如何添加酶切位点
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当在引物5’端添加酶切位点时要考虑:
a)该目的序列内部不得含有相同的酶切位点,在引物发出后才发现错误的事情本人就干过,在论坛上也能看到这样的粗心人。这样的错误会给将来的克隆造成麻烦。
b)如果打算PCR 后直接酶切,不要忘了在酶切位点的外侧再加上保护碱基,不同的酶对于保护碱基的要求是不同的。
如果不设计保护碱基,则多半要用TA 克隆的方式连接到质粒上,这时要注意Taq 酶的选择,若想在目的序列上附加上并不存在的序列,如限制位点和启动子序列,可以加入到引物5'端而不影响特异性。
当计算引物Tm 值时并不包括这些序列,但是应该对其进行互补性和内部二级结构的检测。PCR设计引物时酶切位点的保护?
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