遗传相似系数
白术遗传多样性ISSR分析
白术遗传多样性ISSR分析目的：对白术12个栽培居群及3个半野生居群的遗传多样性进行分析。
方法：应用ISSR分子标记技术研究浙江、安徽、河北等省15个居群356个样品的遗传多样性；采用POPGEN32进行数据分析，UPGMA绘制聚类图。
结果：13条ISSR引物共检测到102个清晰的扩增位点，多态性位点94个，多态位点百分率为92.16%；Nei′s基因多样性指数（He）为0.406 5，Shannon多样性指数（I）为0.590 3，基因分化系数（Gst）为0.202 5。
居群间的遗传相似系数为0.690 7～0.960 5，平均为0.825 6。
聚类分析可知，居群间并无明显分类。
结论：白术具有较高的遗传多样性，遗传分化水平低，无明显地域性差异及品种差异。
这与白术目前栽培及种质流通现状呈正相关。
标签：白术；遗传多样性；ISSR白术为常用中药，来源于菊科苍术属多年生草本植物白术Aractylodes macrocephala Koidz.的干燥根茎。
历史上其道地产区为浙江、安徽，目前，在浙江、安徽、河北、山西等省已被普遍种植[1]，河北安国是白术种子种苗的主产区，有大白术，小白术，二性子白术等栽培品类型。
由于白术有悠久的栽培历史，长期不同区域间的移植、杂交，以及种间、居群间的杂交繁殖，造成了白术的种质混乱，品种不明，药材质量参差不齐。
本研究利用ISSR技术对白术12个栽培居群及3个野生居群的种质资源进行遗传分析，探讨国内不同产地以及不同栽培类型白术的遗传多样性及遗传变异水平，为白术的栽培、育种及种质保存和流通提供一定的参考依据。
1 材料与方法1.1 供试白术种子种子于2009年采自于浙江、安徽、河北及山西4个省的15个不同地区的居群，用牛皮纸封装于-4 ℃冰箱保存备用。
白术种子由河北医科大学郑玉光教授鉴定（表1）。
1.2 仪器和试剂PCR仪为eppendorf Mastercycler personal；离心机为eppendorf centrifuge 5415D；ExTaqDNA聚合酶、DNA marker 2 000，dNTPs等是由Takara公司提供；引物由上海生物工程技术服务有限公司合成。
玉米自交系的遗传多样性分析及杂种优势群划分
玉米自交系的遗传多样性分析及杂种优势群划分摘要：收集具有丰富遗传多样性的种质资源是玉米育种的前提，通过对资源进行杂种优势群的划分可以显著提高育种效率。
本研究利用135对InDel分布在玉米10条染色体上的分子标记引物，系统分析了491份玉米自交系的遗传多样性，结果显示标记多态性信息量变化范围为0.255～0.678。
通过计算遗传相似值（GS），上述材料被划分成8个包括Reid 群、Lancaster群、四平头群和PB群的杂种优势群。
本研究结果为组配优良玉米杂交种提供了遗传信息。
关键词：玉米；分子标记；遗传多样性；杂种优势群；遗传相似性；InDel标记中图分类号：S513.03文献标志码：A文章编号：1002-1302（2015）11-0107-03收稿日期：2015-08-24基金项目：江苏省自然科学基金（编号：BK20141385）；江苏省农业科技自主创新资金[编号：CX（13）3060]。
作者简介：林峰（1978―），男，博士，助理研究员，主要从事遗传育种研究。
E-mail：flinlc@。
通信作者：赵涵，博士，研究员，主要从事作物遗传育种研究。
Tel：（025）84390751；E-mail：zhaohan@。
杂种优势是指2个遗传组成不同的生物体杂交后的杂种一代在生长势、生活力、抗逆性、产量及品质等方面优于双亲的现象。
