常用的克隆载体
克隆载体
谢谢
载体的分类
pBR322质粒载体
重组体的筛选
通过由转化子所显示出的抗生素抗性来鉴定出重组体,需要 用到阴影平板培养。
表达载体及其必须具备的条件:
1.载体能够独立的复制; 2.应具有灵活的克隆位点和方便的筛选标记,以利于外 源基因的克隆、鉴定和筛选; 3.应具有很强的启动子,能被RNA聚合酶所识别; 4.应具有阻遏子,使启动子受到控制,只有当诱导时才 能进行转录; 5.应具有很强的终止子,以使RNA聚合酶集中力量转录 克隆的外源基因,同时使很强的终止子所产生的mRNA 较为稳定;
突变的类型
(3) 倒位 (inversion) 或转位(translocation)
DNA重组使其中一段核苷酸倒置,或从一处迁移到另一处。
倒位或转位(transposition) 指DNA链重组使其中一段核苷酸链方向倒置、或从一处迁移到另一处。
克隆载体
质粒载体的设计 噬菌体载体
克隆载体(Cloning Vector)
M13噬菌体载体
概念:M13噬菌体是一种丝状噬菌体,内有一个环状单链DNA分子,长6.7kb的核 苷酸,含DNA复制和噬菌体增殖所需的遗传信息。
功能:该类噬菌体作为克隆载体,可以通过质粒提取技术在细菌培养物中获取。M13噬 菌体主要用于克隆单链DNA。
侵染对象: 只感染F+(含F质粒,能产生性菌毛)的大肠杆菌。 克隆特点:感染性的单链噬菌体 DNA (正链)在宿主酶的作用下转变成环状双链 DNA , 用于 DNA 的复制,因此这种双链 DNA 称为复制型 DNA (replicative form DNA) ,即 RF DNA 。 目的片段插入RFDNA→感染感受态大肠杆菌细胞→从培养液中获得纯的噬菌体颗粒
生物工程概论试题及答案
生物工程概论试题及答案一、单项选择题(每题2分,共10分)1. 生物工程中常用的基因克隆载体是:A. 质粒B. 噬菌体C. 病毒D. 染色体答案:A2. 以下哪项不是生物反应器的类型?A. 搅拌式生物反应器B. 填充床生物反应器C. 流化床生物反应器D. 电化学生物反应器答案:D3. 基因工程中,用于将目的基因导入植物细胞的方法是:A. 电穿孔法B. 脂质体介导法C. 农杆菌介导法D. 病毒载体法答案:C4. 以下哪种技术不属于蛋白质工程?A. 定点突变B. 基因编辑C. 蛋白质纯化D. 蛋白质结构预测答案:C5. 生物降解塑料的主要原料是:A. 聚乳酸B. 聚氯乙烯C. 聚苯乙烯D. 聚丙烯答案:A二、多项选择题(每题3分,共15分)6. 以下哪些属于生物工程的应用领域?A. 医药B. 农业C. 食品工业D. 能源答案:ABCD7. 基因治疗中可能使用到的载体包括:A. 质粒B. 病毒载体C. 脂质体D. 纳米粒子答案:ABCD8. 生物传感器的组成部分通常包括:A. 生物识别元件B. 信号转换器C. 放大器D. 数据处理器答案:AB9. 以下哪些是生物工程中常用的细胞培养技术?A. 悬浮培养B. 贴壁培养C. 微载体培养D. 共培养答案:ABCD10. 以下哪些属于生物工程产品的安全性评估内容?A. 毒性B. 过敏性C. 遗传稳定性D. 环境影响答案:ABCD三、填空题(每题2分,共10分)11. 生物工程中,________是指利用生物体(如微生物、动植物细胞)或其组成部分(如酶)作为生物催化剂进行化学反应的过程。
答案:发酵工程12. 基因克隆的最终目的是在宿主细胞中________。
答案:表达目的基因13. 在蛋白质工程中,通过________可以改变蛋白质的结构和功能。
答案:定点突变14. 生物降解塑料的优点包括可降解性、________和生物相容性。
答案:生物可再生性15. 细胞培养中,________是指细胞贴附在培养容器壁上生长的过程。
列举重要质粒
列举重要质粒
质粒是一种环形的DNA 分子,常存在于细菌、真菌等生物体中,它能够自主复制并在细胞间转移,携带一些重要的基因信息。
以下是一些重要的质粒:
1. pUC19 质粒:这是一种常用的克隆载体,携带氨苄青霉素抗性基因和lacZ 基因。
它常用于在大肠杆菌中克隆和表达基因。
2. pET 系列质粒:这是一类用于表达外源基因的质粒,常用于在大肠杆菌中高效表达蛋白质。
pET 系列质粒携带T7 启动子,可以诱导基因的高水平表达。
3. pBR322 质粒:这是一种经典的质粒,携带氨苄青霉素和氯霉素抗性基因。
