王镜岩《生物化学》笔记(完整版)
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芳香族氨基酸(Tyr、Trp、Phe)有共轭双键,在近紫外区有 光吸收能力,Tyr、Trp 的吸收峰在 280nm,Phe 在 265 nm。由于大 多数蛋白质含 Tyr、Trp 残基,所以测定蛋白质溶液 280nm 的光吸 收值,是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。 2.两性解离和等电点(isoelectric point, pI)
稳定的黄色 2,4-二硝基苯氨基酸(DNP-氨基酸),这一反应在蛋 白质化学的研究史上起过重要作用,Sanger 等人应用它测定胰岛素 一级结构。
多肽顺序自动分析仪是根据相类似的原理设计的,即利用多肽 链 N 端氨基酸的α-氨基与异硫氰酸苯酯 PITC 反应(Edman 降解 法)。 三、肽(peptide) 1.肽键与肽链
肽分子中不完整的氨基酸称为氨基酸残基。肽按其序列从 N 端 到 C 端命名。一般 10 肽以下属寡肽,10 肽以上为多肽。 2.生物活性肽 (1)谷胱甘肽(glutathione,GSH) 是由 Glu、Cys、Gly 组成的一种三肽,又叫γ-谷氨酰半胱氨酰甘 氨酸(含γ-肽键)。Cys 的-SH 是主要功能基团,GSH 是一种抗氧 化剂,是某些酶的辅酶,可保护蛋白质分子中的-SH 免遭氧化,保 护巯基蛋白和酶的活性。在 GSH 过氧化物酶的作用下,GSH 还原 细胞内产生的 H2O2,生成 H2O,2 分子 GSH 被氧化成 GSSG,后 者在 GSH 还原酶催化下,又生成 GSH。
每克样品含氮克数×6.25×100=100g 样品中蛋白质含量(g%) 二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸 蛋白质在酸、碱或蛋白酶的作用下,最终水解为游离氨基酸(amino acid),即蛋白质组成单体或构件分子。存在于自然界中的氨基酸有 300 余种,但合成蛋白质的氨基酸仅 20 种(称编码氨基酸),最先 发现的是天门冬氨酸(1806 年),最后鉴定的是苏氨酸(1938 年)。 (一)氨基酸的结构通式
第一节 蛋白质的分子组成
一、蛋白质的元素组成 经元素分析,主要有 C(50%~55%)、H(6%~7%)、O(19%~
24%)、N(13%~19%)、S(0%~4%)。有些蛋白质还含微量的 P、 Fe、Cu、Zn、Mn、Co、Mo、I 等。
各种蛋白质的含氮量很接近,平均为 16%。因此,可以用定氮 法来推算样品中蛋白质的大致含量。
若 1 个氨基酸有 3 个可解离基团,写出它们电离式后取兼性离 子两边的 pK 值的平均值,即为此氨基酸的等电点(酸性氨基酸的 等电点取两羧基的 pK 值的平均值,碱性氨基酸的等电点取两氨基 的 pK 值的平均值)。 3.氨基酸的化学反应
氨基酸的化学反应是其基团的特征性反应。重要的有: (1)茚三酮反应
蛋白质分子中的胱氨酸是两个半胱氨酸脱氢后以二硫键结合 而成,胶原蛋白中的羟脯氨酸、羟赖氨酸,凝血酶原中的羧基谷氨 酸是蛋白质加工修饰而成。 (三)氨基酸的重要理化性质 1.一般物理性质
α-氨基酸为无色晶体,熔点一般在 200 oC 以上。各种氨基酸 在水中的溶解度差别很大(酪氨酸不溶于水)。一般溶解于稀酸或 稀碱,但不能溶解于有机溶剂,通常酒精能把氨基酸从其溶液中沉 淀析出。
目前,国际互联网蛋白质数据库已有 3 千多种一级结构清楚。 蛋白质一级结构是空间结构和特异生物学功能的基础。 二、蛋白质的二级结构(secondary structure)
