R语言总结
R语言常量知识点总结
R语⾔常量知识点总结R语⾔基本的数据类型有数值型,逻辑型(TRUE, FALSE),⽂本(字符串)。
⽀持缺失值,有专门的复数类型。
常量是指直接写在程序中的值。
数值型常量包括整型、单精度、双精度等,⼀般不需要区分。
写法如123, 123.45, -123.45, -0.012, 1.23E2, -1.2E-2等。
为了表⽰123是整型,可以写成123L。
字符型常量⽤两个双撇号或两个单撇号包围,如"Li Ming"或'Li Ming'。
字符型⽀持中⽂,如"李明"或'李明'。
国内的中⽂编码主要有GBK编码和UTF-8编码,有时会遇到编码错误造成乱码的问题,MS Windows下R程序⼀般⽤GBK编码,但是RStudio 软件采⽤UTF-8编码。
在R软件内字符串⼀般⽤UTF-8编码保存。
逻辑型常量只有TRUE和FALSE。
缺失值⽤NA表⽰。
统计计算中经常会遇到缺失值,表⽰记录丢失、因为错误⽽不能⽤、节假⽇没有数据等。
除了数值型,逻辑型和字符型也可以有缺失值,⽽且字符型的空⽩值不会⾃动辨识为缺失值,需要⾃⼰规定。
R⽀持特殊的Inf值,这是实数型值,表⽰正⽆穷⼤,不算缺失值。
复数常量写法如2.2 + 3.5i, 1i等。
知识点扩展:常量R中的常量基本分为四种类型:逻辑型、数值型、字符型和因⼦型。
下⾯是⽣成因⼦的命令:x<-c("beijing","shanghai","beijing","beijing","shanghai")y<-factor(x)y也可以写为:y<-factor(c(1,0,1,1,0)) #这⾥levels为因⼦⽔平,表⽰有哪些因⼦.c()为连接函数,把单个标量连成向量.yy==0 #有了变量名,⾸先可以将y与0进⾏⽐较到此这篇关于R语⾔常量知识点总结的⽂章就介绍到这了,更多相关R语⾔常量内容请搜索以前的⽂章或继续浏览下⾯的相关⽂章希望⼤家以后多多⽀持!。
可用于主成分分析R型因子分析简单相应分析的R语言函数总结
可用于主成分分析R型因子分析简单相应分析的R语言
函数总结
主成分分析、R型因子分析和简单相应分析是三种常用的数据分析方法。
在R语言中,有许多函数可以用于实现这些分析。
以下是一些常用的
R语言函数总结:
2. R型因子分析(R-mode Factor Analysis):
- fa(:用于进行因子分析,主要用于解析观测变量之间的关系。
- factanal(:也用于进行因子分析,和fa(函数功能类似。
3. 简单相应分析(Simple Correspondence Analysis):
- ca(:用于进行简单对应分析,可以用于探索两个离散变量之间的
关系。
- dudi.coa(:也用于进行简单对应分析,支持对多个离散变量进行
分析。
除了上述函数,R语言还有许多其他函数和包可以用于不同类型的数
据分析,如下所示:
- FactoMineR包:提供了一系列用于因子分析和主成分分析的函数。
- ade4包:提供了多种多样的单变量和多变量分析方法,包括PCA
和R型因子分析。
- caTools包:包含了用于进行简单对应分析的函数和工具。
- factoextra包:用于展示和解释因子分析和主成分分析的结果。
- psych包:提供了一系列用于心理学研究的统计分析方法,包括因子分析和主成分分析。
-MASS包:提供了一些经典的统计分析方法,包括主成分分析和简单对应分析。
总的来说,R语言提供了丰富的函数和包,可以用于主成分分析、R 型因子分析和简单相应分析等多种数据分析方法。
通过合理选择和组合这些函数和包,可以对不同类型的数据进行有效的分析和解释。
R语言常用语法总结
R语⾔常⽤语法总结## 1. 数据输⼊ ##a$b # 数据框中的变量a = 15 # 赋值a <- 15 # 赋值a = c(1,2,3,4,5) # 数组(向量)b = a[1] # 数组下标,从1开始b = a[1:5] # ⼦数组b = a[-2] # ⼦数组:扣除第2个的⼦数组b = a[c(1,3)] # ⼦数组:访问第1,3个元素b = c(a0,a1,a2) # 连接多个数组a = rep(c(1,2,3,4),each=8) # ⽣成重复数列,⽀持每个重复和整个重复a = seq(from=1,to=4,by=1) # ⽣成等差数列b = cbind(a0,a1,a2,a3) # 按列合并,⽣成⼆维数组b = a[,1] # 取第1列b = a[1:4,1]b = a[,c(1,3,4)]a = vector(length=8) # ⽣成向量a = matrix(1:20, nrow=8,ncol=4) # ⽣成矩阵colnames(a) = c("A","B","C","D") # 列名称。
!! 函数作为左值b = as.matrix(cbind(a1,a2,a3)) # 利⽤cbind直接⽣成矩阵b = data.frame(b1 = a1,b2 = a2) # ⽣成数据框b = list(c(1,2,3),c("a","b","c","d"),matrix(nrow=2,ncol=2)) # ⽣成散列b = a$c == 1 # ⽣成⼀个⽤于筛选的向量 !!较难理解d = a[b,0] # ⽣成符合条件的⼦集d = a[a$c == 1,]b = order(a$c) # ⽣成⼀个⽤于排序的向量 !!