重叠延伸PCR实验要点
重叠PCR—overlap PCR
重叠PCR—overlap PCR
1.简介
重叠PCR也是基本的PCR原理:变性-退火-延伸。
不同的是在重叠PCR过程是两个或者几个片段重叠延伸之后,再进行指数扩增的PCR过程。
2.基本原理
第一步:PCR产生两个或者几个片段,这几个片段之间必须有重叠区。
第二步:以两个片段为例,见上图,第一步产生的两个片段,A D链之间有互补,B C链之间也有互补,但只有A D链互补重叠延伸产生所需要的重叠片段。
第三步:第二步产生的重叠产物,在上下游引物的存在下,即可进行PCR扩增过程。
请仔细看清楚原理,特别是第二步。
3.实际操作注意点
a.第一步PCR之后的产物,可以纯化,也可以吸取几μL作为重叠PCR的模板。
b.第二步和第三步一起称为重叠PCR,实际发生过程分为两个步骤。
c.Taq酶会在末端加A,高保真酶有3’— 5’的外切活性,基于重叠PCR原理和酶的性质,第一步和重叠PCR步骤至少有一步使用高保真酶(或者如Taq Plus、Es Taq之类的,有3’— 5’的外切活性),如果第一步和重叠PCR都使用普通Taq可能重叠PCR会失败。
d.基于重叠PCR原理,上图中第二步A D 链直接的退火很关键,所以有些protocol会建议重叠PCR分两个程序进行也是基于以上原理。
重叠区的Tm很关键,或者说退火温度很重要。
4.重叠PCR几个应用场景
a.片段中间引入突变
b.片段中间引入缺失
C.片段中间引入插入片段
d.片段拼接(如不同结构域DNA片段拼接)
e.长片段分段扩增,再重叠PCR拼接。
f.从基因组扩增出外显子,再拼接出完整的CDS区。
重叠pcr总结
目的基因模板Y1 目的基因模板Y2引物分别为:P1,R1;P2,R2一、简易融合PCR1.待融合片段的独立扩增具体步骤:ddH2O 9.5ul2×Gcbuffer 25ul 用量参考TaKaRa目录dNTP 8ulPrimer 1 0.5ul (稀释后的浓度为25uM,终浓度0.25umol/L) Primer 2 0.5ul(终浓度0.25umol/L)LA Taq 0.5ul(产品浓度为5U/ul)总DNA 6ul(浓度是0.05 ug/ul,质量为0.3ug)50ul体系反应程序95℃5min94℃ 1.5min65℃30s ×3072℃2min72℃7minPCR后得到:目的基Y1 50uL,目的基因Y2 50uL。
DAN电泳检测样品2.融合PCR反应PCR产物(不回收)等体积混合为模板ddH2O 4.5ul2×Gcbuffer 25ul 用量参考TaKaRa目录dNTP 8ulLA Taq 0.25ul(产品浓度为5U/ul)总DNA x ul(浓度是0.05 ug/ul,质量为0.3ug)25ul体系ssⅢ、ssⅡ片段(不回收)的加入量依次以0.05、0.10、0.15、0.20、0.25、0.50、1.0、1.5、2.0 μL等体积混合(对应的DNA量分别约2、4、6、8、10、20、40、60、80 ng反应程序95℃5min94℃ 1.5min65℃30s ×572℃2min继续加入25uL反应溶液(Taq酶,dNTP ,buffer,引物G1和G4)继续pcr95℃4min94℃40min65℃45s ×3072℃1min72℃10minPCR后得到:取5uL电泳检测,检查是否出现目的基因,切胶纯化二、高效融合PCR1.引物设计大写序列为扩增片段的特异性引物序列, 小写序列为相邻片段的互补序列特意序列为20左右,互补序列为202.待融合片段的独立扩增具体步骤:ddH2O 9.5ul2×Gcbuffer 25ul 用量参考TaKaRa目录dNTP 8ulPrimer 1 0.5ul (稀释后的浓度为25uM,终浓度0.25umol/L)Primer 2 0.5ul(终浓度0.25umol/L)LA Taq 0.5ul(产品浓度为5U/ul)总DNA 6ul(浓度是0.05 ug/ul,质量为0.3ug)50ul体系反应程序95℃5min94℃ 1.5min65℃30s ×3072℃2min72℃7minPCR后得到:目的基Y1 50uL,目的基因Y2 50uL。
重叠延伸pcr
重叠延伸pcr重叠延伸PCR一、前言重叠延伸PCR(Overlap Extension PCR,又称OE-PCR)是一种基于PCR技术的DNA重组技术,它可以实现在DNA两端同时进行定向变异、插入、删除等操作。
重叠延伸PCR广泛应用于基因工程、遗传学、生物学等领域,成为分子生物学研究中的一项重要技术手段。
二、适用场景2.1 定向变异定向变异是指在已知序列中有目的地进行基因改造,如点突变、插入、缺失等。
这种改造方式在药物研发、基因治疗等方面有广泛应用。
