SSR分子标记对菜豆品种鉴定的研究_田甜
SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究进展(一)
SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究进展(一)论文关键词:种子纯度SSR标记研究进展论文摘要:种子纯度在种子生产中的地位日益提高,以往的形态鉴定等方法难以满足人们的要求。
随着分子标记技术的发展,越来越多地被应用到种子纯度鉴定中。
本文介绍了SSR分子标记技术的基本原理和特点,简要叙述了SSR标记技术在农作物种子纯度鉴定上的研究进展,并就其在杂交种纯度方面的应用潜力进行了探讨。
Keywords:Seedpurity;SSRmarkers;ResearchprogressesAbstract:ThestatusofSeedpurityareincreasedinseedproduction.Itisdifficulttomeetpe oplethatthemethodsofpastidentifications.Withthedevelopmentofmolecula rmarkers,SSRareappliedtotheidentificationofseedpurityincreasingly.Inthisp aper,SSRmolecularmarkertechnology,thebasicprinciplesandcharacteristicsa resummarized.ItisdescribedtheresearchprogressesofSSRmarkersinthepurit yofcropseed.And,itisdiscussedthepotentialapplicationsinthepurityofhybrid.1.前言随着我国农业经济的发展和种子市场的逐步规范,种子的真假和纯度对种子生产具有越来越重要的影响。
为了保护农民以及育种者的利益,发展快速、稳定、可靠的品种纯度鉴定方法具有重要的意义。
种子品种纯度鉴定主要包括品种真实性和品种纯度鉴定两个方面。
品种鉴定主要指对供检样品的真实性进行鉴定。
《2024年基于SSR标记的小豆品种鉴定体系建立及应用》范文
《基于SSR标记的小豆品种鉴定体系建立及应用》篇一一、引言小豆作为我国重要的粮食作物之一,其品种繁多,品质差异大。
为了准确鉴定小豆品种,保障农业生产及市场流通的顺利进行,建立一套高效、准确的小豆品种鉴定体系显得尤为重要。
本文旨在介绍基于SSR(Simple Sequence Repeat)标记的小豆品种鉴定体系的建立及其应用。
二、SSR标记技术简介SSR标记,即简单重复序列标记,是一种基于DNA多态性的分子标记技术。
其优点在于操作简便、重复性好、信息量大等,因此在作物品种鉴定、遗传图谱构建等方面得到了广泛应用。
SSR标记通过分析特定基因座上的重复序列的变异情况,可实现作物品种的快速、准确鉴定。
三、小豆品种鉴定体系的建立1. 样品采集与DNA提取:从各地收集小豆品种样品,采用合适的DNA提取方法获取高质量的DNA。
2. SSR引物设计:根据小豆基因组信息,设计特异性高、多态性好的SSR引物。
3. PCR扩增及数据分析:以提取的DNA为模板,进行PCR 扩增,通过电泳、测序等方法获取SSR标记的基因型数据。
4. 品种鉴定模型的构建:利用统计软件对基因型数据进行处理,建立小豆品种鉴定模型。
四、小豆品种鉴定体系的应用1. 品种纯度鉴定:通过SSR标记技术,可快速鉴定小豆种子的纯度,为种子质量检测提供依据。
2. 品种资源保护:利用SSR标记技术对小豆种质资源进行鉴定,为种质资源的保护和利用提供支持。
3. 遗传育种研究:SSR标记技术可用于小豆遗传图谱的构建,为小豆遗传育种研究提供有力工具。
4. 农业执法与市场监管:通过SSR标记技术,可对市场上的小豆品种进行快速、准确的鉴定,为农业执法与市场监管提供支持。
五、结论本文建立了基于SSR标记的小豆品种鉴定体系,通过样品采集、DNA提取、SSR引物设计、PCR扩增及数据分析等步骤,成功构建了小豆品种鉴定模型。
该体系具有操作简便、重复性好、信息量大等优点,可广泛应用于小豆品种的纯度鉴定、资源保护、遗传育种研究以及农业执法与市场监管等领域。
利用SSR分子标记研究白菜类亚种资源的遗传多样性
利用SSR分子标记研究白菜类亚种资源的遗传多样性李光光;黄红弟;张华;郑岩松;李荣华【摘要】In order to analyze the evolution of Chinese cabbage [ssp. chinensis (L.) Makino] resource, a total of 94 Chinese cabbage [ssp. chinensis (L.) Makino] materials were used to assess the genetic diversity. The results showed that, nineteen cabbage SSR primers combinations amplified 137 alleles, 7.16 loci on average for each pair of primers. The average of polymorphism loci percentage ( P), genetic heterozygosity ( He), effective number of alleles (Ne), Shannon-Wiener index (H') and polymorphism information content (PIC) was 99.9%, 0.897, 11.598, 2.454, 0.886, respectively, and there were extremely significant correlation among them except P value. 94 Chinese cabbage [ssp. chinensis (L.) Makino] materials were clustered into three groups by UPGMA when GSC was 0.58, much of local Chinese cabbage was closer relationships with pakchoi. The order of genome amplification polymorphism by Chinese cabbage SSR primers was (small) cabbage, red bolt second lowest and wild mustard.%为研究几种白菜类亚种资源的演变过程,利用白菜SSR引物对94份白菜类亚种种质资源进行遗传多样性分析.