基因突变的检测方法

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研究突变基因的方法

研究突变基因的方法

研究突变基因的方法1. 深度测序:使用高通量测序技术对基因组进行全面测序,发现突变基因的特征及其在个体中的分布情况。

2. 基因组学研究:采用基因组学技术对大规模样本进行研究,分析突变基因与疾病关联性及其对个体特征的影响。

3. 基因编辑技术:利用CRISPR/Cas9或其他基因编辑工具对候选基因进行编辑,观察突变对基因功能的影响,从而了解其生物学功能。

4. 蛋白质组学:通过大规模的蛋白质组学研究,鉴定突变基因对蛋白质表达和调控的影响,探索其在细胞功能和信号转导中的作用。

5. 细胞模型:建立突变基因的细胞模型,观察其对细胞增殖、凋亡、分化等生物学过程的影响,以揭示其在疾病发生发展中的作用机制。

6. 功能基因组学研究:通过整合基因组、转录组、表观基因组等数据,探索突变基因对基因功能和调控网络的影响。

7. 代谢组学研究:分析突变基因对代谢产物的影响,揭示其与代谢疾病的关联性,并探究其潜在的治疗靶点。

8. 表观遗传学研究:分析突变基因对DNA甲基化、组蛋白修饰等表观遗传机制的影响,揭示其在疾病发生中的调控作用。

9. 组织工程技术:利用组织工程技术构建突变基因的组织模型,研究其在组织形态和功能上的变化,探索与疾病相关的分子机制。

10. 生物信息学分析:应用生物信息学方法对突变基因进行全面的生物信息学分析,揭示其在基因组水平的特征和影响。

11. 突变基因敲除动物模型:通过敲除突变基因构建动物模型,观察其在器官发育、功能和疾病模型中的作用。

12. 脑神经元细胞模型:建立突变基因在人工合成神经元模型中的表达,研究其对神经元的影响,揭示与神经系统疾病相关的分子机制。

13. 组织芯片技术:利用组织芯片技术研究突变基因在特定组织和细胞类型中的表达模式和功能影响。

14. 药物筛选实验:利用药物筛选实验研究突变基因对药物代谢、药物靶点敏感性等药理学特征的影响。

15. 大数据分析:利用大数据分析技术挖掘突变基因数据中的潜在关联和规律性,发现新的疾病相关基因。

临床常用基因突变及融合基因检查方法

临床常用基因突变及融合基因检查方法

临床常用基因突变及融合基因检查方法全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:临床常用基因突变及融合基因检查方法随着基因组学和分子生物学的发展,基因检测技术在临床诊断中的应用日益广泛。

