克隆载体表达载体构建详细版

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表达载体的构建方法及步骤

表达载体的构建方法及步骤

For personal use only in study and research; not for commercial use表达载体的构建方法及步骤一、载体的选择及如何阅读质粒图谱目前,载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA 是一种新的非病毒转基因载体。

一个合格质粒的组成要素:(1)复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。

原核生物DNA 分子中只有一个复制起始点。

而真核生物DNA 分子有多个复制起始位点。

(2)抗生素抗性基因可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+(3)多克隆位点MCS 克隆携带外源基因片段(4)P/E 启动子/增强子(5)Terms 终止信号(6)加poly(A)信号可以起到稳定mRNA 作用选择载体主要依据构建的目的,同时要考虑载体中应有合适的限制酶切位点。

如果构建的目的是要表达一个特定的基因,则要选择合适的表达载体。

载体选择主要考虑下述3点:【1】构建DNA 重组体的目的,克隆扩增/基因表达,选择合适的克隆载体/表达载体。

【2】.载体的类型:(1)克隆载体的克隆能力-据克隆片段大小(大选大,小选小)。

如<10kb 选质粒。

(2)表达载体据受体细胞类型-原核/真核/穿梭,E.coli/哺乳类细胞表达载体。

(3)对原核表达载体应该注意:选择合适的启动子及相应的受体菌,用于表达真核蛋白质时注意克服4个困难和阅读框错位;表达天然蛋白质或融合蛋白作为相应载体的参考。

【3】载体MCS 中的酶切位点数与组成方向因载体不同而异,适应目的基因与载体易于链接,不能产生阅读框架错位。

综上所述,选用质粒(最常用)做载体的5点要求:(1)选分子量小的质粒,即小载体(1-1.5kb)→不易损坏,在细菌里面拷贝数也多(也有大载体);(2)一般使用松弛型质粒在细菌里扩增不受约束,一般10个以上的拷贝,而严谨型质粒<10个。

(3)必需具备一个以上的酶切位点,有选择的余地;(4)必需有易检测的标记,多是抗生素的抗性基因,不特指多位Ampr(试一试)。

克隆载体与表达载体

克隆载体与表达载体

克隆载体与表达载体
1. T载体是克隆载体,你的基因通过TA克隆法插入载体,这一步的目的是扩增基因,得到大量你要的目的基因片段,以便进行下一步表达载体的构建;DH5α是克隆菌株,不能用来做表达;
2. 欲在大肠杆菌中表达外源基因,需要首先构建原核表达载体,如可将构建至T 载体的目的通过双酶切切下来然后连接到表达载体上,如PET系列的载体等,构建成原核表达载体后,可将此载体转化表达菌株,如BL21(DE3,)等,如果你的目的基因含有稀有密码子,也可以转化Rosetta系列的表达菌株。

最后将构建成功的基因工程菌进行诱导表达。

1、T载体常用于克隆,一般来讲都会再把目的基因亚克隆到表达载体上。

但是并非T载体不能用来表达。

常见的pMD18-T,含有lacZ操纵子,可以IPTG诱导表达。

pGEM-T则含有T7和SP6启动子。

2、为了能够顺利地使用T7系统来表达蛋白,在如BL21(DE3)一类的大肠杆菌菌株中,编码T7RNA聚合酶的基因被整合到其染色体上,并位于lacUV5启动子的下游,受乳糖操纵子调控。

而目标蛋白的编码序列则被构建到含T7启动子序列的质粒上,并受T7RNA聚合酶调控转录。

3、构建质粒、基因表达看似比较成熟,也比较简单。

其实这里面大有学问。

学会看菌株和质粒的相关文档,答案就在其中。

表达载体的构建方法及步骤

表达载体的构建方法及步骤

令狐采学创作表达载体的构建方法及步骤令狐采学一、载体的选择及如何阅读质粒图谱目前,载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA是一种新的非病毒转基因载体。

一个合格质粒的组成要素:(1)复制起始位点(加即控制复制起始的位点。

原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。

而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。

(2)抗生素抗性基因可以便于加以检测,如Amp+ ,I<an+(3)多克隆位点MCS克隆携带外源基因片段(4)P/E启动子/增强子(5)Terms终止信号(6)加poly (A)信号可以起到稳定mRNA作用选择载体主要依据构建的目的,同时要考虑载体中应有合适的限制酶切位点。