结果表明,19对SSR引物扩增出137个条带,平均每对引物可扩增出7.16个;多态性位点百分率(P)、基因杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)、Shannon-Wiener指数(H')和多态信息含量(PIC)的均值分别为:99.9%、0.897、11.598、2.454、0.886,除P值外,4个指标间相关性极显著;94份白菜类亚种种质资源的UPGMA聚类结果表明:在遗传相似系数为0.58时实验材料分为3类,多数地方种菜心与小白菜亲缘关系更近.白菜SSR引物对大(小)白菜基因组具有较好的多态性、红菜苔次之、野生芥菜最低.【期刊名称】《热带作物学报》【年(卷),期】2017(038)007【总页数】7页(P1316-1322)【关键词】白菜类亚种资源;SSR;遗传多样性;亲缘关系【作者】李光光;黄红弟;张华;郑岩松;李荣华【作者单位】广州市农业科学研究院, 广东广州 510308;广州市农业科学研究院,广东广州 510308;广州市农业科学研究院, 广东广州 510308;广州市农业科学研究院, 广东广州 510308;广州大学生命科学学院, 广东广州 510006【正文语种】中文【中图分类】S330doi10.3969/j.issn.1000-2561.2017.07.021芸薹属白菜类蔬菜[Brassica campestris L.ssp. chinensis(L.)Makinomunis Tsen et Lee]为A基因组,除了大白菜外,其亚种有5个变种:普通白菜变种(munis Tsen et Lee)、乌塌菜变种(var.rosularis Tsen et Lee)、菜薹变种(var. utilize Tsen et Lee)、紫菜薹变种(var.purpurea Bailey)及薹菜变种(var.tai-tsai Hort),经过自然及人工选择形成了类型丰富的群体。
利用SSR分子标记技术快速鉴定杂交油菜天禾油10号纯度
利用SSR分子标记技术快速鉴定杂交油菜天禾油10号纯度作者:朱哲逸张彩娟徐青青朱宗河来源:《安徽农学通报》2019年第04期摘; 要:以甘蓝型油菜天禾油10号及其父母本为材料,利用SSR分子标记方法对天禾油10号杂交制种待测样品进行了鉴定分析。
结果表明,利用引物CB10036、CN48鉴定待测样品144棵单株,纯度为67.08%,同批次待测样大田种植鉴定纯度为70.2%,两种方法鉴定结果基本一致,说明引物CB10036、CN48可用于天禾油10号的室内纯度快速鉴定。
关键词:油菜;SSR分子标记技术;天禾油10;纯度中图分类号 S565.4 文献标识码 A 文章编号 1007-7731(2019)04-0016-03中国是油菜生产大国,种植总面积和总产均占世界30%左右[1]。
甘蓝型杂交油菜超亲优势明显,达20%~30%[2],其群体纯度即杂种群体的非杂种植株的多少,是影响群体产量的重要因素之一[3]。
为降低杂交油菜制种风险,需要快速、准确、有效地鉴定杂交油菜品种的纯度[4]。
杂交油菜品种传统的纯度鉴定方法主要是大田种植鉴定[5],但完全依据大田种植鉴定需要异地种植,周期较长[6]。
采用同工酶技术鉴定虽然鉴定时间较短,但难以区分亲缘关系较近的杂交种[7]。
由于SSR标记鉴定技术能体现出同一位点在不同个体之间的多态性,并且数量丰富,扩增稳定,扩增谱带少,易于检测,具有共显性、重复好、多态性丰富以及简单快捷易于掌握等特点,近年来已大量用于杂交油菜的纯度鉴定中[8-19]。
本研究探索利用SSR分子标记技术对国审杂交油菜品种天禾油10号大田生产的杂交种纯度进行鉴定,辅助田间种植鉴定。
1 材料与方法1.1 材料供试材料为国审油菜品种天禾油10号及其亲本不育系5C650和恢复系R161。
亲本种子及天禾油10号杂交种由天禾科技集团股份有限公司提供。
1.1.1 取样杂交种天禾油10号纯度待测样取自安徽和县制种田,制种田于2016年9月播种,收获前在代表性制种田采取“Z”形选取样株。
SSR分子标记在作物种质资源鉴定中的应用
SSR分子标记在作物种质资源鉴定中的应用山东农业科学2012,44(10):11 18Shandong Agricultural Sciences收稿日期:2012-04-27基金项目:国家自然科学基金项目(30971546);山东省科技发展计划项目(2012GNC1101)作者简介:王燕龙(1988-),女,在读硕士研究生,研究方向:分子遗传学。
E -mail :wangyanlong0000@/doc/ac92eece8bd63186b cebbc66.html *通讯作者:单雷,博士,研究员,研究方向:植物分子生物学。
E -mail :shlei1025@/doc/ac92eece8bd63186bcebbc66. htmlSSR 分子标记在作物种质资源鉴定中的应用王燕龙1,2,姜言生3,曲志才1,单雷2*(1.曲阜师范大学生命科学学院,山东曲阜273165;2.山东省农业科学院高新技术研究中心/山东省作物与畜禽遗传改良重点实验室,山东济南250100;3.潍坊市农业科学院,山东潍坊261031)摘要:介绍了SSR 分子标记的特点及其在作物种质资源鉴定中的应用,主要包括亲缘关系鉴定、品种鉴定、真实性鉴定及纯度鉴定;提出了改进方法,并对其应用前景作了展望。
关键词:SSR 标记;作物;指纹图谱;种质鉴定中图分类号:Q599;S338文献标识号:A文章编号:1001-4942(2012)10-0011-08Application of SSR Markers in Crop Germplasm Identification Wang YanLong 1,2,Jiang YanSheng 3,Qu ZhiCai 1,Shan Lei 2*(1.College of Life Science ,Qufu Normal University ,Qufu 273165,China ;2.Hi -Tech Research Center ,Shandong Academy of Agricultural Sciences /Key Laboratory for Genetic Improvement of Crop ,Animal and Poultry of Shandong Province ,Jinan 250100,China ;3.Weifang Academy of Agricultural Sciences ,Weifang 261031,China )Abstract The characterizations of SSR markers were introduced and its application in crop germplasm i-dentification was also reviewed ,which included the relation evaluation of different germplasms ,variety identi-fication ,authenticity and purity identification of varieties.In addition ,the improving methods for SSR were put forward and its application prospect was discussed in this paper.Key wordsSSR analysis ;Crop ;Fingerprinting map ;Germplasm identification种质资源鉴定是作物育种的重要基础,国内外已从形态学、细胞学以及生理生化等方面进行了大量的研究。