它常用于基因克隆和质粒构建。
4. pGL3 质粒:这是一种用于荧光素酶报告基因检测的质粒,常用于研究基因调控和启动子活性。
5. pGEX 系列质粒:这是一类用于表达谷胱甘肽S-转移酶(GST)融合蛋白的质粒,常用于蛋白质的纯化和检测。
这些质粒在分子生物学、基因工程和生物技术等领域具有重要的应用价值。
当然,还有许多其他类型的质粒,它们具有不同的特性和用途,可根据具体需求选择合适的质粒。
第四章克隆载体的特征及类型
质粒
重要得大肠杆菌质粒载体
pBR322:
松弛型复制
Pvu I
Pst I
拷贝数 50 - 100 / cell
氯霉素可扩增
用于基因克隆
EcoR I
Cla I
Pst I
Hind III
BamH I
Apr
Tcr
pBR322
4363 bp
ROI ROP
Sal I Bal I
Origin of Replication Hind II
自主复制型载体和附加载体得扩增方式
载体得类型
应用范围:克隆载体、表达载体。 应用对象:原核载体、真核载体(酵母、植物和动物)、 穿梭载体。 构建来源:质粒载体、病毒或噬菌体载体、质粒DNA与病 毒或噬菌体DNA组成得载体、质粒DNA与染色体DNA片段 组成得载体。
克隆载体(cloning vector)
pUC18/氯-3-吲哚基-b-D-半乳糖苷
X-gal
b
a b-半乳糖苷酶得a-肽段
CH2OH
HO
O
H OH H
O
H
H
H OH
Cl Br
N
Cl O Br
N
N
Br Cl
质粒
重要得大肠杆菌质粒载体
pGEM-3Z:
多拷贝
装有多克隆位点(MCS)
Apr
正选择颜色标记 lacZ’
lacZ'
pUC18 ori
2686 bp Apr
用于基因克隆和测序
pUC18也来自于pBR322,但只保留了复制起点和ampR位点,ampR基因 得序列已改变限制性位点不再存在,所有得克隆位点集中在lacZ基 因内得一个小片段上。
克隆载体
青霉素抗性检测、蓝白斑筛选(重组表型检测标记)
15
三个显著区别:
1. 分子量更小,仅为2.7KB,容纳外源DNA量增大;具有更 高的拷贝数(每个细胞含500-700个拷贝)
2. 含易于检测是否有外源DNA插入的标记基因LacZα,可利 用-互补原理进行蓝白筛选
3. 多克隆位点区(MCS)由人工合成的多个单一酶切位点构成
第一节 载体简介 第二节 克隆载体* 第三节 人工染色体载体 第四节 表达载体
概念:携带目的基因进入宿主细胞进行复制、扩增和 表达的工具称载体(Vector);即用于克隆、运载和转移目的基 因并能自我复制的DNA分子
一个DNA片段只有与合适的载体DNA连接构成重组 DNA后,才能高效地进入宿主细胞,并在其中复制、扩增
3. 加入选择性标记:通过质粒间的重组使质粒携带合适标 记,常用的有抗生素抗性标记。如:氨苄青霉素抗性标 记、四环素抗性标记、卡那霉素抗性标记等
4. 安全性能改造:不能随便转移,以免污染环境 5. 改造或增加基因表达的调控序列:比如加入强启动子
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11
4363bp
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12
Ampr
3. 加装选择标记
如加入lacZ’ 使受体细胞在裂解之后形成蓝色透明圈
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B. λ噬菌体载体分类
1. 插入型载体: 仅有一个可供外源DNA插入的克隆位点,如λgt系列 只能插入较小的外源DNA片段(小于10kb)
cos
cos
LA
RA
EcoRI
2. 替换型载体:具有两个对应的酶切克隆位点
噬菌体还有一大优点,即使它的DNA丢失25%仍不失活, 这部分丢失的空档正好可以装载外源DNA
简述基因克隆载体的主要类型
简述基因克隆载体的主要类型
基因克隆载体是指一类可以携带外源DNA片段并能够被复制的DNA分子。
常用于基因工程中,将特定基因序列克隆到载体DNA上,进而进行转化和表达。
根据不同的功能和应用,基因克隆载体可以分为多种类型,以下是主要的几种:
1. 质粒(Plasmid):质粒是最常用的基因克隆载体之一,通常起源于细菌,具有自主复制的能力,易于操作和扩增。