基因突变和融合基因是许多疾病的发生和发展的关键因素,因此对其检测越来越受到重视。

本文将介绍一些临床常用的基因突变及融合基因检查方法,希望能够帮助读者更深入了解这一领域的知识。

1. PCR技术PCR技术是一种常用的基因检测方法,通过扩增特定基因片段,可以检测到基因的突变。

PCR技术具有高灵敏度和高特异性的优点,可以快速、准确地检测基因突变。

在临床诊断中,PCR技术经常用于检测与疾病相关的基因突变,如遗传性疾病、肿瘤等。

2. 高通量测序技术高通量测序技术是目前最流行的基因检测技术之一,可以同时测序大量基因,并快速高效地识别突变。

高通量测序技术具有高灵敏度、高准确性和高通量的优点,可以帮助医生更准确地诊断疾病,并指导个体化治疗方案的制定。

3. 质谱技术质谱技术是一种基于质量-电荷比的物质分析技术,可以用于检测DNA、RNA等生物分子。

质谱技术具有高灵敏度、高分辨率和高准确性的优点,可以用于检测基因突变、基因表达水平等,对于肿瘤的早期诊断和治疗、药物敏感性的评估等方面具有重要的意义。

1. FISH技术FISH技术是一种常用的融合基因检测方法,通过用荧光染料标记特定基因,可以直接观察到基因的融合情况。

FISH技术具有高分辨率、高灵敏度和高特异性的优点,可以帮助医生准确诊断某些特定的融合基因相关的疾病,如慢性髓性白血病、胃肠道间质瘤等。

在临床实践中,基因突变和融合基因的检测对于疾病诊断、治疗和预后评估具有重要的意义。

随着基因检测技术的不断发展和完善,相信在未来会有更多更高效、更精准的检测方法出现,为临床诊断和治疗带来更多的帮助和改善。

希望本文能为读者对基因突变及融合基因检查方法有更深入的了解和认识。

第二篇示例:临床常用基因突变及融合基因检查方法基因突变是指基因组中的某个基因发生了突变,使其序列发生了改变,导致基因的功能发生变化或失去功能。

突变检测方法

突变检测方法

突变检测方法随着科学技术的不断发展,基因突变成为生物学和医学研究中备受关注的问题。

因此,一种可靠的突变检测方法也变得越来越重要。

在这篇文章中,我们将讨论突变检测方法的相关知识,以及当前存在的一些问题和解决方案。

一、突变检测的背景突变是基因组序列中的变化,它可能由化学损伤、基因重组或其他因素引起。

突变可能会导致基因功能改变,从而影响个体的健康。

例如,许多癌症是由突变引起的。

因此,快速和准确地检测突变对于基因组学、生物医学研究和临床诊断都具有重要意义。

二、突变检测的方法当前,常用的突变检测方法包括Sanger测序、测序分析、PCR、电泳和基因芯片等。

这些方法在检测突变方面都有其优缺点。

1. Sanger测序Sanger测序是一种常用的基因序列测定方法,也可以用于突变检测。

该方法可以测定DNA序列的每一个碱基,从而准确地检测出基因组序列中的突变。

但该方法需要昂贵的仪器和复杂的数据分析过程,而且仅适用于小片段的DNA序列。

2. 测序分析测序分析结合物种遗传信息和功能特征,是发现新的功能序列元件和突变的有效方法。

高通量测序(HTS)技术结合测序分析能够快速有效地检测肿瘤突变和遗传突变,并且提供精准的突变定位信息。

3. PCRPCR是一种传统的基因检测方法,具有重复性好,灵敏度高等优点。

适用于低浓度DNA样品的检测,但该方法对PCR反应系统中的多种影响因素比较敏感。

4. 电泳电泳是一种检测DNA分子大小和电荷变化的常用工具,可用于检测DNA中的插入缺失和点突变。

但由于靶标区域太小或过于相似的序列同位素难以分离,从而会导致检测结果的不准确。

5. 基因芯片基因芯片是一种快速检测基因变异的方法。

它可以同时检测数万个基因变异,具有高通量和高效率的优点。

但该方法需要预先设计芯片,并需要DNA样品的预处理过程。

由于每种检测方法都有其优缺点,选择合适的检测方法也成为了突变检测中的难题。

三、突变检测的问题与解决方案突变检测中存在的一些问题包括:检测灵敏度不足、检测特异性不高、检测时间较长、检测结果不稳定等。

基因突变检测方法

基因突变检测方法

基因突变检测方法
基因突变检测主要有三种检测方法,即FISH检测、Ventana-D5F3 IHC检测和NGS检测。

基因突变检测方法的特点主要体现在以下几方面:
1、FISH:也称为荧光原位杂交技术,其检测的特异性和敏感性都比较高,也是ALK融合基因检测的金标准,因为FISH检测的技术要求比较高,所以也存在有自身问题,如在检测过程中,如果标本固定时间较长、烤片温度较高、变异性温度差异、蛋白消化不当等,就会引起荧光信号的减弱,或者没有信号,容易出现基因突变的假阴性或假阳性;
2、IHC:是一种免疫组化的检测方法,此方法操作比较简单、检测比较快速、经济成本较低,灵敏度较高。

因为对标本需求量较低、IHC检测高灵敏度、高特异性等优点,ALK检测共识中已经推荐优先应用;
3、NGS:也称为二代测序、高通量测序技术,这项检测在ALK基因检测中的地位越来越高,NGS检测能区分ALK突变的所有亚型以及ALK基因本身可能存在的点突变,在临床上可以指导医生后续用药,但是检测费用较贵,临床上主要推荐用于ALK靶向药物耐药的患者检测。

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法基因突变是指细胞中一些基因序列发生改变,影响了基因的正常功能。

这些突变可以是单个碱基的改变、插入或删除,也可以是基因内或基因间区域的结构改变。

基因突变可能是遗传的,也可能是后天的,是导致许多疾病的重要原因之一、因此,对基因突变进行准确的检测和分析对于预防、诊断和治疗疾病具有重要意义。

目前,常见的基因突变的检测方法主要有以下几种:1.直接测序法:直接测序法是一种最常用、最可靠的基因突变检测方法。

通过DNA测序技术,可以准确地检测出基因序列的每个碱基,从而发现可能存在的突变。

这种方法可以检测到单个碱基的点突变、小片段的插入或缺失等突变。

2.聚合酶链式反应(PCR):PCR是一种常用于扩增基因片段的方法,可以将DNA样本中的目标基因片段扩增到足够的数量,以便进行突变的分析。

PCR可以用于检测点突变、大片段缺失和插入等突变。

此外,PCR还可以与其他技术(例如限制性酶切、序列特异性引物放大、测序等)结合使用,增加突变检测的灵敏性和准确性。

3.变性梅毒凝胶电泳(DGGE):DGGE是一种分析DNA序列异质性的方法。

通过在电泳过程中使用梯度浓度的变性剂,可以将DNA样本中具有不同序列的片段分离开来。

通过比较样品与对照的DGGE图谱,可以检测到突变的存在和类型。

4.基因芯片技术:基因芯片技术是一种高通量基因突变检测方法。

基因芯片上携带了大量不同的探针,可以同时检测一系列基因的突变状态。

这种方法适用于筛查大规模的基因突变。

5.网络测序技术:网络测序技术是一种新兴的基因突变检测方法。

通过将DNA样本测序后上传至云端服务器,利用高效的计算机算法和庞大的数据库,可以分析和鉴定样本中的突变。

这种方法可以快速准确地检测大规模基因突变,适用于临床中的个性化医疗。

虽然以上列举了几种常见的基因突变检测方法,但需要注意的是,每种方法都有其优缺点,并且适用于不同类型的突变鉴定。

在实际应用中,常常需要结合多种方法进行综合分析和鉴定,以提高突变检测的准确性和可靠性。

人pole基因突变的新型测定方法及试剂与流程

人pole基因突变的新型测定方法及试剂与流程

人pole基因突变的新型测定方法及试剂与流程【原创版4篇】《人pole基因突变的新型测定方法及试剂与流程》篇1目前,关于人pole 基因突变的新型测定方法、试剂及流程尚处于研究阶段。