基于SSR分子标记的普通丝瓜杂交种子纯度鉴定
基于SSR分子标记的普通丝瓜杂交种子纯度鉴定普通丝瓜是一种重要的蔬菜作物,在世界各地广泛种植。
在种植普通丝瓜时,为了保持良好的品种纯度,需要对种子进行纯度鉴定。
本文将介绍一种基于SSR分子标记的普通丝瓜杂交种子纯度鉴定方法。
SSR(Simple Sequence Repeat)是一种常用的分子标记技术,通过扩增具有重复序列的DNA片段,可以得到具有特定长度的PCR产物。
利用SSR标记,可以快速、准确地检测个体之间的遗传差异。
在普通丝瓜杂交种子纯度鉴定中,首先需要提取种子的DNA。
可以使用常规的CTAB法或商用基因提取试剂盒进行DNA提取。
提取的DNA质量应该要好,以确保后续的PCR反应成功。
接下来,选择合适的SSR引物进行PCR扩增。
可根据先前报道的普通丝瓜SSR引物库进行选择。
引物的选择要考虑到其与目标序列的亲和性,以及在不同普通丝瓜品种之间的兼容性。
PCR反应的条件可以根据引物的特性进行优化。
一般来说,反应体系包括模板DNA、引物、dNTPs、缓冲液、聚合酶和RNase-free水。
PCR反应可以使用传统的热循环法进行,其中包括一定的变性、退火和延伸步骤。
扩增的产物可以通过琼脂糖凝胶电泳分离。
将PCR产物与DNA分子量标记物一起加载到琼脂糖凝胶中,然后进行电泳分离。
分离结果可以通过紫外光下观察,得到一系列具有不同大小的DNA片段。
根据PCR产物的分离结果,进行图谱分析和数据处理。
可以使用相关软件对图谱进行解析,计算出各个样品之间的杂交程度,从而判断杂交种子的纯度。
通过以上步骤,就可以基于SSR分子标记对普通丝瓜杂交种子进行纯度鉴定。
这种方法具有高度的准确性和重复性,可以有效地鉴定杂交种子的纯度,为普通丝瓜的良种繁育提供有力支持。
这种方法也可以应用于其他作物的种子纯度鉴定中,具有广泛的应用前景。
检测甜菜雄蕊育性的SSR分子标记及其应用[发明专利]
专利名称:检测甜菜雄蕊育性的SSR分子标记及其应用专利类型:发明专利
发明人:王希,陈丽,赵春雷,徐杰
申请号:CN201710718808.7
申请日:20170821
公开号:CN107267660A
公开日:
20171020
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:检测甜菜雄蕊育性的SSR分子标记及其应用,涉及一种检测甜菜雄蕊育性的SSR分子标记及其应用。
本发明是要解决现有缺乏甜菜雄蕊育性相关的分子标记,不易于鉴定甜菜雄蕊育性的问题。
用于PCR扩增该分子标记的引物对为BvRE051‑S和BvRE051‑A。
该SSR分子标记用于鉴定甜菜雄蕊育性。
本发明的SSR分子标记检测结果与甜菜雄蕊育性性状表现的一致性达70%,在可育与不育个体中分别达63.33%和76.67%。
表明标记与雄蕊育性有连锁关系,可用于雄蕊育性的检测。
本发明用于甜菜雄蕊育性检测。
申请人:黑龙江大学
地址:150080 黑龙江省哈尔滨市南岗区学府路74号
国籍:CN
代理机构:哈尔滨市松花江专利商标事务所
代理人:侯静
更多信息请下载全文后查看。
基于SSR、InDel分子标记的红甜菜遗传多样性分析
中®杀学逼施2019,35(22):47-52Chinese Agricultural Science Bulletin基于SSR.InDel分子标记的红甜菜遗传多样性分析刘蕊匕刘乃新',吴玉梅j吴则东',兴旺匕王秋红|('黑龙江大学农作物研究院,哈尔滨150080;2青海大学农牧学院/青海省农林科学院土壤肥料研究所,西宁810016;'黑龙江省普通高校甜菜遗传育种重点实验室,哈尔滨150080)摘要:旨在了解21份国内外红甜菜品种的遗传多样性及其演化地位。
利用Indel和SSR分子标记,对21份红甜菜遗传多样性进行研究。
结果表明,InDei标记共得到25个基因位点,24个位点具有多态性,Shannon's信息指数平均值为0.583,Nei's基因多样性指数平均值为0.370,等位基因K为2〜4个,平均2.4个,平均观测杂合度为0.235,期望杂合度0.398,多态信息含量77C值为0.330;SSR标记共扩增出28个基因位点,全部具有多态性,平均每个标记扩增出3.5个多态性基因位点,Shannon's信息指数平均值为0.926,Nei's基因多样性指数平均值为0.548,等位基因K为2〜7个,平均4.625个,平均观测杂合度0.399,期望杂合度0.587,多态信息含量P/C值为0.523。
本研究发现,红甜菜品种大多因亲缘关系较近,因此在选育新品种时,建议尽量选择遗传距离较远的品种作为亲本。
关键词:红甜菜;InDei;SSR;遗传多样性;分子标记中图分类号:S566.3文献标志码:A论文编号:cash19020060Genetic Diversity Analysis of Red Beet:Based on SSR and Indel Molecular MarkersLiu Rui1'2,Liu Naixin',Wu Yumei1,Wu Zedong1,Xing Wang13,Wang Qiuhong' (^Academy of Crop Science,Heilongjiang University,Harbin150080;2College of Agriculture and Animal Husbandry,Qinghai University I I nstitute of S oil and Fertilizer,Qinghai Academy of A griculture and Forestry Sciences,Xining810016;y Key Laboratory of S ugar Beet Genetic Breeding,Harbin150080)Abstract:The paper aims to understand the genetic diversity and evolutionary status of21varieties of red beet.We studied the genetic diversity of21red beets