质粒提取方法
提取质粒的主要步骤原理
提取质粒的主要步骤原理提取质粒是一种分离和纯化质粒DNA的常见实验技术。
质粒是细菌细胞内环状的DNA分子,通常用于基因克隆、转化、表达和基因组编辑等研究。
下面将详细介绍质粒提取的主要步骤原理。
1. 细菌培养:首先,选择含有目标质粒的细菌菌株进行培养。
通常使用大肠杆菌等常用实验菌株。
将细菌接种到含有适当营养物质(如LB培养基)的培养物中,并在适当条件下培养,如37摄氏度、220 rpm振荡培养。
2. 收获细菌:将培养至适当生长期的细菌用离心机离心,收集菌体沉淀。
通常使用1500×g离心10分钟,得到一个细菌菌体的沉淀。
3. 质粒裂解:利用物理或化学方法将细菌菌体裂解,释放内部的质粒DNA。
物理方法包括超声波处理和冻融法,而化学方法则涉及使用碱性裂解液(如SDS 和NaOH)。
该步骤破坏了细胞壁和细胞膜,以及核酸酶等酶的活性。
4. 蛋白质沉淀:为了去除细菌染色体DNA和蛋白质,可通过蛋白质沉淀步骤使质粒DNA纯化。
一种常用的方法是加入混合溶液,其中包含非离子性洗涤剂(如SDS)和蛋白酶K。
SDS具有溶解细菌膜和蛋白质的作用,而蛋白酶K能够降解杂质蛋白质。
该反应可以在高温条件下进行,如50-60摄氏度,以增加SDS和蛋白酶K的活性。
5. DNA沉淀:通过加入盐和酒精,可以使DNA溶液中的质粒DNA沉淀。
正常情况下,添加等体积的冷异丙醇,再加入适量的盐溶液。
因为质粒DNA在冷异丙醇和高盐浓度下更容易沉淀。
经过离心,沉淀的DNA可被分离出来。
6. 洗涤和溶解:将DNA沉淀洗涤一两次,以去除盐和其他杂质。
通常使用70%乙醇洗涤,再次离心以分离DNA沉淀,然后去除液体,使其干燥。
最后,用适当的缓冲液(如TE缓冲液)溶解质粒DNA,以得到高纯度的DNA溶液。
以上步骤提取质粒的主要原理如下:在收获细菌步骤中,细菌通过离心过程被分离出来,得到菌体沉淀。
在质粒裂解步骤中,通过物理或化学方法破坏细胞结构,释放质粒DNA。
提取质粒的原理
提取质粒的原理质粒是一种环状的DNA分子,存在于细菌、酵母等微生物细胞中,具有自主复制和传递的能力。
质粒在基因工程中扮演着重要的角色,可以被用来携带外源基因并在宿主细胞中表达。
因此,提取质粒是基因工程实验中必不可少的步骤之一。
本文将介绍提取质粒的原理及其相关技术。
提取质粒的原理提取质粒的原理基于细胞裂解和质粒分离的过程。
一般来说,提取质粒的步骤包括以下几个方面:1. 细胞裂解首先需要将含有质粒的细胞进行裂解,使质粒从细胞内部释放出来。
细胞裂解的方法有多种,包括机械破碎、超声波破碎、化学裂解等。
其中,化学裂解是最常用的方法之一,其原理是利用化学试剂破坏细胞壁和细胞膜,使细胞内部的物质释放出来。
常用的化学试剂包括SDS、EDTA、蛋白酶K等。
2. 分离质粒细胞裂解后,需要将质粒从其他细胞组分中分离出来。
质粒的分离方法有多种,包括离心、柱层析、电泳等。
其中,离心是最常用的方法之一,其原理是利用离心力将不同密度的物质分离开来。
在离心过程中,质粒会沉积到离心管底部形成沉淀,其他细胞组分则会在上层形成上清液。
此时,可以将上清液倒掉,留下质粒沉淀。
3. 纯化质粒分离出的质粒可能会受到其他杂质的污染,因此需要进行纯化。
质粒的纯化方法有多种,包括酚-氯仿法、硅胶柱层析法、离子交换柱层析法等。
其中,酚-氯仿法是最常用的方法之一,其原理是利用酚和氯仿的不同溶解度将DNA、RNA和蛋白质分离开来。
在酚-氯仿法中,质粒会在上层形成一个白色的粘稠物质,其他杂质则会在下层形成。
提取质粒的技术提取质粒的技术有多种,包括常规提取法、快速提取法、自动提取法等。
其中,常规提取法是最常用的方法之一,其步骤如下:1. 细胞裂解将含有质粒的细胞进行裂解,使质粒从细胞内部释放出来。
常用的化学试剂包括SDS、EDTA、蛋白酶K等。
2. 分离质粒将裂解后的细胞进行离心,分离出质粒沉淀。
3. 纯化质粒将分离出的质粒进行酚-氯仿法纯化。
4. 洗涤质粒将纯化后的质粒进行洗涤,去除残留的酚和氯仿。
质粒提纯的原理
质粒提纯的原理质粒是一种由DNA分子组成的环状双链结构,常见于细菌细胞中。
质粒提纯是指从细菌细胞中分离纯净的质粒DNA,并去除其他细菌细胞成分和杂质的过程。
质粒提纯的原理主要包括质粒提取、细胞裂解、DNA溶解、去除杂质、DNA沉淀、洗涤和干燥等步骤。
1. 质粒提取:质粒提取是通过裂解细菌细胞壁和细胞膜,释放质粒DNA。
常见的方法有碱裂解法、酶裂解法和热裂解法。
其中,碱裂解法是最常用的一种方法。
在碱裂解法中,首先将含有质粒的细菌培养物经离心分离得到菌体沉淀,然后用碱溶解菌体,使细胞壁和细胞膜破裂,释放质粒DNA。
2. 细胞裂解:细胞裂解是指将细菌细胞壁和细胞膜破裂,释放细胞内的质粒DNA。
细胞裂解的方法包括机械破碎、超声波裂解和酶裂解等。
机械破碎法是将经离心得到的菌体沉淀在低温下用椎管等器械进行破碎,使菌体破裂,释放DNA。
超声波裂解法则是利用超声波的高频振动实现细胞破碎,释放DNA。
酶裂解法则通过添加蛋白酶、脱氧核酸酶等酶,使细胞壁和细胞膜被酶降解,释放DNA。
3. DNA溶解:DNA溶解是指将裂解的细胞中的DNA从其他细胞成分中分离出来。
一般来说,DNA可以通过溶于乙醇或异丙醇的方式沉淀下来,然后经过离心分离得到。
此步骤的目的是将DNA和其他细菌细胞成分如蛋白质、RNA等分离。
