抗除草剂Bar基因的优化及PAT蛋白的表达-最新年精选文档
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抗除草剂Bar 基因的优化及PAT 蛋白的表达
DOI :10.14088/jki.issn0439-8114.2015.10.058
Bar 基因作为筛选标记基因,具有快速、简便、高效、转化
细胞产生的假阳性个体少等优
点, 被广泛应用于转基因玉米
( Zea
maysL.)、大豆(Glycine maX)、油菜(Brassica campestris L. )、水稻( Oryza sativa L. )、小麦( Triticum aestivum Linn. ) 和大麦( Hordeumvulgare L. )植物基因工程研究中
基因编码膦丝菌素乙酰转移酶(PAT),其能够使草丁膦的有效 膦丝菌素(PPT 失活,从而解除除草剂的毒性。
Bar 基因广泛应用于基因工程育种中的抗除草剂基因, 也是遗传转化 中的标记基因[4]。
目前,生物技术育种的阳性转化体筛选多数
依据Bar 基因表达的草丁膦除草剂耐受性进行表型鉴定筛选。
而 由于其不同时代单个转化体的外源基因表达稳定性未知, 表型筛 选易受环境等因素影响,导致了鉴定准确性不高。
转基因植物标 记基因的检测方法主要有表型鉴定、 PCR 鉴定、ELISA 和Western 印迹等方法 [5] o ELISA 分析法特异性高,获得结果快,仪器操 作简单,同时可降低检测成本[6-8]。
建立Bar 基因原核表达体 系,表达和纯化PAT 蛋白质可为转基因转化外源蛋白质提供参 考,本研究通过密码子优化和全基因合成, 获得了适合原核表达 的Bar 基因片段,并分离纯化得到的高纯度 PAT 蛋白质,可作为 抗原为制备多抗和单抗打下基础。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌株与质粒 原核表达载体 pET28a (+)、大肠杆菌
[1-3] o Bar 成分
(Escherichia coli ) BL21 (DE3和大肠杆菌 DH5况由吉林省农业科学院生物技术研究所转基因安全评价室保存。
1.1.2酶及试剂限制性内切酶、T4 DNA连接酶、DNA聚合酶、dNTPs引物Marker购自宝生物工程(大连) XX公司;氨苄青霉素、卡那霉素、IPTG十二烷基磺酸钠(SDS和3 -巯基乙醇购自P romega 公司;Ni-NTA His Bi nd Resin 、层析柱购自北京鼎国昌盛生物技
术有限责任公司。
1.2 方法
1.2.1克隆基因片段以合成引物PCF扩增Bar基因全长,然后
用BamH I和Hi nd m内切酶分别酶切 p ET-28a载体和扩增片段,将扩增片段连接PET-28a载体,连接产物转化至DH5况感受态细胞。
利用PCR扩增鉴定阳性质粒,并将阳性重组质粒命名为PET-Bar。
提取质粒pET-Bar并转化到BL21 (DE3感受态细胞。
挑取含PET-Bar质
粒的单克隆菌落,接种于 100 mL含有氨苄青霉素的LB培养基中,37 C振荡培养过夜。
次日用LB(Amp+ 稀释至1 000 mL 37 C培养至
OD600nm为1.0左右,力n IPTG至终浓度为1 mol/L。
37 C继续培养6 h后4 C、5 000 r/min 离心10 min,收集沉淀并用PBS洗涤。
1.2.2密码子的优化利用 SignalP 3.0 Server 软件预测
Bar 基因序列有无信号肽及其位置;利用 TargetP 1.1Server 软
件检测此信号肽的功能。
将链霉菌中Bar 基因密码子与大肠杆菌
偏好密码子进行比对,根据密码子的兼并性,将 Bar 基因密码子改造为大肠杆菌偏好密码子。
1.2.3表达载体的构建将含有目的基因的片段切下并用胶