pole 基因突变与多种疾病相关,如癌症、自身免疫性疾病等。

然而,现有的检测方法在灵敏度、特异性和精确度等方面仍有待提高。

因此,研究人员正在努力开发更先进、高效的检测方法。

在新型测定方法的研究中,可能包括以下几种技术:1. 高通量测序(NGS):通过检测基因组DNA 序列,发现pole 基因的突变。

这种方法具有高灵敏度和高通量,可同时检测多个样本。

2. 基因芯片:利用基因芯片对pole 基因进行检测,具有快速、简便、高灵敏度等优点。

3. 质谱分析:通过质谱分析技术,检测pole 基因突变导致的蛋白质表达异常。

这种方法具有高精度,但操作较为复杂。

试剂方面,可能包括:1. 核酸提取试剂盒:从样本中提取DNA,进行后续检测。

2. 聚合酶链反应(PCR)试剂盒:对pole 基因的特定区域进行扩增,以便进行后续检测。

3. 基因测序试剂盒:用于对pole 基因进行高通量测序。

检测流程可能包括以下步骤:1. 收集样本:获取患者血液、组织等样本。

2. 核酸提取:使用核酸提取试剂盒从样本中提取DNA。

3. PCR 扩增:使用PCR 试剂盒对pole 基因的特定区域进行扩增。

4. 高通量测序:将扩增后的DNA 进行高通量测序,发现pole 基因突变。

5. 数据分析:对测序结果进行生物信息学分析,确认pole 基因突变的类型和位点。

6. 质谱分析:对突变导致的蛋白质表达异常进行质谱分析,以进一步确认突变的功能影响。

7. 结果解读:根据检测结果,为患者提供诊断和治疗建议。

《人pole基因突变的新型测定方法及试剂与流程》篇2目前,关于人pole 基因突变的新型测定方法及试剂尚处于研究阶段。

然而,已经出现了一些用于检测基因突变的常见方法,例如Sanger 测序、高通量测序(如NGS)等。

基因突变检测内容

基因突变检测内容

基因突变检测内容介绍基因突变检测是一种通过分析个体基因组中的突变,来了解个体是否携带有害突变或遗传疾病的方法。

本文将详细探讨基因突变检测的相关内容,包括检测方法、应用领域、优势和限制等,旨在帮助读者全面了解基因突变检测的重要性和应用前景。

一、基因突变检测方法基因突变检测有多种方法,包括单倍型分析、酶切位点变异分析、测序技术和PCR扩增等。

这些方法根据突变类型和检测需求的不同,选择不同的策略来进行基因突变分析。

1. 单倍型分析单倍型分析是通过检测个体基因组上的特定位点的单倍型(allele)来确定基因型。

常用的单倍型分析方法包括限制性片段长度多态性(RFLP)和序列特定引物扩增(SSP)。

这些方法通常用于检测单个核苷酸多态性(SNPs)或小片段的插入/缺失等突变。

2. 酶切位点变异分析酶切位点变异分析是通过检测特定基因上的酶切位点是否发生变异来判断个体是否存在突变。

这种方法常用于检测大片段插入/缺失和染色体重排等结构变异。

在此方法中,关键是选择合适的酶切位点和适当的酶切酶进行检测。

3. 测序技术测序技术是最常用的基因突变检测方法之一。

通过对整个基因组或特定基因进行测序,可以检测到基因组中所有可能的突变类型。

目前,常用的测序技术包括Sanger测序、下一代测序(NGS)和单分子测序等。

4. PCR扩增PCR扩增是一种常用的突变检测方法,通过特定序列的扩增来检测基因组中的突变。

PCR扩增可以用于检测单个核苷酸多态性、小片段插入/缺失以及基因的重复序列等突变。

此外,PCR扩增也可用于基因组的特定区域富集,以便后续测序分析。

二、基因突变检测的应用领域基因突变检测在医学、生物学和遗传学等领域有着广泛的应用。

下面将分别探讨其在这些领域中的具体应用。

1. 医学应用基因突变检测在医学中的应用非常广泛。

它可以用于遗传性疾病的诊断和预测。

通过检测个体基因组中与特定疾病相关的突变,可以及早发现患者的病情并制定相应的治疗方案。

基因组学研究中的突变检测与分析实验报告

基因组学研究中的突变检测与分析实验报告

基因组学研究中的突变检测与分析实验报告【引言】基因组学研究是一个重要的领域,通过研究DNA序列中的突变信息,我们可以了解到基因突变对人类健康以及疾病发生的影响。

本实验旨在讨论基因组学研究中突变检测与分析的方法和实验结果。

【实验方法】1. DNA样本提取:我们从10名志愿者手部采集细胞样本,并使用DNA提取试剂盒按照说明书提取DNA。

2. PCR扩增:通过聚合酶链式反应(PCR)扩增目标基因区域。

我们设计了一对引物来选择性扩增我们感兴趣的基因区域。

PCR条件设置为:初始变性(95℃,5分钟),循环反应(95℃,30秒;56℃,30秒;72℃,30秒),最终延长(72℃,10分钟)。

3. 凝胶电泳:将PCR反应产物与DNA分子量标准物质一同加载到1%琼脂糖凝胶中进行电泳,以观察扩增产物的大小和纯度。

【结果与讨论】我们成功提取了10名志愿者的DNA样本,并进行了PCR扩增反应。

经凝胶电泳分析,我们发现所有样本均得到了预期大小约为500bp的PCR产物,说明PCR反应成功。

这也意味着我们成功地选择性扩增了我们感兴趣的基因区域。

在进一步的突变检测与分析中,我们采用了两种常见的方法:Sanger测序和Next Generation Sequencing(NGS)。

1. Sanger测序:我们从PCR产物中选择了5名志愿者的样本进行Sanger测序。

通过测序分析,我们检测到了一名志愿者的样本中存在一个已知的多态性突变,这与该志愿者的个人医疗史相符。

该突变是一种单核酸多态性(SNP),在基因座位的一对碱基上存在不同的碱基对。

我们对此突变进行了进一步的调查,并发现它与某种常见疾病的发生有关。

2. Next Generation Sequencing(NGS):我们选取了另外5名志愿者的样本进行NGS分析。

NGS是一种高通量测序技术,可以快速检测大量的突变信息。

通过NGS分析,我们发现了每位志愿者不同的突变谱系,包括单核酸多态性(SNPs)、插入、缺失和结构变异等。

检验科常见遗传性疾病检测方法

检验科常见遗传性疾病检测方法

检验科常见遗传性疾病检测方法遗传性疾病是指由遗传因素引起的疾病,它们可由异常基因或染色体异常所引起,包括单基因遗传病、染色体异常病和多因素遗传病等。

近年来,随着遗传学和分子生物学的不断发展,检验科常见遗传性疾病的检测方法也得到了极大的改善和突破。

本文将介绍几种常见的遗传性疾病检测方法。

一、基因突变检测方法基因突变是许多遗传性疾病的主要病因之一,准确检测基因突变对于早期预防、确诊和治疗具有重要意义。

常见的基因突变检测方法包括聚合酶链式反应(PCR)、限制性片段长度多态性分析(RFLP)、序列特异性引物扩增(SSP)和全基因组测序等。

这些方法通过检测基因的突变位点来确定是否携带异常基因,从而判断个体是否患有相关遗传性疾病。