4. 去除杂质:在DNA溶解的过程中会有一些杂质如蛋白质、RNA等混入溶液中。
为了获得纯净的质粒DNA,需要去除这些杂质。
一般可以通过加入酶解剂如RNase A或蛋白酶K进行酶解,使RNA或蛋白质被降解。
然后通过盐酸/乙醚等混合液体沉淀蛋白质,或者通过乙醇沉淀RNA等方式去除杂质。
5. DNA沉淀:通过加入适量的盐和乙醇,使DNA与DNA溶液中碱性pH值条件下的盐结合形成DNA盐沉淀,同时DNA与乙醇结合形成DNA乙醇沉淀。
此过程中DNA成为不溶性盐和DNA乙醇复合物,通过离心分离沉淀下来。
沉淀条件可以根据实验需要进行调整,如调节盐和乙醇的浓度、温度等。
质粒提取方法
质粒提取:质粒是细胞染色体外弄够自主复制的很小的环状DNA分子。
1、将新鲜单菌落或液体培养物接种到5mL液体培养基中,32℃振荡培养至对数生长后期;(振荡速度250-300rpm)2.将菌液倒入1.5mL离心管中,4℃,10000rpm离心20秒,弃去上清液,将离心管倒置于吸水纸上,使上清液尽可能去尽。
为增加菌体的量,可重复操作2-3次;3.将收集的沉淀重悬于预冷的100μL溶液Ⅰ中,涡旋混匀,使充分悬浮,温室放置5分钟。
4.加入200μL溶液Ⅱ,颠倒混匀,冰浴5分钟。
(1、溶液变成半透明粘液;2、冰浴使染色体DNA片段不至于太小,质粒不容易开环;3、若SDS因温度太低析出,需微热使融)5.加入150μL溶液Ⅲ,混匀,冰浴5分钟,(DNA复性)6.12000rpm离心5分钟,将上清液移至1个新的1.5mL的离心管中,(上清液为复性的质粒,沉淀为缠绕的染色体及少量蛋白质)7.加入2倍体积无水乙醇颠倒混匀,室温放置10分钟,(无需-20℃)8.12000rpm离心10分钟,弃去上清液,将管口打开,倒置于吸水纸上,使所有液体尽可能流出。
9.加入1mL75%乙醇(洗去DNA表面的盐类),12000rpm离心5分钟。
10.弃去上清液,将离心管倒置于吸水纸上,使液体流尽,置通风厨中至液体挥干(乙醇需完全挥发)11.将沉淀溶于40μL含20μg/L(2%的浓度)的RNA酶的TE溶液中,38℃放置于10分钟,-20℃保存。
12.检验(DNA溶于水,不溶于酒精)质粒提取中溶液的配制(准备工作)1. 0.5M EDTA(pH=8.0)(10mL)称取1.8g Na2EDTA•2H2O加入约8mL的去离子水,充分搅拌均匀,用NaOH调节pH至8.0(约0.2gNaOH)pH值为8.0时,EDTA才能完全溶解,加入去离子水将溶液定溶至10mL,高温高压灭菌后室温保存。
2. 1M Tris-HCL(pH=8.0)10mL称量1.211g Tris,加入约8mL去离子水,充分搅拌溶解,加入0.42mL浓盐酸,定容至10mL,高温高压灭菌后,室温保存。
质粒提取步骤及原理
质粒提取是分子生物学中常用的实验技术,其目的是从细菌中提取出质粒DNA,用于后续的基因操作和分析。
下面是质粒提取的主要步骤和原理的详细解释。
一、质粒提取原理
质粒是细胞内的一种环状的小分子DNA,是进行DNA重组的常用载体。
作为一个具有自身复制起点的复制单位独立于细胞的主染色体之外,质粒DNA上携带了部分的基因信息,经过基因表达后使其宿主细胞表现相应的性状。
在DNA重组中,质粒或经过改造后的质粒载体可通过连接外源基因构成重组体。
从宿主细胞中提取质粒DNA,是DNA重组技术中最基础的实验技能。
二、质粒提取步骤
培养细菌使质粒扩增:将含有目标质粒的细菌接种在适当的培养基上,提供适当的条件(如温度、湿度和营养)使细菌生长和繁殖,从而使质粒得到扩增。
收集和裂解细菌:通过离心等方法收集培养好的细菌,然后使用适当的裂解液裂解细菌,使细菌的细胞壁和细胞膜破裂,释放出内部的质粒DNA。
分离和纯化质粒DNA:通过离心、过滤或层析等方法,将裂解液中的蛋白质、细胞碎片等杂质去除,得到相对纯净的质粒DNA。
这个过程中可能需要使用一些特殊的试剂或柱子来提高分离和纯化的效率。
通过以上步骤,我们可以从细菌中提取出高质量的质粒DNA,用于后续的基因操作和分析。
质-粒-提-取-原理及步骤
质-粒-提-取-原理及步骤概述质粒提取,又称DNA提取,是一种分离和提取所需DNA的过程。
质粒提取在许多实验中都是非常重要的步骤,例如基因工程、分子生物学、遗传学和其他DNA相关实验。
本文将介绍质粒提取的原理及步骤。
原理DNA提取的过程通常包括细胞破碎、DNA纯化、DNA溶解和复性等步骤。
对于质粒提取,主要步骤通常包括以下内容:1.细菌培养:在质粒提取之前,需要将细菌培养在含有适当抗生素的培养基中,用于扩增质粒数量。
2.细胞破碎:使细胞破裂以释放出含有质粒的细胞内物质,此步骤需要进行严格的抗污染措施,以避免污染质粒样本。
3.除去污染物:除去细胞壁、蛋白质、核酸和其他污染物。
4.离心分离:将上述步骤中提取出的样本进行离心分离,使DNA沉淀,以便进一步纯化。
5.溶解:通过加入一定的缓冲液或去离子水,使DNA重新溶解。
步骤以下是一种常见的质粒提取步骤:1.处理样本:将含有所需质粒的细胞收集,并进行初始处理,包括细胞壁破裂、核酸纤维溶解等。
2.傅里叶纯化:通过傅里叶变换纯化,将细胞内杂质和有机污染物清除。
3.离心分离:将细胞样本离心,使DNA沉淀到底部,并且将上层样本移除。
4.乙醇沉淀:加入乙醇沉淀,将DNA纯化到上清液。
5.重振溶解:最后使用适当缓冲液重振重振溶解DNA,也可以使用去离子水重振。