蛋白质的二级结构是指其分子中主链原子的局部空间排列,是 主链构象(不包括侧链 R 基团)。
构象是分子中原子的空间排列,但这些原子的排列取决于它们 绕键的旋转,构象不同于构型,一个蛋白质的构象在不破坏共价键 情况下是可以改变的。但是蛋白质中任一氨基酸残基的实际构象自 由度是非常有限的,在生理条件下,每种蛋白质似乎是呈现出称为 天然构象的单一稳定形状。
(2)多肽类激素和神经肽 人体内有许多激素属寡肽或多肽,如下丘脑—垂体分泌的催产素(9 肽)、加压素(9 肽)、促肾上腺皮质激素(ACTH,39 肽)等。催 产素和加压素结构仅第 3、第 8 位两个氨基酸残基不同,前者使平 滑肌收缩,有催产和使乳腺泌乳的作用;后者能使小动脉收缩,增 高血压,也有减少排尿的作用。
1953 年,英国科学家 F. Sanger 首先测定了胰岛素(insulin)的 一级结构,有 51 个氨基酸残基,由一条 A 链和一条 B 链组成,分 子中共有 3 个二硫键,其中两个在 A、B 链之间,另一个在 A 链内。
蛋白质的一级结构测定或称序列分析常用的方法是 Edman 降
解和重组 DNA 法。Edman 降解是经典的化学方法,比较复杂。首 先要纯化一定量的待测蛋白质,分别作分子量测定、氨基酸组成分 析、N-末端分析、C-末端分析;要应用不同的化学试剂或特异的蛋 白内切酶水解将蛋白质裂解成大小不同的肽段,测出它们的序列, 对照不同水解制成的两套肽段,找出重叠片段,最后推断蛋白质的 完整序列。重组 DNA 法是基于分子克隆的分子生物学方法,比较 简单而高效,不必先纯化该种蛋白质,而是先要得到编码该种蛋白 质的基因(DNA 片段),测定 DNA 中核苷酸的序列,再按三个核 苷酸编码一个氨基酸的原则推测蛋白质的完整序列。这两种方法可 以相互印证和补充。
神经肽是在神经传导过程中起信号转导作用的肽类。如脑啡肽 (5 肽)、β-内啡肽(31 肽)、强啡肽(17 肽)等。随着脑科学的 发展,会发现更多的生物活性肽。
第二节 蛋白质的分子结构
蛋白质是生物大分子,结构比较复杂,人们用 4 个层次来描述, 包括蛋白质的一级、二级、三级和四级结构。一级结构描述的是蛋 白质的线性(或一维)结构,即共价连接的氨基酸残基的序列,又 称初级或化学结构。二级以上的结构称高级结构或构象 (conformation)。 一、蛋白质的一级结构(primary structure)
肽键 C—N 键长为 0.132nm,比相邻的单键(0.147nm)短,而 较 C=N 双键(0.128nm)长,有部分双键的性质,不能自由旋转。 肽键平面上各原子呈顺反异构关系,肽键平面上的 O、H 以及 2 个 α-碳原子为反式构型(trans configuration)。
主链中的 Cα—C 和 Cα—N 单键可以旋转,其旋转角φ、ψ 决定了两个相邻的肽键平面相对关系。由于肽键平面的相对旋转, 使主链可以以非常多的构象出现。事实上,肽链在构象上受到很大 限制,因为主链上有 1/3 不能自由旋转的肽键,另外主链上有很多 侧链 R 的影响。蛋白质的主链骨架由许多肽键平面连接而成。 2.α-螺旋(α-helix)
氨基酸在水溶液或晶体状态时以两性离子的形式存在,既可作 为酸(质子供体),又可作为碱(质子受体)起作用,是两性电解 质,其解离度与溶液的 pH 有关。
在某一 pH 的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势和 程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的 pH 称为该氨基 酸的等电点。氨基酸的 pI 是由α-羧基和α-氨基的解离常数的负对 数 pK1 和 pK2 决定的。计算公式为:pI=1/2(pK1+ pK2)。