如果构建的目的是要表达一个特定的基因,则要选择合适的表达载体。

载体选择主要考虑下述3点:[1]构建DNA重组体的目的,克隆扩增/基因表达,选择合适的克隆载体/表达载体。

【2】.载体的类型:令狐采学创作令狐采学创作(1)克隆载体的克隆能力一据克隆片段大小(大选大,小选小)。

如<n)kb选质粒。

(2)表达载体据受体细胞类型一原核/真核/穿梭,E.coli/哺乳类细胞表达载体。

(3)对原核表达载体应该注意:选择合适的启动子及相应的受体菌,用于表达真核蛋白质时注意克服4个困难和阅读框错位; 表达天然蛋白质或融合蛋白作为相应载体的参考。

【3】载体MCS中的酶切位点数与组成方向因载体不同而异,适应目的基因与载体易于链接,不能产主阅读框架错位。

综上所述,选用质粒(最常用)做载体的5点要求:(1)选分子量小的质粒,即小载体(l-1.5kb) 一不易损坏,在细菌里面拷贝数也多(也有大载体);(2)一般使用松弛型质粒在细菌里扩增不受约束,一般1()个以上的拷贝,而严谨型质粒<1()个。

(3)必需具备一个以上的酶切位点,有选择的余地;(4)必需有易检测的标记,多是抗生素的抗性基因,不特指多位Ampr (试一试)。

(5)满足自己的实验需求,是否需要包装病毒,是否需要加入荧光标记,是否需要加入标签蛋白,是否需要真核抗性(如Pur。

克隆载体表达载体构建详细版

克隆载体表达载体构建详细版

克隆载体表达载体构建详细版一、稀释引物1、4℃,15min、13000转离心(先等离心机降温)2、根据OD值加DD水。

3、静置30min(冰上)4、准备1.5毫升EP管,并加90ulDD水。

5、向EP管中加10ul引物,震荡离心,-20℃保存。

二、跑MIX检测引物(20ul体系)、上引物0.8ul下引物0.8ulMix 10ulDNA(日本晴)1ulDD水7.4ul三跑高保真酶(50ul体系)DNAorCDNA 2ul上引物2ul下引物2ul5*buffer 10uldNTPs 5ulDD水28ulPfu(最后加)1ul四胶回收流程1、在紫外线下切胶,用牙签装入2ml的EP管中。

2、按量加XP2,放在55℃水浴锅中10min,每2min摇匀1次,涡旋,短离。

3、将液体冷却到室温,转移到平衡住中,离心10000转,1min30s,倒掉滤液。

4、加入xp2 300ul,离心10000r,1min30s,倒掉滤液。

5、加入spw700ul,离心10000r,1min,倒掉滤液(重复一次)6、空转2min,13000r,之后换1.5mlEP管。

7、套上保鲜膜放入37℃烘箱中,30min。

8、加入DD水10ul,静置2min,离心2min,13000r,重复3次,-20℃保存。

五、胶回收产物检测(10ul)体系上引物0.4ul下引物0.4ulMix 5ul回收产物1ulDD水 3.2ul六、构建blunt cloning 载体(克隆载体)(4ul 体系)胶回收产物 3.5ulBlunt cloning 0.5ul混匀后,PCR:25℃15min 盖子温度50℃之后转化1、提前5min从-70℃冰箱中拿出大肠杆菌感受态,冰上解冻5min。

