一种基于BP神经网络的蛋白质二级结构预测方法[发明专利]

专利名称：一种基于BP神经网络的蛋白质二级结构预测方法专利类型：发明专利
发明人：傅娟,汤达祺,汤德佑
申请号：CN201610020567.4
申请日：20160113
公开号：CN105740646A
公开日：
20160706
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明属于蛋白质二级结构预测方法领域。

本发明涉及一种用于蛋白质二级结构预测的BP 神经网络训练及预测方法，解决蛋白质二级结构预测效果差的问题。

本发明所述方法是：首先从PDB 中选取一组α螺旋、β折叠和卷曲三类结构占正常比例的训练样本集，对蛋白质的氨基酸序列信息编码后作为网络输入，对应氨基酸的二级结构作为网络输出；基于梯度方法上进行优化，引入附带动量项和自适应学习率的学习规则，避免“振荡现象”和陷入局部极小值；在输入层采用六位输入编码方式和滑动窗口技术，隐藏层结构根据经验公式和滑动窗口大小进行设置，输出层依据DSSP算法对蛋白质二级结构的分类进行输出预测。

申请人：湖南工业大学,华南理工大学
地址：412007 湖南省株洲市天元区泰山西路88号湖南工业大学产学研处
国籍：CN
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