AFLP分子标记技术在甘蔗遗传育种上的应用

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遗传标记技术中aflp

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遗传标记技术中aflpAFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)是一种遗传标记技术,广泛应用于遗传学研究和种质资源保护。

本文将从AFLP的原理、操作步骤、优势和应用等方面进行介绍。

AFLP是一种基于多态性片段长度的遗传标记技术,它结合了PCR 扩增和限制性内切酶切割的特点。

首先,通过PCR扩增目标DNA 片段,然后利用限制性内切酶对扩增片段进行切割,生成多个DNA 片段。

这些片段在聚丙烯酰胺凝胶电泳中分离并检测,形成特定的DNA指纹。

通过比较不同个体或群体之间的AFLP指纹图谱,可以揭示出遗传变异的差异。

AFLP的操作步骤相对简单,主要包括DNA提取、PCR扩增、酶切反应、连接DNA适配体、选择性扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳等。

首先,需要从样品中提取高质量的DNA。

随后,利用特定引物对目标DNA进行PCR扩增,产生大量的扩增片段。

接下来,使用限制性内切酶对PCR产物进行酶切反应,得到多个DNA片段。

这些片段会与连接了适配体的引物结合形成适配体-片段复合物,随后进行选择性扩增,选择性引物将引导特定片段的扩增。

最后,将扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,并使用荧光染料或放射性同位素进行检测和分析。

AFLP技术具有以下几个优势。

首先,AFLP可以同时检测多个位点的多态性,相比传统的基因标记技术,其检测效率更高。

其次,AFLP技术不需要事先了解目标基因序列,适用于未知基因组的研究。

此外,AFLP可以检测到较低频率的遗传变异,对于研究物种间或个体间的遗传关系非常有用。

最后,AFLP技术具有较高的重复性和稳定性,结果可靠性较高。

AFLP技术在遗传学研究和种质资源保护中得到了广泛应用。

在遗传学研究中,AFLP可以用于揭示物种间或个体间的遗传关系、群体遗传结构的分析以及基因组演化的研究。

在种质资源保护中,AFLP可以用于遗传多样性的评估和遗传资源的鉴定,为保护和合理利用遗传资源提供科学依据。

AFLP标记及其在园艺植物遗传育种中的应用

AFLP标记及其在园艺植物遗传育种中的应用

[收稿日期]20040911[基金项目]国家科技部基础性工作资助项目(00-18) [第一作者简介]陈启亮(1976),男,湖北枝江市人,湖北省农业科学院果茶蚕桑研究所助理研究员AFLP 标记及其在园艺植物遗传育种中的应用陈启亮(湖北省农业科学院果茶蚕桑研究所,湖北武汉430209) 李清国(武汉市东西湖区园艺所,湖北武汉430040) 田 瑞(湖北省农业科学院果茶蚕桑研究所,湖北武汉430209) 张青林 (华中农业大学园艺园林学院,湖北武汉430070)[摘要]A FL P (扩增片段长度多态性)标记是一种新的DN A 分子标记技术,对其基本原理、方法及特点做了简要介绍。

从遗传多样性和亲缘关系分析、品种鉴定和指纹图谱构建、遗传图谱构建、基因定位与克隆、QT L 定位、标记辅助选择育种、基因表达与调控研究等方面概述了A FL P 标记在园艺植物上的应用进展,并对其存在的问题和应用前景做了探讨。

[关键词]A FL P 标记;园艺植物;遗传育种[中图分类号]S603 2;Q 78[文献标识码]A [文章编号]16731409(2005)02001906AFLP (amplified fragm ent length polym orphism)即扩增片段长度多态性,是RFLP 技术和PCR 技术的结合。

A FLP 标记结合了RFLP 标记的高重复性与RAPD 标记不需要预先知道基因组背景,多态位点丰富等优点,克服了RFLP 检测位点有限和RA PD 的不稳定性等缺点,目前已经广泛应用于多种植物的遗传育种研究,如水稻[1]、玉米[2]、小麦[3]、枳[4]、柿[5]、花椰菜[6]等。

笔者拟对AFLP 标记原理、方法特点及其在园艺植物遗传育种研究中的应用做概要介绍。

1 AFLP 技术的原理、基本反应程序及特点1 1 AFLP 技术的发展AFLP 技术是1993年由荷兰科学家Zabeau 和Vos 建立并发展起来的一种检测DNA 多态性的新方法。

AFLP分子标记技术及其应用2

AFLP分子标记技术及其应用2
AFLP 分子标记技术及其 应用
涪陵师范学院生命科学系 主讲人:江 波
AFLP分子标记技术及其应用
? 一、什么叫AFLP ? ? 二、AFLP 的基本原理是什么? ? 三、AFLP 的实验过程怎样? ? 四、AFLP 的应用研究如何? ? 五、对AFLP 的评价
我们都知道世界是多姿多彩的,可以说是 五彩斑斓,花样百出,无奇不有!从生物
?AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism,
扩增片断长度多态性) ? 事实上,还有很多分子标记术像SSR、ISSR、
SRAP(相关序列扩增多态性)另外,还有现在号称 为第三代分子标记的SNP( 单核苷酸多态性) 等
AFLP 的基本原理
? 基因组DNA经两种限制性内切酶酶切,形成分子 量大小不等的随机限制性酶切片段,将特定的人 工合成的短的双链接头连在这些片段的两端,形 成一个带接头的特异片段,通过接头序列和PCR 引物3ˊ端选择性碱基的识别,对特异性片段进行 预扩增和选择性扩增。最后只有那些两端序列能 与选择性碱基配对的限制性酶切片段才能被扩增; 最后将选择性扩增产物在高分辨率的变性聚丙烯 酰胺凝胶上电泳,寻找多态性扩增片段。
叫做扩增片断长度多 h.所得数据可在实验室之间交
态性。
流和比较
分子标记的历史:
? 第一代分子标记技术 RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism,限制性片段长度多态性)
? 第二代分子标记技术 RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA,随机扩增多态性DNA )
a.多态性高;
b.共显性遗传,在二倍体的生 物中能区分纯合与杂合状态;