利用杂种优势获得总体性状优于亲本的杂交种是现代育种的重要手段之一。
而杂种优势群集中了大量有利基因，群间自交系杂交时往往可以获得较大的杂种优势。
因此，杂种优势群的划分有助于自交系改良和杂交种选配，对杂交育种具有重要意义。
玉米是典型的异交作物，杂种优势明显。
玉米中最早的一对杂种优势模式是Reid×Lancaster，2003年，Hallauer提出了BSSS-Tuxpeno和non-BSSS-non-Tuxpeno两个杂种优势列（Heterotic Alignment）的概念，又称SS和NSS群[1]，这一模式大大促进了玉米种质的扩增、改良和创新，得到了广泛应用。
遗传学名词解释
并发系数：观察到的双交换率与预期的双交换率（两个单交换率的乘积）的比值剂量补偿作用：是使具有两份或两份以上的基因量的个体与只具有一份基因量的个体的基因表现趋于一致的遗传效应、剂量补偿效应：在哺乳动物中一定存在一种机制可以补偿x染色体的超量。
在XY性别决定机制的生物中，使性连锁基因在良种性别中有相等或近乎相等的有剂量的遗传效应。
两种机制：1 调节X染色体的转录速率；2 通过失火雌性细胞中的一条X染色体来实现的，无论是雌性还是雄性细胞都只有一条X染色体是有活性基因表达：基因编码的信息转化为细胞结构并在细胞中行使功能的过程。
包括转录成信使RNA接着翻译成蛋白质的基因以及转录成RNA，但是不翻译成蛋白质的基因顺反子：即结构基因，为决定一条多肽链合成的功能单位，约1000bp。
表示一个起作用的单位，一个作用子包括的一个DNA与一个多肽链的合成相对应，是基因的基本功能和转录单位，一个基因可有几个顺反子，一个顺反子产生一条Mrna操纵基因：通过与特定组遏物相互作用而控制邻接结构基因对mRNA合成的染色体上的一个区段，是不转录的DNA区段，是调节基因的一种反转录转座子：真核的许多转座子具有与反转录转座子病毒基因子十分相似的结构，在其两翼为LGR，编码区包含有还原病毒反转录酶的同源序列溶源周期：温和噬菌体感染细菌后DNA整和到宿主染色体上，处于一种休眠状态，随宿主染色体复制而复制溶菌周期：类似裂性噬菌体方式，噬菌体接管细菌遗传系统，在宿主菌内大量增殖，使菌裂解放出噬菌体。
溶源性细菌：含有温和噬菌体的遗传物质而又找不到噬菌体形态上的可见的噬菌体粒子的宿主细菌。
具有免疫性，可诱导性特性原噬菌体：溶源性性细菌所携带的噬菌体，它是温和噬菌体侵入细菌后通过交换整和到细菌染色体上，随染色体一起复制和遗传的噬菌体溶源细菌：细胞总含有以原噬菌体状态存在的温和噬菌体的细菌，此细菌对噬菌体来说是溶源的。
直到诱导，噬菌体开始繁殖，细菌被裂解。
生物遗传因素遗传率=2×同卵双生子相关系数-异卵双生子相关
三、家庭环境因素
• T·帕金斯说道：家庭是 “人类性格的工厂” 它塑造 了人们不同的人格特质。
四、早期童年经验
• 麦肯依 (Mackinnon，1950)认为：早期的亲子关 系定出了行为模式，塑造出一切日后的行为。
• 中国有句俗语: "三岁看大，七岁看老。"
• 大量实验证据表明： 人格发展的确受到童年经验的影响，幸福的童年 有利于儿童发展健康的人格，不幸的童年也会使 儿童形成不良的人格。
自然环境的作用概括为以下2条：
1．自然环境对人格不起决定性的作用。更多表 现为一时性影响。 2．自然环境对特定行为具有一定解释作用。
• 人格是先天和后天的合金，是遗传与环境交互作 用的结果，遗传决定人格发展的可能性，环境决 定人格发展的现实性。
父母的态度对孩子人格的影响
父母的态度 支配的 干涉的 娇宠的
拒绝的 不关心的
孩子的人格 消极、缺乏自主性、依赖、顺从 臆病、神经质、被动的、幼稚的 任性、放肆、幼稚、神经质、温和.
