常用缓冲液配置之欧阳道创编
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实验室常用缓冲液配置方案
1)1 M Tris-HCl (pH7.4, 7.6, 8.0)组份浓度:1 M Tris-HCl 配制量:1 L配制方法:
1. 称量121.1 g Tris置于1 L烧杯中。
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3. 按下表量加入浓盐酸调节所需要的pH值。
4. 将溶液定容至1 L。
5. 高温高压灭菌后,室温保存。
注意:应使溶液冷却至室温后再调定pH值,因为Tris溶液的pH值随温度的变化差异很大,温度每升高1℃,溶液的pH值大约降低0.03个单位。
2)10×TE Buffer (pH7.4, 7.6, 8.0)组份浓度:100 mM Tris-HCl, 10 mM EDTA
配制量:1 L配制方法:
1. 量取下列溶液,置于1 L烧杯中。
2. 向烧杯中加入约800 ml的去离子水,均匀混合。
3. 将溶液定容至1 L后,高温高压灭菌。
4. 室温保存。
3)1.5 M Tris-HCl (pH8.8)
组份浓度:1.5 M Tris-HCl
配制量:1 L配制方法:
1. 称量181.7 g Tris置于1 L烧杯中。
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3. 用浓盐酸调节pH值至8.8。
4. 将溶液定容至1 L。
5. 高温高压灭菌后,室温保存。
注意:应使溶液冷却至室温后再调定pH值,因为Tris溶液的pH值随温度的变化差异很大,温度每升高1℃,溶液的pH值大约降低0.03个单位。
4)3 M醋酸钠(pH5.2)组份浓度:3M醋酸钠配制量:100ml 配制方法:
1.称量40.8g NaAc·3H2O置于100-200ml烧杯中,加入月40ml的去离子水搅拌溶解
2.加入冰醋酸调节pH值至5.2
3.加去离子水将溶液定容至100ml
4高温高压灭菌后,室温保存。
5)PBS Buffer组份浓度:137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4
配制量:1 L配制方法:
1. 称量下列试剂,置于1 L烧杯中。
2. 向烧杯中加入约800 ml的去离子水,充分搅拌溶解。
3. 滴加浓盐酸将pH值调节至7.4,然后加入去离子水将溶液定容至1 L。
4. 高温高压灭菌后,室温保存。
注意:上述PBS Buffer 中无二价阳离子,如需要,可在配方中补充1 mM CaCl2和0.5 mM MgCl2。
6)10 M醋酸铵组份浓度:10 M醋酸铵
配制量:100 ml
配制方法:
1. 称量77.1 g醋酸铵置于100~200 ml烧杯中,加入约30 ml的去离子水搅拌溶解。
2. 加去离子水将溶液定容至100 ml。
3. 使用0.22 mm滤膜过滤除菌。
4. 密封瓶口于室温保存。
注意:醋酸铵受热易分解,所以不能高温高压灭菌。
7)苯酚/氯仿/异戊醇(25 : 24 : 1)配制方法:
1. 说明:从核酸样品中除去蛋白质时常常使用苯酚/氯仿/异戊醇(25 : 24 : 1)。
氯仿可使蛋白质变性并有助于液相与有机相的分离,而异戊醇则有助于消除抽提过程中出现的气泡。
2. 配制方法:将Tris-HCl平衡苯酚与等体积的氯仿/异戊醇(24 : 1)混合均匀后,移入棕色玻璃瓶中4℃保存。
8)10%(W/V) SDS组份浓度:10%(W/V)SDS
配制量:100ml
配制方法:
1.称量10g高纯度的SDS置于100-200ml烧杯中,加入约80ml的去离子水,68℃加入溶解
2.滴加浓盐酸调节pH值至7.2
3.将溶液定容至100ml后,室温保存。
9)2 N NaOH组份浓度:2 N NaOH
配制量:100 ml
配制方法:
1. 量取80 ml去离子水置于100~200 ml塑料烧杯中(NaOH溶解过程中大量放热,有可能使玻璃烧杯炸裂)。
2. 称取8 g NaOH小心地逐渐加入到烧杯中,边加边搅拌。
3. 待NaOH完全溶解后,用去离子水将溶液体积定容至100 ml。
4. 将溶液转移至塑料容器中后,室温保存。
10)2.5 N HCl组份浓度:2.5 N HCl
配制量:100 ml
配制方法:
1. 在78.4 ml的去离子水中加入21.6 ml的浓盐酸(11.6 N),均匀混合。
2. 室温保存。
11)5 M NaCl组份浓度:5 M NaCl
配制量:1 L配制方法:
1. 称取29