分子标记技术及其在园林植物遗传育种中的应用 精品

分子标记技术及其在园林植物遗传育种中的应用 精品

分子标记技术及其在植物遗传育种中的应用近年,随着生物技术的快速发展,分子标记技术在诸多领域得到应用,尤以农业、医药业、畜牧业等行业应用得最多。

分子标记是指以生物大分子的多态性为基础的遗传标记。

分子标记的出现,使植物育种的“间接选择”成为可能,大大提高了遗传分析的准确性和选育种的有效性,因而在遗传育种领域愈来愈受到重视。

在遗传学研究中广泛应用的DNA分子标记已经发展了很多种,一般依其所用的分子生物学技术大致分为两大类:一类是以Southern杂交技术为核心的分子标记(如RFLP),此类被称为第一代分子标记;以PCR技术为核心的分子标记(如STS、RAPD、AFLP、SSR等)称为第二代分子标记,单核苷酸多态性(SNP)标记称为第三代分子标记,这也是以PCR技术为基础的分子标记技术。

现分别介绍其原理及在植物育种上的应用。

1分子标记在植物育种上的特点分子标记育种(molecular mark-assist selection,MAS)是借助分子标记在DNA水平上对遗传资源或育种材料进行选择,对作物产量,品质和抗性等综合性状进行高效改良,并针对目标性状基困连锁进行优良植株筛选,是现代分子生物学与传统遗传育种相结合的新品种选育方法。

与传统育种相比分子标记的优势是:(1)传统育种通过性状间接筛选目的基因,分子标记则通过直接与目的基因连锁进行筛选,因此,后者比前者准确,特别是在一些表现型与基因型之间对应关系较差时的筛选,(2)传统育种需要在成熟期才能筛选,分子标记筛选则可以不受植物生长发育期的限制,在苗期就可以筛选,而且不影响植株生长,(3)传统方法一次只能标记一个基因,分子标记筛选则可以同时筛选多个目的性状基因,(4)分子标记筛选利用了控制单一性状的多个等位基因,避免了传统育种通过表现型而获得不纯植株的缺陷;(5)分子标记筛选样品用量少,可以进行非破坏性筛选,从而加速育种进程,提高育种效率。

2常用分子标记的技术及其在植物育种上的应用2.1限制性内切酶片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP,简称限制片段长度多态性)RFLP是以分子杂交技术为基础的标记技术,其原理是碱基的突变、缺失、重排或是一段DNA的重排或插入,导致限制性内切核苷酸酶的酶切位点分布发生改变,得到的切割片段在数量和长度上不同,从而产生多态性。

常用的分子标记在分子育种中的应用

常用的分子标记在分子育种中的应用

常用的分子标记在分子育种中的应用示例文章篇一:《常用的分子标记在分子育种中的应用》嘿,同学们!你们知道吗?在神奇的科学世界里,有一种超级厉害的东西叫分子标记,它在分子育种中可发挥了大作用呢!先来说说什么是分子标记吧。

就好像我们每个人都有自己独特的指纹一样,生物体内的基因也有它们独特的“标记”,这就是分子标记啦。

那这些分子标记到底有啥用呢?比如说RAPD 分子标记,它就像一个超级侦探,能迅速找出基因中的不同之处。

想象一下,在一个大大的基因花园里,RAPD 标记能快速地分辨出哪朵花和其他的不一样,神奇不?还有AFLP 分子标记,它就像是一把精准的手术刀,能够把复杂的基因片段切得整整齐齐,让科学家们更清楚地看到基因的结构和特点。

这难道不厉害吗?再看看SSR 分子标记,它就像是一个细心的小管家,能准确地记录基因的变化和遗传规律。

哎呀,这可给科学家们省了不少事儿呢!那这些分子标记在分子育种里是怎么大展身手的呢?就拿培育更优良的小麦品种来说吧。

科学家们用分子标记找到了那些具有抗病虫害基因的小麦植株,然后通过育种让这些好基因传递下去。

这不就像我们在班级里选拔优秀的同学,然后让大家都向他们学习,变得越来越棒吗?“那要是没有分子标记,会怎么样呢?”我的小伙伴小明好奇地问。

“那可就麻烦啦!”我大声说道,“没有分子标记,科学家们就像在黑暗中摸索,很难准确地找到那些优良的基因,育种的效率会大大降低,我们可能就吃不到那么好吃、那么高产的小麦啦!”在分子育种的过程中,科学家们还会遇到各种各样的困难和挑战呢。

有时候分子标记的结果不准确,就好像我们考试的时候答案写错了一样,这可让人头疼啦!但是,科学家们可不会轻易放弃,他们会不断改进方法,让分子标记变得更加可靠和准确。

总之,常用的分子标记在分子育种中的应用真是太重要啦!它们就像是一把把神奇的钥匙,打开了培育优良品种的大门,让我们的农业变得更加发达,让我们的生活变得更加美好!同学们,你们说是不是呀?示例文章篇二:哎呀呀,我一个小学生,要跟您讲讲这“常用的分子标记在分子育种中的应用”,这可真是个超级难的题目呀!您知道吗?就像我们每个人都有自己独特的指纹一样,生物的基因也有它们独特的标记。

