用于并行SPM的图像合成技术研究
磁共振实验数据SPM8处理流程
磁共振实验数据SPM8处理流程磁共振实验数据的处理流程主要包括原始数据预处理、功能图像处理和统计分析三个步骤。
其中,SPM8是一款常用的功能磁共振成像软件,可以用于实现磁共振实验数据的处理与分析。
以下是磁共振实验数据SPM8处理流程的详细步骤:1.原始数据预处理:(1)数据导入:将原始数据导入SPM8软件,通常数据的格式为DICOM 或NIfTI格式。
(2)切片时间校正:根据数据采集过程中的切片顺序和时间信息,对数据进行切片时间校正,以获得各个时间点上的切片数据。
(3)运动校正:校正数据中由于受试者运动引起的图像运动,通常使用刚体变换或流形形变方法进行运动校正,以消除不同时间点之间的运动偏移。
(4)标准空间转换:将运动校正后的数据转换到参考空间中,通常使用统一分割方法,将每个受试者的数据映射到一个标准的空间模板上。
(5)降噪处理:对数据进行降噪处理,一般使用高斯平滑方法,平滑数据以减小噪声干扰。
2.功能图像处理:(1)激活检测:通过对原始数据进行激活检测,识别可能激活区域。
常用的方法包括广义线性模型(GLM)和独立成分分析(ICA)等。
(2) 功能图像标准化:将激活检测得到的功能图像进行标准化处理,以便进行后续的统计分析。
常用的方法包括z-score标准化和百分位标准化等。
(4)时间序列提取:从功能图像中提取感兴趣脑区的时间序列数据,以便进行统计分析。
3.统计分析:(1)组间比较:使用统计学方法对不同组别的数据进行比较,常用的方法包括单样本t检验、双样本t检验和方差分析等,可以得到激活区域和激活程度的差异信息。
(2) 相关性分析:分析不同脑区之间的功能连接关系,通常使用Pearson相关系数或互信息等方法进行分析。
(3)多变量分析:使用多变量模式识别方法(如支持向量机、随机森林等)对脑图像数据进行分类或预测,以探索脑区之间的潜在模式。
以上是磁共振实验数据SPM8处理流程的主要步骤,这些步骤将原始数据进行预处理,提取功能图像,以及进行统计分析,从而得出与研究目的相关的结论。
基于SPM的功能磁共振成像图像头动校正配准方法的分析与改进
医 学 影 像 工 程 学 Me d i c a l I ma g i n g E n g i n e e r i n g
・ 7 8 0・ 中国医学影像学杂志
C h i n e s e J o u r n a l o f Me d i c a l I ma g i n g
c omp u t e r - a s s i s t e d ;S PM ; Re a l i g n me n t
功能磁共振成像 ( f u n c t i o n a l ma g n e t i c r e s o n a n c e
基于SPM的脑功能磁共振图像头动校正算法研究
究 ;JunyaFujino 等 将 经 济 学 工 具 与 fMRI技 术 结 合起 来 ,评 估 旋 转 的组 合 。然 而 由于 每 幅 图像 默 认 的 体 素 坐 标 并 不相 同 ,可
出精 神 分 裂 患 者 的模 糊 规 避 行 为 。第 二 类 是 对 fMRI数 据 处 使 所 有 体 素坐 标 转 换 到 统 一 的三 维 笛 卡 尔 坐标 系 ,得两点的距离在变换过程前
实 验 方法 和应 用 方 面 的 研 究 ,在 动 物 和 人 体 上 有着 广 泛 的 应 后 没 有 发 生 改 变 ,比如 平 移 、旋 转 、镜 像 或 者 其 组 合 的运 动 ,实
用 :Guilherm e…等 利 用 BOLD fMRI对 小 鼠 的听 觉 通 路 进 行 研 验 过 程 中头 部 的运 动 即 可 看 成 是 头 部在 三 维 坐 标 中 的 平 移 和
F=M,M G
(1)
据 预 处 理 (时 间层 校 正 ,头 动 校 正 ,配 准 与 标 准 化 ,空 间 平 滑 处
其 中M 、M 分别为刚体变换模 型的平移和旋转变换矩 阵。
理 )、数 据 研 究 分 析 (大 脑激 活 区 显示 、连 接 强 度 分 析 )。其 中在 则在默认体素坐标下即可得出资源 图像 g与靶 图像 f的变换
在 刚体 变 换 模 型 中 ,其 6个 自由度 向量正=( a2.% , 岛),
理方法的研究:Nathan0 等提 出一种 新的预处理统计算法,主要 阵 为 。在 统 一 的笛 卡 尔 坐 标 中 ,由 刚体 变 换 模 型 的变 换 矩 阵
针 对 于 年 纪 偏 大 人 群 的脑 功 能 成 像 。
得 资 源 图像 G 与 靶 图像 F的变 换 关 系 为 :
SPM及其应用共29页
100080 北京中关村北一街二号 Tel:(8610)62615063
510700 广州先烈中路80号汇华大厦1910 Tel:(8620)37618250
SPM的独特优点
• 原子级高分辨率。如STM在平行和垂直于样品表面方向的分辨率分别可达0.1nm和0.01nm, 即可以分材料,将电压转变为位移,控制探针在纳米级的距离上对被测样品的 表面进行扫描,同时记录扫描过程中探针和样品的相互作用,从而得到样品的 表面信息。
中科院化学所本原纳米仪器公司 spm E-mail:
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SPM 的应用:
DNA的三链结构 STM Images of DNA
白春礼, 叶坚等, 科学通报, 35(24),1841(1990)