以上就是质粒提取的原理和步骤,这是一个非常重要的操作,在DNA研究和实验中有着广泛的应用。
我们需要注意的是,在操作过程中需要进行高标准的质量控制,以确保实验结果的准确性。
质粒提取原理和方法
质粒提取原理和方法质粒提取是从细菌基因组中提取出质粒DNA的一种方法。
它是分子生物学和遗传工程中常用的技术,可用于质粒的纯化和制备。
质粒提取的原理主要基于以下几个步骤:1.细菌培养:首先,我们需要将含有目标质粒的细菌培养在适当的培养基上,通过高速离心将细菌收集起来。
2.细菌溶解:将培养物进行离心,分离菌落。
然后采用一定的细胞破碎方法,如超声波震荡、冻融等,将细菌细胞壁破坏,使质粒DNA释放到溶液中。
3.质粒分离:通过离心将细菌碎片、蛋白质等杂质与质粒DNA分离。
一般是通过两次离心来完成,第一次较低速离心用于去除细菌碎片和细胞蛋白质,第二次较高速离心用于沉淀质粒DNA。
4.DNA纯化:将质粒DNA从上一步得到的沉淀物中提取出来。
可以使用酚/氯仿法、硅胶柱法、商用试剂盒等方法进行纯化。
其中酚/氯仿法是较为常用的方法,它可以将DNA溶于水相,而蛋白质和其他的污染物则溶于有机相。
5.DNA沉淀:将纯化得到的DNA溶液加入适量的酒精沉淀剂(如乙醇或异丙醇),再次进行高速离心,使DNA沉淀到离心管底部。
6.DNA洗涤:将离心管底部形成的DNA沉淀用70%乙醇洗涤,去除酒精沉淀剂和其他杂质。
然后用空气吹干,最后用一定体积的纯水或缓冲液溶解。
质粒提取的方法根据实验需求不同和实验室条件的不同可以有所差异,常用的方法有以下几种:1.酚/氯仿法:这是一种经典的DNA提取方法,它将质粒DNA溶于三氯甲烷和酚的混合物中,蛋白质和其他污染物则溶于酚相。
离心去除酚相,再用异丙醇沉淀DNA,最后用70%乙醇洗涤。
2.硅胶柱法:这是一种基于硅胶柱的离心柱技术,可用于高通量的质粒提取。
DNA样品在硅胶柱中被结合,杂质被洗掉,最后用纯水或缓冲液洗提质粒DNA。
3.磁珠法:这是一种基于磁性珠子的质粒提取方法,通过在磁性珠子表面修饰DNA结合物,使质粒DNA与磁性珠子结合。
通过外加磁场将磁性珠子与DNA一起沉淀,然后去除上清液,最后用纯水洗提DNA。
提取质粒的方法
提取质粒的方法提取质粒是分子生物学实验中的常见步骤之一,其目的是将细菌中的质粒分离出来,以进行后续的实验操作。
提取质粒有多种方法,本文将介绍其中的几种常用方法及其优缺点。
一、CACl2热激转化法CACl2热激转化法是经典的提取质粒方法之一。
其过程如下:1. 将含有目的质粒的细菌培养物进行扩增,使细菌数达到一定程度。
2. 离心将细菌沉淀下来,将培养液中的菌落去除。
3. 用无菌水洗涤细菌沉淀,用CACl2溶液缓慢重悬细菌,使CACl2浓度达到0.1M。
4. 加入pH 6.5的冷缓冲液,浸泡在冰上15分钟。
5. 在热水浴中40-45℃,热激转化。
6. 加入含有抗生素的琼脂糖平板上进行筛选。
该方法的优点是操作简单,不需要特殊设备,且质粒提取量较大。
但其缺点也显而易见,即有毒化学物质CACl2使用,对质粒构建的影响较大,在序列克隆等需要高质量的质粒时不适用。
二、碱裂解法碱裂解法是一种有效的质粒提取方法,是利用质粒DNA与蛋白质的不同耐碱性,将质粒分离出来的方法。
其操作流程如下:1. 将细菌沉淀用含50mM Tris-HCl(pH 8.0)的盐水洗涤。
2. 加入含50mM Tris-HCl(pH 8.0)、25mM EDTA和1%SDS的Lysis Buffer(血浆蛋白)溶液,充分振荡混合,放在65℃水浴中加热,使细胞破裂并释放DNA和蛋白质。
3. 加入冷异丙醇,低温离心,使DNA和蛋白质分开。
注意此步骤中异丙醇的体积比例对DNA的提取量有较大影响,需根据实验需要酌情设置。
4. 倒出上清液,将沉淀用50%异丙醇洗涤。
5. 将洗涤后的沉淀用无菌水重悬,进行后续实验操作。
碱裂解法优点较多,其操作简单、快捷,可以得到较纯的质粒DNA,适用于后续实验需要高质量的DNA。
三、亲水性亲油性法亲水性亲油性法又称酚-氯仿法,其原理是利用亲油性有机溶剂和亲水性酚盐在酚-氯仿-异丙醇三相体系中分离质粒和其它细胞成分。
其操作流程如下:1. 培养含有质粒的细菌,并进行扩增。
三种提取质粒的方法及原理
三种提取质粒的方法及原理《三种提取质粒的方法及原理》一、离心法离心法是最常用的一种提取质粒的方法,它通过离心力的作用,使细胞或质粒(例如DNA、RNA等)从悬浮液中分离出来,从而得到提取的质粒。
分离过程如下:1.从对象(例如细胞)上提取纯化的质粒,使其形成悬浮液。
2.将所得悬浮液置于微量离心机中,加入适当的离心剂,并配置合适的离心条件(如离心速度,离心时间)。
3.根据离心力,细胞及其他悬浮液的组分会在离心机的内壁及底部形成层,质粒则聚集在中心处,形成离心质粒。
4.把离心质粒从中心处取出,即可得到纯化的质粒。
二、丙酮离心法丙酮离心法是一种以丙酮、乙醇和水作为分离剂的提取质粒方法,它可用于提取活性质粒,如抗体、RNA和DNA等,这是因为丙酮和乙醇可以良好地维持质粒的活性,并可以使悬浮液以柱状分离,有利于质粒的提取。
丙酮离心法的分离过程如下:1.将所要提取的对象加入适当的提取液(如200 ml丙酮),形成悬浮液。
2.将悬浮液置于微量离心机中,并配置合适的离心条件。
3.由于丙酮和乙醇的作用,悬浮液以柱状分离,并形成梁状质粒在柱峰中。
