帕金森病患者加速度信号的嵌入维和关联维特征
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X(t) ={x(t),x(t+τ),…,x[t+(m -1)τ]} (1)
式 中,τ为 延 迟 时 间;m 为 嵌 入 维;{x(1),x (2),x(3),…,x(N)}为 一 维 时 间 序 列。 Takens于 1981年证明了当 m≥ 2D+1时(D为系统的维数), 重构相 空 间 与 原 相 空 间 微 分 同 胚 。 [9] 基 于 这 种 思 想,Grassberger和 Procaccia提 出 了 GP算 法 [10],通 过计算重构相空间 的 关 联 维 D2 来 揭 示 系 统 的 动 力
一种是检测人 行 走 时 足 底 产 生 的 压 力 信 号,然 后进行峰值提取获 得 步 态 信 号,最 后 分 析 步 态 序 列 的时 空 特 征,如 Rossitza等 曾 用 该 信 号 来 研 究 帕 金 森病患者的步态间 隔 和 节 律 [2];另 一 种 是 采 集 患 者 行走时产生的加速 度 信 号,对 其 峰 值 提 取 并 获 得 步 态 信 号,最 后 分 析 步 态 序 列 的 动 力 学 特 征,如 Plamen等 曾 用 该 信 号 来 研 究 神 经 控 制 系 统 的 复 杂 性 。 [3] 研究人员经过 对 步 态 信 号 的 研 究,发 现 步 态 信号节律的变化可以反映出人体的运动神经控制系 统功能的改变,且帕 金 森 病 等 神 经 性 疾 病 的 出 现 会 改变人体运动神经控制系统的动力学特征 。 [4-5]
由于帕金森病 与 运 动 神 经 系 统 病 变 有 关,因 此
第 1期
帕金森病患者加速度信号的嵌入维和关联维特征
· 45·
研究 人 员 尝 试 通 过 分 析 患 者 步 态 信 号 序 列 (gait series)的方式来达到评价其运动神 经系统 控 制功 能 的目的。步态信号序列一般通过两种方式获取:
上述两种分析方式都必不可少地要进行峰值检 测。峰值检测不仅 会 影 响 分 析 结 果 的 准 确 性,还 会 降低运算的速度,因 此 设 想 能 否 直 接 对 患 者 行 走 时 产生的原始加速度 信 号 进 行 动 力 学 特 征 分 析,来 达 到评价其 运 动 神 经 控 制 系 统 功 能 的 目 的。 嵌 入 维 (embedding dimension, m)和 关 联 维 (correlation dimension,D2)是描 述 一 个 混 沌 系 统 奇 异 吸 引 子 动 力学行为的重要工 具,而 且 它 们 在 其 它 生 理 信 号 的 研究上已经 得 到 了 很 好 的 应 用 。 [6-7] 因 此,本 研 究 采用经典 的 GP算 法 直 接 分 析 帕 金 森 病 患 者 的 原 始加 速 度 信 号,并 以 嵌 入 维 m 和 关 联 维 D2 来 量 化 患者运动神经控制系统的动力学特征。结果发现, 帕金森患者加速度信号的嵌入维和关联维均明显小 于健康人。与以往依赖步态序列的分析方法相比, 理论分析和实践检验的结果均验证了本研究方法的 有效性。
后可得到 lnC(r,m) -lnr直 线 段 的 斜 率,并 将 此 斜
率定义为序列的关联维 D2:
D2
=lim lim
r→0 N→ +∞
lnC(r,m) lnr
(3)
在实 际 计 算 中,以 lnr为 横 坐 标,lnC(r,m)-
lnr的斜率为纵坐标。当 r取 值 在 合 适 的 区 间 时,局
关 键 词 帕 金 森 病 ;加 速 度 信 号 ;嵌 入 维 ;关 联 维 ;G-P算 法 DOI:10.3969/j.issn.1002-3208.2010.0109 中 图 分 类 号 Q811.4 文 献 标 志 码 A 文 章 编 号 1002-3208(2010)01-0044-05
图 1 平台期示意图 Figure1 Sketchoftheplateau
lnC(r,m)-lnr平台 期斜率 一般随嵌 入维 m 的 增大而增大,若 当 m增 大 到 一 定 值 后,平 台 期 斜 率, 即关联维 D2 收敛于某个固定值,则此时的 m值就是 重构相空间的最小嵌入维 m。图 2为一例 PD患者加 速度信号的关联维 D2 随嵌入维 m的变化趋势。
0,x<0
距离,符 号 ‖Xi -Xj‖ 表 示 相 空 间 中 点 Xi和 点 Xj 的范数。关联积分 C(r,m)表示相空间 中吸引 子上
两点间距小于 r的概率。当 r取值较小时,C(r,m)=
0;当 r取值 过大时,C(r,m) = 1;当 r取值 适 中 时,