C.Bai, J.Ye, et al.,
Chinese Science Bulletin,
36(4),345(1991)
本原仪器结果
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SPM 的应用:
辉钼矿(0001)面的STM象 廖立兵, 施倪承, 马哲生等, 科学通报,36(8),606(1991) Liao Libing, Shi Nicheng, Ma Zhesheng et al., Chinese Science Bulletin, 36(23), 1989(1991) 本原仪器结果
扫描探针显微技术(spm)
SPM在生物医学领域的应用将进一步 拓展,如细胞形态学、生物分子结构 和功能研究等。
实现多模式、多功能集成
多模式集成
将多种SPM模式(如隧道电流、力曲线、扫 描隧道谱等)集成在同一台仪器上,实现更 全面的分析。
多功能集成
将SPM与其他分析技术(如光谱学、质谱学 等)集成,实现更全面的材料和生物样品分
在生物学中的应用
细胞形态学研究
利用SPM技术可以观察细胞表面形态和微观结构,研究细胞生长、 发育和疾病发生机制。
生物分子相互作用
SPM技术可以用于研究生物分子之间的相互作用,例如蛋白质与 DNA、蛋白质与蛋白质之间的相互作用。
生物传感器
利用SPM技术可以制备高灵敏度的生物传感器,用于检测生物分子和 细胞活性。
03 SPM的工作模式
接触模式
总结词
在接触模式下,探针与样品表面直接 接触进行扫描。
详细描述
在接触模式下,探针的尖端与样品表面紧 密接触,通过探针的垂直运动来扫描样品 表面。这种模式可以提供高分辨率和高对 比度的图像,适用于硬质和脆性样品。
非接触模式
总结词
非接触模式中,探针与样品表面保持一 定距离,避免直接接触。
在表面科学中的应用
表面形貌分析
SPM技术可以对材料表面进行高精度的形貌分析,研究表面粗糙 度、晶面取向等特性。
表面化学分析
结合其他分析手段,SPM技术可以用于研究表面化学组成和元素 分布。
表面改性
通过SPM技术可以对材料表面进行改性,例如在金属表面形成硬 质涂层、在玻璃表面制备防雾涂层等。
05 SPM的未来发展
宾宁和罗雷尔因此获得 了诺贝尔物理学奖。
原子力显微镜(AFM) 问世,由IBM苏黎世研究 实验室的伊瓦尔·冈萨雷 斯(Ivar Giaever)发明。
航拍图像自动拼接并行化算法的研究与实现的开题报告
航拍图像自动拼接并行化算法的研究与实现的开题报告一、研究背景随着无人机技术的快速发展,航拍图像已经成为获取高分辨率地图的重要手段。
但是,由于航拍图像的数量庞大、分辨率高、数据量大,因此需要进行图像自动拼接处理才能得到完整的拍摄区域地图。
在传统的图像拼接算法中,通常采用特征点匹配、投影变换和图像融合等步骤,但这些算法存在计算量大、处理时间长、运行效率低等问题。
因此,如何实现快速有效的航拍图像自动拼接已经成为研究的热点之一。
二、研究目的本文旨在通过研究航拍图像自动拼接并行化算法,实现快速高效的图像拼接处理,提高无人机航拍数据的处理效率和质量。
主要研究内容包括:基于多核CPU或GPU的并行计算模型设计,图像配准和拼接算法的优化,处理结果的评估等。
三、研究内容(一)并行计算模型设计:为了实现快速的航拍图像自动拼接,需要使用高效的并行计算模型,利用多核CPU或GPU等硬件资源提高处理效率。
本文将结合Hadoop平台和CUDA技术,设计并实现基于分布式计算和并行计算的图像拼接处理模型。
(二)算法优化:图像自动拼接过程中,需要进行图像预处理、特征点提取和配准、投影变换和图像融合等多个步骤。
本文将针对每个环节开展优化措施,如基于SIFT算法的特征点检测和匹配、基于RANSAC算法的异常值检测和剔除、基于CUDA的并行矩阵计算等。
(三)结果评估:本文将根据航拍图像数据集,利用均方误差、拼接效果和处理时间等多个指标,对所设计和实现的航拍图像自动拼接并行化算法进行评估和分析,并与传统的图像拼接算法进行对比。
四、研究方法本文采用实证研究方法,主要包括以下几个步骤:(一)数据采集:利用无人机对指定地区进行航拍,获取高分辨率航拍图像数据集。
(二)算法设计:基于并行计算模型,设计航拍图像自动拼接并行化算法。
(三)算法实现:利用Hadoop平台和CUDA技术,实现所设计的算法,并对算法进行优化。
(四)结果评估:根据图像拼接的效果、处理时间、算法精度等指标,对所实现的算法进行评估和比较。
《SPM及其应用》课件
SPM是目前最先进最实用的神经影像学数据分析 方法之一,其应用前景广阔,值得我们深入研究 和探讨。
SPM在医学影像学中的应用,可以帮助医生诊断和监测病情,促进精准医疗的发展。
SPM的优点
1 统计分析
通过多种统计方法对数 据进行建模和分析,提 高了结果的可靠性和准 确性。
2 灵活性
SPM支持各种不同的数 据分析模式,可以根据 研究问题的不同进行定 制。
3 全脑分析
SPM可以对全脑的功能 影像数据进行分析,探 索全脑活动与各个方面 的关系。
具体案例分析
通过具体案例,展示SPM数据处理的 流程和分析结果,并探讨数据分析方 法的一些注意事项。
SPM的应用
在神经科学领域
SPM应用于大脑功能成像、脑网络分析等领域,成为了研究神经科学的重要工具。
在心理学领域
SPM的应用帮助研究人员研究记忆、情感等心理学问题,为心理学理论提供了实验数据支持。
在医学领域
《SPM及其应用》PPT课 件
探索神经科学前沿——SPM及其应用
什么是SPM?
