PubMed检索机制及规则
pubmed检索方法
pubmed检索方法Pubmed 检索方法Pubmed 是美国国家医学图书馆(National Library of Medicine)所开发的一个免费的生物医学文献库,包含了全球几乎所有的生物医学文献,是医学研究人员和医生进行搜索和查找相关医学文献的重要工具。
本文将介绍Pubmed 的检索方法。
一、关键词检索关键词检索是 Pubmed 最常用的检索方式,通过输入关键字搜索相关的文献。
在检索时需要注意以下几点:(1)关键词要准确。
Pubmed 检索采用布尔操作符(AND、OR、NOT)连接多个关键词,关键词之间要使用英文逗号(,)隔开。
使用过多的关键词可能会导致检索结果没有想象中的好。
(2)参数设置。
可以根据需求调整相关参数,例如年份、文献类型(Review、Clinical Trial、Randomized Controlled Trial等)、文章作者、机构等。
(3)英文文献。
Pubmed 绝大部分都是英文文献,所以检索时需要使用英文关键词。
(4)筛选性强的关键词。
例如疾病名称、独特的药品名称等。
Pubmed 支持多种文献类型检索,例如:(1)临床试验在 Pubmed 首页上,勾选临床试验会检索到近期的中断临床试验、未发布的临床试验等。
(2)随机对照试验勾选随机对照试验可以检索到已发表的随机对照试验。
(3)综述勾选文章类型为系统综述或综述,可以检索到该领域最新的文献综述。
三、学科分类检索Pubmed 中的文献都会有一个或多个学科分类号(MeSH Terms),用户可以通过选择学科分类号进行检索。
在检索时需要注意以下几点:(1)科学性强的关键词。
例如,临床试验、人类、治疗法等。
(2)与所需内容相关的关键词。
例如,药物作用机制、剂量方案等。
(3)使用适当数量的关键词。
使用过少的关键词会导致检索结果过多,使用过多的关键词会导致检索结果不够全面。
Pubmed 中的文献都会有一个分值,通过分值和其他指标来对文献进行评价。
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。
例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。
PubMed检索
[PubMed-OLDMEDLINE]
二、PubMed数据范围
PubMed在不断增加新数据的同时,还会向数据库中追加更早 的数据,目前通过PubMed可查到的最早文献为1809年出版 的Medico-chirurgical transactions上的文献,且为免 费全文。 需要注意的是:In Process Citations和Publishersupplied Citations数据未标引主题词,因此使用主题词 检索只能查到Medline中的数据。
字段限定符:[],空格按词组来匹配 如 :Stem [ti] AND neuroscience 截词符:treat* treat treated treatment 查全同一概念的不同词性的变化
双引号:“ ”,表示对引号中的短语进行强迫词组检索。 检索词自动转换匹配功能关闭 对于专有名称和物质名称及缩写的检索时要加“”,提高查准 率。 例如“acute low back pain” “ang Ⅰ”(血管紧张素Ⅰ缩写)
③短语表(Phrase list)。
该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言 系统(UMLS: Unified Medical Language System)和补充概念(物质)名称 表[Supplementary Concept (Substance) Name]。 如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查 找短词表。
二、PubMed数据范围
PubMed提供部分免费全文,包括① NLM开发的免费生 物医学数字化期刊全文数据库PubMed Central(PMC); ② 开放获取(Open Access, OA)期刊的文献; ③部分出版商提 供的免费期刊文献。
PubMed检索
发展历程
NLM早在1879年即开始编译医学文献的检索刊物 《医学索引》(Index Medicus ,IM)
从1964年起,采用计算机进行电子编辑和排版,在此 基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(Medical Literature Analysis & Retrieval System),即著名 的MEDLARS系统
MeSH转换表 Vitamin h→ "biotin"[MeSH Terms] OR "biotin"[All Fields] OR "vitamin h"[All Fields]
期刊转换表 new england journal of medicine → "N Engl J Med"[Journal] OR "new england journal of medicine"[All Fields]
临床查询(Clinical Queries)
Clinical Study Categories(临床研究类文献) Systematic Reviews(系统评价) Medical Genetics(医学遗传学)
MeSH: Clinical Queries
结果限定选项
直接以systematic review、Cochrane、meta-analysis、 Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索
PubMed每条记录均有惟一的识别号 PMID(PubMed Unique Identifier) 。
❖ MEDLINE: PubMed主体部分,记录均标有 [PubMed-indexed for MEDLINE]
文献检索 第四课 Pubmed
温州医科大学图书馆
林薇
Contents
初识PubMed PubMed基本检索 PubMed高级检索 PubMed主题词检索 PubMed期刊检索 PubMed检索结果处理
初识 PubMed
标引质量高
更新速度快 使用方便
信息量大
选择PubMed的n个理由
/pubmed
Pubmed基本检索
一、Pubmed检索系统
(三)Pubmed基本检索 基本检索
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
1.
