三个虹鳟养殖群体遗传结构的微卫星分析

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三倍体虹鳟线粒体基因组结构与系统进化分析

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虹鳟、山女鳟及其杂交子代(虹鳟♀×山女鳟♂)的微卫星分析

虹鳟、山女鳟及其杂交子代(虹鳟♀×山女鳟♂)的微卫星分析张玉勇;白庆利;贾智英;牟振波;赵海燕【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2009(033)002【摘要】利用虹鳟(♀)和山女鳟(♂)进行种间杂交,获得了90.00%的受精率,80.52%的发眼率,90.68%的孵化率和30.68%的鱼苗成活率.运用13个微卫星分子标记对杂交亲本与杂交子代进行了分子遗传机制的研究,结果表明:(1) 在13个微卫星位点中,3个位点只在虹鳟中得到扩增产物,6个位点扩增出虹鳟和山女鳟清晰的差异条带,另外4个位点在双亲中没有扩增出显著差异条带;(2) 双亲遗传分化显著,虹鳟和山女鳟存在杂交现象,虹鳟和山女鳟杂交子代的遗传符合孟德尔遗传规律,属两性融合生殖,是真正意义上的杂交种. (3) 杂交后代与虹鳟和山女鳟的遗传相似性系数分别为0.461 7和0.596 5,遗传距离分别为0.772 9和0.516 8, 表明杂交F1与两亲本的遗传差异不是对等的, 而是偏向父本一方,UPGMA系统树也同样证明了这一点.【总页数】8页(P188-195)【作者】张玉勇;白庆利;贾智英;牟振波;赵海燕【作者单位】中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江,哈尔滨,150070;大连水产学院生命科学与技术学院,辽宁,大连,116023【正文语种】中文【中图分类】S917【相关文献】1.山女鳟和虹鳟的杂交子代与其亲本后代早期生产性能的比较 [J], 张玉勇;白庆利;贾忠贺;徐革锋;牟振波;王炳谦2.虹鳟、山女鳟的营养与饲料 [J], 王昭明3.不同群体山女鳟及其杂交F1的生产性能比较 [J], 张玉勇;张永泉;贾智英;贾忠贺;白庆利4.山女鳟和天子鳟的饵料配方（％） [J],5.虹鳟(♀)×山女鳟(♂)杂交F1及其亲本肌肉营养成分和肌肉质地的比较 [J], 张玉勇;贾智英;池喜峰;李池陶;胡雪松;石连玉因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

虹鳟spindlin基因克隆及不同倍性的表达分析

doi: 10.7541/2021.2019.193虹鳟spindlin 基因克隆及不同倍性的表达分析史秀兰1, 2黄天晴2徐革锋2邹作宇3谷伟2程琳2刘晨斌2王炳谦2(1. 上海海洋大学, 上海 201306; 2. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所, 哈尔滨 150076;3. 哈尔滨市农业科学院, 哈尔滨 150028)摘要: spindlin 基因是减数分裂纺锤体相关因子, 为了研究spindlin 基因在二倍体和三倍体雌性虹鳟减数分裂过程中出现的差异, 通过cDNA 末端快速扩增(RACE)技术获得spindlin 基因cDNA 4529 bp(GenBank 登录号:MN378564), 其中3′非编码区(UTR)和5′非编码区(UTR)分别长3662 bp 和141 bp, 开放阅读框(ORF)长726 bp, 编码241个氨基酸, 该蛋白质序列的相对分子量为28.3 kD, 理论等电点值为5.94, 无跨膜结构。

同源性分析表明,虹鳟(Oncorhynchus mykiss )与银大马哈鱼(Oncorhynchus kisutch )同源最高, 高达99.59%。

系统发育进化树显示, 虹鳟与大鳞大马哈鱼(Oncorhynchus tshawytscha )和红点鲑(Salvelinus alpinus ), 聚为一支。

实时荧光定量(RT-PCR)结果显示, spindlin 基因在二倍体雌性虹鳟卵巢、肾、肝、脾、肌、鳃、心、眼、肠和鳍组织中均有表达, 其中, 在卵巢中的表达量极显著高于其他组织(P <0.01)。

对于二倍体雌性虹鳟, 在受精后240—300d (days post fertilization, dpf)发育阶段, spindlin 基因在卵巢组织中的相对表达量显著下降。