二、染色体核型分析染色体异常是导致许多染色体异常病的重要原因。

染色体核型分析可以通过染色体的数量和结构来判断个体是否存在染色体异常。

目前常用的染色体核型分析方法包括常规染色体分析、高分辨率染色体分析和荧光原位杂交(FISH)等。

这些方法可以检测到染色体数目变异、核型异常和染色体片段的丢失或重复等异常情况,对于染色体异常病的确诊和预防具有重要意义。

三、蛋白质检测方法蛋白质是构成生物体的重要组成部分,许多遗传性疾病与蛋白质的合成、稳定性和功能异常有关。

蛋白质检测是一种常见的遗传性疾病检测方法,常用的蛋白质检测技术包括免疫印迹、质谱分析和酶联免疫吸附实验等。

通过检测特定蛋白质的表达水平和功能异常来判断个体是否患有相关遗传性疾病。

四、基因组学检测方法基因组学是研究个体所有基因组的学科,它通过全基因组测序、基因组关联分析和基因组编辑等技术,对遗传性疾病的发生机制和预测进行全面深入的研究。

基因组学检测方法已经成为了检测科学研究和临床医学中不可或缺的手段。

通过对个体基因组的全面分析,可以发现与遗传性疾病相关的新基因和突变位点,为疾病的预防、治疗和个体化医疗提供重要依据。

总结:随着科技的发展和进步,检验科常见遗传性疾病的检测方法也在不断更新和完善。

基因突变知识点总结

基因突变知识点总结

基因突变知识点总结基因突变是指在生物体的基因组中发生的突发性变异。

突变可能是由于DNA序列的改变、插入、删除或重排引起的。

它们对生物体的遗传物质产生了重要的影响,并且在进化和遗传疾病的研究中具有重要意义。

本文将对基因突变的一些关键知识点进行总结。

一、基因突变类型1. 点突变:指单个核苷酸的改变,包括错义突变、无义突变和同义突变。

错义突变是指导致氨基酸改变的突变,可能对蛋白质结构和功能产生重要影响。

无义突变则导致产生无效的早终止密码子,使蛋白质无法正常合成。

同义突变是指改变了DNA序列,但没有改变氨基酸序列。

2. 编码区突变:发生在基因的编码区,可能影响蛋白质的结构和功能。

这种突变可以导致单个蛋白质变体的产生,对生物体的表型产生重要影响。

3. 非编码区突变:发生在基因的非编码区,如启动子、增强子、剪接位点等。

这些突变可能导致基因的表达水平的改变,进而影响蛋白质的合成。

4. 染色体结构变异:这些变异包括插入、缺失和倒位等,是染色体上较大范围的突变。

染色体结构变异可能导致某些基因的重排,影响其表达水平。

二、基因突变的影响1. 遗传疾病:某些突变可以导致遗传疾病的发生。

例如,囊性纤维化是由导致蛋白质功能异常的突变引起的,该突变使得粘液在呼吸道和消化道中异常黏稠,影响器官的正常功能。

2. 进化:基因突变是进化过程中的重要因素。

突变可以导致新的基因型和表型的产生,并且在自然选择中起到关键作用。

有利突变有助于个体在环境中生存和繁殖,从而使其传递给后代。

3. 药物抗性:基因突变可能引起对药物治疗的耐药性。

某些基因的突变可以影响药物在体内的代谢和吸收,从而导致药物无效或变得不再适合治疗。

三、基因突变的检测方法1. 基因测序:基因测序是检测基因突变的主要方法之一。

通过测序技术,可以获得DNA序列信息,并发现其中的突变。

2. 多态性标记分析:多态性标记是指基因组中存在多种等位基因的位点。

通过分析这些多态性标记,可以间接检测基因突变。

检测耐药基因突变的金标准

检测耐药基因突变的金标准

检测耐药基因突变的金标准
检测耐药基因突变的方法可以根据疾病和基因突变的特定情况而有所不同。

以下是一些常见的方法和标准:
1. 基因测序(DNA测序):通过对患者样本中与耐药相关的基因进行测序,可以检测到具体的基因突变。

这种方法可以准确地确认特定基因的突变,但耗时较长且费用较高。

2. 蛋白质测序(蛋白质质谱分析):通过测量患者样本中耐药相关蛋白质的水平和结构变化,可以间接地推断是否存在耐药基因突变。

这种方法通常用于确定蛋白质相关的耐药机制。

3. 定量PCR(qPCR):通过量化耐药相关基因的拷贝数来推断耐药基因突变的存在。

这种方法可以快速、灵敏地检测到基因拷贝数的变化,但无法准确地确定具体的基因突变。

4. 组织培养和药敏试验:通过将患者样本中的微生物培养起来,并测试其对不同抗生素的敏感性,可以确定具体的耐药基因突变。

这种方法通常用于细菌等微生物的耐药检测。

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法基因突变是指基因序列发生了改变,包括点突变(例如单核苷酸突变、缺失、插入等)和结构变异(例如片段缺失、增加、倒位、易位等)。

这些突变可能对人体的健康产生重大影响,如导致遗传性疾病的发生或对药物敏感性造成改变。

因此,基因突变的检测对于疾病诊断、预测和个体化治疗至关重要。

目前,基因突变的检测方法主要包括以下几种:1. 直接测序法:这是一种最常用的方法,通过测序技术直接对基因序列进行确定。

例如,通过Sanger测序技术对特定基因进行首选外显子的测序,以便检测点突变或小片段缺失插入。

2. SNP芯片技术:SNP(Single Nucleotide Polymorphism)芯片技术能够同时检测多个SNP位点。

通过这种方法,可以快速高效地测定有数千个SNP位点的基因组范围内的突变情况。

3. 基因组测序:全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS)和全外显子测序(Whole Exome Sequencing,WES)是最全面的基因突变检测方法。

WGS对整个基因组进行测序,包括编码区域和非编码区域,可以全面检测基因组的突变情况。

而WES则主要关注外显子区域,这是人类基因组中编码蛋白质所必需的一部分。

4. FISH技术:FISH (Fluorescence In Situ Hybridization)技术通过标记染色体上的特定序列进行检测。

这种技术可以用于检测染色体结构变异、基因扩增、转座等。

FISH技术能够提供与直接观察、定位和评估染色体关联的一些特定突变的信息。

5. PCR技术:PCR(Polymerase Chain Reaction)技术可以放大DNA 片段,从而使得检测突变更容易。

这种技术可以用于检测具体的点突变、小片段的缺失或插入。

6. 基于高通量测序的技术:近年来,新一代测序技术的快速发展为基因突变检测提供了更高效和经济的方法。

例如,靶向测序技术(Targeted Sequencing)可以选择性地测定特定的基因或基因组区域,从而降低成本和分析难度。

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法基因突变指的是基因序列发生了改变,可能产生遗传性疾病或影响个体的生理功能。