逻辑运算符: AND OR NOT
AND diabetes therapy NOT nifedipine
将检索出同时包含阿司匹林和糖尿病两个检索词的文献。
/美国国立卫生研究院
/美国国立医学图书馆
/国家生物技术信息中心
Entrez资源整合系统
NCBI资源整合系统,基于Web界面的综合生物信 息数据库,可实现跨库检索,包括
GenBank和Nucletide (2) Genoma (3) OMIM (4) Protein (5) Structure (6) Pubmed (7) PMC
(1)
初识Pubmed
一、Pubmed检索系统
(一)Pubmed收藏范围:
(1)
(P46)
Medline:标注为[Pubmed-indexed for Medline] (2) OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline] (3) In Progress Citations:标注为[Pubmed-in Process] (4) Publisher Supplied Citation:标注为[Pubmed-as supplied by Publisher]
pubmed检索技巧
主题检索
主题检索
mad cow disease
主题检索
主题检索
主题检索
期刊检索
检索结果显示与输出
检索结果显示
显示格式 每页显示条数 排序
检索结果输出
通过页面右上方send to实现,包括: Send to File Send to Clipboard Send to Collections Send to Email
逻辑运算符:
逻辑与:AND,逻辑或:OR,逻辑非:NOT
截词符:*,一个词或字拼写出部分字母后 面加上一个截词符,chem*表示用词根进行 检索。
双引号:“ ”,表示对引号中的短语进行 检索。
检索字段标识符:[tag],tag为字段名称。
[ti],[au],[ta], [la],[pt]。
Pubmed 数据库
主要内容
概况 检索机制 检索途径 检索结果显示与输出 全文获取
PubMed概况
美国国家医学图书馆下设的国家生物技术 信息中心(NCBI)开发,是目前国际上公认 的检索生物医学文献最具权威、利用率最 高、影响最广的数据库
PubMed检索机制
自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)
个人绑定邮箱
全文获取
pubmedfw@ xxmu03m99 xx@
谢谢!
出版类型
PubMed登陆
http://www. 或者 /pubmed/ 或者通过图书馆的外文数据库(pubmed文
献服务系统)进入:
PubMed检索界面
pubmed引文检索
pubmed引文检索
在PubMed上进行引文检索(Citation Search)是一种查找特定文献的方法。
这允许你查找引用了或被引用了某一篇文章的其他文章。
以下是在PubMed上执行引文检索的一般步骤:
1.搜索原始文章:进入PubMed,使用文章的标题、作者或PMID(PubMed唯一标识符)等信息,找到你感兴趣的原始文章。
2.进入文章页面:点击文章标题,进入文章的详细页面。
3.找到引文选项:在文章详细页面中,查找引文或相关记录的选项。
通常,这个选项位于页面的右侧或下方。
4.进行引文检索:点击引文或相关记录的链接,这将显示引用了或被引用了原始文章的其他文章列表。
5.筛选和浏览引文:根据需要,你可以使用PubMed提供的筛选选项来缩小结果,例如按日期、文章类型等。
浏览引文列表,找到你感兴趣的文献。
6.查看引文详细信息:点击引文列表中的文献标题,以查看有关该文献的详细信息。
请注意,有时不是所有的引文信息都会在PubMed中显示,这取决于文献的可用性和PubMed数据库的更新。
此外,引文检索的准确性也受到引用格式和文献数据库互操作性的影响。
PubMed检索规则与语法
PubMed检索规则与语法①布尔运算符AND,OR,NOT必须大写,例如,vitaminc OR zinc;②PubMed从左至右进行布尔运算。
不过,你可以通过加圆括符改变运算顺序,如commoncoldAND(vitamincORzinc)。
③指定文献记录字段名称检索,如dna[mh]ANDcrick[au]and1993[dp]。
下面列出常用字段名称缩写:DP——出版日期采用YYYY/MM/DD[DP]格式,如1998/03/06[DP]。
输入日期范围则用冒号连接,如1996:1998[DP],1998/01:1998/04[dp]AD——第一作者机构名称、地址、资助号如LM05545/LM/NLM[ad]AU——作者姓名如o’brienj[au]TA——期刊名称包括期刊名全称、简称、ISSN。
jbiolchem[ta]或0021-9258[ta]LA——文献出版语言Chinese[la]MH-Mesh主题词neoplasms[mh]或neoplasms/dt[mh]PT——出版类型review[pt]TW——自由词AA001794[tw]T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma[ti]PubMed 检索PubMed系统检索范围:MEDLINE数据库和PreMEDLINE数据库。
1.词语(主题)检索在PubMed主页的提问框中键入英文单词或短语(大写或小写均可后回车或点击“Go”,PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并将检索结果直接显示在主页下方。
例如:键入“vitamin c common cold”后回车或点击“Go”,PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
如果检索结果不符合要求,可以在提问框中增加或删除词语,或者在Details状态下(参见Details键的用法)来修改检索式,也可使用“Limits”(参见Limits的用法)选择限定条件后再进行检索。
此外,用户可根据需要使用通配符“*”或双引号进行截词检索或强制检索。
pubmed的主要检索规则
pubmed的主要检索规则
PubMed是一个免费的生物医学文献数据库,主要包含了生物
医学、生命科学和相关领域的学术文章。
