常见医学图像格式
DICOM医学影像文件格式解析
DICOM医学影像⽂件格式解析DICOM医学影像⽂件格式解析dicom协议中⽂⽂档可去csdn下载1.DICOMDICOM(DigitalImaging andCommunications inMedicine)是指医疗数字影像传输协定，是⽤于医学影像处理、储存、打印、传输的⼀组通⽤的标准协定。
它包含了⽂件格式的定义以及⽹络通信协议。
DICOM是以TCP/IP为基础的应⽤协定，并以TCP/IP联系各个系统。
两个能接受DICOM格式的医疗仪器间，可通过DICOM格式的⽂件，来接收与交换影像及病⼈资料。
⽬前，DICOM被⼴泛应⽤于放射医疗，⼼⾎管成像以及放射诊疗诊断设备（X射线，CT，核磁共振，超声等），并且在眼科和⽛科等其它医学领域得到越来越深⼊⼴泛的应⽤。
⽬前采⽤的标准是DICOM3.0，每⼀张图像中都携带着⼤量的信息，这些信息具体可以分为以下四类：（a）Patient（b）Study（c）Series（d）Image每⼀个DICOM Tag都是由两个⼗六进制数的组合来确定的，分别为Group和Element。
如(0010,0010)这个Tag表⽰的是Patient’s Name，它存储着这张DICOM图像的患者姓名。
2.DICOM存储格式DICOM⽂件的整体结构如下表所⽰，先是128字节的导⾔部分（没有实际信息），接着是四个字节组成的"DICM"字符串，然后是若⼲DataElement元素依次排列直⾄⽂件结束。
导⾔"DICM"DataElement DataElement...DataElement128 Byte 4 Byte n Byte n Byte n Byte2.1 DataElement的三种结构DataElement是存储⽂件信息的主体，DataElement的总体结构如下表所⽰：Tag VR（值表⽰法）Len(数据长度)数据值（内容）4 Byte 2 Byte 2 Byte Len ByteTag由2 Byte的组号（group）和2 Byte的元素号(element)组成，VR是DICOM特有的值表⽰法，关于值表⽰法的解释见下⽂按照VR的类型以及是否显⽰VR，DataElement⼜分为三种具体的结构。
医学影像格式
医学影像格式
医学影像格式主要有DICOM、NIFTI、PAR/REC、ANALYZE、NRRD和MINC这六种格式。
其中，DICOM和NIFTI是最常用的格式。
DICOM（医疗中的数字图像和通信）：是医疗影像中最常见的格式之一，一个DICOM文件包含了基本的病人信息以及图像信息。
DICOM是由美国国家电气制造商协会(NEMA)制定的标准。
NIFTI（神经影像学信息技术计划）：最初是为神经影像学发明的，其主要特点就是它包含两个能够将每个体素的索引(i,j,k)和它的空间位置(x,y,z)关联起来的仿射坐标。
此外，还有ANALYZE格式，其储存的每组数据包括两个文件，一个为头文件，扩展名为.hdr，包含图像的元数据；一个为数据文件，其扩展名为.img，包含二进制的图像资料。
这些医学影像格式为医疗影像的存储、传输和处理提供了标准化和便利。
tiff格式解析
tiff格式解析Tiff（Tagged Image File Format）格式是一种非常常见的图像文件格式之一，它使用了一种灵活的结构来存储图像数据，其最早的版本于1986年发布，现在已经成为了一个通用的标准格式。
Tiff格式适用于不同类型的图像，从简单的黑白图像到高质量的彩色图像。
下面我们将详细解析Tiff格式，包括它的特点、结构以及应用领域等。
Tiff格式具有以下几个显著的特点：1.多平台支持：Tiff格式是一种跨平台的图像格式，因此可以在不同操作系统中轻松使用。
它在Windows、Mac、Linux等系统上都可以被广泛地支持和使用。
2.高质量压缩：Tiff格式支持无损压缩和有损压缩两种方式。
无损压缩可以保留原始图像的质量，并减小文件大小，而有损压缩可以进一步缩小文件的大小，但会损失一定的图像质量。
3.支持多通道和多帧：Tiff格式支持多通道和多帧的图像数据，使其非常适用于存储多个版本的图像（例如，RGB图像、CMYK图像等）以及一系列的图像帧（例如，动画）。
4.控制色彩空间：Tiff格式提供了灵活的色彩空间控制功能，可以支持多种色彩模型（例如，RGB、CMYK等），同时还能够存储色彩配置文件和颜色表等信息。
Tiff格式的文件结构相对复杂，它由一系列的IFD（Image File Directory）块组成，每个IFD块都包含了图像的相关信息，例如图像的宽度、高度、色彩模式、压缩方式等。
在Tiff格式中，可以存在多个IFD块，每个IFD块之间通过指针来连接。
IFD块是由一个或多个条目（Entry）组成，每个条目包含了一个标签（Tag）、一个数据类型（Type）和一个值（Value）。
标签指示了条目表示的信息类型，数据类型指示了值的类型，例如整型、浮点型或者字符串型，而值则是具体的数值或字符串。
Tiff格式最常用的数据类型包括以下几种：1. BYTE：8位无符号字节2. ASCII：8位ASCII字符3. SHORT：16位无符号整数4. LONG：32位无符号整数5. RATIONAL：两个LONG类型的分数，用于表示有理数6. FLOAT：32位浮点数7. DOUBLE：64位浮点数Tiff格式的解析一般通过读取文件头部的信息来获取图像的基本属性，然后根据图像的尺寸和压缩方式等信息，解析图像数据部分。