甘蔗种质资源AFLP研究的引物筛选

甘蔗种质资源AFLP研究的引物筛选
粱 旭t 鸣 粱 俊t 位 t 杨 何 中,裕 朝 , , 李 , 宽 , 瑞2 为 t 模t 方 李 谭
(. 西 甘 蔗 研 究 所 , 宁 50 0 ;. 西 作 物 遗 传 改 良生 物 技 术 重 点 开 放 实 验 室 , 宁 50 0 ) 1广 南 3072广 南 3 0 7 摘 要 : 两 个甘 蔗 品种 KOC2 以 5和 KOC 3的基 因组 D 2 NA 为模 板 , 用 A L 利 F P技 术 从 1 0对 弓 物 中 筛 选 出 5对 1 1
基 金 项 目 : 西 科 学 基 金 ( 32 o — ) 广 西 农 科 院 基 金 (0 2 2 ) 助 。 广 o4 0 7 2 和 2o02资
作者简介 : 梁朝旭 (9 2 )男 , 1 7 _ , 广西桂林 市人 , 广西甘蔗研究所助理研究员 , 主要从事甘蔗常规育种和分子生物学研究 。
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第 3 期
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甘蔗种质资源 A L F P研究的引物筛选
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68份国外甘蔗种质资源遗传多样性的AFLP分析

68份国外甘蔗种质资源遗传多样性的AFLP分析
组种质相 比,亲缘关系较远,显示了独特 的遗传组成;来 自法国的种质资源具有较高的分散度 , 包含了较多的遗传信息。

键 词 : 甘 蔗 ;国外 种质 ; 扩增 片段长度 多态性 ; 遗传 多样性
中图分号 :1 0 0 7 — 1 0 3 2 ( 2 0 1 3 ) 0 5 — 0 4 6 6 4 ) 5
F r a n c e ( F R ) , t h e U n i t e d S t a t e s ( C P )a n d P h i l i p p i n e s ( V MC )a n d s t o r e d i n t h e N a t i o n a l S u g a r c a n e G e r mp l a s m R e s o u r c e s Ga r d e n b y t a k i n g t h e a mp l i i f e d f r a g me n t l e n g t h p o l y mo r p h i s m( A F L P ) ma rk e r t e c h n i q u e . T h e r e s u l t s h o ws t h a t t h e g e n e t i c
Ab s t r a c t : We h a v e s ud t i e d t h e g e n e t i c d i v e r s i t y o f 6 8 s u g a r c a n e ( S a c c h a r u m s p p . ) g e r mp l a s ms i mp o r t e d f r o m Au s t r a l i a ( Q ) ,
第3 9 卷第 5 期

甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建

甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建
剂 量 标 记 ,占总 标 记 数 的 4 %; 6 4个 亲本 获 得 单 双 剂 量 标 记 的 数 量 依 次 为 C 4 9 0 /5 > 512 R C2 。 在 L o 1> 23 6 Y7 //> O 5 OD≥ 50 . ,相邻 标 记 遗 传 距 离 ≤4 M 的条 件 下 . 1 体 有 14个 单 双 剂 量 标 记 被 纳 入 5 0c F群 3 5个 连 锁 群 ,其 中 3 连 锁 群 归 属 9个
云南省 甘蔗遗传 改 良重点 实验室 ,云南 开远 6 10 ; 云南省 农业科学 院 甘蔗研 究所 ,云南 开远 6 10 ; 云南省农 业科学 院生物 6 6 0 6 6 0 技 术与种质 资源研究所 ,云南 昆明 6 0 2 ; 5 2 3 澳大 利亚联邦科 学与 丁业研究组 织( s R 植物研 究中心,澳大 利亚 Br b n , D 4 6 c I O) i a e QL 0 7 s

Yu na y La o a o y o u a c n n tc I r v me t n n Ke b r t r fS g r a e Ge ei mp o e n ,Kmy a 61 0 , u 6 6 0 Chi a S g c e Re e c n tt t,Y n a a e fAg i u — n n ; u a a s a h I siu e u n n Ac d my o rc l r n r t a c e c s K ̄y a 61 0 Ch n ; urlS in e ,¥ u 6 6 0, i a Bi tc n l g n o e h o o y& Ge e i s u c sI t u e Yu na a e fAg c l r lS i n e , n n 5 2 3 n t Re o r e i t , n n Ac d my o r u t a ce c s Ku mi g 6 0 2 , c ns t i u

甘蔗遗传转化与基因编辑技术研究进展

甘蔗遗传转化与基因编辑技术研究进展

2023年12月第43卷第6期广西糖业GUANGXI SUGAR INDUSTRYVol.43,No.6,Dec.20230引言甘蔗是全球第一大糖料作物,也是重要的能源作物,世界糖产量的75%来源于甘蔗,而我国85%以上的糖产量来源于甘蔗[1],因此,保证糖料供应是保障国家蔗糖安全的重要举措。

