2018年广西崇左边境ART人群HIV-1分子网络特征分析

村 中 老 年 和 低 文 化 程 度 人 群 传 播 风 险 较 高 ，存 在 高 度 耐 药 毒 株 流 行 ，需 重 视 对 该 地 区 的 耐 药 基 因 序 列 常 规 监 测 并 加
强对重点人群的性健康教育。
关 键 词 ：艾 滋 病 病 毒 ；分 子 网 络 ；传播簇
中 图 分 类 号 ： R 373.9
Corresponding author: LIANG Hao, Email: lianghao@ Supported by sub-project of the 13th Five-Year National Major Science and Technology projects (2018ZX10101002GO1-006); Project supported by National Natural Science Foundation of China (82060610)
1 对象与方法
1 . 1 对 象 2018年1一9月在广西崇左市大新县、宁 明 县 、凭 祥 市 、龙州县四个地区进行常规Cl)4细胞检 测 的 所 有 在 治 H丨V/AlDS患 者 。纳 人 标 准 ：已确诊 HIV- 1 感 染 ，已接受抗病毒治疗，年龄> 1 8 岁 ，自愿参 与 研 究 并 签 署 知 情 同 意 书 ，成 功 扩 得 /w/区基因序 列 排 除 标 准 ：有 严 重 并 发 症 、不 愿 意 参 加 本 研 究 、 年龄低于18岁及测序结果不佳患者、 1 . 2 方法 1.2.丨 序 列 扩 增 及 测 序 对 血细胞样本进行前病毒 DNA提取和巢式PCR扩 增 ，扩增 长 度 为 1 300碱基对 (lmsepair,bp) . 采 用 1 % 的 琼 脂 糖 凝 胶 对 PCR产物 进 行 电 泳 分 析 ，由北京诺赛基因组研究中心有限公 司对扩增成功的样本进行测序。 丨.2.2亚型及耐药判断 使 用 Hypermut工具对所获 序 列 进 行 高 突 变 检 测 ，P<0.05时 认 为 高 突 变 成 立 (https：//www. hiv. lanl. gov/content/sequence/HYPERMUT/hypemu丨t.luml)。使 用 在 线 亚 型 判 别 工 具 COMET (https ://comet.lih.lu/)初 步 判 断 亚 型 ，使用 FastTree建 立 最 大 似 然 树 进 行 亚 型 确 证 。上传序列 至 斯 坦 ■ 福 大 学 耐 药 数 据 库 （https://hiv(丨丨Stanford. e(lu/ liivdh/l>y- nuitations/)进行耐药程度和耐药突变 位点分析，评分标准如下:敏感为< 10分 ，潜在耐药为 10〜14分 ，低 度 耐 药 为 1 5 ~ 2 9 分 ，中度耐药为30~59 分 ，高度耐药为冰0 分 。 1.2.3 分 子 网 络 构 建 分 子 网 络 构 建 基 于 川 乂 TRACE (https ://gilliiil).c'mii/veg/hivti.ace)，运行平台为 Limix内核白勺Uluintu 18.04 LTS，以识另IJ传播簇最多 的基因距离阈值为最佳基W距 离 阈 值 ，将大于网络 中各节点连接度上四分位数(75%)的连接度值定义 为 高 连 接 度 。成 簇 情 况 和 各 节 点 连 接 度 使 用 本 地 localhost基 于 .yarn平台的 hivtrace-viz (https:// github. (.om/ veg/hivtrace-viz)查看0 1 . 3 统 计 分 析 采 用 Kxcd 2016对 数 据 进 行 整 理 ，
genotype mutation in Chongzuo is critical. Sexual health education towards high risk population in rural areas needs to be strengthened.