医学图像格式转换及读取与显示
医学图像格式转换及读取与显示1.医学图像格式转换通常从机器拷贝出来的医学图像数据为DICOM格式，如果是多种模态图像混合，则需要使用Dcm2AsiszImg.exe工具把多模态图像分类出来，软件如下图所示：Dcm2AsiszImg 是一个接收、发送DICOM 图像、把DICOM 图像进行分类、把DICOM 转化为安科Img 图像格式的软件工具。
用法：“输出目录”选择待转化的图像保存路径，“DICOM图像分类”选择要转化的原始图像目录，最后点击“DICOM图像分类”，输出图像分辨率为256*256。
常用的图像格式还有ANALYZE和NIFTI，ANALYZE格式的图像包括图像文件.img 和头文件.hdr，应用于SPM2。
NIFTI把图像文件和头文件合并为.nii文件，应用于SPM8、FSL、FreeSurfer等。
可以利用MRICron软件的dcm2niigui.exe插件把DICOM格式转化为ANALYAZE 和NIFTI格式。
在Help下的preference处可设置输出参数：2.读取与显示DICOM图像Matlab提供了dicominfo、dicomdict、dicomdisp、dicomread、dicomuid 、dicomwrite 函数，可实现DICOM格式图像的读取、显示、保存等操作，以及查看扫描信息。
3.读取与显示NIFTI格式图像MRIcro软件可以显示NIFTI图像①NIfTI这个Matlab程序可以读取显示、保存、制作核磁共振图像。
具体如下：>> [hdr,filetype,fileprefix,machine] = load_nii_hdr('output.hdr');>> [img,hdr] = load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine);>> save_nii(nii, filename, [old_RGB]);②SPM方法：help spm_read_volsV = spm_vol_nifti('output.hdr')[Y,XYZ] = spm_read_vols(V);4.Freesurfer的mgh图像读取与显示Freesurfer安装目录下有一个matlab程序包，提供了load_mgh, save_mgh等函数实现该文件的读取与显示。
医学图像处理重点内容
第六节 图像的三维重建与可视化
1、掌握图像三维重建的基本方法： 面绘制技术 体绘制技术
第七节 图像存储与传输系统
1、掌握图像存储与传输系统的概念 2、了解与ＰＡＣＳ相关的几个医学信息系统
图像存储与传输系统（简称ＰＡＣＳ）是应用数字成像技 术、计算机技术和网络技术，对医学图像进行采集、 存储、传输、检索、显示、诊断、输出、管理、信息处理 的综合应用系统。 医院信息系统（ＨＩＳ）放射科信息系统（ＲＩＳ）
医学图像的配准与融合 虚拟现实技术
DICOM数据通信技术
PACS系统
医学图像处理的应用
1. 辅助医生诊断 2．仿真多角度扫描 3．数字解剖模型 4．手术教学训练 5．制定手术计划 6．手术导航与术中监护…
第二节 医学图像处理基础
1、掌握图像数字化的过程：采样和量化（分别 对图像质量的影响）
2、掌握常用的图像数据格式 3、掌握灰度直方图的概念及性质 4、掌握伪彩色与假彩色的概念 5、掌握常用的体数据文件的格式（DICOM3.0）
傅里叶变换的一个最大的问题是：它的参数 都是复数，在数据的描述上相当于实数的两倍， 不易计算。为此，我们希望有一种能够达到相同 功能但数据量又不大的变换。
在此期望下，产生了DCT变换。 DCT变换系数 是实数。
图像的低频能量集中在左上角，高频能量集中在右下角。
DCT变换在图像处理中的应用
离散余弦变换实际上是傅立叶变换的实数 部分。主要用于图像的压缩，如目前的国际压缩 标准的JPEG格式中就用到了DCT变换。对大多数 图像，离散余弦变换能将大多数的信息放到较少 的系数上去，提高编码效率。
描 述 人 体 功 能 或 代 谢 的 功 能 成 像 模 式 （ Functional Imaging Modality）。比如PET正电子发射断层扫描成像、 SPECT单光子发射断层扫描成像、fMRI功能磁共振成像等。
几种常见ECG数据格式及对比
⼏种常见ECG数据格式及对⽐SCP、DICOM、HL7aECG、GDF格式及对⽐本⽂档⾸先给出SCP、DICOM、HL7aECG、GDF四种⼼电信号格式的具体数据结构，然后分析其各⾃的特点及适⽤范围。
⼀、SCP-ECG format这种格式是专门针对ECG数据的标准格式，其中包含了ECG数据波形，患者信息，ECG采集信息以及测量诊断信息等丰富内容。
SCP-ECG格式主要分为Title(2 bytes for CRC-checksum and 4 bytes for size of ECG record)和Section0-Section11两部分。
其中Title,Section0,Section1是必须有的，其他部分则是可选的。