自我显示、冷淡、乱暴的 攻击的、情绪不安定的、冷酷的、自立的
专横的 民主的
反抗的、情绪不安定的、依赖的、服从的 合作的、独立的、坦率的、社交的
五、学校教育因素
• 教师、学生班集体、同学与同伴等都是学校教育 的元素。教师对学生人格的发展具有指导定向的 作用 。
• 教师的公正性对学生有非常重要的影响。 • 教师期望引起的效应叫“皮格马利翁效应” 。 • 学校是同龄群体会聚的场所，同伴群体对学生人
陆地棉半野生种系的遗传多样性和亲缘关系分析
１ 材 料 和 方 法
１１ 供 试 材 料 ．
ｓ ｔ ．ａｅ ， ｕｕ Ｌ ｒｃ ｓ 以下 简称 半 野 生 棉 ） 有优 质 、 ｅ ｒ 具 多 抗 等优 良的特 性 Ｌ 其染 色 体 数 目（ｎ ４ ＝ ２ 与 ５ Ｊ ， ２＝ ｘ ５ ）
ｔ ｔｔ ｎ ｔｃ ｄｉ ｅ ｓ ｔ ｍ ｏ ｇ ａ ｉ Ｇａ ａ ｅ ｉ ｕｃ ｇｈ ｒ ｔ ｎ ｔ ｔ ｅ ａ ｅ ．Ｇｅ ｅ ａ ｌ ｈｅ ｇｅ ｅ ｉ ｉ ｅ ｓ ｔ ａｍ ｏ ｇ ｔ ｅ ｈａ ｈｅ ｇｅ ｅ ｉ ｖ ｒ ｉ ａ ｙ ｎ Ｍ ｒｅ— ｌ ｎｔ ｓ ｍ ｈ ｈｉ ｅ ｈａ ｈｅ ｏ ｈ ｒ ｒ ｃ ｓ ｎ ｒ ｌｙ，ｔ ｎ ｔｃ ｄ ｖ ｒ ｉ ｙ ｎ ｈ
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基于SRAP的15种鸢尾的遗传多样性和亲缘关系分析
基于SRAP的15种鸢尾的遗传多样性和亲缘关系分析许玉凤;闫小风;邵美妮;关萍;陈旭辉;曲波【摘要】为探讨北方地区15种鸢尾的遗传多样性和亲缘关系,采用SRAP分子标记的方法对鸢尾遗传多样性的亲缘关系进行评价.结果表明:利用优化的SRAP-PCR 反应体系和筛选出的6对引物组合对15种鸢尾扩增,共得到207条清晰稳定的条带,片段大小是50～1500bp,多态位点百分比为100％.多态信息含量为0.3976,遗传多样性参数分别为Na=2.000,Ne=1.6947±0.2416,H=0.3967±0.0941,I--0.5816±0.1065,说明15种鸢尾在种水平上有较高的遗传多样性,并有较大的遗传分化.鸢尾的亲缘关系通过UPGMA聚类分析和主成分分析两种方法进行,在遗传相似性系数为0.589时,15种鸢尾被分成六大类群.该研究为鸢尾属植物种质资源的分类、鉴定、保护及新品种选育等方面提供参考.【期刊名称】《沈阳农业大学学报》【年(卷),期】2015(046)005【总页数】7页(P568-574)【关键词】鸢尾;SRAP;遗传多样性;亲缘关系【作者】许玉凤;闫小风;邵美妮;关萍;陈旭辉;曲波【作者单位】沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110161;沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110161;沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110161;沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110161;沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110161;沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110161【正文语种】中文【中图分类】Q94鸢尾属（Iris L.）为鸢尾科（Iridaceae）多年生草本植物，全世界范围内约300种，我国有60个种、13个变种和5个变型，主要分布于东北、西北、西南等地[1]。
鸢尾花色丰富、姿态优美、栽培管理简便、养护成本低，被广泛地应用于园林绿化。
一些种类如溪荪（I.sanguinea）、马蔺（ctea var.chinensis）等具有抗旱、耐盐碱、耐水湿等特性，可用于滩涂、盐碱地的改良[2]；一些鸢尾种还有药用价值，如马蔺、野鸢尾等，根、茎、叶、花和种子都可入药，其所含的黄酮类化合物具有良好的清热解毒作用。
近交系数资料
近交系数在分子标记辅助育种 中的应用
• 近交系数在分子标记辅助育种中的应用 • 利用分子标记信息计算个体的近交系数 • 为育种提供依据：通过计算近交系数，可以评估个体的遗传风 险和遗传多样性，为育种提供依据 • 提高育种效率：通过分子标记辅助育种，可以快速、准确地计 算近交系数，提高育种效率
03
传关系，从而评估种群的遗传多样性 • 指导遗传育种：近交系数可以指导遗传育种过程中的亲本选择
和杂交组合设计，以提高育种效果 • 评估遗传风险：近交系数可以评估特定个体的遗传风险，如遗
传疾病的发病率等
近交系数的计算方法：基于系谱的公式
基于系谱的近交系数计算方 法
亲本近交系数 （F）：表示个 体与其父母之 间的遗传关系
• 近交系数在鸟类中的变化规律 • 鸟类的一般近交系数较低：由于鸟类的繁殖方式和迁徙习性， 近交系数通常较低 • 不同鸟类之间的近交系数存在差异：近交系数受物种、生态环 境和繁殖方式等多种因素影响
近交系数在植物中的变化规律
• 近交系数在植物中的变化规律 • 植物的一般近交系数较高：由于植物的生命周期和繁殖方式， 近交系数通常较高 • 不同植物之间的近交系数存在差异：近交系数受物种、生态环 境和繁殖方式等多种因素影响
