临床常见镰刀菌rDNA ITS序列分析

临床常见镰刀菌rDNA ITS序列分析
窦红涛;李若瑜;万哲;李然;孙旭光;卜定方;王端礼
【期刊名称】《临床和实验医学杂志》
【年(卷),期】2006(5)6
【摘要】目的探讨rDNA ITS序列分析用于快速鉴定临床常见镰刀菌的方法,为临床早期诊断镰刀菌感染提供依据.方法选择临床常见的茄病镰刀菌、串珠镰刀菌、尖孢镰刀菌和半裸镰刀菌,提取基因组DNA,用真菌通用引物ITS1、ITS4、PCR扩增rDNA ITS,纯化后测定其序列,所得序列在GenBank核酸序列数据库中进行同源序列搜索,并和其中镰刀菌标准株的rDNA ITS序列进行序列比对.利用Clustal X 软件将序列匹配排列,进行1000次bootstrap统计学检验,用TreeView软件显示系统树.结果 rDNA ITS序列分析的结果与表型基本一致,以前经形态学鉴定的2株串珠镰刀菌经过rDNA ITS序列分析鉴定为层生镰刀菌.系统树显示茄病镰刀菌和标准株聚在一起,串珠镰刀菌大部分也和标准株聚在一起.结论形态学鉴定镰刀菌有一定的局限性,rDNA ITS序列分析可用于快速鉴定临床常见的镰刀菌.
【总页数】3页(P646-648)
【作者】窦红涛;李若瑜;万哲;李然;孙旭光;卜定方;王端礼
【作者单位】北京协和医院检验科;北京大学第一医院皮肤科,北京,100034;北京大学第一医院皮肤科,北京,100034;首都医科大学同仁眼科中心,北京,100005;首都医科大学同仁眼科中心,北京,100005;北京大学第一医院皮肤科,北京,100034;北京大学第一医院皮肤科,北京,100034
【正文语种】中文
【中图分类】R3
【相关文献】
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