2、将样品(4ul)加入感受态的大肠杆菌中,冰上30min,大约剩5min左右,打开水浴锅预热到42℃,并拿出SDC 培养基解冻(室温解冻)。

3、水浴锅42℃,60-90s迅速转移到冰浴2min,该过程中不要摇动离心管。

构建表达载体的一般流程

构建表达载体的一般流程

构建表达载体的一般流程
构建表达载体的一般流程如下:
1. 选择合适的载体:根据需要表达的基因或蛋白质,选择一个合适的表达载体。

常用的载体有质粒、病毒、合成RNA等。

2. 插入目标基因:将需要表达的基因插入到载体的多克隆位点中。

可以通过PCR 扩增目标基因并使用限制性内切酶切割载体和基因,然后进行连接。

3. 连接启动子和终止子:为确保基因在宿主细胞中能够正常表达,需要在基因的上游添加启动子和在基因的下游添加终止子。

这些序列将调控基因的表达方式和水平。

4. 检验构建质量:通过限制性内切酶切割、PCR扩增或测序等方法,验证所构建的载体和目标基因的正确性和完整性。

5. 转化宿主细胞:将构建好的表达载体导入到宿主细胞中。

常用的转化方法有电穿孔、热激冲击和化学转化等。

6. 筛选和鉴定:通过特定的筛选方法或选择标记,在转化的宿主细胞中筛选和鉴定表达目标基因的阳性克隆。

7. 表达优化:根据需要,可以通过调节培养条件、添加诱导剂或使用特定的宿主菌株等方法,优化目标基因的表达水平和质量。

8. 收获表达产物:经过一段时间的培养后,收获表达的基因产物,如蛋白质,进行后续的纯化、鉴定和应用等。

需要注意的是,具体的构建流程和方法可能会因实验的目的和要求而有所不同。

在实施过程中,需要对不同步骤和条件进行优化和调整,以确保表达载体的构建和表达目标基因的成功。

分子克隆详细步骤

分子克隆详细步骤

分子克隆详细步骤分子克隆是通过重组DNA分子来产生大量完全相同的DNA序列的技术。

在分子克隆工作中,我们主要进行克隆载体的构建、目标DNA的扩增、将目标DNA插入克隆载体中、转化和筛选等步骤。

下面将详细介绍这些步骤:1.克隆载体的构建:克隆载体是用于插入目标DNA的DNA分子。

常用的克隆载体包括质粒、噬菌体和人工染色体等。

在构建克隆载体时,我们首先需要选择适合的载体,并提取载体的DNA。

然后,利用酶切酶对载体进行酶切,生成线性的载体DNA。

接下来,将目标DNA插入克隆载体的相应位点上,形成重组的载体。

2.目标DNA的扩增:目标DNA可以通过PCR(聚合酶链反应)来扩增。

首先,设计引物,使其与目标DNA的两端末端相互互补。

然后,在PCR反应中,通过DNA聚合酶的扩增作用,使目标DNA得以扩增。

PCR反应通常包括模板DNA、引物、核苷酸和聚合酶等成分。

3.目标DNA的插入:将扩增后的目标DNA与酶切后的载体进行连接,利用DNA连接酶催化目标DNA与载体之间的连接反应,生成重组的克隆载体。

连接后的载体含有目标DNA的序列。

4.转化:将克隆载体引入宿主细胞中进行复制。

这一步骤通常称为转化。

转化可以通过电击、热激、化学方法等方式进行。

宿主细胞通常是大肠杆菌等细菌。

5.筛选:利用筛选方法来选择包含目标DNA的克隆。

常用的筛选方法包括抗生素筛选、报告基因筛选和限制性内切酶酶切筛选等。

抗生素筛选是将带有选择性抗生素耐受基因的克隆引入含有相应抗生素的培养基中,只有带有目标DNA的克隆才能生长。

报告基因筛选是通过将报告基因插入克隆载体中,使之与目标DNA一起被转录和翻译,从而表达报告基因的蛋白质,以此来筛选包含目标DNA的克隆。

限制性内切酶酶切筛选是通过限制性内切酶对重组载体和目标DNA进行酶切,并通过凝胶电泳的方法来分离并检测含有目标DNA的克隆。

以上就是分子克隆的详细步骤。

通过这些步骤,我们可以获得大量完全相同的DNA序列,并用于各类分子生物学研究和应用中。

克隆载体与表达载体

克隆载体与表达载体

克隆载体
基因间隔区(intergenic region, IG 区)基因II与基因IV之间存在一段507bp的基因间隔区,内含有复制起始位点,是实施改造、构建人工载体的重点区域。

② IG区内只有一个Bsu I 切点。

(2)加入酶切位点,在IG区内加入单一内切酶位点。

M13mp1 在IG区内插入一个大肠杆菌的LacZ’(-肽序列)。

使克隆的DNA片段以特定单链的形式输出受体细胞外,M13重组分子筛选简便,被M13噬菌体感染的受体细胞生长缓慢,形成混浊斑,易于辨认挑选。

而且重组分子越大,混浊斑的混浊度亦越大但M13-DNA载体的最大缺陷是装载量小,只有 kb
考斯质粒是一类人工构建的含有λ-DNA cos序列和质粒复制子的的特殊类型载体。

能像
-DNA那样进行体外包装,并高效转染受体细胞;能像质粒那样在受体细胞中自主复制具有较高容量的克隆能力:45kb;具有与同源性序列的质粒进行重组的能力粘粒(cosmid)是带有 cos 序列的质粒。

cos序列是噬菌体 DNA 中将DNA 包装到噬菌体颗粒中所需的 DNA 序列。

黏粒的组成包括质粒复制起点(colE1),抗性标记(amp r),cos 位点,因而能象质粒一样转化和增殖。

克隆的最大 DNA 片段可达 45kb 。

有的粘粒载体含有两个cos 位点,在某种程度上可提高使用效率。

质粒载体总结
λ噬菌体载体
表达载体。

克隆载体与表达载体介绍

克隆载体与表达载体介绍

(二)质粒载体的构建
天然质粒载体不易直接作为克隆载体,需要改造:
(1)选择合适的复制起始位点,松散型质粒复制起始位点; (2)加入合适的选择标记基因,主要有LacZ基因和抗生素抗性基因; (3)增加或减少酶切位点,组装多个单一的限制酶切位点即多克隆位点
(MCS); (4)缩短长度,通常重组DNA分子越小,转化效率越高。
(三)常用的质粒载体
1. pBR322质粒载体
2. pUC18和pUC19质粒载体
3. TA载体
二、噬菌体载体
(一) λ 噬菌体载体 1 λ 噬菌体的性质
λ噬菌体Βιβλιοθήκη 外壳蛋白 线性,全长48502bp
λDNA 5’端含12bp的黏性末端
2 λ 噬菌体的构建 构建λ 噬菌体的依据:
a.λ 噬菌体能够包装原λDNA长度的75%-105%的DNA片段 (36.4~51kb) b.有20kb的区域对λ噬菌体生长非必需。
该λ 噬菌体载体的最大装载容量为: 4.9+5.5+2.6+(51-48.5)=15.5kb
2.6kb
3 代表性λ 噬菌体
(1) 插入型载体
装载容量为:0-10.18kb
(2) 置换型噬菌体载体载体 克隆外源DNA片段范围为:9-23kb
(二) M13 噬菌体载体
1.M13噬菌体的增值
M13噬菌体是单链丝状噬菌体; 长6407bp, 507bp基因间隔区,含复制起始位点,同时可用于改造; M13 DNA在宿主细胞中以双链或单链形式存在,但释放到细胞外的 M13 噬菌体颗粒以单链形式存在。
2.M13噬菌体载体 1) 插入选择标记基因; 2) 组装合适的多克隆位点。
三、噬菌体-质粒杂合载体