较难理解a[b,] # 排序结果b = merge(a1,a2,by = "Sample",all = "TRUE") # join两个数据框a$fb = factor(a$b) # 因⼦化tapply(X=a$b,INDEX=a$c,FUN=mean) # 对所有⼦集作函数运算sapply(a,FUN=mean) # 对所有列作函数运算,输出向量lapply(a,FUN=mean) # 对所有列作函数运算,输出列表summary(a) # 计算所有列的基本统计信息table(a$b) # 计算列联表table(a$b,a$c)paste("a","b",sep=",") # 连接字符串##2. 载⼊和输出数据 ##b = read.table(file="C:/data.txt",header=TRUE,dec=".") # 读取CSV数据library(RODBC) # 载⼊ODBC⼯具odbcConnect("MyDb.mdb") # 连接ODBC数据库b = sqlFetch(channel,"MyTable") # 取表write.table(a,file="temp.txt",sep=" ",quote = FALSE, append=FALSE,na="NA") # 输出## 3. 绘图 ##plot(x=a$b,y=a$c,xlab="X",ylab="Y",main="Title",xlim=c(0,10),ylim=c(0,100),pch=1,col=2,cex=1.5) # 散点图,参数多⽀持向量lines() # 曲线jpeg(file="any.jpg") # 打开⼀个jpg⽂件dev.off() # 关闭图⽚⽂件## 4. 语法 ##for (i in 1:10) {do sth...} # for循环a = function(a,b="n") { # 构造函数do sht...}## A. 函数 ### 运算 #colSums() # 按列求和max()median() # 中位数min()paste() # 连接字符串rowSums() # 按⾏求和solve() # 矩阵求拟sqrt() #sum() # na.rm=TRUE 忽略NA值t() # 矩阵转置# 数据定义 #attach() # 添加数据框为路径as.matrix() # 作为矩阵as.data.frame() # 作为数据框c() # 连接向量cbind() # 按列连接,⽣成⼆维colnames() # 列名detach() # 去除数据框作为路径dim() # ⾏数、列数factor() # 因⼦化is.matrix() # 是否矩阵is.data.frame() # 是否数据框lapply() # 对所有列作函数运算,输出列表matrix() # ⽣成矩阵names() # 查看list的元素名称nrow() # ⾏数ncol() # 列数order() # 数据框排序rbind() # 按⾏连接rep() # 重复数列。
r语言编程实验报告总结
r语言编程实验报告总结
本次实验主要是对R语言编程的学习和掌握进行实践操作,通过实验了解R语言的基本语法和数据结构,掌握R语言的编程方法和数据分析技巧。
在实验中,我们学习了R语言的基础知识,如基本数据类型、变量、运算符、数据结构等。
同时,我们也学习了R语言的控制结构,如条件语句、循环语句等,这些控制结构可以帮助我们更好地控制程序的执行。
除此之外,我们还学习了R语言的函数和包的使用,在实验中我们使用了一些常用的包,如ggplot2包和dplyr包,这些包可以帮助我们更加方便地进行数据分析和绘图。
同时,我们也学习了如何自己编写函数,并且熟练掌握了函数的调用和参数传递。
通过实验,我们还学习了如何进行数据处理和数据分析,包括数据的读取和写入、数据的清洗和转换、数据的统计分析和可视化等等。
我们使用R语言对一些真实数据进行了处理和分析,这些数据包括房价、气温、人口等等。
在实验中,我们遇到了一些问题,如代码错误、数据异常等等,但是通过对问题的分析和解决,我们不断提升了自己的编程能力和数据分析技能。
综上所述,通过本次实验,我们深入了解了R语言的编程方法和数据分析技巧,掌握了一些常用的包和函数,并且在实践中熟悉了数据处理和分析的整个过程,这对我们今后的学习和工作都具有重要的
意义。
r语言mindr包总结
r语言mindr包总结摘要:1.简介a.R 语言介绍b.mindr 包的概述2.mindr 包的安装与加载a.安装方法b.加载方法3.mindr 包的主要功能a.数据导入与导出b.数据处理与分析c.数据可视化4.mindr 包的常用函数a.数据导入与导出函数i.导入数据ii.导出数据b.数据处理与分析函数i.数据清洗ii.数据转换iii.数据汇总c.数据可视化函数i.绘制直方图ii.绘制箱线图iii.绘制散点图5.mindr 包的案例分析a.案例背景b.数据导入与导出c.数据处理与分析d.数据可视化6.mindr 包的优缺点a.优点i.功能丰富ii.操作简便iii.结果直观b.缺点i.学习成本较高ii.兼容性问题7.总结a.mindr 包的价值b.适用场景c.未来发展方向正文:R 语言是一种广泛应用于数据科学和统计分析的编程语言。
在R 语言中,有一个名为mindr 的包,它为数据处理、分析和可视化提供了一系列实用的功能。
首先,我们需要安装并加载mindr 包。
安装方法有两种:一种是使用install.packages() 函数,另一种是在RStudio 中直接安装。
加载方法为library(mindr)。
mindr 包的主要功能包括数据导入与导出、数据处理与分析以及数据可视化。
在数据导入与导出方面,mindr 包支持多种数据格式的导入与导出,如CSV、Excel、SPSS 等。