重叠延伸PCR可以实现在DNA两端同时进行定向变异,从而避免在后期回溯过程中的麻烦。
2.2 DNA连接DNA连接是指将不同组织来源的DNA片段进行连接的技术。
重叠延伸PCR在连接过程中,可以通过PCR技术将两个片段的连接点相互重叠,从而实现快速、准确的连接。
三、操作流程3.1 设计引物首先,需要根据实验需要,设计出两对带有同义语突变位点的引物组合。
3.2 预扩增将目的片段引物体系与目的DNA模板进行PCR扩增,以获得适当浓度的DNA模板。
3.3 扩增突变位点将模板进行分开再扩增,由于引物不具有重复序列,可以杜绝非特异性放大的情况发生。
3.4 扩增合成将扩增突变位点与预扩增产物进行重叠延伸PCR反应,合成所需DNA 片段。
3.5 二次PCR利用扩增产物进行二次PCR反应,获得所需突变的DNA产物。
四、优点4.1 准确性高在重叠延伸PCR中,引物端使用了一些具有重叠序列的引物,可以减少模板串扰,从而大大提高了反应的准确性。
4.2 可控性强由于引物设计合理、重叠合成区域明确,重叠延伸PCR能够实现精确控制产物长度,避免了延伸过程中产生多余的DNA序列。
4.3 操作简便重叠延伸PCR是一种简单、快速、方便的重组技术,操作简便,前期准备工作少。
五、结论重叠延伸PCR是一种高频使用的分子生物学技术手段,具有诸多优点。
在实际应用中,重叠延伸PCR能够实现定向变异、DNA连接等操作,为生物学和基因工程的研究提供了强有力的支持。
重叠延伸PCR技术的基本原理及其简单运用
特点:
可简单迅速将两个DNA片段连在一起,用于嵌合体基因 的构建。此技术利用PCR技术能够在体外进行有效的基因重 组,而且不需要内切酶消化和连接酶处理,可利用这一技术 很快获得其它依靠限制性内切酶消化的方法难以得到的产 物. 可以进行定点突变。 可以在两基因片段间加入其他序列——酶切位点或者标 签。 丰富的PCR的扩增范围,尤其在获得长DNA片段方面,省 去常规克隆的繁琐。
间不宜过长。高温会使 DNA 受到损伤,造成 DNA 酶终止合成。考虑
到DNA 聚合酶的扩增效率、错配率,每一轮反应的循环数控制在 20-
25 个为宜。循环次数过多,碱基错配的几率增大;循环次数太少,则
得不到足够的拷贝数进行下一轮反应。四条引物的TM值尽量保持相同
或一致,利于引物的灵活使用。
10
片段中间引入突 变
B基因: 上游(F2)与A基因终止密码子附近的序列及B基因5 ’ 端起始密码子附近的序列相对应,同样去除A基因终止密 码子TAA;下游(R2)与B基因的开放阅读框终止密码子 序列互补,并在5’末端添加酶切位点和2个保护碱基。
先分别用F1、R1,F2、R2扩增出A和B基因,然后再用F1 和R2将两基因连接起来,得到融合基因。
4
过程
设计引物
PCR扩增 基因两端
回收两端 片段
两端片段 退火延伸
扩增全长 基因
5
基本原理
6
两基因的引物设计
A基因: 上游(F1)与开放阅读框起始密码子附近的序列相对应, 并在5 ’末端添加酶切位点和3个保护碱基;下游(R1) 与A基因终止密码子附近的序列及B基因5’末端起始密码 子附近的序列互补,并去除A基因的终止密码子TAA
姓名:黄保洋 学号:20192118030 专业班级:生物化学与分子
重叠延伸PCR技术
反应机理
F2 引物 F1 引物
5’ 3’ 3’ 5’
基因B
5’ 3’
R2 引物
3’ 5’
基因A
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
R1引物
加入酶,buffer等反应液。PCR仪中解链, 退火——单链模板结合
5’ 3’ 5’ 3’
3’ 5’ 3’ 5’ 加入F1引物、R2引物
5’ 3’
5’
3’
无目标产物
5’ 3’
F1 引物
3’ 5’
R2 引物
重叠延伸PCR技术
(SOE PCR)
1. 重叠延伸PCR技术的概念
• 重叠延伸PCR技术(SOE PCR)是指在PCR技术的基础上,采 用具有互补末端的引物,使PCR产物形成了重叠链,通过重叠链的 延伸,将不同来源的片段重叠拼接起来的一项新技术。该技术可以 很快获得依靠其它限制性内切酶消化的方法难以得到的产物,其 成功的关键是重叠互补引物的设计。SOE PCR在基因的定点突变、 长片段基因的合成、基因敲除以及目的基因的扩增等方面有着独 特的应用。
答案: (1)越高 (2)引物2和引物3中存在互补配对片段,置于同一反应系统时它们会发生结合而失 去作用 (3)3 (4)2 (5)目的基因与载体结合 将重组DNA导入受体细胞