定义
SPM是一统计学参数映射方法,用于分析神经影像学数据。
起源和发展
SPM起源于20世纪90年代,目前已是神经科学领域最常用的数据分析方法之一。
SPM的基本原理
工作原理
SPM基于统计参数推断,通过计算神经影像学数 据与特定模型的拟合程度来进行分析。
使用的方法和技术
SPM使用多种方法和技术,如高斯滤波、线性回 归分析等,来实现数据处理和分析。
SPM的数据处理流程
1
分析数据的步骤
2
处理好的数据会接受多组统计参数推
断,得到不同脑区、不同时间点的统
计结果,形成3D或4D的分析图像。
【国家自然科学基金】_扫描探针显微镜(spm)_基金支持热词逐年推荐_【万方软件创新助手】_20140730
2012年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21
科研热词 推荐指数 扫描探针显微镜 3 磁控溅射 2 饱和场 1 钨探针 1 跳跃探针式离子电导显微镜 1 苯乙烯-丁二烯-苯乙烯嵌段共聚物1 结合橡胶 1 纳米生物学 1 磁记录 1 磁性 1 矫顽力 1 炭黑 1 扫描离子电导显微镜 1 微观结构 1 微结构 1 定位控制 1 多层膜 1 pvdf振动梁 1 l10织构 1 fept薄膜 1 co/cu 1
推荐指数 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
2010年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32
科研热词 扫描离子电导显微镜 扫描探针显微镜 静电吸附 锁相环路 金纳米颗粒 边缘提取 超声波 评述 组装 纳米尺度振动 纳米医学 神经细胞 磁控溅射 石墨烯 矫顽力 相关法 相位反馈控制 氧化还原法 氧化石墨 微探针 应用 并行扫描探针显微镜 外差干涉 图像平滑 图像合成 原理 压电微音叉 共振频率 光学测量 云母基底 hummers法 ag/fe/ag
推荐指数 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
2011年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24
2011年 科研热词 扫描探针显微镜 迭代学习控制 迟滞 过硫酸铵 自旋 结合胶 织构 纳米操作系统 纳米操作方法 磁控溅射 磁性 磁共振成像 磁共振力显微镜 研究现状 湿法各向异性腐蚀 扫描力显微术 异丙醇 多壁碳纳米管 压电驱动器 关键技术 二自由度(2dof)控制 tmah fept合金 (110)硅 推荐指数 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
一种并行绘制中进行图像合成的方法[发明专利]
专利名称:一种并行绘制中进行图像合成的方法专利类型:发明专利
发明人:毕重科,潘沛儒,侯敏,邓亮,王昉,王岳青申请号:CN202010766968.0
申请日:20200803
公开号:CN112116683A
公开日:
20201222
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明公开了一种并行绘制中关于图像合成的方法,包括:根据不同图像分辨率进行实验得出最优分组(m,k)表;根据最优分组(m,k)表对多个节点进行最优分组;在组内通过m叉树进行图像合成;组间之间通过BinaryTree方式合成最终图像;本发明中提到的图像合成mSwap方法对现有的图像合成策略进行优化结合,根据现有的图像和(m,k)表对各个节点进行分组并找出各个节点最佳处理情况,充分利用了每个节点的性能,在一定程度上提高了各个节点的利用率;在最后,采用Binary Tree方式进行合成最终图像,避免了图像采集的过程;mSwap图像合成策略不但可以减少通信成本,并且也更加适用于大规模图像合成。
申请人:天津大学
地址:300072 天津市南开区卫津路92号
国籍:CN
代理机构:天津市北洋有限责任专利代理事务所
代理人:韩帅
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一种基于SMPL模型的人体图像合成方法及系统[发明专利]
专利名称:一种基于SMPL模型的人体图像合成方法及系统专利类型:发明专利
发明人:周余,陈菲,于耀,都思丹
申请号:CN202010418445.7
申请日:20200518
公开号:CN111462274A
公开日:
20200728
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明涉及一种基于SMPL模型的人体图像合成方法及系统。
该方法包括:获取训练好的人体图像合成网络;人体图像合成网络包括SMPL模型、外表编码网络、全连接网络和解码网络;人体图像合成网络中包括待合成人物的外表参数;获取待合成图像;调整SMPL模型中的SMPL参数,生成待合成人物的uv图;利用外表编码网络得到当前人体的外表编码;根据人体的外表编码,利用全连接网络得到待合成人物的外表特征图;外表特征图与uv图大小一致;根据外表特征图和uv图,利用解码网络得到前景人体合成图像和二值掩膜;根据二值掩膜,将背景图像和前景人体合成图像相加,得到待合成图像对应的人体合成图像。
本发明可以提高人体图像合成的准确度。
申请人:南京大学
地址:210046 江苏省南京市栖霞区仙林大道163号
国籍:CN
代理机构:北京高沃律师事务所
代理人:杜阳阳
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spm计算机控制系统的研制