4.把梁状质粒从柱峰中取出,即可得到纯化的质粒。
三、超滤法超滤法是一种用于提取质粒的物理分离方法,它通过扩散作用及滤膜孔径的大小,可以有效地将非蛋白质物质等从悬浮液中分离出来,而不改变其本身的结构和性质。
超滤法的分离过程如下:1.将所要提取的对象加入适当的提取液(如水),形成悬浮液。
2.将所得悬浮液置于微量超滤器中,并配置合适的超滤条件(如超滤压力、超滤温度)。
3.根据超滤的原理,液体及其他悬浮物质会被超滤滤膜过滤,而质粒则不会被过滤,从而被滤过的液体中提取出质粒。
4.把质粒从超滤液中取出,即可得到纯化的质粒。
质粒提取原理
质粒提取原理质粒提取是分子生物学实验中常见的操作,其原理主要是利用离心、溶解、沉淀等方法将目标质粒从细菌中提取出来,为后续的实验操作提供必要的材料基础。
下面将详细介绍质粒提取的原理及相关操作步骤。
一、离心法。
离心法是质粒提取的基础步骤之一,其原理是通过高速离心使得细菌细胞和质粒分离。
首先,将含有目标质粒的培养基液体培养物进行离心,使得细菌细胞被沉淀到离心管底部,上清液中则含有目标质粒。
接着,将上清液转移至新的离心管中,再次进行离心操作,将残余的细菌细胞去除,得到含有目标质粒的上清液。
二、溶解法。
溶解法是质粒提取的另一关键步骤,其原理是通过特定的溶解液将目标质粒从细菌细胞中释放出来。
一般情况下,利用含有EDTA和蛋白酶K的溶解液对细菌细胞进行裂解,使得细菌细胞壁和膜被破坏,质粒得以释放。
此时,目标质粒已经被释放到溶解液中,为后续的纯化操作做好准备。
三、沉淀法。
沉淀法是质粒提取的最后一步,其原理是通过加入盐类或醇类使得目标质粒沉淀到溶液底部,从而实现质粒的分离和纯化。
一般情况下,将加入盐类或醇类的溶液与目标质粒混合后,通过离心将质粒沉淀到离心管底部,上清液中则含有杂质和其他不需要的物质。
最后,将上清液倒掉,得到沉淀的质粒,即可用于后续的实验操作。
综上所述,质粒提取的原理主要包括离心、溶解和沉淀三个步骤。
通过这些操作,可以有效地将目标质粒从细菌中提取出来,并得到相对纯净的质粒样品,为分子生物学实验提供了重要的基础材料。
在实际操作中,需要严格按照操作步骤进行操作,并注意操作中的细节,以确保提取到高质量的质粒样品。
希望本文介绍的质粒提取原理能够对相关实验工作有所帮助。
6分钟提取质粒
6分钟提取质粒
"6分钟提取质粒" 通常指的是在分子生物学实验中,从细菌中提取质粒的过程,该过程可以在相对较短的时间内完成。
提取质粒是为了获取质粒中的目标基因、DNA片段或其他重要的遗传物质。
以下是一般的质粒提取步骤,这个过程可以在大约6分钟内完成:
1. 培养菌株:
- 开始前,先在培养基中培养含有目标质粒的大肠杆菌(E. coli)菌株。
2. 离心:
- 将培养好的菌液进行离心,将菌体沉淀。
3. 去除培养基:
- 弃去上清液,保留含有大肠杆菌的菌体沉淀。
4. 溶解:
- 使用缓冲液溶解菌体,使DNA释放。
5. 加入溶解剂:
- 加入一些溶解剂,如碱性SDS(十二烷基硫酸钠),破坏膜脂,释放DNA。
6. 快速离心:
- 进行瞬时离心,将膜脂等杂质快速沉淀。
7. 取上清:
- 取上清液中含有的质粒DNA。
8. 沉淀:
- 加入醋酸等溶液,使DNA沉淀。
9. 洗涤:
- 对DNA沉淀进行洗涤,去除残余的盐和其他污染物。
10. 溶解:
- 最后,用适当的缓冲液溶解沉淀的质粒DNA。
这样的质粒提取方法通常使用快速、高效的离心和溶解步骤,使得整个过程可以在相对较短的时间内完成。
实际提取时间可能因具体实验方案和使用的提取试剂盒而有所不同。
提取质粒的原理
提取质粒的原理随着基因工程技术的不断发展,提取质粒已经成为了分子生物学和生物技术领域中的一项基本操作。
质粒提取是指从细菌中提取质粒,并进行纯化和鉴定的过程。
质粒是一种很小的环状DNA分子,它存在于细菌细胞内,并承担着细菌的一些重要生命活动,如抗生素抗性等。
质粒提取的过程是分子生物学实验中的一个重要步骤,对于分子生物学实验的成功与否有着至关重要的作用。
本文将介绍质粒提取的原理和方法。
质粒提取的原理提取质粒的原理主要是利用细菌细胞壁的物理和化学特性,将细菌细胞壁破裂,并将质粒从其中分离出来。
主要的步骤包括:1. 细胞裂解将细菌细胞裂解是提取质粒的第一步。
细胞壁的物理和化学特性限制了质粒的提取,因此需要先破坏细胞壁。
通常使用碱性溶液、高渗液、超声波等方法破坏细胞壁,使得细胞内的物质可以释放出来。
2. 分离质粒破坏细胞壁后,质粒和细胞内的其他物质就一起释放出来了。
此时需要用化学方法将质粒与其他物质分离开来。
常用的方法有离心、溶液层析、凝胶过滤等。
3. 纯化质粒分离出来的物质中,除了质粒外还有其他的DNA片段、RNA、蛋白质等。
为了得到纯净的质粒,需要进行进一步的纯化。
如聚丙烯酰胺凝胶电泳、离子交换层析、亲和层析等。
4. 鉴定质粒最后一步是鉴定质粒。
鉴定质粒的方法有多种,包括酶切、PCR、测序等。
通过这些方法可以确定质粒序列、大小、拓扑结构等信息。
质粒提取的方法1. 碱裂解法碱裂解法是最常用的质粒提取方法之一。
其原理是利用NaOH和SDS对细胞壁进行破坏,使得细胞内的DNA、RNA、蛋白质等物质可以释放出来。
具体步骤如下:(1)将细菌菌落接种到含有适当抗生素的LB培养基中,进行培养。
(2)将菌落转移到含有适当抗生素的LB培养基中,进行预培养。