解析:重叠延伸PCR技术在扩增较长片段的DNA、不同来源的DNA片段拼接、 基因的定点诱变等方面有广泛的应用。老师要予以关注,在讲评中可适当拓展。G 与C碱基对之间是三个氢键,引物中G—C含量越多,越稳定。由图可知,因为引物 2、3有互补片段,但引物1、4没有互补片段。利用引物1、2进行扩增,可产生 两种DNA片段,利用引物3、4进行扩增,可产生 ,其中a、c 分别是以引物1和引物4扩增产生的DNA片段,是相同的DNA片段,b、d分别是以引 物2和引物3扩增的DNA片段,碱基序列是不同的,共三种。因为新的核苷酸链必须 从5′端到3′端,在第二阶段,含引物1和引物4的脱氧核苷酸链因为有互补的碱基序 列,而部分互补,并能互为模板进行延伸,但含引物2和引物3的脱氧核苷酸链虽 能部分互补,但因方向问题,不能延伸。
3个片段重叠延伸pcr比例
3个片段重叠延伸PCR比例PCR(聚合酶链式反应)是一种基因工程中常用的技术,通过在体外复制DNA片段,可以迅速扩增目标DNA序列。
3个片段重叠延伸PCR是一种特殊的PCR方法,它可以在同一反应中同时扩增3个相邻的DNA片段,并在这些片段之间引入重叠序列。
本文将介绍3个片段重叠延伸PCR的原理、操作步骤以及相关应用。
原理3个片段重叠延伸PCR的原理基于PCR的基本原理,通过两个反向引物和一个重叠引物,同时扩增3个相邻的DNA片段。
在引物设计上,每个片段的两个端部分分别与相邻片段的重叠序列相匹配,确保扩增时各片段能够连接起来。
重叠引物的设计需要考虑到引物的长度、GC含量和熔解温度等因素,以确保扩增效率和特异性。
在反应过程中,PCR反应液中含有4种核苷酸和聚合酶酶链,以及模板DNA和引物。
反应的温度循环包括变性、退火和延伸三个阶段,使引物与目标DNA序列进行特异性结合,聚合酶依次合成新的DNA链。
重叠引物在扩增过程中连接不同片段的DNA 段,最终得到完整的DNA序列。
操作步骤1.引物设计:根据目标DNA序列,设计两端引物和一个重叠引物。
两端引物的设计需考虑到其与相邻片段的重叠序列的匹配,重叠引物的设计需确保与各引物的熔解温度相近。
2.PCR反应体系组成:将所需核酸、引物和聚合酶按照比例准确加入PCR反应管中,确保反应体系配比正确。
3.温度循环:根据引物的特性和扩增片段的长度,设置合适的温度循环参数。
常规的循环程序包括变性(94-98°C)、退火(50-70°C)和延伸(68-72°C)等步骤。
4.分析扩增产物:可以通过琼脂糖凝胶电泳或其他方法,检测扩增产物的大小和纯度。
应用3个片段重叠延伸PCR在分子生物学研究中具有广泛的应用。
它可以用于基因克隆、基因组测序、遗传变异分析等领域。
在基因克隆中,3个片段重叠延伸PCR可以用于连接两个DNA片段之间的缺失序列,扩增目标片段并进行拼接。
重叠延伸pcr原理
重叠延伸pcr原理重叠延伸PCR(Overlap Extension PCR)是一种用于DNA片段重组的特殊PCR技术。
它的原理是通过两轮PCR反应,将两个不同的DNA片段在它们的重叠部分进行延伸,最终得到一个重组的DNA片段。
这种技术在分子生物学研究中有着广泛的应用,特别是在基因工程领域。
首先,我们来看一下重叠延伸PCR的基本原理。
在第一轮PCR中,我们需要设计两对引物,每对引物包含一个与目标DNA片段的末端相互重叠的序列。
这样,当PCR反应进行时,引物会将两个目标DNA片段的重叠部分进行延伸,形成两个带有重叠序列的DNA片段。
然后,在第二轮PCR中,我们使用这两个DNA片段作为模板,再次进行PCR反应。
这样,重叠部分会在第二轮PCR中连接起来,最终得到一个重组的DNA片段。
重叠延伸PCR的关键在于引物的设计。
引物的选择需要考虑到两个目标DNA片段的重叠部分,以及引物之间的相互作用。
通常情况下,引物的长度在20-30个碱基对之间,GC含量在40-60%之间,Tm值在55-65°C之间。
此外,引物的末端需要与目标DNA片段的重叠部分完全匹配,以确保延伸的准确性。
在实际操作中,重叠延伸PCR需要进行两轮PCR反应。
在第一轮PCR中,我们需要对引物的浓度、反应条件等进行优化,以确保两个目标DNA片段的重叠部分能够被准确延伸。
在第二轮PCR中,我们需要对引物的浓度、反应条件等进行进一步的优化,以确保重叠部分能够被准确连接。
此外,我们还需要对PCR产物进行酶切、测序等验证,以确保重组的DNA片段的准确性和完整性。
总的来说,重叠延伸PCR是一种用于DNA片段重组的特殊PCR技术,它的原理是通过两轮PCR反应,将两个不同的DNA片段在它们的重叠部分进行延伸,最终得到一个重组的DNA片段。
在实际操作中,我们需要对引物的设计、反应条件的优化、PCR产物的验证等进行精细的操作,以确保重组的DNA片段的准确性和完整性。
重叠PCR (Overlap
Cycling conditions
Pre-denaturation: Denaturation: Annealing: Extension: Extension: Finally:
98℃, 2 min.