lnC(r,m)和 lnr呈 近 似 的 线 性 关 系,经 过 直 线 拟 合
【Keywords】 Parkinson’sdisease;accelerationsignal;embeddeddimension;correlationdimension; GPAlgorithm
0 引 言
帕金森病 (Parkinson’sdisease,PD)是 一 种 常
基 金 项 目 :国 家 自 然 科 学 基 金 (60701002)资 助 作者单位:南京 大 学 电 子 科 学 与 工 程 系 生 物 医 学 电 子 工 程 研 究 所
此重点研究一下这两个参数的选取规则。
2.1 延迟时间 τ的选择
延迟 时 间 τ的 选 取 要 考 虑 两 个 因 素,既 要 保 留
原序列的动力学系 统 信 息,又 要 降 低 序 列 内 元 素 间
的相关性。一般可 采 用 自 相 关 系 数 法、平 均 位 移 法 和互信息法 等 确 定 延 迟 时 间 。 [11] 本 研 究 采 取 自 相 关系数法 [12],定义自相关系数:
学特征,关联维 D2 可以通过计算关联积分求得:
∑ ∑ C(r,m) =lim N→ ∞ N(
1 N -1)
NN
θ(r-‖Xi -Xj‖)
i=1 j=i+1
(2)
式 中,N为 有 限 长 时 间 数 据 序 列 的 长 度;θ(x)
{1,x≥0
是 Heaviside函数,θ(x) =
;r为 给 定 的 临 界
(南 京 210093) 作 者 简 介 :符 懋 敬 (1987— ),男 。 Email:victorfmj@163.com 通信作者:庄 建 军 (1973—),博 士,讲 师。 Email:zhuangjeff@ 163.
com
见 于 中 老 年 人 群 的 神 经 功 能 障 碍 疾 病 ,虽 不 致 命 ,但 会严重影响患者正 常 的 工 作 生 活 能 力,表 现 为 动 作 缓慢、运动 障 碍、肌 肉 强 直 和 静 止 性 震 颤 等 临 床 症 状。上述症 状 主 要 用 于 帕 金 森 病 中 晚 期 病 例 的 诊 断 ,但 对 于 尚 未 出 现 明 显 临 床 症 状 的 早 期 病 例 ,诊 断 却比较困难。 因 此,寻 找 确 诊 早 期 PD病 例 的 客 观 依据对患者的早期治疗有重要的实际意义 。 [1]
EmbeddedDimensionandCorrelationDimensionCharacteristicsof theAccelerationSignalfrom thePatientswithParkinson’sDisease
FU Maojing,ZHUANG Jianjun,NING Xinbao,YIN Jie,WU Xuhui InstituteforBiomedicalElectronicEngineering,DepartmentofElectronicScienceand
Engineering,NanjingUniversity,Nanjing 210093
【Abstract】 Parkinson’sdisease(PD)cansignificantlyreducetheabilityofthecentralnervoussystem tocontrolhuman body.In thispaper,theGP algorithm wasapplied toinvestigatethechaoticdynamic characteristicsoftheaccelerationsignalfrom humanwalking.Incomparisonwithhealthysubjects,obvious decreasesintheembeddeddimension(m)andcorrelationdimension(D2)ofaccelerationsignalfrom patients withPD were observed. Experimentalresultsdemonstrated thatPD reduced the complexity and chaotic characteristicofthepatients’ motornervesystem,thechangeofwhichcouldbereconstructedthroughone dimensionalacceleration signalswith finitelength. Theresultprovidesavaluablemethod forboth clinical diagnosisofPD andphysiologicalmodelingofhumanlocomotionsystem.