因此,准确、高效地检测基因突变对于研究人类疾病、诊断和治疗非常重要。

随着科技的发展,一系列的基因突变检测方法得以应用并不断完善。

1. PCR(聚合酶链式反应)PCR是一种常用的基因突变检测方法。

它基于DNA的复制过程,通过放大目标基因区域(包括突变位点)的DNA序列,可以使低浓度的突变基因片段被检测到。

PCR方法快速、高灵敏度,但在某些情况下可能面临突变频率低或特定基因区域难以扩增的挑战。

2. 基因测序技术基因测序技术是一种通过直接读取DNA序列来检测基因突变的方法。

Sanger测序是最早应用的测序技术,通过荧光标记的倍位链终止剂和电泳分离,可精确测定突变的碱基。

然而,Sanger测序的速度较慢,对于大规模的测序任务不够高效。

近年来,高通量测序技术的出现,例如Illumina测序、Ion Torrent测序等,使得基因组的测序更加快速和经济。

这些技术的发展使得大规模基因突变检测成为可能。

3. 基因芯片技术基因芯片技术是一种高通量的基因突变检测方法。

这种方法利用固相芯片上特定的探针,针对已知的突变位点进行杂交反应。

根据探针与待测样品中的DNA序列的互补程度,可以判断是否存在突变。

基因芯片技术的优点是可以一次检测多个基因位点,并且速度相对较快。

然而,缺点是芯片设计需要事先知道可能突变位点的信息,对于未知突变的检测无能为力。

4. 筛查方法除了上述的特定突变位点检测方法,筛查方法可以用于对大规模的突变进行初步的筛查。

例如,全基因组关联研究(GWAS)通过比较大量的基因样本与突变频率,来寻找与遗传病相关的基因突变。

全外显子组测序(WES)则通过测定编码蛋白质的基因序列,以确定突变位点。

综上所述,基因突变的检测方法多种多样,每种方法都有其特点和适用范围。

因此,选择合适的方法取决于科研或临床的具体需求,如检测的目标基因、样本数量和时间要求等。

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法

基因突变的检测方法基因突变的检测方法基因突变的研已成为当今生命科学研究的热点之一,检测方法也随之迅速发展。

人类细胞癌基因的突变类型已如上所述,对于基因突变的检测,1985以前,利用Southern印迹法,可以筛选出基因的缺失、插入和移码重组等突变形式。

对于用该法法不能检测的突变,只能应用复杂费时的DNA序列测定分析法。

多聚酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术是突变研究中的最重大进展,使基因突变检测技术有了长足的发展,目前几乎所有的基因突变检测的分子诊断技术都是建立于PCR的基础之上,并且由PCR衍生出的新方法不断出现,目前已达二十余种,自动化程度也愈来愈高,分析时间大大缩短,分析结果的准确性也有很大很提高。

其中包括单链构象多态性(single-strand comformational polymorphism,SSCP)和异源双链分析法(heteroduplex analysis,HA)。

下面分别介绍几种PCR衍生技术及经典突变检测方法,可根据检测目的和实验室条件选择时参考。

PCR-SSCP法PCR-SSCP法是在非这性聚丙烯酰胺凝胶上,短的单链DNA和RNA分子依其大街基序列不同而形成不同构象,一个碱基的改变将影响其构象而导致其在凝胶上的移动速度改变。

其基本原理为单链DNA在中性条件下会形成二级结构,这种二级结构依赖于其碱基组成,即使一个碱基的不同,也会形成不同的二级结构而出刺同的迁移率。

由于该法简单快速,因而被广泛用于未知基因突变的检测。

用PCR-SSCP法检测小于200bp的PCR产物时,突变检出率可达70%-95%,片段大于400bp时,检出率仅为50%左右,该法可能会存在1%的假阳性率。

应用PCR-SSCP法应注意电泳的最佳条件,一般突变类型对检测的灵敏度无大的影响,同时该法不能测定突变的准确位点,还需通过序列分析来确定。

Sarkar等认为对于大于200bp的片段,用其RNA分子来做SSCP会提高其录敏度。

第八章基因突变监测

第八章基因突变监测

可以预计,在 21世纪,新的高灵敏度、高检测密度、高输出量的突变 检测技术将使遗传性和非遗传性的基因突变的鉴定成为现实。基因治疗的 成功将根本性的改变医疗实践,分子医学的新时代已经来临。

结:
1.基因突变扫描方法有哪些?其基本程序是什么? 2.简述序列分析的大体步骤?
(二)突变诊断方法 1. 序列分析 第一代序列分析技术:以凝胶电泳为基础 第二代的技术包括高压毛细管电泳、超薄电泳和共振离子化光谱分析。 这些方法可使分析速度提高一个数量级。 第三代方法包括流氏细胞光度术对单个标记的碱基进行荧光检测。用 扫描隧道或原子力显微镜直接读出 DNA 序列。对 DNA 进行序列质谱 分析。用杂交法进行序列分析等。这些方法将使序列分析的效率提高 几个数量级,但是,实验方法需要不断成熟与完善。 DNA序列分析方法既是一种突变扫描方法,更是一种突变诊断方法。 对未知的突变来说,必须通过序列分析类鉴定突变的类型和位置。
第八章 基因突变的检测
方法与进展
(一) 突变扫描方法 1. 单链构象多样分析法(SSCP) 其原理在于在非变性条件下一个单链DNA分子会依据其碱基序 列而形成独特的构象。一个单一碱基变化就会引起其构象的改变。 因此,当这两个分子同时在非变性条件下电泳时,他们会出现在 不同的位置,从而区分开来。由于DNA是双链分子,在电泳图谱 上就会出现两条正常带和两条突变带。
一些与疾病相关的基因探针在不断地出现,在不久的将来会有更大容量的基 因探针问世。
随着疾病基因的不断发现,今后的研究将不再局限于确定单个基因产 物对一两个基因的调控,而是要了解一个基因及其突变体在细胞水平上对 所有基因表达的影响。只有通过这样的实验研究才能全面确定一个突变基 因如何在细胞内改变基因表达的标志,从而引起细胞分裂的失控(癌症), 细胞坏死(衰老),细胞代谢的紊乱等等。为了达到这个目的,一些新技 术在不断涌现,如DNA微型组合技术就是 将寡聚核苷酸或cDNA片段固定 到玻璃片上,然后用DNA杂交来观察其基因转录情况。另一种大规模分析 基因转录的方法称为基因表达的系列分析法(SAGE)。其原理是用两个 内切酶将每一个cDNA缩短成10-14各碱基的序列标签,然后用DNA连接酶 连接这些小的标签。在PCR扩增和酶切后,再将这些序列标签连接起来, 通过克隆和序列分析来鉴定基因表达。(详见相关文献)

