分子生态学名词解释图文稿
分子生态学
四 随机遗传漂变是种群进化的重要动力
• 小种群比大种群发生漂变的速度快，所以等位基 因在小种群中被固定的平均时间比大种群短。
• 一个等位基因被固定的概率等于其此时在种群中 的频率，所以稀有基因更易被淘汰。
• 随机遗传漂变降低种群的遗传多样性。
分子生物学与生态学紧密联系：基因研究 首先从生物的生态特征和适应入手。
An overview depicting several of the most important early discoveries on
二、分子生态学的起源
• 1950s: 凝胶电泳技术（Smithies, 1955)和蛋白质组织化 学染色方法（Hunter &Marker 1957) 的发明和有机结 合，促进了利用蛋白质多态性方法分析遗传变异。
• 因为新突变被固定的概率等于其此时在种群中的 频率，所以，新突变在小种群中被固定的可能性 大于在大种群中。
• 在metapopulation中，局部种群越小其遗传多样性 丧失的越快，局部种群间的遗传分化就越大。
• 对所有中性等位基因的作用一致，因此，在没有 其它进化动力的条件下，不同的中性位点揭示的 进化（演化）规律应相同。
106
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Scale (m)
尺度 与学科的关系示意图
分子生态学的多学科交叉特性
多学科交叉的复合学科： 分子生物学
生物地理学
生态学
数学
古生物学
群体遗传学
分子生 行为生物学 态学分子进化Fra bibliotek系统发生学
保护生物学
进化生物学
古地学/古气候学
Model of DNA built by Watson and Francis Crick at Cambridge University, 1953.
分子生态学
分子生态学
分子生态学是一门研究进化生态学基础的科学，它试图通过研究生物体内分子
与环境关联而获得的信息来解释各种物种行为以及其进化的历史。
分子生态学即在内分子和外环境间建立关联，以研究生物体的行为与进化史。
分子生态学涉及的方面很多，例如生物材料的演化，以及如何通过分子技术来
研究物种之间的联系。
这种研究将通过研究多种物种的分子、生物学和行为学特征来理解物种间的关联。
分子生态学还会研究物种迁移，物种间种群变化，以及种群构成中物种多样性的演变。
分子生态学也会探寻物种进化中发生的变化，以便于更好理解物种间的进化史。
此外，分子生态学也旨在更深入地研究不同物种之间的关系，也就是物种的互补性、竞争性和协调性的研究。
分子生态学是一个极其复杂的科学，需要集成生物学、分子生物学和计算机科
学技术。
它具有极其广泛的应用，可以帮助我们思考和了解不同物种的进化历史，从而从根本上解决人类面临的生态问题。
分子生态学
分子生态学1.什么是分子生态学?答：分子生态学的诞生是以1992年的《Molecular Ecology》创刊为标志的，目前较为一致的看法是：分子生态学是应用分子生物学的原理和方法来研宄生命系统与环境系统相互作用的机理及其分子机制的科学[1,2]。
它是生态学与分子生物学相互渗透而形成的一门新兴交叉学科，其特点是强调生态学研宄中宏观与微观的紧密结合，用分子生物学的方法来解决种群水平的生物学问题[3]。
2.什么是遗传多样性？衡量遗传多样性水平的参数有哪几个？1)什么是遗传多样性？答：J.McNeely(1990)的定义将遗传多样性定义为：蕴藏在地球上的植物、动物和微生物个体基因中的遗传信息的总和。
世界资源研究所(WRI)1992年在“全球生物多样性策略”纲领性文件中明确地定义为：遗传多样性是指种内基因的变化，包括同种显著不同的群体间或同一群体内的遗传变异。
是对一个种群的基因库中遗传因子多样化的测度。
[4]2) 衡量遗传多样性水平的参数有哪几个？答：整体杂合度、多态位点的比例和各位点的平均等位基因数等( Hedrick , 1985;Nei, 1987; Richards and Leberg , 1996)。
具体如下：等位基因频率和等位基因数；杂合度、基因多样性和多态信息含量；F-统计量。
[5]3.什么是种群遗传结构，怎么样表示种群遗传结构？答：种群的遗传结构(Population genetic structure)是指一个种群内的遗传变异程度及其在群体间的分布模式，或指种群中各种基因的频率以及由这些基因决定的基因型的数量和分布情况（曲若竹等，2004）。
用基因频率、基因型频率、交配与繁殖模式、种群遗传分化、种群间基因交流模式等表示种群的遗传结构。
[6]4.什么是遗传漂变、有效种群大小、种群瓶颈、奠基者效应（建群者效应）？遗传漂变指在群体遗传学中，由小群体引起的基因频率随机减少甚至丢失的现象。
[7]有效种群大小是指一个种群中能将其基因连续传递到小一代的个体平均数。
第3章分子生态学概述
第3章 分子生态学概述分子生态学是90年代初新兴的一门生态学学科分支，它一经产生就引起了人们的广泛重视。