质粒通常被用于基因表达、基因敲除和基因突变等领域。
2. 病毒载体(Viral Vector):病毒载体是一类通过改造病毒而成的基因克隆载体,具有高度的转染效率和生物安全性。
病毒载体通常被用于基因治疗、免疫治疗和癌症治疗等领域。
3. 人工染色体(Artificial Chromosome):人工染色体是一种可以模拟天然染色体结构和功能的基因克隆载体,通常具有高度的稳定性和扩增性能。
人工染色体通常被用于基因组学研究和治疗复杂遗传病等领域。
4. 原核表达载体(Prokaryotic Expression Vector):原核表达载体是一类专门用于大肠杆菌等原核生物中进行基因表达的基因克隆载体。
原核表达载体通常具有高度的表达效率和易于操作的特点,被广泛应用于蛋白质制备和生物技术研究等领域。
分子克隆详细步骤
分子克隆详细步骤分子克隆是通过重组DNA分子来产生大量完全相同的DNA序列的技术。
在分子克隆工作中,我们主要进行克隆载体的构建、目标DNA的扩增、将目标DNA插入克隆载体中、转化和筛选等步骤。
下面将详细介绍这些步骤:1.克隆载体的构建:克隆载体是用于插入目标DNA的DNA分子。
常用的克隆载体包括质粒、噬菌体和人工染色体等。
在构建克隆载体时,我们首先需要选择适合的载体,并提取载体的DNA。
然后,利用酶切酶对载体进行酶切,生成线性的载体DNA。
接下来,将目标DNA插入克隆载体的相应位点上,形成重组的载体。
2.目标DNA的扩增:目标DNA可以通过PCR(聚合酶链反应)来扩增。
首先,设计引物,使其与目标DNA的两端末端相互互补。
然后,在PCR反应中,通过DNA聚合酶的扩增作用,使目标DNA得以扩增。
PCR反应通常包括模板DNA、引物、核苷酸和聚合酶等成分。
3.目标DNA的插入:将扩增后的目标DNA与酶切后的载体进行连接,利用DNA连接酶催化目标DNA与载体之间的连接反应,生成重组的克隆载体。
连接后的载体含有目标DNA的序列。
4.转化:将克隆载体引入宿主细胞中进行复制。
这一步骤通常称为转化。
转化可以通过电击、热激、化学方法等方式进行。
宿主细胞通常是大肠杆菌等细菌。
5.筛选:利用筛选方法来选择包含目标DNA的克隆。
常用的筛选方法包括抗生素筛选、报告基因筛选和限制性内切酶酶切筛选等。
抗生素筛选是将带有选择性抗生素耐受基因的克隆引入含有相应抗生素的培养基中,只有带有目标DNA的克隆才能生长。
报告基因筛选是通过将报告基因插入克隆载体中,使之与目标DNA一起被转录和翻译,从而表达报告基因的蛋白质,以此来筛选包含目标DNA的克隆。
限制性内切酶酶切筛选是通过限制性内切酶对重组载体和目标DNA进行酶切,并通过凝胶电泳的方法来分离并检测含有目标DNA的克隆。
以上就是分子克隆的详细步骤。
通过这些步骤,我们可以获得大量完全相同的DNA序列,并用于各类分子生物学研究和应用中。
质粒载体种类
质粒载体种类质粒载体是分子生物学实验中常用的工具,用于在细胞中携带外源DNA序列,并实现其在细胞内的复制和表达。
根据其结构和功能的不同,质粒载体可以分为多种类型。
本文将介绍常见的几种质粒载体及其特点。
一、表达质粒载体表达质粒载体是常用的质粒载体类型之一,用于外源基因的表达。
其中,pUC18是常用的表达质粒载体,其大小为2686bp,含有多个重要的功能元件。
例如,pUC18包含了抗生素耐受基因,如AmpR基因,使得细菌能够在含有抗生素的培养基上生长。
此外,pUC18还包含了启动子、终止子和复制起始位点等重要序列,能够实现外源基因在细菌中的高效表达。
二、克隆质粒载体克隆质粒载体是用于基因克隆的质粒载体类型。
pBluescript II KS+是常用的克隆质粒载体,其大小为2960bp。
pBluescript II KS+含有多个克隆位点,如多克隆位点(MCS),能够方便地进行DNA片段的插入和克隆。
此外,pBluescript II KS+还包含了T7和T3启动子,使得插入的DNA片段能够通过转录和转录后修饰的方式进行进一步研究。
三、RNA干扰质粒载体RNA干扰质粒载体是用于RNA干扰实验的质粒载体类型。
pSUPER是常用的RNA干扰质粒载体,其大小为3144bp。
pSUPER含有特定的siRNA序列,能够通过RNA干扰技术抑制特定基因的表达。