(3)收集细菌菌落,进行洗涤。
(4)将菌落加入含有10mM Tris-HCl,1mM EDTA,pH8.0的缓冲液中,进行瞬时冻存。
(5)加入含有50mM葡萄糖、25mM Tris-HCl、10mM EDTA、0.5% SDS、pH12.0的溶液中,进行碱裂解。
试剂盒提取质粒原理
试剂盒提取质粒原理
试剂盒提取质粒的原理是利用化学方法将目标质粒从细胞中提取出来。
通常的提取方法包括以下步骤:
1. 细胞破碎:首先,使用试剂盒中的细胞破碎缓冲液或细胞裂解酶将细胞膜破坏,释放出质粒和其他细胞内容物。
2. 质粒去除:接下来,使用试剂盒中的除去其他核酸的试剂将线性DNA、基因组DNA和RNA等其他核酸从细胞提取物中去除。
一般的方法是通过特定的酶水解剪切或其他去除方法,将其他核酸去除。
3. 质粒纯化:然后,通过试剂盒中纯化试剂提取纯质粒。
这可以通过离心和其他分离技术来实现,根据质粒的大小和其他特性,将质粒与其他杂质分离。
4. 质粒浓缩:最后,将提取到的质粒用试剂盒中的浓缩试剂进行浓缩,以得到更高浓度的质粒溶液。
这种试剂盒提取质粒的方法相对简便和高效,不需要使用复杂的高速离心等步骤,适用于实验室中质粒提取的常规需求。
质粒提取试剂盒提取步骤
质粒提取试剂盒提取步骤
一、质粒抽提
1、细胞抽提:将细胞培养物加入或移植到一种含有高浓度酸性剂的6-8mm离心管里,将细胞离心至半浸没,以保持溶液沉积在离心管壁上。
2、除去膜:添加浓酸溶液(如硫酸氢钠(NaHSO3)),膜结构会被溶解,使其细胞表面的结构被破坏,从而除去细胞的膜。
3、去染色:添加RNA隔离试剂,脱去细胞染色物质以获得高纯度的RNA质粒。
4、离心:离心至接近干旱,并移除液体,这时的混合液中已只剩下RNA质粒。
5、抹拭:将离心管倒过来,将质粒在管壁上均匀抹拭,这时的RNA 质粒就会在管壁上附着。
6、冷冻干燥:将管子放到冰上,将管子中的水分蒸发冷冻干燥,使RNA质粒固定在管壁上。
7、溶解:最后,将RNA质粒溶解到可以用于后续实验的溶液中。
二、PCR扩增:
1、PCR建库:将抽提的DNA放入PCR管中,加入PCR反应混合液(包括DNA聚合酶、dNTPs和MgCl2),并添加特长引物,即可进行PCR 反应。
2、PCR扩增:使用PCR反应温度循环加热并添加高分子量DNA来将DNA片段扩增。
3、电泳:将PCR配型片段送到电泳仪中,使用添加特异性引物的特定电泳条件,检测和鉴定基因突变。
质粒dna提取的方法
质粒dna提取的方法
提取质粒DNA的常用方法主要有:
1. 碱裂解法:将含有质粒DNA的细菌株进行裂解,使细菌质粒DNA与蛋白质分离。
一般使用碱性裂解缓冲液(如0.2 M NaOH)和含有细菌裂解酶(如SDS)的胰酶溶液进行裂解,然后使用中性盐溶液(如3 M醋酸钠)进行酸性沉淀,最后通过离心分离沉淀的质粒DNA。
2. 除菌剂法:使用含有除菌剂(如SDS)的裂解缓冲液直接裂解细菌细胞,使质粒DNA与细菌蛋白质分离。
然后使用物理方法(如离心)分离DNA和蛋白质,最后使用醋酸盐沉淀法分离质粒DNA。
3. 膜裂解法:将含有质粒DNA的细菌株均匀涂在含有质粒DNA结合断裂物的特殊膜上,经裂解后,膜上会形成质粒DNA的斑点。
然后使用洗脱缓冲液将质粒DNA从膜上洗脱,得到纯化的质粒DNA。
4. 商业化质粒DNA提取试剂盒:市面上有各种质粒DNA提取试剂盒可供选择,这些试剂盒能够提供简便、快速、高产量且高质量的质粒DNA纯化方法。
根据试剂盒的不同,步骤和原理会有所区别。
不同的方法适用于不同的实验目的和样品类型,请根据具体情况选择合适的提取方法。
简述提取质粒的主要步骤
简述提取质粒的主要步骤一、引言提取质粒是分子生物学研究中的常见操作。
质粒是一种环状的DNA分子,广泛存在于细菌和真核生物中。
提取质粒可以用于基因克隆、转基因技术等多个方面的研究。
本文将详细介绍提取质粒的主要步骤。
二、准备工作在进行质粒提取之前,需要准备以下材料和设备:1. 细菌培养液:含有目标质粒的细菌培养液。
2. 离心管:用于离心培养液。
3. 高速离心机:用于离心样品。
4. PBS缓冲液:用于洗涤样品。
5. 质粒提取试剂盒:包含了各种试剂,如溶解缓冲液、裂解缓冲液等。
三、裂解细胞1. 收集含有目标质粒的细菌培养液,并将其放入离心管中,离心10分钟,去除上清液。
2. 加入适量的溶解缓冲液(如SDS)、蛋白酶K和RNase A等试剂,混匀,使得所有细胞都充分裂解。
3. 放入高速离心机中,离心10-15分钟,去除上清液。
四、分离DNA1. 加入等体积的异丙醇,并轻轻混匀,使DNA从溶液中沉淀下来。
2. 将样品放入高速离心机中,离心10-15分钟,去除上清液。
3. 加入70%的乙醇洗涤一次DNA沉淀,并将样品放入高速离心机中,离心5分钟,去除上清液。
4. 用PBS缓冲液洗涤一次DNA沉淀,并将样品放入高速离心机中,离心5分钟。
五、纯化DNA1. 将DNA沉淀溶于适量的纯化缓冲液中。
2. 将溶解后的DNA样品加入吸附柱中,并进行洗脱步骤。
3. 使用洗脱缓冲液洗脱目标质粒。
六、检测质粒1. 用琼脂糖凝胶电泳检测提取出来的质粒是否存在,并确定其大小和纯度。
2. 如果需要进行进一步的分析(如限制性内切酶切割、测序等),则需要对质粒进行纯化和浓缩。
七、总结提取质粒是分子生物学研究中的重要操作,其主要步骤包括细胞裂解、DNA分离、DNA纯化和质粒检测等。