第一章源自文库蛋白质化学
教学目标:
1.掌握蛋白质的概念、重要性和分子组成。 2.掌握α-氨基酸的结构通式和 20 种氨基酸的名称、符号、结构、 分类;掌握氨基酸的重要性质;熟悉肽和活性肽的概念。 3.掌握蛋白质的一、二、三、四级结构的特点及其重要化学键。 4.了解蛋白质结构与功能间的关系。 5.熟悉蛋白质的重要性质和分类
带有非极性 R(烃基、甲硫基、吲哚环等,共 9 种):甘(Gly)、 丙(Ala)、缬(Val)、亮(Leu)、异亮(Ile)、苯丙(Phe)、甲硫 (Met)、脯(Pro)、色(Trp)
带有不可解离的极性 R(羟基、巯基、酰胺基等,共 6 种): 丝(Ser)、苏(Thr)、天胺(Asn)、谷胺(Gln)、酪(Tyr)、半(Cys) 带有可解离的极性 R 基(共 5 种):天(Asp)、谷(Glu)、赖(Lys)、 精(Arg)、组(His),前两个为酸性氨基酸,后三个是碱性氨基酸。
蛋白质是由 L-α-氨基酸通过肽键缩合而成的,具有较稳定的 构象和一定生物功能的生物大分子(biomacromolecule)。蛋白质是 生命活动所依赖的物质基础,是生物体中含量最丰富的大分子。
单细胞的大肠杆菌含有 3000 多种蛋白质,而人体有 10 万种 以上结构和功能各异的蛋白质,人体干重的 45%是蛋白质。生命是 物质运动的高级形式,是通过蛋白质的多种功能来实现的。新陈代 谢的所有的化学反应几乎都是在酶的催化下进行的,已发现的酶绝 大多数是蛋白质。生命活动所需要的许多小分子物质和离子,它们 的运输由蛋白质来完成。生物的运动、生物体的防御体系离不开蛋 白质。蛋白质在遗传信息的控制、细胞膜的通透性,以及高等动物 的记忆、识别机构等方面都起着重要的作用。随着蛋白质工程和蛋 白质组学的兴起和发展,人们对蛋白质的结构与功能的认识越来越 深刻。
组成蛋白质的 20 种氨基酸有共同的结构特点: 1.氨基连接在α- C 上,属于α-氨基酸(脯氨酸为α-亚氨基酸)。 2.R 是側链,除甘氨酸外都含手性 C,有 D-型和 L-型两种立体异 构体。天然蛋白质中的氨基酸都是 L-型。
注意:构型是指分子中各原子的特定空间排布,其变化要求共 价键的断裂和重新形成。旋光性是异构体的光学活性,是使偏振光 平面向左或向右旋转的性质,(-)表示左旋,(+)表示右旋。构型 与旋光性没有直接对应关系。 (二)氨基酸的分类 1.按 R 基的化学结构分为脂肪族、芳香族、杂环、杂环亚氨基酸 四类。 2.按 R 基的极性和在中性溶液的解离状态分为非极性氨基酸、极 性不带电荷、极性带负电荷或带正电荷的四类。
α-螺旋是肽键平面通过α-碳原子的相对旋转形成的一种紧密 螺旋盘绕,是有周期的一种主链构象。其特点是: ① 螺旋每转一圈上升 3.6 个氨基酸残基,螺距约 0.54nm(每个残 基上升 0.15nm,旋转 100O)。 ② 相邻的螺圈之间形成链内氢键,氢键的取向几乎与中心轴平行。 典型α-螺旋一对氢键 O 与 N 之间共有 13 个原子(3.613),前后间 隔 3 个残基。 ③螺旋的走向绝大部分是右手螺旋,残基侧链伸向外侧。R 基团的 大小、荷电状态及形状均对α-螺旋的形成及稳定有影响。 3.β-折叠(β-pleated sheet) β-折叠是一种肽链相当伸展的周期性结构。 ① 相邻肽键平面间折叠成 110O 角,呈锯齿状。 ② 两个以上具β-折叠的肽链或同一肽链内不同肽段相互平行
导入:100 年前,恩格斯指出“蛋白体是生命的存在形式”;今天 人们如何认识蛋白质的概念和重要性?