华中师范大学硕士学位论文SPM计算机控制系统的研制姓名:***申请学位级别:硕士专业:凝聚态物理指导教师:***2000.6.1Z357D2SPM计算机控制系统的研制摘要以扫描隧道显微镜(STM)和原子力显微镜(AFM)为代表的扫描探针显微镜作为一类新型表面分析与纳米加工工具在物理、化学、生物、材料领域的应用越来越受到人们的重视。
本论文首先详细地讨论了SPM硬件控制系统的结构及其工作原理,完成了前置放大器电路、模数转换器电路、数模转换器电路、逻辑控制电路、步进电机及继电器控制电路等电路的设计、制作及调试,对数字信号处理器(DSP)技术在SPM中的应用进行了探讨。
然后详细地讨论基于Windows9x基础上的SPM多线程软件控制系统的组织体系结构,并用MicrosoftVisualC++6.0编写并调试了!呈M圈篮童盛与存储程序、SPM扫描参数设置程序、SPM纳米参数设置及加工程序、AFM光斑位置监视程序、扫描探针进针程序以及扫描控制程序等。
同时利用上述SPM计算机控制软硬件系统成功地进行了原子成像和大范围的扫描成像,探讨了STM隧道针尖的制作及SPM标定方法,实验观测了针尖长度、探针扫描方向等对扫描图像的影响,此外还探讨了SPM图像的离线处理方法。
TheresearchofSPMcomputercontrolsystemAbstractandnanofabrication,scanningBeinganewtypeofmicroscopeforanalysesprobemicroscopes(SPM)suchasscanningtunnelingmicroscope(STM)andatomforcemicroscope(AFM)aremoreandmorewidelyusedinsuchfieldsasPhysics,Chemistry,Biology,MaterialsScienceandsoon.ThepaperfirstdiscussedtheframeworkandgeneralprincipleofSPMhardwarecontrolsystem.vl—o∞controlcircuitssuchaspreamplifier,analogtodigitalconverter,digitaltoanalogconverter,logiccontroller,stepmotorandpeckercontrolleretc.aredesignedandcarefullyadjusted.ThenthepaperdiscussedtheschemaoftheSPMmulti.threadsoftwarecontrolsystemforWindows9x.UsingMicrosoftVisualC++6.0suchcontrolprogramsformultiplepseudo-colorimagedisplayandstorages,settingofparametersofscanning,settingofparametersofnaglofabrication,monitoringofthepositionof’faculaofAFM,tipapproaching,scanningcontrollingwerecomposed.UnderthecontrolofaboveSPMcomputercontrolsystem,suchsamplesashiglllyorientedpyrolyticgraphitewasscanned,revealingatomicandnanoscalefeatures.TheinfluenceofscanningdirectiononSPMimageandtheinfluenceofthelengthoftiponSPMscanningareaWereinvestigatedandtheiroriginswerediscussed.Inaddition.methodsforSPMimageofflineprocessingwerediscussed.!!竺竺兰!苎!塑生兰型兰!!苎查竺翌主竺兰竺苎第一章绪论§1.1SPM发展的历史回顾扫描隧道显微镜(ScanningTunnelingMicroscope,STM)是由IBM苏黎世实验室的GerdBinning和HeinrichRohrer1982年发明的一种新型表面分析仪器。
SPM针尖制备技术研究及应用
SPM针尖制备技术研究及应用随着纳米科技的发展,扫描探针显微镜(Scanning Probe Microscopy)技术因其直接反应样品表面形貌、粘弹性、摩擦力、吸附力和电磁场分布等信息的优势已经成为纳米测量强有力的手段。
探针作为SPM的核心部件,直接影响着样品成像质量及研究成果,批量制备重复率高、大长-径比的纳米级探针仍是国内外学者研究的热点,大长-径探针使SPM测量出深沟槽以及近似铅垂侧面样品的真实形貌成为可能,因此课题组展开了对扫描探针显微镜探针制备技术的研究。
论文设计并搭建了基于电化学腐蚀法制备探针的完整系统,系统机械装置可保证探针制备过程中的稳定性,避免电极的微动和电解液面的波动对探针形成质量的影响。
运用步进精度为50nm的电机控制探针的提拉和给进深度。
腐蚀电路比较了基于电平比较法与反馈控制法在探针形成瞬间的断电时间和曲率半径,最终确定采用反馈控制技术在几百纳秒内切断腐蚀电路,保护探针针尖的原子不被再腐蚀。
软件控制完成腐蚀电流信号的采集,采用VB编写上位机控制界面,实现了探针制备的自动化控制,减少了人为误差对理论分析和实验结果的影响。
机械装置与控制系统的高效结合保证了探针制备的成功率和稳定性。
在电化学腐蚀探针机理的研究基础上,解决了电解过程中腐蚀工艺的难点,经过大量实验分析了断电时间、电解电压、电解液浓度、浸没深度对探针针尖的曲率半径、长-径比、形貌的影响,最终得到静态电化学腐蚀的最佳腐蚀参数为电解液浓度1.5mol/L、电解电压12V、浸没深度0.4mm。
