种猪场遗传数据的收集管理与分析

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猪业科学 
 SWINE INDUSTRY SCIENCE 2016年33卷第9期主题策划
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3.4 养殖社区模块
1）生产变动：负责上报日常猪群转群、转栏变动、死亡、淘汰情况。

2）日常喂料：负责上报日常喂料情况。

3）日常免疫：负责上报日常免疫情况。

4）异常报告：负责上报日常异常情况。

5）技术巡查：负责上报日常技术人员现场巡查情况，包括：图片、文字、定位信息上传。

6）社区论坛：提供各个养户交流的平台，促进养殖水平提高。

7）技术云：提供多媒体养殖技术培训的平台。

8）财富经：提供养殖能手致富经验交流平台。

9）行情宝：提供实时肉猪行情发展态势分析。

10）个人金库：提供给养户养殖日常财务记账、现金台帐、
统计和分析平台。

4 合作社猪场数据化管理的价值体现
4.1 由点及面带动发展中国生猪养殖水平的稳步提高，
增强企业核心竞争力
在全国部署技术服务点，通过运算分析云系统内养殖大数据，由专家团队有针对性地制定各区域养户的技术服务要求和标准。

借助系统数据追踪确保政策一步到位，做好技术服务工作，做响技术服务口碑，做大技术服务群，提高企业市场竞争力和核心竞争力。

4.2 掌握终端养户基础数据，准确把握市场动向，主导市场定价权
根据云系统养户生猪存栏结构，准确预测生猪上市数量，
指导各区域养户有计划性清栏上市。

分析客户饲养投入，统一各区域生猪上市价格。

4.3 深度发掘市场资源，降低市场运作成本
从猪苗、饲料、兽药、疫苗、生产设备到养殖技术和产品回收，借助云系统做长企业技术服务线，充分发掘现有客户群的市场价值。

树立标杆，使部分养户变相成为技术服务部，发展周边更多潜在养户群。

4.4 成为中国生猪行业食品安全溯源标准的制定者
做大养户群，逐步统一各区域生猪饲养标准。

以云系统为基础，制定生猪养殖全产业链溯源标准。

4.5 主动的信息推送为管理者及时提供管理信息，为使
用者及时反馈预警
通过移动终端设备，管理数据随时随地随手可以进行获取、过滤、分析，以快速的响应速度参与到管理决策中。

（收稿日期：2016-08-23）
种猪场遗传数据的收集管理与分析
李 涛
（福建华天农牧生态股份有限公司，福建 南平 353205）
20世纪80年代中期，最佳线性无偏预测（BLUP）育种方法应用于生猪育种。

最初的应用主要集中在改良生长速度和胴体性状这些具有中等遗传力的形状上。

如加拿大1985年开始应用BLUP 动物模型对背膘厚和100 kg 体重日龄进行遗传评估，并取得100 kg 日龄-1.5 d/年的遗传成绩。

 科学的育种方法加速种猪育种的
进展，科学而严谨的育种数据收集与整理是保证种猪群体遗传评估的关键。

目前国内种猪场普遍存在基层员工文化水平低下，缺乏严谨务实的工作作风；由于封闭的生活和工作条件，员工变更相对频繁等问题。

这就为育种数据的收集带来一定的困难。

有的种猪场基本的育种设施陈旧单一，机械出现故障之后无备用设施，致使育种
数据收集常常出现间断现象。

1 保证种猪身份的准确性
 种猪的身份代表高产基因流动的方向，因此种猪身份准确是科学育种的基础，直接关系到遗传评估准确与否。

确保种猪身份的准确是育种任务的关键点之一。

种猪场内保证种猪身份准确性是一个系统和需长期坚持的工作。

为确保种猪身份的准确性，通
图
4 养殖社区管理云端示意图
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常要做到以下几点：首先对于种猪耳标的佩戴方面，尽量选用质量可靠的耳标，准确标明种猪ID号。

