化学软件chemoffice安装和基本教程
化学软件chemoffice安装和基本教程
图4-18复制修改得到的乙酰水杨酸结构式
乙酰水杨酸合成反应方程式
图4-20符号窗口
图4-21 字体选项
图4-22“Color”菜单选项
图4-23调色板
绘制实验装置
利用实验仪器模板工具1和实验仪器模板工具2进行实验装置的绘制,在模板 中选择所需的实验仪器,单击产生相应的玻璃仪器。玻璃仪器连接处为阴影。通 过旋转选择框改变角度和大小进行玻璃仪器的连接。示范图例见下图4-24。
链的绘制链长对话框链属性的设置4化合物结构绘制示例ch胡萝卜素结构连接点及单键的产生长链的生成?结构的复制及旋转两个结构的连接连接前的胡萝卜素结构绘制绘制修正修正图形存盘图形存盘图形旋转和缩放图形旋转和缩放检查结构错误检查结构错误结构式结构式名称名称1名称名称结构结构structurestructureconvertnamestructureconvertnamestructure先靠文字输入先靠文字输入结构式结构式名称名称结构式结构式名称名称预测核磁共振化学位移预测核磁共振化学位移structurestructurepredictpredict11hhnmrshiftsnmrshiftsstructurepredict1hnmrshifts分析结构估计性质分析结构估计性质3化学反应方程式绘制举例ohcoohoocchcoohch70c80c15min水浴图418复制修改得到的乙酰水杨酸结构式乙酰水杨酸合成反应方程式图420符号窗口图421字体选项图422color菜单选项图423调色板绘制实验装置利用实验仪器模板工具1和实验仪器模板工具2进行实验装置的绘制在模板中选择所需的实验仪器单击产生相应的玻璃仪器
chemoffice软件安装步骤详细截图
1、双击安装软件:
2、然后点击"Activate Later"运行
(最下面那个Activation Code不要填,直接点上面的"Activate Later"即可)
3、一路选择默认设置,安装软件
4、,安装成功后,要替换此文件,如下图。找到这个目录
将安装包里面的此文件复制到如图所示的安装路径下,5、安装成功,运行此软件,即可开始工作。
Chemoffice_2008_使用教程
C hemoffice2008使用教程
ChembioOffice简介
ChembioOffice是由CambridgeSoft开发的综合性科学应用软件包。该软件包是为广大从事化学、生物研究领域的科研人员个人使用而设计开发的产品。同时,这个产品又可以共享解决方案,给研究机构的所有科技工作者带来效益。利用ChemBioOffice你可以方便的进行化学生物结构绘图、分子模型及仿真、可以将化合物名称直接转为结构图,省去绘图的麻烦;也可以对已知结构的化合物命名,给出正确的化合物名。目前最新的版本为Chemoffice 2010。
Chemoffice2008包括以下几个部分:
1.ChemDraw Ultra11.0:化学结构绘图。
2.Chem3D Ultra11.0:分子模型及仿真。
3.ChemFinder Ultra11.0:化学信息搜寻整合系统
4.E-Notebook11.0:整理化学信息、文件和数据,并从中取得所要的结果。
Chemoffice安装方法:
1.运行setup.exe
2.输入证书时输入:
Name:lZ0
email:lz0@
Serial:011-256104-7199
3.然后点击"Activate Later"
4.复制crack.reg文件到C:\Program Files\CambridgeSoft\ChemOffice2008\Common\DLLs 双击确定即可
ChemDraw的使用方法:
1.绘制结构式
以水杨酸(salicylic acid)为例
步骤:1.打开ChemDraw
ChemOffice-软件的操作与使用课件
立构中心模板
超分子模板
ChemOffice-软件的操作与使用
绘图实例
➢ 绘制阿司匹林结构式
O
利用模板按左图绘制出简式;
O O
单击选取框按钮,选中画好的 阿司匹林结构式;
OH
asp irin
➢ 图形存盘
执行【Structure】/【Clean Up Structure】菜单命令,整理图形 到最佳状态。
分子式和结构式是化学家的语言
目录
ChemOffice-软件的操作与使用
主要内容
• 第一部分:化学结构绘制软件Ch百度文库mWin