甘蔗作为异源多倍体作物,遗传背景复杂,生长周期较长,进行传统育种困难较多,很难同时改变多种不良性状[2]。

目前我国登记的甘蔗品种较多,但商业化种植品种依然较单一,只有新台糖(ROC )、桂糖和桂柳系列等[3]。

甘蔗育种主要目标为高糖、高产、抗病、抗虫、抗旱、宿根性长和适宜机械收割等,但通过常规育种很难达到目的。

转基因技术具有缩短育种时间、按需导入目的基因和避免常规育种出现大量基因重组所导致的复杂筛选过程等优势[4]。

通过转基因育种技术,在重要粮食作物、经济作物及园艺作物增产、抗逆和改善品质等方面已取得重大突破,培育了性状优异的小麦[5,6]、玉米[7]和水稻[8]等作物新品种。

由于甘蔗直接用于榨糖或制备能源燃料,没有人类直接食用过程,所以转基因甘蔗株系不会对人体造成负面影响。

因此,在国际上转基因甘蔗被认为是风险最低(I 级)的转基因作物,科研工作者已在不断探索基因工程在甘蔗上的应用前景,发现其具有巨大应用潜力[9]。

文章对植物的遗传转化方法和转基因技术进行系统综述,并讨论目前适合于甘蔗转基因育种的方案。

在此基础上阐述甘蔗通过转基因技术育种存在的困难,分析甘蔗转基因技术培育新品种的解决方案,针对存在的转化效率低、转基因株系鉴定结果不明确和愈伤组织培育易水渍化和褐化等问题,探讨解决方法,旨在为甘蔗遗传转化和转基因技术应用提供借鉴。

1转基因技术1.1农杆菌转化法农杆菌是一种土栖革兰氏阴性细菌,具有将Ti 质粒的一部分移动并整合到被感染植物细胞核中的天然能力[10]。

利用农杆菌的这种能力,Fraley 等[11]已通过其开发的缺乏肿瘤形成基因的改良农收稿日期:2023-10-28基金项目:广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2023KY1233);广西农业职业技术大学校级科研项目(XKJ2316)通讯作者:黄振(1994-),男,讲师,主要从事甘蔗育种研究工作,E-mail :*******************第一作者:黄堂伟(1988-),男,讲师,主要从事作物栽培及育种研究工作,E-mail :*****************.cn甘蔗遗传转化与基因编辑技术研究进展黄堂伟1,许誉芝2,黄振1*(1.广西农业职业技术大学农业工程学院,广西南宁530007;2.广西大学农学院,广西南宁530004)摘要:甘蔗遗传背景复杂,采用常规育种方法进行甘蔗品种选育耗时较长,对亲本的要求也较高,杂交后代分离严重,且会携带一些不需要的基因。

实验推荐分子标记技术AFLP

实验推荐分子标记技术AFLP

实验推荐分子标记技术AFLP 引言:分子标记技术是现代遗传学和分子生物学研究中不可或缺的工具之一。

由于其高度多态性和高分辨率的特点,AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism,扩增片段长度多态性)技术在种质资源评价、基因组构建和进化生态学研究等领域得到广泛应用。

本文将介绍AFLP 技术的基本原理、实验步骤及数据分析方法,旨在为研究人员提供一种高效、准确的分子标记技术。

一、AFLP技术的原理AFLP技术利用限制性内切酶对基因组DNA进行特异性切割,然后通过PCR扩增和电泳分离等步骤,获得多态性的DNA序列。

其原理流程如下:1. DNA提取:从不同样本(如植物、微生物等)中提取总DNA,保证所需的DNA质量和浓度。

2. 酶切反应:选择适当的限制性内切酶对DNA进行切割,生成特定的DNA片段。

3. 适配体连接:将适配体序列连接到DNA片段的末端,使其成为PCR扩增的起始模板。

4. 扩增反应:利用引物对连接的DNA片段进行PCR扩增,生成大量的AFLP产物。

5. 电泳分离:将扩增的AFLP产物进行电泳分离,根据片段的大小而呈现不同的迁移距离。

6. 成像和数据分析:利用凝胶图像获取AFLP分析结果,并进行数据分析和解读。

二、AFLP实验步骤AFLP实验的具体步骤如下:1. 样本准备:选择适当数量的样本,根据研究目的确定样品的种类和数量,并进行相应的预处理。

2. DNA提取:采用合适的DNA提取方法提取样本中的总DNA,并进行质量和浓度检测。

3. 酶切反应:选择合适的限制性内切酶对DNA进行酶切反应,生成DNA片段。

4. 适配体连接:将适配体序列连接到DNA片段末端,以便进行扩增反应。

5. 扩增反应:利用PCR技术对连接的DNA片段进行扩增,生成大量的AFLP产物。

6. 电泳分离:将扩增的AFLP产物进行凝胶电泳分离,根据片段大小进行排序,形成AFLP图谱。

7. 图谱分析:根据AFLP图谱进行数据分析,解读样品之间的遗传关系。

aflp技术的原理与应用

aflp技术的原理与应用

AFLP技术的原理与应用1. 简介AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism,扩增片段长度多态性)技术是一种基于PCR扩增的分子标记技术,用于研究基因组的遗传多样性和基因型差异。

它结合了限制性内切酶的切割特点和PCR扩增的高效性,可以快速而高效地分析大量DNA样本上的多态性。

2. 原理AFLP技术将DNA分子进行限制性内切酶切割,得到的片段通过两次PCR扩增反应使其增加特异性引物序列,然后通过聚丙烯酰胺凝胶电泳分析DNA片段的长度差异,从而确定遗传多样性。

