核酸合成

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(可见光)
T+T
3' 5' 3' 5'
2.切除修复:由3种酶共同参与完成。
5' 3' 5' 3' 5' 3'
特异性核酸内切酶 DNA pol I
DNA连接酶
3' 5'
5' 3'
3' 5'
3.重组修复:亦称复制后修复
3' 5' 3' 5' 3' 5' 3' 5' 3' 5' 3' 5' 3' 5'
复制
DNA的复制过程
复制的起始 链的延长 复制的终止
复制的起始
2.依赖于单链模板,由引物酶催化按碱 基配对规律合成一小段RNA引物 (原核细胞引物长50-100个碱基,真 核约10个碱基)。
1.在拓扑异构酶、解链酶及单链结合蛋 白的共同作用下,DNA解旋、解链, 形成复制叉。
复制起始阶段的特点
5. 释放因子(RF)


模板链


DDDP 5´3´聚合作用示意图
5´ 3´外切 3´5´外切

C 3´

A
DDDP 的
5´3´外切及3´5´外切作用示意图
6. DNA连接酶(DNA Ligase)
作用:在有模板指导的条件下,催化2个 DNA片段(两片段间的距离为1个3' ,5' 磷酸二酯键的键长)的连接。 原理:在一个DNA片段的3' -OH末端和另一 个DNA片段的5'-P末端形成3',5'-磷酸 二酯键,从而实现连接。
起始密码子:AUG。 终止密码子:UAA, UGA , UAG。 . 6.摆动性
二、 tRNA(transfer RNA) — 蛋白质生物合成的 “高级搬运工”
氨基酸臂
反密码子环
l tRNA的功能:
¶ 特定的tRNA搬运特定的氨基酸, 保证了遗传信息传递的准确性。
· 活化氨基酸,跨越能障,使肽键的 形成变得容易。
(二)参与转录的酶和有关因子 ⒈ RNA聚合酶 常称为转录酶
▲ E.Coli的DDRP 由 5 个亚基组成 +σ因子 σα2ββ'(全酶)
α2ββ'(核心酶)
大肠杆菌RNA聚合酶亚基组成及其功能 ──────────────────────── 类型 亚基/酶分子 主 要 功 能 ──────────────────────── α 2 决定哪些基因被转录 β 1 参与转录的全过程 β' 1 与模板DNA结合 σ 1 识别转录起始点 ────────────────────────
一 蛋白质生物合成体系
一、 mRNA(messenger RNA) • —— 蛋白质生物合成的直接模板
DNA mRNA 蛋白质
一、 mRNA
* mRNA分子中每三个相临碱基组成一个 密码子,代表一种氨基酸,或起始信号, 或终止信号。
* mRNA上的四种碱基可组成64(43)个密码子, 其中61个代表不同的氨基酸,其余三个 代表终止信号。
4.引物酶
DNA不能从无→有合成,需在一小段 RNA基础上合成DNA RNA的合成:需引物酶,它是一种特殊 的RNA聚合酶。
5´ 3´





5、原核生物(E.coli)迄今已知只有 3种:DNA polⅠ、 DNA polⅡ、 DNA
polⅢ。
酶 作用
DNA聚合酶Ⅰ 5‘-3’聚合酶及外切酶作用,3‘-5’外切 酶酶作用,可校正/修复DNA链,还可切除引物 DNA聚合酶Ⅱ 5‘-3’聚合酶及3‘-5’外切酶酶作用,可 校正/修复DNA链 DNA聚合酶Ⅲ 与酶Ⅰ作用类似,酶活高,是主要的链延伸酶 (聚合酶
通 用
遗 传 密 码

l 遗传密码的5个特点:
. 1. 通用性: 从简单生物到人类使用同一套密码子。 由此可推测所有生物来源于一个共同的祖先。 . 2. 方向性: mRNA中密码子的阅读方向是5′→3′。 . 3. 简并性: 除Met,Trp外,其余氨基酸由2个以上 密码子编码。同义密码子 (但每一个密码子仅对应一个氨基酸) 生物学意义:保证属的稳定性。
原核细胞:仅有一个复制起始位点,但往往是双向复制
链的延长