2.2 g NaCl置于1 L烧杯中,加入约800 ml的去离子水后搅拌溶解。
2. 加去离子水将溶液定容至1 L后,适量分成小份。
3. 高温高压灭菌后,4℃保存。
11)20%(W/V) Glucose组份浓度:20%(W/V) Glucose 配制量:100 ml
配制方法:
1. 称取20 g Glucose置于100~200 ml烧杯中,加入约80 ml的去离子水后,搅拌溶解。
2. 加去离子水将溶液定容至100 ml。
3. 高温高压灭菌后,4℃保存。
12)Solution I(质粒提取用)组份浓度:25 mM Tris-HCl (pH8.0), 10 mM EDTA, 50 mM Glucose
配制量:1 L配制方法:
1. 量取下列溶液,置于1 L烧杯中。
2. 高温高压灭菌后,4℃保存。
3. 使用前每50 ml的Solution I中加入2 ml的RNase A(20 mg/ml)。
13)Solution II(质粒提取用)组份浓度:200mM NaOH,1%(W/V)SDS
配制量:500ml
配制方法:
1.量取下列溶液,置于500ml烧杯中
10%SDS 50ml
2N NaOH 50ml
2.加灭菌水定容至500ml,充分混匀
3.室温保存,此溶液保存时间最好不要超过一个月注意:SDS易产生气泡,不要剧烈搅拌
14)Solution III(质粒提取用)组份浓度:3 M KOAc, 5 M
CH3COOH
配制量:500 ml
配制方法:
1. 称量下列试剂,置于500 ml烧杯中。
2. 加入300 ml去离子水后搅拌溶解。
3. 加去离子水将溶液定容至500 ml。
4. 高温高压灭菌后,4℃保存。
15)0.5 M EDTA(pH8.0)组份浓度:0.5 M EDTA
配制量:1 L配制方法:
称取186.1 g Na2EDTA·2H2O,置于1 L烧杯中。
2. 加入约800 ml的去离子水,充分搅拌。
3. 用NaOH调节pH值至8.0(约20 g NaOH)。
注意:pH 值至8.0时,EDTA才能完全溶解。
4. 加去离子水将溶液定容至1 L。
5. 适量分成小份后,高温高压灭菌。
6. 室温保存。
16)1 M DTT
组份浓度:1 M DTT
配制量:20 ml
配制方法:
1. 称取3.09 g DTT,加入到50 ml塑料离心管内。
2. 加20 ml的0.01 M NaOAc(pH5.2),溶解后使用0.22 mm滤器过滤除菌。
3. 适量分成小份后,-20℃保存。
17)10 mM ATP 组份浓度:10 mM ATP
配制量:20 ml
配制方法:
1. 称取121 mg Na2ATP·3H2O,加入到50 ml塑料离心管内。
2. 加20 ml的25 mM Tris-HCl(pH8.0),搅拌溶解。
3. 适量分成小份后,-20℃保存。
一.常用贮液与溶液
1mol/L亚精胺(Spermidine): 溶解2.55g亚精胺于足量的水中,使终体积为10ml。
分装成小份贮存于-20℃。
1mol/L精胺(Spermine):溶解3.48g精胺于足量的水中,使终体积为10ml。
分装成小份贮存于-20℃。
10mol/L乙酸胺(ammonium acetate):将77.1g乙酸胺溶解于水中,加水定容至1L后,用0.22um孔径的滤膜过滤除菌。
10mg/ml牛血清蛋白(BSA):加100mg的牛血清蛋白(组分V或分子生物学试剂级,无DNA酶)于9.5ml水中(为
减少变性,须将蛋白加入水中,而不是将水加入蛋白),盖好盖后,轻轻摇动,直至牛血清蛋白完全溶解为止。
不要涡旋混合。
加水定容到10ml,然后分装成小份贮存于-20℃。
1mol/L二硫苏糖醇(DTT):在二硫苏糖醇5g的原装瓶中加32.4ml水,分成小份贮存于-20℃。
或转移100mg 的二硫苏糖醇至微量离心管,加0.65ml的水配制成1mol/L二硫苏糖醇溶液。
8mol/L乙酸钾(potassium acetate):溶解78.5g乙酸钾于足量的水中,加水定容到100ml。
1mol/L氯化钾(KCl):溶解7.46g氯化钾于足量的水中,加水定容到100ml。
3mol/L乙酸钠(sodium acetate):溶解40.8g的三水乙酸钠于约90ml水中,用冰乙酸调溶液的pH至5.2,再加水定容到100ml。
0.5mol/L EDTA:配制等摩尔的Na2EDTA和NaOH溶液(0.5mol/L),混合后形成EDTA的三钠盐。
或称取186.1g 的Na2EDTA·2H2O和20g的NaOH,并溶于水中,定容至1L。