对于三倍体雌性虹鳟, 该基因在240—330 dpf 阶段的表达量显著上升。

在同一发育阶段中, spindlin 基因在二倍体雌性虹鳟卵巢中的表达量较三倍体雌性虹鳟相对较高, 且均存在极显著差异(P <0.01)。

虹鳟生长性状的随机回归分析

第6期
王悦玲等: 虹鳟双列杂交试验生长性状的动态遗传分析
1217
对 5 个虹鳟品系后代进行了生长性状的遗传力和育种值估计, 结果表明, 虹鳟体重、体长和肥满度的表型趋势和遗传趋势基本一致, 且 3 个性状都属于中等遗传力; 刘宗岳等[5]的研究中也得出虹鳟体重和体长均属于中等遗传力。实际上, 要对虹鳟的生长过程进行遗传分析, 需要在该过程中的特定阶段(在某几天、几周或几个月)对生长性状进行反复测量。在早期的研究中, 利用单变量动物模型分别分析了特定年龄段的生长性状[6-15]。同时, 多变量动物模型被用来估计一段时间内生长性状的遗传相关[8, 10, 14, 16-24]。这些分析很大程度上受到可变的和无规律的测定时间的限制[25]。
值的误差效应; q0、q1、q2 和 q3 分别是勒让德多项式中性别、家系、加性遗传和永久环境效应的阶
次。勒让德多项式的前 5 个协变量是 P0 (t) 1,
P1 (t )
t,
P2
(t)
1 2
(3t 2
1),
P3 (t)
1 2
(5t 2
3t),
P4 (t)
1 8
(35t 4
30t 2
3)。
体重或体长的随机模型用矩阵形式可以表示
当对同一个体进行反复测量时, 可以为该个体绘制一条随时间变化的生长曲线。在 20 世纪 90 年代, 研究者推出了奶牛产奶日期的随机回归模型[3], 该模型也常用于评估水产养殖中生长曲线的遗传参数[15, 26-28]。随机回归模型可以灵活地计算任何年龄的生长性状遗传力以及一段时间内的遗传相关。特别是多变量随机回归模型, 还可以估计成对性状之间的遗传相关, 并且改进每个性状的遗传力估计值。与将不同年龄的表型视为同一性状进行分析的简单重复力模型相比, 随机回归模型有利于动态性状的遗传分析, 同时还可以提高育种值的预测准确度[3, 29]。

基于细胞色素b基因序列分析我国鲑亚科鱼类系统发育关系和不同虹

本研究通过对中围主要养殖鲜鳟鱼类和皿ｒ鳟
的不同养殖群体细胞色素ｂ基【大Ｊ进行测序，研究我国虹鳟不同养殖群体的遗传特性，了解我同虹鳟养殖群体遗传多样性水平，研究丰要养殖鲑鳟鱼类
业价值，仵名特水产品养殖中，鲑鳟鱼类的养殖是
很有前景的产业之一。２０世纪５０年代末首次从朝鲜引人虮鳟，开始了我国的鲑鳟鱼类的养殖，目前在同内北方已开展了大面积鲑鳟鱼类的养殖。我国养殖的虹鳟引闩小同的国家，对于有限的亲本数日经过不同形式的选择育种，势必造成一定
为了更好地保护、利用祠Ｉ开发鲑鳟鱼类种质资
源、保障鲑鳟鱼类养殖产业的健康可持续发展和科学合理地开展遗传选育，开展鲑鳟鱼类的遗传多样性分析和系统关系研究具有重要的科学意义和应
用价值。细胞色素ｂ基因在鱼类群体和进化遗传
中图分类号：Ｓ９１７文献标识码：Ａ文章编号：ｌ００３ｌｌｌ１（２Ｏｌ５）０６０３８６０５
鲑鳟鱼类，是鳟鱼和鲑鱼的统称。如金鳟
（Ｏｎｅ ’ ｏｒｈｙｎｃｈｕｓａｇｕａｂｏｎｉｔａ）、虹鳟（０．ｍｙｋｉｓｓ）、褐