在操作过程中需要注意配合使用不同的试剂和设备,以确保提取到高质量的质粒。
简述提取质粒的主要步骤
提取质粒的主要步骤质粒提取是分子生物学实验中的一项重要技术,用于从细菌中提取质粒DNA。
质粒DNA是细菌细胞中的一种环状DNA分子,具有自主复制的能力,因此在分子生物学研究中广泛应用。
下面将详细介绍提取质粒的主要步骤。
步骤一:培养细菌第一步是培养携带目标质粒的细菌。
在选择培养基时,应根据质粒的抗生素耐受性选择含有相应抗生素的培养基。
将含有质粒的细菌接种到含有抗生素的培养基中,并在适当的温度下培养细菌。
步骤二:细菌增殖在合适的培养条件下,将细菌培养到较高的密度,以便从中提取足够的质粒。
细菌增殖时间的长短取决于细菌的生长速度和所需的质粒数量。
步骤三:收获细菌当细菌培养到适当的密度时,将菌液进行收获。
可以通过离心将菌体沉淀下来,然后去除上清液,或者使用其他方法收获细菌。
步骤四:裂解细菌细胞在这一步中,需要将细菌细胞裂解以释放质粒。
常用的方法是使用裂解缓冲液,通过机械、物理或化学手段破坏细菌细胞壁,使细菌DNA和质粒DNA被释放出来。
步骤五:纯化质粒DNA在这一步中,需要将裂解液中的杂质和细菌残余物除去,以纯化质粒DNA。
常用的方法是使用离心来分离质粒DNA和其他细胞成分。
离心后,上清液中的质粒DNA可以通过吸附剂或其他纯化方法进一步提纯。
步骤六:测定质粒DNA的浓度和纯度纯化的质粒DNA通常还会带有一些杂质,如RNA、蛋白质和副产物等。
因此,需要对提取得到的质粒DNA进行浓度和纯度的测定。
常用的方法有比色法、光谱法和凝胶电泳等。
步骤七:存储质粒DNA提取得到的质粒DNA可以进行存储,以备后续实验使用。
常见的质粒DNA存储方式有冷冻保存和冻干保存等。
以上是提取质粒的主要步骤,这些步骤在实验中是相互关联的,需要严格按照操作流程进行,以确保提取质粒的质量和纯度。
同时,不同的实验目的可能需要有所调整和优化,具体操作时需要根据实际情况进行调整。
质粒大量提取、纯化方法及相关溶剂的详细配方
PEG8000沉淀法大量制备和纯化质粒1质粒提取纯化步骤1.1 质粒提取步骤1) 在超净工作台上,将甘油管保种的质粒菌自然解冻后接种到含200 mL 液体LB(含100 μg/mL Kan)培养基的三角瓶中;2) 置于恒温摇床中,37℃、180 rpm条件下振荡培养16个小时;3) 用50 mL离心管在12,000 rpm、2 min条件下离心菌液,弃上清;4)重复步骤3,将200 mL菌体合并到2个50 mL离心管中;5) 菌泥重悬于3.6 mL 溶液I,加入400 μL新配的溶菌酶(10 mg/mL),涡旋震荡混匀,室温放置15-20 min,中间晃动2-3次;6) 加入8 mL现配的溶液II,盖紧管盖后轻柔颠倒10次混匀至溶液呈透明粘稠状;7) 加入4 mL预冷的溶液III,盖紧管盖后颠倒10次混匀至白色絮状沉淀呈均匀分散状;8) 12,000 rpm离心10 min,用尼龙滤膜过滤将上清液转移至新的50 mL离心管中;9) 加入0.6倍体积的异丙醇(9.6 mL),充分混匀后室温放置30 min;10) 12,000 rpm离心5 min,弃上清,加入5 mL 70%乙醇洗涤沉淀,12,000 rpm 离心2 min;11) 弃乙醇,晾干后加400 μL TE(pH 8.0)溶解核酸,转入10 mL离心管中,再加200 μL TE洗管,合并后共600 μL于4℃保存。
(如果提取量较多,合并后TE应少于2.5 mL)1.2 大提质粒的纯化1) 在上述保存的每管中加等体积(600 μL)预冷的5 M LiCl,充分混匀后冰浴10 min,12,000 rpm离心10 min;2) 取上清加等体积(1.2 mL)异丙醇,充分混匀后放置20 min,12,000 rpm 离心10 min,弃上清;3) 70%乙醇洗涤,12,000 rpm离心2 min弃上清,晾干后加700 μL TE 溶解于1.5 mL离心管中,加10 μL RNaseA(10 mg/mL),37 ℃消化30 min;4) 加入0.5体积(350 μL)的含30 mM MgCl2的40% PEG8000,倒置混匀数次可观察到蛋清色絮状沉淀,静置20 min,12,000 rpm离心20 min,弃上清;5) 70%乙醇洗涤,12000 rpm离心2 min弃上清,晾干后加700 μL TE 溶解于1.5 mL离心管中;6) 加等体积(酚350 μL,氯仿/异戊醇350 μL)的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)混匀5 min,12,000 rpm离心10 min,取上清再次用酚/氯仿/异戊醇抽提一次;7) 取上清,加入等体积(650 μL)氯仿/异戊醇(24:1)混匀5 min,12,000rpm离心10 min;8) 取上清600 μL于2 mL离心管中,加约1/10体积(60 μL)NaAc(3 M,pH 5.2),加2倍体积(1.2 mL)无水乙醇混匀,室温放置20 min。
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思考题
1、碱裂解法提取质粒DNA时应注意哪 些问题?溶液I、溶液Ⅱ、溶液Ⅲ的 作用? 2、描述质粒DNA的电泳图谱,并解释 产生的现象及可能的原因?