AFLP技术的主要步骤包括:2.1 DNA样本的制备首先,需要从研究对象中提取DNA样本,并通过质量检测确保样本的质量和纯度。

通常使用酚/氯仿法、磁珠法等方法提取高质量的DNA。

2.2 限制性内切酶切割将提取的DNA样本与适当的限制性内切酶一起孵育,选择性切割DNA片段。

不同的内切酶会产生不同的切割模式和DNA片段长度。

2.3 适配体连接适配体是特定序列的引物,通过连接适配体,使得限制性内切酶切割的DNA 片段获得特异性序列。

适配体连接反应包括两步PCR反应,第一步是单核苷酸加酶反应(T4 DNA核苷酸转移酶),第二步是锚定PCR。

2.4 扩增和荧光标记经过适配体连接后的DNA片段即可进行扩增反应。

采用带有荧光染料的引物进行PCR扩增,荧光标记的引物可用于不同长度的DNA分子之间的区分。

2.5 凝胶电泳分析将扩增产物进行凝胶电泳分析,通常使用聚丙烯酰胺凝胶,根据DNA片段的长度差异,通过荧光检测仪或射线照射,获得DNA的长度信息。

3. 应用AFLP技术具有高通量、高灵敏度和高分辨率的特点,广泛应用于生物学和农学等领域。

以下是AFLP技术的一些应用:3.1 遗传多样性研究AFLP技术可以用于测定不同个体、种群或物种之间的遗传多样性,从而了解基因组的遗传变异情况。

3.2 基因型鉴定AFLP技术可以用于鉴定不同个体或物种之间的基因型差异,以区分各个个体或物种。

甘蔗基因定位及分子标记辅助育种研究

甘蔗基因定位及分子标记辅助育种研究

K yw r s sgra e r e—si e lc o ;g n ;Q L e od : u a n ;ma ras tds et n e e T c k s e i
作 物 中大 多 数 重 要 的农 艺 性 状 和 经 济性 状 如 产 量 、品 质 、生 育期 、抗 逆性 等 都 是 质 量性 状 或 数量 性状 ,受单 基 因或多 个 数 量基 因位 点 Q eTat oi , )和 环 境 因子 的 共 同作 用 t v L
mo c a ak reh iu , b nfe r e u yo a n e e n ce rt edvlp n f S ( re— si- l u r r e tcnq e el m e e tdi f t r td fo t ggn s dacl a t eeomet i n uh s l i c a e e h d o MA Mak rA s t s e eet n t h iu uacn r dn . hs tde t d cdtersac ok o su t gm lc a ak r p dSlc o ) e nq ei sgra ebe ig T e s i i r ue eerhw rsi cnt c n o ur m re - i c n e e u sn o h n r i el ma
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量 性状 的遗 传 研究 比质量 性状 的研 究 困难 许 多 。长 期 以来 ,只能 借助 数 理统 计手 段 ,将 控 制数 量性 状 的多基 因 系统作 为 一 个整 体来 研究 ,用平 均 值 和方 差 来反 映数 量 性状 的遗传 特征 ,但 这 些方 法 无法 了 解 单个 基 因 的位置 和 效应 。这 种状 况 制 约 了人们 在

崖城系列甘蔗亲本遗传多样性的AFLP标记分析

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系遗传 多样性指数 较低 。建议在亲本创新过程 中, 同一亲 本不宜过多重复使用 。 关键词 甘 蔗, 崖城 系列亲 本, F P 遗 传多样 性 A L,
AFLP An l sso n tcDi e st e i sS g r a ePa e t v l p d ay i fGe ei v r i i S re u a c n r n sDe e o e y n a S t H BS
p is r 4 , n e ec na eo p lmop im c s 73 % . eg n t i lry id x s( I f 2 ar e6 .0 a dt r e tg f oy r hs l i .0 Th e ei s a t e e GS)o we 1 hp o wa 7 c mi i n 5
研 究报 告
Re e r h Re o t s a c p r
崖城 系列 甘蔗 亲本遗 传 多样 性 的 A L F P标记 分析
劳方业 刘 睿 何慧怡 邓海华 陈仲 华 陈健文 符成 张垂 明 杨 业后
广 f甘 蔗 糖 业研 究 所 , 东 省甘 蔗 改 良与 生物 炼 制 重 点 实验 室 , 州 , 13 6 、 I ' 1 广 广 50 1 通 讯 作者 ,a fny@ 2c . r l ag e ncn o l o
料分 为 5 大类 , 系谱记录 中亲缘 关系密切 的品系 , 大多数都 能归为 同一类 。不 同年代品系 的遗 传多样性指数差 异 明显 , 最高 是 2 0世纪 9 0年代 , 0 1 , 为 _ 5 最低 是 2 纪 的 5 ~ 0 代 , 0 6 ; 自相 一组合 的后代 品 3 5 0世 07 年 为 .5 来 2 4
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AFLP分子标记及其在作物遗传育种中的应用与前景

AFLP分子标记及其在作物遗传育种中的应用与前景

AFLP分子标记及其在作物遗传育种中的应用与前景
罗培高;任正隆;张怀渝;傅体华
【期刊名称】《四川农业大学学报》
【年(卷),期】2001(019)004
【摘要】AFLP是一种基于PCR技术的新的分子标记,也是一种可靠而又理想的遗传标记方法.本文简述AFLP的发展、原理、方法与特点,并综述其在遗传学和育种学中的应用现状及前景.
【总页数】5页(P406-410)
【作者】罗培高;任正隆;张怀渝;傅体华
【作者单位】四川农业大学,植物遗传育种省级重点实验室,四川,雅安,625014;四川农业大学,植物遗传育种省级重点实验室,四川,雅安,625014;四川农业大学,植物遗传育种省级重点实验室,四川,雅安,625014;四川农业大学,植物遗传育种省级重点实验室,四川,雅安,625014
【正文语种】中文
【中图分类】Q789;S330
【相关文献】
1.AFLP分子标记在泡桐遗传育种中的应用与前景 [J], 王念;何威;王文君;刘迎节
2.AFLP分子标记技术及其在蔬菜遗传育种中的应用进展 [J], 侯雷平;梅燚;崔艳玲;陈海丽;孟淑春
3.AFLP分子标记技术在蚕豆遗传育种中的应用 [J], 李萍
4.AFLP分子标记在茄果类蔬菜遗传育种中的应用 [J], 尹秀丽;张喜春
5.AFLP分子标记技术在桑树遗传育种研究中的应用前景 [J], 王卓伟;余茂德;鲁成因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