具体数据结构如下：Table 1. Structure of SCP-ECG records.Mandatory 2 bytes - checksum - crc -CCITT over the entire record(excluding this word)Mandatory 4 bytes - (unsigned) size of the entire ecg record (in bytes)Mandatory (Section 0)pointers to data-areas in the recordMandatory (Section 1)header information - patient data/ecg acquisition dataOptional (Section 2)huffman tables used in encoding of ecg data (if used)Optional (Section 3)ecg lead definitionOptional (Section 4)QRS locations (if reference beats are encoded)Optional (Section 5)encoded reference beat data if reference beats are storedOptional (Section 6)"residual signal" after reference beat subtraction if reference beats are stored, otherwise encoded rhythm dataOptional (Section 7)global measurementsOptional (Section 8)textual diagnosis from the "interpretive" deviceOptional (Section 9)manufacturer specific diagnostic and over-reading data from the "interpretive" deviceOptional (Section 10)lead measurement resultsOptional(Section 11)universal statement codes resulting from the interpretation 缺点：（1）只⽀持静态⼼电信息，不⽀持信号平均⼼电即晚电位信息，不⽀持动态⼼电信息(HOLTER)和运动⼼电信息(Exer- cise ECG)等；（2）仅仅⽀持RS232串⼝传输，使⽤⼆进制⽅式存储不利于⽹络传输的信息交换；（3）使⽤的复杂压缩算法难以进⾏实现和测试，也不能⽀持预约等其他⼯作流。
DICOM格式医学图像及其图像信息的显示
万方数据
万方数据
万方数据
．．１８８８．．
中国医学物理学杂志第２７卷第３期２０１０年５月
圈４图像的显示
隐４Ｔｈｅｄｉｓｐｌａｙｏｆｔｈｅｉｍａｇｅ
５总结
ＤＩＣＯＭ３．０作为医学图像存档和通信的国际标准，是所有医学影像技术的基础。
本文基于ＤＩＣＯＭ３．０
标准．对ＤＩＣＯＭ医学图像文件的格式及数据编码规
则进行了阐述，并进一步实现了ＤＩＣＯＭ图像及其图
像信息的计算机显示。
在此基础上，也为ＤＩＣＯＭ格
式医学图像的更广泛应用留下了空间。
例如这里通过
将ＤＩＣＯＭ格式转化为ＢＭＰ格式这样的转化，就可
以很方便地将虚拟人的ＣＴ和ＭＲＩ数据格式转换到
ＢＭＰ，从而方便下一步编程实现ＣＴ和ＭＲＩ的图像
配准嘲。
田５图像信息的显示
ｎ茚Ｔｈｅｄｉｓｐｍｙｏｆｔｈｅｈｌｌａｇｅｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ
参考文献：
【ｌ】梁存升，冯骥．ＤＩＣＯＭ标准分析及其应用叨．中国医学装备，２００６，１３（２），１８－２０．
【２】冯辉．ＤＩＣＯＭ二进制文件解读的ＶＣ＋＋实现叨．医学影像学杂志，２００３．１３ｆｆ）５３８．【３】曹玉磊．ＤＩＣＯＭ标准研究与图像处理工具的实现【Ｄ】．西安电子科技大学．２００７．１．
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【５】彭承琳，陈诚，陈园园．ＤＩＣＯＭ医学图像格式转化的ＶＣ＋＋实现田．重
庆大学学报。
２００７，３０（１０），１２６－１２９．万方数据。
tif格式
# TIF格式简介TIF（Tagged Image File Format）是一种支持多种图像数据格式的文件格式。
TIF文件使用了标签和封装结构，可以存储不同类型的数据，如位图、线条艺术和图像。
TIF格式最初于1986年由Aldus公司引入，后来由Adobe Systems维护和推广。
它是一种无损压缩的图像格式，被广泛用于各种行业和应用中。
TIF文件结构TIF文件由头部和图像数据两个主要部分组成。
TIF文件头部TIF文件头部是一个固定大小的结构，用于描述TIF文件的属性和图像结构。
它包含了一系列的标签（tags），用于存储相关的图像信息。
标签是TIF文件的核心概念，用于描述和解释图像数据。
标签由两个字节的标签标识符和四个字节的数据类型组成。
每个标签可以存储不同类型的数据，如整数、浮点数、字符串等。
标签标识符指定了标签的用途，数据类型指定了标签所存储数据的类型。
除了基本的图像属性外，TIF文件头部中的标签还可以存储图像色彩空间、颜色表、像素排列、压缩方式等信息。
图像数据TIF文件的图像数据部分存储了实际的像素信息。
图像数据可以采用不同的压缩方式，包括无压缩、LZW压缩、JPEG 压缩等。
无压缩方式保存图像数据的原始像素值，保证了图像质量的完整性，但文件大小较大。
LZW压缩方式通过使用字典编码来压缩图像数据，可以显著减小文件大小。
JPEG压缩方式则使用有损压缩算法，可以进一步减小文件大小，但会导致一定程度的图像质量损失。