• 1. ChemWin简介
• 2.键、环、箭头箭头工具
• 3.编辑工具、原子标记、轨道、组合工具、菜单命令等
• 第二部分:集成化学软件桌面系统ChemOffice
• 1. Chem Draw
ChemOffice-软件的操作与使用
2.2 ChemDraw的使用
• 2.2.1 概述 • 2.2.2 化学结构绘图 • 2.2.3 ChemNMR-核磁谱的计算 • 2.2.4 ChemProp-分子物理化学性质计算和标准
命名 • 2.2.5 原子轨道和分子轨道图的制作
ChemOffice-软件的操作与使用
苯环
ChemOffice-软件的操作与使用
模
垂直工具栏上的【模板】按钮包含了常
chemoffice安装和基本教程
• 两个结构的连接
连接前的胡萝卜素结构
CH3 CH3 CH3 CH3 CH3 H C CH 3 3
H3C CH3
H3C
绘制
修正
图形存盘
图形旋转和缩放
检查结构错误
结构式 名称
(1)名称结构(structure convert name to structure) 先靠文字输入
结构式 名称
ChemDraw Ultra 8.0 化学结构绘图
Chem3D Ultra 8.0 分子模型及仿真 ChemFinder Pro8.0 化学信息搜寻整合系统 E2Notebook Ultra8.0
化学结构绘图软件ChemDraw
ChemDraw 软件功能十分强大,可以编辑、绘制与化 学有关的一切图形,如建立和编辑各类分子式、方程式、
分子模型及仿真软件Chem3D
主界面
3D模型绘制与编辑
(1)利用键工具建立模型 (2)利用文本工具建立模型
(3)利用子结构建立3D模型
子结构模型库
使用模板建立3D模型
利用模板建立富勒烯 3D模型
改变元素序号与替换元素 改变元素序号:
首先选中模型。执行“Edit”菜单中的“Select All”命令或ctrl + A快捷键;
化学软件ChemOffice
概述
ChemOffice软件是由剑桥化学(Cambridge Soft)软件公司开 发的集成化学软件桌面系统,集成了Chem3D、ChemDraw、 ChemFinder和ChemInfo,以及Chem TableEditor等软件,具有强 大的高端开发功能。
chemoffice20.0用法
chemoffice20.0用法
ChemOffice20.0是一款强大的化学信息软件,它提供了全面的化学信息数据库,包括分子建模、反应机制、光谱分析等功能,广泛应用于化学、生物、材料等领域。本文将详细介绍ChemOffice20.0的用法,帮助用户更好地掌握软件功能。
一、安装与启动
ChemOffice20.0的安装过程较为简单,只需要按照安装向导的提示即可完成安装。安装完成后,可以通过启动图标进入软件。首次启动ChemOffice20.0时,会提示用户选择一个模板,以便进行分子建模和计算。
二、基本操作
1.创建分子模型:在ChemOffice20.0中,可以通过点击“新建”按钮创建一个新的分子模型。在创建过程中,可以选择不同的建模工具和参数,以满足不同的建模需求。
2.编辑分子模型:创建分子模型后,可以通过各种编辑工具对分子结构进行修改。例如,可以使用“旋转”工具将分子模型旋转到正确的角度,以便观察分子的细节。
3.保存和导出分子模型:完成分子模型的编辑后,可以将其保存到本地或导出为常见的文件格式,如XYZ、MOL、PDB等。
三、化学信息查询
ChemOffice20.0提供了丰富的化学信息查询功能,包括分子轨道、键能计算、光谱分析等。用户可以通过软件内置的数据库查询所需的化学信息。
四、反应机制模拟
ChemOffice20.0支持反应机制模拟,用户可以通过软件内置的反应模块构建反应路径,观察反应过程中的能量变化和产物生成。
五、光谱分析
ChemOffice20.0提供了多种光谱分析工具,如红外光谱、核磁共振光谱、拉曼光谱等。用户可以通过选择相应的光谱模块,导入分子模型,并设置相应的参数进行光谱分析。
chemdraw15.0安装教程
1.选中【Chemdraw15.0】压缩包鼠标右击选择【解压到Chemdraw15.0】。4
2.双击打开【Chemdraw15.0】文件夹。
3.软件需要Net
4.6的环境,选中【Net4.6】鼠标右击选择【以管理员身份运行】。
4.点击【是】。
5.等待加载。
要。