材料、设备及试剂
一、材料
含卡那酶素的E. coli DH5α,1.5ml塑料离心管(又称 eppendorf管), 离心管架。
二、设备
微量取液器(20µl,200µl,1000µl), 台式高速离心机,恒 温振荡摇床, 高压蒸汽消毒器(灭菌锅), 涡旋振荡器, 电 泳仪,琼脂糖平板电泳装置和 恒温水浴锅等。
DNA双链 双链
变性 强碱 中性 复性 DNA单链 单链
闭合环状的质粒DNA,在变性后不会 , 闭合环状的质粒 分离,复性快; 分离,复性快;
染色体线性 和或有缺口 染色体线性DNA和或有缺口的质粒 线性 和或有缺口的质粒 DNA变性后双链分离,难以复性而形成 变性后双链分离, 变性后双链分离 缠绕的结构,与蛋白质—SDS复合物结 缠绕的结构,与蛋白质 复合物结 合在一起,在离心的时候沉淀下去。 合在一起,在离心的时候沉淀下去。
三、试剂 1、 LB液体培养基(Luria-Bertani) :称取蛋白胨(Tryptone)10 g,酵母 提取物(Yeast extract) 5 g,NaCl 10 g,溶于800ml去离子水中,用NaOH调 pH至7.5, 加去离子水至总体积1升,高压下蒸气灭菌20分钟。 2、LB固体培养基:液体培养基中每升加12g琼脂粉,高压灭菌。 3、 氨苄青霉素(Ampicillin, Amp)母液:配成 50mg/ml水溶液, -20℃保 存备用。 4、 溶菌酶溶液: 用10mmol/L Tris·Cl(pH8.0)溶液配制成10mg/ml,并分 装成小份(如1.5ml)保存于-20℃,每一小份一经使用后便予丢弃。 5、 3mol/l NaAc (pH5.2): 50ml水中溶解40.81g NaAc·3H2 O,用冰醋 酸调pH至5.2, 加水定容至100ml, 分装后高压灭菌,储存于4℃冰箱。 6、 溶液Ⅰ:50 mmol/L 葡萄糖,25 mmol/L Tris.Cl (pH8.0), 10mmol/L EDTA (pH8.0)。 溶液Ⅰ可成批配制,每瓶100ml,高压灭菌15分钟, 储存于4℃冰箱。 7、溶液Ⅱ:0.2 mol/L NaOH (临用前用5-10mol/L NaOH母液稀释),1 % SDS。 8、溶液Ⅲ:5 mol/L KAc 60ml,冰醋酸 11.5ml, H2O 28.5ml,定容至 100ml, 并高压灭菌。溶液终浓度为: K+ 3mol/L, Ac¯ 5mol/L。
操作步骤
一、 细菌的培养和收集
将含有质粒菌种接种在LB固体培养基(含50µg/ml Amp)中, 37℃培养12-24小时。用无菌牙签挑取单菌落接种到5ml LB 液体培养基(含50µg/ml Kan)中,37℃振荡培养约12小时至对 数生长后期。
质粒DNA少量快速提取 二、 质粒 少量快速提取
质粒DNA小量提取法对于从大量转化子中制备少量部分纯化 的质粒DNA十分有用。这些方法共同特点是简便、快速,能同 时处理大量试样,所得DNA有一定纯度,可满足限制酶切割、电泳 分析的需要。
(二)、碱裂解法
1、取1.5ml培养液倒入1.5ml eppendorf管中,4℃下10000rpm离心 5min。 2、弃上清,将管倒置于卫生纸上数分钟,使液体流尽。 3、菌体沉淀重悬浮于150µl溶液Ⅰ中(需剧烈振荡),室温下放置5-10分 钟。 4、加入新配制的溶液Ⅱ300µl, 盖紧管口,快速温和颠倒eppendorf管 数次,以混匀内容物(千万不要振荡 千万不要振荡),冰浴5分钟。 千万不要振荡 5、加入227µl预冷的溶液Ⅲ,盖紧管口,并倒置离心管,温和振荡10秒, 使沉淀混匀,冰浴中5-10分钟,4℃下12000g离心5-10分钟。 6、上清液移入干净eppendorf管中,加入等体积的酚/氯仿(1:1),颠倒混 匀, 4℃下12000g离心5分钟,重复一次。 7、将水相移入干净eppendorf管中,加入0.6-1倍体积的异丙醇,颠倒混 匀静置10分钟,然后12000g离心10分钟。 8、弃上清,将管口敞开倒置于卫生纸上使所有液体流出,加入100ul 70% 乙醇洗沉淀两次。 9、吸除上清液,将管倒置于卫生纸上使液体流尽, 室温干燥。 10、将沉淀溶于20-50µl 无A比质粒大得多,受机械力后细 菌染色体DNA会被震断成不同大小的线性片段而缠绕 附着在细胞碎片上,并发生变性。同样受机械力质粒 DNA会变性,机械力后复性。但质粒DNA的复性要快 于细菌染色体DNA。
从细菌中分离质粒DNA的方法都包括 3个基本步骤:
1、培养细菌使质粒扩增 2、收集和裂解细胞 3、分离和纯化质粒DNA
(三)小量一步提取法
1.取0.5ml细菌过夜培养物,置1.5ml的Eppendolf管中 2.加入0.5ml的氯仿:异戊醇,用振荡器最大速度振荡1min, 充分混匀。 3.12000g,离心5min,取上清移至另一个Eppendolf管中, 加入500µl异丙醇混匀,立即12000g,离心5min。 4.弃上清,加入500µl70%乙醇漂洗沉淀,短暂离心。 5.弃上清,室温干燥沉淀2min,然后加入20µl无菌水溶解 DNA。
(一)、煮沸法 试验步骤:
• 将振荡过夜培养的细菌1.5ml ,于8 000r/min离心1min, 弃上清液。 • 将沉淀回溶于350µL STET (0.1 mol/L NaCl,10mmol/L Tris·Cl(pH8.0),10 mmol/L EDTA (pH8.0), 5% Triton X-100。)中。 • 加入25µL溶菌酶(10mg/mL),放入沸水中40s,立即于 10 000r/min离心10min。 • 吸出上清移至另一个Eppendolf 管中或用已灭菌的牙签 小心地将沉淀去除,加入 40µL2.5mol/LNaAc(PH5.2) 和420µL冰冻的异丙醇,振荡混匀,室温放置5 min。 • 12000g,离心5min,弃上清液,用70%乙醇洗涤两次, 然后将离心管倒扣在吸水纸上,使尽量干燥。 • 用20µL无菌水溶解沉淀,于-20℃冻存