TIF文件的应用TIF格式是一种开放的、跨平台的图像文件格式，广泛应用于数字摄影、印刷、出版、医学影像、GIS等领域。
由于TIF格式具有无损压缩、多标签和跨平台等特点，使得它成为了许多专业软件和设备的首选输出格式。
许多图像处理软件和操作系统都支持TIF格式的读写功能。
TIF格式也具有较好的兼容性和可扩展性。
它支持不同的图像色彩空间和多通道图像，可以存储HDR（High Dynamic Range）图像和大尺寸图像。
bmp的常见知识
bmp的常见知识BMP的常见知识一、BMP格式简介BMP（Bitmap）是一种无损的图像文件格式，它以像素点的颜色信息来描述图像。
BMP格式最早由Microsoft公司在Windows操作系统中使用，并得到了广泛的应用。
BMP格式的文件通常以".bmp"为后缀名。
二、BMP格式特点1. 色彩深度：BMP格式支持多种色彩深度，包括1位、4位、8位、16位、24位和32位。
色彩深度越高，图像的颜色表现能力就越强。
2. 像素点存储：BMP格式将每个像素点的颜色信息存储在文件中，每个像素点的颜色占用的字节数根据色彩深度而定。
3. 文件大小：由于BMP格式是无损压缩的，因此文件大小相对较大。
尤其是在图像分辨率较高、色彩深度较大的情况下，文件大小会更加庞大。
4. 支持透明色：BMP格式支持透明色的设置，使得图像可以在不同背景下进行显示。
三、BMP格式的优缺点1. 优点：- 图像质量高：BMP格式文件保存的是原始图像数据，不进行任何压缩，因此图像质量非常高，不会损失细节。
- 跨平台兼容性好：BMP格式是一种通用格式，在不同的操作系统和软件中都可以打开和编辑。
- 支持透明色：BMP格式支持透明色的设置，方便图像的叠加和合成。
2. 缺点：- 文件大小较大：由于BMP格式不进行任何压缩，文件大小相对较大，占用存储空间较多。
- 不支持动画和多帧图像：BMP格式只能保存单帧静态图像，不支持动画和多帧图像的存储。
四、BMP格式与其他图像格式的比较1. 与JPEG格式比较：- 图像质量：BMP格式保存的是原始图像数据，不会损失图像质量，而JPEG格式是有损压缩的，会损失一定的图像细节。
- 文件大小：BMP格式文件较大，而JPEG格式通过压缩可以显著减小文件大小。
- 应用场景：BMP格式适用于对图像质量要求较高的场景，如印刷、设计等；JPEG格式适用于在存储和传输过程中需要减小文件大小的场景，如网页、电子邮件等。
医学图像了解
医学图像了解医学图像医学图像是反映解剖区域内部结构或内部功能的图像，它是由⼀组图像元素——像素（2D）或⽴体像素（3D）组成的。
医学图像是由采样或重建产⽣的离散性图像表征，它能将数值映射到不同的空间位置上。
像素的数量是⽤来描述某⼀成像设备下的医学成像的，同时也是描述解剖及其功能细节的⼀种表达⽅式。
像素所表达的具体数值是由成像设备、成像协议、影像重建以及后期加⼯所决定的医学图像有四个关键成分——像素深度、光度表⽰、元数据和像素数据。
这些成分与图像⼤⼩和图像分辨率有关图像深度（⼜称⽐特深度或颜⾊深度）是⽤来编码每个像素信息的⽐特数。
⽐如说，⼀个8⽐特的光栅可以有256个从0到255数值不等的图图像深度像深度光度表⽰解释了像素数据如何以正确的图像格式（单⾊或彩⾊图⽚）显⽰。
为了说明像素数值中是否存在⾊彩信息，我们将引⼊“每像素采光度表⽰样数”的概念。
单⾊图像只有⼀个“每像素采样”，⽽且图像中没有⾊彩信息。
图像是依靠由⿊到⽩的灰阶来显⽰的，灰阶的数⽬很明显取决于⽤来储存样本的⽐特数。
在这⾥，灰阶数与像素深度是⼀致的。
医疗放射图像，⽐如CT图像和磁共振（MR）图像，是⼀个灰阶的“光度表⽰”。
⽽核医学图像，⽐如正电⼦发射断层图像（PET）和单光⼦发射断层图像（SPECT），通常都是以彩⾊映射或调⾊板来显⽰的元数据是⽤于描述图像的信息。
它可能看起来会⽐较奇怪，但是在任何⼀个⽂件格式中，除了像素数据之外，图像还有⼀些其他的相关信元数据息。
这样的图像信息被称为“元数据”，它通常以“数据头”的格式被储存在⽂件的开头，涵盖了图像矩阵维度、空间分辨率、像素深度和光度表⽰等信息像素数据是储存像素数值的位置。
根据数据类型的不同，像素数据使⽤数值显⽰所需的最⼩字节数，以整点或浮点数的格式储存像素数据图像⼤⼩ = 数据头⼤⼩（包括元数据） + ⾏数栏数像素深度（图像帧数）医学图像格式放射图像有6种主要的格式，分别为DICOM（医学数字成像和通讯）、NIFTI（神经影像信息技术）、PAR/REC（Philips磁共振扫描格式）、ANALYZE（Mayo医学成像）、NRRD（近原始栅格数据）和MNIC现代神经影像学技术脑电图（EEG），单光⼦发射体层成像（SPECT），正电⼦发射型计算机断层显像（PET），功能性磁共振成像（fMRI），侵⼊性光学成像（Invasive Optical Imaging），颅内电极记录（Intracranial Recording），脑⽪层电图（ECoG）。
医学课件目前我们常见的视频格式主要是两大类影像格式
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WMV： WMV有两种标准，这里说的 是WMV-HD格式，基于WMV9高 清编码，与其他几种封装格式相 比开放性稍差，但有微软的推广， 也不容小觑。号称能无损的还原 1080p信号，但对硬件的要求较 高，H.264文件的封装较为常见。
2018/9/6