by InDei and SSR molecular markers.The results showed that: the molecular markers of InDei had25gene loci,24of which were polymorphic;the average of Shannon's information index was0.583,the average of Nei's genetic diversity index was0.370,the allele K was2-4with an average2.4;the average observed heterozygosity was0.235,the expected heterozygosity was0.398,and the PIC of polymorphic information content was0.330;SSR markers amplified28gene loci,all of which were polymorphic,and an average of3.5polymorphic gene loci were amplified per marker;the average of Shannon's information index was0.926,the average of Nei's genetic diversity index was0.548,the alleles K was2-7with an average of4.625;the average observed heterozygosity was0.399,the expected heterozygosity was0.587,and the PIC of polymorphic information content was0.523.The study found that most of the red beet varieties are close to each other,so it is suggested that the varieties with longer genetic distance should be selected as基金项目:国家现代农业产业技术体系(糖料)建设专项“质量安全与营养品质评价"(CARS-17-0503);国家农产品质量安全风险评估专项经费“枸杞人参百合糖料中典型污染物残留及安全控制点风险评估工作”(GJFP2019020);农业行业标准项目"甜菜种子生产技术规程”。
一种SSR和SV分子标记引物和及其在世界大豆群体遗传多样性分析中的
专利名称:一种SSR和SV分子标记引物和及其在世界大豆群体遗传多样性分析中的应用
专利类型:发明专利
发明人:刘学勤,龙泉秀,谢鹏飞,杨洋
申请号:CN202011566354.4
申请日:20201225
公开号:CN112593000A
公开日:
20210402
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明公开了一种SSR和SV分子标记引物和及其在世界大豆群体遗传多样性分析中的应用,属于植物遗传资源技术领域。
本发明提供了223对均匀覆盖大豆20条染色体的SSR和SV分子标记引物,利用这223对分子标记引物对大豆样品基因组进行PCR扩增;通过核酸电泳分析扩增条带的大小和数量,得到大豆样品的谱带信息;根据谱带信息利用PowerMarker 3.25对大豆地理群体的等位变异丰富度和等位变异离散度进行分析;利用Arlequin version 3.11计算成对群体间分化系数;根据SharedAllele算法计算群体内两两个体间的遗传距离(d),绘制无根树状遗传关系聚类图。
本发明所选的SSR和SV分子标记引物的多态性高,重复性好,易于鉴别不同植株基因水平的差异,为后续世界大豆群体遗传多样性的分析提供了基础。
申请人:江苏农林职业技术学院
地址:212400 江苏省镇江市句容市文昌东路19号
国籍:CN
代理机构:南京苏高专利商标事务所(普通合伙)
代理人:丁静静
更多信息请下载全文后查看。
基于SSR分子标记的普通丝瓜杂交种子纯度鉴定
基于SSR分子标记的普通丝瓜杂交种子纯度鉴定
普通丝瓜是一种常见的蔬菜作物,其种子的纯度鉴定对于品种保护和生产具有重要意义。
本文基于SSR分子标记技术,结合聚合酶链式反应(PCR)和聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术,研究了普通丝瓜杂交种子的纯度鉴定方法。
首先,从不同的普通丝瓜品种中选取了10个具有代表性的SSR引物,利用PCR扩增得到了SSR分子标记。
将扩增产物用PAGE凝胶电泳分离,并用银染法染色,得到了多态性条带图谱。
其次,选择两个不同品种的丝瓜进行交配,并将其杂交种子进行收获和切割,取出其中的胚珠片段。
对不同杂交种子的胚珠片段进行DNA提取,并进行PCR扩增。
将扩增产物用PAGE凝胶电泳分离,与标准品带对比,识别种子中是否含有父本或母本特征条带。
最后,基于分子标记特征和PAGE条带图谱的分析结果,鉴定杂交种子的纯度。
如图所示,杂交种子中含有父本和母本条带的纯种丝瓜为杂交品种的亲本,而只含有杂交特征条带的种子则为纯杂交种子。
通过对多个杂交种子进行分析,可得出其纯度。
本研究采用的基于SSR分子标记的纯度鉴定方法具有高精度、高效率和高可重复性,对于普通丝瓜种子的纯度鉴定具有一定的参考价值。
SSR标记研究驯化和育种对大豆遗传多样性的影响的开题报告
SSR标记研究驯化和育种对大豆遗传多样性的影响的开题
报告
一、研究背景
大豆是中国传统的重要农作物之一,也是世界上最重要的粮食作物之一。
由于其食用、油脂和饲料价值,大豆一直是农业领域的研究热点。
同时,随着生物技术的发展和应用,育种方法也得到了改进和提高。
基于这些现象,研究大豆的遗传多样性,特别是
处理SSR标记的驯化和育种过程中遗传多样性的变化,将成为今后的重要任务。
二、研究目的
本研究旨在研究SSR标记的驯化和育种对大豆遗传多样性的影响,分析遗传多样性在
不同育种阶段的变化规律,为今后的大豆育种提供科学依据。
三、研究内容
1. 收集大豆样本:收集具有典型代表性的大豆品种和生态类型,并对不同地理环境中
大豆遗传多样性进行系统的分析和研究。
2. 提取SSR标记:使用标准的DNA提取和PCR扩增方法,获取大豆基因组的SSR标记数据,探索大豆遗传多样性的组成和结构。
3. SSR标记的驯化和遗传多样性分析:基于已有的SSR标记数据,研究SSR标记的优化和驯化过程,同时分析SSR标记驯化和育种对大豆遗传多样性的影响。
4. 大豆育种的影响:分析SSR标记的驯化和育种对大豆遗传多样性变化的影响,探究育种过程中基因组或亚基因组的变化模式和规律。
5. 编制研究报告:根据研究结果,编制研究报告并提出相应的对策建议。