克隆载体与表达载体

克隆载体与表达载体

噬菌 粒载 体
M13-DNA 那样体外包 装,并高效转染受体细 胞 装载量比常规的 M13mp 系列要大很多
点、抗生素抗性选择标记和丝状体噬菌 体 DNA 间隔区(含有噬菌体 DNA 复制 起始、终止以及噬菌体颗粒形态发生所 必需的全部顺式作用元件)
个 ampr 基因作为选择记号,便于转化子的选择; 3. 拷贝数含量高 4. 存在着一个多克隆位点区,因 此多种不同类型的外源 DNA 片段,不经修饰便可 直接插入到载体分子上;5.多克隆位点区阻断了大
噬 黏粒 装,并高效转染受体细 位点,因而能象质粒一样转化和增殖。 DNA 可大于 40kb。重组的柯斯质粒可象噬菌体λ
菌 载体 胞;能像质粒那样在受 克隆的最大 DNA 片段可达 45kb 。 一样感染大肠杆菌,并在细菌细胞中复制。
体-
体细胞中自主复制具有 有的粘粒载体含有两个 cos 位点,在

M13 噬菌 体的 基 因组 为单链 DNA。噬菌体颗 粒的大小受其 DNA 端 点制约的,不存在包装 限制。只感染雄性大肠 杆菌
(1)基因组大小;去除非必需区,建立外 源 DNA 片段的克隆或替换位点(2)在 DNA 的非必需区插入选择标记:lacZ 基因;基因 cⅠ 失活(cI 基因:溶源 过程控制基因);Spi 筛选(野生型 λ 噬 菌 体 在 带 有 P2 原 噬 菌 体 的 溶 源 性 E.coli 中 的生长会受到限制的表型, 称作 Spi+ ,即对 P2 噬菌体的干扰敏 感) 基因间隔区(intergenic region, IG 区) 基因 II 与基因 IV 之间存在一段 507bp 的基因间隔区,内含有复制起始 位点,是实施改造、构建人工载体的重 点区域。② IG 区内只有一个 Bsu I 切 点。(2)加入酶切位点,在 IG 区内加 入单一内切酶位点。M13mp1 在 IG 区

克隆载体表达载体(课件)PPT课件

克隆载体表达载体(课件)PPT课件
详细描述
组成型表达载体是将基因整合到宿主细胞的染色体上,使基因在任何生长条件下都能稳定表达。这种 表达载体适用于需要持续稳定表达的基因。
组织特异性表达载体
总结词
在特定的组织或器官中,表达载体才能 启动基因的表达。
VS
详细描述
组织特异性表达载体是将基因与特定的组 织或器官相关的调控序列结合,使基因只 在特定的组织或器官中表达。这种表达载 体适用于需要组织特异性表达的基因。
05
克隆载体和表达载体的未来发展
克隆载体和表达载体的新技术和新方法
基因编辑技术
利用CRISPR-Cas9等基因编辑技术,实现对克隆载体和表达载体的精确修饰,提高基 因治疗的效率和安全性。
人工染色体技术
开发人工染色体技术,实现对大型基因组的克隆和表达,为遗传病研究和治疗提供新的 工具。
克隆载体和表达载体的新应用和新领域
04
克隆载体和表达载体的应用
克隆载体在基因工程中的应用
基因克隆
克隆载体可以将目的基因插入到质粒 或病毒载体中,实现基因的复制和扩 增,为基因工程提供大量目的基因。
基因保存
基因突变
通过将目的基因插入到克隆载体中, 进行定点突变或随机突变,研究基因 功能和蛋白质活性。
克隆载体可以保存和传递目的基因, 为基因工程提供长期稳定的基因来源。
01
02
03
基因治疗
利用克隆载体和表达载体, 开发新型基因治疗策略, 针对遗传性疾病、肿瘤等 进行有效治疗。
生物制药
通过克隆载体和表达载体, 实现高效、大规模的蛋白 质药物生产,推动生物制 药产业的发展。
农业育种
利用克隆载体和表达载体, 培育抗逆、抗病、高产的 农作物新品种,提高农业 生产效益。