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16
TS：
网络下载最流行的封装格式 之一，MPEG-2或者VC-1等编码 都可以封装，是蓝光和全高清视 频常采用的封装格式，体积较大， 但视频质量相仿优秀，还原准确。
2018/9/6
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6
在流媒体格式中同样还可以划分为几种：
1、RM格式：这是由Real Networks公司开 发的一种新型流式视频文件格式。 2、MOV格式：苹果公司的QuickTime能够 通过Internet提供实时的数字化信息流、 工作流与文件回放功能，为了适应这一网 络多媒体应用，QuickTime为多种流行的 浏览器软件提供了相应的QuickTime Viewer插件（Plug－in），能够在浏览器 中实现多媒体数据的实时回放。
2018/9/6
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5
流媒体就是应用流技术在网络上 传输的多媒体文件。 流技术就是把连续的影像和声音 信息经过压缩处理后放到网络服务器 上，让用户一边下载一边观看、收听 的网络传输技术。流式文件格式经过 特殊编码，适合在网络上边下载边播 放，常用的流式文件类型有 ASF、WMV 、RM、FLV等。
2018/9/6
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3
3、MPEG/MPG/DAT：MPEG也是Motion Picture Experts Group 的缩写。这类格 式包括了 MPEG-1, MPEG-2 和 MPEG-4在 内的多种视频格式。MPEG-1被广泛地应用 在 VCD 的制作和一些视频片段下载的网 络应用上面，大部分的 VCD 都是用 MPEG1 格式压缩的 ( 刻录软件自动将 MPEG1转为 .DAT格式 ) ，使用 MPEG-1 的压缩算法，可以把一部 120 分钟长的 电影压缩到 1.2 GB 左右大小。
DICOM医学图像文件格式
DICOM医学图像文件格式何斌金永杰何斌先生，清华大学硕士研究生; 金永杰先生，清华大学教授，博士生导师，中国电子学会核医学电子学专业委员会副主任委员。
关键词: DICOM PACS 数字医学影像系统为了提升医疗服务水准，跟随医学影像技术和网络技术的发展，我国众多医院都在大量配备各种数字影像设备，并开始建立医院管理信息系统(HIS)，开展远程医学试验。
他们对于图像存档和传输系统(PACS)的需求越来越紧迫，PACS的应用前景十分诱人。
然而，我国PACS的研究开发尚处于起步阶段，尽快自主开发适合我国国情的基于In-tranet的PACS是当务之急。
PACS必需解决的技术问题之一是统一各种数字化影像设备的图像数据格式和数据传输标准。
为此，诞生了新的医学数字成像及通信标准，即DICOM 3.0。
只要遵照这个标准就可以通过PACS沟通不同厂家生产的、不同种类的数字成像设备。
DICOM 3.0已经得到了世界上主要厂商的支持，新一代医学影像设备均以支持该标准作为基本特征，我国的医疗器械开发、生产部门都十分重视这个发展趋势。
DICOM 3.0标准极为庞大、复杂，本文将根据我们的开发经验，介绍如何制定符合DICOM 3.0标准的医学图像文件格式。
一 DICOM概述DICOM是Digital Imaging and Communications in Medicine的缩写，其字面含义很清楚，包括了医学的数字成像和通信两个方面。
DICOM标准是由美国放射学院(Ameri-can College of Radiology，ACR)和国家电气制造商协会(National Electrical Manufacturers Association，NEMA)共同制定的。
1. DICOM的发展过程20世纪70年代以来，计算机断层成像技术(CT)和其它数字成像技术飞速发展，很多厂商都研制了具有计算机的成像设备，制定了各自不同的图像格式。
tff 与tiff格式
TFF与TIFF格式1. 介绍TFF（Tagged Image File Format）和TIFF（Tagged Image File Format）是两种常见的图像文件格式。
它们都是用于存储和传输图像数据的文件格式，但在一些方面有所不同。
本文将详细介绍TFF和TIFF格式的特点、应用场景以及它们之间的区别。
2. TFF格式2.1 特点TFF格式是一种无损的位图图像文件格式，最初由Aldus公司开发，后来由Adobe系统继续维护。
TFF格式支持多种图像压缩算法，包括无压缩、LZW压缩和JPEG压缩等。
TFF格式还支持图像的透明度和分层信息，可以存储图像的元数据和颜色配置文件。
2.2 应用场景TFF格式广泛应用于打印、出版、图像编辑和图形设计等领域。
由于TFF格式支持多种压缩算法，可以在保证图像质量的同时减小文件大小，因此在网络传输和存储方面也有着广泛的应用。
2.3 TFF格式与其他格式的比较与JPEG格式相比，TFF格式是无损压缩的，不会导致图像质量的损失，适用于保存需要保持高质量的图像。
与PNG格式相比，TFF格式支持更多的颜色深度和透明度选项，适用于保存具有复杂颜色和透明效果的图像。
3. TIFF格式3.1 特点TIFF格式是一种无损的位图图像文件格式，由Adobe和Aldus共同开发。
