中国人群2型糖尿病相关基因的关联分析及基因型交互作用研究

中国人群2型糖尿病相关基因的关联分析及基因型交互作用
研究
焦红肖;吕佳;杨付花;李明珊;冯淑芝;李卫东;蔡春友;魏凤江;时文涛;陈莉明;林静娜;韩鸿玲;凌超;于萍【期刊名称】《天津医科大学学报》
【年(卷),期】2013(019)001
【摘要】Objective: To identify associations of diabetes candidate genes with type 2 diabetes in Chinese population. Methods: 1 463 unrelated Chinese from Tianjin in a case-control study (non-diabetes controls, n=548; type 2 diabetes cases, n=915) were examined. 21 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 17 genes were genotyped by MALDI-TOF MS, PLINK software was used for association and pairwise genotype interaction analyses. Results: Five genes were significantly associated with type 2 diabetes (P<0.05), including CD-KN2A/B (rs10811661, P=2.91×10-5), CDKAL1 (rs7756992, P=0.0028), LPHN3 (rs6856526, P＝0.0031), IGF2BP2 (rs4402960,P＝0.0006), and ABCG2 (rs2231142, P=0.0315); Genotype interactions (epistasis) among 6 pairs of SNPs were significantly associated with type 2 diabetes (P<0.05). Conclusion: In this study, the polymorphisms of LPHN3 and ABCG2 gene are associated with type 2 diabetes; previous associations among CDKN2A/B, CDKAL1, and IGF2BP2 gene polymorphisms and type 2 diabetes are replicated in Chinese population.%目的:检验糖尿病候选基因在中国人群中与2型糖尿病的相关性.方法:以1 463名无血缘关系的中国天津地区人群为研究对象[其中对照组(非糖尿病)548
名,病例组(2型糖尿病)915名]进行病例-对照研究.采用MALDI-TOF MS对17个基因的21个SNP位点进行基因分型,运用PLINK软件进行关联分析及基因型交互作用分析.结果:发现5个SNP位点与2型糖尿病显著相关(P＜0.05),分别为CDKN2A/B(rs10811661,P=2.91×10-5)、CDKAL1 (rs7756992,P=0.0028)、LPHN3 (rs6856526,P=0.0031)、IGF2BP2(rs4402960,P=0.0006)和ABCG2 (rs2231142,P=0.0315)；并发现6对基因间的交互作用达到显著水平(P＜0.05).结论:LPHN3和ABCG2基因的多态性与2型糖尿病相关；并进一步验证了
CDKN2A/B、CDKAL1、IGF2BP2基因的多态性在中国人群中与2型糖尿病的关联性.
【总页数】4页(P6-8,12)
【作者】焦红肖;吕佳;杨付花;李明珊;冯淑芝;李卫东;蔡春友;魏凤江;时文涛;陈莉明;林静娜;韩鸿玲;凌超;于萍
【作者单位】天津医科大学基础医学研究中心,天津300070;天津医科大学基础医学研究中心,天津300070;天津医科大学基础医学研究中心,天津300070;天津医科大学基础医学研究中心,天津300070;天津医科大学总医院,天津300052;天津医科大学基础医学研究中心,天津300070;天津医科大学基础医学研究中心,天津300070;天津医科大学基础医学研究中心,天津300070;天津医科大学基础医学研究中心,天津300070;天津医科大学代谢病医院,天津300070;天津市人民医院,天津300121;天津医科大学总医院,天津300052;天津医科大学基础医学研究中心,天津300070;天津医科大学基础医学研究中心,天津300070
【正文语种】中文
【中图分类】R587.1;R394
【相关文献】
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3.C反应蛋白基因多态性及环境因素交互作用与中国人群缺血性脑卒中的关联研究[J], 李继来;陈忠云;李晓峰;李婧;杜继臣;杨旭
4.IGF2BP2、CDKAL1基因多态性及基因-环境交互作用与2型糖尿病的关联研究[J], 饶平;于鑫玮;盖思齐;王皓;房红红;王友信;王嵬;
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