引物合成后,由DNA polⅢ,在引物3'OH末端逐一添加与模板链对应互补的 脱氧核苷磷酸,使新合成的链不断延长。
领头链:链的延长方向(5' 3')与解链方向(复制 叉移动方向)相同, 为连续合成。 随从链: 链的延长方向(5'3')与解链方向(复制 叉移动方向)相反,为不连续合成。 分段合成的DNA片段, 最初被命名为冈 崎片段
DNA复制
RNA→DNA
反转录
一、DNA的半保留复制
1.定义:
以亲代DNA双链为模板以碱基互补方式合成子 代DNA,这样新形成的子代DNA中,一条链来自亲 代DNA,而另一条链则是新合成的,这种复制方 式叫半保留复制。
必须具备的基本条件
模板:母链DNA 原料:dNTP(包括dATP、dGTP、dCTP 、dTTP) 酶和蛋白质因子: 引物:一小段RNA 能量(ATP)及某些无机离子
重组
DDDP I DNA 连接酶
5' 3'
5' 3' 5' 3'
5' 3' 5' 3'
5' 3' 5' 3'
4. SOS修复:DNA分子受到较大范围的损 伤,细胞对危急状态所作出的反应。
机制
SOS调节网诱导产生的DNA聚合酶特异性 低,识别碱基能力差, 使修复部位仍存在较 多错配的碱基,但细胞能继续生存。
转录的DNA模板
• 细胞内DNA不是其全长都可作为转录 模板 • DNA双链中,可作为模板转录成 RNA 的一条链,称为模板链(或反意义链) • 同一DNA双链中与模板链相对(互补)的 一条链称为编码链(或有意义链),可见 转录是不对称的 • 模板链=反意义链=负链 • 编码链=有意义链=正链
为何称模板链为反意义链 ,编码链为有意义链? 可从下图理解: 5' …GCA GTA CAT GTC …3 ' 编码链 DNA 3 ' …CGT CAT GTA CAG …5' 模板链 转录 5' …GCA GUA CAU GUC …3 ' mRNA 翻译 N … 丙 - 缬 - 组 - 缬… C 肽 比较编码链和 RNA 链的碱基序列可见,除了以 U代T外,其余均一致。基因组序列均以编码链( 正链)表示.
. 4. 连续性: 密码子的排列是连续的,不间隔,也不 重叠。 5′…. UCACGACAUAUG….3′ 丝 精 组 蛋 5′….UCAGCGACAUAUG….3′ 插入 丝 丙 苏 酪 缺失 5′…. UCAGACAUAUG….3′ 丝 天 异亮 * 移码突变是最严重的突变!
. 5. 起始密码子与终止密码子:
3. 转录终止
• 依赖 因子的终止 • 不依赖于因子的终止
不依赖因子的终止
l 作用机理:终止信号区特殊碱基 序列决定RNA形成发夹形二级结构, 这是阻止转录继续向下游推进的关键;
蛋白质的生物合成
蛋白质合成(Translation)
• 以mRNA为直接模板,tRNA为氨基酸运
载体,,核蛋白体为装配场所,共同协调 完成蛋白质生物合成的过程。也就是把 mRNA的碱基排列顺序转译成多肽链中氨 基酸的排列顺序。
III
或领头链
三、DNA复制的半不连续性
前导链:以3’ → 5’ 方向的
亲代链为模板连续合成的子代链。
前导链
冈崎片段 滞后链
滞后链:以5’ →3’方向
的亲代链为模板的子代链先逆 复制叉移动方向合成冈崎片段, 再连接成滞后链。
DNA链的延伸
在DNA聚合酶Ш的催化下, 以四种5’ -脱氧核苷三磷 酸为底物,在RNA引物的3’ 端以磷酸二酯键连接上脱 氧核糖核苷酸并释放出焦 磷酸。DNA链的延伸同时进 行前导链和滞后链的合成。 两条链方向相反。
参与复制的酶类与蛋白质因子 1. 拓扑异构酶(解超螺旋酶)
切割(断)双链DNA中的一链,松解螺旋,
2. 解链酶(又称解螺旋酶或螺旋酶,helicase)
作用:断裂互补碱基间的氢键,使DNA双链分离形 成“复制叉”。
解链酶
3. 单链结合蛋白(DNA结合蛋白)
作用:防止重新形成双 链和防止单链模板 被核酸酶水解,维持DNA单链状态和完整性
DNA的损伤与修复
一、DNA的损伤
概念
生物体受某些理化和生物等外源性 因素或机体内环境改变的影响,引起 DNA分子结构的任何异常改变称为DNA 损伤(DNA damage)
DNA损伤的修复