利用AFLP进行“甘蔗属复合体”系统演化和亲缘关系研究

利用AFLP进行“甘蔗属复合体”系统演化和亲缘关系研究
研究甘蔗种质资源的系统演化和亲缘关系对深 入探讨甘蔗种质资源遗传背景 ,评价其遗传多样性水 平具有重要意义 。随着现代分子生物学技术的不断 发展 ,DNA 分子技术以其稳定的遗传特性为遗传多 样性研究提供了真实可靠的研究手段和依据 ,RFL P、 RAPD 等 技 术 相 继 在 甘 蔗 研 究 领 域 得 到 了 应 用 。 Besse[3 ,4] 利用 RFL P 技术 ,对保存在澳大利亚和美国 的甘蔗属 2 个种和蔗茅属 11 个种进行了 rDNA(包括 26S + 18S 和 5S) 位点分子标记遗传多样性研究及其 属种间遗传分类关系评价 ;Nair[5] 利用 RAPD 分子标 记对印度保存的“甘蔗属复合体”中 4 个属 9 个种进 行了属种间系统分类关系研究 ;美国的 Pan[6] 对甘蔗 栽培品种和野生种进行了 5S rRNA 间隔区 (5S rRNA intergenic spacers) PCR 检测 ,分析评价了甘蔗品种与 野生种的遗传关系。近年来 ,我国甘蔗研究机构也相 继利用分子标记技术进行了甘蔗种质资源遗传多样 性等研究 。范源洪等[7~10] 利用 RAPD 标记技术对甘 蔗及其近缘属 、甘蔗细茎野生种进行了属种间遗传多 样性研究 ,通过核糖体 DNA 内转录间隔区 ( ITS) 序列 测定 ,对甘蔗及其近缘属的系统演化和亲缘关系进行 了分析 ,并在一定程度上揭示了“甘蔗属复合体”内各 属种间的遗传分类关系 。新近发展起来的 AFL P (amplified fragment length polymorphisms) 分子标记技 术 ,是 RFL P 和 RAPD 的结合 ,既有 RFL P 的可靠性 , 又具有 RAPD 的方便性 ,被认为是当前较有效的分子 标记技术[11~13] ,但在“甘蔗属复合体”属种间的系统 分类研究上未见报道 。

甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建

甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2010, 36(1): 177−183/zwxb/ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@本研究由中-澳合作项目(CS1/2000/038),云南省应用基础研究计划重点项目(2006C0013Z)和国家科技基础条件平台工作项目子专题(2007DKA21002-11)资助。

*通讯作者(Corresponding author): 范源洪, E-mail: fyhysri@第一作者联系方式: E-mail: lxlgood868@Received(收稿日期): 2009-06-03; Accepted(接受日期): 2009-08-31.DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.00177甘蔗SSR 和AFLP 分子遗传连锁图谱构建刘新龙1,2 毛 钧1,2 陆 鑫1,2 马 丽1,2 Karen Sarah AITKEN 4 Phillip Andrew JACKSON 4 蔡 青1,3 范源洪1,2,*1云南省甘蔗遗传改良重点实验室, 云南开远 661600; 2 云南省农业科学院甘蔗研究所, 云南开远 661600; 3云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所, 云南昆明 650223; 4澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)植物研究中心, 澳大利亚Brisbane, QLD 4067 摘 要: 采用甘蔗商业品种Co419与野生种割手密Y75/1/2杂交, 获得269个单株, 组成F 1群体, 用F 1 02/356与商业品种ROC25回交获得266个单株, 组成BC 1群体。

利用筛选的多态性条带丰富的36对SSR 引物和12对AFLP 引物, 对两个群体进行PCR 扩增和分子遗传连锁分析, 构建甘蔗分子遗传连锁图谱。

用F 1群体获得630个分离标记, 经χ2检测, 298个标记为单双剂量标记, 占总标记数的47%; 用BC 1群体获得571个分离标记, 有264个标记为单双剂量标记, 占总标记数的46%; 4个亲本获得单双剂量标记的数量依次为Co419>02/356>Y75/1/2>ROC25。

中国滇蔗茅种质资源遗传多样性的AFLP分析

中国滇蔗茅种质资源遗传多样性的AFLP分析

作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2009, 35(2): 262−269/zwxb/ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@本研究由云南省重点基金项目(2006C0013Z), 国家科技基础条件平台项目(2007DKA21002-11), 国家财政部行业专项(nyhyzx07-019), 科技部广西省部会商项目(2007BAD30B02)资助。