四、研究意义
本研究将有助于深入了解驯化和育种对大豆遗传多样性的影响,并为今后的大豆育种
研究提供参考和科学依据。
同时,本研究还能进一步提高大豆育种水平,推动农业生
产的发展。
基于SSR分子标记的普通菜豆种质遗传多样性分析
基于SSR分子标记的普通菜豆种质遗传多样性分析夏春阳; 杜吉到; 韩毅强; 孙浩月; 李明; 吴洪斌; 张琦; 于晟龙【期刊名称】《《食品与机械》》【年(卷),期】2019(035)010【总页数】5页(P232-236)【关键词】普通菜豆; SSR标记; 遗传多样性【作者】夏春阳; 杜吉到; 韩毅强; 孙浩月; 李明; 吴洪斌; 张琦; 于晟龙【作者单位】黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江大庆 163319【正文语种】中文普通菜豆又名芸豆、四季豆,属豆科蝶形花亚科菜豆族菜豆属菜豆种,是菜豆属重要的栽培种之一[1]。
中国普通菜豆的主产区主要分布在黑龙江、内蒙古、吉林、云南、贵州、山西、陕西等地。
普通菜豆适应性强在世界范围内均有种植,是最受消费者欢迎的食用豆类作物之一[2],成熟普通菜豆经过加工后可以制成豆沙或者糕点等,未达到成熟时期的可作为蔬菜食用。
普通菜豆籽粒中蛋白质含量为17%~23%,脂肪含量为1.3%~2.6%,碳水化合物含量为56%~61%[3],还含有矿物质以及多种维生素,在欠发达国家和地区,菜豆可供人们直接食用,并且是人们膳食结构中重要的组成部分[4-5]。
目前中国对菜豆种质资源研究包括对现有的资源进行系统的形态鉴定;对部分菜豆种质资源进行抗病虫、抗逆性试验鉴定,首先筛选出一部分优质种质资源,对菜豆特殊功能成分进行提取及分析[6]。
Lei等[7]对233份菜豆进行形态多样性鉴定,并筛选出183份优异种质。
Blair等[8]和栾非时等[9]分别对323份芸豆和60份芸豆基于形态性状进行聚类分析,分别划出2个类群与3个类群。
遗传多样性是指在群体内个体间基因组成的差异,这是一个种群和一个物种中的遗传基础,一个种群的遗传多样性越丰富,种质资源对生存环境的适应力越强,更容易扩展分布的范围和开拓新环境[10]。
分子标记是DNA水平遗传变异的直接反映,新的DNA标记技术如简单重复序列(SSR)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、表达序列标签(EST)扩增片段多态性(AFLP)、简单重复序列标记(ISSR)、单核苷酸多态性(SNP)等分子标记技术不断涌现应用,已成为现代作物育种领域的研究内容与技术手段。
SSR分子标记对菜豆品种鉴定的研究
SSR分子标记对菜豆品种鉴定的研究田甜;冯国军;盛慧;刘大军;赵春梅;王杰;李建红【期刊名称】《北方园艺》【年(卷),期】2012(000)004【摘要】以“将军”和“太空将军”2个近似的菜豆品种为试材,利用SSR引物进行品种鉴定,以筛选分析品种鉴定所需要的引物,为菜豆神质资源的保存、品种的纯度鉴别提供理论依据.通过对65时SSR引物进行筛选,筛选出3对作为鉴定上述品种的特异性引物.结果表明:利用PM1040、PM1050、PM1065 3对SSR引物可以对上述2个品种的随机或混合样品进行快速、准确的品种鉴定.【总页数】3页(P111-113)【作者】田甜;冯国军;盛慧;刘大军;赵春梅;王杰;李建红【作者单位】哈尔滨市农业科学院,黑龙江哈尔滨150070;哈尔滨市农业科学院,黑龙江哈尔滨150070;哈尔滨市农业科学院,黑龙江哈尔滨150070;哈尔滨市农业科学院,黑龙江哈尔滨150070;哈尔滨市农业科学院,黑龙江哈尔滨150070;哈尔滨市农业科学院,黑龙江哈尔滨150070;哈尔滨市农业科学院,黑龙江哈尔滨150070【正文语种】中文【中图分类】S643.103.7【相关文献】1.SSR分子标记技术及其在农产品品种鉴定中的应用 [J], 赵雅楠;王颖;张东杰;沈琰;孙大庆;杨义杰2.SSR分子标记技术在草品种鉴定中的应用探讨 [J], 高秋;王杰;马金星;孙娟3.利用SSR分子标记进行棉花品种鉴定的研究 [J], 张小娟;陆徐忠;何团结;路曦结;郑曙峰;倪金龙;张冰清;杨剑波4.菜豆抗草甘膦基因SSR分子标记的研究 [J], 张俐俐;陶波5.沃柑SSR分子标记筛选及其在品种鉴定上的应用 [J], 黄其椿; 卢东长城; 陈东奎; 江东; 刘吉敏; 谢健; 施平丽; 张兰; 刘福平因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
利用SSR标记评价普通菜豆种质遗传多样性
作 物 学 报 ACTA A GRONOM ICA SIN ICA
Vol131 , No15 pp1 619 - 627 May , 2005
利用 SSR 标记评价普通菜豆种质遗传多样性
张赤红 王述民 3 Ξ
(中国农业科学院作物品种资源研究所 ,北京 100081)
CO8543A2BUL K
GEN TR Y NO122492
表 1 野生菜豆的来源及名称
Table 1 Origin and name of the wild common bean
报道较少 ,栾非时等分别用形态标记 、等位酶标记和 RAPD 标记 ,对我国黑龙江省的 43 个菜豆栽培种 、 国际热带农业研究中心的 13 个半野生种和波兰 4 个矮生种进行了多样性研究 ,等位酶标记和 RAPD 标记结果将蔓生种分为 5 类 ,矮生种分为 2 类 ,半野 生种分为 2 类 。形态标记结果将 60 份材料分为 2 类 ,即矮生种一类 ,蔓生种和半野生种合为一 类[10~12 ] 。Beebe 等用 39 个 RA PD 引物对 269 份材 料 (180 份来源于墨西哥 ,其他来源于中美中心和美 洲其他普通菜豆次级起源中心) 进行了遗传多样性
ya hoo1co m1cn 3 通讯作者 :王述民 , Tel : 010268918567 ; E2mail : smwang @mail1caas1net1cn Received (收稿日期) :2004204223 ,Accepted (接受日期) :2004205205.
© 1995-2005 Tsinghua Tongfang Optical Disc Co., Ltd. All rights reserved.
利用SSR分子标记鉴定大豆新品种北农103
利用SSR分子标记鉴定大豆新品种北农103
谢晨;谢皓;张芳;陈学珍
【期刊名称】《北京农学院学报》
【年(卷),期】2010(25)2
【摘要】SSR分子标记技术已经在农作物品种鉴定上广泛应用,利用SSR标记对新选育的大豆品种北农103和其亲本品种中黄18进行分子鉴定,期望通过分子标记鉴别上述2个品种.结果表明,在随机选取330对大豆SSR引物中,有7对引物在2个品种间表现出清晰差异带,可以作为分子标记区分北农103和中黄18,并在今后的品种纯度鉴定上应用.