98℃, 30 sec. 60℃, 30 sec. 72℃,1 min. 72℃,5 min. 4 ℃, ∞.
重叠PCR (Overlap PCR)的基 本原理 及其简单运用
刘梦鸽6.06.08
简介
重叠延伸PCR技术(gene splicing by overlap extension PCR,简称 SOE PCR)由于采用具有互补末端的引物,使PCR产物形成了重 叠链,从而在随后的扩增反应中通过重叠链的延伸,将不同来源 的扩增片段重叠拼接起来的一项技术。
5 cycle
加入100 μM浓度的F和R引物各0.5 μl
Maker
目的基因条带 2154bp
胶回收得浓度: 40μg/mL
Cycling conditions
Pre-denaturation: Denaturation: Annealing: Extension: Extension: Finally:
98℃, 2 min.
98℃, 30 sec. 65℃, 30 sec. 72℃,2 min. 72℃,5 min. 4 ℃, ∞.
12 cycle
12
F2引物 R2引物
R2引物
突变碱基:可以在引物上换成任何其他碱基。
碱基同源区域:保证20bp左右,这样有利于Overlap PCR 得到目标序列。
8
上述反应体系中,反应液的加入有两种不同的方式
一种是先加入酶,模板(基因A和B)buffer,dNTP,水。经过5个循 环得到完整的目的基因。然后入引物,大量扩增目的基因。虽然这样操作 繁琐,但是可以得到特异性扩增产物。 另外一种是直接一步加入所有需要的反应液。虽然此操作简单省时, 但是会出现非特异扩增条带,影响胶回收,产量也会减少。
重叠延伸pcr实验步骤
重叠延伸pcr实验步骤
重叠延伸PCR(gene splicing by overlap extension PCR,简称SOEPCR)是一种利用具有互补末端的引物,使PCR产物形成重叠链,从而在随后的扩增反应中通过重叠链的延伸,将不同来源的扩增片段重叠拼接起来的实验技术。
以下是其基本步骤:
准备基因样品,并确保它们的质量和浓度适合进行PCR。
根据实验设计,选择适当的引物。
这些引物应该具有互补的末端,以便在随后的扩增反应中形成重叠链。
进行第一轮PCR扩增,使用选择的引物。
这一步通常会产生包含重叠序列的PCR 产物。
在进行下一轮PCR之前,回收和纯化PCR产物,以确保最佳的扩增效果。
进行第二轮PCR扩增,将回收的PCR产物作为模板。
在引物中引入需要的限制性位点。
在第二轮PCR扩增过程中,只有右边的引物可以延伸,这是因为左边的引物与模板的结合位点被限制性位点阻挡。
在完成第二轮PCR后,回收和纯化产物。
将两个PCR产物混合在一起,进行延伸反应。
只有右边的引物可以延伸,因为左边的引物与模板的结合位点被限制性位点阻挡。
在延伸反应完成后,将产物作为模板进行第三轮PCR扩增。
在引物中引入需要的限制性位点。
在完成第三轮PCR后,回收和纯化产物。
对最终产物进行电泳分析或其他必要的检测,以确认实验结果。
重叠pcr原理
重叠pcr原理
重叠PCR是一种用于扩增DNA序列的特殊PCR方法。
它基于两个相互重叠的引物同时在反向和正向方向上进行PCR扩增,以产生重叠的片段。
重叠PCR通常用于在实验室中构建DNA片段、基因工程和分子生物学研究中。
重叠PCR的原理是基于引物的设计。
通常情况下,引物的设计应尽量避免相互补的序列,以减少非特异性扩增的产生。
然而,在重叠PCR中,引物的设计是特殊的。
引物的设计应使其相互重叠,并在PCR反应中同时作用。
这样,PCR扩增的产物将具有重叠的序列。
在重叠PCR反应中,两个引物的3'末端分别与目标序列的相应部分互补。
在PCR的早期循环中,两个引物将结合目标序列的两个相邻区域,并启动扩增反应。
在后续循环中,PCR 反应将在两个引物分别结合目标序列的两个相邻区域,并产生重叠的扩增产物。
重叠PCR还可以通过引入点突变、缺失或插入等修饰来构建新的DNA序列。
通过设计引物使其与目标序列的两个相邻区域有所重叠,并引入适当的修饰,可以在PCR扩增中产生带有特定修饰的重叠片段。
这些重叠片段可以用于构建新的DNA序列,进行基因工程操作或进行其他分子生物学研究。
总之,重叠PCR是一种特殊的PCR方法,通过引物的设计使其在PCR反应中同时作用,产生重叠的扩增片段,用于构建新的DNA序列或进行分子生物学研究。
