乌金猪mtDNA D-Loop区的遗传多样性

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吉 首 大 学 学 报 (自然 科 学 版 )
第 39卷
1 材 料 与 方 法
1.1实 验 材 料 实验 用 乌金猪 血 液样本 由四川 省凉 山彝族 自治州 畜牧 科学 研究 院提 供.选 取健 康成 年 乌 金猪 (不 区分
公母 )的 3个 类群 ,四川 凉 山猪 27只(昭 觉 l1只 ,美 姑 13只 ,西 昌 3只 ),贵州 毕节 地 区柯 乐猪 21只 ,云 南 富 源县 大河 猪 2O只.用 内含 EDTA K抗 凝 剂 的试 管 自颈静 脉 采血 ,血液 样本 低 温保存 带 回实验 室备 用. 1.2主 要 试 剂
乌 金猪 mtDNA D—Loop区的遗 传 多样 性
王志敏 ,徐 亚 欧 ,孙 艳 ,杨 磊 ,徐 珑 洋 ,王 英 明 ,黄 卫 平
(1.西 南 民 族 大 学 生 命 科 学 与 技 术 学 院 ,四川I成 都 810041; 2.凉 山州 畜牧 兽 医科 学 研究 所 ,四川 凉 山 州 615042)
对乌 金猪 的起 源及 不 同类群 的遗 传关 系研究 多基 于其 外貌 特 征 ,分 布地 域 ,群 体 变化 ,生 产性 能 ,历史 考证 等 方 法进 行 .利用 现 代 分 子生 物 学 方法 对 乌 金猪 不 同类 群 间 的遗传 亲缘 关 系研 究 还 未见 报 道.动 物 mtDNA具 有广 泛 的种 内和种 间多 态性 ,且 为母性 遗传 ,在 亲缘关 系相 近 的物种 间其 进化 速度 比核基 因快 , 因而 它为 种群 遗传学 和进 化遗 传 学在分 子水 平 上 的研 究 提供 了理 想 的研 究 对 象.并 已广 泛 的应 用 于 动物 遗传 学 、遗 传分 化 、种 群遗 传结 构分 析 、原种 鉴定 、分子 生态 学等 方面 I4 ].本研 究利 用 mtDNA D-loop的多 态 性对 分 布于 与云南 (大河 猪 )、贵 州 (柯 乐猪 )和 四川 (凉 山猪 )乌金 猪 的 不 同类 群 的亲 缘 关 系进 行 比较 研 究 ,为今后 乌金 猪不 同类 群遗 传资 源 的保护 与开 发利用 提供 理论 依据 .
* 收稿 日期 :2017一O5—17 基 金 项 目 :凉 山州 应 用 技 术 研 究 与 开 发项 目(13CXYO004) 作 者 简 介 :王 志 敏 (1989一 ),女 ,贵 州 人 ,西 南 民族 大 学 生命 科 学 与 技术 学 院 硕 士 生 ,主 要 从 事 动 物 遗 传 育 种 研 究 通 信 作者 :黄 卫 平 ,女 (藏 族 ),凉 山州 畜 牧 兽 医科 学 研 究 所 高 级 畜 牧 师 ,主 要 从 事 养 猪 生产 与科 研工 作.
中 图 分 类 号 :Q953
文 献 标 志 码 :B
பைடு நூலகம்
DOI:10.3969/j.cnki.jdxb.2018.02.014
乌金猪 原产 于云 贵 高原 ,是 我 国优 良的地 方 遗 传资 源 之一 ,主要 分 布 在 云南 、贵 州 和 四川 交 界 的大 部 分 地 区.毛 色主要 有黑 色 和棕黄 色 ,因产 地 的不 同在 各 地 的 叫法 也 不 同.在 四川 的凉 山彝 族 自治 州 被称 作 凉 山猪 ,主要 分 布于凉 山州 的西 昌 、昭觉 和美 姑等 地 .贵 州 的柯 乐 猪 、威 宁 猪 ,云南 的大 河猪 等 均 属 于乌 金 猪 不 同类 群 .1976年云南 、贵 州和 四川 联合 调 查 认 为 ,上 述 不 同名 称 的 猪种 属 同种 异 名 ,将其 统 称 为 乌 金 猪 .乌金 猪具 有体 型健 壮 、后 驱 发达 、能适 应高寒 气 候和粗 放 饲养 ,适宜 高原 牧场 繁衍 ,形 成 了 肉质鲜 嫩 ,口 感好 ,在 云南 、贵州 和 四川 的冕 宁等地 有用 做火 腿 的习惯 _1。。].
2 Tag酶 PCR Master Mix、DNase/RNase—free去 离子水 、D2000 DNA Marker、天根 基 因组 DNA 提 取 试盒 和琼 脂糖 Agarose,均 购 自成都 康迪 生 物技术 有 限公 司. 1.3基 因组 DNA的提 取及 检测
利 用天 根生 物试 剂有 限公 司离 心柱 型血 液 基 因组 DNA 提 取 试 剂 盒 ,从 EDTA 抗 凝 全血 中提 取 基 因 组 DNA.紫 外分 光光 度 计检 测 DNA 样 品 D 260/280值及 浓 度 .配 制 1.5 琼 脂糖 平 板凝 胶 ,电泳 缓 冲液 为 0.5×TBE,溴 化 乙锭染 色 ,电压 为 120 V,电泳 时间 为 30 min,凝胶 成像 系统 观察 、保存 . 1.4引物 的设 计与 合成
第 39卷 第 2期 2018年 3月
吉 首 大 学 学 报 (自然 科 学 版 ) Journal of Jishou University (Natural Science Edition)
V0I.39 NO.2 M ar. 2O18
文章 编 号 :1007—2985(2018)02—0065—05
到 46个 突变 位 点 ,其 中 简 约信 息 位 点 为 5个 ,单 一 多 态位 点 为 37个 ,其 中 以 A/G 突 变 为 主 .凉 山猪 的 3个 类 群 (昭 觉 、美
姑 、西 昌 )首 先 聚 为一 类 ,然 后 凉 山猪 与 大 河猪 聚 为 一 类 ,最 后 凉 山猪 与 柯 乐 猪 聚 类.3个 地 区 的 乌 金 猪 有 2个 母 系起 源 ,大
摘 要 :为揭 示鸟 金 猪 3个地 方 类群 遗传 多样 性 及 其 分 布 情 况 .以乌 金 猪 的 3个 地 方 类群 凉 山猪 、大 河 猪 和 柯 乐猪 为 对
象 ,研 究 了线 粒 体 DNA D环 高 变 区 (mtDNA D-loop HVI)的序 列 多 态性 .研 究 表 明 ,在 全 长 290 bp的 核 苷 酸序 列 中共 检 测
河 猪 与 凉 山猪 为 一 个母 系起 源 ,柯 乐猪 为 另 一 个母 系起 源.就 总体 而言 ,鸟金 猪 的 各 地 方 类 群 凉 山 猪 与 大 河 猪 遗 传 亲 缘 关 系
最 近 ,其 次是 柯 乐 猪 ,有 2个母 系起 源.
关 键 词 :鸟金 猪 ;mtDNA D-loop;遗 传 多样 性
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