以下是PubMed的主
要检索规则:
1. 使用关键词检索:用户可以在PubMed的搜索框中输入与所
需信息相关的关键词,例如特定疾病、研究领域、药物名称等。
可以使用布尔运算符(AND、OR、NOT)来组合关键词,以
便更精确地进行检索。
2. 使用限制条件:用户可以使用限制条件来缩小检索结果的范围。
例如,可以通过选择特定时间范围、特定语言、特定研究类型(如临床试验、回顾性研究等)来限制检索结果。
3. 使用注册号检索:用户可以使用PubMed的搜索框来搜索特
定文献的注册号,如PubMed唯一的标识号(PMID)或国际
标准序列号(ISBN)等。
4. 使用高级搜索:PubMed还提供了高级搜索选项,用户可以
使用更多的搜索条件和筛选器来进行更精确的检索。
例如,用户可以在高级搜索中指定作者、期刊、出版日期等限制条件。
5. 使用Mesh词检索:PubMed还使用了医学主题词(Medical Subject Headings,简称Mesh)的术语系统来标注和分类文章。
用户可以使用Mesh词来更精确地检索文章并获得相关的研究
结果。
需要注意的是,PubMed的检索规则可能会根据平台的更新而有所变化。
因此,用户在使用PubMed检索时应根据具体的要求和搜索介面的提示进行操作。
Pubmed文献检索
PT
Publication Type SO Source TA Journal Title TI Title
四、检索途径与方法
1.
关键词检索
直接输入检索词即可 e.g. vitamin c 、common cold e.g. “single cell”
使用双引号检索,会自动关闭词汇转换功
Pubmed的检索界面
检索输入框
二、PubMed的检索原理和过程
PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。
当未加任何限定修饰的检索词被输入到检 索提问框时,它是按照一定的顺序被核对、 转换、匹配和检索的。 Mesh转换表:包括Mesh词、参见词、副 主题词等 期刊转换表:包括刊名、缩写、ISSN号等 短语表 作者索引 要查验检索词的转换情况,可用“details”
六、组配检索
AND、
OR、 NOT air AND bladder AND fistula dna [mh] AND crick [au] AND 1993[dp] asthma/therapy [mh] AND review [pt] 查有文摘的文献 neoplasms AND hasabstract
三、字段标识符
ALL All Fields AU Authors’ names MAJR MeSH Major Topic MH MeSH Terms SHP Subheadings SB Subset DP Publication Date IS ISSN LA Language
能,做为词组来检索
2. 作者检索
姓在前,名在后(用缩写) e.g. smith ja 如没有名,则在所有字段中查找, 限定用 smith[au]
PubMed检索规则与语法
PubMed检索规则与语法①布尔运算符AND,OR,NOT必须大写,例如,vitaminc OR zinc;②PubMed从左至右进行布尔运算。
不过,你可以通过加圆括符改变运算顺序,如commoncoldAND(vitamincORzinc)。
③指定文献记录字段名称检索,如dna[mh]ANDcrick[au]and1993[dp]。
下面列出常用字段名称缩写:DP——出版日期采用YYYY/MM/DD[DP]格式,如1998/03/06[DP]。
输入日期范围则用冒号连接,如1996:1998[DP],1998/01:1998/04[dp]AD——第一作者机构名称、地址、资助号如LM05545/LM/NLM[ad]AU——作者姓名如o’brienj[au]TA——期刊名称包括期刊名全称、简称、ISSN。
jbiolchem[ta]或0021-9258[ta]LA——文献出版语言Chinese[la]MH-Mesh主题词neoplasms[mh]或neoplasms/dt[mh]PT——出版类型review[pt]TW——自由词AA001794[tw]T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma[ti]PubMed 检索PubMed系统检索范围:MEDLINE数据库和PreMEDLINE数据库。
1.词语(主题)检索在PubMed主页的提问框中键入英文单词或短语(大写或小写均可后回车或点击“Go”,PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并将检索结果直接显示在主页下方。
例如:键入“vitamin c common cold”后回车或点击“Go”,PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
如果检索结果不符合要求,可以在提问框中增加或删除词语,或者在Details状态下(参见Details键的用法)来修改检索式,也可使用“Limits”(参见Limits的用法)选择限定条件后再进行检索。
此外,用户可根据需要使用通配符“*”或双引号进行截词检索或强制检索。
PubMed检索原理及途径
PubMed检索原理及途径1. 检索原理PubMed具有自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)。
对于输入检索框中的检索词,将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换,然后再进行检索。
其顺序是:MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。
此外,还可进行短语检索,即将短语作为一个词组进行检索,可用双引号将其引起,此时系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。
2. 检索途径⑴基本检索PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏,此外,其左侧栏还提供了几种检索功能:Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。