此外,pSUPER还包含了启动子和选择性标记基因,使得转染细胞后能够通过选择性培养基筛选出抑制特定基因表达的细胞株。
四、双杂交质粒载体双杂交质粒载体是用于蛋白质相互作用研究的质粒载体类型。
pGBKT7和pGADT7是常用的双杂交质粒载体,分别用于检测靶蛋白的DNA结合活性和激活活性。
pGBKT7和pGADT7含有启动子、选择性标记基因和多克隆位点等重要元件,能够实现蛋白质相互作用的检测和分析。
五、表面显示质粒载体表面显示质粒载体是用于细胞表面展示外源蛋白的质粒载体类型。
克隆载体的名词解释
克隆载体的名词解释克隆载体是分子生物学实验中常用的工具,用于携带并负载外源DNA片段,以实现基因克隆和基因工程。
克隆载体可由天然或人工合成的DNA构建而成,广泛用于基础研究、基因表达、基因治疗等领域。
本文将从克隆载体的定义、组成结构、常见类型以及应用等方面对其进行解释。
一、克隆载体的定义克隆载体是指用于将目标外源DNA导入到宿主细胞或有机体中,并在其中进行自主复制、表达和传递的DNA分子。
克隆载体具有一系列特定的序列和功能元件,包括起始子、终止子、选择标记、荧光蛋白等,以确保成功实现目标DNA的克隆和表达。
二、克隆载体的组成结构克隆载体通常由一个或多个元件组成,包括DNA序列、选择标记、表达载体以及复制起源,具体结构如下:1. DNA序列:克隆载体内含有目标外源DNA的序列,其大小和类型因实验需求而异。
DNA序列通常具有特定的限制性内切酶切位点,以便于将外源DNA片段定向插入到载体中的特定位置。
2. 选择标记:为了筛选成功克隆和转入宿主细胞的载体,克隆载体通常携带有选择标记基因,如抗生素抗性基因或荧光蛋白基因。
这些标记基因在宿主细胞中可以提供对抗生素的耐药性或特定荧光表达,从而方便筛选出含有目标外源DNA的成功克隆载体。
3. 表达载体:对于需要进行表达的克隆载体,其内部还包含有启动子、终止子以及表达宿主基因的相关元件。
这些元件协同作用,使得克隆载体能够在宿主细胞中进行基因的转录和翻译,从而实现目标基因的表达。
4. 复制起源:为了保证克隆载体能够在宿主细胞中独立复制,克隆载体通常还含有复制起源序列。
复制起源序列可以与宿主细胞的复制系统相互配合,使得克隆载体能够被复制并遗传到下一代细胞中。
三、克隆载体的常见类型克隆载体具有多种类型,根据其应用和特性的不同,常见的克隆载体包括质粒、噬菌体、合成DNA以及病毒载体等。
1. 质粒(Plasmid):质粒是环状的双链DNA分子,常见于细菌和真核生物中。
质粒通常具有小分子大小(约1-10 kb),较容易复制和操纵。
常用克隆载体
PAC ( P1-derived artificial chromosome, 插入片 段可达300kb)
本图所表数字是 以 EcoR I 位点中央计为0, 从顺时针方向计算,至各 酶切位点的 第一个碱基的 数。在圆的内 部所表示的 各限制酶是在 pBR322 DNA上只有一个酶 切位 点的酶,圆外所表示的各 酶是在pBR322 DNA上 有2个至3个的酶切位点的 酶,()内的数是酶切位 点数
质粒载体pUC19
缺点:插入M13的外源DNA超过1000bp时就不稳定,在 噬菌体增殖时会出现缺失。
噬菌粒载体
由质粒载体和单链噬菌体载体结合而成的新型载体系列, 称为噬菌粒(phagemid)。
噬菌粒(phagemid)是带有丝状噬菌体复制起始点的 质粒。
pUC118/pUC119噬菌粒载体; pBluescript噬菌粒载体(最常用,M13载体在多克隆 位点的两侧引入了T7和T3两个噬菌体的启动子。)
常用的粘粒载体
用于在细菌中增殖真核DNA的粘粒载体 pJB8, c2RB, pcos1EMBL 用于转染哺乳动物细胞的粘粒载体 cos202/203,pWE15/16
粘粒的主要特征
(1)由质粒与组成的一种4-6kb的环状杂种DNA, 容易分离并可分离操作。既能像质粒一样在细菌 中繁殖,又能像一样在体外包装,并高效导入受 体细胞。
基因工程常用的克隆载体
克隆载体
目的基因进入细胞必须要有载体(vector) 的运载作用才能实现。
载体运载外源DNA至宿主细胞,是通过 载体自身DNA的核酸序列中插入了外源 DNA,再进入宿主细胞内进行的DNA复制, 在载体DNA复制时,外源DNA分子也获得 了复制(扩增)和表达。
基因克隆的载体
插入失活型质粒载体