为什么要先构建克隆载体再用表达载体 甄选

为什么要先构建克隆载体再用表达载体   甄选

为什么要先构建克隆载体再用表达载体(优选.)为什么要先构建克隆载体再用表达载体构建克隆载体是大量扩增DNA片段,用以测序、酶切和改造等对DNA实施的后续操作,构建表达载体是大量得到翻译产物——蛋白质。

为什么要先构建克隆载体,再用表达载体,我猜是因为:①得到大量的DNA,虽然PCR也可以,但PCR扩增有出错率、但你每做一次常规的PCR,而且每次都要重新提DNA和RNA才行,而且,PCR反应的试剂盒又不便宜,用PCR来制备大量DNA有点得不偿失。

尽管构建克隆载体也存在操作复杂(相对于PCR),成功率不是极高,而且还要筛选,但一旦你重组成功并转入了大肠杆菌,你就可以保存了,你想什么时候用,摇个菌,就可以制备到大量的DNA。

②测序需要。

你想转表达,你首先得确定你扩增的目的片段是不是你要的,不要以为你设计了个特异性引物,然后跟你mark的长度就可以确定了,这也只是推测,在科学上不严谨。

扩增出的基因片段保险起见或者经费允许,要拿去测序,而一般送测的序列都是构建到载体上的序列,克隆载体上一般也都带有测序引物,已确定这就是你要的那条序列。

你要写论文必须要给人真凭实据。

先构建克隆载体再构建表达载体并不是一个必须的选择,如果你的扩增PCR目的条带很亮,而且单一性很好,我建议你可以直接克隆进入表达载体。

很多人选择先构建克隆载体,是因为在扩增基因时目的条带模糊,特异性不好,这样将基因连接到克隆载体上就可以便于挑去单克隆进行测序,增加测序的准确度,从而确认自己克隆基因序列的正确性。

单纯的PCR产物往往是一些各种PCR片段的混合物,直接送过去测序,往往导致测序信号峰很杂,有时候并不能测出想要的信号序列。

同时保存的PCR片段比较容易降解,而构建好克隆载体后形成的质粒是很容易扩增和保存的。

先构建克隆载体,一是为了便于测序,确认克隆序列正确,二是为了便于基因PCR片段的保存。

怎么构建克隆载体和表达载体?首先根据你的实验需要选择相应的载体。

大豆基因的克隆及表达载体的构成

大豆基因的克隆及表达载体的构成

大豆基因的克隆及表达载体的构成大豆(Glycine max)是一种重要的粮食作物和油料作物,其种子中含有高蛋白、高油、高碳水化合物等营养成分,因此在全球范围内广泛种植和应用。

为了深入研究大豆的生长发育、代谢调控等基本生物学问题,以及开发新的大豆品种,需要对大豆基因进行克隆和表达研究。

下面我们来介绍大豆基因的克隆及表达载体的构成。

一、大豆基因的克隆大豆基因的克隆是指从大豆中分离出目标基因的过程。

大豆基因的克隆方法主要有PCR扩增、基因文库筛选和基因芯片等。

其中,PCR扩增是最常用的方法之一。

PCR扩增是指利用DNA聚合酶酶链反应(PCR)技术,通过引物特异性扩增目标基因序列。

PCR扩增方法具有快速、简便、高效、灵敏等优点,适用于小片段基因的克隆。

而对于大片段基因的克隆,则需要使用基因文库筛选和基因芯片等方法。

二、大豆基因的表达载体的构成大豆基因的表达载体是指将目标基因插入到表达载体中,通过转化到宿主细胞中,使目标基因得以表达的载体。

大豆基因的表达载体构成主要包括以下几个部分:1.启动子:启动子是指调控基因转录的DNA序列,它位于基因的上游区域,与转录因子结合后启动基因的转录。

在大豆基因表达载体的构建中,常使用的启动子包括CaMV 35S启动子、nos启动子、ubi启动子等。

2.选择性标记基因:选择性标记基因是指在转化过程中,通过对宿主细胞进行筛选,选择带有表达载体的细胞的基因。

在大豆基因表达载体的构建中,常使用的选择性标记基因包括抗生素耐药基因、草酸乙酯酯化酶基因等。

3.多克隆位点:多克隆位点是指在表达载体中设置多个限制性内切酶切割位点,方便将目标基因插入到载体中。

在大豆基因表达载体的构建中,常使用的多克隆位点包括pUC19多克隆位点、pGEM-T多克隆位点等。

4.表达标签:表达标签是指将目标基因与特定的标签融合,以便于检测目标基因的表达情况。

在大豆基因表达载体的构建中,常使用的表达标签包括His标签、GST标签、FLAG标签等。

构建基因表达载体的流程

构建基因表达载体的流程

构建基因表达载体的流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。

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②载体选择与准备:根据表达系统(细菌、酵母、哺乳动物细胞等)和目的蛋白特性,选择合适的表达载体,如pET系列(原核)、pYES2(酵母)、pcDNA3.1(哺乳动物)。