在数据处理与分析方面,mindr 包提供了丰富的函数,可用于数据清洗、转换和汇总。
在数据可视化方面,mindr 包内置了许多可视化函数,如直方图、箱线图和散点图等。
mindr 包中有很多常用的函数。
在数据导入与导出方面,我们有read.csv()、read.excel() 等函数;在数据处理与分析方面,我们有clean()、transform()、summarise() 等函数;在数据可视化方面,我们有hist()、boxplot()、scatter() 等函数。
R语言时间序列有关各种函数总结
R语言时间序列有关各种函数总结R语言是一种强大的统计分析和数据可视化工具,提供了许多时间序列分析的函数和方法。
下面是一些重要的时间序列分析函数的总结:1. ts(函数:用于创建时间序列对象。
可以指定时间序列的起始时间、结束时间、时间间隔等。
例如,创建从1990年1月到1999年12月的月度时间序列对象可以使用以下代码:```Rts_data <- ts(data, start=c(1990, 1), end=c(1999, 12), frequency=12)``````R```3. stl(函数:基于季节性-趋势-随机性分解的局部回归方法,用于进行季节调整。
该函数可以根据时间序列的特性自动选择适当的分解模型。
以下是使用stl(函数进行季节调整的示例:```Rseasonally_adjusted <- stl(ts_data, s.window="periodic")```4. forecast(函数:用于时间序列的预测。
可以根据历史数据拟合不同的模型,例如ARIMA模型、指数平滑模型等,并生成未来一段时间的预测结果。
以下是使用forecast(函数生成未来12个月的预测结果的示例:```Rforecast_result <- forecast(ts_data, h=12)```5. autocorrelation(函数:用于计算时间序列的自相关系数。
自相关系数可以帮助我们了解时间序列的固定模式和周期性。
以下是计算时间序列的自相关系数的示例:```Racf_result <- autocorrelation(ts_data)```6. arima(函数:用于建立自回归移动平均模型(ARIMA)来拟合时间序列。
ARIMA模型是一种常用的时间序列预测模型,可以预测时间序列的未来值。
以下是使用arima(函数拟合ARIMA模型的示例:```Rarima_model <- arima(ts_data, order=c(p, d, q))```7. ets(函数:用于指数平滑时间序列模型的拟合和预测。
R语言学习总结
R语言学习总结经过接近一个学期的学习,从对R语言的完全陌生,到现在对其有了一些粗浅的认识,其中经历了遇到困难苦思冥想的艰辛,也有解决问题以后豁然开朗的畅快。
在学习的过程中,以前掌握的数理基础给我带来了不少便利,而认真地态度和踏实的性格也使我获益匪浅。
在这个学期中,我学会了R语言的基本操作和语法,以及针对具体的统计学问题相应的解决方法.并按时完成老师布置的课后作业,以达到学以致用的目的,也加强了对R语言操作的熟练度。
一、初识R软件R软件是一套完整的数据处理、计算和制图软件系统。
其功能包括:据存储和处理,数组运算,完整连贯的统计分析工具,优秀的统计制图功能已及简便而强大编程语言。
接触R语言以后,我的第一感觉就是方便和强大。
R语言中有非常多的函数和包,我们几乎不用自己去编一些复杂的算法,而往往只需要短短几行代码就能解决很复杂的问题,这给我们的使用带来了极大地方便;于此同时,它又可操纵数据的输入输出,实习分支、循环,使用者可以自定义功能,这就意味着当找不到合适的函数或包来解决所遇的问题时,我们又可以自己编程去实现各种具体功能,这也正是R语言的强大之处。
二、学习心得在学习该书的过程中,我不仅加深了对统计学方法的理解,同时也掌握了R 软件的编程方法和基本技巧,了解了各种函数的意义和用法,并能把两者结合起来,解决实际中的统计问题。
1、R语言的基本语法及技巧R语言不仅可以进行基础的数字、字符以及向量的运算,内置了许多与向量运算有关的函数。
而且还提供了十分灵活的访问向量元素和子集的功能。
R语言中经常出现数组,它可以看作是定义了维数(dim属性)的向量.因此数组同样可以进行各种运算,以及访问数组元素和子集.二维数组(矩阵)是比较重要和特殊的一类数组,R可以对矩阵进行内积、外积、乘法、求解、奇异值分解及最小二乘拟合等运算,以及进行矩阵的合并、拉直等。
apply()函数可以在对矩阵的一维或若干维进行某种计算,例如apply(A,1,mean)表示对A按行求和.R语言允许将不同类型的元素放在一个集合中,这个集合叫做一个列表,列表元素总可以用“列表名[[下标]]”的格式引用。
R语言中的各种分布函数总结
R语言中的各种分布函数总结R语言中有许多常用的概率分布函数。
每个概率分布函数对应着一种特定的随机变量,如正态分布、二项分布、泊松分布等。
本文将总结R语言中常用的概率分布函数。
1. 正态分布:正态分布是自然界中非常常见的一种分布。
在R语言中,正态分布相关的函数有`dnorm(`(概率密度函数)、`pnorm(`(累积分布函数)、`qnorm(`(分位数函数)和`rnorm(`(随机样本生成函数)。
2. 二项分布:二项分布是一个离散型的概率分布,描述了在给定样本数n和成功概率p的条件下,成功事件发生k次的概率。
R语言中,二项分布相关函数有`dbinom(`(概率质量函数)、`pbinom(`(累积分布函数)、`qbinom(`(分位数函数)和`rbinom(`(随机样本生成函数)。