将外源DNA片断插入在质粒上会导致选择记号基因 失活的位点,就有可能通过抗菌素抗性的筛选,大幅度 的提高获得阳性克隆的机会。
Example:
在pBR329质粒载体的EcoR1位点插入外源片断,会 使氯霉素抗性基因失活,在筛选的氯霉素敏感的转化子 细胞群体中,含有插入片断的重组体质粒的几率会显著 上升。
4、有适合的标记,易于选择。
5、有时还要求载体要能启动外源基因进行转录及表达, 并且尽可能是高效的表达。 6、从安全角度考虑,要求载体不能随便转移,仅限于在 某些实验室内特殊菌种内才可复制等等。
载体
功能 克隆载体: 克隆一个基因或DNA片断 表达载体: 用于一个基因的蛋白表达 整合载体: 把一个基因插入到染色体组中
正选择的质粒载体
正向选择:应用只有突变体或重组体才能正常生 长的培养条件进行选择。 这种质粒载体具有直接选择记号并可 赋予寄主细 胞相应的表型。
正向选择质粒载体的条件限制: 1、需要特殊的寄主菌株或选择培养基 2、可使用的克隆位点少 3、 假阳性水平高 4、 不能够调节插入序列表达活性
表达型的质粒载体
微量碱变性法分离程序:
1、取1.5毫升含质粒的大肠杆菌过夜培养物,加在微量离心管 中,离心收集细胞沉淀; 2、加入100微升冰冷的溶液I(50mM葡萄糖, 25mM TrisHCl PH=8.0, 10mM EDTA,4~5mg溶菌酶)静置5分钟; 3、加入200微升微冷的溶液II(0.2NaOH,1.0%SDS)缓缓 混匀置室温5分钟。 65度水浴一段时间会加强染色体DNA的变性作用。 4、加入150毫升冰冷的PH=4.8的3M醋酸钠(溶液III),振荡后, 冰浴5分钟。 5、离心的上清液用苯酚抽提数次,用乙醇沉淀收集质粒DNA。
常用的克隆载体
第一章 概 论 第二章 基因疫苗工作原理 第三章 基因疫苗抗原基因的筛选和克隆 第四章 基因疫苗的构建 第五章 基因疫苗制备第六章 基因疫苗免疫方法 第七章 基因疫苗免疫效果检测 第八章 影响基因疫苗免疫效果的因素第九章 基因疫苗安全性第十章 细菌病基因疫苗第十一章 病毒病基因疫苗第十二章 寄生虫病基因疫苗第十三章 肿瘤基因疫苗第十四章 控制动物生长性能的基因疫苗 四、常用的克隆载体克隆载体就是将目的基因导入宿主细胞进行复制,从而获得大量克隆化片段的运载工具,常用的克隆载体种类很多,主要包括质粒、粘粒和噬菌体等。
其中,质粒是目前应用最为广泛的克隆载体。
下面简要介绍作为克隆质粒的特性和结构。
(一)质粒特性质粒是指在染色体外能够独立复制和稳定遗传的一类环状双链 DNA 分子。
有的质粒处于染色体外的游离状态,可以随着染色体的复制而复制,并且通过细胞分裂传递到子代。
有的质粒在一定条件下能够可逆地整合到寄主染色体上。
质粒的表示常根据 1976 年提出质粒命名原则,用小写字母 p 代表质粒,在 p 字母后面用两个大写字母代表发现这一质粒的作者或者实验室名称。
例如质粒 pUCl8 ,字母 p 代表质粒, UC 是构建该质粒的研究人员的姓名代号, 18 代表构建的一系列质粒的编号。
质粒广泛地分布于原核生物细胞中,也存在于一些真核细胞中。
质粒相对分子质量范围为10 6 -2 @ 10 8 。
根据质粒在受体细胞内的数量将质粒分为严紧型质粒和松弛型质粒两种类型。
严紧型质粒在每个细胞只有 1 个至几个拷贝;松弛型质粒在每个细胞中有 10-200 个拷贝。
质粒可以分为三种构型,一种是呈现超螺旋的 SC 构型( scDNA ),一种是开环 DNA( ocDNA ),另一种是呈线形分子的 L 构型。
质粒 DNA 与一般 DNA 分子的理化性质相似,例如溶于水、不溶于乙醇等有机溶剂、能吸收紫外线、可嵌入溴乙锭染料等。
实验室常利用这些理化特性鉴定和纯化质粒。
基因克隆的载体噬菌粒载体
基因克隆的载体噬菌粒载体
第3页
4. 存在着一个多克隆位点区,所以许各种不一样类型外 源DNA片段,不经修饰便可直接插入到载体分子上;
5. 因为多克隆位点区阻断了大肠杆菌lacZ基因5’端编码区,可按照IPTG组织化学显色反应试验, 筛选重组子;
基因克隆的载体噬菌粒载体
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常见噬菌粒载体pUC118和pUC119
是一对分别由pUC18和pUC19质粒与野生型M13噬菌体基 因间隔区(IG)重组而成噬菌粒载体。