微卫星标记分析3个耐寒鲤品种的遗传多样性

微卫星标记分析3个耐寒鲤品种的遗传多样性桑滨;鲁翠云;李超;孙效文;李丹彤【期刊名称】《生物学杂志》【年(卷),期】2017(34)3【摘要】耐寒品种的培育与养殖对于三北地区的鲤养殖业非常重要,对育成品种进行遗传分析有助于种质资源的可持续利用.研究采用30个微卫星标记分析了3个遗传背景相近的耐寒鲤品种松荷鲤(GG,Cyprinuscarpio L.)、荷包红鲤抗寒品系(HH,Cyprinuscarpio var.wuyuanensis)与松浦鲤(SS,Cyprinuscarpiovar.Songpu)的遗传多样性.结果显示:1)3个耐寒鲤品种GG、HH和SS平均有效等位基因数为4.392、4.501和4.518,平均观测杂合度为0.801、0.815和0.809,平均多态信息含量为0.720、0.717和0.720,GG、HH和SS均属高度多态水平(PIC>0.5),3个群体偏离Hardy-Weinberg平衡的位点较少,种群结构合理.2)计算3个耐寒鲤品种间的遗传距离并绘制聚类图,结果GG和HH先聚为一个分支,再与SS聚在一起.基于Structure亚种群数检验的分析结果显示,当K=2时,HH群体从3个群体中分离出来,GG和SS群体主要遗传组分相同;当K=3时,GG、HH和SS 群体相互分离开,并且各自形成自己的遗传组分.3)在26个标记中检测出品种特异等位基因73个,其中41个品种特异等位基因的频率超过10%,进而获得基因型频率大于10%的品种特异基因型161个,可用于3个耐寒鲤品种的种质鉴定.%Cultivation and breeding of cold resistant varieties are very important for carp farming in the Three-North Region,meanwhile,genetic analysis of cultivars is helpful to the sustainable utilization of the germplasm parative analysis of genetic diversity was conducted usingmicrosatellite markers on three cold-resistant varieties of common carp with similar genetic background,Cyprinuscarpio L.(GG),Cyprinuscarpio var.wuyuanensis (HH),and Cyprinuscarpio var.Songpu(SS).The results showed as following: (1) The average effective number of alleles of three cold-resistant varieties of common carp (GG,HH,SS) were 4.392,4.501 and 4.518,respectively.Average observed heterozygosities were 0.801,0.815 and 0.809,respectively.The average polymorphism information contents were 0.720 and 0.717,0.720,respectively.Three cold-resistant varieties of common carp were of highly polymorphic level.Three populations deviated from the Hardy-Weinberg equilibrium and the population structure were reasonable.(2) A tree diagram was constructed by clustering analysis according to genetic distance of three breeding carp.The results indicated that SS clustering was a separate branch firstly,followed by GG and HH.In accordance with the results of Structure analysis,HH separated as a group alone,GG and SS clustered together for the model K=2.WhereasGG,HH,and SS were clustered into 3 different groups for the modelK=3.(3)seventy-three specific alleles were detected from 26 markers,of which 41 specific alleles frequency reached more than 10%.There were 161 specific genotypes with genotypic frequencies over 10%,which can be used for germplasm identification of 3 varieties of cold resistant carp.The purpose of this study was to provide a beneficial reference bases for the breeding and germplasm identification of common carp.【总页数】10页(P24-32,56)【作者】桑滨;鲁翠云;李超;孙效文;李丹彤【作者单位】大连海洋大学水产与生命学院, 大连 116023;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所, 哈尔滨 150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所, 哈尔滨 150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所, 哈尔滨 150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所, 哈尔滨 150070;大连海洋大学水产与生命学院, 大连116023【正文语种】中文【中图分类】Q75;Q959.46+8【相关文献】1.一个建鲤家系的遗传多样性及微卫星标记与经济性状相关性分析 [J], 李建林;李红霞;唐永凯;俞菊华2.利用164个微卫星标记分析镜鲤家系的遗传多样性和经济性状 [J], 徐浩;鲁翠云;孙效文3.利用164个微卫星标记分析镜鲤家系的遗传多样性和经济性状 [J], 徐浩;鲁翠云;孙效文;4.利用微卫星标记分析长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤的遗传多样性 [J], 孙莉;杨国梁;王军毅;吴婷婷;张海波;吴添文;陈国宏5.基于微卫星标记的拟鲤遗传多样性及群体遗传结构分析 [J], 李可;马徐发;谢鹏;高萌;郭焱;谢从新;侯杰因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