不同的学者从各自的研究背景出发，对分子生态学的概念有着不同的理解。
Burke等（1992）和 Smith等（1993）分别在《分子生态学》（《Molecular Ecology》）的创刊号和第二期首卷的社论中解释了分子生态学的概念。
这个概念注重动植物和微生物（包括重组生物体）的个体或群体与环境的关系，认为分子生态学是分子生物学与生态学有机结合的一个很好的界面。
它利用分子生物学手段来研究生态学或种群生物学的方方面面，阐明自然种群和引进种群与环境之间的联系，评价重组生物体释放对环境的影响。
向近敏等（1996）则将分子生态学与宏观生态学和微观生态学对应起来，认为分子生态学是研究细胞内的生物活性分子，特别是核酸分子与其分子环境关系的。
这个概念强调有生命形式的细胞内寄生物（如分子形式的病毒等）及其有生物学活性的细胞和分子与其相关细胞之间的各种活性分子，直至分子网络相互作用的生理平衡态和病理失调态的分子机制，从而提出促进生理平衡和防止病理失调的措施和方法。
由于本章作者的生物学专业背景，所以只能从一般意义的生物与环境之间的联系上对分子生态学作一肤浅的介绍。
Burke等（1992）的结论说明了 《Molecular Ecology》中所发表文章的范围：①分子群体生物学，包括群体和进化遗传学、行为生态学和保护生物学；②分子环境遗传学，包括种群生态学及基因流、重组生物体环境释放的生态学方面和自然环境中的遗传交换；③分子适应，包括遗传分化及生理适应、环境对基因表达的影响，以及一些方法和技术等。
如果从一般意义上的生物与环境的关系来理解分子生态学的话，上述几个方面可以作为分子生态学的主要研究内容来理解。
当然，分子生态学的研究内容不仅仅限于此，正如 Smith等在 《Molecular Ecology》第二期首卷的社论中所指出的那样：分子生态学不是简单的分子技术在生态学问题中的应用，而是代表着一个新兴的学科，具有着生态学和分子生物学相互交叉的强大活力。
分子生物学名词解释最全
分子生物学名词解释最全第一章名词解释1、基因(gene) 就是贮存遗传信息的核酸(DNA或RNA)片段,包括编码RNA与蛋白质的结构基因以及转录调控序列两部分。
2、结构基因(structural gene)指基因中编码RNA与蛋白质的核苷酸序列。
它们在原核生物中连续排列,在真核生物中则间断排列。
3、断裂基因(split gene真核生物的结构基因中,编码区与非编码区间隔排列。
4、外显子(exon)指在真核生物的断裂基因及其成熟RNA中都存在的核酸序列。
5、内含子(intron)指在真核生物的断裂基因及其初级转录产物中出现,但在成熟RNA 中被剪接除去的核酸序列。
6、多顺反子RNA(polycistronic/multicistronic RNA)一个RNA 分子上包含几个结构基因的转录产物。
原核生物的绝大多数基因与真核生物的个别基因可转录生成多顺反子RNA。
7、单顺反子RNA(monocistronic RNA)一个RNA分子上只包含一个结构基因的转录产物。
真核生物的绝大多数基因与原核生物的个别基因可转录生成单顺反子RNA。
8、核不均一RNA(heterogeneous nuclear RNA, hnRNA)就是真核生物细胞核内的转录初始产物,含有外显子与内含子转录的序列,分子量大小不均一,经一系列转录后加工变为成熟mRNA。
9、开放阅读框(open reading frame, ORF)mRNA分子上从起始密码子到终止密码子之间的核苷酸(碱基)序列,编码一个特定的多肽链。
10、密码子(codon)mRNA分子的开放读框内从5' 到3' 方向每3个相邻的核苷酸(碱基)为一组,编码多肽链中的20种氨基酸残基,或者代表翻译起始以及翻译终止信息。
11、反密码子(anticodon)指tRNA分子反密码环中间3个相邻的核苷酸(碱基),它们与mRNA上的三联体密码子互补配对,确保蛋白质合成时氨基酸按照密码子对号入座。
分子生态学简介
分子生态学简介一、概念：分子生态学的诞生是以1992年的《Molecular Ecology》创刊为标志的，目前较为一致的看法是：分子生态学是应用分子生物学的原理和方法来研究生命系统与环境系统相互作用的机理及其分子机制的学，它是生态学与分子生物学相互渗透而形成的一门新兴交叉学科，其特点是强调生态学研究中宏观与微观的紧密结合。
二、研究内容：1、分子种群生物学（1）行为生态学亲缘关系与亲本分析（2）保护生物学进化遗传学、保育遗传学（3）种群遗传学。
2、分子适应研究各种内部外部因素对于基因表达的影响。
3、分子生态学技术发明新方法。
4、分子环境遗传学种群生态学、基因流、重组生物释放、自然环境中的遗传交换5、遗传生态栽培学。
三、研究技术：1、等位酶技术“等位酶”(allozyme)指一定基因位点上不同的等位基因编码的酶；“同工酶”(isozyme)指通过电泳鉴定的染色功能相同的酶的不同生化形式。
等位酶是同工酶的一种特殊形式，有时也叫等位同工酶。