1. 含有较小分子量共价、闭合、环形基因组DNA,可克 隆10kb外源DNA片段,并易于进行分离与操作;
2. 编码一个ampr基因作为选择记号,所以只有携带 pUC118或pUC119噬菌粒载体大肠杆菌转化子细胞,才 能够在含有氨苄青霉素培养基中生长,便于转化子选择;
6. lacZ基因是置于lac开启子控制之下,这么插入 外源基因便会以融合蛋白质形式表示;
7. 含有质粒复制起点,在没有辅助噬菌体情况下, 克隆外源基因能够像质粒一样按常规方式,复 制形成大量双链DNA分子
基因克隆的载体噬菌粒载体
第4页
8. 带有一个M13噬菌体复制起点,在有辅 助噬菌体感染寄主细胞中,能够合成出 单链DNA拷贝,并包装成噬菌体颗分泌 到培养基中;
第6页
pBluescript噬菌粒载体
基T3和T7噬菌体开 启子,能够定向指导外源基因转录活动;
2. 同时含有一个单链噬菌体M13或f1复制起点 和一个来自ColE1质粒复制起点,在不一样情 况下,能够采取不一样复制形式,分别合成单 链或双链DNA;
3. 编码有一个胺苄青霉素抗性基因,供作转化 子记号;
分子克隆常用载体
pUCm-T质粒 图谱
pUCm-T载体序列
二、噬菌体载体
噬菌体的生命周期
♪ (1)溶菌生长周期噬菌体(烈性 噬菌体)
♪ (2)溶源生长周期噬菌体(温和 噬菌体)
(1)烈性噬菌体的生活周期
(2)温和噬菌体的生活周期
裂解循环
Hale Waihona Puke 溶源态重要的噬菌体载体
一、λ噬菌体载体
(1)插入型载体:有单一酶切点,便于外源DNA插入
分子克隆常用载体
理想的质粒载体必须具备的基本条件
♪ 1、具有复制起点 ♪ 2、具有抗菌素抗性基因 ♪ 3、具有若干限制酶单一识别位点 ♪ 4、具有较小的分子量和较多的拷贝数
重要的大肠杆菌质粒载体
♪ pSC101质粒载体; ♪ ColE 1质粒载体; ♪ pBR322质粒载体; ♪ pUC质粒载体;
(2)具有质粒的特性(有质粒复制子及抗菌素基因 );
(3)具有高容量的克隆能力(本身仅5-7kb, 克隆极 限可达45kb左右);
(4)具有与同源序列质粒进行重组的能力。
四、酵母细胞的克隆载体
♪1、整合型载体(YIP)
♪ YIP型载体是由大肠杆菌质粒和酵母的 DNA片段构成的。这类载体在细菌中复 制、扩增,进入酵母后可整合表达。 YIP型载体的特点是转化率低(只有110转化子/微克DNA),但转化子遗传性 稳定,多用于遗传分析工作。
(2)替换型载体,具有成对的克隆位点,在这两个位点之 间λ DNA区段可以被外源插入的 DNA片段所取代λ噬菌体载体是主要用于cDNA构建, 也经常用于外源目的基因的克隆。
注意:λ噬菌载体作为载体,其重组噬菌体 DNA大小只能: 36kb ~ 51kb。
体外包装:λ噬菌体载体 + 尾部蛋白 + 头部蛋白
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第一章 概 论 第二章 基因疫苗工作原理 第三章 基因疫苗抗原基因的筛选和克隆 第四章 基因疫苗的构建 第五章 基因疫苗制备第六章 基因疫苗免疫方法 第七章 基因疫苗免疫效果检测 第八章 影响基因疫苗免疫效果的因素第九章 基因疫苗安全性第十章 细菌病基因疫苗第十一章 病毒病基因疫苗第十二章 寄生虫病基因疫苗第十三章 肿瘤基因疫苗第十四章 控制动物生长性能的基因疫苗 四、常用的克隆载体克隆载体就是将目的基因导入宿主细胞进行复制,从而获得大量克隆化片段的运载工具,常用的克隆载体种类很多,主要包括质粒、粘粒和噬菌体等。
其中,质粒是目前应用最为广泛的克隆载体。
下面简要介绍作为克隆质粒的特性和结构。
(一)质粒特性质粒是指在染色体外能够独立复制和稳定遗传的一类环状双链 DNA 分子。
有的质粒处于染色体外的游离状态,可以随着染色体的复制而复制,并且通过细胞分裂传递到子代。
有的质粒在一定条件下能够可逆地整合到寄主染色体上。
质粒的表示常根据 1976 年提出质粒命名原则,用小写字母 p 代表质粒,在 p 字母后面用两个大写字母代表发现这一质粒的作者或者实验室名称。
例如质粒 pUCl8 ,字母 p 代表质粒, UC 是构建该质粒的研究人员的姓名代号, 18 代表构建的一系列质粒的编号。
质粒广泛地分布于原核生物细胞中,也存在于一些真核细胞中。