在提问框输入自由词或检索表达式(可直接进行字段限定),点击go 即可进行自由词检索。
同样可结合辅助工具栏按钮,进一步检索。
Limits:限定检索。
PubMed限制内容较多,可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。
History:检索历史。
可自动将检索式及结果数量记录到History屏,结合#号进一步检索。
#号间可以用布尔逻辑符组佩检索,如#1 AND #2。
例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献步骤:PubMed主页→点击limits,限定时间2004;语种为English→页面最下端点击go,在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。
⑵主题词检索点击主页左侧栏MeSH Database,或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH,即可进入MESH检索界面。
PubMed检索原理及途径
PubMed检索原理及途径1. 检索原理PubMed具有自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)。
对于输入检索框中的检索词,将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换,然后再进行检索。
其顺序是:MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。
此外,还可进行短语检索,即将短语作为一个词组进行检索,可用双引号将其引起,此时系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。
2. 检索途径⑴基本检索PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏,此外,其左侧栏还提供了几种检索功能:Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。
在提问框输入自由词或检索表达式(可直接进行字段限定),点击go 即可进行自由词检索。
同样可结合辅助工具栏按钮,进一步检索。
Limits:限定检索。
PubMed限制内容较多,可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。
History:检索历史。
可自动将检索式及结果数量记录到History屏,结合#号进一步检索。
#号间可以用布尔逻辑符组佩检索,如#1 AND #2。
例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献步骤:PubMed主页→点击limits,限定时间2004;语种为English→页面最下端点击go,在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。
⑵主题词检索点击主页左侧栏MeSH Database,或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH,即可进入MESH检索界面。
第三章 PUBMED检索
OldMedline:含1950~1965年期间发表的生物医学文献,
记录中没有MeSH字段和摘要字段,记录标识[PubMedOLDMEDLINE for Pre1966]。
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1.PubMed的数据来源
LOGO PreMedline(In-process citations):未经主题词标引,
PubMed数据库文献记录数已经超过了1900万条。其中部分 文献提供免费的全文链接服务。
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二、PubMed概况
LOGO
特点:
主题加工规范 检索方式灵活多样
免费提供题录和文摘
提供与原文的网址链接(部分免费获取) 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷
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第三节 PubMed的使用
LOGO
一、检索机制和规则
1.单词、词组检索 2.短语检索
3.截词检索
4.布尔逻辑运算 5.MeSH检索(主题词检索) 6.限定检索 7.序号检索
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1.单词、词组检索
直接输入检索词,不 加任何限定
没有录入Medline中的数据,每天更新。标识为[PubMed- in
process]。 Publisher-Supplied Citation:出版商直接提供的电子文
献,标识为[PubMed-as supplied by publisher]。
此外,PubMed还提供NCBI开发的其他综合性分子生物学数据 库链接服务,包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、人类 孟德尔遗传在线等。
内容涉及基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医
PubMed检索规则与语法
PubMed检索规则与语法①布尔运算符AND,OR,NOT必须大写,例如,vitaminc OR zinc;②PubMed从左至右进行布尔运算。
不过,你可以通过加圆括符改变运算顺序,如commoncoldAND(vitamincORzinc)。
③指定文献记录字段名称检索,如dna[mh]ANDcrick[au]and1993[dp]。
下面列出常用字段名称缩写:DP——出版日期采用YYYY/MM/DD[DP]格式,如1998/03/06[DP]。