*通讯作者(Corresponding author): 蔡青, E-mail: caiqingysri@第一作者联系方式: E-mail: lxlgood868@Received(收稿日期): 2008-06-16; Accepted(接受日期): 2008-09-04.DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.00262中国滇蔗茅种质资源遗传多样性的AFLP 分析刘新龙1 蔡 青2,* 毕 艳1 陆 鑫1 马 丽1 应雄美11云南省农业科学院甘蔗研究所, 云南开远661600; 2 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所, 云南昆明650223摘 要: 利用10对AFLP 引物对来自国家甘蔗资源圃的41份滇蔗茅(Erianthus rockii )无性系进行扩增, 获得860个片段, 多态性条带629个, 多态性条带比率0.73, 特异片段54个。

遗传相似性系数、UPGMA 聚类和主效应分析表明, 在相似系数0.52处做切割线, 毛轴野古草、斑茅和滇蔗茅无性系分为3个类群; 在相似系数0.715处做切割线时, 又将41份滇蔗茅无性系划分为3个大类群, 云滇07/23独自形成A 类群, 鉴于其叶鞘背毛, 有待作进一步的分析; B 类群3份无性系, 主要来自云南西南部高海拔地区; C 类群37份无性系, 其中30份来自云南西南方向的保山、德宏地区, 其他地区7份; 在相似系数0.738处做切割时, 将C 类群37份无性系划分为4个亚类群, 亚类群的划分反映出明显的地域分布规律, 来自同一地区的无性系多聚为一类; 在相似系数0.765处做切割可将C4亚类群划分为4个亚类群(C4-1, C4-2, C4-3, C4-4), 其中C4-3亚类群中云滇07/9/1与云滇99/4分子聚类最为相似, 可作为复份材料保存; C4-3亚类群在相似系数0.773处切割又可以分为3个分支类群, 以上分析反映出同一地区无性系之间具有丰富的遗传变异; 主效应分析反映的属间、种间、无性系之间的亲缘关系与分子聚类分析结果一致; 由此可见, 丰富的地理生态条件造就了滇蔗茅丰富的遗传多样性和明显的地域性分布规律。

分子标记AFLP及其在遗传分析中应用

分子标记AFLP及其在遗传分析中应用

分子标记AFLP及其在遗传分析中应用
朱文进;曹瑞琴;张纪刚;王曦;杜美红;郭传甲
【期刊名称】《猪业科学》
【年(卷),期】2001(019)005
【摘要】AFLP是一种新的DNA标记,它是利用PCR技术对基因组DNA双酶切片段的选择性扩增.这种技术可经济、快捷、有效地产生大量分子标记,且多态标记丰富、均匀地遍布整个基因组、共显性遗传、重复性和可比性强.标记研究无需预先了解基因组的序列信息.
【总页数】3页(P21-23)
【作者】朱文进;曹瑞琴;张纪刚;王曦;杜美红;郭传甲
【作者单位】山西农业大学动物科技学院,;山西农业大学动物科技学院,;山西农业大学动物科技学院,;山西农业大学动物科技学院,;山西农业大学动物科技学院,;山西农业大学动物科技学院,
【正文语种】中文
【中图分类】S813.3
【相关文献】
1.AFLP分子标记技术及其在蔬菜遗传育种中的应用进展 [J], 侯雷平;梅燚;崔艳玲;陈海丽;孟淑春
2.AFLP分子标记在枣研究中的应用进展 [J], 王晓玲;许莉斯
3.AFLP分子标记技术在蚕豆遗传育种中的应用 [J], 李萍
4.AFLP分子标记技术在中药研究中的应用进展 [J], 肖硕
5.AFLP分子标记在牦牛遗传分析中的初探 [J], 江明锋;姜权
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AFLP揭示的热带和亚热带印度甘蔗品种间的基因组结构和遗传关系

AFLP揭示的热带和亚热带印度甘蔗品种间的基因组结构和遗传关系

AFLP揭示的热带和亚热带印度甘蔗品种间的基因组结构和遗
传关系
谢国禄(摘译)
【期刊名称】《作物育种信息》
【年(卷),期】2006(000)006
【摘要】甘蔗(Saccharum spp.)是一种热带植物。

