提取植物组织RNA的准备工作和操作规范

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提取RNA前的准备工作
1、提取RNA操作全程及配制RNA提取试剂必须穿实验服,戴口罩和一次性手套,触摸皮
肤(例如面部)、门把手及实验室其他未处理过RNase的普通物体表面后立即更换手套。

2、器具干烤:需要干烤的器具包括金属和玻璃制品,如研钵、钥匙、镊子、剪刀、试剂瓶
(200mL、500mL、1L)、量筒(50mL、100mL)、烧杯,即所有在配制RNA提取试剂过程中需要用到的玻璃器皿均需要干烤处理。

所有干烤的器具均用锡箔纸包住,如研钵、钥匙、镊子、剪刀和匀浆器,容器用锡箔纸封口,如试剂瓶、量筒和烧杯。

180℃干烤6h后放入RNA专用柜中备用。

3、DEPC水的处理:用于处理枪头、试剂瓶盖和离心管等塑料制品的0.1%的DEPC水可以在
烧杯中配制,磁力搅拌器上搅拌过夜,搅拌过程中用锡箔纸封口。

用于配制RNA提取试剂的DEPC水需要在干烤过的试剂瓶中配制,盖上瓶盖搅拌过夜后121℃灭菌20min。

4、枪头、离心管和试剂瓶盖用0.1%DEPC水过夜处理后用报纸包好高温灭菌,移液器必须
是专用的,用之前用DEPC处理的水配制的75%酒精擦拭整个移液器,特别是枪杆。

超净台的处理:用DEPC处理的水配制的75%酒精擦拭干净后,用氯仿快速擦拭,再用75%酒精擦拭,将提取所需的物品放入超净台,并用75%酒精擦拭,另放置一个废物缸,表面喷酒精,上述完成后,超净工作台紫外灯照射15-20min。

试剂配制过程中所用的枪头也必须是DEPC水处理过并高温灭菌的。

5、提取过程中用新开封的氯仿和异丙醇,用DEPC水处理过的15mL离心管分装,每管分
装10mL并于4℃保存,最后溶解RNA沉淀的DEPC处理过的水用处理过的1.5mL离心管分装并于-20℃保存。

6、用专用的电泳槽电泳RNA,用DEPC处理的水配制50×TAE缓冲液,每次电泳前用DEPC
处理的水配制1×TAE缓冲液进行电泳,电泳前用去污剂将电泳槽、制胶板和梳子清洗干净,DEPC水配制的75%乙醇擦拭,最后用DEPC处理的水冲洗干净。

提取植物组织RNA的操作步骤
1、将RNase-free的离心管用镊子在超净台中取出并加入1mL trizol置于冰上,将新鲜采集
的植物幼叶用烘烤过的研钵在液氮环境下快速研磨成粉末,此过程中用到的剪刀、钥匙和镊子均是经过烘烤处理的。

研磨速度要快,一个样品尽量在1min内研磨完全,必须在液氮或低温下进行,将粉末加入trizol中后迅速在震荡仪上振荡20s,室温下放置5min。

2、加入200μL的氯仿,盖紧离心管盖,用手剧烈震摇30s,室温放置10min。

3、12000rpm,4℃离心15min,此时溶液分为三层,上层的水相,中间的DNA沉淀和下层
的有机相,小心缓慢吸取上层水相至新的离心管中,上清可以不用吸干净,但是一定不要吸到中间层和下层。

吸取上清的时候换新的手套。

4、加入等体积的异丙醇颠倒混匀后室温放置10min,12000rpm,4℃离心10min。

5、小心地倒掉上清,用1mL 75%的乙醇洗涤沉淀。

洗涤的过程可以用手指轻弹离心管,尽
量将沉淀弹起,并上下颠倒,使整个离心管内部被充分洗涤。

6、12000rpm,4℃离心5min,重复洗涤一次,将上清液尽量吸干后室温干燥2-3min。

7、加入20-50μL DEPC处理的水溶解RNA沉淀。

8、用0.1%的琼脂糖凝胶电泳检测RNA的完整性,200V电泳10min。

9、RNA的保存:电泳检测时先将RNA溶液保存于-40℃,待电泳结束后根据实验需要决定
是否保存RNA,若需保存则将样品先用液氮速冻后用封口袋装好,于封口袋上标明日期和样品名称冻存于-80℃。

操作过程中的注意事项
1、研磨之前事先将研钵预冷,研磨过程中杵棒和研钵不要碰到其他未处理过RNase的物体。

在转移粉末至离心管中时速度一定要快,不能让粉末吸收空气中的水分而受潮,以防止被空气中的RNase降解。

2、在超净台中操作时每次需要用DEPC水配制的75%酒精擦拭手及新放入超净台中的物品,
操作过程中不能将皮肤任何地方暴露在超净台中。

3、吸取试剂时,枪杆不能插入试剂瓶中,慢吸慢打,吸取液体后的枪不能平放。

插好的枪
头若碰到了其他地方必须重新换枪头,用枪加样时必须悬空加,以免造成污染。

4、整个操作过程尽量快,操作过程中不能用手套、枪杆或其他物体碰到离心管口及内部,
以免造成污染。

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