回收试剂盒回收,再与同样酶切处理的载体P ET28a连接,并转化大肠杆菌DH5x,碱解法提取质粒,根据酶切鉴定结果,筛选含有 Bar 基因的重组质粒命名为 pET28a-Bar 。
摇菌过夜培养,取1 mL菌液送北京鼎国昌盛生物技术公司测序以确定基因序列。
1.2.4外源基因的诱导表达将含有 pET28a-Bar 表达载体的
BL21 (DE3菌株于37 C活化过夜后,按4: 100稀释到20 mL含有60 mg/mL卡那霉素的LB培养基中。
振荡培养至OD600nm 为0.6〜1.0时,加入IPTG至终浓度为0.6 mmol/L,再继续培养 3 h 后 12 000 r/min 离心 5 min 后收集菌体,用 0.025 mol/L
Tris-HCl (PH 8.0 )重悬菌体, 12 000 r/min 离心 2 min 收集菌体,置于-20 C备用。
1.2.5诱导表达条件的优化振荡培养至OD600 nm为0.6 时,加入IPTG后2 h、5 h、过夜诱导,分别取出1 mL菌液,
12 000 r/min 离心1 min收集菌体,菌体置于-20 C备用。
以
SDS-PAGE分析不同的表达时间对蛋白质诱导表达量的影响。
菌液振荡培养至OD600 nm为0.6时,加入IPTG至终浓度分别为1 mmol/L,分别在37 C继续诱导5 h以上,其中在每隔1 h均取
出 1 mL 菌液, 12 000 r/min 离心 1 min 收集菌体,用 SDS-PAGE 电泳分析最佳诱导表达时间。
126目的蛋白质的纯化取诱导表达3 h后的菌液,4 C、
6 000 r/min 离心 20 min 收集菌体,将菌体破碎后分别收集可溶性和包涵体表达的PAT蛋白质,利用镍离子亲和层析柱纯化,
可溶性表达的PAT蛋白质在非变性条件下纯化,包涵体形式的
PAT蛋白质在变性条件下纯化。
2 结果与分析
2.1 密码子的优化利用 SignalP
3.0 Server 软件预测 Bar 基因
序列有无信号
肽及其位置;利用 TargetP 1.1Server 软件检测此信号肽的功能。
将链霉菌中 Bar 基因密码子与大肠杆菌偏好密码子进行比对,根据密码子的兼并性将 Bar 基因密码子改造为大肠杆菌偏好密码子(图1)。
2.2 优化序列合成序列确定后在基因的5’端引入BamHI酶切位
点,3’端弓
入Hind m酶切位点,并加入保护碱基进行全基因合成。
扩增Bar 基因全长的引物: BarF:5’ -CGCGGATCCATGTCTC3’CG;- BarR:5’ -CCCAA
GCTTGATTTCGGTAAC-分别用前1〜14条和13〜26条弓
物进行PCF扩增,把两次扩增后的产物各取 1 U L做模板,用
BarF和BarR引物进行基因全长扩增,PCFT增产物见图3。
测序结果表明,优化前后核苷酸序列同源性为 79.89%,氨基酸(183
个)同源性为 100%。
2.3 pET28a-Bar 表达载体的构建
将Bar基因片段和pET28a载体以BamH和Hind m双酶切后,T4 DNA连接酶连接过夜,转化到大肠杆菌 DH5x 中,然后将阳性质粒 pET28a-Bar 转化到大肠杆菌 BL21(DE3)中,表达质粒 pET28a-Bar 酶切鉴定结果见图 4。
2.4 Bar 基因的原核表达诱导
挑取含有重组阳性质粒的单菌落,接种到含有100 mg/mL氨衣青霉素的LB液体培养基中,37 C振荡培养过夜,然后1 : 100 接种于含有氨苄青霉素 LB液体培养基中,OD60Chm为0.4〜0.6
时加入IPTG振荡培养5 h诱导表达,将蛋白质进行 SDS-PAG电泳。
结果(图 5)表明,该重组表达载体表达外源蛋白质的最佳
诱导时间为 3 h ,重组蛋白质存在于超声破碎的沉淀中,所以表
达蛋白质为包涵体,为非可溶性的蛋白质。
2.5 PAT 蛋白质的纯化
以包涵体形式PAT蛋白分别经镍离子亲和层析纯化(图6), 纯化方法。