通过对各控制参数的不断优化与分析,最终成功制备出重复率达91.2%、曲率半径小于5nm、长-径比达50k:1的理想型指数轮廓的SPM钨探针。
将静态腐蚀与动态腐蚀法结合,制备出了多直径探针和可控圆锥形探针,使深沟道样品的测量成为可能,也可与电火花等技术结合,展开纳米操作和生物细胞等领域的研究,自制的多形貌探针拓宽了SPM探针的应用领域。
SPM软件包数据处理原理简介_第二部分_应用于PET及fMRI
[3] Hartigan JA.Clustering Alg orithm [M].New Y ork :W iley Press ,1975.1132129.[4] T alairach J ,T ournoux P.C oplanar S tereotaxic Atlas of the Human Brain[M].S tuttgart :Thieme M edical ,1988.[5] Hu ZH ,Wu YG,Chen FY,et al.AD RAT m odel applied in fMRI[J ].Acta Psychologica S inica ,2002,34(Suppl ):94295.胡正珲,吴义根,陈飞燕,等。
AD RAT 模型的fMRI 研究[J ].心理学报,2002,34(增刊):94295.[6] DeG root MH.Probability and S tatistics [M ].Chicag o :Addis on 2W esleyInc ,1975.B asic principle of SPM :an introduction-P art Ⅱ:applications to PET and fMRIWU Yi 2gen ,LI K e(K ey Laboratory o f Nuclear Analysis Techniques ,Institute o f High Energy Physics ,Chinese Academy o f Sciences ,Beijing 100039,China )[Abstract] The basic mathematic principle of the SP M was introduced in the first part of this essay.Then s ome useful application m odels in the PET and fMRI data set were em phasized in the second part of the paper.[K ey w ords] SP M;T om ography ,emission 2com puted ;Functional magnetic res onance imagingSPM 软件包数据处理原理简介———第二部分:应用于PET 及fMRI吴义根,李 可(中国科学院高能物理研究所核分析技术重点实验室,北京 100039)[摘 要] 在本文第一部分介绍了SP M 软件包对数据进行预处理的基本数学原理后,此第二部分将重点介绍它在PET 和fMRI 数据处理中的一些具体应用模型。
SPM简介
引言SPM(statistical parametric mapping)一个通用软件包。
它的理论和思想最初是由英国的Karl Friston在1991年提出的,当时是为了处理PET功能成像数据。
到了1994年Karl Friston推出SPM的第一个正式版SPM 94,后来的SPM 95(从这个版本开始能够对fMRI数据做处理)、SPM 96,一直到现在的SPM 99都是在SPM 94的基础上加入新的算法和理论开发出来的。
它的主要目的是对被试间或者被试内的不同成像结果作比较,得出一个具有统计学意义的结果,SPM处理过程中的每一步都是为了实现这个目的。
SPM指的是统计参数图像,也就是这个软件的最终输出。
它对所有成像数据的每一个像素点都分别计算,得出包含有每个像素点参数值的图像,这个参数图像是许多单次扫描图像所包含信息的精简和压缩。
这样有利于我们读取和理解。
它的主要贡献是解决了不同图像数据间的比较问题,给出了具有统计学意义的结果对大多数的成像技术(比如fMRI,PET,EEG 等)所得的数据,我们都会遇到两个关键的问题,第一是不知道应该用什么统计模型来处理分析。
这是因为我们不知道所采集数据的分布形式,再加上这些技术的空间分辨率不够高,使得每个体素都包含了周围组织的信息,数据预处理过程中的对齐,又使得每个体素和周围的体素产生了更大的关联。
由于这些原因,我们就不能用普通的统计分布模型(比如泊松分布,高斯分布等)来处理这些数据。
第二个问题是,由于体素之间的关联性,我们在做多组图像数据的比较时,有必要对结果做矫正。
传统的方法是Bonferroni矫正,由于Bonferroni矫正主要应用于互不关联数据的统计计算,现在把它用到脑功能成像数据的处理当中,就会使得所输出的结果非常保守,在统计参数图像上几乎得不到明显的激活区。
SPM给出了一种行之有效的统计方法———随机高斯场(random gaussian field),利用这个理论就能对不同的图像数据做统计学上的比较,其具体的应用就是对图像数据做高斯平滑滤波。
在SPM的基础上分析PET图像
15
构成功能网络
2008
16
功能网络的分析
2008 • 规则网络 • 随机网络 • 小世界网络
17
功能网络的分析(续)
2008 • 局部连接效率 • 全局连接效率
18
功能网络的分析(续)
2008 • 规则网络的局部连接效率高 • 随机网络的全局连接效率高 • 小世界网络兼顾两者的特性 • 脑功能
Precentral Rectus
Frontal_Sup Frontal_Sup_Orb
脑区 Frontal_Inf_Tri Frontal_Inf_Orb