7.win7需要安装,勾选【我已阅读并接受许可条款】然后点击【安装】。
8.安装中。
9.点击【完成】。
10.重启电脑,点击【立即重新启动】。
11.重启后打开【Chemdraw15.0】文件夹,选中【cop150】可执行文件鼠标右击选择【以管理员身份运行】。
12.加载中。
13.点击【Install Software】。
14.点击【Quit】。
15.点击【确定】。
16.点击【Next】。
17.滑块拉到底选择【I accept the terms in…】然后点击【Next】。
18.点击【Change】更改软件的安装路径,建议安装在除C盘之外的其他磁盘,可以在D盘或其他盘新建一个【ChemOffice2015】文件夹,然后点击【Next】。
19.点击【Next】。
20.点击【Next】。
21.选择【ChemOffice Professional2015】然后点击【Install】。
22.安装中。
23.点击【Finish】。
24.点击【EXIT】。
25.点击开始菜单找到【ChemDraw Professional15.0】往桌面拖动即可创建桌面快捷方式。
26.双击打开【ChemDraw Professional15.0】。
27.打开之前解压后的【Chemdraw15.0】文件夹,选中【Crack】文件鼠标右击选择【以管理员身份运行】。温馨提示:若打开后没有crack文件,则需要关闭你电脑杀毒软件和防火
ChemOffice-软件的操作与使用
第四节 钢结构工程施工质量缺陷分析与防治措施
主
主工具栏
格式栏
菜单栏
结构工具栏 界
面
模板工具栏
状态栏
绘图区
第四节 钢结构工程施工质量缺陷分析与防治措施
套索 实键 双键 虚键 切割键 切割楔键 黑体键 黑体楔键 空心楔键 波浪键 表格 长链 环丙烷环 环戊烷环 环庚烷环 环己烷椅式 环戊二烯环
子轮廓图及分子轨道特性分析,并和数种量子化 学软件结合在一起。 3. ChemFinder模块——化学信息搜寻整合系统 智能型的快速化学搜索引擎。可以建立化学数据 库、储存及搜索,也可以使用现成的化学数据库。
第四节 钢结构工程施工质量缺陷分析与防治措施
2.2.1 概述 2.2.2 化学结构绘图 2.2.3 ChemNMR-核磁谱的计算 2.2.4 ChemProp-分子物理化学性质计算和标
1. 简单的无机反应式和有机分子式
ChemDraw中可以一次性输入反应式文本,在应用 “Formula”
进行优化,其Formula格式化的智能程度较其他软件有所 增
强。
2. Fischer(费舍尔)投影式 3. Haworth(霍沃思)投影式 4. Newman(纽曼)投影式 5. 立体化学
垂直工具栏上的【模板】按钮包含了常用的和重要 的模板如多种较复杂的分子种类和玻璃仪器模板
化学常用软件应用简介(ChemOffice) ppt课件
包含三种工具:
碎片工具 离解工具 合成工具
:破坏指定化学键,使分子成为两部分。 :破坏化学键画出一个离解反应。 :破坏化学键画出一个逆向合成反应。
ppt课件
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• 环工具:画环状结构。
• 楔形键工具: 画楔形键。
• 制表工具: 用于多重网格制表。其中 薄层色谱板(TLC)可以画出
可以显示生物绘图工具栏,增加了生物和 生物化学的基本元素。
ppt课件
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• 对象工具: 【View】/【Show Object ToolBar】,
:将对象结合成组合对象 :将组合对象拆散为单个对象
:将对象按左对齐
:将选定对象置于其他对象上层
:将对象按上对齐
:将选定对象置于其他对象下层
:将对象按左右居中对齐
ppt课件
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ppt课件
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ppt课件
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7. 选中垂直工具栏 中的文本工具,分 别将鼠标移至应该 出现羟基或氧原子 的位置,待出现连 接点后,点击键盘 上的O键。
ppt课件
page47