2 计 算 参 数 的 选 择
从 G-P算 法 的 计 算 过 程 中 可 以 看 出,序 列 长
· 46·
北京生物医学工程 第 29卷
图 2 关联维 D2 随嵌入维 m变化趋势 Figure2 Therelationshipbetweenthecorrelationdimensionand
embeddingdimension
图 3 自相关函数值随延迟时间 τ的变化 Figure3 Changinginthevalueofautocorrelation
functionwithtimedelayτ
度 N,临界距离 r,延 迟 时 间 τ和 平 台 期 的 判 断 标 准
对嵌 入 维 m 和 关 联 维 D2 的 计 算 结 果 均 有 影 响,其 中延迟时间 τ和平 台 期 的 判 断 标 准 的 影 响 较 大,因
部 斜 率 的 曲 线 相 对 平 滑 ,该 区 间 范 围 可 称 为 平 台 期 , 以此作为确定关 联 维 D2 依 据 。 [7] 图 1为 平 台 期 示 意 图 ,图 中 的 横 线 表 示 平 台 期 的 均 值 。
1 理 论 基 础
Packard等人曾于 1980年提出使 用一 维时间 序 列的延时变量来重构一个非线性系统的相空间 : [8]
第 29卷 第 1期 2010年 2月
北京生物医学工程 BeijingBiomedicalEngineering
Vol.29 No.1 February 2010
帕金森病患者加速度信号的嵌入维和关联维特征
符懋敬 庄建军节功能障碍性 疾 病,会 显 著 地 降 低 人 体 中 枢 神 经 系 统 对 肢 体 的 控制能力。本文将 G-P算法直接应用于人体行走时产生的加速度 信 号 的 混 沌 动 力 学 研 究。 通 过 对 帕 金 森 病 患 者 和 健 康 人 群 加 速 度 信 号 的 动 力 学 特 征 进 行 比 较 后 发 现 ,相 对 于 健 康 人 ,帕 金 森 病 患 者 加 速 度 信号的嵌入维和关联维均显著减小。结果表明,帕金 森 疾 病 会 使 患 者 运 动 神 经 控 制 系 统 的 混 沌 程 度 减 弱 ,复 杂 性 降 低 ;而 且 可 以 通 过 对 有 限 长 一 维 加 速 度 信 号 的 重 构 捕 捉 患 者 运 动 神 经 控 制 系 统 动 力 学 特 征 的改变。本研究的结论对于人体运动神经控制系统的生理建模以及帕金森病的临床诊断具有一定的理 论和应用价值。
式 中,τ为 延 迟 时 间;m 为 嵌 入 维;{x(1),x (2),x(3),…,x(N)}为 一 维 时 间 序 列。 Takens于 1981年证明了当 m≥ 2D+1时(D为系统的维数), 重构相 空 间 与 原 相 空 间 微 分 同 胚 。 [9] 基 于 这 种 思 想,Grassberger和 Procaccia提 出 了 GP算 法 [10],通 过计算重构相空间 的 关 联 维 D2 来 揭 示 系 统 的 动 力
一种是检测人 行 走 时 足 底 产 生 的 压 力 信 号,然 后进行峰值提取获 得 步 态 信 号,最 后 分 析 步 态 序 列 的时 空 特 征,如 Rossitza等 曾 用 该 信 号 来 研 究 帕 金 森病患者的步态间 隔 和 节 律 [2];另 一 种 是 采 集 患 者 行走时产生的加速 度 信 号,对 其 峰 值 提 取 并 获 得 步 态 信 号,最 后 分 析 步 态 序 列 的 动 力 学 特 征,如 Plamen等 曾 用 该 信 号 来 研 究 神 经 控 制 系 统 的 复 杂 性 。 [3] 研究人员经过 对 步 态 信 号 的 研 究,发 现 步 态 信号节律的变化可以反映出人体的运动神经控制系 统功能的改变,且帕 金 森 病 等 神 经 性 疾 病 的 出 现 会 改变人体运动神经控制系统的动力学特征 。 [4-5]
由于帕金森病 与 运 动 神 经 系 统 病 变 有 关,因 此
第 1期
帕金森病患者加速度信号的嵌入维和关联维特征
· 45·
研究 人 员 尝 试 通 过 分 析 患 者 步 态 信 号 序 列 (gait series)的方式来达到评价其运动神 经系统 控 制功 能 的目的。步态信号序列一般通过两种方式获取:
上述两种分析方式都必不可少地要进行峰值检 测。峰值检测不仅 会 影 响 分 析 结 果 的 准 确 性,还 会 降低运算的速度,因 此 设 想 能 否 直 接 对 患 者 行 走 时 产生的原始加速度 信 号 进 行 动 力 学 特 征 分 析,来 达 到评价其 运 动 神 经 控 制 系 统 功 能 的 目 的。 嵌 入 维 (embedding dimension, m)和 关 联 维 (correlation dimension,D2)是描 述 一 个 混 沌 系 统 奇 异 吸 引 子 动 力学行为的重要工 具,而 且 它 们 在 其 它 生 理 信 号 的 研究上已经 得 到 了 很 好 的 应 用 。 [6-7] 因 此,本 研 究 采用经典 的 GP算 法 直 接 分 析 帕 金 森 病 患 者 的 原 始加 速 度 信 号,并 以 嵌 入 维 m 和 关 联 维 D2 来 量 化 患者运动神经控制系统的动力学特征。结果发现, 帕金森患者加速度信号的嵌入维和关联维均明显小 于健康人。与以往依赖步态序列的分析方法相比, 理论分析和实践检验的结果均验证了本研究方法的 有效性。
后可得到 lnC(r,m) -lnr直 线 段 的 斜 率,并 将 此 斜
率定义为序列的关联维 D2:
D2
=lim lim
r→0 N→ +∞
lnC(r,m) lnr
(3)
在实 际 计 算 中,以 lnr为 横 坐 标,lnC(r,m)-
lnr的斜率为纵坐标。当 r取 值 在 合 适 的 区 间 时,局
关 键 词 帕 金 森 病 ;加 速 度 信 号 ;嵌 入 维 ;关 联 维 ;G-P算 法 DOI:10.3969/j.issn.1002-3208.2010.0109 中 图 分 类 号 Q811.4 文 献 标 志 码 A 文 章 编 号 1002-3208(2010)01-0044-05
图 1 平台期示意图 Figure1 Sketchoftheplateau
lnC(r,m)-lnr平台 期斜率 一般随嵌 入维 m 的 增大而增大,若 当 m增 大 到 一 定 值 后,平 台 期 斜 率, 即关联维 D2 收敛于某个固定值,则此时的 m值就是 重构相空间的最小嵌入维 m。图 2为一例 PD患者加 速度信号的关联维 D2 随嵌入维 m的变化趋势。
0,x<0
距离,符 号 ‖Xi -Xj‖ 表 示 相 空 间 中 点 Xi和 点 Xj 的范数。关联积分 C(r,m)表示相空间 中吸引 子上
两点间距小于 r的概率。当 r取值较小时,C(r,m)=
0;当 r取值 过大时,C(r,m) = 1;当 r取值 适 中 时,
lnC(r,m)和 lnr呈 近 似 的 线 性 关 系,经 过 直 线 拟 合
【Keywords】 Parkinson’sdisease;accelerationsignal;embeddeddimension;correlationdimension; GPAlgorithm
0 引 言
帕金森病 (Parkinson’sdisease,PD)是 一 种 常
基 金 项 目 :国 家 自 然 科 学 基 金 (60701002)资 助 作者单位:南京 大 学 电 子 科 学 与 工 程 系 生 物 医 学 电 子 工 程 研 究 所
此重点研究一下这两个参数的选取规则。
2.1 延迟时间 τ的选择
延迟 时 间 τ的 选 取 要 考 虑 两 个 因 素,既 要 保 留
原序列的动力学系 统 信 息,又 要 降 低 序 列 内 元 素 间
的相关性。一般可 采 用 自 相 关 系 数 法、平 均 位 移 法 和互信息法 等 确 定 延 迟 时 间 。 [11] 本 研 究 采 取 自 相 关系数法 [12],定义自相关系数:
学特征,关联维 D2 可以通过计算关联积分求得:
∑ ∑ C(r,m) =lim N→ ∞ N(
1 N -1)
NN
θ(r-‖Xi -Xj‖)
i=1 j=i+1
(2)
式 中,N为 有 限 长 时 间 数 据 序 列 的 长 度;θ(x)
{1,x≥0
是 Heaviside函数,θ(x) =
;r为 给 定 的 临 界
(南 京 210093) 作 者 简 介 :符 懋 敬 (1987— ),男 。 Email:victorfmj@163.com 通信作者:庄 建 军 (1973—),博 士,讲 师。 Email:zhuangjeff@ 163.