TIFF格式支持多种图像压缩算法，包括无压缩、LZW压缩、JPEG压缩和PackBits压缩等。
TIFF格式还支持多页文档和多通道图像，可以存储图像的元数据和颜色配置文件。
3.2 应用场景TIFF格式广泛应用于打印、出版、医学影像、卫星图像和数字摄影等领域。
由于TIFF格式支持多种压缩算法和多页文档，可以在保证图像质量的同时减小文件大小，并且方便进行图像的组织和管理。
3.3 TIFF格式与其他格式的比较与JPEG格式相比，TIFF格式是无损压缩的，适用于保存需要保持高质量的图像。
与PNG格式相比，TIFF格式支持更多的颜色深度和透明度选项，适用于保存具有复杂颜色和透明效果的图像。
tif格式
TIF格式简介TIF（Tagged Image File Format）是一种常用的图像文件格式，由Adobe开发，用于存储图像和照片。
它是一种无损的图像压缩格式，支持多通道、多分辨率和多平面的图像。
TIF格式的文件通常使用扩展名.tif。
TIF文件采用一种灵活的标签结构，可以容纳多种数据类型和图像类型，包括灰度图像、彩色图像和透明图像。
它还支持元数据，可以存储图像的描述信息、作者、拍摄日期等，使得TIF文件非常适合在专业的图像处理和印刷领域使用。
特点无损压缩TIF格式使用无损压缩算法，可以保留图像的所有细节和精度，不会造成图像质量的损失。
这使得TIF格式非常适用于需要保留高质量图像的应用场景，比如印刷和出版领域。
多通道支持TIF格式支持多通道的图像，包括灰度图像、RGB彩色图像和CMYK彩色图像。
这使得TIF格式在处理多种图像类型时非常灵活，而且可以减少图像转换过程中的信息损失。
多分辨率支持TIF格式允许存储多个不同分辨率版本的图像，这对于需要在不同场景下使用不同分辨率的图像非常有用。
例如，在网络浏览时可以使用低分辨率版本的图像，而在印刷时可以使用高分辨率版本的图像。
元数据支持TIF格式支持元数据，可以存储与图像相关的信息，比如图像的描述、作者、拍摄日期等。
这些元数据可以被其他软件和系统读取和使用，方便图像的管理和搜索。
使用场景图像处理和编辑TIF格式是图像处理和编辑软件中常用的文件格式之一。
它可以保留图像的高质量，并且支持多种图像类型和通道，使得用户可以在处理和编辑过程中灵活地操作图像。
印刷和出版TIF格式在印刷和出版领域被广泛使用。
由于TIF格式的无损压缩特性和多通道支持，使得它成为了印刷品质图像的标准格式之一。
医学图像TIF格式也常用于存储医学图像，比如X光片、核磁共振图像等。
TIF格式的无损压缩和多通道支持可以确保医学图像的质量和准确性。
总结TIF格式是一种灵活、高质量的图像文件格式，具有无损压缩、多通道支持、多分辨率支持和元数据支持等特点。
ome-tiff格式
ome-tiff格式
OME-TIFF是一种用于存储生物医学图像数据的文件格式，它结
合了OME（Open Microscopy Environment）数据模型和TIFF （Tagged Image File Format）文件格式。
OME-TIFF的设计旨在克
服传统TIFF格式在存储大规模多维图像数据时的局限性，同时提供
对元数据和数据的丰富支持。
从技术角度来看，OME-TIFF格式使用TIFF作为基础文件格式，但添加了对元数据的丰富描述，这些描述包括图像采集设备、实验
条件、样本信息等。
这些元数据可以帮助科研人员更好地理解和分
析图像数据，同时也有利于数据的共享和再利用。
OME-TIFF格式还支持多维图像数据，这意味着可以存储包括时
间序列、Z轴堆叠、通道信息等在内的多个维度的图像数据。
这对
于生物医学图像数据来说是非常重要的，因为这些数据通常是多维的，例如在活细胞成像、组织切片成像等方面。
此外，OME-TIFF格式还提供了对大尺寸图像数据的支持，它采
用了基于文件的数据存储方式，允许对大型图像数据进行分块存储
和延迟加载，从而提高了数据的访问效率和处理能力。
总的来说，OME-TIFF格式通过结合OME数据模型和TIFF文件格式，为生物医学图像数据的存储和管理提供了一种强大的解决方案，它不仅支持丰富的元数据描述和多维图像数据，还能够应对大规模图像数据的存储和处理需求。
这使得OME-TIFF格式成为生物医学图像领域中备受青睐的文件格式之一。
labelme影像组学保存格式
一、labelme影像组学的介绍labelme影像组学是一种用于处理医学影像数据的开源工具，它能够对医学影像进行标注和分析。
labelme影像组学可以帮助医生和研究人员更好地理解和利用医学影像数据，从而提高诊断和治疗的准确性。
二、labelme影像组学的保存格式在使用labelme影像组学进行标注和分析时，需要将医学影像数据保存在特定的格式中，以便后续使用和处理。
下面将介绍一些常见的labelme影像组学保存格式。
1. JSON格式JSON是一种轻量级的数据交换格式，labelme影像组学通常将标注信息保存为JSON格式。
JSON格式具有易读性和易解析性，可以方便地在不同评台和系统之间进行数据交换和共享。
在labelme影像组学中，JSON格式通常包含医学影像的标注信息、标注区域的坐标和属性等内容。
2. PNG格式PNG是一种流行的无损压缩图像格式，labelme影像组学通常将标注后的医学影像保存为PNG格式。
PNG格式具有良好的图像质量和广泛的兼容性，可以保留医学影像的细节和清晰度，适合在不同设备上进行展示和分析。
3. XML格式XML是一种可扩展标记语言，labelme影像组学通常将医学影像的元数据和标注信息保存为XML格式。
