如何确认RNA提取后的质量

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一般通过总量,纯度与完整性三大项检测来确认RNA质量:
1总量:微量分光光度计测260nm吸收值计算。

2纯度:微量分光光度计测260nm/230nm吸收值的比值,用于评估有机溶剂残留;260nm/280nm吸收值的比值,用于评估蛋白质污染比例。

3完整性:以Agilent Bioanalyzer进行毛细管电泳(capillary electrophoresis),并以软件的RIN(RNA Integrity Number)分数评估,10为RNA完整性最好,0为最差。

RNA质检参数中260、280、320、230nm下的吸光度分别代表了核酸、蛋白质、盐浓度和有机溶剂的值。

其中:
A230: 测定其它碳源物质,如酚,糖类等。

A260:核酸的吸收峰测,测RNA,DNA,引物等的浓度用的。

A280:蛋白质的吸收峰。

一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)在1.8~2.1范围内时,我们认为RNA中蛋白的污染是可以容忍的,不过要注意,当用Tris作为缓冲液检测吸光度时,R 值可能会大于2(一般应该是<2.2的)。

当R < 1.8时,溶液中蛋白的污染比较明显,可以根据自己的需要决定这份RNA 的命运。

当R > 2.2时,说明RNA已经水解成单核酸了,而纯RNA的OD260/OD280的比值为2.0。

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