若碱基错配频频发生或损伤范围大,则
需采用以下修复方式进行修复.
DNA修复方式 1. 光修复:
光复活酶
TT
肽酰结合位点(P位) 氨酰接受位(A位)
mRNA mRNA 结合位点 P T A Ep 细胞 内膜 系统
Et
A:受位,氨基酰位;
T:转肽酶。
P:给位,肽位; Ep:多肽链出口; Et:tRNA出口
四、 参与蛋白质生物合成的其他组分
1. 氨基酰tRNA合成酶 2. GTP,ATP 3. 起始因子(IF) 4. 延长因子(EF)
1. 转录起始
DDRP(σ亚基)辨认并结合于启动子部位 由DDRP催化,头2 个NTP直接在起始点形成 第一个磷酸二酯键(不需引物,由模板指导), 形 成转录起始复合物
第 一 个 总 是
GTP
2. 链的延长


• RNA链的延长由核心酶催化 • 核心酶沿模板链3'→5'方向移动,RNA 链按碱基配对规律沿5'→3'方向延伸 • 新生链与模板链形成杂化双链(该杂化 分子结构不稳定,RNA链游离后, DNA双链重新形成)
后果
引起DNA较长期的、广泛的突变。
第二节 RNA的生物合成 两种方式
DNA→RNA
转录
存在于绝大多数生物体
RNA→RNA
RNA复制
存在于某些病毒体内
一、转 录
(一)概念
在RNA聚合酶催化下,以DNA的一条 链为模板,4种NTP为原料,按碱基配对规 律(T-A,A-U,G-C)合成一条与模板链互补的 RNA链的过程。
l tRNA上的反密码子识别mRNA上的 密码子遵循不稳定或摆动配对原则。
mRNA
5′ ACG UGU 5′ 3′
反密码子的 第一碱基 密码子的 第三碱基
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
tRNA反密码环
3′
U G I
A或G C或U U,C或 A
* 一种tRNA仅转运一种氨基酸, 而一种氨基酸可由几种tRNA转运。
三、核糖体(ribosome) —— 蛋白质生物合成的场所 转录
¸ 将密码子信息转换为对应氨基酸的符号 —— 接合体,接合器,适配器等。 即tRNA能与专一的氨基酸结合并识别 mRNA分子上的密码子.
l tRNA搬运功能的忠实性是通过以下 两条途径实现的:
¶ 不同的tRNA有不同的碱基组成,并由 不同的氨基酰tRNA合成酶识别。
既能识别特异的tRNA, 又能识别特异的氨基酸。 · tRNA的反密码子识别mRNA的密码子。
前导链
滞后链
冈崎片段
冈崎模型
半不连续复制
复制的终止
1.水解引物及填补空隙
冈崎片段合成后,由DNA polⅠ水解去除 RNA引物,并填补留下的空隙(5' 3')聚合。
2.完整双链DNA分子的形成
填补空隙后,DNA片段与片段之间还有一 个缺口(一个3',5'-磷酸二酯键的长度), 由 DNA连接酶催化连接成完整的链,从而产 生完整的双链DNA分子。
DNA rRNA 核糖体:大、小亚基组成(蛋白质和rRNA)
l 组成、结构与功能特点:
. 1. 结构复杂而精密 由3种的rRNA(占60%左右) 及数十种蛋白质组成。 . 2. rRNA起着主导的作用,蛋白质 协助维持rRNA的功能区域。
• • • • •
有容纳mRNA的通道 能结合起始、延长及终止因子等。 有A位(acceptor site)和P位(donor site). 有转肽酶活性,催化肽键形成 大亚基上有延长因子依赖的GTP酶活性, 可为转肽提供能量。
RNA聚合酶的主要功能
• 能识别并结合于DNA模板的启动子部位 • 解开DNA双螺旋,产生单链模板; • 不需引物,催化形成第一个3',5'-磷酸二酯 键,沿 5'→3'方向延伸RNA链 • 能识别DNA模板上的转录终止信号依赖 于ρ因子
(五) 转录过程
(以大肠杆菌的转录为例)
• 起始 • 延长 • 终止
核酸的合成 DNA的生物合成和修复 RNA的生物合成和加工
中心法则
复 制 DNA 转 录 RNA 翻 译 复 制 反 录 转 蛋 质 白
生物的遗传信息从 DNA传递给mRNA的过 程称为转录。根据mRNA链上的遗传信 息合成蛋白质的过程,被称为翻译和表 达。
第一节 DNA的复制
两种方式
DNA→DNA
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