在绘制过程中,化学键键角难以精确掌握,且 拖拉化学键或键点的过程中难免会造成键长的变 化和图形的扭曲,因此需要对图形进行整理。除 了手动调整外,还可以通过ChemDraw的相关菜 单命令进行整理。
ChemOffice软件及应用第一章 概述
4. ChemFinder
化学信息管理系统
可进行化学物质的物理化学数据查询和化学反应查 询;也可以自己建立数据库,进行管理。 数据查询:结构查询、文本查询和反应式查询。
ChemOffice软件及应用
第一章 概述
Hale Waihona Puke Baidu
1. 1 简 介
ChemOffice是美国Cambrigesoft公司出品 本学习版本为ChemOffice 2004 其中包括 ChemDraw, Chem3D, ChemFinder, E-Notebook ChemInfo和BioAssay几个部分。 运行环境在Microsoft Windows 95\98\NT, Windows XP下,也可在其它系统中操作。
将二维平面的有机分子结构图型转化成三维的空间 结构,在分子和原子水平上模拟和分析分子的立体构象 是其一大特点。 其辅助工具可计算分子半径的几何构象和单个点的 能量以及相关性质。
3. ChemInfo
智能型数据管理系统
可建立分子结构的数据库,将用到的所有分子结 构和文字等说明以及得到的试验数据和分析结构输入 进去。
1.2 ChemOffice 2004 组成
1. ChemDraw 是化学结构绘图软件 • 绘制和编辑化学结构图 • 识别和显示立体结构 • 结构和名称(IUPAC Name)的转换 • 包含NMR数据库 • 与Excel集成
化学软件 ChemOffice 的使用
字符映射表在文本输入下激活(黑色)
字符映射表在非文本输入 下不激活(灰色)
结构的展开与调整:
展开标记
结构调整
文件保存
三、检查化学结构信息:
分析结果窗口
结果粘贴:
化合物结构与命名:
结构命名
名称转化为结构 结构转化为名称
查看俗名
氢谱的预测
1HNMR预测
1HNMR预测结果
预测结果
碳谱的预测
ChemDraw——主要操作
7、 选中垂直工具栏中的文本工具,分别将鼠标移至应该出现羟基或氧原子的位 置,待出现连接点后,点击键盘上的O键。 8、单击 选取框按钮,选中画好的阿司匹林结构式。 9、执行【Structure】/【Clean Up Structure】命令,整理图形,即可将结构式整 理到最佳状态。该命令可多执行几次,直到结构式的形状不再变化。
二、保存:
ChemDraw文件的扩展名为“cdx”。 【File】/【Save As】,弹出【另存为】对话框,即可保存。【保存类型】 有多种选项,可另存为Chem Draw 3.x版的格式(“chm”),或“gif”、 “bmp”图形格式,或另存为ISIS格式。
打开文件
元 素 周 期 表
字 符 映 射 表
➢ ChemDraw Ultra 11.0 化学结构绘图 ➢ Chem3D Ultra 11.0 分子模型及仿真 ➢ ChemFinder Pro11.0 化学信息搜寻整合系统 ➢ E2Notebook Ultra11.0 ➢ BioAssay Pro11.0 ➢ 量化软件MOPAC、Gaussian 和GAMESS 的界面 ➢ ChemSAR Server Exce ➢ ClogP,CombiChemPExcel
ChemOffice使用简介
3.7 其他计算
从头算程序: 从头算程序:Gamess Gaussian 需另外安装这两个程序。 需另外安装这两个程序。 半经验或分子力学计算 Mechanics Mopac (Am1, Mindo/3, Mndo, PM3) 计算方式:计算性质,最小能,过渡态优化, 计算方式:计算性质,最小能,过渡态优化,光谱分析
鄙人水平有限,不足之处,请大家批评指正。
3. Chem3D简介 Chem3D简介
提供功能 制作结构:单键、 制作结构:单键、 双键、三键, 双键、三键,氢分 子键, 子键,立体旋转 读取chemDraw结构 读取chemDraw结构 chemDraw 进行结构优化计算 进行量化结构
O
3.1
基本制作
制作结构:单键、双键、三键,氢分子键,立体 制作结构:单键、双键、三键,氢分子键, 旋转
2.ChemDraw简介 2.ChemDraw简介