• 利用系谱信息计算个 体的近交系数 • 主要包括亲本近交系 数、兄妹近交系数和半兄 妹近交系数等
• F = （1/2）^n，其中 n为父母之间的代数
兄妹近交系数 （F_s）：表示 个体与其兄妹 之间的遗传关
系
• F_s = （1/2）^n，其 中n为兄妹之间的代数
半兄妹近交系 数（F_h）：表 示个体与其半 兄妹之间的遗
近交系数与遗传多样性的关系
近交系数与遗传多样 性的关系分析
中型狼尾草种质特性及遗传多样性研究
中型狼尾草种质特性及遗传多样性研究中型狼尾草（Pennisetum longissimum var. intermedium）是陈守良和金岳杏在1984年发现并命名的长序狼尾草新变种，为禾本科（Gramineae）狼尾草属（Pennisetum）多年生疏丛型草本植物，在我国云南、四川、贵州、湖南、甘肃等地均有分布。
中国农科院兰州畜牧与兽药研究所经过多年引种驯化，选育出4个中型狼尾草新品系，具有产草量高、萌发力强、易栽培、抗病性强等优良特性，平均株高1.8～1.9m，年均干草产量达到1.60×104kg/hm2，粗蛋白含量18%以上。
本论文对中型狼尾草4个新品系的生长特性、生殖特性、细胞学特性、抗逆性进行深入研究，并对包括4个新品系在内的29份中型狼尾草种质材料的表型多样性和分子多样性进行了分析比较，以期为中型狼尾草种质资源的开发利用及新品种选育提供科学依据。
主要结果如下：（1）对中型狼尾草3个早熟品系的开花授粉习性及花粉形态进行观察研究。
结果显示，日内开花时间主要集中在7:00～11:00，8:00～10:00是开花高峰期。
1号品系开花时间7:00开始，11:00结束；2号品系7:30开始开花，11:30结束；3号品系开花始于7:30，11:00结束。
1号、2号和3号品系的开花期持续时间分别为13d、20d和15d。
1号、2号品系有一个开花高峰期，总体呈现“低—高—低”的态势；2号品系出现两个开花高峰期，总体呈现“低—高—低—次高—低”的态势。
中型狼尾草开花变化除受自身开花节律的控制外，与气温变化、空气湿度也有一定关系，20～25℃温度范围较适宜花粉萌发，空气湿度较大时，花药散粉推迟或不散粉。
花粉形态近似球形或卵园形，花粉粒表面有皱褶，花粉外壁为细小颗粒饰纹，呈鱼鳞状排列。
平均花粉粒大小为47.1μm，平均极轴长为45μm，平均赤道轴长为52μm，平均长/宽比例为0.86。
探讨了中型狼尾草开花授粉习性在杂交育种中的应用以及花粉形态与低结实率的关系。
遗传力
参数估计的基本设计遗传力我们关注遗传力的原因在于它能够确定父母与子女的相似程度，而这种相似性又依次决定了选择的反应。
尤其说明的是后代回归的斜率是h²=V A/V P.为什么用h²代替h?学生们经常会问为什么我们使用h²代替h来衡量遗传力，对于这点我们可以归咎于休厄尔赖特，因为他使用h表示一个个体的育种值和表型值的相互关系，再看相关系数的平方是变异的总百分数，通过一个变量来表示未予说明的部分，这导致了h²的普遍使用。
的确，我们谈论遗传力的时候，我们指的是h²而不是h。
再看h的确是一个个体的繁殖和表型值的相互关系，式子（5.1）为相关系数的定义遗传力是一个种群函数由于遗传力是一个基因和环境变化的函数，它是一个种群严格的性质，不同的种群，即使密切相关，也会有不同的遗传力。
自从遗传力成为一个种群的持续遗传变异的量度，零遗传力并不意味着一个特征是遗传决定的。
例如，一个自交家系会显示出结构性特点，这些特点相对于其他家系是明显的遗传差异的结果。
不管怎么样，后来没有假设的近亲种群遗传力的变异，h²是零。
遗传力的增加记录显示σ²p显性变化的增加导致h²的减少。
所以，如果能减少环境变量（例如更仔细测量一个特征，或使用更统一的环境）就能增加遗传力。
其中注意谨慎行事。
遗传力不仅仅是一个种群的基因性质，还是种群经历环境变化的分布。
因此，在实验室中测出的一个种群的遗传力测量值肯定是不同于同一种群在更广阔的自然环境下的测量值。
对于饲养员和实验员来说，基因型与环境相互作用很小不是一个严重的问题。
随着环境变化更普遍，显著的GxE被提出，它能够改变基因的价值和以后的任何适当的遗传方差。
这个问题特别关注的是植物育种，就环境价值的分布来说甚至略有不同的种植区域可能有细微但是一致的差异。
遗传力与育种值的预测h²代表总变异量的比例应占育种值的差异，此外，h²是给一个个体表型值给出的预测育种值的回归斜率，此根据回归斜率而得。
利用InDel标记分析23份黄瓜种质的遗传多样性及核心种质资源筛选
利用InDel标记分析23份黄瓜种质的遗传多样性及核心种质资源筛选张红梅;翟文;金海军;丁小涛;余纪柱【摘要】为了研究不同来源黄瓜的亲缘关系,筛选适宜作杂交亲本的种质资源,基于黄瓜重测序开发的InDel标记,应用UPGMA进化树聚类、主成分分析和群体遗传结构分析3种方法分析了23份黄瓜种质的遗传多样性.结果表明:23份黄瓜种质的遗传相似性系数为0.23-0.95,平均值为0.56,相似性系数低于0.6的有137对组合,占全部组合的54％,说明这些材料的遗传多样性较好.3种分析方法均将23份黄瓜种质分为三大类群:P1来源于亚洲,都属于华南类型黄瓜;P2来源于欧洲和美国,包含欧洲类型长黄瓜、欧洲类型短黄瓜和2个美国加工型黄瓜;P3仅包含1个来源于广东的品种,从表型上看属于华南类型.P3亲缘关系更接近P1,P1和P2之间遗传差异明显.利用InDel标记分析的结果,对核心种质最佳样本量进行了预测,应用M策略将9份黄瓜种质确定为核心种质,包含了群体中几乎所有的黄瓜类型,外形上有白刺、褐刺以及光滑型,这9份核心种质能够很大范围地覆盖表型的变异.