【总页数】3页(P11-13)
【作者】谢晨;谢皓;张芳;陈学珍
【作者单位】北京农学院植物科学技术学院,北京102206;北京农学院植物科学技术学院,北京102206;北京农学院植物科学技术学院,北京102206;北京农学院植物科学技术学院,北京102206
【正文语种】中文
【中图分类】S565.1
【相关文献】
1.利用SSR分子标记鉴定刺葡萄F1代杂种 [J], 苏聪聪;李含晰;金燕;徐丰;白描;石雪晖;杨国顺;钟晓红;刘昆玉;陈陈恒
2.大豆新品种北农103的选育及栽培要点 [J], 谢皓;陈学珍;白宝良;于同泉;杨柳;王
文平;王建立;谢晨;高书元
3.利用SSR分子标记技术快速鉴定杂交油菜天禾油10号纯度 [J], 朱哲逸;张彩娟;徐青青;朱宗河
4.利用SSR分子标记技术快速鉴定津甜100甜瓜种子纯度 [J], 武云鹏;李肯;张若纬;彭冬秀
5.利用ISSR分子标记鉴定蝴蝶兰不同种资源的遗传多样性 [J], 苏宇静;姚文敏;陈兆贵
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
利用SSR分子标记构建甜菜登记品种的分子身份证
利用SSR分子标记构建甜菜登记品种的分子身份证王宇晴;李乔乔;阚文亮;邳植;吴则东【期刊名称】《江苏农业科学》【年(卷),期】2022(50)18【摘要】通过构建111份甜菜登记品种的分子身份证,促进甜菜品种DUS测试标准体系的建立,实现甜菜品种的快速检索与比对,为甜菜品种指纹鉴定和溯源管理提供理论依据。
利用22对简单重复序列(SSR)核心引物,基于最适的取样策略对来自国内外不同地区的111份甜菜登记品种进行遗传多样性分析以及分子身份证构建。
结果显示,22对引物共检测到101个等位基因,每对引物检测出3~7个等位基因,平均为4.59个;Shannon多样性指数(I)为0.60~1.73,平均为0.95;Nei s期望杂合度(H_(e))为0.41~0.79,平均为0.56;PIC值范围为0.91~0.99,平均值为0.96,22对引物可用于区分甜菜品种。
利用UPGMA聚类分析,22对引物将111份材料划为3个类群(G1~G3),聚类结果大致与其地理来源一致;通过获得的等位基因计算遗传距离,111份甜菜品种的遗传距离范围为0.059~0.564,平均值为0.325,甜菜品种间具有一定的遗传多样性。
基于最少引物区分最多品种的原则,通过UPGMA聚类分析,仅用6个SSR引物组合可将全部材料区分。
结果表明,基于6对SSR引物扩增的结果,通过数字与英文的形式,使用在线二维码软件构建的111份甜菜登记品种的分子身份证,丰富了甜菜品种指纹图谱的可视化形式,从而提高了品种鉴定的效率,保护育种者及消费者权益。
【总页数】6页(P289-294)【作者】王宇晴;李乔乔;阚文亮;邳植;吴则东【作者单位】黑龙江大学现代农业与生态环境学院/黑龙江省普通高校甜菜遗传育种重点实验室;黑龙江省农垦总局九三农业科学研究所【正文语种】中文【中图分类】S566.302.4【相关文献】1.基于SSR标记构建中国芍药品种资源分子身份证2.利用与大豆灰斑病抗性基因连锁的SSR标记构建大豆品种(系)的分子身份证3.利用SSR标记构建枸杞品种分子身份证4.利用SSR构建甜菜品种的分子身份证5.利用荧光标记SSR绘制中国芍药品种分子身份证因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
利用SSR分子标记检测分析30份大豆种质遗传完整性
利用SSR分子标记检测分析30份大豆种质遗传完整性夏冰;卢新雄;陈晓玲;任守杰;林凤;张志娥
【期刊名称】《大豆科学》
【年(卷),期】2007(26)3
【摘要】以国家种质库中期库的30份大豆种质为试验材料,用30对SSR引物对每份种质不同年份繁殖的材料进行了遗传完整性检测。
结果表明,25份种质不同繁殖年份之间未检测到等位基因存在差异,5份种质检测到等位基因变化,同时对其引起变化的原因进行了分析,并探讨了SSR标记作为大豆种质遗传完整性检测方法的可行性。
【总页数】5页(P305-309)
【关键词】大豆;遗传完整性;SSR标记
【作者】夏冰;卢新雄;陈晓玲;任守杰;林凤;张志娥
【作者单位】沈阳农业大学;中国农业科学院作物科学研究所/农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室
【正文语种】中文
【中图分类】S565.1
【相关文献】
1.保存大豆种质遗传完整性的策略——基于SSR分子标记选择纯系 [J], 李英慧;常汝镇;邱丽娟
2.利用ISSR分子标记检测老化扁蓿豆种质遗传完整性的变化 [J], 王小丽;李志勇;
李鸿雁;师文贵
3.利用SSR和ISSR分子标记分析崇明白扁豆种质资源的遗传多样性 [J], 沈千; 陈岳; 顾立君; 潘俊松
4.利用SRAP和SSR分子标记检测分析29份棉花种质遗传完整性 [J], 李驰;卢新雄;张志娥;陈晓玲;林凤;张香云;刘存敬
5.SSR标记分析种子老化及繁殖世代对大豆种质遗传完整性的影响 [J], 王栋;卢新雄;张志娥;陈晓玲;辛霞;辛萍萍;耿立格
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
利用SSR标记评价普通菜豆种质遗传多样性
利用SSR标记评价普通菜豆种质遗传多样性张赤红;王述民【期刊名称】《作物学报》【年(卷),期】2005(31)5【摘要】利用36对SSR引物对332份国内普通菜豆、16份国外普通菜豆和29份野生菜豆的遗传多样性进行了分析,等位变异数和多样性指数的计算结果显示,3种生态型普通菜豆遗传多样性由大到小的顺序为国内普通菜豆、野生菜豆和国外普通菜豆;我国贵州、云南、黑龙江等省普通菜豆的遗传多样性较为丰富.基于SSR数据,对377份普通菜豆种质资源进行聚类分析,结果聚为6组,其中29份野生菜豆聚到第1组群,与其他样品无任何交叉;国外16份材料中的11份与我国25份材料聚在第6组,说明国内外普通菜豆的遗传关系要比两者同野生菜豆的遗传关系近.【总页数】9页(P619-627)【作者】张赤红;王述民【作者单位】中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,100081;中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,100081【正文语种】中文【中图分类】S521【相关文献】1.25份普通烟草种质资源遗传多样性的SSR标记分析 [J], 杨柳;汪斌;童治军;黄勇兵;曹梅秀;吴海乔;巫升鑫;陈顺辉;兰涛2.利用EST-SSRs标记分析巴西橡胶树魏克汉种质的遗传多样性及遗传分化 [J], 龙青姨;华玉伟;高战;杨金鑫;黄华孙3.利用SSR标记分析26份南瓜种质的遗传多样性 [J], 周秦;郭子卿;朱璞;徐诚;徐恒辉4.基于SSR分子标记的普通菜豆种质遗传多样性分析 [J], 夏春阳; 杜吉到; 韩毅强; 孙浩月; 李明; 吴洪斌; 张琦; 于晟龙5.利用SSR和ISSR分子标记分析崇明白扁豆种质资源的遗传多样性 [J], 沈千; 陈岳; 顾立君; 潘俊松因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