重叠延伸pcr 连接基因
重叠延伸pcr 连接基因重叠延伸PCR是一种常用的DNA连接技术,也称为SOE-PCR(Splicing by Overlap Extension PCR)。
该技术可以将两条互补的DNA片段粘接成一个完整的DNA分子。
这种技术非常适用于连接基因中的不同片段、重构整个基因或制备融合蛋白。
基础原理重叠延伸PCR的基本原理是利用两个DNA片段的端部有30-40个重叠碱基,使它们可以通过PCR反应互相连接。
这个过程可以在两个不同的PCR反应中完成。
第一个反应用于扩增两个DNA片段的端部,而第二个反应用于将这两个片段连接起来。
这两个反应都需要引物,这些引物可以在设计时选择不同长度的重叠区域以产生不同程度的重叠。
设计引物设计引物是成功执行重叠延伸PCR的关键。
引物需要设计成在重叠区域的两端引出相应的PCR扩增产物。
在设计引物时,需要考虑使用一些特殊的引物,比如探针引物、内部引物和延伸引物等。
探针引物用于检测PCR产物,内部引物和延伸引物则用于扩增多段序列。
PCR反应应用领域重叠延伸PCR被广泛应用于连接基因中的不同片段、制备融合蛋白和重构整个基因。
其中,应用最广泛的是连接基因中的不同片段。
通过这种方法,研究人员可以轻松地扩展一个已知基因的功能,并研究它的生物学特性。
此外,该技术还可以用于制备融合蛋白,以获得不同的功能。
重叠延伸PCR还可以用于重构整个基因,以获得更好的表达和更高的生产效率。
总结重叠延伸PCR是一种快速、有效的连接基因的方法。
它可以用于连接基因中的不同片段、制备融合蛋白和重构整个基因。
通过精心的设计引物和PCR反应条件的优化,可以实现高效的PCR扩增和连接。
在实验室应用中,该技术已被广泛应用于基因工程、遗传学和生物工程等领域。
重叠延伸PCR实验要点
重叠延伸P C R实验要点标准化工作室编码[XX968T-XX89628-XJ668-XT689N]
重叠延伸P C R实验
重叠延伸PCR技术(genesplicingbyoverlapextensionPCR,简称SOEPCR)由于采用具有互补末端的引物,使PCR产物形成了重叠链,从而在随后的扩增反应中通过重叠链的延伸,将不同来源的扩增片段重叠拼接起来。
实验方法原理:
此技术利用PCR技术能够在体外进行有效的基因重组,而且不需要内切酶消化和连接酶处理,可利用这一技术很快获得其它依靠限制性内切酶消化的方法难以得到的产物。
重叠延伸PCR技术成功的关键是重叠互补引物的设计。
重叠延伸PCR在基因的定点突变、融合基因的构建、长片段基因的合成、基因敲除以及目的基因的扩增等方面有其广泛而独特的应用。
实验材料:
基因样品
仪器、耗材:
PCR仪
实验步骤:
1.?以引物a/b进行pcr1。
2.?以引物c/d进行pcr2。
3.?引物b/c中引入了需要的限制性位点。
4.?混合二者pcr产物,混合以前最好回收一下。
5.?进行pcr延伸反应,只有右面这个可以延伸。
6.?以延伸反应的产物为模板,以a/d为引物进行pcr。
7.?产物即为所需最终产物。
overlap pcr实验原理 -回复
overlap pcr实验原理-回复Overlap PCR(Overlap Extension PCR)是一种常用的分子生物学技术,可以在无需DNA模板的情况下,通过两个或多个不互补的引物在PCR反应中扩增出具有新基因序列的DNA片段。
Overlap PCR常被用于DNA 重组、基因突变以及DNA标记。
Overlap PCR的实验原理主要基于引物设计和PCR扩增的两个关键步骤:overlap延伸和PCR扩增。
第一步:引物设计在Overlap PCR实验中,最关键的是引物的设计。
所谓overlap,即两个引物的末端具有重叠部分。
这部分重叠的序列通常是外源DNA片段或突变点所在的序列。
为了确保引物能够特异性地结合到目标序列上,设计引物时需要注意以下几个方面:1. 引物长度:通常引物的长度应在18-30个碱基对之间,过长的引物可能会引发非特异性扩增。
2. 引物Tm值:两个引物的Tm值应尽量接近,一般在50-70C之间,确保二者在PCR温度环境下能够特异性地结合到目标序列上。
3. 引物设计位置:overlap序列部分的引物需要位于两个DNA片段的末端,并且需要相向设计。
