基因组学和生物信息学

作业1：基因组学作业
（1）每人指定一篇论文或一个专题； （2）在NCBI、google、scopus、 scirus等查阅英文文献；在期刊网和 百度上查阅中文文献。 （3）翻译文献； （4）制作10分钟左右的ppt（15-20页） 在课堂上汇报。
作业2：生物信息学综合练习
每人选择一个基因，进行以下生物信息学分析： 搜索数据库（GenBank, Homologen；) 下载同源序列； 编辑成为fasta格式； 进行序列比对(CLUSTALX)； 计算序列之间的遗传距离(MEGA5)； 采用距离法、简约法和最大似然法构建系统树 (MEGA5) ； 分析蛋白质家族特征； 分析蛋白质结构特征。
Jonathan Pevsner著, 孙之荣主译，化学 工业出版社，2006; ￥95.00 2．T. A. Brown 基因组3, 科学出版社， 2009 3．探索基因组学、蛋白质组学和生物信息 学(第二版)，科学出版社，2007
基因组学作业
选择《基因组学和生物信息学》课程并需要
成绩的学生必需完成2个作业。每个作业50 分。 作业必须在12月底前用email发到 yuanh@snnu.edu.cn.
基因组学和生物信息学 Genomics and Bioinformatics
课程简介
本课程将介绍基因组学和生物信息学的 主要内容。教学内容以理论讲述和计算 机练习并重，旨在让学生了解基因组学 和生物信息学基本理论的基础上，初步 掌握2门学科的常用计算机技能和方法。
本课程主要以学ຫໍສະໝຸດ Baidu主动学习为主，教师课堂讲述为辅。主动学习包 括自学课件、查阅研究文献，进行专题综述，练习计算机实际操作 等。
自学内容
教材： （1）杨金水：《基因组学》（第二版） （2）李霞主编：生物信息学 课件： （1）复旦大学杨金水课件（提供） （2）李霞生物信息学课件（提供）
课堂学习主要内容
生物学数据库 基因组浏览器
序列比对
进化分析
序列注释
蛋白质特征分析 蛋白质结构分析
参考书
1．生物信息学与功能基因组学：