苯硫脲苦味实验存在问题及重新设计

苯硫脲苦味实验存在问题及重新设计
周洲
【期刊名称】《《实验室研究与探索》》
【年(卷),期】2019(038)009
【总页数】3页(P92-94)
【关键词】遗传学实验; 苯硫脲; DNA模板
【作者】周洲
【作者单位】南京师范大学生命科学学院南京210021
【正文语种】中文
【中图分类】Q3-3
0 引言
苯硫脲(Phenylthiocarbamide，PTC)是一种人工合成的白色晶体化合物，因含有N—C=S基团而有苦涩味。

PTC尝味能力主要受位于人类7号染色体上的
TAS2R38基因影响，尝味者与味盲者主要区别在于TAS2R38基因编码区145位(C/G)、785位(C/T)和886位(G/A)三处存在单核苷酸多态性(SNPs)[1]，属于常染色体不完全显性遗传。

PTC尝味实验是遗传学实验中常见实验项目，主要用于学习基因在群体水平上的传递规律[2-11]。

该实验采用阈值法检测学生PTC尝味能力，然后根据首次尝出苦味的溶液编号确定其基因型，并计算出基因频率和基因型频率，最后分析其是否处于遗传平衡状态。

但之前已有研究显示,PTC尝味能力
是受多基因控制[8,12]，实践调查也表明PTC尝味能力并不完全符合单基因孟德
尔遗传规律[13]，如父母双方基因型都为tt，子代基因型却为Tt。

另外，PTC的
苦涩味重并具有毒性，结果易受心理因素干扰[14]，学生对其比较排斥，实践中不愿意认真配合调查工作。

本文对PTC尝味实验进行重新设计，首先改进实验材料
获取方法，而后选择合适PCR引物扩增TAS2R38苦味基因，最后采用RFLP法
确定被调查者的基因型，从而获得更为准确与科学的实验结果[15]。

1 实验准备
(1) 实验对象。

受试者为在校大学生，年龄为19～20周岁。

(2) 实验试剂。

PTC梯度稀释液；50 mmol/L NaOH；1 mol/L Tris-Cl (pH8.0)；PCR试剂盒(上海生工)；PCR引物(上海生工合成)：引物1(5′-CCTTCGTTTTCTTGGTGAATTTTTGGGATGTAGTGAAG-AGGCGG-3′)；引物
2(5′-AGGTTGGCTTGGTTTGCAA-TCATC-3′)；QDL2000 Quantitative DNA Marker (Takara)；内切酶Hae III (Takara)等。

(3) 实验仪器。

水平电泳槽、微波炉、微量移液器、PCR仪、紫外透射仪等。

2 实验方法
2.1 阈值法
按相关教材方法配制PTC梯度溶液(1～14)[2-11]，测试者首先从14号管液体滴
加于受试者舌根处，令其缓缓咽下品尝，测试者应尽量避免受试者看到标签。

询问受试者能否准确鉴别两种溶液的味道，若不能鉴别或鉴别不准，此依次用13、12号液体重复，直至能明确鉴别出PTC的苦味为止；当受试者鉴别出某一号液体时，应用此号溶液重复尝味3次，3次结果一样时，结果才可靠。

根据受试者最初觉察苦味溶液的编号，查对照表查出相应的基因型并做记录。

2.2 PCR-RFLP法
2.2.1 口腔黏膜细胞收集
(1) 实验室取样。

取出0.2 μL PCR管，在PCR管加入50 μL 50 mmol/L NaOH
溶液；用纯净水轻微漱口，用无菌牙签轻刮脸颊内壁多次，将刮取物置于NaOH
溶液中搅动释放细胞，然后弃去牙签。

(2) 校园调查取样。

吸取1 mL无水乙醇于1.5 mL离心管中；被调查者用纯净水
轻微漱口，用牙签轻刮脸颊内壁多次，将刮取物置于无水乙醇中；剪去不含刮取物的多余牙签部分，盖紧管盖后，带回实验室；置于旋涡混合器上振荡30 s，打开
管盖后用弃去牙签；盖紧管盖后，3 000 r/min离心10 min，轻轻倾倒掉上清液，可用移液器轻轻吸取剩下上清液，将离心管倒扣在无菌滤纸上空气晾干，或置于真空干燥仪中快速干燥；加入50 μL 50 mmol/L NaOH溶液，用移液器吹打沉淀，然后将混合液转移至0.2 mL PCR管中。

2.2.2 模板DNA直接制备
将PCR管短暂离心后，置于PCR仪中，95 ℃下裂解10 min；取出PCR管，加
入5 μL 1 mol/L Tris-Cl (pH8.0)缓冲液(1/10体积)，混匀后即为用于PCR的模板DNA。