检测基因点突变的方法

检测基因点突变的方法

检测基因点突变的方法
检测基因点突变的方法有多种,常见的方法包括:
1. PCR扩增法:PCR是一种分子生物学技术,可用于扩增DNA片段。

在检测基因点突变时,可根据已知的突变位点设计适当的引物,通过PCR扩增得到目标基因的片段,然后对扩增产物进行测序,以检测该位点是否发生了突变。

2. 基因芯片技术:基因芯片是一种高通量检测技术,可以同时检测上千个基因位点。

在检测基因点突变时,将待检测样本中的DNA片段杂交到含有数千个不同基因探针的芯片上,经过染色体成像和数据分析,可以得出样本中每个位点的基因型。

3. NGS技术:全称为“下一代测序技术”,是一种高通量测序技术。

NGS可以快速、准确地测序整个基因组或特定基因区域,从而检测基因点突变。

4. Sanger测序法:Sanger测序法是一种传统的测序技术,通过反复扩增、合成和分离DNA 片段来确定DNA序列。

在检测基因点突变时,可以使用Sanger测序法对目标基因的特定区域进行测序,从而检测该区域是否发生了突变。

总之,以上方法都有其优缺点,选择合适的方法需要考虑到样本数量、检测精度、成本等多个因素。

mk突变检验原理

mk突变检验原理

mk突变检验原理MK突变检验原理是一种用于检测基因突变的分子生物学技术。

它基于PCR扩增技术和DNA测序技术,可以快速、准确地检测出基因中的突变。

本文将从MK突变检验的原理、应用和优缺点等方面进行阐述。

一、MK突变检验的原理MK突变检验是一种基于PCR扩增技术的突变检测方法。

它利用PCR扩增目标基因的片段,然后通过DNA测序技术来确定突变的存在与否。

具体步骤如下:1. 样品处理:首先,需要从样品中提取出目标基因的DNA。

常用的提取方法包括酚/氯仿法、盐法和商业化的DNA提取试剂盒等。

2. PCR扩增:将提取的DNA作为模板,利用特异性引物在PCR反应中扩增出目标基因的片段。

引物的设计需要根据目标基因的序列进行合理选择,以确保扩增的特异性和效率。

3. PCR产物纯化:将PCR反应产物进行纯化,去除杂质和未反应的引物、引物二聚体等。

4. DNA测序:将纯化的PCR产物送至测序机构进行DNA测序,获得目标基因片段的序列信息。

5. 数据分析:通过比对测序结果与参考序列,分析目标基因中是否存在突变。

常用的序列比对软件有BLAST、CLUSTAL等。

二、MK突变检验的应用MK突变检验可以广泛应用于基因突变的检测和分析。

以下是一些常见的应用场景:1. 遗传病筛查:MK突变检验可以用于遗传病的筛查,帮助确定致病基因的突变类型和位置。

通过检测突变基因可以帮助家庭了解遗传病的风险,进行遗传咨询和生殖选择。

2. 药物敏感性检测:MK突变检验可以用于检测肿瘤细胞中的突变基因,帮助确定肿瘤对某些药物的敏感性。

这对于个体化药物治疗的选择具有重要意义。

3. 病原体检测:MK突变检验可以应用于病原体的检测,帮助确定病原体的种类和毒力因子的变异情况。

这对于疾病的防控和诊断具有重要意义。

4. 基因编辑验证:MK突变检验可以用于验证基因编辑技术的效果。

通过检测编辑后的基因序列,可以判断是否成功实现了目标基因的修饰。

三、MK突变检验的优缺点MK突变检验作为一种常用的突变检测技术,具有以下优点:1. 高灵敏度:MK突变检验可以检测到非常低浓度的突变基因,对于突变的敏感性较高。

基因突变检测技术简介

基因突变检测技术简介

基因突变检测技术简介基因突变检测技术是一种用于检测个体基因组中突变的方法。

基因突变是指基因序列发生的变异,可分为点突变、插入和缺失等多种类型。

这些突变可能与遗传性疾病、癌症等疾病的发生有关。

基因突变检测技术的发展,为疾病治疗和预防提供了重要依据。

现今,基因突变检测技术主要应用在两个领域:遗传病筛查和肿瘤突变检测。

在遗传病筛查中,基因突变检测技术广泛应用于新生儿筛查和遗传咨询。

新生儿筛查旨在在婴儿出生后尽早发现可治疗的遗传病。

通过分析婴儿的基因组,可以及早识别出导致遗传性疾病的突变基因,从而及时采取干预措施。

遗传咨询是指向具备遗传病风险的个体提供遗传咨询,帮助他们了解潜在风险,并制定适当的生育计划和预防措施。

基因突变检测技术可通过对个体基因组进行测序,发现其中存在的潜在疾病风险基因,从而提供个性化的遗传咨询。

在肿瘤突变检测领域,基因突变检测技术具有重要的意义。

肿瘤是基因突变导致的一类疾病,通过检测肿瘤细胞中的突变基因,可以实现肿瘤的早期诊断、分型、分级以及预后评估。

同时,肿瘤突变检测还可以指导个体化治疗的选择。

以肺癌为例,肺癌患者的基因突变情况会影响对特定药物的敏感性,通过检测突变基因,可以选择最有效的药物治疗方案,提高治疗效果。

目前,常用的基因突变检测技术包括PCR、Sanger测序、下一代测序(NGS)等。

PCR(聚合酶链式反应)技术是一种高度敏感的突变检测方法。

利用PCR技术可以扩增目标基因或特定片段,通过检测扩增产物的变异位点,确定是否存在突变。

PCR技术具有高度特异性和敏感性的优点,广泛应用于突变的快速检测。

Sanger测序是一种经典且广泛应用的突变检测技术。

该技术通过测序反应逐个回顾目标片段的碱基序列。

当一个碱基被修饰时,会生成特定的信号,从而识别突变位点。

Sanger测序技术具有较高的准确性和可靠性,是突变检测的金标准技术。

下一代测序(NGS)是一种高通量测序技术,已逐渐成为基因突变检测的主流技术。

基因突变检测

基因突变检测

基因突变检测基因突变检测是一种重要的分子生物学技术,它可以用于检测个体体内的基因突变情况。

基因突变是指由于DNA序列发生改变而导致基因功能发生变异的现象。

在人类的遗传疾病中,许多疾病都与基因突变密切相关。

因此,基因突变检测具有较高的临床应用价值。

本文将重点介绍基因突变检测的原理、方法和应用领域。

一、基因突变检测的原理基因突变检测的原理基于对基因序列的分析和比较,通过测定样本的DNA序列来鉴定其是否存在突变。

常见的基因突变包括点突变、插入突变、缺失突变和倒位突变等。

在进行基因突变检测时,我们通常通过PCR扩增或测序等方法对特定的基因区域进行分析,以确定基因是否发生了突变。

二、基因突变检测的方法1. PCR扩增法PCR扩增法是一种常用的基因突变检测方法,它能够在很短的时间内扩增出特定的DNA片段。

通过PCR扩增后,可以使用限制性内切酶酶切分析或直接测序等方法,对扩增产物进行检测。

PCR扩增法具有快速、敏感、特异性高等优点,广泛应用于基因突变的检测。

2. Sanger测序法Sanger测序法是一种广泛应用的基因测序方法,它利用DNA聚合酶合成新链时,加入ddNTP(dideoxynucleotide triphosphate)进入反应体系,从而终止合成链的延伸,形成长度不同的DNA片段。