采用蛋白质电泳获得多位点等位酶的谱图是分子生态学研究中最有价值的资料之一。
“等位酶”分析技术基本成熟，它的基本要求是按个体提取具有活性的酶，然后电泳、染色。
为正确解释等位酶带谱，通常要了解每一种等位酶变异的遗传基础，至少分析10~20个独立分离的多态性位点，才能达到统计的可信度。
等位酶技术操作相对简单，花费少，统计方法标准，并且有大量的前人资料可以借鉴，但对于一些狭域分布的地方种群，往往缺乏多态性的位点，无法进行等位酶分析。
分析时一定要保持酶的活性，这也是该技术局限性所在。
2、基因指纹(DNAfingerprint)随着分子生物学技术的迅速发展，DNA分析技术成为生态学家探讨种群遗传变异的必然选择。
DNA相对于等位酶而言，具有更丰富的变异，甚至能够提供区分个体的特异性“指纹”(fingerprint)，同时试验材料易于获得，从化石到活体材料都可以用，且所需材料微少。
分子生态学概念
分子生态学概念分子生态学是一项研究在生态系统中种群、物种与群落水平上，分子遗传学、生态学、进化生物学以及生态系统学等多学科交叉的研究领域。
具体而言，分子生态学旨在应用分子生物学技术，如DNA/RNA、微生物群落组学等多样方法，探究不同空间和时间尺度内生物体和生物系统之间的相互作用和关系，旨在为生物多样性保护和管理、生态学和环境保护工作提供科学支持。
众所周知，生态系统由不同种群、物种和群落组成，这些生物体之间存在着相互依存和相互作用的复杂关系。
分子生态学依托于分子遗传学的进展，将种群遗传学、数字生态学和物种互作网络等生态学领域的理论和实践技术结合起来，以分子水平为依据，探索生物体的分布、适应性、群落稳定性等问题。
因此，分子生态学在加深对生物多样性形成和维持的认识、揭示群落演化的机制、预测和控制环境变化对生物系统的影响等方面都具有重要的意义。
在分子生态学的应用领域中，种群遗传学和DNA指纹技术被广泛运用。
在诸多生态系统中，种群大小、群体分布、迁徙路线以及群体分化等因素都会影响到种群遗传多样性的水平和分布。
通过采集生物样品，提取样品中的DNA，运用PCR扩增技术，得到PCR产物后，再进一步利用电泳技术进行分离和检测，最终获得关于种群遗传多样性的信息。
此外，DNA指纹技术也可以用于对生物样品的鉴定，如微生物样品中病原体的检测和人体指纹的识别等。
这些技术的应用不仅可以检测和监测自然和人工生态系统中生物种群的健康状况，也为自然保护区和野生动物管理者提供了科学依据和技术支持。
微生物群落组学研究的不断深入，也为分子生态学的发展提供了新的方向。
微生物是自然生态系统中最为丰富和多样的生物体，其数量之多以及占地广，则超越了大多数其他生物体。
微生物群落组学则是借助于高通量测序技术，对一个或多个生态系统内微生物组成进行全面的分析，以期建立微生物分布模型，剖析微生物群体功能和作用，预测生态系统变化对微生物群体的影响。
在分子生态学的研究中，微生物群落组学技术可以起到重要的作用，既可以用于研究生态系统中微生物的多样性、密度和活性，又可以用于研究微生物之间的互作关系，如微生物共生、共存和竞争等。
第2章 分子生态学的基本理论
基因组尺寸如何进化是一个早已存在的问题，然而，由于基因组测序的 进行，这个问题现在反而变得新奇起来。 基因组复杂性从单细胞到多细胞真核生物升高的方式与基因组大小特别 是编码区的大小并无直接的关系，编码区的延长不能解释特定生物体 （门、种系、组织等）中出现的许多新功能。
分子进化的动力
分子水平上生物的进化可以看作是一个两步的过程；首先 是突变和重组，由此产生出可遗传的变异；其次是遗传变 异有差异的世代相传。
分子生态学的实践性
分子生态学的实践性也是非常重要的，这不仅是学科本身发展的 需要，也是科学技术转化为生产力的需要。
2.1 分子生态学概念的提出
分子生态学是在分子水平上由生态学和生物学融合而成的新型 科学。我们对分子生态学的认识和分子生态平衡是生命本质的 认识，作为发展分子生态学的前提。分子生态学的发展是以分 子生物学的发展为基础。
第2章 分子生态学的基本理论
李永峰
李巧燕
教授
研究生
目录
1 2
分子生态学概念的提出
分子生态学系统概念
３ 4
分子生态系统的结构组成
生态学中的遗传学
2.1 分子生态学概念的提出
生命科学是研究生物生命活动规律的科学
分子生物学的概念只停留在生物学的认 识水平是不够的
分子生物学
分子生物学必须含有生态学的概念
分子生态学(molecular ecology)
概念 研究 内容
以生物活性分子， 特别是以核酸分子 为中心同其分 子环境关系的生态 学
阐明生命体和相关细胞 的各种生物活性分子及其分 子环境与网络相互作用的生 理平衡态 和病理失调态的分子机制， 从而提出促进生理平衡和防 止与治疗 病理失调的措施及方法。
分子生态学(前沿)
分子生态学的发展过程
1963年，M. Nass和S. Nass发现了mt DNA，使得以mt DNA为研究 对象，探讨生物进化和生态学等领域的一些问题成为可能。