基本功能与 chemwind相同 相同 特殊功能: 特殊功能: (1)分子结构模板众 (1)分子结构模板众 多 (2)玻璃容器与玻璃 玻璃容器与玻璃 管模板: 管模板:可制作实 验装置
质谱碎片
弧线 电子云 图形 插入表格 结构与仪器模板 配位键及手性 标注 薄层色谱图
3.5 MM2计算 MM2计算
例如:甲苯结构, 例如:甲苯结构,Minimal Energy计算 计算 运算完后, 运算完后,执行 “Structuer/measurements”菜单 菜单 可显示 键长Bond Lengths 键长 键角Bond Angles 键角 二面角Dihedral Angles 二面角 等分子优化前后的内坐标参数
ChemOffice2004使用手册
ChemOffice 2004使用手册CS ChemOffice 2004是由美国剑桥软件公司开发,包括增强版和标准版。CS ChemOffice包括三个软件:ChemDraw、Chem3D、ChemFinder。其中Chemdraw主要用来绘制分子结构式、反应方程式;Chem3D可以显示分子的三维立体图象;ChemFinder可以建立自己的数据库。这三部分既可以单独使用,又可以联合起来应用到教学和编辑的工作之中。该软件可以运行于Microsoft Windows98、2000以及Windows NT下,也可以运行在多种操作系统中。由于Windows环境下具有的友好用户界面的切换功能,使得其资料可更加方便地共享于各软件之间。
§2.1 ChemDraw的使用
ChemDraw的特点
ChemDraw的程序界面是标准的Windows窗口(图1),在窗口中点击左键以激活快捷工具。用来画分子图形的各种常用操作均用图标形式显示于左边的工具箱中,不必记忆任何操作命令,亦可采用下拉式菜单方式使用。有的工具按钮上有“向右的小三角”图标,表明有多重选项。如果需要对分子图形进行放大和缩小或者进行任意角度旋转等操作,可以直接用鼠标选中相应的结构,就可进行操作。该软件提供了各种类型的化学键、化学分子轨道、电荷、球(椭球);并且自带了12类几百个模板,从芳环、多元环、羰基化合物到糖、氨基酸等应有尽有,使用十分方便;ChemDraw还具有了分子结构的扩展,例如在写分子式时可以用Me代替甲基,Ph代表苯环,在利用展开分子式功能可以将这些缩写展开。
ChemOffice2008实用教程
8
1.3 ChemOffice 2008的安装与启动
1 2 3
系统配置要求 安装、启动及退出 如何获得帮助
9
1.3.1 系统配置要求
ChemOffice 2008可以在Windows上运行(ChemDraw 2008可在Macintosh 操作系统上运行)。操作系统要求Windows 2000、Windows XP或Windows Vista。需注意的是,到目前为止,ChemOffice 2008只支持32位操作系统, 而不支持64位Windows XP或Windows Vista系统。除此之外,ChemOffice 2008 的运行还需 Internet Explorer 6.0 或更高版本的浏览器,同时也可支持 Mozilla Firefox 1.5(包括Mozilla Firefox 2.0)、Netscape 7.x和Mozilla 1.x 等其他浏览器。需特别注意的是,为了能顺利运行Chem & Bio 3D,显示器 分辨率至少要设置为800×600或以上。 【注意】在本教程的撰写过程中以Windows XP作为操作平台,因此在后面 的介绍中,所有的软件安装及使用都以Windows XP作为默认操作平台。
ChemFinder:化学信息搜寻整合系统(Searching & Information Integration)
4
1.2.1 ChemDraw模块组件
ChemOffice软件使用简介
模板工具
脂环模板工具
14
第一部分 ChemDraw简介
模板工具 DNA模板工具
15
第一部分 ChemDraw简介
模板工具 官能团模板工具
16
第一部分 ChemDraw简介
模板工具 己糖模板工具
17
第一部分 ChemDraw简介
模板工具
苯环模板工具
18
第一部分 ChemDraw简介
模板工具 多面体模板工具
模板工具
生物模板工具
9
第一部分 ChemDraw简介
模板工具 玻璃仪器模板工具(I)
10
第一部分 ChemDraw简介
模板工具 玻璃仪器模板工具(II)
11
第一部分 ChemDraw简介
模板工具
构象异构体模板工具