1839 年荷兰化学家马尔德(G.J.Mulder)研究了乳和蛋中的清 蛋白,并按瑞典化学家 Berzelius 的提议把提取的物质命名为蛋白质 (Protein,源自希腊语,意指 “第一重要的” )。德国化学家费 希尔(E.Fischer)研究了蛋白质的组成和结构,在 1907 年奠立蛋白质 化学。英国的鲍林(L.Pauling)在 1951 年推引出蛋白质的螺旋;桑格 (F.Sanger)在 1953 年测出胰岛素的一级结构。佩鲁茨(M.F.Perutz)和 肯德鲁(J.C.kendrew) 在 1960 年测定血红蛋白和肌红蛋白的晶体结 构。1965 年,我国生化学者首先合成了具有生物活性的蛋白质— —胰岛素(insulin)。
20 世纪 30 年代末,L.Panling 和 R.B.Corey 应用 X 射线衍射分 析测定了一些氨基酸和寡肽的晶体结构,获得了一组标准键长和键 角,提出了肽单元(peptide unit)的概念, 还提出了两种主链原子 的局部空间排列的分子模型(α-螺旋)和(β-折叠)。 1.肽单位
肽键及其两端的α-C 共 6 个原子处于同一平面上,组成了肽 单位(所在的平面称肽键平面)。
所有具有自由α-氨基的氨基酸与过量茚三酮共热形成蓝紫色 化合物(脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质)。用分光
光度法可定量测定微量的氨基酸。蓝紫色化合物的最大吸收峰在 570nm 波长处,黄色在 440nm 波长下测定。吸收峰值的大小与氨 基酸释放的氨量成正比。
(2)与 2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应 在弱碱性溶液中,氨基酸的α-氨基很容易与 DNFB 作用生成
一个氨基酸的α-羧基和另一个氨基酸的α-氨基脱水形成的酰 胺键称为肽键。由氨基酸通过肽键相连而成的化合物称为肽。肽键 及其两端的α-碳原子相连所形成的长链骨架,即…Cα—C—N—C α—C—N—Cα—C—N—Cα…称为多肽主链,—CαCN—是重复 单位。肽键是蛋白质分子中的主要共价键。多肽链的方向性是从 N 末端指向 C 末端。
稳定的黄色 2,4-二硝基苯氨基酸(DNP-氨基酸),这一反应在蛋 白质化学的研究史上起过重要作用,Sanger 等人应用它测定胰岛素 一级结构。
多肽顺序自动分析仪是根据相类似的原理设计的,即利用多肽 链 N 端氨基酸的α-氨基与异硫氰酸苯酯 PITC 反应(Edman 降解 法)。 三、肽(peptide) 1.肽键与肽链
肽分子中不完整的氨基酸称为氨基酸残基。肽按其序列从 N 端 到 C 端命名。一般 10 肽以下属寡肽,10 肽以上为多肽。 2.生物活性肽 (1)谷胱甘肽(glutathione,GSH) 是由 Glu、Cys、Gly 组成的一种三肽,又叫γ-谷氨酰半胱氨酰甘 氨酸(含γ-肽键)。Cys 的-SH 是主要功能基团,GSH 是一种抗氧 化剂,是某些酶的辅酶,可保护蛋白质分子中的-SH 免遭氧化,保 护巯基蛋白和酶的活性。在 GSH 过氧化物酶的作用下,GSH 还原 细胞内产生的 H2O2,生成 H2O,2 分子 GSH 被氧化成 GSSG,后 者在 GSH 还原酶催化下,又生成 GSH。
每克样品含氮克数×6.25×100=100g 样品中蛋白质含量(g%) 二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸 蛋白质在酸、碱或蛋白酶的作用下,最终水解为游离氨基酸(amino acid),即蛋白质组成单体或构件分子。存在于自然界中的氨基酸有 300 余种,但合成蛋白质的氨基酸仅 20 种(称编码氨基酸),最先 发现的是天门冬氨酸(1806 年),最后鉴定的是苏氨酸(1938 年)。 (一)氨基酸的结构通式