1966年，Harris首次把同工酶分析用于人类，Richardson等出版了 “等位酶电泳 — 动物系统学和种群研究手册”，这些工作被认 为时分子生态学的雏形。
早期生态学的研究主要集中在物种的个体、种群、群落和生态系统等宏观 领域，所观察到的从个体到生态系统之间的性状以及各种关系均只是表观特 征，而确定这些表观特征的正是每一物种的遗传组成及与所处环境的综合作 用，借助于分子生态学的理论和方法，恰能使研究深入到生物体内的各种生 物活性分子以及这些分子在微环境中的作用，进而从宏观与微观结合的角度 真实地反映出生态系统中生物个体和种群间关系的本质。
•Assessing the diversity and distribution of microorganism communities.
Conservation Genetics: •Applications of molecular studies in the conservation programmes for wild populations.
Bachmann(1994)在 Molecular markers in plant ecology 则 认为：
分子生态学是用分子生物学手段研究生态和种群生物学的 新兴交叉学科。
向近敏等(1996) 则认为：
分子生态学是研究细胞内的生物活性分子特别是核酸 分子与其分子环境关系的。
结论：
分子生态学并非是生态学技术在生态学研究领域 中的简单运用, 而是宏观与微观的有机结合, 它是 围绕着生态现象的分子活动规律这个中心进行的, 包含了 生物形态 遗传 生理生殖 进化 各水平上协调适应的分子机理。
生态学名词解释2
【现代生态学】第一篇分子生态学1中性突变（neutral mutation）：大多数分子水平的遗传变异，在选择上是中性的，即他们并不影响生存适合度，其命运主要是由随机漂变而不是自然选择决定的。
这些遗传变异称为中性突变。
这一进化理论称为中性理论，不适合于解释其他层次的进化现象。
2 负选择和正选择（negative selection & positive selection）：能降低生存适合度的突变成为有害突变（deleterious mutation）, 他们在选这种处于劣势，因而自然选择想将其从中群众淘汰的方向进行，这种选择称为负选择。
偶尔也会繁盛能提高生存适合度的突变，称为有利突变（advantageous mutation）; 有利突变在选择中处于优势，因而自然选择倾向于把它们在种群众固定下来，这种形式的选择校正选择。
3 固定（dixation）：指等位基因在种群中的频率达到1，即种群的所有个体在该位点上都是同一等位基因的纯合体。
4 位点（locus）：遗传学上泛指染色体上为一个基因所占据的位置；分子生态学中指染色体上为一个DNA 分子标记（不管编码与否）所占据的位置。
5 谱系（lineage）：只具有连续共同进化历程、享有共同祖先的一个支系；它可以是一组亚种群，一个物种，一组物种。
6 单倍型（haplotype）：具有独特遗传特征的、连锁的DNA序列。
7 基因流（gene flow）：指基因通过个体迁移或其他途径在种群间的传播、交换。
8 随机遗传漂变（random genetic drift）：指中群众等位基因频率或基因型频率受随机抽样误差影响在世代间的的波动，又称遗传漂变。
9 搭载效应（hitchhiking effect）：指一个等位技艺频率的改变不是因为它本身受选择影响，而是因为已经他连锁的另外一个位点受到选择而被牵连的现象。
10 非同源相似（homoplasy）：指性状的等同状态是通过不同进化途径形成的巧合。
分子生态学简介
分子生态学简介
这是一个关于分子生态学的开放分类，共收录词条1个（含子类）。
分子生态学是应用分子生物学的原理和方法来研究生命系统与环境系统相互作用的生态机理及其分子机制的科学。
分子生态学（Molecular ecology）是生态学与分子生物学相互渗透而形成的一门新兴交叉学科，形成于20世纪70年代末至80年代初。
分子生态学是应用分子生物学的原理和方法来研究生命系统与环境系统相互作用的生态机理及其分子机制的科学。
其研究内容包括种群在分子水平的遗传多样性及遗传结构、生物器官变异的分子机制、生物体内有机大分子对环境因子变化的响应、生物大分子结构、功能演变与环境长期变化的关系以及其他生命层次生态现象的分子机理等。
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《分子生态学》课件
在分子生态学中，分子标记技术可用于物种鉴定、种群遗传结构分 析、亲缘关系鉴定等方面。
分子标记技术的优势
具有较高的灵敏度和特异性，能够快速准确地检测生物体的遗传特 征，有助于揭示种群结构和遗传多样性。
生物信息学方法
生物信息学方法
利用计算机科学和统计学的理论和方法，对生物学数据进行分析 、整合和挖掘。
生态平衡
生态平衡是指生态系统内部各组成部分之间相互制约、相互依存的关系，是生态系统稳定和可持续发展的基础。 维护生态平衡是保护生物多样性和生态安全的重要措施之一。