12
第一部分 ChemDraw简介
模板工具
环戊二烯模板工具
13
第一部分 ChemDraw简介
19
第一部分 ChemDraw简介
模板工具
RNA模板工具
20
第一部分 ChemDraw简介
特殊符号模板工具
模板工具
立体中心模板工具
21
第一部分 ChemDraw简介
快捷键
命令
灰色表 示命令 未激活
小三角 表示 子菜单
22
化学软件ChemOffice的使用说明
二、 化学结构绘图软件ChemDraw
ChemDraw 软件功能十分强大,可以编辑、绘制与化学 有关的一切图形,如建立和编辑各类分子式、方程式、结 构式、立体图形、对称图形、轨道等,并能对图形进行编 辑、翻转、旋转、缩放、存储、复制、粘贴等多种操作。 用它绘制的图形可以直接复制粘贴到Word 软件中使用。 最新版本的软件还可以生成分子模型、建立和管理化学信 息库、增加了光谱化学工具等功能。
图18 复制修改得到的乙酰水杨酸结构式
图19 乙酰水杨酸合成反应方程式
图20 符号窗口
图21 字体选项
图22 “Color”菜单选项
图23 调色板
6、绘制实验装置
利用实验仪器模板工具1和实验仪器模板工具2进行实验装置的绘制,在模板 中选择所需的实验仪器,单击产生相应的玻璃仪器。玻璃仪器连接处为阴影。通 过旋转选择框改变角度和大小进行玻璃仪器的连接。示范图例见下图4-24。
1、主界面
图1 ChemDraw的主界面
(1)菜单栏 )
菜单栏共有11个下拉菜单,每一个下拉菜单中都包括相应的命令。 其中如果相应的命令前有√,则该条命令已经被执行;若命令后有小 三角表示该指示条有子菜单;指示条灰色表示该命令未激活。
图 2 ChemDraw的菜单栏
“File”菜单命令
图3 文件命令的下拉菜单
•文件命令对话框
图4 文件命令的对话框
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
②元素符号的输入:
官能团或元素符号的输入
键及元素文本属性的设置:
(2)环工具:主工具面板中提供了10种环
工具命令,其中在模板命令中还有芳香化合物 模板和双环模板可以绘制环状化合物。
•环的绘制
•环的连接
➢面板中选取相应的环命令后,直接在绘制区点击可产 生相应的环。点住鼠标左键不放,拖动鼠标可以对环的 大小,放置的角度进行自由改变。
➢元素符号的输入与目标参数的设置与键操作类似,同样 在“Structure”菜单中可以对选择的键的属性进行设定。
(3)链工具
① 链的绘制
选取长链工具,在需要进行的连接原子或环上点击或拖动可产生链; 同时弹出链长对话框,可以选择增长链的长度。
链长对话框
② 链属性的设置
(4)化合物结构绘制示例
CH3 CH3
➢环己烷的椅式构型直接点击为水平放置,按Shift键点 击可由水平变为垂直。
➢在面板中任选一环命令,按Ctrl键点击,可以在环中 产生不定域共轭圈。
➢选择键命令或环命令,直接在环的任何一个节点处点击 或拖动可以实现键的连接或环与环的点连接。
➢选择环的一个节点,按住鼠标左键,从一个节点拖至另 一个节点,可以实现环与环的双点连接。
Chemdraw主界面
(1)菜单栏
菜单栏共有11个下拉菜单,每一个下拉菜单中都包括相应的命令。 其中如果相应的命令前有√,则该条命令已经被执行;若命令后有小 三角表示该指示条有子菜单;指示条灰色表示该命令未激活。
“File”菜单命令
•文件命令对话框
(2)
主 工 具 图 标 板
主 工 具 图 表 板
化学物质检索方法
“ChemFinder”对话框
图 4-40分子结构信息对话框
请按
化学反应的检索
查找免费网络资源
免费资源查找链接
➢改变元素:
双击需要改变元素符号的原子,弹出输入框,输入元素符号,按回车 键完成原子序号的更改。若原子的三维结构中显示孤对电子,执行关闭 “Tools”菜单中的“Show H’s ans Lp’s”命令,可不显示氢原子和孤对电子。
ChemDraw结构式与3D模型的转换
(1)ChemDraw结构式转换为3D模型 (2)3D模型转换为平面结构式
ChemDraw Ultra 8.0 化学结构绘图 Chem3D Ultra 8.0 分子模型及仿真 ChemFinder Pro8.0 化学信息搜寻整合系统
E2Notebook Ultra8.0
化学结构绘图软件ChemDraw