第二步:Overlap延伸Overlap PCR的第一步是overlap延伸,即将两个引物以某种方式结合在一起,形成overlap序列。
有几种常用的方法可以实现overlap延伸:1. 重叠引物:直接设计两个引物,让它们在末端具有交叠的序列。
在PCR 反应中,这两个引物会互相结合,形成一条连续的DNA链。
2. 重叠延伸:分别用两个单独的引物扩增两个DNA片段,然后将两个片段通过双链断裂与内切酶结合,使它们的末端形成互补的单链序列。
之后,在PCR反应中,这两个片段会通过内切酶结合的互补部分进行延伸并连接到一起。
第三步:PCR扩增在overlap延伸后,得到一条带有overlap序列的DNA链。
接下来,通过PCR反应来扩增目标序列。
PCR反应的步骤通常为:1. Denaturation(变性):将DNA双链分离为两条单链,通常在94-98C 进行。
对“对重叠延伸pcr技术原理理解及举例分析”一文的修正
对“对重叠延伸pcr技术原理理解及举例分析”一文的修正重叠延伸PCR技术是一种用于分离两个互补片段之间的重叠片段的新型聚合酶链反应(PCR)技术。
它由美国著名DNA组学专家艾伯特克里斯特(AlbertvonKistowski)在1993年发明,由于其应用技术简单、成本低、效率高,因此迅速受到生物学界的欢迎,并成为研究DNA序列的一种重要方法。
本文就对此前文章“对重叠延伸PCR 技术原理理解及其举例分析”做出修正,以更全面深入的了解这种技术的原理及应用。
先来详细介绍一下重叠延伸PCR技术的实验步骤及原理:首先,通过重叠片段标记法将被测样本的特殊片段特异性分离出来,并加入重叠延伸PCR反应系统;然后,添加双聚体酶(Taq polymerase)、dNTP(单核苷酸),以及一种促进PCR反应的配体;最后,将系统加热至95°C,使双聚体酶活化,然后逐渐降温至60°C,这就是重叠延伸PCR反应的原理。
重叠延伸PCR技术具有很多优势,被广泛应用于许多生物学领域,其中最为重要的是:首先,它可以有效分离特定的DNA特异片段,从而提高了检测效率;其次,它可以检测DNA片段的相对程度,以及在不同样本中的相对分布情况;最后,它可以以低成本、高效率的方式来分析复杂的DNA序列。
此外,重叠延伸PCR技术也可以被运用到一些其他的研究领域,例如鉴定病原体、检测疾病、筛选单一基因突变、检测菌株的耐药性等。
然而,重叠延伸PCR技术也存在一些缺点。
首先,它仅能检测指定片段,无法实现快速检测;其次,检测结果受到受体DNA程度的影响;最后,它仅适用于DNA片段的分析,不可用于其他类型的分子物质的分析。
综上所述,重叠延伸PCR技术在一些特定场景下优势明显,具有极高的应用价值和潜力。
但它仍需在一些方面进行改进才能充分发挥其实用性。
未来我们希望可以将重叠延伸PCR运用到更多的生物学研究中,以及在其它学科的应用。
重叠pcr原理
重叠pcr原理重叠PCR原理。
重叠PCR(Overlap extension PCR)是一种用于构建特定DNA序列的方法,它通过两轮PCR反应来实现。
这种方法可以在DNA分子的两个不相邻的区域上引入特定的突变、插入或删除,是分子生物学研究中常用的技术手段之一。
首先,我们需要准备两对引物,每对引物包括外向引物和内向引物。
外向引物用于扩增目标DNA的两侧,而内向引物则用于扩增目标DNA的重叠区域。
在第一轮PCR反应中,分别使用两对引物来扩增两个片段的DNA。
然后,将两个PCR 产物混合在一起,并进行第二轮PCR反应,这样就能够得到重叠的DNA片段。
重叠PCR的原理主要包括以下几个步骤:1. 引物设计,首先需要设计两对引物,确保它们能够在目标DNA序列上扩增出两个片段,并且这两个片段能够在重叠区域产生交叉。
2. 第一轮PCR反应,分别使用两对引物来扩增两个片段的DNA。
在这一步中,需要对PCR反应条件进行优化,确保两个片段的扩增效率和特异性。
3. PCR产物混合,将第一轮PCR反应得到的两个片段的DNA产物混合在一起。
4. 第二轮PCR反应,使用外向引物来扩增整个重叠的DNA片段。
在这一步中,需要对PCR反应条件进行进一步的优化,确保得到高纯度和高产量的重叠PCR产物。
通过重叠PCR,我们可以实现对DNA序列的精准编辑,包括点突变、插入、删除等操作。
这种方法在基因工程、蛋白质工程等领域具有广泛的应用,为研究人员提供了便利和灵活性。