输入日期范围则用冒号连接,如1996:1998[DP],1998/01:1998/04[dp]AD——第一作者机构名称、地址、资助号如LM05545/LM/NLM[ad]AU——作者姓名如o’brienj[au]TA——期刊名称包括期刊名全称、简称、ISSN。
jbiolchem[ta]或0021-9258[ta]LA——文献出版语言Chinese[la]MH-Mesh主题词neoplasms[mh]或neoplasms/dt[mh]PT——出版类型review[pt]TW——自由词AA001794[tw]T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma[ti]PubMed 检索PubMed系统检索范围:MEDLINE数据库和PreMEDLINE数据库。
1.词语(主题)检索在PubMed主页的提问框中键入英文单词或短语(大写或小写均可后回车或点击“Go”,PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并将检索结果直接显示在主页下方。
例如:键入“vitamin c common cold”后回车或点击“Go”,PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
如果检索结果不符合要求,可以在提问框中增加或删除词语,或者在Details状态下(参见Details键的用法)来修改检索式,也可使用“Limits”(参见Limits的用法)选择限定条件后再进行检索。
此外,用户可根据需要使用通配符“*”或双引号进行截词检索或强制检索。
PubMed检索原理及途径
PubMed检索原理及途径1. 检索原理PubMed具有自动转换匹配功能(Automa tic Term Mappin g)。
对于输入检索框中的检索词,将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换,然后再进行检索。
其顺序是:MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。
此外,还可进行短语检索,即将短语作为一个词组进行检索,可用双引号将其引起,此时系统不进行自动转换匹配,也不进行Me SH词的扩检。
2. 检索途径⑴基本检索PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏,此外,其左侧栏还提供了几种检索功能:Journa ls Databa se , MeSH Databa se , Single Citati on Matche r, BatchCitati on Matche r, Clinic al Querie s, Specia l Querie s, LinkOu t, My NCBI (Cubby)。
在提问框输入自由词或检索表达式(可直接进行字段限定),点击go 即可进行自由词检索。
同样可结合辅助工具栏按钮,进一步检索。
Limits:限定检索。
PubMed限制内容较多,可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Ent rez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。
Histor y:检索历史。
可自动将检索式及结果数量记录到H istor y屏,结合#号进一步检索。
#号间可以用布尔逻辑符组佩检索,如#1 AND #2。
例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placen ta growth)和氧气 (oxygen)的英文文献步骤:PubMed主页→点击limi ts,限定时间2004;语种为Eng lish→页面最下端点击go,在检索词输入框中,输入plac entagrowth AND oxygen→点击go→得到检索结果。
第三章 PUBMED检索
期刊出版地
作为文献主题的人名 文献类型,包括期刊论文、综述、临床试验、随机对照试验、病例报 告、来信等 酶学委员会分配给特定酶的编号和CAS的化学物质登记号 PubMed中的子集数据库,如Medline,OldMedline,Nursing Journals,Core Clinical Journals,AIDS等 MeSH副主题词 文献出处 刊名缩写 篇名 不用于显示。用于对篇名和摘要字段进行检索 不用于显示。用于以下字段的检索:TI、AB、MH、SH、NM、PS、 OT等字段 期刊卷号
一、Medline简介 二、PubMed概况 三、PubMed与Medline的比较
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一、Medline简介
LOGO Medline是美国国立医学图书馆(NLM)创建和维护的国际性
综合生物医学信息书目数据库,是当前国际上最权威的生
物医学文献数据库。 收录了80多个国家和地区的5000多种生物医学及相关学科 期刊,累积了1950年至今的1600多万篇文献,年收录文献 约40万篇。
四、检索结果的处理
五、PubMed的全文获取与相关链接
第四节
检索练习
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本章内容的重点、难点
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PubMed的使用:检索规则、基本检索
途径、逻辑关系组配、主题检索,以及
检索结果的排序和保存。
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第一节 Medline和PubMed
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二、PubMed概况
LOGO 2.学科主题
PubMed内容涉及医学、护理学、口腔医学、兽医学、卫生
保健系统、前临床医学、药理学、生理学、基础医学等领 域。 3.收录年限 PubMed收录了自1950年以来的包括MEDLINE在内的全世界
PubMed检索原理及途径