ChemDraw 软件功能十分强大,可以编辑、绘制与化 学有关的一切图形,如建立和编辑各类分子式、方程式、 结构式、立体图形、对称图形、轨道等,并能对图形进行 编辑、翻转、旋转、缩放、存储、复制、粘贴等多种操作。 用它绘制的图形可以直接复制粘贴到Word 软件中使用。最 新版本的软件还可以生成分子模型、建立和管理化学信息 库、增加了光谱化学工具等功能。
化学软件
Chem Office使用方法简介
概述
ChemOffice软件是由剑桥化学(Cambridge Soft)软件公司开 发的集成化学软件桌面系统,集成了Chem3D、ChemDraw、 ChemFinder和ChemInfo,以及Chem TableEditor等软件,具有强 大的高端开发功能。
分子模型及仿真软件Chem3D
主界面
3D模型绘制与编辑
(1)利用键工具建立模型 (2)利用文本工具建立模型
(3)利用子结构建立3D模型
子结构模型库
使用模板建立3D模型
利用模板建立富勒烯 3D模型
改变元素序号与替换元素 ➢ 改变元素序号:
首先选中模型。执行“Edit”菜单中的“Select All”命令或ctrl + A快捷键; 然后整理结构,执行“Tools”菜单中的“Clean Up Structure”菜单命令。 使用垂直工具栏中 的工具,双击需要改变序号的原子,弹出输入框, 输入原子序号,按回车键完成原子序号的更改。
双键命令板中的子菜单中还包括12个键命令。利用键 工具进行结构绘制操作的基本操作:首先在命令面板 中选取键命令,绘制的基本操作是“点位”、 “拖 动”和“点击”。
绘制分子结构的基本操作
① 键的产生:
点位后,向某个方向拖动可以产生。 直接单击,产生所选择类型的化学键,连续点击两键
相连默认角度为120度。 点位位于一键的起点(显示小蓝块),沿键拖动会产
Chem3D的分子优化
(1)整理结构和简单优化
Tools- Clean up structure
(2)MM2优化 Minimize structure
(3)MOPAC优化
化学信息搜索引擎ChemFinder
ChemFinder 是一个智能型的快速化学搜寻引擎,所 提供的ChemInfo 是目前世界上最丰富的数据库之一,包 含ChemACX、ChemINDEX、ChemRXN、ChemMSDX等, 并不断有新的数据库加入。该程序可以从本机、网络、服 务器中搜索Word、ChemDraw、ISIS、Excel等格式的分子 结构文件。ChemFinder 自带多个数据库,其数据库文件 扩展名为“sfw”,这些数据库默认存放在C:\Program Files\CambridgeSoft\ChemOffice 2004\ChemFinder\Samples 文件下。
结构式 名称
(2) 结构式名称
预测核磁共振化学位移(structure---predict 1H-NMR shifts)
Structure—predict 1H-NMR shifts
分析结构估计性质
(3)化学反应方程式绘制举例
OH
(CH3CO)2 70°C80°C 15min水浴
COOH
OOCCH3 COOH
H3C
CH3
CH3
CH3
胡萝卜素结构
CH3
H3C
CH3
H3C
连接点及单键的产生
长链的生成
•结构的复制及旋转
• 两个结构的连接
连接前的胡萝卜素结构
CH3 H3C CH3 CH3
CH3 CH3
CH3 H3C CH3 H3C
绘制
修正
图形存盘
图形旋转和缩放
检查结构错误
结构式 名称
(1)名称结构(structure convert name to structure) 先靠文字输入
பைடு நூலகம்
图4-18复制修改得到的乙酰水杨酸结构式
乙酰水杨酸合成反应方程式
图4-20符号窗口
图4-21 字体选项
图4-22“Color”菜单选项
图4-23调色板
绘制实验装置
利用实验仪器模板工具1和实验仪器模板工具2进行实验装置的绘制,在模板 中选择所需的实验仪器,单击产生相应的玻璃仪器。玻璃仪器连接处为阴影。通 过旋转选择框改变角度和大小进行玻璃仪器的连接。示范图例见下图4-24。
模板
点击模板工具栏按钮下面的右指三角箭头,单击该按钮, 不松开,就可以弹出模板信息,众多画图的起点。
【Aromatics芳香族模板】 【Bicyclics双环模板】 【Bioart生物艺术模板】
8
总结:共17个模板
绘制与编辑典型化学物质结构式
(1)键工具: 主工具图标板上提供了九个键操作的命令,其中