质粒相对分子质量范围为10 6 -2 @ 10 8 。
根据质粒在受体细胞内的数量将质粒分为严紧型质粒和松弛型质粒两种类型。
严紧型质粒在每个细胞只有 1 个至几个拷贝;松弛型质粒在每个细胞中有 10-200 个拷贝。
质粒可以分为三种构型,一种是呈现超螺旋的 SC 构型( scDNA ),一种是开环 DNA( ocDNA ),另一种是呈线形分子的 L 构型。
质粒 DNA 与一般 DNA 分子的理化性质相似,例如溶于水、不溶于乙醇等有机溶剂、能吸收紫外线、可嵌入溴乙锭染料等。
实验室常利用这些理化特性鉴定和纯化质粒。
质粒具有以下几项生物学特性:• 寄生性:质粒可以在特定的宿主细胞内存在和复制。
• 稳定性:每种质粒在特定的宿主细胞内保持着一定的拷贝数。
• 重组性:两种不同的质粒处于同一宿主细胞中或者一种质粒处于一种宿主细胞中,有可能发生质粒与质粒之间或质粒与染色体之间的重组。
• 不相容性:有相同复制始区的不同质粒不能共存于同一宿主细胞中,其分子基础主要是由于它们在复制功能之间的相互干扰造成的。
• 传递性:有些质粒在细菌间能够传递,具有传递性的质粒带有一套与传递有关的基因。
• 消除性:存在于宿主细胞中的质粒,可用某些办法将其去除。
• 复制类型:严紧型质粒的复制受到宿主细胞蛋白质合成的严格控制,松弛型质粒的复制不受宿主细胞蛋白质合成的严格控制。
• 表现型:不同的质粒有不同的表现型,例如对抗生素的抗性等。
(二)质粒载体必需具备的条件1 、拷贝数较高质粒拷贝数是指宿主细菌(胞)在标准培养基条件下,每个细菌(胞)中含有的质粒数目。
根据宿主细胞所含的拷贝数多少,将质粒分为严紧型和松弛型两种。
每个宿主细胞中含有1-3 个拷贝拷数的质粒称为“严紧型”质粒( Stringent plasmid )。
有的质粒拷贝数较高,每个宿主细胞中可达 10-60 个拷贝,称为“松弛型”质粒( Relaxed plasmid )。
高拷贝质粒倾向在松弛控制下进行复制,而低拷贝的质粒则通常是在严紧控制下复制。
高拷贝质粒复制的启动是由质粒编码基因合成的功能蛋白质调节的,与宿主细胞周期开始时合成的不稳定的复制起始蛋白质无关。
如果用氯霉素或者壮观霉素等蛋白质合成抑制剂处理宿主细胞,宿主细胞染色体 DNA 复制受阻,但是松弛型质粒仍然可以继续扩增。
有时实验室为了提高质粒的产量,常用氯霉素或者壮观霉素等处理就是这个原理。
低拷贝质粒的情况则不同,它的复制受宿主细胞不稳定的复制起始蛋白质控制,并能与宿主细胞染色体同步复制。
2 、分子量较小一般来说低分子的质粒通常拷贝数比较高,这不仅有利于质粒 DNA 的制备,同时还会使细胞中克隆基因的数量增加。
分子量小的质粒对外源 DNA 容量较大,容易分离纯化,容易转化。
当质粒大于 15 kb 时,转化效率会低一些。
3 、具有选择标记抗性是常用的选择标记,例如氨苄青霉素抗性( Amp r )、卡那霉素抗性( Kan r )、四环素抗性( Tet r )等。
如果抗性基因内有若干单一的限制酶切点就更好。
当基因克隆成功时,由于外源基因插入使该抗性基因失活,这时宿主菌变为对该抗菌素敏感的菌株,这样容易检测。
β- 半乳糖苷酶筛选系统也是一个常用的方便的筛选系统。
质粒上带有一个来自大肠杆菌的 lac 操纵子,编码 β- 半乳糖苷酶氨基端的一个蛋白片段。
异丙基 -β-D 硫代半乳糖苷( IPTG )可以诱导该蛋白片段的合成,这个片段能与宿主细胞所编码的 β- 半乳糖苷酶羧基端的一个蛋白片段进行 α 互补。
在培养基中有 IPTG 诱导物时,细菌含有编码 lacZ 基因的质粒,同时合成该酶的两种片段。
该菌将在有生色底物 5- 溴 -4- 氯 -3- 吲噌 -β-D- 半乳糖苷( X-gal )的培养基上生长,形成蓝色菌落。
将一连串克隆位点克隆到 β- 半乳糖苷酶氨基端的基因中,外源基因插入质粒的多克隆位点后可使 β- 半乳糖苷酶的氨基端片段灭活,从而破坏 α 互补作用。
因此,带有重组质粒的细菌将产生白色菌落。
利用这种筛选方法可以方便地将含有目的基因的重组子筛选出来。
4 、具有较多的限制性酶切位点目前,常用克隆质粒载体上有多克隆位点( MCS ),较多的单一限制酶酶切位点对外源基因插入的插入提供了极大的方便。