1mol/L HEPES:将23.8gHEPES溶于约90ml的水中,用NaOH调pH(6.8-8.2),然后用水定容至100ml。
1mol/L HCl:加8.6ml的浓盐酸至91.4ml的水中。
25mg/ml IPGT:溶解250mg的IPGT(异丙基硫代-β-D-半乳糖苷)于10ml水中,分成小份贮存于-20℃。
1mol/LMgCl2:溶解20.3g MgCl2·6H2O于足量的水中,定容到100ml。
100mmol/L PMSF:溶解174mg的PMSF(苯甲基磺酰氟)于足量的异丙醇中,定容到10ml。
分成小份并用铝箔将装液管包裹或贮存于-20℃。
20mg/ml蛋白酶K(proteinase K):将200mg的蛋白酶L 加入到9.5ml水中,轻轻摇动,直至蛋白酶K完全溶解。
不要涡旋混合。
加水定容到10ml,然后分装成小份贮存于-20℃。
10mg/mlRnase(无DNase)(DNase-free RNase):溶解10mg的胰蛋白RNA酶于1ml的10mmol/L的乙酸钠水溶液中(pH 5.0)。
溶解后于水浴中煮沸15min,使DNA 酶失活。
用1mol/L的Tris-HCl调pH至7.5,于-20℃贮存。
(配制过程中要戴手套)
5mol/L氯化钠(NaCl):溶解29.2g氯化钠于足量的水中,定容至100ml。
10N氢氧化钠(NaOH):溶解400g氢氧化钠颗粒于约0.9L水的烧杯中(磁力搅拌器搅拌),氢氧化钠完全溶解
后用水定容至1L。
10%SDS(十二烷基硫酸钠):称取100gSDS慢慢转移到约含0.9L的水的烧杯中,用磁力搅拌器搅拌直至完全溶解。
用水定容至1L。
2mol/L山梨(糖)醇(Sorbitol):溶解36.4g山梨(糖)醇于足量水中使终体积为100ml。
100%三氯乙酸(TCA):在装有500gTCA的试剂瓶中加入100ml水,用磁力搅拌器搅拌直至完全溶解。
(稀释液应在临用前配制)
2.5%X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-半乳糖苷):溶解25mg的X-gal于1ml的二甲基甲酰胺(DMF),用铝箔包裹装液管,贮存于-20℃。
100×Denhardt试剂(Denhardt's regent)
依照上表称取各组分,溶于水中定容。
过滤除菌及杂质,分装成小份于-20℃贮存。
10×标准DNA连接酶缓冲液(standard DNA ligase buffer)(粘端、平端连接)
将配制好的缓冲液分装成小份,贮存于-20℃。
100 mmol/L dNTP 溶液(dNTP solutions)可以购买到100mmol/L纯dNTPs贮液,-80℃可贮存至少6个月。
10mmol/L dNTP混合液
20%PEG 8000/2.5M NaCl
加聚乙二醇于含有氯化钠的烧杯中,加水至终体积100ml,用磁力搅拌器搅拌溶解。
20×SSC
溶解柠檬酸三钠(二水)和氯化钠于约0.9L水中,加几滴10N NaOH溶液调pH为7.0,用水补足体积至1L。
DEPC(焦碳酸二乙酯)处理水加100ul DEPC 于100ml
水中,使DEPC的体积分数为0.1%。
在37℃温浴至少12h,然后在15 psi 条件下高压灭菌20min,以使残余的DEPC失活。
DEPC会与胺起反应,不可用DEPC处理Tris缓冲液。
甲酰胺(deionized formamide)直接购买或加Dowex XG8 混合树脂于装有甲酰胺的玻璃烧杯中,用磁力搅拌器轻轻搅拌1h,可去除甲酰胺中的离子。
经Whatman 1号滤纸过滤除去树脂后分成小份,充氮气于-80℃贮存(防止氧化)。
磷酸缓冲液(phosphate buffer)按照下表所给定的体积,混合1 mol/L 的磷酸二氢钠(单碱)和1mol/L 磷酸氢二钠(双碱)贮液,获得所需pH的磷酸缓冲液。
配制1 mol/L 的磷酸二氢钠(NaH2PO4·H2O)贮液:溶解138g于足量水中,使终体积为1L;1mol/L 磷酸氢二钠(Na2HPO4)贮液:溶解142g于足量水中使终体积为1L。
TE(用于悬浮和贮存DNA)
Tris缓冲液(Tris-HCl buffer)将121g的Tris碱溶解于约0.9L水中,再根据所要求的pH(25℃下)加一定量的浓盐酸(11.6N),用水调整终体积至1L。
二.电泳缓冲液、染料和凝胶加样液
电泳缓冲液
50×Tris-乙酸(TAE)缓冲液
5×Tris-硼酸(TBE)缓冲液
染料
1%溴酚蓝(bromophenol blue)加1g水溶性钠型溴酚蓝于100ml水中,搅拌或涡旋混合直到完全溶解。
1%二甲苯青FF(xylene cyanole FF)溶解1g二甲苯青FF于足量水中,定容到100ml。