耳标佩戴最好由经过专业培训员工佩戴于种猪不易受损的部位。

猪群中种猪耳标要定期检查，一旦发现耳标有松动或者缺失现象，尽快做好补打工作。

繁殖母猪卡片与种猪要一一对应悬挂，这是另一种种猪身份标记，耳标遗失情况下，可以依据繁殖母猪卡进行身份确认。

做好配种舍与产房之间的种猪身份准确性交接，在各自岗位必须确保种猪身份的准确，及时发现并标记种猪身份。

做好种猪死亡或者淘汰记录，掌握种猪群的变动情况，科学严格的补入后备种猪。

进入群体的后备种猪需身份明确、系谱完整且经过遗传评估的优秀种猪。

2 仔猪的身份标记
种猪场内种猪身份的标记工作是基础性，且关乎到育种数据准确性的工作。

种猪的出生到身份标记完成是最容易出现身份混乱的时间段。

有些种猪场由于种猪身份标记混乱，导致场内种猪系谱错乱，育种数据失去了参考价值，最终导致生产成绩下降和种群退化。

认真做好产仔数据的收集工作与仔猪身份标记要做到以下几点：首先，着重培训员工，学习种猪的形态结构特点，及时发现有疑问猪只；其次，做好种猪的接生工作，记录下种猪的产仔数据。

未标记身份之前不允许调动仔猪进行寄养，急需寄养的仔猪需在猪身上做好标记；最后，标记人员采用简明易识别的标志进行标记仔猪，至少保证仔猪有两套标记，以防止仔猪身份遗失，失去种用价值。