03 分子生态学研究方法
CHAPTER
基因组学技术
基因组学技术
利用全基因组测序、基因表达谱分析 等技术，研究生物体内基因组的组成 、结构和功能，以及基因表达的调控 机制。
生态恢复
通过分子生态学手段研究生态系统退化的原因，提出针对性的恢复和重建方案，如植被恢复、土壤微 生物群落重建等。
生态系统恢复与重建
受损生态系统修复
针对受损生态系统，利用分子生态学方法研究生态系统内部各组分的相互关系和作用机 制，提出生态系统修复方案。
生态工程设计
基于分子生态学原理，设计生态工程，如人工湿地、生态浮床等，以实现生态环境的改 善和修复。
种群动态与进化
种群动态
种群动态是指种群数量和结构的变化 规律，是生态学研究的重要内容之一 。它受到环境因素、种间关系、种内 关系等多种因素的影响。
种群进化
种群进化是指种群在适应环境变化的 过程中，基因频率发生改变，导致种 群特征的演化。种群进化是生物多样 性的重要来源之一。
生态位与物种共存
生态位
生物多样性保护
分子生态学研究有助于保护生物 多样性，维护地球生态平衡。
分子生态学的名词解释
分子生态学的名词解释分子生态学是研究生物群落和生态系统中分子信息的学科，主要探究生物间相互作用、物种多样性、生态过程等方面的分子机制。
分子生态学是生态学领域中的一项重要分支，综合运用了生态学、分子遗传学、生物化学、分子生物学等多个学科的知识和方法。
在分子生态学中，常见的名词包括:1. 分子标记 (molecular marker):指用于遗传分析的分子数据，可以是基因片段、DNA 序列、蛋白质序列等。
分子标记可以用于遗传多样性分析、种群结构分析、遗传变异分析等。
2. 遗传多样性 (genetic diversity):指在一个群体中，不同个体之间的基因型差异和遗传背景的多样性。
遗传多样性是评估物种和保护物种的重要手段之一。
3. 物种多样性 (species diversity):指在一个生态系统或群落中，不同物种的数量和比例。
物种多样性是评估生态系统健康和生态平衡的重要指标。
4. 生态过程 (ecological process):指在生态系统或群落中，物种之间相互作用和生物群落演变的过程。
生态过程是生态系统或群落动态和演化的基础。
5. 相互作用 (interaction):指不同物种之间的相互作用，包括竞争、捕食、共生等。
相互作用是物种间相互影响的过程，也是生态系统中物种数量和分布的重要因素。
6. 群落 (community):指由多个相互作用的物种组成的生态系统或群落。
群落是生态系统的基本单位，也是生态结构和功能的基础。
7. 遗传变异 (genetic variation):指在一个群体中，不同个体之间的基因型差异和遗传背景的多样性。
遗传变异是物种进化和适应性的基础。
8. 进化 (evolution):指生物种群的基因频率和基因型频率随时间变化的过程。
进化是物种演化的基础，也是物种适应性和多样性的来源。
9. 保护 (conservation):指采取措施，保护野生动植物及其生态系统，维护生态平衡和生物多样性。
分子生态学-植物的行为生态学-PPT
大家好
11
种子和花粉是植物基因流动的载体
由花粉和种子传播完成的基因流是遗传结构建立的 关键性因素之一；
当全部基因流受到抑制时，随着个体间地理距离的 增加，个体间的遗传相关性降低，形成地理隔离。
大家好
12
估测基因流动水平
传统方法：依据特定模型下亚种群间的差异程度来 推断其过去均值的间接方法来完成的
植物的行为生态学
大家好
1
植物的行为生态学问题：
·花粉和种子传播
·克隆结构及斑块的建立和发展
繁殖方式、有性和无性繁殖比 杂交的分子鉴定 种群的生活史对策(生态对策)
大家好
2
第一节 花粉散布和种子传播
植物的花粉从雄蕊传播到雌蕊上就是传粉
大家好
3
第一节 花粉散布和种子传播
异花传粉的方式： 依靠昆虫
37
研究克隆植物斑块的建立和发展及斑块内外的 遗传多样性对了解克隆植物种群的形成、维持
和衰退有重要意义。
大家好
38
第四节 杂交的分子鉴定
早期研究对杂交的识别主要依赖形态特征，基于形 态特征的杂交指数常被用于区别双亲间的中间类型 并推断个体是否来自杂交。但形态特征的可塑性常 混杂子代和双亲。
分子标记，特别是DNA标记，为杂交鉴定提供了更
大家好
10
第一节 花粉散布和种子传播
自然植物种群中，有性繁殖个体的空间遗传结构 (genetic structure)的决定因素：
①基因流(gene flow)—传粉媒介与其适应； ②局部遗传漂变(genetic drift)—杂交及其渐渗； ③不同形式的自然选择—胁迫、压力、突变； ④个体的空间分布—适应能力。
大家好
27
名词解释生态终审稿)
名词解释生态公司内部档案编码：[OPPTR-OPPT28-OPPTL98-OPPNN08]名词解释绪论1.生态学：是研究有机体及其周围环境相互关系的科学。