微卫星在水产动物种质资源研究方面的应用

微卫星在水产动物种质资源研究方面的应用
微卫星是一类高度可变的DNA序列，其由重复单元构成，通常在基因组中存在多个拷贝。

由于微卫星具有高度可变性和多态性，因此被广泛应用于种质资源的研究中。

在水产动物领域，微卫星在种质资源研究方面也发挥了重要的作用。

首先，微卫星可以用于水产动物的种群结构和遗传多样性的分析。

通过分析不同个体之间重复序列的差异，可以评估种群内的遗传多样性水平以及种群间的遗传分化程度。

这对于保护和管理水产动物资源具有重要意义，可以帮助科学家确定合适的保护策略并促进可持续利用。

其次，微卫星可以用于水产动物的亲缘关系分析。

通过分析个体之间微卫星位点的共享情况，可以确定个体之间的亲缘关系。

这对于进行家系繁殖、选育和种质改良具有重要意义。

例如，在虾类养殖中，通过亲缘关系分析可以选择出具有优良遗传特性的个体作为亲本，以提高后代的养殖性能。

此外，微卫星还可以用于水产动物的遗传标记定位和基因图谱构建。

通过分析个体之间微卫星位点的位点连锁关系，可以确定基因组上不同位点之间的物理距离和相对位置，从而构建基因图谱。

这对于水产动物的遗传图谱研究、功能基因的定位和克隆具有重要意义。

总的来说，微卫星在水产动物种质资源研究方面的应用非常广泛。

它不仅可以用于种群遗传学和亲缘关系分析，还可以用于遗传标记定位和基因图谱构建。

这些应用为水产动物资源的保护、利用和种质改良提供了重要的科学依据，有助于促进水产业的可持续发展。

虹鳟PPARα基因克隆、序列分析及其组织表达分布

虹鳟PPARα基因克隆、序列分析及其组织表达分布贾成霞;张照斌;张清靖;刘盼;朱华【摘要】克隆了虹鳟(Oncorhynchus mykiss)过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptor,PPAR)αmRNA全序列.对其序列分析发现,虹鳟PPARα与其他脊椎动物PPARα有较高的同源性,其中mRNA序列有66.4％～97.5％相同,氨基酸序列有69.2％～98.9％相同.DNA结合结构域和配体结合结构域从鱼类到人类高度保守,其中DNA结合结构域有88.0％～98.8％的氨基酸序列相同;配体结合结构域有74.6％～99.6％的氨基酸序列相同.系统发生树分析表明,虹鳟的PPARα基因与同属鲑科鱼类的大西洋鲑(Salmo salar)属于同一分支.实时定量RT-PCR方法分析虹鳟不同组织中的表达发现,PPARα基因在脂肪、肌肉、卵巢、肾脏和肠中表达量较高.%Peroxisome proliferator-activated receptors (PPARs) belong to the nuclear receptor superfamily, which regulates the biosynthesis and metabolism of lipids, and the differentiation and formation of lipocytes. PPARa mRNA from the rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) was cloned by RT-PCR. Sequence homology analysis showed that rainbow trout PPARa gene was similar to those reported in other vertebrate species. The mRNA sequence and the deduced amino acid sequence of rainbow trout PPARa showed identitiesof 66.4%-97.5% and 72.5%-93.8%, respectively, with those of other vertebrates. The DNA-binding domain and the ligand-binding domain of PPARa have been highly conserved in the evolution from fish to humans, which show 88.0%-98.8% and 74.6%-99.6% amino acid sequence identities, respectively, with those of other vertebrates. Phylogenetic analysisindicated that PPARa of rainbow trout and Atlantic salmon (Salmo salar) belong to the same branch of the phylogenetic tree. Using quantitative real-time RT-PCR, we observed that rainbow trout mRNA was expressed predominantly in lipid, muscle, ovarian, renal, and intestinal tissues.【期刊名称】《中国水产科学》【年(卷),期】2012(019)004【总页数】8页(P707-714)【关键词】PPARα;虹鳟;基因克隆;序列分析;组织分布【作者】贾成霞;张照斌;张清靖;刘盼;朱华【作者单位】北京市水产科学研究所,北京100068;北京大学城市与环境学院,北京100871;北京市水产科学研究所,北京100068;北京市水产科学研究所,北京100068;北京市水产科学研究所,北京100068【正文语种】中文【中图分类】S96过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptor, PPAR)是一类在脂肪合成代谢､脂肪细胞分化和脂肪堆积等过程中起着重要信号转导和调控作用的核受体超家族成员[1−6], 包括PPARα、PPARβ/δ和PPARγ 3种亚型[7]。

微卫星标记在水产动物遗传研究方面的应用

微卫星标记在水产动物遗传研究方面的应用陈万光1,贾晓慧2(1.洛阳师范学院生命科学系,河南洛阳471022;2.洛阳理工学院环境与化学工程系,河南洛阳471023)摘要微卫星标记具有分布广、多态性高、数量丰富、等位基因检测方便等优点,在亲缘关系分析、种质资源鉴定、物种遗传多样性检测等方面被研究者广泛采用。

笔者简要介绍了微卫星标记在水产动物遗传方面的研究进展,以期为水产动物遗传研究提供参考。

关键词微卫星标记;水产动物;遗传;应用中图分类号 S188 文献标识码 A 文章编号 0517-6611(2009)12-05659-02作者简介陈万光(1964-),男,河南洛阳人,教授,从事水产动物遗传育种方面的研究。

收稿日期 2009-02-0620世纪80年代,M a rsh fie ld 医学研究基金会(M a rsh fie ld M ed ica l R esea rch F ound a tion)的J am es 和俄勒冈健康科学大学(O regon H ea lth S cien ces U n ive rs ity)的W is 等人分离出一种比小卫星DN A 具有更短重复单元的DN A 序列,被称为微卫星(M icrosa tellite)。

由于其是几个(1～6bp)核苷酸为单位,多次串联重复N DA 序列,因此又被称之为简单重复序列(S in g le S equence R ep ea ts ,S SR )、简短串联重复序列(S hor t T a ndem R e-pea ts ,S TR)或简单序列长度多态性(S i m p le S equ ence L eng th P o lym o rp h is m,S S LP )[1]。

根据重复单元的构成与分布,微卫星DN A 序列被分为3种类型:单一型(pu re)、复合型(com p ound)和间断型(in terrup ted)。

三个地理群体赤眼鳟遗传多样性的ISSR分析

ＤＡ，Ｎ参考文献［２方法，１］略有改动。提取后用０８．％
琼脂糖凝胶电泳检测其质量，紫外分光光度计估算用
龄、生长和繁殖等生物学方面
性的研究未见报道。
，而对其遗传多样
浓度和纯度，调整浓度至３ｎ／Ｌ４０ｇ，℃保存备用。
１３ＩＳＰＲ扩增实验所用ｄＴｓ和Ｔｑ．ＳＲ－ＣＮＰａ
ＩＳＩｔｉｌＳｑｅｃｅｅｔ是建立在ＳＲ（ｎｅＳｒｍｐｅｅｕｎｅＲｐａ）
ＰＲ反应基础上的一种新型的分子标记技术。Ｃ它结合了ＳＲ和ＲＰＳＡＤ技术的优点，具有模板需要量少、多态性丰富、实验成本低、作简单、验稳定操实
０１０、．３７和０１８，ｈｎｏ．５９０１９．３５Ｓａｎｎ信息指数分别为０２７、．４３和０２７。３个群体上述指标差异均不显著（．５５０２０．３２Ｐ＞．５。丹江１水库与青龙湖群体遗传距离最远（．５１，江１水库与宿鸭湖群体次之（．４９，龙湖和宿００）：３０１８）丹：３０１２）青
三个地理群体赤眼鳟遗传多样性的ＩＳ分析ＳＲ
杨太有关建义陈宏喜
（．河南师范大学牛命科学学院，乡４３０；新乡医学院生命科学技术系，乡１新５０７２新４３０）５０３