Insula Cingulum_Ant Frontal_Inf_Oper Cingulum_Mid Postcentral Cingulum_Post Hippocampus
• 事件实际上就是外加刺激 • 刺激能否使脑功能信号的变化能否超过脑部自发活
动是关键
3
事件相关的过程
2008
4
事件相关的模型(续)
2008
• 线性回归
• 卷积(视大脑为黑箱)
• 状态空间
0 b12 b13
yt1 yt2 yt3 yt1 yt2 yt3 0 0
Frontal_Mid Frontal_Mid_Orb
Lingual Occipital_Sup Occipital_Mid Occipital_Inf
Fusiform
Rolandic_Oper Supp_Motor_Area
Olfactory Frontal_Sup_Medial
Frontal_Mid_Orb Temporal_Mid
7
对MRI的分析
2008 • 使用MRI,利用脑皮层厚度分析脑功能连接
SPM软件在功能磁共振图像处理与分析中的应用
SPM软件在功能磁共振图像处理与分析中的应用
吴琴;姜平;盛良驹;尉传社;钱坤喜
【期刊名称】《现代保健:医学创新研究》
【年(卷),期】2007(000)11X
【摘要】目的探讨如何应用统计参数映射(SPM)进行功能磁共振图像处理与分析的研究。
方法采用3.0T西门子磁共振机对正常人进行无意义图形的记忆编码的脑功能磁共振成像扫描,获得有关记忆的脑功能图像,应用SPM软件进行图像处理与分析研究。
结果通过SPM软件的分析获得理想的有关记忆的脑激活图,从而用来进行进一步的分析脑的记忆功能。
结论在进行脑功能磁共振图像处理与分析中,指出SPM软件应用的关键问题以及该技术还有待进一步研究之处。
【总页数】3页(P3-5)
【作者】吴琴;姜平;盛良驹;尉传社;钱坤喜
【作者单位】江苏大学流体中心生物医学工程,江苏镇江212013;江苏大学医学院【正文语种】中文
【中图分类】R445.2
【相关文献】
1.SPM软件在功能磁共振图像处理与分析中的应用 [J], 吴琴;姜平;盛良驹;尉传社;钱坤喜
2.True Type字体在图形图像处理软件中的应用分析 [J], 陈姉忆
3.SPM中的图像空间预处理技术及其在功能磁共振图像分析中的应用 [J], 雷震;胡德文
4.True Type字体在图形图像处理软件中的应用分析 [J], 万兵
5.基于综合评判的图像压缩软件在图像处理与分析教学中的应用 [J], 李新利;宋哲;黄从智;杨国田;刘禾
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图像处理技术在SPM系统中的应用
图像处理技术在SPM系统中的应用张津;李博;杨勇;张玉莉【期刊名称】《天津大学学报(英文版)》【年(卷),期】2001(007)003【摘要】Up to now the imported commercial scanning probe microscope(SPM) has not an automatic error correcting and reducing system.In this paper a software system is presented to solve this problem.This software system gives the average distance between the centers of mass of two adjacent atoms on the same horizontal line and its mean square root as well as the atom s shape and center of mass by filtering the measured image of a standard sample—highly oriented pyrolysis graphite(HOPG).This system forms the basis of SPM s automatic measurement error correcting.%目前,我国引进的一般商业性的SPM(扫描探针显微镜)中缺少误差的自动修正和改进系统.为了解决这一问题,研制了一软件系统,该系统可对标准样品——HOPG的测量图像进行滤波处理,求出原子的边缘和重心,以及原子重心的平均距离及其均方根误差,为实现SPM的测量误差的自动修正奠定基础.【总页数】5页(P202-206)【作者】张津;李博;杨勇;张玉莉【作者单位】天津理工学院计算机科学与工程系,;天津理工学院计算机科学与工程系,;天津大学精密仪器与光电子工程学院,;天津大学精密仪器与光电子工程学院,【正文语种】中文【中图分类】TP391.4因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
第一部分,SPM原理简介
第一部分,SPM原理简介一、 定义SPM包括多种成像模式,它们的共同特点是探针在样品表面扫面,同时针尖/样品相互作用力被记录。
两种基本形式1、STM2、AFMz两种主要模式:1.接触式AFM2.轻敲式AFM一、 其它形式的SPMz Lateral Force Microscopyz Magnetic Force Microscopyz Electric Force Microscopyz Surface Potential Microscopyz Force V olumez Piezorsponse Force Microscopyz Conductive AFMz Torsional Resonance Microscopy二、 STM原理及应用原理简介:应用量子力学中的隧穿效应。
它用一个半径很小的针尖探测被测样品表面,以金属针尖为一电极,被测固体表面为另一电极,当它们之间的距离小到1nm左右时,形成隧道结,电子可从一个电极通过量子隧穿效应穿过势垒到达另一电极,形成遂川电流。