·生物技术·
, , , 3 0s 4 9 6 5 ℃温度梯度退火3 0 s 7 2 ℃延伸3 0 s 4 0个循 ~ 。取扩增产物5μ , 环, 最后7 加2μ 2 ℃延伸1 0m i n L L溴 酚蓝, 在2 在 % 琼脂糖胶中以 1×T B E 为电泳缓冲液, , 电泳之后经凝胶成 8 0 1 2 0V电压下电泳1 0 0 1 2 0m i n ~ ~ , 。 像系统 紫外灯下观察并照相 根据电泳结果, 将各引 物的扩增产物情况进行记录。 表1
引物名称 P r i m e r c o d e P M - 1 0 0 1 P M - 1 0 0 5 - 1 0 1 0 P M P M - 1 0 1 5 P M - 1 0 2 0 - 1 0 2 5 P M P M - 1 0 3 0 P M - 1 0 3 5 P M - 1 0 4 0 P M - 1 0 4 5 P M - 1 0 5 0 - 1 0 5 5 P M P M - 1 0 6 0 P M - 1 0 6 5
[] 细粉, 依照 C T A B 法提取基因组总 D N A2 , 1 . 0 %琼脂糖 凝胶电泳检测 D 紫外灯下观察并且照相。 检 N A 质量,
只要筛选到能明确区分的共显性 S S R 标记, 1 对引物便 足以鉴别真假杂种。但对于菜豆品种纯度的检测, 没有 可以参照的标准, 该研究针对菜豆生产和种子检验等实 研究利用 S 际问题, S R 快速鉴定菜豆品种的方法。
测后- 2 0 ℃保存备用。 由北京三博远 1 . 2 . 2 C R 扩增和电泳 选引物 6 5 对, P ) 。P 志生物技术有限公司合成( 部分见表1 C R 扩增反应 , 在P 扩增体系2 含D E - 9 7 0 0 P C R 扩增仪上进行, 5μ L N A , , / , 模板2μ L 1 0×b u f f e r 2μ L 2 5m m o l L M C l . 5μ L 22 g / , / 反引物各 1 0m m o l L d N T P s 0 . 2 5μ L 1 0μ m o l L 正、 , / , T a 0 . 5μ L 5U L D N A 聚合酶0 . 2 5μ L d d H q 2O μ 。反应程序为 9 ; 1 7μ L 4 ℃ 模板预变性 5 m i n 9 4 ℃变性 1 1 1
a b l e 1 r i m e r u s e d f o r S S R a n a l s i s o f P h a s e o l u s v u l a r i s L . T P y g
, 图3 M 1 0 4 0 P M 1 0 5 0和 P M 1 0 6 5扩增多态性结果 引物 P
1 材料与方法
1 . 1 试验材料 、 “ , 供试的 2 个菜豆品种为 “ 将军” 太空将军 ” 由哈
, 第一作者简介 : 田甜( 女, 硕士 , 农艺师 , 现主要从事菜豆分 1 9 8 3 -) : 子育种研究工作 。E -m a i l t i a n t i a n 9 4 5 2 0 @ 1 6 3 . c o m。 ) , , , , 责任作者 : 冯国军( 男 博士 研究员 现主要从事蔬菜育种 1 9 6 6 - : 研究工作 。E -m a i l f e n 9 9 8 @ 1 2 6 . c o m。 g ) 。 基金项目 : 国家科技部科技成果转化资助项目( 2 0 0 9 G B 2 B 2 0 0 0 9 9 收稿日期 : 2 0 1 1 - 1 1 - 3 0
: , , ’ N o t e L a n e 1 3 5w a s‘ J i a n u n w a s‘ T a i k o n i a n u n’ i n E l e c t r o - g j g j g j h o r e s i s t i u r e . p g
3 结论与讨论
北方园艺2 ( ) : 0 1 2 0 4 1 1 1 1 1 3 ~
S S R 引物名称与序列
( ) 引物序列 S r i m e r e u e n c e o f 5 ′ - 3 ′ p q G C T C A C G T A C G A G T T G A A T C T C A G A T C T G A G A G C A G C G A C A T G G T A G T G T C C C T A A G A A C G A A T A T G G A A T C G A A T C A A G C A A C C T T G G A T C A T A A C G C A G A T C G C C T A C T C A C A A A C G T T G A C G A G A A G C A T C A A G G T T G C C A C C G G T G A T A A T C T G T G A G G C A A G A A G C C T T C A A T T A T C A C C A T C A C C C A A G T T C C T T C G T G T T T G T T T G T G T T T T C G A G G T G A C G T A A A G A T T T C A A C A A G G A T G G A G A A G A T G G A A G A C A C A T G T G A A G A G G C T T C C T C T C A C T T T C C A C T G T A T G T C C T A C G A G G G T T G A T C C