三倍体雌性虹鳟性腺发育阶段细胞色素相关基因的表达

中国水产科学 2018年9月, 25(5): 949-957 Journal of Fishery Sciences of China研究论文收稿日期: 2017-09-13; 修订日期: 2017-12-05.基金项目: 现代农业产业技术体系专项资金项目(CARS-46); 中国水产科学研究院基本科研业务费项目(2018HY-ZD03); 黑龙江省自然科学基金面上项目(C2016069).作者简介: 相福生(1990–), 男, 硕士研究生, 主要从事冷水鱼育种与繁殖的研究. E-mail: fishxiangfs@ 通信作者: 王炳谦(1963–), 研究员. E-mail: wangbingqian@DOI: 10.3724/SP.J.1118.2018.17329三倍体雌性虹鳟性腺发育阶段细胞色素相关基因的表达相福生1, 2, 3, 徐革锋2, 谷伟2, 黄天晴2, 刘晨斌2, 王炳谦21. 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心, 上海 201306;2. 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所, 黑龙江哈尔滨 150070;3. 上海海洋大学水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心, 上海 201306摘要: Cyp19a1b 、Cyp11a1、Cyp11b2、Cyp17a1、Hsd3b1等细胞色素相关基因能够调节硬骨鱼类性类固醇的合成, 对性腺发育和性别决定产生影响。

本研究以全雌三倍体虹鳟(Oncorhynchus mykiss )为研究对象, 正常雌性二倍体虹鳟为对照, 选取31~68 dpf (days post fertilization)时间段的虹鳟仔鱼脑组织, 采用qRT-PCR 和酶联免疫的方法研究以上几种基因的表达状况和脑芳香化酶的活性变化, 以期探明导致三倍体雌性虹鳟性腺发育异常的关键原因。

qRT-PCR 结果显示, 二倍体中Cyp19a1b 在30~50 dpf 时表达量上调并且维持在较稳定水平, 但50~56 dpf 时表达量逐渐下调, 之后56~68 dpf 表达量持续上调; 三倍体中Cyp19a1b 表达量在30~35 dpf 开始上调, 35~47 dpf 逐渐下调, 47~55 dpf 开始第二次上调, 之后维持在较稳定水平直至68 dpf, 但三倍体Cyp19a1b 的表达量显著(P<0.05)低于同期二倍体的。

虹鳟6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析

（．国水产科学院黑龙江水产研究所，哈尔滨１０７；２大连水产学院，连１６２）１中５００．大１０３
摘
要：利用１４对微卫星分子标记对虹鳟的６个养殖群体进行遗传多样性分析。结果表明：６个群体的平均等位
体遗传距离最远。
关键词：虹鳟；养殖群体；遗传多样性；微卫星
中图分类号：９５１２￥６．２文献标识码：Ａ文章编号：２３７２２０）８９６７０５ —９７（０６０ —０５ —０
ＧｅｅｉｖｒｔｈｎｔｃＤｉｅｓｉｙｏｆｔｅＣｕｌｕｅｏｕｌｔｏｓｏｘＲａｎｏｔｒｄＰｐａｉｎｆＳｉｉｂｗ
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研究报告
虹鳟６个养殖群体遗传多样性的微卫星分析
赵莹莹’ 朱晓琛孙效文’ ，，

水产生物微卫星标记技术研究进展及其应用

水产生物微卫星标记技术研究进展及其应用一、本文概述随着现代生物技术的飞速发展，微卫星标记技术（Microsatellite Markers）已成为水生生物学研究中不可或缺的工具。

本文旨在全面综述水产生物微卫星标记技术的最新研究进展，包括其在水生生物遗传多样性分析、种群遗传结构解析、亲缘关系鉴定、遗传图谱构建、基因定位以及辅助育种等多个领域的应用。

本文还将探讨微卫星标记技术在未来水产生物学研究中的发展趋势和潜在挑战。

我们将对微卫星标记技术的基本原理和特点进行简要介绍，以便读者对该技术有一个清晰的认识。

随后，我们将重点回顾近年来微卫星标记技术在各类水产生物（如鱼类、甲壳类、贝类等）中的研究应用，以及所取得的重要成果。

在此基础上，我们将分析当前研究中存在的问题和不足，并对未来发展方向进行展望。

通过本文的阐述，我们期望能为从事水产生物学研究的学者和技术人员提供有益的参考和启示，推动微卫星标记技术在水产生物学领域的应用和发展。

二、微卫星标记技术的基本原理和方法微卫星标记技术，也称为简单序列重复（Simple Sequence Repeats, SSRs）或短串联重复（Short Tandem Repeats, STRs），是一种基于DNA序列多态性的分子标记技术。