载体需预先线性化或具有特定限制酶切位点。

③酶切与连接:使用限制性内切酶对目的基因片段和载体分别进行酶切,以产生相匹配的黏性末端或平末端。

之后,通过T4 DNA连接酶将目的基因片段连接到载体上。

④转化与筛选:将连接产物转入相应的宿主细胞(如大肠杆菌DH5α),通过热激、电击等方法促进细胞吸收DNA。

随后在含有抗生素的选择培养基上培养,筛选出含重组载体的阳性克隆。

⑤验证与测序:挑取阳性克隆,通过PCR、酶切分析或直接测序等方法验证目的基因是否正确插入载体,以及阅读框是否正确。

⑥表达验证:将验证后的重组载体转入最终的表达宿主细胞中,诱导表达目标蛋白,通过SDS-PAGE、Western Blot等方法检测蛋白的表达效率及特性。

基因的克隆、表达载体构建及功能验证

基因的克隆、表达载体构建及功能验证

基因的克隆、表达载体构建及功能验证(一般性方法)一、基因克隆★事前三问a.克隆这个基因干什么?它有什么功能?b.这个基因在哪种材料中扩增?c.材料需要怎么处理?◎实验前准备工作a.设计引物,准备材料,b.购置试剂:Taq酶、反转录试剂盒、凝胶回收试剂盒、质粒提取试剂盒、连接试剂盒c.实验试剂及用具:枪头、离心管、培养皿、滤纸灭菌;Amp+ 、Kan+等抗生素准备※基本流程提取和纯化RNA—cDNA第一条链合成—PCR—凝胶电泳—胶回收—连接—转化—涂平板—挑单菌落—摇菌—提质粒—测序1.总RNA的提取、纯化及cDNA第一链合成1.1叶片、根总RNA的提取Trizol是一种高效的总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速裂解植物细胞,抑制细胞释放出的核酸酶,所提取的RNA完整性好且纯度高,以利于下一步的实验。

1)实验前准备预先配制0.1%的DEPC水(ddH2O中含0.1%DEPC,V/V,37 ℃过夜处理12 h),高温灭菌后,用DEPC水配制75%乙醇,研钵、量筒、试剂瓶等需200℃灭菌至少4 h,所用枪头和枪盒均去RNA酶处理(直接购买)。

2)Trizol 法(小麦)叶片或根的总RNA实验步骤如下:(1)提前在1.5 ml离心管中加入1 mlTrizol,然后将200 mg样品液氮中研磨成白色粉末,移入管内,用力摇15 s,在15-30℃温育5 min,使核酸蛋白复合物完全分离。

(2)4℃,12000g离心10min,取上清,离心得到的沉淀中包括细胞外膜、多糖、高分子量DNA,上清中含有RNA。

(3)吸取上清液加0.2 ml氯仿,盖好盖,用力摇15 s,15~30 ℃温育2~3 min。

(4)在≤12000g,4℃离心10 min,样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层,RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60%。

(5)将上层水相转移到新的1.5 ml离心管中,加2倍体积的无水乙醇沉淀RNA,室温静止30 min。

载体构建

载体构建

载体构建分为以下步骤:1.载体的选择和引物设计以扩增目标基因2.目标片段的PCR扩增3.载体和目标片段的限制性酶切4.连接转化5.挑取克隆提质粒6.单克隆的验证及送样测序。

载体的选择实验室常用的载体有pUC19(扩繁目标片段),pet28a(原核表达载体Kna+),pGEX-4T-1(原核表达载体Amp+),pCI-NEO(真核表达载体Amp+),pCDNA3.1(真核表达载体Amp+),pLKO.1(shRNA构建Amp+)。

根据所要构建的质粒目的的差异以及载体和目标片段的酶切位点分析结果来选择载体。

举例如下:实验目的是将MYC基因插入到载体中,转染进细胞中表达。

应选用真核表达载体pCI-NEO 或pCDNA3.1。

引物设计引物设计的目的是将目标片段扩增出来以便与载体连接,所以在引物的两端应人为加上酶切位点,酶切位点前加上保护碱基。

在选择酶切位点是应注意,选择的应该是目的基因片段中没有而载体上有的限制性内切酶,防止目标片段被切不完整,也便于和载体连接。

载体构建之后我们的目的是要表达,所以应该加入标签以便western blot检测蛋白是否表达。

常用的标签有Flag标签、6XHis标签、HA标签和Myc标签。

Flag标签:D Y K D D D D KGAT TAC AAG GAT GAC GAC GAT AAG6XHis标签:H H H H H HCAC CAC CAC CAC CAC CACHA标签:Y P Y D V P D Y ATAC CCA TAC GAT GTT CCA GAT TAC GCTMyc标签:E Q K L I S E E D L这些标签被表达成氨基酸后,特定的氨基酸序列会与相应抗体结合,在western blot时可被检测。