第一节 蛋白质的分子组成
一、蛋白质的元素组成 经元素分析,主要有 C(50%~55%)、H(6%~7%)、O(19%~
24%)、N(13%~19%)、S(0%~4%)。有些蛋白质还含微量的 P、 Fe、Cu、Zn、Mn、Co、Mo、I 等。
各种蛋白质的含氮量很接近,平均为 16%。因此,可以用定氮 法来推算样品中蛋白质的大致含量。
若 1 个氨基酸有 3 个可解离基团,写出它们电离式后取兼性离 子两边的 pK 值的平均值,即为此氨基酸的等电点(酸性氨基酸的 等电点取两羧基的 pK 值的平均值,碱性氨基酸的等电点取两氨基 的 pK 值的平均值)。 3.氨基酸的化学反应
氨基酸的化学反应是其基团的特征性反应。重要的有: (1)茚三酮反应
蛋白质分子中的胱氨酸是两个半胱氨酸脱氢后以二硫键结合 而成,胶原蛋白中的羟脯氨酸、羟赖氨酸,凝血酶原中的羧基谷氨 酸是蛋白质加工修饰而成。 (三)氨基酸的重要理化性质 1.一般物理性质
α-氨基酸为无色晶体,熔点一般在 200 oC 以上。各种氨基酸 在水中的溶解度差别很大(酪氨酸不溶于水)。一般溶解于稀酸或 稀碱,但不能溶解于有机溶剂,通常酒精能把氨基酸从其溶液中沉 淀析出。
目前,国际互联网蛋白质数据库已有 3 千多种一级结构清楚。 蛋白质一级结构是空间结构和特异生物学功能的基础。 二、蛋白质的二级结构(secondary structure)
蛋白质的二级结构是指其分子中主链原子的局部空间排列,是 主链构象(不包括侧链 R 基团)。
构象是分子中原子的空间排列,但这些原子的排列取决于它们 绕键的旋转,构象不同于构型,一个蛋白质的构象在不破坏共价键 情况下是可以改变的。但是蛋白质中任一氨基酸残基的实际构象自 由度是非常有限的,在生理条件下,每种蛋白质似乎是呈现出称为 天然构象的单一稳定形状。
(2)多肽类激素和神经肽 人体内有许多激素属寡肽或多肽,如下丘脑—垂体分泌的催产素(9 肽)、加压素(9 肽)、促肾上腺皮质激素(ACTH,39 肽)等。催 产素和加压素结构仅第 3、第 8 位两个氨基酸残基不同,前者使平 滑肌收缩,有催产和使乳腺泌乳的作用;后者能使小动脉收缩,增 高血压,也有减少排尿的作用。
1953 年,英国科学家 F. Sanger 首先测定了胰岛素(insulin)的 一级结构,有 51 个氨基酸残基,由一条 A 链和一条 B 链组成,分 子中共有 3 个二硫键,其中两个在 A、B 链之间,另一个在 A 链内。
蛋白质的一级结构测定或称序列分析常用的方法是 Edman 降
解和重组 DNA 法。Edman 降解是经典的化学方法,比较复杂。首 先要纯化一定量的待测蛋白质,分别作分子量测定、氨基酸组成分 析、N-末端分析、C-末端分析;要应用不同的化学试剂或特异的蛋 白内切酶水解将蛋白质裂解成大小不同的肽段,测出它们的序列, 对照不同水解制成的两套肽段,找出重叠片段,最后推断蛋白质的 完整序列。重组 DNA 法是基于分子克隆的分子生物学方法,比较 简单而高效,不必先纯化该种蛋白质,而是先要得到编码该种蛋白 质的基因(DNA 片段),测定 DNA 中核苷酸的序列,再按三个核 苷酸编码一个氨基酸的原则推测蛋白质的完整序列。这两种方法可 以相互印证和补充。
神经肽是在神经传导过程中起信号转导作用的肽类。如脑啡肽 (5 肽)、β-内啡肽(31 肽)、强啡肽(17 肽)等。随着脑科学的 发展,会发现更多的生物活性肽。
第二节 蛋白质的分子结构