2.2.3 PCR扩增
在冰上放置1.5 mL离心管，PCR试剂解冻后立即置于冰上，鉴于溶液黏性造成误差，先按PCR反应所需量配制除DNA模板以外总的混合液，然后在0.2 μL PCR 管中精确分成相应等份，实验操作时单独添加模板。

30 μL PCR反应体系：5 μL DNA模板，3 μL 10×buffer (1×)，1.8 μL MgCl2 (1.5 mmol/L)，2.4 μL dNTPs (0.2 mmol/L)，0.6 μL引物1 (0.2 μmol/L)，0.6 μL引物2 (0.2 μmol/L)，0.2 μL Taq酶(1.0U)，16.4 μL ddH2O。

PCR反应条件：95 ℃预变性2 min，94 ℃变
性30 s，67 ℃退火45 s，72 ℃延伸45 s，共30个循环，最后在72 ℃下延伸5 min，结束后取出样品4 ℃保存备用。

2.2.4 PCR产物浓度测定
采用4 ℃保存的2.5%琼脂糖凝胶和缓冲液进行电泳检测，加样时将PCR产物与Marker共同点样，以5 μL QDL2000 Quantitative DNA Marker上样量为例，2 000、1 000、750、500、250、100 bp条带的DNA量分别为200、100、75、50、25以及10 ng；100～150 V电泳检测30～40 min；根据Marker和PCR 产物电泳条带的大小与亮度，观察与估算PCR产物的大小与浓度。

2.2.5 酶切反应与检测
使用限制性内切酶Hae III对TAS2R38基因PCR产物进行消化。

20 μL酶切反应体系：17 μL PCR产物(≤1 μg)，2 μL 10×M Buffer (1×)，1 μL Hae III内切酶(10U)，37 ℃温育3～4 h，最后取出样品进行电泳检测。

采用4 ℃保存的2.5%琼脂糖凝胶和缓冲液进行电泳检测，酶切结果检测上样量为20 μL，100～150 V 电泳检测40～50 min，最终根据Marker和酶切结果确定基因型。

3 实验结果与讨论
3.1 电泳结果
在凝胶成像系统下观察与拍照，PCR产物电泳检测结果如图1和图3所示，PCR 预期产物为221 bp的DNA条带，接近于Marker的250 bp条带，其中图1为实验室取样，图3为校园调查取样，实验结果表明不管是何种取样方法，都可以扩增出221b目的片段。

图2和图4分别为图1和图3的酶切电泳检测结果，显性基因T经过Hae III酶切后，长度变为177和44 bp，Hae III无法酶切隐性基因t，因此仅出现177 bp片段则说明是TT基因型；出现221和177 bp片段出现则说明是Tt基因型；仅出现221 bp片段则说明是tt基因型；其中44 bp的DNA片段太短，比较靠前，容易与PCR引物二聚体混在一起，所以无需依据它的存在与否确定PTC基因型。

3.2 实验讨论
采用半定量分子Marker主要是用于确定PCR产物含量问题。

从实验结果看，
20μL PCR产物的DNA含量达不到1 μg，因此以后开展此实验时，可采用其他常规分子Marker。

在实验教学中同时采用阈值法与PCR-RFLP法检测TAS2R38基因型，发现约有19%的同学的尝味结果与基因分型结果不一致，这也说明PTC尝味能力不符合单基因遗传规律。

遗传学实验教学内容理应与最新科学研究成果相一致，不能因为之前的方法相对简便，就仍然坚持采用旧内容与方法进行实验教学。

采用PCR-RFLP法带来的问题是学生缺乏直观体验，由于十字花科蔬菜中的苦味
物质含有N—C=S基团，因此可调查学生对十字花科蔬菜的嗜好性，如萝卜、卷
心菜、西兰花等，在调查时要求被调查者如实填写，例如明显能够感觉到苦味为超敏感，偶尔能感觉到的为一般敏感，没有感觉的为不敏感，学生可直观感受
TAS2R38基因型与此类蔬菜嗜好性的相关性，激发学生学习兴趣和增强实验教学
效果。

图1 实验室取样PCR扩增结果
图2 实验室取样酶切结果
图3 校园取样PCR扩增结果
图4 校园取样酶切结果
4 结语
传统的阈值法即便采用毒性较小的PROP代替PTC进行尝味能力调查，在用于本科实验教学时，仍存在之前的问题，同时该试剂也存在其它缺点，如测量区间更窄，不同基因型对应溶液存在重叠，若要细分出不同基因型，需要与NaCl溶液配合使用，被测试者需反复品尝这两个溶液并做比较，从而难以获得准确结果数据[1]。

本实验方法主要通过收集被调查者口腔粘膜细胞，采用直接法快速获取模板DNA，从而简化了实验材料的收集，方便学生进行实验与开展校园调查，同时对实验试剂和仪器要求较低，大多数高校都可以开设此实验。

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