2.2.种群：是栖息在同一地域中同种个体组成的复合体3.群落：是栖息在同一地域中的动物、植物和微生物组成的复合体。
4.生态系统：是一定空间中生物群落和非生物环境的复合体。
5.生物圈：指地球上的全部生物和一切适合于生物栖息的场所，它包括岩石圈上层、全部水圈和大气圈的下层。
6.分子生态学：是应用分子生物学方法研究生态学问题所产生的新的分支学科。
7.尺度：是指某一现象或过程在空间和时间上所涉及的范围和发生的频率。
1、生物与环境1.环境：指某一特定生物体或生物群体周围一切的总和，包括空间及直接或间接影响该生物体或生物群体生存的各种因素。
2.大环境：是指地区环境、地球环境和宇宙环境。
3.大气候：大环境中的气候称为大气候，是指离地面1.5米以上的气候，是由大范围因素决定的，如大气环流、地理纬度、据海洋距离、大面积地形等。
4.小环境：是指对生物有直接影响的邻接环境，即指小范围内的特定栖息地。
5.小气候：是指近地面大气层中1.5米以内的气候。
受局部地形、植被和土壤类型的调节。
6.生态因子：是指环境要素中对生物起作用的因子，如光温度、水、氧气、二氧化碳、食物和其他生物等。
7.生境：指所有生态因子构成生物的生态环境，特定生物体或群体的栖息地的生态环境。
8.主导因子：对生物起作用的众多因子并非等价的，其中一个是起决定性作用的，它的改变会引起其他生态因子发生变化，使生物的生长发育发生变化，这个因子称为主导因子。
9.作用：环境的非生物因子对生物的影响，一般称为作用。
10.反作用：生物对环境的影响，一般称为反作用。
11.利比希最小因子定律：低于某种生物需要的最小量的任何特定因子，是决定该种生物生存和分布的根本因素。
也称短板理论。
12.限制因子：任何生态因子，当接近或超过某种生物的耐受性极限而阻止其生存、生长、繁殖或扩散时，这个因子称为限制因子。
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分子生态学名词解释文件管理序列号：[K8UY-K9IO69-O6M243-OL889-F88688]一、翻译并解释名词：(10x4分)1.allele 等位基因一个位点的序列变异。
2.Effective population size (Ne) 有效种群大小在一个具有相等性比、随机交配的理想种群中表现出与特定统计（全部成体数目）规模相对应的真实的种群杂合性随时间丧失的速率相同的个体数。
3.F-statistics F 统计检验用于评估个体间、亚种群间和整个种群间杂合性的分布的统计方法，被广泛应用于定量亚种群的遗传分化。
4.Genetic load 遗传负荷相对于理论最佳值来说降低了的基因型适合度。
5.Hardy-Weiberg equilibrium哈温平衡当所有等位基因频率是已知的时候，在一个大的随机交配种群中的纯合子和杂合子的预期比例。
假设没有迁移、突变或选择作用，哈温平衡定律则认为等位基因频率从一个世代到下一个世代应该保持不变。
6.Bottleneck effect瓶颈效应种群的规模大为缩小，随后常常有一个（种群的）恢复。
7.Selection sweep选择扫荡。
课件：Occurrence of a beneficial mutation，Only individuals carrying the mutation reproduce，‘Population bottleneck’，Mainly affects linked loci。
8.IAM 无限等位基因模型其中突变不是以可预料的方式一个接一个发生，而大多数突变是像产生SNP（单核苷酸多态性）那样出现的。
9.Linkage disequilibrium (LD) 连锁不平衡。
术语表：Linkage equilibrium 连锁平衡：由重组促成的情形，其中遗传位点在繁殖期相互独立分离。
当两个位点上的等位基因一起分离时，如他们在同一个染色体上的物理位置太接近时，则发生不平衡。
百度：连锁平衡：不同的各在人群中以一定的出现。
在某一群体中，不同座位上某两个出现在同一条染色体上的高于预期的随机频率的现象，称连锁不平衡 (linkage disequilibrium) 。
由于 HLA 不同的某些经常连锁在一起遗传，而连锁的基因并非完全随机地组成单体型，有些基因总是较多地在一起出现，致使某些单体型在群体中呈现较高的，从而引起连锁不平衡。
10.Metapopulation复合种群种群再分为多个同类群，至少其中的一些偶尔灭绝，随后通过从其他同类群迁入再建立种群。
11.Microsatellite微卫星带有单序列（通常为2-，3-或4-核苷酸）重复多次的遗传位点。
12.MtDNA 线粒体DNA存在于线粒体中的环状染色体。
13.Non-synomous mutation非同义突变由一个三联密码变化使特定氨基酸改变的突变。
14.PCR聚合酶链式反应用寡核苷酸引物和耐热的DNA聚合酶扩增大量DNA序列的一种方法。
15.SNP单核苷酸多态性在DNA序列中一个特殊位点上出现不同核苷酸碱基的等位基因。