XML格式具有良好的结构化特性和扩展性，可以方便地对医学影像数据进行组织和管理，适合在复杂的医学影像研究项目中使用。
4. NPY格式NPY是一种用于存储多维数组数据的专有格式，labelme影像组学通常将医学影像的像素数据保存为NPY格式。
NPY格式具有高效的数据存储和加载性能，可以在不损失数据精度的情况下有效地压缩医学影像数据，适合在大规模医学影像研究中使用。
三、labelme影像组学保存格式的选择在使用labelme影像组学进行医学影像数据的标注和分析时，需要根据具体的应用场景和需求选择合适的保存格式。
以下是一些选择保存格式的注意事项：1. 数据质量和精度要求：如果对医学影像数据的质量和精度要求较高，推荐使用PNG格式保存标注后的医学影像，以保留影像的清晰度和细节。
simpleitk读取格式 -回复
simpleitk读取格式-回复SimpleITK是一个在Python编程语言中使用的简单的图像处理工具包，它是基于医学影像处理工具包ITK（Insight Segmentation and Registration Toolkit）构建而成的。
SimpleITK为开发人员提供了一组简单而强大的工具，用于读取、处理和分析医学图像数据。
在本文中，将逐步介绍如何使用SimpleITK来读取不同格式的图像数据。
首先，要使用SimpleITK读取图像，我们需要将SimpleITK库导入到Python脚本中。
可以使用以下代码行完成这个步骤：import SimpleITK as sitk接下来，我们需要提供图像的文件路径。
在SimpleITK中，支持读取多种图像文件格式，例如DICOM、Nifti、JPEG、PNG等。
根据不同的格式，我们需要使用不同的函数来读取图像。
下面将介绍几种常见的图像文件格式，并给出相应的读取函数。
1. DICOM格式：DICOM（Digital Imaging and Communications in Medicine）是医学图像领域的常见文件格式。
SimpleITK提供了`sitk.ReadImage`函数来读取DICOM文件。
示例如下：pythonimage_path = "path_to_dicom_directory"image = sitk.ReadImage(image_path)2. Nifti格式：Nifti（Neuroimaging Informatics Technology Initiative）是一种常见的医学图像文件格式，用于存储三维和四维图像数据。
SimpleITK提供了`sitk.ReadImage`函数来读取Nifti文件。
示例如下：pythonimage_path = "path_to_nifti_file"image = sitk.ReadImage(image_path)3. JPEG和PNG格式：除了医学图像文件格式，SimpleITK还可以读取一般的图像文件格式，例如JPEG和PNG。
nrrd后缀
nrrd后缀
NRRD后缀是一种数据格式，通常用于存储医学图像。
NRRD代表非连续图像存储和传输。
它是由医学图像处理软件3D Slicer的开发人员开发的，并受到医学图像处理界的广泛认可。
NRRD格式的优点之一是其可扩展性。
它可以存储许多类型的医学图像数据，包括体积、断层扫描和表面网格。
此外，它还可以存储相关的元数据，如方向和像素间距，这些元数据对于医学图像的处理和分析非常重要。
NRRD格式还可以存储多个数据集，这对于存储如CT和MRI这样的多模态图像数据非常有用。
另外，这种格式还支持压缩和加密，从而确保数据的安全性和完整性。
NRRD格式的一个缺点是它的文件大小相对较大，这对于存储大量医学图像数据的机构可能会成为问题。
需要注意的是，在进行某些医学图像处理操作时，NRRD格式的文件可能会被破坏，这可能会导致丢失数据。
总之，NRRD格式是一种非常流行和有用的医学图像存储格式。
它具有可扩展性、可压缩性和元数据存储等优点，同时还支持多模态图像
数据和加密功能。
尽管存在一些缺点，但这种格式仍然受到广泛的认可，并且在医学图像处理和研究中扮演着非常重要的角色。
ultrasoundmultiframeimagestorage -回复
ultrasoundmultiframeimagestorage -回复什么是[ultrasoundmultiframeimagestorage]？[Ultrasoundmultiframeimagestorage]是医学图像的一种格式，用于存储超声波扫描图像。
这种格式允许医生和技术人员以多帧的形式查看并分析超声波图像。
通过使用这种格式，医学专业人员可以获得更全面和详细的信息来做出更准确的诊断。
超声波是一种声能频谱的无损检测技术，通过传导声波进入人体并反射回来的方式来生成图像。
这些图像用于检测和诊断许多不同类型的疾病和病症，包括心脏病、肿瘤、妊娠等。
超声波图像是动态的，通过多个连续的帧来呈现组织和器官的运动。
每一帧都包含了扫描期间采集的声波数据，这些数据经过处理和转换后呈现为一幅图像。
这些图像以多帧的形式被存储在[ultrasoundmultiframeimagestorage]中。
[Ultrasoundmultiframeimagestorage]格式的优点之一是它可以存储大量的图像数据，并且可以高效地传输和管理。
这对于医生、技术人员和研究人员来说非常重要，因为他们需要在超声波图像中查找特定的解剖结构或异常。