com
见 于 中 老 年 人 群 的 神 经 功 能 障 碍 疾 病 ,虽 不 致 命 ,但 会严重影响患者正 常 的 工 作 生 活 能 力,表 现 为 动 作 缓慢、运动 障 碍、肌 肉 强 直 和 静 止 性 震 颤 等 临 床 症 状。上述症 状 主 要 用 于 帕 金 森 病 中 晚 期 病 例 的 诊 断 ,但 对 于 尚 未 出 现 明 显 临 床 症 状 的 早 期 病 例 ,诊 断 却比较困难。 因 此,寻 找 确 诊 早 期 PD病 例 的 客 观 依据对患者的早期治疗有重要的实际意义 。 [1]
EmbeddedDimensionandCorrelationDimensionCharacteristicsof theAccelerationSignalfrom thePatientswithParkinson’sDisease
FU Maojing,ZHUANG Jianjun,NING Xinbao,YIN Jie,WU Xuhui InstituteforBiomedicalElectronicEngineering,DepartmentofElectronicScienceand
Engineering,NanjingUniversity,Nanjing 210093
【Abstract】 Parkinson’sdisease(PD)cansignificantlyreducetheabilityofthecentralnervoussystem tocontrolhuman body.In thispaper,theGP algorithm wasapplied toinvestigatethechaoticdynamic characteristicsoftheaccelerationsignalfrom humanwalking.Incomparisonwithhealthysubjects,obvious decreasesintheembeddeddimension(m)andcorrelationdimension(D2)ofaccelerationsignalfrom patients withPD were observed. Experimentalresultsdemonstrated thatPD reduced the complexity and chaotic characteristicofthepatients’ motornervesystem,thechangeofwhichcouldbereconstructedthroughone dimensionalacceleration signalswith finitelength. Theresultprovidesavaluablemethod forboth clinical diagnosisofPD andphysiologicalmodelingofhumanlocomotionsystem.
2 计 算 参 数 的 选 择
从 G-P算 法 的 计 算 过 程 中 可 以 看 出,序 列 长
· 46·
北京生物医学工程 第 29卷
图 2 关联维 D2 随嵌入维 m变化趋势 Figure2 Therelationshipbetweenthecorrelationdimensionand
embeddingdimension
图 3 自相关函数值随延迟时间 τ的变化 Figure3 Changinginthevalueofautocorrelation
functionwithtimedelayτ
度 N,临界距离 r,延 迟 时 间 τ和 平 台 期 的 判 断 标 准
对嵌 入 维 m 和 关 联 维 D2 的 计 算 结 果 均 有 影 响,其 中延迟时间 τ和平 台 期 的 判 断 标 准 的 影 响 较 大,因
部 斜 率 的 曲 线 相 对 平 滑 ,该 区 间 范 围 可 称 为 平 台 期 , 以此作为确定关 联 维 D2 依 据 。 [7] 图 1为 平 台 期 示 意 图 ,图 中 的 横 线 表 示 平 台 期 的 均 值 。
1 理 论 基 础
Packard等人曾于 1980年提出使 用一 维时间 序 列的延时变量来重构一个非线性系统的相空间 : [8]
第 29卷 第 1期 2010年 2月
北京生物医学工程 BeijingBiomedicalEngineering
Vol.29 No.1 February 2010
帕金森病患者加速度信号的嵌入维和关联维特征
符懋敬 庄建军节功能障碍性 疾 病,会 显 著 地 降 低 人 体 中 枢 神 经 系 统 对 肢 体 的 控制能力。本文将 G-P算法直接应用于人体行走时产生的加速度 信 号 的 混 沌 动 力 学 研 究。 通 过 对 帕 金 森 病 患 者 和 健 康 人 群 加 速 度 信 号 的 动 力 学 特 征 进 行 比 较 后 发 现 ,相 对 于 健 康 人 ,帕 金 森 病 患 者 加 速 度 信号的嵌入维和关联维均显著减小。结果表明,帕金 森 疾 病 会 使 患 者 运 动 神 经 控 制 系 统 的 混 沌 程 度 减 弱 ,复 杂 性 降 低 ;而 且 可 以 通 过 对 有 限 长 一 维 加 速 度 信 号 的 重 构 捕 捉 患 者 运 动 神 经 控 制 系 统 动 力 学 特 征 的改变。本研究的结论对于人体运动神经控制系统的生理建模以及帕金森病的临床诊断具有一定的理 论和应用价值。