16.RFLP限制性片段长度多态性用限制性酶和凝胶电泳鉴定DNA序列多态性的方法。
17.Transition转换一个嘌呤核苷酸被另一个嘌呤核苷酸替代，或一个嘧啶核苷酸被另一个嘧啶核苷酸取代的突变。
18.Transversion颠换一个嘌呤核苷酸被另一个嘧啶核苷酸取代或相反过程的突变。
19.Molecular ecology分子生态学课件:分子生物学是应用分子生物学的原理和方法来研究生命系统与环境系统相互作用的生态机理及其分子机制的科学。
它是生态学与分子生物学相互渗透而形成的一门新兴交叉学科,其研究内容包括种群在分子水平的遗传多样性及遗传结构，生物器官变异的分子机制、生物体内有机大分子对环境因子变化的响应、生物大分子结构、功能演变与环境长期变化的关系以及其它生命层次生态现象的分子机理等。
分子生态学的理论和方法对传统学科有巨大的促进作用，同时，对解决诸如转基因、克隆技术应用中的生态安全、环境与人类健康等重大问题将产生深刻的影响。
20.Functional ecological and evolutionary genomics(FEEG)生态和进化基因组学21.PhylogeographicPhylogeographiy 亲缘地理学研究调控系谱世系的地理分布的原理和过程的科学。
22.Monophyly 单系类群中的所有个体是从同一个祖先来的，并且从这个祖先来的所有存活的后代都在这个类群中。
23.Intron 内含子真核生物的结构基因间的非编码DNA序列。
内含子被转录但它们的RNA拷贝在功能产生期间被切除。
24.Introgression 渐渗杂交等位基因从一个种群或物种向另一个种群或者物种的扩散，而产生像种群间或物种间的近交或杂交这样的结果。
25.Genetic drift 遗传漂变《生物多样性导论》：在有性生殖的群体中，每个世代的基因库是对上一个世代基因库的随机抽样和复制。
在世代交替过程中，不同的等位基因遗传到下一代的偶然性对种群遗传结构有可能产生显着影响。
Wright把这种由于配子产生及结合过程中的随机性导致的基因频率的波动称为遗传漂变(genetic drift)，也称随机漂变、遗传偏离或Wright效应。
26.Haplotype 单（倍体）型源于同一染色体或染色体单倍体组的一套等位基因。
27.ESU(Evolutionary Significant Unit) 进化显着单元分类学上对保护重要类群的一种尝试性定义。
28.Metagenomics 宏基因组学百度：宏基因组学（Metagenomics）又叫微生物环境基因组学、元基因组学。
它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库，利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。
它是在微生物基因组学的基础上发展起来的一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。
其主要含义是：对特定环境中全部为生物的总DNA（也称宏基因组，metagenomic）进行克隆，并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质；或者根据rDNA数据库设计引物，通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息。
29.CpDNA 叶绿体DNA存在于叶绿体内的环状染色体。
30.Heterosis 杂种优势，杂合体优势杂合子比纯合子有较高的适合度的情形。
31.Recombination 重组二倍体生物中减数分裂期间同源（配对）染色体间的DNA交换。
32.rRNA 核糖体RNA核糖体中的RNA分子…………33.SNP 单核苷酸多态性在DNA序列中一个特殊位点上出现不同核苷酸碱基的等位基因。
34.Sympatric speciation 同域发生（物种形成）生活在同一地区的个体中形成的新物种。
35.Vicariance 地理隔离种群或物种被环境事件，如山脉形成造成的物理隔离注：描黄部分为术语表中无相关解释的，仅供参考。
分子生态学简答题1. 什么是分子生态学，分子生态学的主要研究内容是什么？教材的定义:分子生物学是应用分子生物学的原理和方法来研究生命系统与环境系统相互作用的生态机理及其分子机制的科学。
它是生态学与分子生物学相互渗透而形成的一门新兴交叉学科。
研究内容：包括种群在分子水平的遗传多样性及遗传结构，生物器官变异的分子机制、生物体内有机大分子对环境因子变化的响应、生物大分子结构、功能演变与环境长期变化的关系以及其它生命层次生态现象的分子机理等。
分子生态学的理论和方法对传统学科有巨大的促进作用，同时，对解决诸如转基因、克隆技术应用中的生态安全、环境与人类健康等重大问题将产生深刻的影响。
2. 什么是宏基因组学，其主要研究过程如何？宏基因组学（Metagenomics）又叫微生物环境基因组学、元基因组学。