在极间加很小偏压,即有净隧穿电流出现。
遂穿电流与两极的距离成指数关系,反馈原理是采用横流模式,当两极间距不同(电流不同),系统会调整Z轴的位置从而成高度像。
只能测试导电样品。
应用:z形貌像z STS(扫描隧道谱)三、 AFM原理及应用:AFM的反馈原理,是探针在样品表面扫描,针尖顶部原子的电子云压迫样品表面原子的电子云时,会产生微弱的排斥力,如:范德瓦尔斯力、静电力等,力随样品表面形貌的变化而变化。
同时针尖/样品相互作用力被记录,通过激光束探测针尖的位移,从而得到样品的形貌。
z接触式反馈原理:针尖与样品距离比较近,靠悬臂的偏折量反馈,扫描过程中要保持恒定的偏着量,当样品的表面高低变化时,悬臂的偏折量也会随之变化,要保证恒定的偏折量,就要改变Z轴的位置从而成高度像。
z轻敲式反馈原理:扫描过程中悬臂以一定的频率和振幅在振动,轻敲模式靠振幅反馈,扫描过程要保持恒定的振幅,当样品表面高低变化时,悬臂的振幅也会随之变化,要保证恒定的振幅,就要改变Z轴的位置从而成高度像。
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这些因素的影响。这样不但能够剔除被认为不相关 的信息 , 大幅度地减少数据量 , 而且保留了图像重要 的特征属 性, 为 后续拼 接时的 图像特 征识别 提供基 础。 SPM 扫描的样品多种多样 , 不同的样品会得到特 征各异的图像。不同特征的图像应选用不同的边缘 检测算法 , 否则可能引起有用信息的丢失。本系统提 供梯 度 法、Roberts 算 子、Sobe l算 子、Lap lac ia 算 子、 C anny 算子、 K irsch 算子、 Robinson 算子、 P rew itt算子和 Sobe l边缘细化等边缘提取方法, 以适应不同的图像特 征要求。
扫描探针显微镜 ( SPM ) 的原理是利用一端固定, 另一端装有针尖的弹性微 悬臂梁来检测样品表面形 貌或其他表面性质。该系统分辨 率高、 操作 简单, 被 广泛应用于材料研究、 缺陷分析、 成膜条件评价和质 量控制等诸多方面; 确立了微悬臂梁在样品表面性质 研究和微小探测领域的主导地位
[ 1]
研究
图像的拼接采用图像识别的方法来处理 , 其原理
现代制造工程 2010年第 9 期 同探针扫描同一区域得出 的图像存在整体亮度以及 局部细节信息的差异 , 如图 1 所示。 对于该问题 , 选择基于空间模板的像素匹配算法 即能解决寻找匹配特征的问题。匹配的算法有基于 绝对误差和函数 ( SAD) 的块匹配法、 改进的比值块匹 配法及最小差值法等
Abstrac t : A type o f i m ag ing syn thesis arithm etic for paralle l SP M was stud ied. T he scann ing i m ages character istics o fmu lti probe paralle l SP M w ere si m u la ted by si m p le probe A F M syste m. O n i m ag e process ing , m ed ia l filter and va rious edge detections we re integ ra ted into i m ag ing syste m in orde r to i m prove i m ag ing quality . Scanned pictures caught by adjacent probes w ere stitched by re lated coeffic ient ar ithm e tic w hich is si m p le on princ ip le and easy to ach ieve . I m ages w ere blended naturally by w eighting co m bi nation arithm etic . T his effic ient and h ighly accurate arithm etic is proven to satisfy the i m ag ing requ ire m ent . The si m ilarity be t w een m age after synthesis and o rig ina l i i m age can ach ieve to be 96% . K ey word s : para lle l SPM; i m ag ing smoo th ing ; edg e ex tracting; coeffic ient a rithm etic ; i m age syn thesis
Study on i m age synthesis techn ique AO Gang , L IU Yong, ZHANG Jin hong, CHU Jia ru ( Depart m ent o f P rec ision M ach in ery and P recisio n Instrum entation , U niversity o f Science and T echno lo gy of Ch in a , H efei 230027 , China)
[ 10]
1 图像模型
