始,所以,分子标记为黄瓜基因组的研究奠定了基础。
国内外在黄瓜连锁图谱构建上取得了一定成就,但与水稻、小麦、番茄等作物相比,其标记或基因的密度、覆盖长度、与传统遗传图谱的整合程度等都相差很远。
2009年,时秋香等利用黄瓜近等基因系纯雌株WI1983G(基因型为FFMM)与两性花株WI1983H(基因型为FFMM)为亲本,以WI1983H为回交亲本构建了BC1代分离群体,采用SSR及SCAR分子标记技术,获得了3个与M基因紧密连锁的标记SSR23487、SCAR123和SSR19914。
这3个分子标记的获得不仅可以用于分子标记辅助选择育种,而且为最终M基因的克隆打下了基础。
2010年,王军辉等利用抗黄瓜花叶病毒病(CMV)的黄瓜材料F-3和感CMV的黄瓜材料HZL04-1为亲本,构建包含190个F2后代的遗传作图群体,结果表明:采用SSR、EST-SSR和SCAR3种分子标记技术对该群体进行遗传连锁分析,获得1个包含170个SSR标记,6个EST-SSR标记,3个SCAR标记的黄瓜遗传连锁图谱,为黄瓜抗CMV的QTL定位奠定了基础,并确定了连锁群与染色体之间的对应关系。
二、种质资源的遗传多样性和亲缘关系黄瓜品种的分类方法较多,主要是从地理分布和形态上对不同变种或类型进行界定。
分子标记可以有效地鉴别黄瓜种质资源之间的亲缘关系,明确了易杂交成功的品种,缩短了获得黄瓜杂种一代的时间。
因此,对黄瓜各个生态型之间的亲缘关系进行研究,有助于合理引进国外种质资源和充分利用野生种质资源,有效地进行亲本选择选配,提高育种效率,为品种资源的鉴定与保存、探究黄瓜的起源与发展进化、远缘杂交亲本的选配、预测杂种优势提供理论依据。
开展黄瓜的遗传多样性和亲缘关系研究,对了解黄瓜遗传多样性分布和种质间的遗传关系,鉴别和发现新的基因源,促进黄瓜种质资源的收集保存和有效利用具有非常重要的意义。
分子标记用于黄瓜系谱分析国内外已有多篇报道。
2007年,王佳等利用ISSR技术对46份黄瓜材料分析,8个ISSR引物在46份黄瓜种质中共扩增出42条带,多态性带的比例为85.71%。
聚类分析结果表明,46份黄瓜材料可以被分为四大类,虽然不能完全按照生态型将现有黄瓜资源完全聚类,但总体而言,来自于同一生态型的多数资源可以聚在不同的类或亚类中。
2008年,王惠哲等用AFLP分子标记对4种不同类型黄瓜种质资源进行了多态性分析。
利用NTSYS软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。
从50对AFLP引物中筛选出24对多态性高、扩增稳定、重复性好的引物。
试验结果表明AFLP标记位点多,重复性好,可以揭示不同类型黄瓜种质之间的遗传基础。
三、分子标记辅助育种黄瓜育种中的分子标记辅助是通过分析与目标基因紧密连锁的分子标记来判断目标基因是否存在。
利用分子标记不仅可定位目标基因,也可利用与目标基因紧密连锁的分子标记追踪目标基因,进而进行分子标记辅助选择,其快速、准确的优越性已在实践中表现,尤其是在抗性育种中的应用。
Hallden等找到了与抗病基因紧密连锁的PCR标记,并设计了自动化操作设备,每天可对4 800个样品进行分析。
2006年,罗建华等以抗病的“秋棚”和感病的“欧洲8号”杂交获得的115份重组自交系(RL)为材料,进行了黄瓜抗ZYMV2CH遗传规律和连锁分子研究。
结果表明:病情指数在黄瓜RL群体呈双峰分布,表明其对ZYMV的抗性是受主基因控制的性状,但也存在微效基因的修饰作用,该标记可以作为黄瓜抗ZYMV辅助选择的分子标记。
2008年,白智龙等利用黄瓜抗霜霉病纯系S94(华北型)和感霜霉病纯系S06(欧洲型)构建永久群体,采用温室人工喷雾接种法,在春、秋两季分别进行霜霉病抗性鉴定分析。
在已构建的永久群体遗传图谱基础上,使用WinQTLCart2.5软件进行复合区间定位(LOD≥3.0),报道了黄瓜霜霉病抗性的QTL分析。
结果显示,在春、秋两季各检测到了黄瓜霜霉病抗性的3个QTLs集中分布在第1和第6连锁群上。