目前大多数种猪场采用耳缺加耳牌的双重标记，大大减少仔猪身份遗失的问题。

在北美一些国家，由于动物福利的原因，动物剪耳缺已经被禁止，这些育种企业通过佩戴双耳牌和耳朵刺青号码标记种猪身份，可见育种企业对于种猪身份准确性的重视程度。

3 做好出生选留工作
种猪场内育种数据都是服务选种工作，根据各场育种方向设定育种参考系
数，进而计算种猪的育种值（EBV值）。

依据育种值高多留、育种值低少留的原
则。

目前国家遗传改良计划规定要求每
窝种猪至少保证选留1公2母参与种猪
测定。

加拿大加裕公司推荐平均每窝仔
猪留2头公猪，优秀的仔猪最多可以
选留3头小公猪，全部母猪参与生长
性能测定。

遗传评估的准确性与参与
测定的后裔数量具有紧密的关系，最
大可能地收集子代生长和背膘眼肌等
相关数据，提高遗传评估的准确性。

通常选留一头优秀的种猪非常不易。

经过遗传评估后，并非所有遗传数据
高的种猪全部符合种用标准，因此尽
可能多地选留种公猪对于加速遗传进
展具有推动作用。

制定自场选留标准，
坚决剔除不符合种用的个体或者群体，
育种值低的猪只可少选留，具有明显
遗传缺陷或者不符合种用疾病的猪只
尽量不选留。

选留过程中，母系群体
同时要考虑奶头数量和肢蹄强壮度等
相关性状。

制定一套适合本场的选留
制度，尽可能多选留遗传育种值高的种
公猪是遗传育种的重要工作之一。

4 有害基因数据的收集
家畜遗传病的出现不仅阻碍了育种
的遗传进展，还会降低种猪品种和品系
的质量。

随着人们对种猪遗传病研究，
目前一些遗传病的机理已然明确。

通过
遗传机理，淘汰缺陷猪只以及追溯其
亲属，降低遗传病的发病率。

目前种
猪场主要收集脐疝、阴囊疝、隐睾以
及睾丸雌性化这些易于观察的遗传病。

前三者可以通过淘汰种公猪，减少种
群内动物的发病率，后者主要淘汰种
母猪，除去X染色体上的雌性化突变
基因。

其他一些遗传病的遗传机制尚
不明确，需要收集大量的素材加以分
析推测，逐渐验证其发病机制。

因此
这些遗传缺陷个体的数据仍需要一一
收集。

如仔猪皮肤缺损、肢蹄先天性
弯曲、缺少肢蹄等相关遗传病的研究。

为更早揭示其遗传原理，并且剔除相关
的缺陷基因做准备。

5 种猪繁殖数据的收集
根据国家生猪遗传改良计划，母猪
繁殖性能记录包括猪只ID、胎次、与
配公猪、产仔日期、总产仔数、产活仔
数以及断奶窝重等信息。

这些信息的准
确性与完整性直接影响母猪繁殖性状的
遗传评估。

配种信息收集方面依据选配计划，
合理使用场内的公猪与母猪进行交配。

主要依据是优秀种公猪多配，普通公猪
少配，注意场内种公猪各血缘的平衡性。

及时淘汰劣质血缘，提高种群整体的生
产性能。

配种完成之后及时将配种信息
数据输入育种软件内，原始记录归档保
存，以备复查相关信息。

母猪产仔信息的收集应该准确严
谨，杜绝仔猪未标记之前进行寄养活动，
特别需要寄养的仔猪需在仔猪身上做上
不易脱落的记号后方能进行寄养。

国外
的产仔信息收集一般采用接产单，接产
单上注明产仔时间、活仔数、死胎数以
及木乃伊数。

由接生人员一一填写相应
的栏目。

记录母猪准确的产仔信息。

国
内有些场用黑板等工具进行记录，等到
标记员标记后进行寄养工作。

无论哪一
种方法，都需要接产工作人员的认真记
录，从而最真实反映种群中母猪的繁殖
性能。

标记人员认真核查接产单与分娩
信息，并根据接产单内容，按照场内
的标记方法准确编排耳号信息并逐个
标记仔猪耳缺号。

然后在猪耳朵上佩
戴与耳缺相对应的耳牌。

将分娩标记
信息单整理并校对完成后，交给育种
数据录入相关人员，及时记录在电脑
内。

相应的报表及时整理，按照时间
顺序妥善保管，备以后必要的查阅。

寄养数据记录准确，每天登记仔猪
死亡的信息加以收集汇总。

认真填写断
奶信息，包括断奶仔猪数、断奶窝重等
相关信息。

将寄养信息与断奶信息综合
起来，输入电脑中的育种软件内。

此处
如果出现错误，可以参照分娩标记信息
单进行校对。

输入完毕，将断奶信息单
存档保存。

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6 生长性能的收集
生长性能测定是对种猪优劣客观评定的基础工作，种猪的评定是种猪选留的依据，是实现遗传改良的重要育种措施。

种猪性能测定的方式分为测定站测定和现场测定两种。

国内较大的种猪企业以开展现场测定为主。

受测猪必须在相同的营养水平和饲养环境条件下进行，受测猪个体必须是健康、生长发育正常、无遗传疾病且身份清楚的猪只。

现场测定哪些性状取决于该种猪场的选育目标、测定技术和相关设备的情况。

全国种猪遗传评估方案中规定了15个可供测定的性状，其中总产仔数、100 kg 体重日龄、100 kg 体重背膘厚设为最重要的经济性状，因此农业部将这3个性状规定为种猪场必测性状。

其他12个性状为辅助测定性状。

种猪场对参加测定的种猪加以选择，同批次种猪要选择生长发育良好，符合品种形态特征，无遗传疾患的个体，目前国家农业部规定每窝至少挑选1公2母参与测定；在北美的一些国家，已经做到了全群测定。

由于后裔测定的数量越多，遗传评估越准确，因此加拿大在近十几年内，从原来的种猪进口大国一跃成为种猪输出大国。

1）达100 kg 体重日龄：待测猪体重达到80～105 kg 左右空腹测定，将待测猪只赶到笼称上称重，记录种猪所在栋舍、栏号、耳号，性别、测定日期、体重等信息，按照实际体重与日龄，由育种软件校正到100 kg 体重日龄。