在印度,开始于20世纪
初期的系统育种育成了适宜亚热带环境的品种。

尽管有较长的育种历史,但系统育种者并不了解这些品种的遗传结构。

本研究采用扩增片断长度多态(AFLP)方法,鉴定了暇热带和亚热带地区栽培的28个商品甘蔗品种。

研究中所用的12个选择
性引物组中有11个可以逐个地相互区分全部品种,这表明了这些引物组在鉴别甘蔗品种方面的有用程度。

【总页数】1页(P12)
【作者】谢国禄(摘译)
【作者单位】无
【正文语种】中文
【中图分类】S566.1
【相关文献】
1.热带、亚热带玉米自交系与温带自交系遗传关系研究
2.外来热带、亚热带玉米自交系与温带玉米自交系产量配合力分析及其遗传关系的研究
3.AFLP分析揭示的东
南亚甜瓜资源的遗传关系4.采用AFLP分析所揭示的南非栽培花生基因型间的遗传变异5.利用AFLP揭示野生萝卜东亚自然群体的遗传关系和遗传多样性
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AL F P分子标记技术在甘蔗遗传育种上的应用
李 鸣 .梁 旭 ,位 3梁 俊, 杨 谭 模 ,为 ,朝 3 宽 , 一 方 , 瑞, 裕 中 李 何
(. 国科 学 院寒 区 旱 区环 境 与 工程 研 究所 , 州 7 00 ; . 西 作物 遗 传 改 良生 物 技术 重 点 开放 实 验 室 , 宁 5 00 ; 1中 兰 3 00 2 广 南 3 0 7 3广 西甘 蔗研 究 所 , 宁 5 00 ) . 南 30 7
用潜 力和前 景 。
1 AF P 分 子 标 记 技 术 的基 本 原 理 L
A L ( m l e rg e t e g o m rhs 扩 增 片段 长度 多 态性) F PA pi dFa m n n t P l op i i f L h y m, 是荷 兰科 学 家 Z b a a eu和 V s于 o 19 9 2年建立起 来 的一种 检测 D A多态性 的新方 法。其原 理是基 于 P R技 术选 择性扩 增基 因组 D A限制 N C N 性酶切 片段 , 本质上 与 R L F P一致 。 L AF P综合 了 R L F P和 R P A D的优点 , 既有 R L F P的稳定 性和 P R反应快 C 速、 灵敏 的特 点 , 又有 R P A D的方便性 , 同时还克服 了 R L F P和 R D的缺 点【 。其 基本 流程包括 3个 步骤 : AP 5 I q ( ) 因组 D A用 限制 性 内切酶 酶切后 , 特定 的 A L 1基 N 与 F P寡聚核 苷酸 接头 (d po 连接 , A at) r 形成 一个 带接头 的 特异 片段 。 限制性 酶 切 片段 用两 种酶 切割 产生 ,一 种是 切 割位点 少 的识 别 位点 为 6个碱 基 的 内切酶 , 如 DI R 。一种 是切割位 点多的识别 位点为 4个碱基的 内切酶 , MsI 2 通 过接头序列 和邻近 的限制性酶 切 如 e。( )
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S g r Cr p fChn u a
文 章 编 号 :0 7 2 2 ( 0 6 0 - 0 3 0 10 — 6 4 20 )1O 4 — 4 -
2 AI P在 甘 蔗 遗 传 育 种 研 究 中的 应 用
21 鉴 定 品 种 或 种 质 .
指纹 图谱 技术 在植物 育种 中最 为直接 的应用 就是 品种 鉴定及 品种质量 和纯度 的检测 。Z b a ae u和 V s・ o[t s 6
位点序列作 为引物 结合位 点 , 以引物 3 端的识别 进行 P R选 择性扩 增 限制性 酶切 片段 , C 可使 目的序列 扩增
至 O g 3 用变 性聚 丙烯 酰胺凝胶 电泳分 离 , . 1 。( ) 5 通过 放射 自显 影[ 、 5 荧光 标记 霓 酸银染 检 测 。 一 核 ・ 研
遗传 标 记 (e ei Mak r 是 基 因型 特殊 的 易 于识别 的表现 形 式 。 G n t res c ) 它一 般 具有 较 强 的 多态 性 、 表现 的 共显 性 、 不影 响 重要 的农 艺 性状 , 济方便 、 经 易于 观察 记载 等优 点【 】 1 。随着 遗 传学 的发 展 , 传标 记 也 不断 遗 得到发 展 , 描述 生物 外 部特 性特 征 的传统 形态 标g ( rh lg a Mak r)到研究 染 色体 核 型 和带 型的 从 i Mop ooi l res,  ̄ c 细胞标 i (yo gcl re )生物 生化特 性特 征 的生化标 记(ic e ia Mak r 1 2 能够 反 映生 物个体 g C tl i k r 、 o a Ma s Bo h m cl re ) ; s)  ̄ A 或种群 间基 因组 中某 种差 异特 征 D A片段 的 D A分子标 记 f lclr re ) N N Moeua k r 。前 3种标 记 都是 基 因表 Ma s 达 的结 果 , 是对 基 因 的间 接反 映 , 标记 数 目有限 , 多态 性 较差 , 易受 环 境 的影 响 , 不能 满 足种 质 资 源鉴 定 和 育 种工作 的 需要 。而 D A分 子标记 是直接 在 D A分 子上 检测生 物 之 间的差 异 , D A水 平遗 传变 异 的 N N 是 N 直 接反 映 , 它具 有 不受 生 育期 、 环境 和基 因表 达 与否 的 限制 , 量极 多 , 及整 个基 因组 , 态 性 高和 遗传 数 遍 多
稳定 的特 点【 。分 子标 记 虽 处 于起步 阶段 。 存在 一定 的局 限性 。 其 准确 、 但 可靠 和高 效率 等优 越 性 在实 践
中已充分 表现 出来 , 克服 了形 态 、 化和 细胞等 遗 传标 记作 为鉴 定 和辅助 选择 中遇 到 的许 多难 以解决 的 它 生 问题 。农作 物 育种 和 品种鉴定 等 有关研 究将 随着分 子标 记技术 的 日趋 成熟 及其 在植 物指 纹分 析 、资源 检 测 、 因定 位和 遗传 图谱 绘制 等 方面的 广泛应用 和深入研 究 中得到 发展 , 展现 出分 子标 记技术 巨大的 应 基 并
摘 要 : 述 了 A L 论 F P分 子 标 记 技 术 的 产 生 、 点 和基 本 原 理 。 特 目前 A L F P分 子 标 记 技 术 在 甘蔗 遗传 育种 研 究 中 广 泛应 用 于鉴定 品种 或种 质 。 测遗传 多样 性 。 建 分子连 锁遗 传 图谱 , 检 构 定位克 隆 基 因等领 域 , 现 出广 阔 的应 用前 景 。 展 关 键 词 : 蔗 遗 传 育种 ; F P分子 标 记 ; 用 甘 A L 应 中图 分 类 号 :5 61 3 ¥6 . 0 文 献 标识 码 : A
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