在多探针 SPM 并行扫描系统中 , 需将多根探针得 到的图像拼接以得到完整的样品形貌图。然而 , 为保 证扫描区域完整连续 , 相邻探针扫描得到的图像有重 叠 , 故应先寻找重叠区域 , 再进行拼接。由于样品的 倾斜、 微悬臂梁在制备时不可避免地存在差异等, 使 得相邻探针对相同区域扫 描得到的图像存在亮度及 细节上的差异。用单探针 AFM 系统模拟并行 SPM 扫 描图像的特征时 , 首先 , 由于并行 SPM 系统探针阵列 的长度相等 , 所以在 AFM 探针扫描样品不同区域时, 应保证探针每次扫描的起点位置在 Y 方向上一致 ( 见 图 1 ); 其次 , 并行 SPM 在同一次扫描 过程中, 每根探 针扫过的区域 大小 一致且 扫描点 数相同 , 故应 保证 AFM 每次扫描的样品区域大小和点数相同; 最后, 由 于并行 SPM 系统多探针弯曲程度可能不同 , 所以 AFM 在每次扫描前可以允许在探针工作距离范围内 , 在空 间 Z 方向上对探针的位置进行一定的调整。 单探针 AFM 模拟并行 SPM 相邻探针扫描的图像 如图 1 所示 , 图 1a 、 图 1b 两图有明显的重叠区域, 且 在 Y 方向位置保持一致, 图像的大小 相同, 符合并行 系统扫描成像特征。而且, 两图有一定程度的明暗差 异 , 对同一区域不同次扫描得出的图像也存在细节上 的差别, 完 全 模 仿 了 并 行 系 统 相 邻 探针 扫 描 成 像 的特点。
[ 3] [ 2]
以及 IBM 公
司于 20 世纪 90年代开始的基于探针阵列的数据存储
*
国家自然科学 基金资助项目 ( 50805137)
4
试验研究 该算法能够快速、 准确地将多幅相邻探针检测到的样 品局部形貌图拼接成一幅样品整体形貌图。
现代制造工程 2010 年第 9 期 为: 在每一根探针得到的图像重建之后 , 对可能重叠 的区域进行图像识别, 得到相同的特征后 , 再依据图 像处理技术进行拼接。该方法依靠软件, 可实现全自 动拼接。 对图像的拼接, 首先需要对图像进行预处理以消 除噪声 , 其次根据特征匹配方法进行图像合成 , 最后 对图像进行灰度平衡及融合, 实现图像的准确、 自然 拼接。下面分节叙述各个环节。 2 1 图像预处理 对于 SPM 成像系统 , 一般直接输 出扫描原始图 像。然而由于受到环境噪声等因素的影响, 图像质量 会恶化 , 成像 模糊, 特征被淹 没, 给 后续分析 带来困 难, 故在拼接前需要先对图像进行平滑处理 , 去除噪 声, 以改善图像质量并抽出对象特征。 本文采用 3 3 邻域五点中值滤波过滤图像中的 [ 9] 噪声 。中值滤波是一种非线性的信号处理方法 , 它 可以去除干扰但保留一定的图像清晰度, 且对滤除脉 冲干扰以及图像扫描噪声最为有效。 3 3 邻域五点 中值滤波的原理是取五个点的滑动窗口, 用窗口中各 点灰度值的中值来替代窗口中心点的灰度值
。 此
法既保持了 边缘的陡 峭又去掉 了干扰。图 1a 图像滤噪后效果 图如图 2 所示, 经过滤波后的图 像中, 尖峰 干扰已被去 除, 且边 缘特征也并未发生太大改变。 然而 , 平滑会不可避免地给
图 2 图 1a 图像滤 噪后效果图
图像带来轮廓模糊等不利因素 , 因此需要利 用边缘检 测来消除
。
目前常用的单 探针 SPM 检测 面积小, 扫描速度 低 , 检测效率也较低 , 不能完全满足现今微机电系统 ( MEM S) 发展对检测 范围以及效率 的要求。为提高 SPM 的检测效率、 扩大检测面积 , 多探针并行检测系 统是扫描探针显微镜发展的必然趋势 。 Saton 等人 研制的采用独立工作的两根 PZT 压电薄膜悬臂梁组 成的多探针原子力显微镜 ( AFM ) 系统
现代制造工程 2010年第 9 期
试验研究
用于并行 SPM 的图像合成技术研究
孔雯 , 赵钢 , 刘勇, 张晋弘 , 褚家如 ( 中国科学技术大学精密机械与精密仪器系, 合肥 230027)
*
摘要 : 介绍一种针对并行扫描探针显微镜系统的图像合成算法。利用单探针原子力 显微镜 ( AFM ) 系统 模拟多探 针扫描 探针显微镜 ( SP M ) 并行扫描的图 像特征。在图像处理上 , 将中值滤波器及各种边缘检测算法与 成像系统集成在一起 , 以 提高成像质量 ; 同时 , 依靠原理简 单并易于实现的标准化协方差相关法实现 相邻探针 扫描图像的 拼接 , 采用加权 合成算 法进行图像的自然融合。实验证明 , 该算法高效、 高 精度 , 合成后的 图像与原图 相似度达到 96% , 能够满足并 行 SP M系 统的成像要求。 关键词 : 并行扫描探针显微镜 ; 图 像平滑 ; 边缘提取 ; 相关法 ; 图像合成 中图分类号 : TN911 73 文献标识码 : A 文章编号 : 1671 3133( 2010) 09 0004 04
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试验研究 直接得到的图像 , 会由于亮度的差异产生图像灰度左 右不一致的情况, 使拼接的图像失真 , 故需对原始图 像平衡灰度, 以消除悬臂梁弯曲程度不一致对图像造 成的影响。 灰度平衡依靠以下方法来实现 : 对已寻找出的两 幅图像的 重叠区 域计算 两幅图 像平均 灰度 的差异。 利用所求得的灰度差值, 对于两幅图像的所有区域进 行灰度平均, 即可得到灰度一致的两幅图像, 如图 3所 示。该种方法简单易行, 适用性广。
, 然而这些算法较适用于重叠
区域相似度 很大且 不重叠 区域完 全不 相似的 图像。 本系统采用标准化协方差相关法 , 这种相关法能起到 突出特征变化的效果 , 使得相关系数矩阵呈明显的单 峰分布, 并且峰顶形状更尖锐, 更易找到相关度最大 的位置。具体实现原理为: 选取第一幅图像中的重叠 部分的一块矩形区域作为模板, 在第二幅图像中搜索 相似的对应块, 计算区域间的相关性, 通过比较相关 度确定匹配的位置。该种方法原理简单, 逻辑易于实 现 , 不但定出了目标的位置, 而且给出了目标的可信 度 , 因而更适用于 SP M 扫描成像系统。 相关性的主要指标参数为相关 系数 r, 其值总在 [- 1 , 1 ] 之间变化 , r 值越大代表所比较二者的相关度 越大。 r=