其基本原理是利用生物基因组中广泛存在的微卫星DNA序列，这些序列由1-6个碱基组成的重复单元串联而成，重复次数在不同个体或品种间存在差异，从而表现出多态性。

微卫星位点的筛选和引物设计：通过生物信息学方法，从已知的基因组序列中筛选出微卫星位点，然后利用这些位点的序列信息设计特异性引物。

PCR扩增：以基因组DNA为模板，利用设计的特异性引物进行PCR 扩增，扩增产物即为包含微卫星序列的DNA片段。

电泳检测和数据分析：将PCR产物进行凝胶电泳，根据DNA片段的大小差异进行分离，然后通过凝胶成像系统观察并记录结果。

通过对电泳图谱的分析，可以计算出微卫星序列的重复次数，从而得到不同个体或品种间的多态性信息。

利用164个微卫星标记分析镜鲤家系的遗传多样性和经济性状

ｒｔ１．￣ｃａｒｐｉｏＬ．由黑龙江水产研究所在２０世纪８Ｏ年
中随机分布等特点，被认为是检测群体遗传多样性的最佳方法之一，Ｌｉ等利用３０个微卫星标记分析了６个野生鲤群体的遗传多样性，结果６个群体
第２８卷第３期２０１３年大
学学报
Ｖ０１．２８Ｎｏ．３
ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＤＡＬＩＡＮＯＣＥＡＮＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ
Ｊｕｎｅ２０１３
文章编号：２０９５ — １３８８（２０１３）０３－０２４７ — ０７
利用１６４个微卫星标记分析镜鲤家系的遗传多样性和经济性状
徐浩，鲁翠云，孙效文
（１．中国水产科学院黑龙江水产研究所淡水鱼类育种国家地方联合工程实验室，黑龙江哈尔滨１５００７０；２．大连海洋大学水产
与生命学院，辽宁大连１１６０２３）
摘要：利用来源于细菌人工染色体（Ｂａｃｔｅｒｉａｌａｒｔｉｉｆｃｉｌａｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ，ＢＡＣ）的１６４个微卫星标记分析了
镜鲤ｃｎ咄ｃａｒｐｉｏＬ家系遗传多样性及标记与体质量、体长、体高、体厚４个性状间的相关性。结果表
测，优良品种与普通品种杂交以及近亲繁殖所引起
收稿日期：２０１２ — ０９ — ２５

三种笛鲷的野生群体和养殖群体遗传多样性的微卫星分析

三种笛鲷的野生群体和养殖群体遗传多样性的微卫星分析彭银辉;刘楚吾;郭昱嵩;刘丽;王中铎【期刊名称】《农业生物技术学报》【年(卷),期】2008(16)5【摘要】利用微卫星标记技术,采用10对微卫星引物对南海海域红鳍笛鲷(Lutjanus erythopters)、星点笛鲷(L.stellatns)和紫红笛鲷(L.argenamaculatus)3种笛鲷鱼的野生种群(HYE、XYE和ZYE)和养殖种群(HYA、XYA和ZYA)进行了遗传多样性分析.10对微卫星引物在6个群体中共检测到78个等位基因,每个位点的等位基因数目在1～8个之间.6个群体的观测杂合度(H0)为0.2500～1.0000,平均观测H0为:ZYE(0.9550)>ZVA(0.8900),HYE(0.8950)>HYA(0.8400),XYE(0.8450)>XYA(0. 8100);平均多态信息含量(PIC)为0.36484-0.7964,各野生群体均大于养殖群体;3种笛鲷鱼的野生群体和养殖群体遗传距离HYE与HYA,XYE与XYA,ZYE与ZYA分别为0.1029,0.0371和0.0135,基因分化系数(Fst)分别为0.0371,0.0211和0.0352.群体遗传结构分析结果表明:红鳍笛鲷、星点笛鲷和紫红笛鲷的遗传多样性较丰富,养殖群体的遗传多样性较野生群体均有一定程度的降低,野生群体和养殖群体分化较弱.【总页数】5页(P810-814)【作者】彭银辉;刘楚吾;郭昱嵩;刘丽;王中铎【作者单位】广东海洋大学水产学院,湛江,524025;广东海洋大学水产学院,湛江,524025;广东海洋大学水产学院,湛江,524025;广东海洋大学水产学院,湛江,524025;广东海洋大学水产学院,湛江,524025【正文语种】中文【中图分类】S188【相关文献】1.青蟹野生与养殖群体遗传多样性的微卫星分析 [J], 周宇芳;舒妙安;赵晓枫;朱晓宇2.大亚湾紫红笛鲷野生群体遗传多样性的RAPD分析 [J], 牛文涛;蔡泽平3.许氏平鲉(Sebastes schlegeli)微卫星标记开发及野生、养殖群体遗传多样性分析 [J], 韩承慧;马海涛;姜海滨;刘阳;韩慧宗;王斐4.鲤野生和养殖群体遗传多样性分析中的微卫星(SSLP)分析 [J], 梁利群;冯国军;常玉梅;汪海燕5.利用高通量测序开发的熊本牡蛎微卫星标记评价野生和养殖群体的遗传多样性及通用性 [J], 黄飘逸; 马海涛; 喻子牛; 张跃环; 高红梅; 彭建军因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