四、品种纯度鉴定种子纯度鉴定的研究方法主要来源于遗传标记。
由于分子标记具有迅速、准确的特点,在检测良种质量,保护名、特、优种质及育成品种的知识产权等方面有着广泛的应用。
在种质资源研究中,应用分子标记可有效地鉴别栽培品种,消除同名异物、同物异名的现象,确定保护种质资源遗传完整性的最小繁种群体和最小保种量,进行核心种质筛选和种质资源的分类等。
Matsuura等发现利用RFLP分析可快速检测黄瓜杂交一代F1品种的纯度。
1999年,邓义才等用40个随机引物(P1-P40)对亲本和F1样本的DNA进行了PCR扩增,发现P14和P27这两个随机引物可稳定地扩增出在亲本间出现差异明显的多态性片段,能够清晰明确地鉴别亲本。
用P14和P27对亲本G992-2和987各35个DNA样本进行RAPD分析,从显示的结果分析表明,扩增产物在各亲本间所表现的多态性是完全一致的,可用于种子纯度检测。
2006年,李丽等利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术对35份不同类型的黄瓜品种进行了指纹图谱遗传多态性分析,从38对引物组合中筛选出3个多态性高的引物组合,此3对引物扩增得到的图谱可将35份黄瓜品种完全区分开来。
用SRAP分子标记技术得到了两个黄瓜品种杂交组合F1与亲本的指纹图谱中的鉴别条带,可用于黄瓜杂交种的纯度检测。
2010年,卢锐等以黄瓜杂交品种哈研808及其亲本为试验材料,利用102对EST-SSR引物对其进行纯度分析,筛选合适的引物,结果表明:有2对EST-SSR引物能够用于黄瓜杂交种子纯度的鉴定。
通过分子标记对亲本和F1的DNA进行扩增,建立起指纹图谱,通过比较鉴别条带,可以有效地鉴定F1品种纯度,进而判断杂种优势。
通过分子标记鉴定品种纯度,可以合理筛选品种,缩短育种时间。
五、展望分子标记技术已渗透到黄瓜遗传育种研究的各个方面,有力地推动了黄瓜育种的进程。
新的分子标记不断出现和完善,必将为分子育种发挥更大的作用。
首先,将分子标记辅助选择与传统育种经验相结合,合理利用多态性高的分子标记。
任何一种分子标记都具有各自的优缺点,根据研究对象和研究目的的不同,选用合适的分子标记,尤其注意对那些操作简单、稳定性和重复性好、成本低廉、安全高效的分子标记的引进和吸收。
其次,现有的黄瓜作图亲本大多为加工类型黄瓜,而我国黄瓜以鲜食为主,因此,应以鲜食型黄瓜作为作图群体构建分子图谱,并对该类型黄瓜的重要农艺性状进行基因定位。
第三,发展和利用永久性作图群体来构建遗传图谱,如,NILs、RILs和DH群体。
第四,对野生种质资源和国外资源的引进和充分利用,通过远缘杂交和原生质体融合技术,创新种质,拓宽黄瓜遗传背景,提高杂种优势。
第五,利用分子标记技术解决影响黄瓜生产中的关键问题。
黄瓜大多数经济性状都为数量性状,如,产量、品质、抗病性等,利用分子标记可以对多个基因进行分解分析。
第六,实现分子标记技术的自动化,提高工作效率。
参考文献:[1]时秋香,刘世强,等.与黄瓜M基因连锁的三个共显性标记[J].园艺学报,2009,36(5).[2]王军辉,等.利用SSR标记技术构建黄瓜遗传连锁图谱[J].北方园艺,2010,4(22).[3]王佳,徐强,等.黄瓜种质资源遗传多样性的ISSR分析[J].分子植物育种,2007,5(5).[4]王惠哲,李淑菊,孙霞,等.不同类型黄瓜亲缘关系的AFLP分析[J].华北农学报,2008,23(4).[5]HALLDEN C,et al. Absrract of plant genome III[J].San Diego RSA,1995.[6]罗建华,张海英,毛爱军,等.黄瓜ZYMV2CH抗性遗传与连锁分子标记研究[J].园艺学报,2006,33(5).[7]白智龙,袁晓君,蔡润,等.黄瓜霜霉病抗性QTL分析[J].自然科学进展,2008,18(6).[8]卢锐,叶永亮,冯国军,等.EST-SSR标记在黄瓜F1种子纯度鉴定中的应用[J].北方园艺,2010(18).(责任编辑王立河)。