【期刊名称】《上海农业学报》【年(卷),期】2019(035)004【总页数】6页(P28-33)【关键词】黄瓜;InDel标记;核心种质;遗传多样性【作者】张红梅;翟文;金海军;丁小涛;余纪柱【作者单位】上海市农业科学院设施园艺研究所,上海市设施园艺技术重点实验室,上海201403;东华理工大学化学生物与材料科学学院,南昌330013;上海市农业科学院设施园艺研究所,上海市设施园艺技术重点实验室,上海201403;上海市农业科学院设施园艺研究所,上海市设施园艺技术重点实验室,上海201403;上海市农业科学院设施园艺研究所,上海市设施园艺技术重点实验室,上海201403【正文语种】中文【中图分类】S642.2黄瓜（Cucumis sativus L.）是世界上重要的蔬菜作物之一，也是遗传研究的一个模式植物［1］。
医学遗传学亲缘系数
医学遗传学亲缘系数
亲缘系数又称血缘系数、亲属间遗传相关系数、亲缘相关系数，是指将群体中个体之间基因组成的相似程度用数值来表示。
具体来说，亲缘系数反映的是两个个体间的遗传相关（亲缘）程度，与近交系数不同。
近交系数$F_{\chi}$是说明$x$这个个体本身是什么程度的近交产生的，而亲缘系数则是反映两个个体间的遗传相关程度。
亲缘关系有两种，一种是直系亲属即祖先与后代的关系，另一种是旁系亲属的关系，即两个体既不是祖先又不是后代的关系，如兄弟姐妹、堂（表）亲属间的关系等。
亲缘系数在医学遗传学中具有重要的应用价值，可以用于研究亲属间的遗传关系，评估遗传风险等。
plink 近交系数 数值的解释
plink 近交系数数值的解释解释说明1. 引言1.1 概述在遗传学和生物统计学中，近交系数是用来衡量个体间亲缘关系的一种指标。
亲缘关系是指个体之间共享的基因数量，而近交系数则能够quantitatively（定量地）反映这种亲缘关系。
通过测量近交系数，我们可以揭示不同个体之间的遗传相关性，进而深入了解物种内部的遗传变异和演化过程。
1.2 文章结构本文将针对plink 近交系数及其数值进行详细解释和说明。
首先，我们将介绍plink 近交系数的概念和定义，以及计算方法。
接着，我们会探讨近交系数的意义和应用场景，包括了解群体内基因流动情况、研究亲缘关系和家族疾病遗传等。
在解释说明部分，我们将重点讨论如何理解近交系数的数值范围、如何利用近交程度分析遗传疾病关联性，并且阐述近交系数所带来的局限性和误差来源。
1.3 目的本文旨在提供读者对于plink 近交系数以及其相关概念的全面理解。
通过阐述近交系数的计算方法和意义，我们可以帮助读者更好地应用近交系数进行遗传学研究，并且在解释和分析结果时具备相应的知识和技能。
以上是文章“1. 引言”部分的详细内容。
根据文章目录中其他部分的描述，您可以继续撰写接下来的章节。
祝写作顺利！2. plink 近交系数数值的解释2.1 plink 近交系数介绍plink近交系数是一种用于测量个体间亲缘关系的统计指标。
它可以衡量同一个群体中不同个体之间的遗传相似程度，并且能够反映出这些个体之间是否存在近亲关系。
2.2 近交系数的计算方法plink近交系数的计算基于基因座位上等位基因频率和共享等位基因数量。
一般而言，plink会根据可用的基因组数据，利用所选定的SNPs（单核苷酸多态性）进行分析。
具体计算时，首先利用已知样本信息对SNPs进行过滤和质控，然后根据假设模型来确定SNP对应位点上等位基因的频率。
接下来，通过比较两个样本间共享的等位基因数量与预期情况下随机共享等位基因数量之间的差异，就可以得到近交系数。
基于ITS_和ISSR_的灵芝种质资源遗传多样性分析
河南农业科学，2023，52（11）：66⁃74Journal of Henan Agricultural Sciencesdoi:10.15933/ki.1004-3268.2023.11.008基于ITS 和ISSR 的灵芝种质资源遗传多样性分析许琳1，张瑞2，王胜1，李金涛1，刘琳玲1，闫梅霞1（1.中国农业科学院特产研究所，吉林长春130112；2.吉林农业大学中药材学院，吉林长春130118）摘要：为明确吉林栽培的灵芝（Ganoderma lucidum ）种质资源的遗传多样性，以吉林省18个主栽灵芝菌株为试验材料，通过应用ITS （Internal transcribed spacer ）序列分析及拮抗试验，并与ISSR （Inter⁃simple sequence repeat ）分子标记相结合对其进行鉴定和遗传多样性分析。
基于ITS 序列构建的系统发育树表明，18种灵芝菌株均与赤芝（Ganoderma lingzhi ）聚为一类，并细分为4个类群；79.7%的灵芝菌株之间存在拮抗现象，基于ITS 序列分析及拮抗试验结果，菌株被分为7个类群；ISSR 遗传多样性分析结果表明，18种灵芝菌株的遗传相似系数在0.3824~0.9744，平均为0.6529，当相似系数约0.679时，其亦可被分为7个类群。
综上，基于ISSR 分子标记的分类结果与基于ITS 序列分析+拮抗试验结果的分类一致，18种灵芝菌株表现出明显的遗传多样性。
关键词：灵芝；拮抗试验；ITS ；ISSR ；遗传多样性中图分类号：S567.31文献标志码：A文章编号：1004-3268（2023）11-0066-09收稿日期：2023-02-26基金项目：吉林省科技发展计划项目（20210401101YY ）作者简介：许琳（1997-），女，山东济南人，在读硕士研究生，研究方向：食用菌遗传育种。