虹鳟MHCⅡ类A基因(DAA)多态性与抗IHN相关性分析

虹鳟MHCⅡ类A基因（DAA）多态性与抗IHN相关性分析虹鳟MHCⅡ类A基因（DAA）多态性与抗IHN相关性分析摘要：虹鳟（Oncorhynchus mykiss）是一种重要的经济鱼类，对于其免疫系统的研究具有重要意义。

而MHCⅡ类A基因(DAA)是MHC家族中的重要成员，参与了虹鳟免疫反应的调控。

本研究旨在分析虹鳟MHCⅡ类A基因的多态性以及其与抗IHN（鳟瘟）的相关性。

1. 引言虹鳟是一种重要的经济鱼类，然而，鳟瘟（Infectious hematopoietic necrosis, IHN）是其养殖过程中常见的疾病之一。

因此，研究虹鳟的免疫反应机制，尤其是与抗疾病能力相关的基因，对于提高虹鳟养殖鲜活率具有重要意义。

2. MHCⅡ类A基因的功能MHCⅡ类A基因编码MHCⅡ类分子，是抗原递呈过程中的关键调控因子。

虹鳟的MHCⅡ类A基因（DAA）多态性与个体抵抗力密切相关。

通过免疫相关基因的多态性分析，可以更深入地了解虹鳟的抗疾病机制。

3. 实验方法本实验选取了100只健康虹鳟，提取其DNA样本，并使用特定引物扩增MHCⅡ类A基因片段。

通过电泳分析鉴定出不同的等位基因，得到虹鳟MHCⅡ类A基因的多态性信息。

4. 结果与讨论我们在分析样本中发现了多个不同的MHCⅡ类A基因等位基因，证实了虹鳟DAA基因的多态性。

研究结果表明，虹鳟的MHCⅡ类A基因具有显著的多态性差异。

进一步分析发现，一些特定等位基因与虹鳟对IHN的抵抗力相关联。

5. 结论本研究通过分析虹鳟MHCⅡ类A基因的多态性与抗IHN的相关性，初步揭示了虹鳟免疫反应调控中的重要基因。

这些发现对于虹鳟养殖过程中提高其抗病能力具有指导意义，也为虹鳟免疫相关基因的进一步研究奠定了基础。

6. 局限性与展望本研究仍有一些局限性，如样本数量有限，需要进一步扩大样本规模以提高研究的可靠性。

此外，我们没有对虹鳟MHCⅡ类A基因的功能进行进一步的研究，还需开展相关的实验验证。

四大家鱼微卫星标记的筛选及其在物种鉴定中的应用

• 在 5、8月份所占的比例最大分别 11.81% 和22.8%，9月份次之,6、7月份比较少；在总量上，草鱼最多，青鱼最少，鉴定结果与形态鉴定基本一致，说明采用微卫星标记进行种类鉴定是可行的。
青鱼、草鱼、鲢鱼和鳙鱼原是我国特有的鱼类，最早作为驯养种类故有 “四大家鱼”之称。四大家鱼在我国具有分布广、生长快、食性广、抗病力强、肉味鲜、易养殖等特点，是我国淡水养殖和捕捞的主要对象。近年来，由于水利工程建设、环境污染、过度捕捞等诸多因素，使四大家鱼的天然产量急剧下降，四大家鱼的资源状况直接影响着我国淡水渔业的持续发。为此，有必要对四大家鱼的早期资源展开调查。
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结论与讨论四大家鱼特异性微卫星位点的获取微卫星标记的筛选和开发是利用微卫星标记鉴定物种中最关键的一步本研究从经济省时高效的目的出发从已发表的文献和数据库中查找微卫星标记其中从文献中共获得个微卫星位点其中个位点和可用于四大家鱼的种类鉴定说明从文献中获取微卫星标记是可行的但是获取效率较低可能与这些标记用于四大家鱼遗传多样性的研究有关多态性较高不利于单态性标记的筛选是近年来开发微卫星标记的首选数据库研究表明中含有较为丰富的微卫星序列约有个别物种甚至达到以上本文从和中获得个微卫星标记共筛选出四大家鱼的个微卫星鉴定位点筛选效率较从文献中获取较高认为重复次数多的微卫星既能在种间又能在种内产生多态性但重复次数少的微卫星仅能在种间产生多态性可能与本文所筛选的标记中重复次数较少有关

基于细胞色素b基因序列分析我国鲑亚科鱼类系统发育关系和不同虹鳟养殖群体遗传变异

基于细胞色素b基因序列分析我国鲑亚科鱼类系统发育关系和不同虹鳟养殖群体遗传变异王伟伟【摘要】采用PCR技术扩增了中国不同虹鳟群体的细胞色素b基因，对虹鳟不同养殖群体进行了遗传多样性分析，并与鲑亚科中其他5属11个物种的细胞色素b 基因进行同源性比较，建立了主要养殖鲑亚科鱼类的系统关系。