Keywords: HIV; Molecular network; Transmission cluster
The molecular network was calculated in HIV-TRACE with pol gene sequences. The influence factors of clustering were
analyzed using logistic regression. Results 191 patients (51.5%) were included in the transmission network, and 31 (2-
areas. Routine monitoring of drug resistance and
收稿日期：2020-丨丨- 1 8 ;修回日期：202卜03-15 基 金 项 目 ：国家“ 十 K 五” 科技专项子课题（2018ZX10101002001-006);国家自然科学基金项目（82060610) 第一作者简介：杨垚（ 1994一 ），男 ，陕西省汉中市人，硕士研究生 在读，研究方向：艾滋病分子流行病学。
当 地 防 控 艾 滋 病 进 行 重 点 千 预 提 供 依 据 : 方 法 纳 入 2018年 1一 9 月 在 广 西 崇 左 市 大 新 县 、宁 明 县 、凭 祥 市 、龙州县
四 个 地 区 进 行 常 规 CU4细 胞 检 测 的 在 治 HIV/AIDS患 者 作 为 研 究 对 象 ，并 收 集 研 究 对 象 基 本 信 息 ，使 用 HIV-TKACE
and NVP. Conclusion The subtypes in HIV-1 positive patients receiving ART in Chongzuo were complex, and there was
a highly drug-resistant cluster exist. The risk of transmission was high among elderly and low education people in rural
பைடு நூலகம்
53) clusters were identified. People who had a relatively high proportion in clusters were farmers, males, Zhuang
minorities, and those with an education level of primary school, having commercial sex behavior, from Daxin county, over
中国艾滋病性病 202丨年6 月第 2 7 卷 第 6 期 Chin J AIDS STD Vol.27No.6Jun 2021 DOI: 10 .13419/ki.aids.2021.06.03
577 •论著•
2018年广西崇左边境A R T 人群HIV- 1 分子网络特征分析
杨 垚 、 梁 华 悦 \ 钟 姗 妹 \ 于 德 蛾 、 覃 彩 '，杨 媛 1' 张 菲 、 梁冰玉u , 梁浩1’2
60 years, and with CD4 count > 500 cells/|il. People from Daxin or Longzhou counties and aged ^ 60 had a high median
degree in the network. A highly drug-resistant cluster of CRF08 BC was identified with the mutation at K103 N for EFV
病 例 来 A 大 新 县 、龙 州 县 及 年 龄 > 6 0 岁 的 个 体 节 点 间 的 连 接 度 较 高 ：还 发 现 一 个 CRF08_BC亚 型 高 度 耐 药 簇 ，耐药突
变 位 点 以 K103 N 为 主 ，主 要 对 E FV 和 NVP产 生 耐 药 。 结 论 崇 左 地 区 接 受 ART的 HIV/AIDS患 者 基 因 亚 型 复 杂 ，农
文献标志码： A
文 章 编 号 ：1672-5662(2021 )06-0577-05
Molecular Network Analysis of HIV/AIDS patients receiving antiviral therapy in Chongzuo, Guangxi in 2018 YANG Yao', LIANG Huayue', ZHONG Shanmei', YU Dee1, QIN Cai', YANG Yuan'2, ZHANG Fei', LIANG Bingyu'2, LIANG Haol:. (/. Public health department o f Guangxi Medical University & Guangxi key laboratory fo r AIDS prevention and treatment, Nanning 530021; 2. Life Sciences Institute & Guangxi Collaborative Innovation Center for Biomedicine, Guangxi Medical University, Nanning 530021)
在 分 布 。 在 3 7 1 条 /W 序 列 中 ，有 191条 人 网 ，形 成 3 1 个 包 含 2〜 5 3 个 序 列 以 上 的 分 子 簇 ，人 网 率 51.5% 。农 民 、男 性 、
壮 族 、小 学 文 化 、有 商 业 性 行 为 史 ，来 f t 大 新 县 、年 龄 大 于 6 0 岁 ，CD4细 胞 计 数 大 于 500个V L 在 人 网 人 群 中 占 比 较 高 。
(1.广西医科大学公共卫生学院广西艾滋病防治研究重点实验室，南宁530021; 2.广西医科大学生命科学研究院 广西生物医药协同创新中心，南 宁 530021)
摘 要 ：目 的 构 建 广 西 边 境 崇 左 市 四 个 边 境 县 接 受 ART的 HIV/A1DS患 者 的 本 底 分 子 网 络 并 识 别 重 点 人 群 ，为
Abstract: Objective To develop evidence-based intervention strategies, we performed molecular network analysis
and identified the transmission hotspots o f HIV cases who received antiretroviral therapy (ART) in Chongzuo, a border
通信作者：梁浩，Email: lianghao@gxmu.e(丨
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IM司艾滋病性病 2021 年 6 月第 27 卷 第 6 期 Chin J AIDS STD Vol.27 No.6 Jun 2021
广西 壮 族 自 治 ix 崇 左 市 处 于 中 越 边 境 地 区 ，整 体 的 HIV- 1 疫 情 形 势 较 为 严 峻 叭 分 子 网 络 技 术 是 利用病毒基因序列研究传染病传播特征的新兴方 法 ，全 球 已 经 有 大 量 的 研 究 将 分 子 网 络 应 用 于 H1V 疫 情 监 测 ，探 寻 传 播 关 系 和 传 播 热 点 等 2 本研究 于 2018年 1_ 9 月选取崇左市大新、宁 明 、凭 祥 、龙州 四 个 边 境 县 中 接 受 ART的 H1V/A丨DS患者作为研究 对 象 . 构 建 本 底 分 子 网 络 并 分 析 网 络 特 征 ，为该地区 艾滋病疫情防控提供科学参考依据。
对 研 究 对 象 /W 区 基 因 序 列 进 行 分 子 网 络 分 析 。 结 果 共 获 得 371例 患 者 的 H IV/W 区 序 列 ，CKH)1_AE亚 型 是 主 要
的 传 播 亚 型 ，占 85.2%，其 次 是 CRF08_BC( 6.7%)和 CRF07_BC( 5.4%) , CRF55_01B 、CRF59_01B 、B 、A 1 和 URF 亚 型 散
area in Guangxi, China. Methods Patients who received ART and underwent baseline CD4 tests in Daxin, Ningming,
Pingxiang, and Longzhou countries from January 2018 to September 2018 were included. Basic information was gathered.