E-mail ：*****************通信作者：闫梅霞（1982-），女，河北石家庄人，副研究员，硕士，主要从事灵芝种质资源收集与品种选育、栽培模式探索研究。
基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较
基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较黄平;崔娇鹏;郑勇奇;张川红【摘要】以月季品种的微卫星标记数据为基础,选择7个遗传相似系数对月季品种间遗传相似度进行计算,并采用非加权组平均法(UPGMA)建立相应的系统树.通过遗传相似系数相关性、聚类结果一致性以及拟合优度等分析方法,探讨不同的遗传相似系数在微卫星遗传分析中的适用性.分析数据显示7个系数之间相关系数介于0.726 ～1.000.共表型相关系数rc介于0.85～0.93,表明品种间遗传差异在基于UPGMA方法的聚类树状图中有良好体现.系统树之间的CI.指数范围为0.468 ～1.000,表明采用不同相似系数进行聚类分析时,结果存在较大差异.7个遗传相似系数的S统计值介于16.24％～ 29.90％,Russel and Rao系数最低,Simple Matching等3个系数S值均大于20％.综合考虑分子标记特点、物种杂合度、Kruskal拟合优度等因素,并结合聚类分析与品种谱系比较结果,研究认为Dice系数和Jaccard系数适用于月季的微卫星遗传分析,其次是Simple Matching系数.%Seven genetic similarity coefficients were selected to calculate pairwise genetic similarity of rose ( Rosa ) varieties based on microsatellite data, and the 7 corresponding dendrograms were constructed by Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean. The applicability of different genetic similarity coefficients in analyzing genetic relationships based on the microsatellite in rose varieties was investigated by means of correlation analysis between genetic similar matrixes, consistency analysis between cluster trees, and test of the goodness of fit. The result showed that correlation coefficients between different similar matrixes ranged from 0. 726 to 1, 000. Cophenetic correlation coefficientsranged from 0. 85 to 0. 95 , indicating that there was a good representation of similarity matrixes in the form of dendrograms. Index of CIc between pairwise dendrograms ranged from 0.468 to 1.000, which indicated that dendrograms were dependent on selection of different genetic similarity coefficients. STRESS values among the 7 genetic similarity coefficients ranged from 16, 24% to 29. 90% . The STRESS values of Simple Matching, Roger and Tanirnoto, and Hamann coefficients were all more than 20% . Comprehensive consideration of molecular marker characteristics, species heterozygosis, STRESS value, and combined with clustering result and variety lineage, Dice coefficient and Jaccard coefficient were found to be the most appropriate for rose variety genetic analysis , followed by Simple Matching coefficient.【期刊名称】《林业科学》【年(卷),期】2013(049)001【总页数】9页(P68-76)【关键词】月季;品种;多倍体;微卫星标记;遗传相似系数;聚类分析【作者】黄平;崔娇鹏;郑勇奇;张川红【作者单位】国家林业局植物新品种分子测定实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091;北京植物园北京100093;国家林业局植物新品种分子测定实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091;国家林业局植物新品种分子测定实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091【正文语种】中文【中图分类】S718.46DNA分子标记是指生物个体间或者群体间基因组上的DNA差异片段。