3. 泊松分布:泊松分布适用于描述在给定时间和空间内事件发生的次数的随机过程。
R语言中,泊松分布相关函数有`dpois(`(概率质量函数)、`ppois(`(累积分布函数)、`qpois(`(分位数函数)和`rpois(`(随机样本生成函数)。
4. 均匀分布:均匀分布是指在给定的区间上,随机变量的概率密度函数是一个常数。
R语言中,均匀分布相关函数有`dunif(`(概率密度函数)、`punif(`(累积分布函数)、`qunif(`(分位数函数)和`runif(`(随机样本生成函数)。
5. 指数分布:指数分布是连续型分布,用于描述独立随机事件发生间隔时间的概率。
R语言中,指数分布相关函数有`dexp(`(概率密度函数)、`pexp(`(累积分布函数)、`qexp(`(分位数函数)和`rexp(`(随机样本生成函数)。
6. 卡方分布:卡方分布是指若干相互独立的标准正态分布的随机变量的平方和服从卡方分布。
R语言中,卡方分布相关函数有`dchisq(`(概率密度函数)、`pchisq(`(累积分布函数)、`qchisq(`(分位数函数)和`rchisq(`(随机样本生成函数)。
r语言课程个人总结与心得
:R语言课程个人总结与心得在过去的几个月里,我有幸参加了一门关于R语言的课程,这段学习经历不仅让我深入了解了数据分析和可视化的基本原理,还为我提供了一个强大的工具,使我能够更有效地处理和分析数据。
以下是我在这门课程中的个人总结与心得。
1. 入门与基础知识:一开始,我对R语言并不熟悉,但通过系统的学习,我迅速掌握了基础知识。
课程的前几周主要注重于语言的基本语法、数据结构和基本操作,为我打下了坚实的基础。
学习过程中,我发现R语言的语法清晰简洁,使得代码编写变得更加直观和易读。
2. 数据处理与清洗:课程的重点之一是数据处理和清洗。
通过学习R语言的相关函数和技巧,我学会了如何有效地导入、清理和处理各种类型的数据。
处理缺失值、重复值和异常值的技能,使我在实际工作中更加得心应手。
3. 数据分析与统计:R语言在数据分析和统计方面有着强大的功能,而课程也深入介绍了如何利用R进行常见的统计分析。
从描述性统计到假设检验,我逐渐掌握了如何使用R语言进行数据分析,从而更好地理解数据背后的信息。
4. 数据可视化:数据可视化是R语言的一项强项,通过学习相关的包如ggplot2,我学会了如何创建各种精美、具有信息传达能力的图表。
这不仅提高了我的数据沟通能力,还使我能够更好地向他人展示数据的洞察力。
5. 实际应用与项目实践:除了理论知识,课程还注重实际应用和项目实践。
通过参与真实场景的项目,我深刻理解了如何将所学知识应用到实际问题中,并通过与同学的合作,提高了团队协作的能力。
6. 持续学习与社区参与:R语言是一个不断发展的工具,我学到的知识只是冰山一角。
课程鼓励我们积极参与R语言社区,查阅文档、阅读博客,从其他人的经验中学到更多。
持续学习的态度将是我未来的方向。
总的来说,这门R语言课程让我受益匪浅。
通过系统学习和实际操作,我不仅掌握了R语言的基本技能,还培养了数据分析的思维方式。
这将对我的职业发展和学术研究产生深远的影响。
我深深感谢这门课程给予我的启发与指导,相信R语言将成为我未来数据领域探索的得力助手。
R语言函数总结(转)
R语言函数总结(转)
1、abs( 函数:
abs(函数,即绝对值函数,求一个实数/集合中的绝对值,返回一个绝对值。
abs函数实际上表达的就是一个点到原点的距离。
2、acos(函数:
acos(函数,即反余弦函数,求一个实数的反余弦值,返回一个角度值,该角度值的余弦值与该实数相同。
3、acosh(函数:
acosh(函数,即反双曲余弦函数,求一个实数的反双曲余弦值,返回一个实数。
该实数的双曲余弦值与该实数相同。
4、asin(函数:
asin(函数,即反正弦函数,求一个实数的反正弦值,返回一个角度值,该角度值的正弦值与该实数相同。
5、asinh(函数:
asinh(函数,即反双曲正弦函数,求一个实数的反双曲正弦值,返回一个实数。
该实数的双曲正弦值与该实数相同。
6、atan( 函数:
atan( 函数,即反正切函数,求一个实数的反正切值,返回一个角度值,该角度值的正切值与该实数相同。
7、atanh( 函数:
atanh( 函数,即反双曲正切函数,求一个实数的反双曲正切值,返
回一个实数。
该实数的双曲正切值与该实数相同。
8、ceiling( 函数:
ceiling( 函数,即地板函数,求一个实数的离它最近的大于等于它
的整数,返回一个整数。
9、cos( 函数:
cos( 函数,即余弦函数,求一个角度/实数的余弦值,返回一个实数。
10、cosh(函数:
cosh( 函数,即双曲余弦函数。
r语言实验报告总结.doc
r语言实验报告总结.doc说明:本文是一个r语言实验报告的总结,共1000字。
主要内容包括实验目的和背景、实验设计和方法、实验结果和分析,以及实验结论和展望。
实验目的和背景本次实验的目的是探究身高和体重之间的相关性,为了达到这个目标,我们使用了r语言中的数据分析功能来进行相关性分析。
实验设计和方法本次实验采用了r语言中的数据分析工具来进行相关性分析,具体的实验设计和方法如下:样本数据的导入:我们首先使用r语言中的数据导入功能将样本数据导入到分析环境中,为后续的分析做好准备。
数据分析的可视化:为了更好地观察数据之间的相关性,我们使用r语言中的图形分析功能将样本数据制成散点图和箱线图等可视化图像。
数据的统计分析:为了对数据进行更准确的分析,我们使用r语言中的统计分析函数来计算身高和体重之间的相关系数和显著性水平等统计指标。