通过电泳分离这些DNA片段,就可以得到原始序列信息。

Sanger测序法具有准确性高、稳定可靠等优点,在基因突变检测中得到广泛应用。

3. 下一代测序法下一代测序法是近年来发展起来的新一代测序技术,它通过高通量平台,可以在较短的时间内同时测序大量的DNA片段。

下一代测序法拥有高通量、高灵敏度和高分辨率等优势,被广泛应用于基因突变的检测。

它能够更好地满足临床需求,并在基因突变的诊断和治疗中发挥重要作用。

三、基因突变检测的应用领域基因突变检测在医学研究和临床实践中具有广泛的应用。

以下是一些常见的应用领域:1. 遗传疾病的诊断和筛查基因突变与许多遗传疾病有着密切的关系。

基因突变与遗传疾病的诊断方法

基因突变与遗传疾病的诊断方法

基因突变与遗传疾病的诊断方法遗传疾病是由基因突变引起的疾病,其对人类健康和生命质量产生了严重的影响。

随着科学技术的发展,基因突变的诊断方法也得到了极大的进步和发展。

本文将介绍一些常见的基因突变与遗传疾病的诊断方法,以及它们在临床实践中的应用。

一、核酸序列分析核酸序列分析是一种常见的基因突变诊断方法。

它通过对疾病相关基因的DNA序列进行测定和分析,来确定是否存在基因突变。

这种方法的优势在于可以准确地验证基因突变的类型和位置,从而为疾病的早期诊断提供重要依据。

目前,核酸序列分析已经在许多遗传疾病的诊断中得到了广泛应用。

二、基因组测序基因组测序是一种高通量测序技术,可以对个体的整个基因组进行测序和分析。

通过对基因组的测序,可以发现遗传疾病相关基因的突变情况,从而为疾病的诊断和治疗提供重要的信息。

基因组测序技术的不断发展,使得大规模基因突变筛查成为可能,为遗传疾病的早期诊断和个体化治疗打下了坚实基础。

三、PCR(聚合酶链式反应)PCR是一种高效、敏感的DNA扩增技术,被广泛应用于基因突变的检测与诊断。

通过PCR技术,可以在短时间内扩增出特定基因片段,从而检测其中的突变情况。

PCR技术的优势在于可以快速、准确地检测出基因的突变,并且可以在微量样本中进行分析。

因此,PCR技术成为了遗传疾病诊断中常用的方法之一。

四、扩增基因位点分析扩增基因位点分析是一种针对已知突变位点进行检测的方法。

通过引物的设计和PCR扩增的方式,可以精确地筛查出特定位点中的突变情况。

扩增基因位点分析的优势在于可以快速、准确地检测出特定基因位点的突变,为遗传疾病的诊断提供了可靠的依据。

综上所述,基因突变与遗传疾病的诊断方法包括核酸序列分析、基因组测序、PCR以及扩增基因位点分析等。

这些方法在临床实践中的应用为遗传疾病的早期诊断和个体化治疗提供了重要的技术支持。

随着科学技术的不断进步,相信未来基因突变的诊断方法还会得到更加精确和高效的发展,为保障人类健康做出更大的贡献。

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基因突变的检测方法基因突变的研已成为当今生命科学研究的热点之一,检测方法也随之迅速发展。

人类细胞癌基因的突变类型已如上所述,对于基因突变的检测,1985以前,利用Southern印迹法,可以筛选出基因的缺失、插入和移码重组等突变形式。

对于用该法法不能检测的突变,只能应用复杂费时的DNA序列测定分析法。

多聚酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术是突变研究中的最重大进展,使基因突变检测技术有了长足的发展,目前几乎所有的基因突变检测的分子诊断技术都是建立于PCR的基础之上,并且由PCR衍生出的新方法不断出现,目前已达二十余种,自动化程度也愈来愈高,分析时间大大缩短,分析结果的准确性也有很大很提高。

其中包括单链构象多态性(single-strand comformational polymorphism,SSCP)和异源双链分析法(heteroduplex analysis,HA)。

下面分别介绍几种PCR衍生技术及经典突变检测方法,可根据检测目的和实验室条件选择时参考。

PCR-SSCP法 PCR-SSCP法是在非这性聚丙烯酰胺凝胶上,短的单链DNA和RNA分子依其大街基序列不同而形成不同构象,一个碱基的改变将影响其构象而导致其在凝胶上的移动速度改变。

其基本原理为单链DNA在中性条件下会形成二级结构,这种二级结构依赖于其碱基组成,即使一个碱基的不同,也会形成不同的二级结构而出刺同的迁移率。

由于该法简单快速,因而被广泛用于未知基因突变的检测。

用PCR-SSCP法检测小于200bp的PCR产物时,突变检出率可达70%-95%,片段大于400bp时,检出率仅为50%左右,该法可能会存在1%的假阳性率。

应用PCR-SSCP法应注意电泳的最佳条件,一般突变类型对检测的灵敏度无大的影响,同时该法不能测定突变的准确位点,还需通过序列分析来确定。

Sarkar等认为对于大于200bp的片段,用其RNA分子来做SSCP会提高其录敏度。

应用PCR-SSCP检测点突变已见报道于人类大部分的肿瘤组织或细胞,如乳腺癌、食管癌、肺癌、胃癌、肝癌、胰腺癌等。

检测的基因包括多种癌基因及抑癌基因,也是检测抑癌基因p53突变最常用的方法,仅检测第5-8外显子即可发现85%以上的p53基因突变。

由于该法简便快速,特别适合大样本基因突变研究的筛选工作。

异源双链分析法(HA) HA法直接在变性凝胶上分离杂交的突变型一野生型DNA双链。

由于突变和野生型DNA形成的异源杂合双链DNA在其错配处会形成一突起,在非变性凝胶中电泳时,会产生与相应的同源双DNA不同的迁移率。

该法与SSCP相似,所不同的是SSCP分离的是单链DNA,HA法分离的是双链DNA,也只适合于小片段的分析。

但HA对一些不能用SSCP 检出的突变有互补作用,两者结合使用,可使突变检出率提高到近100%。

突变体富集PCR法(mutant-enriched PCR)本法的基本原理是利用ras基因家族某个密码子部位存在已知的限制性内切酶位点,如K-ras基因第12密码子的BstNI位点,第13密古巴子有BgⅠⅡ位点。

用链续二次的巢式PCR来扩增包括K-ras第12、13密码子的DNA片段,在两次扩增反应之间用相应的内切酶消化扩增的DNA片段,野生型因被酶切而不能进入第二次PCR扩增,而突变型则能完整进入第二次PCR扩增并得到产物的富集。

变性梯度凝胶电泳法(denaturing gradinent electrophoresis,DGGE) DGGE法分析PCR 产物,如果突变发生在最先解链的DNA区域,检出率可达100%,检测片段可达1kb,最适围为100bp-500bp。

基本原理基于当双链DNA在变性梯度凝胶中进行到与DNA变性湿度一致的凝胶位置时,DNA发生部分解链,电泳适移率下降,当解链的DNA链中有一个碱基改变时,会在不同的时间发生解链,因影响电泳速度变化的程而被分离。

由于本法是利用温度和梯度凝胶迁移率来检测,需要一套专用的电泳装置,合成的PCR引物最好在5`末端加一段40bp-50bp的GC夹,以利于检测发生于高熔点区的突变。

在DGGE的基础上,又发展了用湿度梯度代替化学变性剂的TGGE法(温度梯度凝胶电泳temperature gradient gelelectrophoresis,TGGE)。