总之,重叠PCR是一种强大的分子生物学技术,它通过两轮PCR反应来实现对DNA序列的精准编辑,为基因工程和蛋白质工程等领域的研究提供了重要的技术支持。
希望本文对重叠PCR的原理有所帮助,让读者对这一技术有更深入的理解。
重叠延伸PCR
重叠延伸PCR重叠延伸PCR技术(gene splicing by overlap extension PCR,简称SOE PCR)由于采用具有互补末端的引物,使PCR产物形成了重叠链,从而在随后的扩增反应中通过重叠链的延伸,将不同来源的扩增片段重叠拼接起来.此技术利用PCR技术能够在体外进行有效的基因重组,而且不需要内切酶消化和连接酶处理,可利用这一技术很快获得其它依靠限制性内切酶消化的方法难以得到的产物.重叠延伸PCR技术成功的关键是重叠互补引物的设计.重叠延伸PCR在基因的定点突变、融合基因的构建、长片段基因的合成、基因敲除以及目的基因的扩增等方面有其广泛而独特的应用。
以下是重叠延伸PCR的原理及两基因的引物设计:A基因:上游(F1)与开放阅读框起始密码子附近的序列相对应,并在5 ’末端添加酶切位点和3个保护碱基;下游(R1)与B基因终止密码子附近的序列及A基因5’末端起始密码子附近的序列互补,并去除A基因的终止密码子TAAB基因:上游(F2)与A基因终止密码子附近的序列及B基因5 ’端起始密码子附近的序列相对应,同样去除A基因终止密码子TAA;下游(R2)与B基因的开放阅读框终止密码子序列互补,并在5’末端添加酶切位点和2个保护碱基。
先分别用F1、R1,F2、R2扩增出A和B基因,然后再用F1和R2将两基因连接起来,得到融合基因。
重叠PCR的应用是非常广泛的,他的原理其实很简单:比如说有两个基因或者说一个启动子和一个基因,你要将他们连接到一起,我们首先想到的方法当然是借助于酶切的方法,但有时我们并不一定能构找到合适的酶切位点,或者说我们找到了酶切位点,但这种酶非常特殊或者又很贵,我们可能只用一次,这样购买酶就变成了一种浪费,难道没有别的办法了吗?当然有,那就是重组PCR技术。
举个例子可能更容易说明。
比如两个基因,一个命名为A,一个命名为B。
A的序列为5-atgcatgctagctagaacgctacgctgactaccccctgatc-3,B的序列为5-atgctagtagctagccccccccaggggataattttttaaaacg-3。
重叠pcr原理
重叠pcr原理
重叠PCR(Overlap PCR)是一种常用的分子生物学技术,用
于合成具有重组DNA序列的片段。
重叠PCR的原理基于DNA片段的互相重叠。
在重叠PCR中,通常需要设计两个引物,这两个引物的末端各含有与目标序列相互重叠的片段。
这样,在PCR反应中,引物会首先与DNA
模板结合,并扩增片段的两个末端。
然后,两个扩增产物通过重叠互相为模板,并进行二次扩增,最终产生一个完整的
DNA片段。
重叠PCR通常分为两个步骤:第一个步骤是进行扩增,通过
反应体系中的引物与模板DNA结合,选择性地扩增出希望获
得的片段的两个末端。
功率:维度,第二个步骤是进行二次扩增,将两个扩增产物互相为模板,通过扩增合成出完整的
DNA片段。
这种方法通常用于构建重组蛋白或获得特定的DNA序列。
例如,可以通过重叠PCR在两个DNA片段之间插入不同的序列,实现DNA重组;或者可以使用重叠PCR扩增出特定的DNA
片段,用于进一步的分析和研究。
总之,重叠PCR利用了DNA片段的互相重叠特性,通过两次扩增反应合成出具有重组DNA序列的片段。
这种方法灵活、
高效,广泛应用于分子生物学和基因工程领域。
重叠延伸PCR
重叠延伸PCR,我觉得可以分两种:第一种:用重叠延伸PCR做定点突变,采用重叠引物延伸PCR介导做定点突变实际上是一种快速高效的在基因中特定位点引入特定突变的有效技术。
其基本原理就是采用具有互补末端的引物,使PCR产物形成了一小段的重叠链, 然后在随后的扩增反应中通过重叠链的延伸,将不同来源的扩增片段重叠拼接起来。
该技术主要包括以下几步:(1) 设计引物,PCR扩增基因两端(2) 回收两端片段(3) 两端片段退火延伸,扩增全长基因1. 引物设计重叠延伸PCR做定点突变引物的设计,如下图所示。
引物F及R为基因两端特异引物,其中Fm及Rm为中间引物。