10mg/ml的溴化乙锭(ethidium bromide)小心称取1g溴化乙锭,转移到广口瓶中,加100ml水,用磁力搅拌器搅拌直到完全溶解。
用铝箔包裹装液管,于4℃贮存。
凝胶上样液(gel loading solutions)6×碱性凝胶上样液(室温贮存)
6×聚蔗糖凝胶上样液(室温贮存)
6×溴酚蓝/二甲苯青/聚蔗糖凝胶上样液(室温贮存)
6×甘油凝胶上样液(4℃贮存)
6×
蔗糖凝胶上样液(室温贮存)
10×十二烷基硫酸钠/甘油凝胶上样液(室温贮存)
三.常用培养基
1) LB 培养基将下列组分溶解在0.9L 水中:
如果需要用1N NaOH (~1ml )调整pH 至7.0,再补足水至1L 。
注:琼脂平板需添加琼脂粉12g/L,上层琼脂平板添加琼脂粉7g/L 。
SOB 培养基将下列组分溶解在0.9L 水中:
用水补足体积到1L。
分成100ml的小份,高压灭菌。
培养基冷却到室温后,再在每100ml的小份中加1ml灭过菌的1mol/L氯化镁。
2)SOC培养基成分、方法同SOB培养基的配制,只是在培养基冷却到室温后,除了在每100ml的小份中加1ml 灭过菌的1mol/L氯化镁外,再加2ml灭菌的1mol/L葡萄糖(18g葡萄糖溶于足够水中,再用水补足到100ml,用0.22um的滤膜过滤除菌)。
3)TB培养基将下列组分溶解在0.9L水中:
各组分溶解后高压灭菌。
冷却到60℃,再加100ml灭菌的170mmol/L KH2PO4/0.72 mol/L K2HPO4的溶液(2.31g 的KH2PO4和12.54gK2HPO4溶在足量的水中,使终体积为100ml。
高压灭菌或用0.22um的滤膜过滤除菌)。
4)2×YT培养基将下列组分溶解在0.9L水中:
如果需要用1N NaOH(~1ml)调整pH至7.0,再补足水至1L。
注:琼脂平板需添加琼脂粉12g/L,上层琼脂平
板添加琼脂粉7g/L。
5)YPD培养基将下列组分溶解在0.9L水中:
用水补足体积为1L后,高压灭菌。
建议在高压灭菌之前,对色氨酸营养缺陷型每升培养基添加1.6g色氨酸,因为YPD培养基是色氨酸限制型培养基。
为了配制平板,需要在高压灭菌前加入20g琼脂粉。
四.常用抗生素
1)氨苄青霉素(ampicillin)(100mg/ml)溶解1g氨苄青霉素钠盐于足量的水中,最后定容至10ml。
分装成小份于-20℃贮存。
常以25ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
2)羧苄青霉素(carbenicillin)(50mg/ml)溶解0.5g羧苄青霉素二钠盐于足量的水中,最后定容至10ml。
分装成小份于-20℃贮存。
常以25ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
3)甲氧西林(methicillin)(100mg/ml)溶解1g甲氧西林钠于足量的水中,最后定容至10ml。
分装成小份于-20℃贮存。
常以37.5ug/ml终浓度与100ug/ml氨苄青霉素一起添加于生长培养基。
4)卡那霉素(kanamycin)(10mg/ml)溶解100mg卡那霉素于足量的水中,最后定容至10ml。
分装成小份于-20℃贮存。
常以10ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
5)氯霉素(chloramphenicol)(25mg/ml)溶解250mg 氯霉素足量的无水乙醇中,最后定容至10ml。
分装成小份于-20℃贮存。
常以12.5ug/ml~25ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
6)链霉素(streptomycin)(50mg/ml)溶解0.5g链霉素硫酸盐于足量的无水乙醇中,最后定容至10ml。
分装成小份于-20℃贮存。
常以10ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
7)萘啶酮酸(nalidixic acid)(5mg/ml)溶解50mg萘啶酮酸钠盐于足量的水中,最后定容至10ml。
分装成小份于-20℃贮存。
常以15ug/ml的终浓度添加于生长培养基。
8)四环素(tetracyyline)(10mg/ml)溶解100mg四环素盐酸盐于足量的水中,或者将无碱的四环素溶于无水乙醇,定容至10ml。
分装成小份用铝箔包裹装液管以免溶液见光,于-20℃贮存。
常以10ug/ml~50ug/ml的终浓度添加于生长培养基。