DGGE和TGGE均有商品化的电泳装置,该法一经建立,操作也较简便,适合于大样本的检测筛选。

化学切割错配法(chemical cleavage of mismatch,CCM)CCM为在Maxam-Gilbert测序法的基础上发展的一项检测突变的技术,其检测突变的准确性可与DNA测序相仿。

其基本原理为将待测含DNA片段与相应的野生型DNA片段或DNA和RNA片段混俣变性杂交,在异源杂合的双链核酸分子中,错配的C能被羟胺或哌啶切割,错配的T能被四氧化饿切割,经变性凝胶电泳即可确定是否存在突变。

该法检出率很高,也是检片段最长的方法,已有报功检测了片段,如果同时对正、反义链进行分析,检出率可达100%。

应用荧光检测系统可增强敏感度,可检测到10个细胞中的1个突变细胞。

该法中的化学试剂有毒,又发展了碳二亚胺检测法(catodiimide,CDI),CDI为无毒物质,也可检测大片段DNA的点突变。

等位基因特异性寡核苷酸分析法(allele-specific oligonucleotide,ASO) ASO为一种以杂交为基础对已知突变的检测技术。

以PCR和ASO相结合,设计一段20bp左右的寡核苷酸片段,其中包含了发生突变的部位,以此为探针,与固定在膜上的经PCR拉增的样品DNA杂交。

可以用各种突变类型的寡核苷酸探针,同时以野生型探针为对照,如出现阳性杂交带,则表运河样品中存在与该ASO探针相应的点突变,ASO需严格控制杂交条件和设置标准对照避免假阳性和假阴性。

目前已有商品化的检测盒检测部分癌基因ASO突变。

DNA芯片技术(DNA chip) DNA芯片技术是90年代后发展的一项DNA分析新技术,它集合了集成电路计算机、激光共聚焦扫描、荧光标记探针和DNA合成等先进技术。

可用于基因定位、DNA测序、物理图谱和遗传图谱的构建等。

在基因突变检测方面DNA芯片也有广阔的前景,其基本原理为将许多已知序列的寡核苷酸DNA排列在1块集成电路板上,彼此之间重叠1个碱基,并覆盖全部所需检测的基因,将荧光标记的正常DNA和突变DNA发别与2块DNA 芯片杂交,由于至少存在1个碱基的差异,正常和突变的DNA将会得到不同的杂交图谱,经过共聚集显微镜分别检测两种DNA分子产生的荧光信号,即可确定是否存在突变,该方法快速简单、片动化程度高,具有很大的发展潜力,将在基因突变检测中心发挥非常重要的作用。

连接酶链反应(ligase chain reaction,LCR)与其他核酸扩增技术比较,其最大特点为可准确区分基因序列中单个基因突变,由Landegree于1988年首次应用于镰刀奖细胞贫血的分子诊断。

LCR是以DNA连接酶将某一DNA链的5`-磷酸与另一相邻链3`-羟基连接为基础,应用两对互补的引物,双链DNA经加热变性后,两对引物分别与模板复性,若完全互补,则在连接酶的作用下,使相邻两引物的5`-磷酸与3`-羟基形成磷酸二酯二酯键而连接,前一次的连接产物又作为下一次循环反应的模板,如果配对的碱基存在突变则不能连接和扩增。

LCR产物检测最初是通过这32p标记上游引物3`未端,经变性凝胶电泳分离后放射自显影加以鉴定,其检测敏感性达到200个靶分子。

也可设计1个横跨两引物的检测探针,用它与LCR产物进行杂交检测。

近年有应用荧光素、地高辛等非核素标记方法。

Batt在1994年发展了一种更为简的方法,好微孔板夹心杂交法。

由于LCR的快速、特蛋和敏感的特性,以及能检测单个碱基突变的能力,因此被应用于肿瘤基因突变的分子诊断,并与PCR结合用以提高其敏感性。

等位基因特异性扩增法(Allele-specific amplification,ASA)ASA于1989年建立,是PCR 技术应用的发展,也称扩增阻碍突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)、等位基因特性PCR(allele-specific PCR,ASPCR)等,用于对已知突变基因进行检测。

该法通过设计两个5`端引物,一个与正常DNA互补,一个与突变DNA互补,对于纯合性突变,分别加入这两种引物及3`端引物进行两个平行PCR,吸有与突变DNA完互补的引物才可延伸并得到PCR扩增产物。

如果错配位于引物的3`端则导致PCR不能延伸,则称为ARMS。

ARMS和ASPCR借鉴多重PCR原理,可在同一系统中同时检测两种或多种等位基因突变位点。

ASA法的检出率依赖于反应条件的优化和可能发生的引物与靶DNA有氏配时错配延伸,特别是当错配碱基为G:T时,这时可通过调整实验条件如引物靶DNA,Taq DNA 聚合酶的浓度等来得高瓜在特异性。

在反应体系中加入甲酰胺也可减少非特异性扩增。

还可通过在引物3`端的第二个碱基引入一个错配碱基,使之与模板之间形成双重错配以阻止错误延伸。

RNA酶A切割法(RNase A cleavage)在一定条件下,氨基源双链核酸分子RNA:RNA或RNA:DNA中的错配碱基可被RNaseA切割,切割产物可通过变性凝胶电泳分离。

当RNA探针上错配的碱基为嘌呤时,RNaseA在错配处的切割效率很低,甚至不切割,而当错配碱基为嘧啶时,则其切割效率较高。

故如果仅分析被检DNA的一个条链,突变检出率只有30%,如同时分析正义和反义二条链,检出率可达70%。

该法需要制备RNA探针,增加了操作的复杂性,但可用于1-2kb的大片段进行检测,并能确定突变位点。

于这些优越性,它仍被作为一种经典方法用于对未知突变进行分析。

染色体原位杂交(In situ hybridization of chromosome)染色体发现距今已有150多年的历史,染色体检测被广泛用于动、植物及人类的细胞遗传学研究,随着染色体分技术和分子生物学技术的发展。

染色体研究范围也不断扩大,特别是用于肿瘤分子诊断。

肿瘤细胞的染色体变化是一非常普遍的现象,可分为原发和继发两类。

在肿瘤形成的生物学基础方面,原发性的染色体变化与引起肿瘤的直接原因有关,肿瘤细胞中可以发现各种形式的染色体畸变,如缺失、重复、易位、重排、单体断裂及核内复制等;继发性变化主要是肿瘤细胞核型的改变。

染色体的检测对于肿瘤的诊断、鉴别诊断、生物学行为判别等方面都重要意义。

染色体的检测方法进展很快,检测的精确率也不断提高,这里主要介绍荧光原位杂交和PRINS 法。

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