因此,在设计引物时,这些核酸序列应位于起始密码子ATG之后。

翻译是从mRNA的5‘端开始,而蛋白质合成是从N端到C端,所以若要把标签加在N端,标签所对应的核苷酸序列应位于ATG之后,若是加在C端,则应该将标签所对应的核苷酸序列置于终止密码子TAA之前。

最新为什么要先构建克隆载体再用表达载体备课讲稿

最新为什么要先构建克隆载体再用表达载体备课讲稿

最新为什么要先构建克隆载体再⽤表达载体备课讲稿为什么要先构建克隆载体再⽤表达载体构建克隆载体是⼤量扩增DNA⽚段,⽤以测序、酶切和改造等对DNA实施的后续操作,构建表达载体是⼤量得到翻译产物——蛋⽩质。

为什么要先构建克隆载体,再⽤表达载体,我猜是因为:①得到⼤量的DNA,虽然PCR也可以,但PCR扩增有出错率、但你每做⼀次常规的PCR,⽽且每次都要重新提DNA和RNA才⾏,⽽且,PCR反应的试剂盒⼜不便宜,⽤PCR来制备⼤量DNA有点得不偿失。

尽管构建克隆载体也存在操作复杂(相对于PCR),成功率不是极⾼,⽽且还要筛选,但⼀旦你重组成功并转⼊了⼤肠杆菌,你就可以保存了,你想什么时候⽤,摇个菌,就可以制备到⼤量的DNA。

②测序需要。

你想转表达,你⾸先得确定你扩增的⽬的⽚段是不是你要的,不要以为你设计了个特异性引物,然后跟你mark 的长度就可以确定了,这也只是推测,在科学上不严谨。

扩增出的基因⽚段保险起见或者经费允许,要拿去测序,⽽⼀般送测的序列都是构建到载体上的序列,克隆载体上⼀般也都带有测序引物,已确定这就是你要的那条序列。

你要写论⽂必须要给⼈真凭实据。

先构建克隆载体再构建表达载体并不是⼀个必须的选择,如果你的扩增PCR⽬的条带很亮,⽽且单⼀性很好,我建议你可以直接克隆进⼊表达载体。

很多⼈选择先构建克隆载体,是因为在扩增基因时⽬的条带模糊,特异性不好,这样将基因连接到克隆载体上就可以便于挑去单克隆进⾏测序,增加测序的准确度,从⽽确认⾃⼰克隆基因序列的正确性。

单纯的PCR产物往往是⼀些各种PCR⽚段的混合物,直接送过去测序,往往导致测序信号峰很杂,有时候并不能测出想要的信号序列。

同时保存的PCR⽚段⽐较容易降解,⽽构建好克隆载体后形成的质粒是很容易扩增和保存的。

先构建克隆载体,⼀是为了便于测序,确认克隆序列正确,⼆是为了便于基因PCR⽚段的保存。

怎么构建克隆载体和表达载体?⾸先根据你的实验需要选择相应的载体。

人类TAP1基因克隆及表达载体的构建

人类TAP1基因克隆及表达载体的构建

文章编号:1007-8738(2004)01-0053-02人类T AP1基因克隆及表达载体的构建刘 玉1,李殿俊1,吕雪莹1,杨秋霞1,谷金宇2,王 兰1(哈尔滨医科大学:1免疫学教研室,2附属二院普外科,黑龙江哈尔滨150086)收稿日期:2003-06-16; 修回日期:2003-09-05基金项目:黑龙江省自然科学基金资助课题(No.D0122)作者简介:刘 玉(19762),女,黑龙江五大连池人,助教,硕士生.Tel :(0451)86674566;Email :christineliuyu @关键词:TAP1;基因克隆;表达载体的构建;序列分析中图分类号:Q785 文献标识码:A 抗原处理相关转运体(TAP )属于ABC (A TP 2binding cas 2sette )转运体超家族B 亚家族。

人类TAP 基因位于6号染色体上的MHC 2II 类基因区,其编码的TAP1和TAP2分子,分别由748和686个氨基酸残基所组成,两者可形成异源二聚体参与肽类的转运过程,在MHC 2I 类分子介导的抗原递呈途径中起着重要作用[1,2]。

因此,TAP 的异常将严重影响抗原递呈,成为病毒感染及肿瘤细胞逃避免疫监视的重要机制[3],如卵巢癌[4]、肝癌[5]及宫颈癌[6]细胞中TAP1的表达量明显下降。

我们在本实验中,从B 淋巴母细胞系中克隆出TAP1基因,并构建了其表达载体pcDNA3.1/V52His TOPO TA 2TAP1。

1 材料和方法1.1 材料 人类B 2LC L 细胞由本校生物学教研室惠赠。

TRI 2zol 试剂、Therm oscript RT 2PCR system 及P fx DNA 聚合酶,以及pcDNA 3.1/V52H is TOPO T A 载体,均购自Invitrogen 公司。