利用SSR标记分析木薯遗传多样性
利用SSR标记分析木薯遗传多样性摘要应用简单重复序列（SSR）标记对国家木薯种质资源圃195 份国内（外）品种（系）进行遗传多样性分析。
结果表明：44对引物共扩增出186个等位基因，每对引物平均扩增出2～8个等位基因，平均Shannon's信息指数I为1.01，平均多态性信息量（PIC）为0.49。
195个品种（系）的遗传相似系数（GS）分布在0.57～0.99。
聚类分析结果表明，在遗传距离0.71处，可将供试材料分为7个类群。
关键词木薯；SSR标记；遗传多样性；聚类分析分类号S533Genetic Diversity of Cassava Germplasm Revealed by SSR MarkersWANG Ming XIAO Xinhui AN Feifei WAN ZhongqingYING Dongshan WANG Qinfei ZHANG Rulian LI Kaimian YE Jianqiu（Tropical Crops Genetic Resources Institute /Ministry of Agriculture Key Laboratory for Germplasm Resources Conservationand Utilization of Cassava / Ministry of Agriculture Key Laboratory ofTropical Crops Germplasm Resources Utilization，CATAS，Danzhou，Hainan 571737）Abstract Using simple sequence repeat （SSR）markers 195 domestic（foreign）varieties（lines）on the National Cassava Germplasm Resources Garden were analyzed for genetic diversity. The results showed that 44 pairs of primers amplified 186 alleles with 2-8 alleles amplified by each pair of primers. The average Shannon 's information index was 1.01，and the average PIC is 0.49. The （GS）distributions on the genetic similarity coefficient of 195 varieties （lines）were 0.57～0.99. Cluster analysis results showed that 195 germplasms can be divided into 7 groups while the genetic distance was 0.71.Keywords cassava ；SSR marker ；genetic diversity ；cluster analysis木薯（Manihot esculenta Crantz）又称树薯，是世界三大薯类作物之一。
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66
魏泓
3
67
高和琼
3
68
高丽丽
3
69
马艳明
3
70
马成杰
3
71
雷伏贵
3
72
陶爱芬
3
73
陶正明
3
74
陈顺辉
3
75
陈进红
3
76
陈虎
3
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陈继康
3
78
陈涛
3
79
陈校辉
3
80
陈栋
3
81
陈平
3
82
陈学军
3
83
陈培峰
3
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陈国华
3
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陈发波
3
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陈兆贵
3
87
陈俊意
3
88
闵丽
3
89
金国虔
3
90
邹冬梅
3
91
车卓
3
一、主题简介
二、主题相关科研产出总体分析
2.1文献总体产出统计
图表1文献总体产出统计表
期刊论文
学位论文
会议论文
科技成果
中外专利
中外标准
法律法规
外文期刊
外文会议
综合统计
1423
1068
129
15
9
0
1
290
16
图表2文献总体产出饼图