PubMed检索原理及途径1. 检索原理PubMed具有自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)。
对于输入检索框中的检索词,将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换,然后再进行检索。
其顺序是:MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。
此外,还可进行短语检索,即将短语作为一个词组进行检索,可用双引号将其引起,此时系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。
2. 检索途径⑴基本检索PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏,此外,其左侧栏还提供了几种检索功能:Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。
在提问框输入自由词或检索表达式(可直接进行字段限定),点击go 即可进行自由词检索。
同样可结合辅助工具栏按钮,进一步检索。
Limits:限定检索。
PubMed限制内容较多,可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。
History:检索历史。
可自动将检索式及结果数量记录到History屏,结合#号进一步检索。
#号间可以用布尔逻辑符组佩检索,如#1 AND #2。
例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献步骤:PubMed主页→点击limits,限定时间2004;语种为English→页面最下端点击go,在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。
⑵主题词检索点击主页左侧栏MeSH Database,或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH,即可进入MESH检索界面。
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PubMed检索机制及规则
PubMed的检索功能非常强大,在检索中可实现检索词的自动转换、通配符的使用等功能,也可以进行强制性检索。
1 词汇的自动转换功能
在PubMed主页的检索提问框中输入检索词进行检索时,系统将按顺序自动使用如下3种索引,对检索词进行转换后再进行检索。
1.1 Mesh转换表(MeSH Translation Table)
包括MeSH词、参见词、副主题词、出版类型、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS)、补充概念(物质)名称表等。
如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词(或其它词表中的词)和Text word词(题名词和文摘词),并用“OR”组配进行检索,同时停止使用其它的索引进行转换。
有些词在转换后可能会出现3个词进行检索。
例如:键入“blood",系统将其转换成"("blood"[MeSH Subheading] OR "blood"[MeSH Terms]) OR blood[Text Word]"后进行检索。
1.2 刊名转换表(Journal Tanslation Table)
包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。
如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其对应到相应的刊名进行检索。
此外,该转换表能把键入的刊名全称转换为MEDLINE缩写后进行检索。
如:在检索提问框中键入:“new england journal of medicine”,PubMed将其转换为“N Engl J Med”后进行检索。
1.3 著者索引(Author Index)
如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1-2个字母的短语,PubMed 即会自动查找著者索引。
<BR>如果仍然查不到相匹配的词,PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到为止。
假如仍然不能找到匹配的词,系统将把各单词用“and”连接,在全部字段中进行查找。
要查看词汇的转换情况,可点击“Details”进行查看。
2 截词检索功能
PubMed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。
如:键入“flavor*”,系统会找到那些前一部分是flavor 的单词(如flavored, flavorful, flavoring等),并对其分别进行检索。
如果这类词少于600个,PubMed会逐个词检索,若超过600个(如:ca*),PubMed将显示警告信息,要求增加词汇的开头字母数量。
截词功能只限于单词,对词组无效。
如:“infection*”包括“infections”,但不包括“infection control”等。
注意:使用截词检索功能时,PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。
3 强制检索功能
如上所述,在PubMed主页的检索提问框中键入一个短语后点击“Go”,系统会用自动转换功能查找到相应的匹配词后再进行检索;但是,当键入的词语无匹配词时,PubMed就会将键入的词语断开后再重复上述自动词汇转换过程,若仍然没有匹配词,系统就将短语分解成单词,再用AND联在一起在全部字段中检索。
很明显,这样检索的结果是不符合用户要求的。
因此,PubMed允许使用双引号(“”)来强制系统进行短语检索。
例如,在PubMed主页的检索提问框中键入“Single cell”,并用双引号引起来,然后点击“Go”,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。
<BR>使用双引号检索,会自动关闭词汇转换功能。