2）100 kg 体重活体背膘厚和眼肌深度：在测定100 kg 体重日龄时，同时进行测定100 kg 体重活体背膘厚。

将待测猪赶到限位单栏上进行单体测定背膘厚度和眼肌深度。

测定该数据时，猪只应保持站立状态进行。

目前我国以倒数第3～4肋间，距背中线4～5 cm 的位置作为这两项指标的测定点。

如果猪只被毛比较厚，测定时可将被毛
剪去再进行。

在测定点及附近涂抹耦合剂，拇指和食指握探头与背中线平行放置于测定点处。

其余三指辅助调整探头的角度。

测定图像选择基本原则：图像清晰，背膘和眼肌分界明显，图像上背膘厚度基本相同，肋骨处出现一条清晰的亮线。

冻结图像后，使用操作面板上的工具对背膘厚和眼肌深度进行调整，最后将测定结果记录在报表上并储存测定图片。

不具有B 超的单位可利用A 超测定腰荐结合部和胸腰结合部距背中线左侧5 cm 处背膘厚的平均值。

7 数据的输入与勘误
所有收集的育种数据及时整理，分门别类输入GBS、GPS 或Herdsman 等相关的育种软件。

定期对数据进行备份，每次备份需要用单独的移动硬盘或者U 盘。

最好能将备份数据分不同地点存放，以防止出现意外导致多年育种数据丢失等重大损失。

原始记录应当按照类别和时间顺序进行归档，妥善保存在安全的地点，以备后来必要的查询。

数据输入过程中，如出现数据不完整，存在漏洞的情况，如猪只信息收集不全面、分娩数据遗漏、数据存在逻辑错误等问题，及时发现并弥补。

记录单数据应当工整清晰，如有模糊不清的情况应及时询问记录人员。

数据输入电脑过程中，工作人员应当严谨认真，避免读错或者敲错键盘。

8 遗传评估
遗传评估目前有两种形式：自场遗传评估软件评估和联合育种中心软件评估。

自场遗传评估软件可以最大化地利用场内收集的信息进行评估，缺点是不能有效利用本场以外与本场种猪相关种猪的遗传信息综合评估。

联合育种中心软件评估能够利用多个种猪场相关的数据进行遗传评估，该遗传评估的数据更加准确，因此许多国家建立起联合育种的体系，加快遗传改良进度。

该制度还有一点不足，某
些数据兼容等方面的问题，遗传改良方向相对单一。

数据核查无误，创建生产数据同期同代组。

同代组的时间长短根据自己场本身状况，尽量满足时间间距不要太大，同时满足该同期组有足够的数据进行遗传分析。

使用BLUP 法对猪只多项性状，如总产仔数，100 kg 日龄，100 kg 体重背膘厚等，进行EBV 评估，根据计算后的EBV 指数排序，指数高的个体在遗传上具有较高的种用价值，也可以根据单性状EBV 值挑选具有特色的种群，进行专门化品系的培育。

数据收集所需要的设备要经常维护，防止因为设备损坏、老化造成数据收集的不准或者中止。

数据的完整性和准确性是每一位育种工作者的工作重点。

准确的数据是育种工作的灵魂，直接关系到育种的成败。

认真做好育种数据的收集与管理工作，关系到育种成果和经济效益。

根据育种方向设定育种参数进行BLUP 分析。

根据分析结果进行种猪的选留，把最优秀的种猪留下来作为育种群体。

大量的测定数据和遗传分析，尽可能多选留，多淘汰。

尽可能缩短种猪世代间隔，核心群年更新率尽可能做到100%。

随着数量遗传学理论的发展，育种学家借助一定的统计方法将性状的表型值进行剖析，并从中评估出真实的部分。

同时应用动物模型BLUP 方法，使得育种值估计可以充分利用不同亲属的信息、场区、年度以及其他环境进行评估，预测出个体育种值，从而指导科学准确的选种。

种猪育种数据收集是一项长期坚持的过程，逐渐实现种猪遗传信息的量变到质变。

相信在科学严谨的育种环境条件下，我国的育种水平可以达到一个新的高度。

逐步摆脱对国外进口种猪的依赖，真正地做到自主创新，育出适应中国国情的优良种猪。

（收稿日期：
2016-08-10）。