试验结果显示，虹鳟种内本地虹鳟群体遗传距离最小（0．001），道氏群体最高（0．004）。

种间遗传距离以哲罗鲑与马苏大麻哈鱼的遗传距离最大（0．127），其次为哲罗鲑与银大麻哈鱼（0．123），以远东红点鲑和美洲红点鲑的最近（0．003）。

聚类分析表明，同属的鱼均能单独聚类，哲罗鱼属和细鳞鱼属聚在一起，鲑属与红点鲑属聚在一起。

虹鳟不同群体间并没有单独聚类，提示不同虹鳟群体间没有发生明显的遗传分化。

%The Cytb sequences were amplified by PCR technique ,and genetic diversity was analyzed in different populations of rainbow trout Oncorhynchus mykiss farmed in China . The phylogenetic relationships among members in Salmoninae were established by comparing with the sequences from eleven other species representing five genera in subfamily Salmoninae .The results showed that the local rainbow trout population (0 .001 ) had the minimal intraspecies genetic distance ,and Donaldsons population the maximal (0 .004) .In the interspecies ,however ,there was the maximal genetic distance (0 .127) between taimen Hucho taimen and masou salmon O . masou ,followed by between taimen and coho salmon O . kisutch(0 .123)and the minimal genetic distances between Siberian char Salvelinus leucomaenis and brook trout S .fontinalis (0 .003) .Clusteringanalysis revealed that fish in the same genus was separatelyclustered ,lenok Brachymystax and H ucho being clustered together ,and Oncorhynchus and Salvelinus being clustered together .No clustering was observed in the individuals of different rainbow troutpopulations ,indicating that different populations of rainbow trout seem to have no significant genetic differentiation .【期刊名称】《水产科学》【年(卷),期】2015(000)006【总页数】5页(P386-390)【关键词】虹鳟;鲑亚科;细胞色素b基因;系统关系;遗传变异【作者】王伟伟【作者单位】山西农业大学动物科技学院，山西太谷030801【正文语种】中文【中图分类】S917鲑鳟鱼类，是鳟鱼和鲑鱼的统称。

不同养殖模式下三倍体虹鳟鱼肉品质差异的研究

不同养殖模式下三倍体虹鳟鱼肉品质差异的研究管玲玲;刘小红;田海宁;励建荣;孟玉琼;马睿【期刊名称】《水生生物学报》【年(卷),期】2022(46)7【摘要】以网箱(W)、工厂化循环水(G)和流水池塘(C)养殖4 kg左右的三倍体虹鳟为研究对象,通过检测表观、肉质、气味及营养价值相关111个品质指标来评价不同养殖模式下三倍体虹鳟鱼肉品质的差异。

结果表明,在3种养殖模式下三倍体虹鳟鱼肉品质存在明显差异。

其中,网箱养殖三倍体虹鳟鱼肉色调角、硬度、内聚性、弹性、咀嚼性、汁液流失率和失水率均显著高于其他养殖模式(P<0.05),而挥发性气味物质中1-庚醇、庚醛、辛醛、壬醛和气味活度总值显著低于其他养殖模式(P<0.05);工厂化循环水养殖三倍体虹鳟肥满度和鱼肉的红色值、色度值、盐溶性蛋白含量、总脂肪酸含量和n-3脂肪酸含量显著高于其他养殖模式(P<0.05);流水池塘养殖三倍体虹鳟肥满度、鱼肉的黄色值、色度值、水分、脂肪含量、n-3脂肪酸含量和多不饱和脂肪酸含量最低(P<0.05),出肉率、黏附性、肌糖原含量及挥发性风味物质中1-辛烯-3-醇、2,3-辛二酮、戊醛、庚醛、辛醛、(E)-2-癸烯醛和气味活度总值最高(P<0.05)。

总之,三种养殖模式养殖的三倍体虹鳟品质各具特色:网箱养殖三倍体虹鳟鱼肉质地坚实富有弹性,挥发性风味物质含量较低;工厂化循环水养殖三倍体虹鳟具有较红的肉色并富含不饱和脂肪酸;流水池塘养殖三倍体虹鳟形体优美且出肉率相对较高,挥发性风味物质含量丰富。

【总页数】13页(P1016-1028)【作者】管玲玲;刘小红;田海宁;励建荣;孟玉琼;马睿【作者单位】青海大学农牧学院;省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室;青海大学生态环境工程学院;渤海大学食品科学与工程学院【正文语种】中文【中图分类】S965.1【相关文献】1.不同养殖模式大黄鱼肉质性状的分析研究2.不同养殖模式斑石鲷的鱼肉品质特性分析3.不同养殖模式对斑石鲷鱼肉品质的影响及分析4.不同养殖模式下加州鲈鱼肉质比较分析5.青海省不同水域地区网箱养殖虹鳟品质研究因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。