2.2学术关注趋势分析
图表3学术关注趋势图
三、主题相关科技论文产出分析
6
13
陈静
6
14
鄢家俊
6
15
荣廷昭
6
16
白史且
6
17
王军
6
18
李新海
6
19
张世煌
6
20
孙效文
6
21
黎裕
5
22
黄团
5
23
黄勇
5
24
陈智华
5
25
陈健文
5
26
陈仲华
5
27
陈仕勇
5
28
邓海华
5
29
劳方业
5
30
刘睿
5
31何慧怡5 Nhomakorabea32黄路生
4
33
黄忠乾
4
34
高军
4
35
马红勃
4
36
马玉宝
4
37
雷尊国
4
38
陈奕欣
4
创新助手报告
——主题分析报告
创新助手平台提供
北京万方软件股份有限公司
2014-06-27
报告目录
图表目录
报告核心要素
本报告是围绕以下主题，利用海量数据库和数据挖掘、聚类分析和可视化技术，从文献总体产出、学术关注趋势、相关文献分布与增长情况、权威机构和人物排名等方面得出的综合分析结果。
主 题：
遗传相似系数
19%
2013
176
1180
18%
2014
53
1233
4%
3.1.2中文期刊论文增长趋势
图表5近十年中文期刊论文增长趋势曲线图
3.1.3发文较多期刊
图表6发文较多期刊
3.1.4发文较多的机构
图表7发表中文期刊论文较多的机构名称及数量
序号
机构名称
数量
1
中国农业科学院
93
2
四川农业大学
83
3
西北农林科技大学
?金花茶组物种遗传关系的ISSR分析南宁市金花茶公园；中国林业科学研究院亚热带林业研究所；肖政；李志辉；李纪元；范正琪；黄连冬；蒋昌杰；国家科技支撑计划项目；国家国际科技合作专项2014
?大麦SSR标记遗传多样性及群体遗传结构分析甘肃省农业科学院小麦研究所；甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室；甘肃农业大学生命科学技术学院；甘肃农业大学农学院；马小乐；王晋；王化俊；孟亚雄；赖勇；李葆春；王世红；尚勋武；甘肃省农牧厅生物技术专项；国家大麦青稞产业技术体系；甘肃省科技厅成果转化项目；甘肃省自然科学基金；国家自然科学基金2014
40
4
甘肃农业大学
29
5
南京农业大学
26
6
海南大学
23
7
云南农业大学
23
8
广东海洋大学
22
9
河北农业大学
21
10
江苏省农业科学院
21
11
福建农林大学
20
12
山东农业大学
19
13
四川省农业科学院
19
14
中国热带农业科学院
19
15
山东省农业科学院
17
16
中国水产科学研究院
17
17
东北农业大学
17
18
西南大学
39
陈亮
4
40
钟国跃
4
41
赵卫国
4
42
贾定洪
4
43
肖炳光
4
44
粟建光
4
45
王云月
4
46
杨克诚
4
47
李隆云
4
48
李莉
4
49
李明顺
4
50
李开绵
4
51
李丽
4
52
彭燕
4
53
张利
4
54
张军
4
55
姚启伦
4
56
刘伟
4
57
龚友才
3
58
黎萍
3
59
黄贵民
3
60
黄萌
3
61
黄勇平
3
62
黄云霄
3
63
黄东益
3
64
鲜灵
3
65
鲁凤娟
5
66
中国海洋大学
5
67
上海海洋大学
5
68
黑龙江省农垦科研育种中心
4
69
黑龙江大学
4
70
陕西师范大学
4
71
长江师范学院
4
72
重庆市农业科学院
4
73
西南林业大学
4
74
苏州大学
4
75
福建省水产研究所
4
76
甘肃省农业科学院
4
77
河南科技学院
4
78
广西亚热带作物研究所
4
79
广州市农业科学研究院
4
80
天津市农业科学院
4
81
黑龙江省农业科学院
3
82
黑龙江水产研究所
3
83
鲁东大学
3
84
重庆文理学院
3
85
福建省三明市农业科学研究所
3
86
石河子大学
3
87
湘南学院
3
88
湖北省农业科学院
3
89
浙江农林大学
3
90
江西省农业科学院
3
91
江苏省淡水水产研究所
3
92
惠州学院
3
93
广州中医药大学
3
94
山西大学
3
95
安康学院
3
96
宁波大学
7
50
长江大学
6
51
西华师范大学
6
52
江苏科技大学
6
53
扬州大学
6
54
广东省农业科学院
6
55
山西省农业科学院
6
56
四川大学
6
57
中国医学科学院;北京协和医学院
6
58
青岛农业大学
5
59
集美大学
5
60
陕西理工学院
5
61
辽宁师范大学
5
62
延边大学
5
63
山东中医药大学
5
64
北京林业大学
5
65
仲恺农业工程学院
3
97
宁夏农林科学院
3
98
复旦大学
3
99
四川省草原科学研究院
3
100
四川省中医药科学院
3
3.1.5发文较多的人物
图表8发表中文期刊论文较多的人物名称及数量
序号
人物名称
数量
1
张新全
25
2
郑有良
24
3
魏育明
20
4
马啸
20
5
周永红
12
6
陈大霞
11
7
吴卫
9
8
颜泽洪
8
9
马峙英
7
10
马小乐
7
11
黄琳凯
6
12
黄先群
3.1中文期刊论文
3.1.1近十年中文期刊论文分布列表
图表4近十年中文期刊论文分布列表
年代
文献量
累积量
增长率
2005
46
46
0%
2006
78
124
170%
2007
89
213
72%
2008
129
342
61%
2009
157
499
46%
2010
174
673
35%
2011
174
847
26%