蛋白质是生物大分子,结构比较复杂,人们用 4 个层次来描述, 包括蛋白质的一级、二级、三级和四级结构。一级结构描述的是蛋 白质的线性(或一维)结构,即共价连接的氨基酸残基的序列,又 称初级或化学结构。二级以上的结构称高级结构或构象 (conformation)。 一、蛋白质的一级结构(primary structure)
肽键 C—N 键长为 0.132nm,比相邻的单键(0.147nm)短,而 较 C=N 双键(0.128nm)长,有部分双键的性质,不能自由旋转。 肽键平面上各原子呈顺反异构关系,肽键平面上的 O、H 以及 2 个 α-碳原子为反式构型(trans configuration)。
主链中的 Cα—C 和 Cα—N 单键可以旋转,其旋转角φ、ψ 决定了两个相邻的肽键平面相对关系。由于肽键平面的相对旋转, 使主链可以以非常多的构象出现。事实上,肽链在构象上受到很大 限制,因为主链上有 1/3 不能自由旋转的肽键,另外主链上有很多 侧链 R 的影响。蛋白质的主链骨架由许多肽键平面连接而成。 2.α-螺旋(α-helix)
氨基酸在水溶液或晶体状态时以两性离子的形式存在,既可作 为酸(质子供体),又可作为碱(质子受体)起作用,是两性电解 质,其解离度与溶液的 pH 有关。
在某一 pH 的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势和 程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的 pH 称为该氨基 酸的等电点。氨基酸的 pI 是由α-羧基和α-氨基的解离常数的负对 数 pK1 和 pK2 决定的。计算公式为:pI=1/2(pK1+ pK2)。
第一章源自文库蛋白质化学
教学目标:
1.掌握蛋白质的概念、重要性和分子组成。 2.掌握α-氨基酸的结构通式和 20 种氨基酸的名称、符号、结构、 分类;掌握氨基酸的重要性质;熟悉肽和活性肽的概念。 3.掌握蛋白质的一、二、三、四级结构的特点及其重要化学键。 4.了解蛋白质结构与功能间的关系。 5.熟悉蛋白质的重要性质和分类
带有非极性 R(烃基、甲硫基、吲哚环等,共 9 种):甘(Gly)、 丙(Ala)、缬(Val)、亮(Leu)、异亮(Ile)、苯丙(Phe)、甲硫 (Met)、脯(Pro)、色(Trp)
带有不可解离的极性 R(羟基、巯基、酰胺基等,共 6 种): 丝(Ser)、苏(Thr)、天胺(Asn)、谷胺(Gln)、酪(Tyr)、半(Cys) 带有可解离的极性 R 基(共 5 种):天(Asp)、谷(Glu)、赖(Lys)、 精(Arg)、组(His),前两个为酸性氨基酸,后三个是碱性氨基酸。
蛋白质是由 L-α-氨基酸通过肽键缩合而成的,具有较稳定的 构象和一定生物功能的生物大分子(biomacromolecule)。蛋白质是 生命活动所依赖的物质基础,是生物体中含量最丰富的大分子。
单细胞的大肠杆菌含有 3000 多种蛋白质,而人体有 10 万种 以上结构和功能各异的蛋白质,人体干重的 45%是蛋白质。生命是 物质运动的高级形式,是通过蛋白质的多种功能来实现的。新陈代 谢的所有的化学反应几乎都是在酶的催化下进行的,已发现的酶绝 大多数是蛋白质。生命活动所需要的许多小分子物质和离子,它们 的运输由蛋白质来完成。生物的运动、生物体的防御体系离不开蛋 白质。蛋白质在遗传信息的控制、细胞膜的通透性,以及高等动物 的记忆、识别机构等方面都起着重要的作用。随着蛋白质工程和蛋 白质组学的兴起和发展,人们对蛋白质的结构与功能的认识越来越 深刻。
组成蛋白质的 20 种氨基酸有共同的结构特点: 1.氨基连接在α- C 上,属于α-氨基酸(脯氨酸为α-亚氨基酸)。 2.R 是側链,除甘氨酸外都含手性 C,有 D-型和 L-型两种立体异 构体。天然蛋白质中的氨基酸都是 L-型。