CONCEPT 凝胶纯化试剂盒购于G ibcoBRL 公司。

MiniBEST 质粒提取试剂盒及特异性T AP1引物购于T a K aRa 公司。

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一、稀释引物
1、4℃,15min、13000转离心(先等离心机降温)
2、根据OD值加DD水。

3、静置30min(冰上)
4、准备1.5毫升EP管,并加90ulDD水。

5、向EP管中加10ul引物,震荡离心,-20℃保存。

二、跑MIX检测引物(20ul体系)、
上引物0.8ul
下引物0.8ul
Mix 10ul
DNA(日本晴)1ul
DD水7.4ul
三跑高保真酶(50ul体系)
DNAorCDNA 2ul
上引物2ul
下引物2ul
5*buffer 10ul
dNTPs 5ul
DD水28ul
Pfu(最后加)1ul
四胶回收流程
1、在紫外线下切胶,用牙签装入2ml的EP管中。

2、按量加XP2,放在55℃水浴锅中10min,每2min摇匀1次,涡旋,短离。

3、将液体冷却到室温,转移到平衡住中,离心10000转,1min30s,倒掉滤液。

4、加入xp2 300ul,离心10000r,1min30s,倒掉滤液。

5、加入spw700ul,离心10000r,1min,倒掉滤液(重复一次)
6、空转2min,13000r,之后换1.5mlEP管。

7、套上保鲜膜放入37℃烘箱中,30min。

8、加入DD水10ul,静置2min,离心2min,13000r,重复3次,-20℃保存。

五、胶回收产物检测(10ul)体系
上引物0.4ul
下引物0.4ul
Mix 5ul
回收产物1ul
DD水 3.2ul
六、构建blunt cloning 载体(克隆载体)(4ul 体系)
胶回收产物 3.5ul
Blunt cloning 0.5ul
混匀后,PCR:25℃15min 盖子温度50℃
之后转化
1、提前5min从-70℃冰箱中拿出大肠杆菌感受态,冰上解冻5min。

2、将样品(4ul)加入感受态的大肠杆菌中,冰上30min,大约剩5min左右,打开水浴锅预热到42℃,并拿出SDC 培养基解冻(室温解冻)。

3、水浴锅42℃,60-90s迅速转移到冰浴2min,该过程中不要摇动离心管。

4、加入900ulSOC培养基,混匀。

5、37℃,160r摇床1h,使细菌复苏。

6、取出后离心3000r,2min。

7、吸出上清,留下100-150ul左右冻在LB 100ml+kana或者A 固体培养基上。

8、涂板,37℃过夜培养。

9、挑单菌落(一般不超过7个)加入到10ul的DD水中。

菌液PCR体系(10ul体系)
上游引物0.4ul
下游引物0.4ul
Mix 5ul
菌液1ul
DD水 3.2ul
之后跑电泳,若有目的条带则继续。

七摇菌
菌液+LB液体(加抗生素)-------L管(过夜摇菌)
第二天500ul菌液+500ul甘油混匀保存2管,其中一管送检,另一管-70℃保存。

若检测结果正确
八、提取质粒
1、在1.5ul的EP管中收集菌液,10000转,1min,弃上清,重复一次。

2、加205ul solution I(提前预热),用枪头打匀,室温静置2min。

3、加250ul solution II(提前预热),混匀,室温静置2min。

4、加350ul solutionIII,混匀,室温静置2min(有白色丝状物产生)
5、13000转,10min,取700ul上清液于吸附柱中,10000转,1min。

6、加500ul HBbuffer,12000转,1min,倒掉废液。

7、加700ul DNA wash buffer,13000转,1min,倒掉废液,重复一次。

再空离心2min 13000转。

8、37℃烘箱中干燥5分钟,加50ulDD水溶解,静置2min,离心13000转,2min。

九做酶切(50ul)
DD水19ul
K-B 5ul
质粒20ul
bamI 3ul
HIndIII 3ul
之后37℃烘箱,不超过16h
十、加5ul lodding buffer
若有条带胶回收。

十一胶回收(步骤同四)
十二做连接,连接表达载体
目的基因(胶回收的)4ul
载体(1300)1ul
DD水2ul
Buffer 2ul
T4连接酶1ul
过夜16℃,水浴连接。

十三、连接后转化,同“六”
十四、挑条单菌落
跑菌落PCR,若有条带,将剩下的9ul +LB液体+K 加入L管过夜培养。

十五、取L管500ul与500ul 甘油加入EP管中,并与-70℃保存
将L管剩下的菌液取1ul跑菌落PCR(10ul体系)
跑电泳检测结果。

十六提质粒
十七酶切检测
DD水7ul
K-B 1ul
质粒1ul
BamI 0.5ul
HinIII 0.5ul
37℃2.5h后可以检测。

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