基因检测免费体验普及基因检测,免费检测大赠送! 优基因免费基因检测5 、具有复制起始点复制起始点是质粒扩增必不可少的条件,也是决定质粒拷贝数的重要元件,可使繁殖后的宿主细胞维持一定数量的质粒拷贝数。
质粒在一般情况下含有一个复制起始点,构成一个独立的复制子。
但穿梭质粒含有两个复制子,一个是原核复制子,另一为真核复制子。
(三)常用的克隆质粒第一个成功地用于克隆真核基因的大肠杆菌质粒是 pSCl01 质粒。
pBR322 是用人工方法构建的符合理想质粒载体条件的好载体,得到广泛的应用。
下面介绍目前常用的克隆质粒载体 pUC 系列和 pGEM 系列。
1 、 pUC 质粒pUC 系列质粒载体,包括如下 4 个组成部分:( 1 )来自 pBR322 质粒的复制起点( ori );( 2 )氨苄青霉素抗性基因( Amp r ),但它的 DNA 核苷酸序列已经发生了变化,不再含有原来的限制酶切位点;( 3 )大肠杆菌 β- 半乳糖酶基因( 1acZ )的启动子及其编码该基因氨基端 α- 肽链的基因序列,称为 lacZ' 基因;( 4 )多克隆位点( MCS )区段:位于 lacZ' 基因中的靠近 5'- 端,内含十几个限制性内切酶位点,使含有不同粘端的目的 DNA 片段可方便地定向插入载体中。
但它并不破坏 lacZ' 基因的功能。
pUC 质粒系列是目前基因工程研究中较通用的克隆载体之一。
以下以 pUC18 质粒为例介绍其特点。
( 1 )具有更小的分子质量和更高的拷贝数在 pBR322 基础上构建 pUC 质粒载体时,仅保留了其中的氨苄青霉素抗性基因及其复制起点,使分子量相应减小。
由于偶然的原因,在操作过程中使 pBR322 质粒的复制起点内部发生了自发的突变,即 rop 基因的缺失。
由于该基因编码的 Rop 蛋白是控制质粒复制的特殊因子,它的缺失使得 pUCl8 质粒的拷贝数比带有 pMB1 或 ColEl 复制起点的质粒载体都要高得多,平均每个细胞可达 500-700 个拷贝。
( 2 )重组子的检测方便pUCl8 质粒结构中具有 lacZ' 基因,编码的α- 肽链可参与α- 互补。
因此,在应用 pUC8 质粒为载体的重组实验中,可用 X-gal 显色法一步实现对重组子克隆的鉴定。
( 3 )具有多克隆位点( MCS )区段pUCl8 质粒载体具有与 M13mp8 噬菌体载体相同的多克隆位点( MCS ),可以在这两类载体系列之间来回“穿梭”。
因此,克隆在 MCS 当中的外源 DNA 片段,可以方便地从 pUCl8 质粒载体转移到 M13mp8 载体上,进行克隆序列的核苷酸测定工作。
同时,也正是由于具有 MCS 序列,可以使具两种不同粘性末端的外源基因直接克隆到 pUCl8 质粒载体上。
2 、 pGEM 系列GEM 质粒系列是与 pUC 系列十分类似的小分子载体。
总长度为 2 743 bp ,含有一个氨苄青霉素抗性编码基因和一个 lacZ' 编码基因。
在后者还插入了一段含有 EcoR Ⅰ、 Sac Ⅰ、 Kpn Ⅰ、 Ava Ⅰ、 Sma Ⅰ、 BamH Ⅰ、 Xba Ⅰ、 Sal Ⅰ、 Acc Ⅰ、 Hind Ⅱ、 Pst Ⅰ、 Sph Ⅰ和 Hind Ⅲ等的多克隆位点。
此序列结构几乎与 pUCl 8 克 隆载体的完全一样。
pGEM 系列与 pUC 系列之间的主要差别是,它具有两个来自噬菌体的启动子,即 T7 启动子和 SP6 启动子,它们为 RNA 聚合酶的附着提供特异性识别位点。
由于这两个启动子分别位于 lacZ' 基因中多克隆位点区的两侧,若在反应体系中加入纯化的 T7 或 SP6 RNA 聚合酶,便可以将已经克隆的外源基因在体外转录出相应的 mRNA 。
质粒载体 pGEM-3Z 和 pGEM-4Z 在结构上基本相似,两者之间的差别仅仅在于 SP6 和 T7 这两个启动子的位置互换、方向相反而已。
由于 PCR 产物在多数的情况下 3' 端均有 A 碱基,如果用平整末端载体与其连接效率比较低,用 T- 载体克隆是比较好的办法,其中 pGEM-T 或 pUC-T 比较常用。
它们的基本骨架与相应的载体系列基本相同,只是在线形化的质粒载体平整末端的 5' 端有一个突出的碱基 -T 。
利用这个特点,使载体与 PCR 产物之间产生了小的互补粘端,使 PCR 产物的克隆效率大幅度提高。
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