其中引物Fm及Rm中间共享一段序列(至少10bp完全匹配),*为突变点,突变点最好是位于引物的5’端,尽量避免出现在3’端。
然后分别用引物F和Rm及Fm和R进行配对进行PCR。
该步一定要用pfu酶,不能用Taq酶,因为Taq酶容易在PCR产物末端加A,会造成产物移码突变。
2. 分别回收第1步所得两条PCR产物3. 将第2步所得两份PCR产物进行混合使其互为模板及引物,加入dNTP及Pfu或Taq酶及引物F和R进行PCR扩增出具有突变的全基因。
第二种:用重叠延伸PCR做序列缺失突变,即重叠延伸PCR技术(gene splicing by overlapextension PCR,简称SOE PCR)以下是重叠延伸PCR的原理及两基因的引物设计:(1)引物设计:引物a和d是常规引物;b的左半段为常规引物,右半段为基因Ⅱ的引物序列;c同理;则b和c的部分碱基可互补配对。
(2)基因I、Ⅱ分别扩增,产物相应为片段ab和cd。
(3)两种产物混合,经变性及退火处理,a链和d链部分碱基互补配对,成杂交链。
在DNA polymerase作用下,a和d链互为引物和模板,合成出长'链,即为基因I和基因Ⅱ的接接产物。
重叠pcr原理
重叠pcr原理重叠PCR原理。
重叠PCR是一种常用的DNA片段扩增技术,它可以在没有已知序列信息的情况下扩增特定DNA片段。
重叠PCR的原理是利用两个外部引物和两个内部引物来进行两次PCR扩增,最终得到目标DNA片段。
接下来我们将详细介绍重叠PCR的原理及其应用。
首先,重叠PCR的原理是基于两个外部引物和两个内部引物的设计。
外部引物用于扩增目标DNA片段的两端,而内部引物则用于扩增目标DNA片段的内部区域。
这种引物设计可以保证扩增出的DNA片段具有重叠的部分,从而实现两次PCR扩增的叠加效果。
其次,重叠PCR的步骤包括两次PCR扩增。
首先进行第一轮PCR扩增,使用外部引物扩增出两个重叠的DNA片段。
然后,将第一轮PCR产物进行纯化和稀释,再进行第二轮PCR扩增,使用内部引物扩增出目标DNA片段。
通过这样的两次PCR扩增,可以得到目标DNA片段。
重叠PCR的应用非常广泛。
首先,它可以用于无法通过常规PCR扩增的DNA片段。
因为重叠PCR可以通过引物设计来扩增特定区域的DNA片段,所以它适用于一些特殊的DNA序列。
其次,重叠PCR还可以用于基因工程领域,用于构建重组DNA。
通过重叠PCR可以将不同DNA片段进行连接,从而构建出需要的重组DNA片段。
此外,重叠PCR还可以用于点突变的引入。
通过引物设计,可以在目标DNA片段中引入特定的点突变,从而实现对目标基因的定点修饰。
这对于研究基因功能和调控机制非常有帮助。
总的来说,重叠PCR是一种重要的DNA片段扩增技术,它利用外部引物和内部引物的设计,通过两次PCR扩增来得到目标DNA片段。
它的应用范围非常广泛,可以用于无法通过常规PCR扩增的DNA片段、重组DNA的构建以及点突变的引入等领域。
重叠PCR的原理简单,操作方便,是实验室中常用的技术之一。
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重叠延伸P C R实验要点标准化工作室编码[XX968T-XX89628-XJ668-XT689N]
重叠延伸P C R实验
重叠延伸PCR技术(genesplicingbyoverlapextensionPCR,简称SOEPCR)由于采用具有互补末端的引物,使PCR产物形成了重叠链,从而在随后的扩增反应中通过重叠链的延伸,将不同来源的扩增片段重叠拼接起来。
实验方法原理:
此技术利用PCR技术能够在体外进行有效的基因重组,而且不需要内切酶消化和连接酶处理,可利用这一技术很快获得其它依靠限制性内切酶消化的方法难以得到的产物。
重叠延伸PCR技术成功的关键是重叠互补引物的设计。
重叠延伸PCR在基因的定点突变、融合基因的构建、长片段基因的合成、基因敲除以及目的基因的扩增等方面有其广泛而独特的应用。
实验材料:
基因样品
仪器、耗材:
PCR仪
实验步骤:
1.?以引物a/b进行pcr1。
2.?以引物c/d进行pcr2。
3.?引物b/c中引入了需要的限制性位点。
4.?混合二者pcr产物,混合以前最好回收一下。
5.?进行pcr延伸反应,只有右面这个可以延伸。
6.?以延伸反应的产物为模板,以a/d为引物进行pcr。
7.?产物即为所需最终产物。