实验结果和分析通过对样本数据的分析,我们得出了以下结论:身高和体重之间存在着一定的相关性,相关系数为0.7,表明身高和体重之间具有较强的正相关关系。
身高和体重之间的差异较大,从箱线图的结果可以看出,身高和体重之间的差异较大,而且体重的分布范围也较为广泛。
身高和体重的分布形态较为正态,从散点图的结果可以看出,身高和体重的分布形态较为接近正态分布,符合正态分布的假设条件。
实验结论和展望通过本次实验,我们得出了身高和体重之间存在着一定的正相关关系的结论,这对于人们正确认识身高和体重之间的关系,以及合理控制体重具有一定的指导意义。
未来,我们可以考虑进一步拓展数据集,将年龄、性别、学历等因素纳入分析,以便更全面、深入地探究身高和体重之间的关系。
同时,我们也可以结合健康生活习惯、饮食等方面的数据,来寻找身高和体重之间的因果关系,为人们制定更科学的健康生活计划提供更加有力的依据。
R语言函数总结(2)
R语⾔函数总结(2)统计学上分布有很多,在R中基本都有描述。
因能⼒有限,我们就挑选⼏个常⽤的、⽐较重要的简单介绍⼀下每种分布的定义,公式,以及在R中的展⽰。
统计分布每⼀种分布有四个函数:d――density(密度函数),p――分布函数,q――分位数函数,r――随机数函数。
⽐如,正态分布的这四个函数为dnorm,pnorm,qnorm,rnorm。
下⾯我们列出各分布后缀,前⾯加前缀d、p、q或r就构成函数名:norm:正态,t:t分布,f:F分布,chisq:卡⽅(包括⾮中⼼) unif:均匀,exp:指数,weibull:威布尔,gamma:伽玛,beta:贝塔 lnorm:对数正态,logis:逻辑分布,cauchy:柯西, binom:⼆项分布,geom:⼏何分布,hyper:超⼏何,nbinom:负⼆项,pois:泊松 signrank:符号秩,wilcox:秩和,tukey:学⽣化极差下⾯先列举各种分布:rnorm(n, mean=0, sd=1) ⾼斯(正态)分布rexp(n, rate=1) 指数分布rgamma(n, shape, scale=1) γ分布 rpois(n, lambda) Poisson分布rweibull(n, shape, scale=1) Weibull分布 rcauchy(n, location=0, scale=1) Cauchy分布 rbeta(n, shape1, shape2) β分布 rt(n, df) t分布 rf(n, df1, df2) F分布 rchisq(n, df) χ 2 分布rbinom(n, size, prob)⼆项分布rgeom(n, prob)⼏何分布rhyper(nn, m, n, k) 超⼏何分布rlogis(n, location=0, scale=1) logistic分布rlnorm(n, meanlog=0, sdlog=1)对数正态rnbinom(n, size, prob)负⼆项分布runif(n, min=0, max=1)均匀分布rwilcox(nn, m, n), rsignrank(nn, n) Wilcoxon分布注意了,上⾯的分布都有⼀个规律,就是所有的函数前⾯都有r开始,所以呢,如果想获得概率密度,就⽤d替换r如果想获取累计概率密度,就⽤p替换r如果想获取分位数,就⽤q替换r⼆项分布:即重复n次独⽴的。
总结R语言中矩阵运算的函数
总结R语言中矩阵运算的函数
R语言中矩阵运算的函数主要有以下几类:
1、矩阵创建函数
(1)matrix(函数:可以方便地构建由数据集合成的矩阵。
(2)array(函数:可以构建指定步长、指定维度的矩阵。
(3)cbind(和rbind(函数:可以把两个或多个向量或矩阵合并成一个矩阵,其中cbind(按列连接,rbind(按行连接。
2、矩阵访问函数
(1)[]函数:可以把一个矩阵按行或列的范围抽出来。
(2)rownames(函数:可以把一个矩阵制定行的名字抽出来。
(3)colnames(函数:可以把一个矩阵指定列的名字抽出来。
3、矩阵运算函数
(1)+、-、*以及/等运算符:可以实现矩阵的加减乘除以及其他算术运算。
(2)t(函数:可以把一个矩阵转置,把行变成列,把列变成行。
(3)diag(函数:可以把一个矩阵按对角线把元素抽出来组成一个新的向量。
(4)det(函数:可以计算矩阵的行列式,可以用于解决方程组。
(5)solve(函数:可以解决矩阵的特征方程组。
(6)crossprod(函数:可以把两个向量或两个矩阵带入,计算两个向量或者两个矩阵的点乘,也就是其内积。
(7)outer(函数:可以把乘积的结果按行和列的方式组织起来,形成一个矩阵。
4、矩阵转换和汇总函数。
R语言方法总结
计算描述性统计量:1、summary:例:summarymtcarsvarssummary函数提供了最小值、最大值、四分位数和数值型变量的均值,以及因子向量和逻辑型向量的频数统计;2、apply函数或sapply函数计算所选择的任意描述性统计量;mean、sd、var、min、max、median、length、range 和quantile;函数fivenum可返回图基五数总括Tukey’s five-number summary,即最小值、下四分位数、中位数、上四分位数和最大值;sapply例:mystats <- functionx, na.omit = FALSE {if na.omitx <- xis.naxm <- meanxn <- lengthxs <- sdxskew <- sumx - m^3/s^3/nkurt <- sumx - m^4/s^4/n - 3returncn = n, mean = m, stdev = s, skew = skew, kurtosis = kurt}sapplymtcarsvars, mystats3、describe:Hmisc包:返回变量和观测的数量、缺失值和唯一值的数目、平均值、分位数,以及五个最大的值和五个最小的值;例:libraryHmiscdescribemtcarsvars4、stat.desc:pastecs包若basic=TRUE默认值,则计算其中所有值、空值、缺失值的数量,以及最小值、最大值、值域,还有总和;若desc=TRUE同样也是默认值,则计算中位数、平均数、平均数的标准误、平均数置信度为95%的置信区间、方差、标准差以及变异系数;若norm=TRUE不是默认的,则返回正态分布统计量,包括偏度和峰度以及它们的统计显著程度和Shapiro–Wilk正态检验结果;这里使用了p值来计算平均数的置信区间默认置信度为0.95:例:librarypastecsstat.descmtcarsvars5、describe:psych包计算非缺失值的数量、平均数、标准差、中位数、截尾均值、绝对中位差、最小值、最大值、值域、偏度、峰度和平均值的标准误例:librarypsychdescribemtcarsvars分组计算描述性统计量1、aggregate:例:aggregatemtcarsvars, by = listam = mtcars$am, mean2、by:例:dstats <- functionxcmean=meanx, sd=sdxbymtcarsvars, mtcars$am, dstatsbymtcars,vars,mtcars$am,plyr::colwisdstats3、summaryBy:doBy包例librarydoBysummaryBympg + hp + wt ~ am, data = mtcars, FUN = mystats 4、describe.by:doBy包describe.by函数不允许指定任意函数, 例:librarypsychdescribe.bymtcarsvars, mtcars$am5、reshape包分组:重铸和融合例:libraryreshapedstats <- functionx cn = lengthx, mean = meanx,sd = sdxdfm <- meltmtcars, measure.vars = c"mpg", "hp","wt", id.vars = c"am", "cyl"castdfm, am + cyl + variable ~ ., dstats频数表和列联表1、table:生成简单的频数统计表mytable <- withArthritis, tableImprovedMytable2、prop.table:频数转化为比例值prop.tablemytable3、prop.table100:转化为百分比prop.tablemytable100二维列联表4、tableA,B/xtabs~A+b,data=mydata例:mytable <- xtabs~ Treatment+Improved, data=Arthritis5、margin.table和prop.table:函数分别生成边际频数和比例1:行,2:列行和与行比例margin.tablemytable, 1prop.tablemytable, 1列和与列比例margin.tablemytable, 2prop.tablemytable, 2prop.tablemytable6、addmargins:函数为这些表格添加边际和addmarginsmytableadmarginsprop.tablemytableaddmarginsprop.tablemytable, 1, 2addmarginsprop.tablemytable, 2, 17.crossTable:gmodels包例:librarygmodelsCrossTableArthritis$Treatment, Arthritis$Improved多维列联表1、table和xtabs:都可以基于三个或更多的类别型变量生成多维列联表;2、ftable:例:mytable <- xtabs~ Treatment+Sex+Improved, data=Arthritismytableftablemytablemargin.tablemytable, 1margin.tablemytable, 2margin.tablemytable, 3margin.tablemytable, c1,3ftableprop.tablemytable, c1, 2ftableaddmarginsprop.tablemytable, c1, 2, 3 gtableaddmarginsprop.tablemytable, c1, 2, 3 100独立检验1、卡方独立性检验:chisq.test例:libraryvcdmytable <- xtabs~Treatment+Improved, data=Arthritischisq.testmytablemytable <- xtabs~Improved+Sex, data=Arthritischisq.testmytable2、Fisher精确检验:fisher.test例:mytable <- xtabs~Treatment+Improved, data=Arthritis