C G T T G A A A A G A T C A A G T C C T T G G T T G G A G C A G C A G C C A C A G A C A C C C T C G C G A T G T C T T G T C A T T T A G C A C T T A G C A C G T T G T T G T T T A C T A A G A G C C C G T G T G G T T G G T A G T G T C T T T G C T G A G G C C T T G C T T T A A G C T C A G A A C T C G G C C A A G G T G A A C G G T G G T G G A G C G A G A A T G G C G G A A G G G A T T C C C T T C C T A G C T A T G G C T G C T G G A C A T G A A G A T T C A G G C T G A C G T A G G T G A C A A C C C G G C T T G T G C T T C A T T G T C T G
、 、 ; 、 、 。 注: 电泳图中泳道 1 将军” 太空将军” 3 5 是“ 2 4 6 是“
, F i . 3 m l i c a t i o n r e s u l t s o f rp P M 1 0 5 0a n d P M 1 0 6 5
[ ] 1
尔滨市农业科学院蔬菜花卉分院菜豆育种实验室提供 。 1 . 2 试验方法 1 . 2 . 1 N A 制备 种子分组浸泡 5 1 0h 后, 基因组 D ~ 播种于营养钵, 每个品种播 7 个营养钵, 每个营养钵 3 粒, 置于2 出苗1 从每份材料的3株 0 2 5 ℃温室, 0d后, ~ 幼苗上采收刚要展开的嫩叶 1g 左右, 在液氮中研磨成
北方园艺2 ( ) : 0 1 2 0 4 1 1 1 1 1 3 ~
·生物技术·
S S R 分子标记对菜豆品种鉴定的研究
田 甜,冯 国 军,盛 慧,刘 大 军,赵 春 梅,王 杰
( ) 哈尔滨市农业科学院 , 黑龙江 哈尔滨 1 5 0 0 7 0
以“ 将军” 和“ 太空将军” 利用 S 以 2个近似的菜豆品种为试材, S R 引物进行品种鉴定, 摘 要: 筛选分析品种鉴定所需要的引物, 为菜豆种质资源的保存、 品种的纯度鉴别提供理论依据。 通过 对6 筛 选 出 3 对 作 为 鉴 定 上 述 品 种 的 特 异 性 引 物。 结 果 表 明: 利用 5对 S S R 引物 进 行 筛 选, 、 、 准确 P M 1 0 4 0 P M 1 0 5 0 P M 1 0 6 5 3对 S S R 引物可以对上述2个品种的随机或混合样品进行快速 、 的品种鉴定。 关键词: 菜豆; 品种鉴定 S S R; ( ) 中图分类号: S 6 4 3 . 1 0 3 . 7 A 文章编号: 1 0 0 1 - 0 0 0 9 2 0 1 2 0 4 - 0 1 1 1 - 0 3 文献标识码: 作物育种和种子检 作物品种纯度鉴定是农业生产、 也是保护新品种, 防止假冒伪劣品种进 测的重要内容, 入市场, 维护农民利益的重要手段。 传统的田间种子鉴 定费时、 费力、 成本高, 且易受环境因素影响, 导致表型 特征会有一定程度的偏差。“ 将军 ” 油豆是哈尔滨市农 业科学院蔬菜花卉分院经人工杂交后采用系统选育方 “ 法育成的品种, 太空将军 ” 油豆角是通过搭载卫星的 “ 将军” 油豆种子经过5a精心选育获得的品种。 2 个品 ( ) , ( ) , 种的种子外观相近 图 1 田间的区分度小 图 2 差异 传统的种子鉴定方法很难将二者区分开。 不明显, 分子标记技术的快速发展为种子鉴定提供了快速 和高效的方法。在各种 D N A 分子标记中, S S R 分子标 具有很多的优越性。S 记应用于种子鉴定, S R 以其共显 性遗传, 在群体中常存在大量复等位性 , 以及引物在种 内或种间的保守性, 重复性高、 灵敏度高、 稳定性好、 操 作 简 单 而 成 为 构 建 遗 传 图 谱、 基因定位等的理想工 具 。研究集中在“ 将军” 和“ 太空将军 ” 的品种鉴定上,
、 “ 该试验旨在对表观特征相近的 “ 将军” 太空将军” 通过对 2 个优良菜豆品种的鉴 2个品种进行鉴定分析, 定分析结果可以看出, 在进行种子鉴定时, 可以用 S S R 分子标记鉴定来代替田间鉴定, 从而克服田间鉴定周期 长、 易受环境条件的影响、 田间差异小等缺点。 该试验 可将供试材料 从6 5对引物中筛选获得3对多态性引物, 鉴别开。 经济的发展需要良好的市场环境秩序, 为了适应经 济发展新形势, 菜豆研究与开发的知识产权保护工作尤 , 显重要 特别是具有广阔应用前景的品种, 更需要产权 的保护。因此, 加强和改进品种鉴定工作是形势所需 。 将先进的分子标记技术应用于菜豆品种鉴定中 , 可以有 效防止假冒种子充斥市场。“ 太空将军 ” 是由 “ 将军 ” 搭 载第1 8颗返回式卫星后经过系统选育育成的新品种 , 它比“ 将军” 油豆熟期早 3d 左右, 产量比 “ 将军 ” 油豆增 产1 将军 ” 油豆冒充 0 %以上。市场上有不法经销商以 “ “ 太空将军” 油豆销售的行为, 由于这 2 个品种的种子外 观相似, 植物学性状相似, 区分这 2 个品种有一定困难, 通过该研究的探索有助于鉴定这 2 个相近的菜豆品种, 可为知识产权的保护提供高效的技术检测手段。 该研究选用 S 将军” 和“ 太空 S R 分析标记技术做为“ 将军” 2个品 种 的 鉴 定 手 段。 由 于 S S R 标记多态性丰 , 富, 且目前已有许多现有的 S 引物 因此, 可以直接利 S R 用现有的 S 技术难度低, 成本不 S R 因物进行 P C R 扩增, 高, 是十分理想的品种鉴定的分子标记方法。 该研究采用2 %的琼脂糖凝胶电泳8 0 1 0 0V 电压 ~ 电泳, 可以显现出良好的扩增产物带型, 而不需要进行 繁杂的聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染过程 , 实用性较强。 鉴于菜豆 S S R 标记目前已开发出来的 S S R 引物数量有 , 限 不能够彻底解决菜豆种子鉴定的难题 , 尚需对 S S R 引物进行进一步的筛选。