它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库，利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。
宏基因组学的研究过程：对特定环境中全部为生物的总DNA（也称宏基因组，metagenomic）进行克隆，并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质；或者根据rDNA数据库设计引物，通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息。
3. 什么是生态和进化基因组学，其主要研究内容如何？研究环境条件与基因组结构、功能、动态及进化相互关系的学科。
4. 什么是亲缘地理学，其研究内容是什么？研究调控系谱世系的地理分布的原理和过程的科学。
5. 什么是数量性状数量性状有那些类型数量性状又称为适应性性状，通常由互相影响的多个基因控制，并会明显受到环境的影响。
在足够大的群体中，数量性状的分布基本符合正态规律。
数量性状的类型：连续型、阈值型、间断型（或离散型）连续型：数量性状的表现为连续分布，群体中个体数足够多时，连续型数量性状基本符合正态分布，如：身高、体重、奶牛产奶量等。
阈值型数量性状：此种数量性状的表现会受到潜在风险因素的影响，具有最低或最高阈值，例如：生物的性成熟年龄，疾病的易感率等。
间断型数量性状：只能用离散的数值或数组表示其表现型的数量性状，如动物每胎产仔个数、果蝇足上的刚毛数等。
6. 影响种群等位基因频率变化的进化过程有哪些？种群进化的主要动力有：突变、遗传漂变、选择、基因的迁移（基因流动）。
突变：生物核酸序列上碱基种类或数目发生改变，导致新等位基因产生或原有等位基因丧失。
遗传漂变：由于进行有性生殖的生物的配子形成过程具有随机性，亲代的部分遗传信息在通过配子传递给子代时会由于这种不确定性而丢失，导致部分等位基因在整个种群的下一代中频率降低甚至消失。
遗传漂变现象在小种群中表现尤其明显。
选择：外部自然环境对种群等位基因的选择往往是定向的，若等位基因所控制的形状不能使生物较好地适应生存环境，自然选择就会逐步淘汰这些等位基因。
基因流动：种群内个体在不同种群之间进行迁移时，会造成不同种群之间等位基因的混合。
整体而言，大规模的种群之间个体迁移能够调和等位基因频率分布的不均衡现象，有利于提高种群等位基因多样性。
7. 什么叫选择扫荡是如何产生的A selective sweep is the reduction or elimination of variation among the nucleotides in neighboring DNA of a mutation as the result of recent and strong positive natural selection.A selective sweep can occur when a new mutation occurs that increases the fitness of the carrier relative to other members of the population. Natural selection will favour individuals that have a higher fitness and with time the newly mutated variant (allele) will increase in frequency relative to other alleles. As its prevalence increases, neutral and nearlyneutral genetic variation linked to the new mutation will also become more prevalent. This phenomenon is called genetic hitchhiking. A strong selective sweep results in a region of the genome where the positively selected haplotype (the mutated allele and its neighbours) is essentially the only one that exists in the population, resulting in a large reduction of the total genetic variation in that chromosome region.选择扫荡或选择性清除：种群中产生了能够提高个体适合度的有利变异后，该有利变异以及与之连锁的中性和近中性变异的等位基因频率逐渐提高，从而导致其他等位基因频率的降低乃至丧失，最终造成种群遗传多样性整体显着降低的现象。