变性
煮沸法: 煮沸法:
将细菌悬浮于含Triton X-100和能消化细胞壁 的溶菌酶缓冲液中,然后加热到100℃使其裂 解。加热除了破坏细胞壁外,还有助于解开 DNA链的碱基配对,并使蛋白质和染色体 DNA变性。但是,闭环质粒DNA彼此不会分 离,这是因为他们的磷酸二酯骨架具有互相 缠绕的拓扑结构,当温度下降后,闭环DNA 的碱基又各自就位,形成超螺旋分子,离心 除去变性的染色体核蛋白质,就可从上清中 回收质粒DNA
实验目的:
1、学会小量制备质粒DNA的碱裂解方 法、 煮沸法、小量一步提取法这三种质 粒DNA的提取方法。 2、三种方法的比较,能够根据不同的 实验目的选择合适的方法。
实验原理:
碱变性原理 : 根据共价闭合环状质粒DNA与线性 DNA在拓扑学上的差异来分离。在pH12.0∼12.5 这个狭窄的范围内,线性DNA双螺旋结构解开而 被变性。尽管在这项的条件下共价闭合环状质粒 DNA也会变性,但两条互补链彼此互相盘绕,仍 会紧密结合在一起。当加入pH4.8的乙酸钾高盐 缓冲液使pH恢复中性时,共价闭合环状质粒 DNA复性快,而线性的染色体DNA复性缓慢,经 过离心与蛋白质和大分子RNA一起沉淀下去。
基因工程原理与技 术实验部分:
质粒三种提 取方法的比 较
质粒(Plasmid)是一种染色体外的稳定遗传因子 染色体外的稳定遗传因子, 染色体外的稳定遗传因子 大小从1-200kb不等 为双链、闭环的 不等,为双链 分子,并 大小从 不等 为双链、闭环的DNA分子 并 分子 以超螺旋状态存在于宿主细胞中。质粒主要发现 以超螺旋状态存在于宿主细胞中 于细菌、放线菌和真菌细胞中,它具有自主复制 和转录能力,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数,并 表达所携带的遗传信息。
[注意 注意] 注意
1. 提取过程应尽量保持低温。 2. 提取质粒DNA过程中除去蛋白很重要,采用酚/ 氯仿去除蛋白效果较单独用酚或氯仿好,要将蛋白尽量 除干净需多次抽提。 3. 沉淀DNA通常使用冰乙醇,在低温条件下放置时 间稍长可使DNA沉淀完全。沉淀DNA 可用异丙醇(一 般使用等体积), 无水乙醇(2-2.5倍体积),区别?。
在细菌细胞内,共价闭环质粒以超螺旋形式存在。在提 在细菌细胞内 共价闭环质粒以超螺旋形式存在。 共价闭环质粒以超螺旋形式存在 取质粒过程中,除了超螺旋DNA外,还会产生其它形式的 取质粒过程中,除了超螺旋 外 质粒DNA。如果质粒 质粒 。如果质粒DNA两条链中有一条链发生一处或多 两条链中有一条链发生一处或多 处断裂,分子就能旋转而消除链的张力 分子就能旋转而消除链的张力,形成松驰型的环状 处断裂 分子就能旋转而消除链的张力 形成松驰型的环状 分子,称开环 称开环DNA(Open circular DNA, 简称 ocDNA);如 分子 称开环 ; 果质粒DNA的两条链在同一处断裂 则形成线状 的两条链在同一处断裂,则形成线状 果质粒 的两条链在同一处断裂 DNA(Linear DNA)。当提取的质粒 电泳时,同一质粒 。当提取的质粒DNA电泳时 同一质粒 电泳时 DNA其超螺旋形式的泳动速度要比开环和线状分子的泳动 其超螺旋形式的泳动速度要比开环和线状分子的泳动 速度快。 速度快。
9、RNA酶A母液:将RNA酶A溶于10mmol/L Tris·Cl(pH7.5), 15mmol/L NaCl 中,配成10mg/ml的溶液,于100℃加热15分钟,使混有的DNA酶失活。冷却后用 1.5ml eppendorf管分装成小份保存于-20℃。 10、饱和酚:市售酚中含有醌等氧化物,这些产物可引起磷酸二酯键的断裂及 导致RNA和DNA的交联,应在160℃用冷凝管进行重蒸。重蒸酚加入0.1%的8-羟基 喹啉(作为抗氧化剂),并用等体积的0.5mol/L Tris·Cl (pH8.0)和0.1mol/L Tris·Cl(pH8.0)缓冲液反复抽提使之饱和并使其pH值达到7.6以上,因为酸性条件下 DNA会分配于有机相。 11、 氯仿:按氯仿:异戊醇=24:1体积比加入异戊醇。氯仿可使蛋白变性并有 助于液相与有机相的分开,异戊醇则可起消除抽提过程中出现的泡沫。 按体积 /体积=1:1混合上述饱和酚与氯仿即得酚/氯仿(1:1)。酚和氯仿均有很强的腐蚀性, 操作时应戴手套。 12、 TE缓冲液:10 mmo/L Tris·Cl (pH8.0),1 mmol/L EDTA (pH8.0)。高压 灭菌后储存于4℃冰箱中。 13、STET:0.1 mol/L NaCl,10mmol/L Tris·Cl(pH8.0),10 mmol/L EDTA (pH8.0), 5% Triton X-100。 14、STE:0.1mol/L NaCl,10mmol/L Tris·Cl(pH8.0),1mmol/L EDTA (pH8.0)。 15、 电泳所用试剂: (1) TBE 缓冲液 (5×):称取 Tris 54g,硼酸27.5g, 并加入 0.5M EDTA (pH8.0) 20ml,定溶至1000ml。 (2)上样缓冲液 (6×): 0.25% 溴酚蓝,40% (w/v) 蔗糖水溶液。