实验室及研究工作简介

Strategy of Spectral Simulation
SPECTRAL SIMULATION
STRUCTURAL ELUCIDATION
O
Descriptors
C NH2
SIRS-SS: Substructure/Subspectra correlation 4 subdatabases: .Small molecules; .Atom focused FRELs; .Particular fragments; .Bond focused FRELs
实验室及研究工作简介
Prof. B.T. Fan ITODYS, Université Paris 7 - Denis Diderot CNRS UMR 7086, 1, rue Guy de la Brosse, 75005 Paris Cedex, France
CAS，北京 2004年 ， 年
ITODYS （系统界面、组织和动力学研究所） 系统界面、组织和动力学研究所）
Dubois Doucet Fan
高分子功能材料 和纳米复合材料
表面和界面 及生物传感 器
生物体系和 生物大分子 的物理化学
MAIN RESEARCH AREAS
Quantum Calculations
Organic reactions Processes …… Materials
Chemoinformatics
Theoretical Study of Reaction Mechanism
Scheme 3
N O N O H − O H SN2 H endo TS − R O H H X X H N O H exo TS H − O HR H exo N O R H O H N O H endo H R O
Substructure/Subspectra Correlation and Databases of SIRS-SS
Small Molecules
Particular Fragments
Atom focused FRELs
Bond focused FRELs
Example
BUTYL BENZOATE
巴黎第七（狄德罗）大学－ 巴黎第七（狄德罗）大学－法国国家科研中心 UMR7086
总人数（包括研究生、博士后等）：约 总人数（包括研究生、博士后等）：约 120－150人 ）： － 人 正式研究人员及员工： 正式研究人员及员工：70 教授和主任研究员人数： 教授和主任研究员人数：14 主要研究领域 化学信息学 和分子模型
Molecular Graph Handling Ring Perception; Detection of Constitutionally Equivalent Sites; Automorphism; Homomorphism; Isomorphism; Pattern Recognition; Graphic Index; Canonic Numbering; Relative Symmetry; ……
B.T. Fan, A. Barbu and J.P. Doucet, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2., 1997, pp1937-1941. G. Klopman, M.H. Tu and B.T . Fan, Theor. Chem. Acc., 1999,102,33-38. O. Spérandio, B. T. Fan , K. Zakrzewska, Z.J. Jia , R.L. Zheng, A. Panaye, J.P. Doucet, N. Elefassi, SAR and QSAR Environ. Research., 2002, 13, 243-260. Kun Gao, Bo Tao Fan, Nadia El Fassi, Krystyna Zakrzewska, Zhongjian Jia, Ronglian Zheng, Annick Panaye, and Jean-Pierre Doucet , QSAR & Comb. Sci., 2003, 22, 18-28. P.F. Xu, S. Li, T.J. Lu, C.C. Wu, B.T. Fan, G. Golfis, submitted to JACS.
Molecular Graphs Data Mining Spectral Simulation Structural Elucidation Molecular Similarity and Diversity
B
Bioactive Molecules and Drug Design
PPGs, Rutin, Quercetin, …: Action Mechanism Saccharide-Saccharide Interaction Rational Structure Generation Anti-HIV Drug Design Anti-Cancer Drug Design Virtual High Throughput Screening RNA Target Drug Design
CALCULATION OF SR NUMBER (nR)IN SSSR
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
nR = 1 +
∑
i =1
i N (C i + 2 ) 2
DETECTION PROCEDURE OF EQUIVALENT SITES
B.T. Fan, A. Panaye, J.P. Doucet and A. Barbu. J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1993, 33, pp657-662. B.T. Fan, A. Panaye, J.P. Doucet and A. Barbu, AIP Conference Proceedings 330, pp538-543. B.T. Fan, A. Barbu, A. Panaye and J.P. Doucet, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1996,36,654-659. J.E. Dubois, J.P. Doucet, A. Panaye and B.T. Fan, In "Topological indices and related descriptors in QSAR and QSPR". Gordon and Breach Sciences Publishers, the Netherlands, 1999, pp613-673. B.T. Fan, A. Panaye, J.P. Doucet, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1999, 39, 630-631. J.H. Yao, S.G. Yuan, H.F. Chen, C.Z. Zheng, S. Yang, B.T. Fan, A. Panaye, J.P. Doucet, Compt. & App. Chem., 1999, 16, 97-100. B.T. Fan, A. Panaye, J.H. Yao, S.G. Yuan and J.P. Doucet, DIMACS Series in Discrete Mathematics and Theoretical Computer Science, Vol. 51, Eds. P. Hansen, P.Fowler and M. Zheng, 2000,129-138. M. Petijean, B.T. Fan, A. Panaye and J.P. Doucet, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2000, 40, pp1015-1017. B.T. Fan, A. Maldonado, M. Petitjean, “Molecular similarity and diversity : concepts and applications”. Invited Review, Mol. Diversity, in preparation.
RING PERCEPTION
nR = 1 +
1 2 × 12 + × 1 = 8 2 2
Elimination Technique
This technique concerns the successive removal of reducible nodes from a block according certain criteria, which decreases rapidly the number of nodes involved in next searching step of the smallest rings, and saves considerably the CPU time.
中国科学院海外杰出青年学者基金 绿色化学农药先导结构及作用靶标的发现与研究 (973项目：2003CB114401） (973项目： 项目 中山大学肿瘤研究所（广东省和广州市重点项目：抗癌药物） 中山大学肿瘤研究所（广东省和广州市重点项目：抗癌药物） 其它项目
中法合作项目： 中法合作项目：
年起开始合作， 从1994年起开始合作，获得多项中法合作项目资助： 年起开始合作 获得多项中法合作项目资助： PRA M95-01, PRA M98-03，PRA SI00-05，PRA SI02-03， CNRS/ACS ， ， ， N°7491, N°10337, N°12475，等 ° ° ° ， 年来， 多篇论文， 近5年来，共发表了约 多篇论文， 一本专著， 获得了两个软件著作 年来 共发表了约80多篇论文 一本专著， 个奖项， 权，4个奖项，一个专利申请。 组织召开了一次中法学术讨论会， 个奖项 一个专利申请。 组织召开了一次中法学术讨论会， 并将与上海有机所联合主办第三届 CMTPI （CMTPI－2005）国际 － ） 会议
1.0
0.9
0.8
0.7
0.6 Absorbance
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
4000
3000
2000 Wavenumbers (cm-1)
1000
"SIRS-SS: system of simulation of IR/Raman spectra. I. substructure/subspectra correlation", J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2001, 41, 1046-1052. "SIRS-SS: system of simulation of IR/Raman spectra. II. Spectral simulation and performance", J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2002,42, 199-207. “SPECOIND: Ageneral IR spectral database search method". Applied spectroscopy. 2003, 57(7), 858867.
+
X−
+
XCH2R
+
X−
Geometries of transition states obtained from ab initio calculation Imaginary frequency: –338.98cm–1 for axial attack TS, –383.37cm–1 for equatorial attack TS
Scientific Prize of AFCRST, 2001, France Copyright of software: IDDN.FR.001.160015.D.P.2002.000.20700
Non-Linear Methods Applied to QSAR/QSPR
ANNs and Applications in QSPR SVM and Applications to QSAR/QSPR
Genetic Algorithms
参与中国的科研及中法合作项目
参与项目： 参与项目： 中国国家自然科学基金