注意:构型是指分子中各原子的特定空间排布,其变化要求共 价键的断裂和重新形成。旋光性是异构体的光学活性,是使偏振光 平面向左或向右旋转的性质,(-)表示左旋,(+)表示右旋。构型 与旋光性没有直接对应关系。 (二)氨基酸的分类 1.按 R 基的化学结构分为脂肪族、芳香族、杂环、杂环亚氨基酸 四类。 2.按 R 基的极性和在中性溶液的解离状态分为非极性氨基酸、极 性不带电荷、极性带负电荷或带正电荷的四类。
α-螺旋是肽键平面通过α-碳原子的相对旋转形成的一种紧密 螺旋盘绕,是有周期的一种主链构象。其特点是: ① 螺旋每转一圈上升 3.6 个氨基酸残基,螺距约 0.54nm(每个残 基上升 0.15nm,旋转 100O)。 ② 相邻的螺圈之间形成链内氢键,氢键的取向几乎与中心轴平行。 典型α-螺旋一对氢键 O 与 N 之间共有 13 个原子(3.613),前后间 隔 3 个残基。 ③螺旋的走向绝大部分是右手螺旋,残基侧链伸向外侧。R 基团的 大小、荷电状态及形状均对α-螺旋的形成及稳定有影响。 3.β-折叠(β-pleated sheet) β-折叠是一种肽链相当伸展的周期性结构。 ① 相邻肽键平面间折叠成 110O 角,呈锯齿状。 ② 两个以上具β-折叠的肽链或同一肽链内不同肽段相互平行
导入:100 年前,恩格斯指出“蛋白体是生命的存在形式”;今天 人们如何认识蛋白质的概念和重要性?
1839 年荷兰化学家马尔德(G.J.Mulder)研究了乳和蛋中的清 蛋白,并按瑞典化学家 Berzelius 的提议把提取的物质命名为蛋白质 (Protein,源自希腊语,意指 “第一重要的” )。德国化学家费 希尔(E.Fischer)研究了蛋白质的组成和结构,在 1907 年奠立蛋白质 化学。英国的鲍林(L.Pauling)在 1951 年推引出蛋白质的螺旋;桑格 (F.Sanger)在 1953 年测出胰岛素的一级结构。佩鲁茨(M.F.Perutz)和 肯德鲁(J.C.kendrew) 在 1960 年测定血红蛋白和肌红蛋白的晶体结 构。1965 年,我国生化学者首先合成了具有生物活性的蛋白质— —胰岛素(insulin)。
20 世纪 30 年代末,L.Panling 和 R.B.Corey 应用 X 射线衍射分 析测定了一些氨基酸和寡肽的晶体结构,获得了一组标准键长和键 角,提出了肽单元(peptide unit)的概念, 还提出了两种主链原子 的局部空间排列的分子模型(α-螺旋)和(β-折叠)。 1.肽单位
肽键及其两端的α-C 共 6 个原子处于同一平面上,组成了肽 单位(所在的平面称肽键平面)。
所有具有自由α-氨基的氨基酸与过量茚三酮共热形成蓝紫色 化合物(脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质)。用分光
光度法可定量测定微量的氨基酸。蓝紫色化合物的最大吸收峰在 570nm 波长处,黄色在 440nm 波长下测定。吸收峰值的大小与氨 基酸释放的氨量成正比。
(2)与 2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应 在弱碱性溶液中,氨基酸的α-氨基很容易与 DNFB 作用生成
一个氨基酸的α-羧基和另一个氨基酸的α-氨基脱水形成的酰 胺键称为肽键。由氨基酸通过肽键相连而成的化合物称为肽。肽键 及其两端的α-碳原子相连所形成的长链骨架,即…Cα—C—N—C α—C—N—Cα—C—N—Cα…称为多肽主链,—CαCN—是重复 单位。肽键是蛋白质分子中的主要共价键。多肽链的方向性是从 N 末端指向 C 末端。