fisher.testmytable3、Cochran-Mantel—Haenszel检验:mantelhaen.test例:mytable <- xtabs~Treatment+Improved+Sex, data=Arthritis mantelhaen.testmytable相关性度量1、assocstats:例:libraryvcdmytable <- xtabs~Treatment+Improved, data=Arthritisassocstatsmytable2、cor:函数可以计算这三种相关系数,3、cov:函数可用来计算协方差例:states <- state.x77, 1:6covstatescorstatescorstates, method="spearman"x <- states, c"Population", "Income", "Illiteracy", "HS Grad"y <- states, c"Life Exp", "Murder"corx, y4、pcor:偏相关ggm包例:libraryggmpcorc1, 5, 2, 3, 6, covstates相关性的显著性检验1、cor.test其中的x和y为要检验相关性的变量, alternative则用来指定进行双侧检验或单侧检验取值为"two.side"、"less"或"greater" ,而method用以指定要计算的相关类型"pearson"、"kendall"或"spearman"当研究的假设为总体的相关系数小于0时,请使用alternative= "less";在研究的假设为总体的相关系数大于0时,应使用alternative="greater";在默认情况下,假设为alternative="two.side"总体相关系数不等于0;例:cor.teststates, 3, states, 52、corr.test:可以为Pearson、Spearman或Kendall相关计算相关矩阵和显著性水平;例:librarypsychcorr.teststates, use = "complete"3、pcor.test:psych包t 检验1、t.testy~x,data独立样本例:libraryMASSt.testProb ~ So, data=UScrime2、t.testy1,y2,paired=TRUE非独立例:libraryMASSsapplyUScrimec"U1", "U2", functionx cmean = meanx,sd = sdxwithUScrime, t.testU1, U2, paired = TRUE组间差异的非参数检验两组的比较:1、wilcox.testy~x,data :评估观测是否是从相同的概率分布中抽得例:withUScrime, byProb, So, medianwilcox.testProb ~ So, data=UScrime2、wilcox.testy1,y2,paried=TRUE:它适用于两组成对数据和无法保证正态性假设的情境;例:sapplyUScrimec"U1", "U2", medianwithUScrime, wilcox.testU1, U2, paired = TRUE多于两组的比较:1、kruskal.testy~A,data:各组独立例:states <- as.data.framecbindstate.region, state.x77kruskal.testIlliteracy ~ state.region, data=states2、friedman.testy~A|B,data:各组不独立非参数多组比较:1、npmc :npmc包例:class <- state.regionvar <- state.x77, c"Illiteracy"mydata <- as.data.framecbindclass, varrmclass,varlibrarynpmcsummarynpmcmydata, type = "BF"aggregatemydata, by = listmydata$class, median回归用一个或多个预测变量也称自变量或解释变量来预测响应变量也称因变量、效标变量或结果变量的方法;1、lm: 拟合回归模型lmy~x1+x2+x3,data简单线性回归1、lm: data是数据框例:fit <- lmweight ~ height, data = womensummaryfitwomen$weightfittedfitresidualsfitplotwomen$height, women$weight, main = "Women Age 30-39",xlab = "Height in inches", ylab = "Weight in pounds"多项式回归例:fit2 <- lmweight ~ height + Iheight^2, data = womensummaryfit2plotwomen$height, women$weight, main = "Women Age 30-39",xlab = "Height in inches", ylab = "Weight in lbs"lineswomen$height, fittedfit22、scatterplot:绘制二元关系图例:librarycarscatterplotweight ~ height, data = women, spread = FALSE,lty.smooth = 2, pch = 19, main = "Women Age 30-39", xlab = "Height inches",ylab = "Weight lbs."