通过使用多帧图像存储，他们可以根据时间的推移观察和比较图像，以更好地理解病情的发展和变化。
此外，[ultrasoundmultiframeimagestorage]格式还允许医学图像与其他医疗设备和系统进行无缝集成。
这对于医疗机构和医生来说非常重要，因为他们需要与其他设备和系统共享图像和数据。
使用[ultrasoundmultiframeimagestorage]格式存储的超声波图像可以通过特定的软件进行查看和分析。
这些软件通常提供可视化工具和算法，以帮助医生和技术人员解释图像并做出准确的诊断。
在医疗领域，超声波已成为一种常用的影像诊断技术。
通过使用[ultrasoundmultiframeimagestorage]格式存储超声波图像，医生和技术人员能够获得更全面和准确的诊断结果。
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附录C 图像格式
译者：Synge
发表时间：2012-05-03浏览量：1604评论数：0挑错数：0
翻译：xiaoqiao
在fMRI的早期，由于大多数据都用不同研究脉冲序列采集，然后离线大量重建，而且各研究中心文件格式各不相同、大多数的分析软件也都是各研究单位内部编写运用。
如果这些数据不同其他中心交流，数据的格式不影响他们的使用。
因此图像格式就像巴别塔似的多式多样。
随着fMRI领域的不断发展，几种标准的文件格式逐渐得到了应用，数据分析软件包的使用促进了这些文件格式在不同研究中心和实验室的广泛运用，直到近期仍有多种形式的文件格式存在。
这种境况在过去的10年里随着公认的NIfTI格式的发展和广泛认可而优化。
该附录就fMRI资料存储的常见问题以及重要的文件格式做一概述，
3.1 数据存储
正如第2章所述，MRI数据的存储常采用二进制数据格式，如8位或16位。
因此，磁盘上数据文件的大小就是数据图像的大小和维度，如保存维度128 ×128×96的16位图像需要25,165,824位(3 兆字节)。
为了保存图像的更多信息，我们希望保存原始数据，即元数据。
元数据包含了图像的各种信息，如图像维度及数据类型等。
这点很重要，因为可以获得二进制数据所不知道的信息，例如，图像是128 ×128×96维度的16位图像采集还是128 ×128×192维度的8位图像采集。
在这里我们主要讨论不同的图像格式保存不同的数量及种类的元数据。
MRI的结构图像通常保存为三维的资料格式。
fMRI数据是一系列的图像采集，可以保存为三维格式，也可以保存为四维文件格式（第4维为时间）。
通常，我们尽可能保存为四维数据格式，这样可以减少文件数量，但是有些数据分析软件包不能处理四维数据。
3.2 文件格式
神经影像的发展中出现了很多不同图像格式，常见的格式见表1.在这里我们就DICOM、Analyze和NIfTI最重要的三种格式做一讨论。
表1. 常见医学图像格式
Analyze .img/.hdr Analyze软件, 梅奥临床医学中心
DICOM 无ACR/NEMA协会
NIfTI .nii或.img/.hdr NIH影像学信息工具倡议
MINC .mnc 蒙特利尔神经学研究所（MNI，扩展名NetCDF)
有些MRI的脉冲序列（特别是西门子MRI系统）把fMRI的DICOM数据存储为Mosaic 格式。
这种格式中，每个图像文件中包含1个mosaic文件，而实际是16层的图像。
该存储格式就节约了大量的存储空间。
大多情况下，仪器生产商宁愿保存为256×256，而fMRI 图像的矩阵为64×64。
因此，分析前必须解压缩mosaic图像，使之成为三维或四维文件从而符合分析软件需要的格式。
3.2.2 Analyze格式
最知名的曾使用过的MRI数据格式为Analyze格式，它是由梅奥临床医学中心使用同名的分析软件包而得名（由于费用问题而仅用于fMRI）。
Analyze格式储存的每组数据组包含2个文件，一个为数据文件，其扩展名为.img，包含二进制的图像资料；另外一个为头文件，扩展名为.hdr，包含图像的元数据。
在fMRI 的早期，Analyze格式最常用的格式，但现在逐渐被NIfTI格式所取代。
Analyze格式主要不足就是头文件不能真正反映元数据。
3.2.3 NIfTI格式
为了减少不同研究中心及数据分析软件共享数据后存在的问题，2000年美国国家精神研究所、国立神经疾病与脑卒中研究所的研究小组创建了新的数据存储格式。
2004年，新的数据格式的第一个版本即NIfTI-1格式发布，它是Analyze 7.5格式的延伸且增加了相当数量的元数据。
NIfTI格式最重要的特征就是能反应MRI仪器的像素指数与空间位置。
如果使用得当，能帮助我们准确定向，如能帮我们确定哪边代表的是左脑。
标准NIfTI图像的扩展名是.nii，包含了头文件及图像资料。
由于NIfTI格式和Analyze 格式的关系，因此NIfTI格式也可使用独立的图像文件（.img）和头文件（.hdr）。
单独的.nii 格式文件的优势就是可以用标准的压缩软件（如gzip），而且一些分析软件包（如FSL）可以直接读取和写入压缩的.nii文件（扩展名为.nii.gz）。
* 由于某些原因，在影像研究者倾向于发展使用自己的文件格式转换程序而不是已经存在的图像转换软件。
就我们观点来说，这是浪费时间，而且会增加潜在的资源错误。
神经影像领域里有很多亟待解决的问题值得智慧的科研人员去研究，而把DICOM格式转换为其他标准图像格式并不属于该领域。