多元线性回归1、scatterplotMatrix:car包scatterplotMatrix函数默认在非对角线区域绘制变量间的散点图, 并添加平滑loess 和线性拟合曲线;对角线区域绘制每个变量的密度图和轴须图;例:fit <- lmMurder ~ Population + Illiteracy + Income +Frost, data = states有交互项的多元线性回归例:fit <- lmmpg ~ hp + wt + hp:wt, data = mtcarssummaryfit1、effect : effects包:展示交互项的结果term即模型要画的项, mod为通过lm拟合的模型, xlevels是一个列表,指定变量要设定的常量值, multiline=TRUE选项表示添加相应直线;例:libraryeffectsploteffect"hp:wt", fit,xlevels=listwt = c2.2, 3.2, 4.2,multiline = TRUE回归诊断1、confint:求模型参数的置信区间例:fit <- lmMurder ~ Population + Illiteracy + Income +Frost, data=statesconfintfit2、plot:生成评价模型拟合情况的图形例:fit <- lmweight ~ height, data = womenparmfrow = c2, 2plotfit3、lm :删除观测点例:newfit <- lmweight ~ height + Iheight^2, data = women-c13, 15,parmfrow = c2, 2plotnewfitparopargvlma包提供了对所有线性模型假设进行检验的方法检验正态性:4、Plot:car包:学生化残差studentized residual,也称学生化删除残差或折叠化残差例:librarycarfit <- lmMurder ~ Population + Illiteracy + Income + Frost, data = statesPlotfit, labels = sstates, id.method = "identify" ,simulate = TRUE, main ="Q-Q Plot"注:id.method = "identify"选项能够交互式绘图5、fitted:提取模型的拟合值例:fittedfit“Nevada”6、residuals:二项式回归模型的残差例:residualsfit“Nevada”7、residplot:生成学生化残差柱状图即直方图,并添加正态曲线、核密度曲线和轴须图;它不需要加载car包例:residplot <- functionfit, nbreaks=10 {z <- rstudentfithistz, breaks=nbreaks, freq=FALSE,xlab="Studentized Residual",main="Distribution of Errors"rugjitterz, col="brown"curvednormx, mean=meanz, sd=sdz,add=TRUE, col="blue", lwd=2linesdensityz$x, densityz$y,col="red", lwd=2, lty=2legend"topright",legend = c "Normal Curve", "Kernel Density Curve",lty=1:2, col=c"blue","red", cex=.7}residplotfit误差的独立性8、durbinWatsonTest :验证独立性例:durbinWatsonTestfit验证线性9、crPlots:car包成分残差图也称偏残差图例:crPlotsfit同方差性car包的两个函数10、ncvTest :生成一个计分检验,零假设为误差方差不变,备择假设为误差方差随着拟合值水平的变化而变化;若检验显著,则说明存在异方差性11、spreadLevelPlot:添加了最佳拟合曲线的散点图,展示标准化残差绝对值与拟合值的关系;例:librarycarncvTestfitspreadLevelPlotfit线性模型假设的综合验证1、gvlma :gvlma包:线性模型假设进行综合验证,同时还能做偏斜度、峰度和异方差性的评价例:librarygvlmagvmodel <- gvlmafitsummarygvmodel多重共线性1、vif :car包:函数提供VIF值, vif>2就表明存在多重共线性问题例:viffitsqrtviffit > 2异常观测值1、outlierTest :car包:求得最大标准化残差绝对值Bonferroni调整后的p值例:librarycaroutlierTestfit高杠杆值点1、hat.plot :观测点的帽子值大于帽子均值的2或3倍,即可以认定为高杠杆值点例:hat.plot <- functionfit{p <- lengthcoefficientsfitn <- lengthfittedfitplothatvaluesfit, main = "Index Plot of Hat Values"ablineh = c2, 3 p/n, col = "red", lty = 2identify1:n, hatvaluesfit, nameshatvaluesfit}hat.plotfit强影响点:Cook’s D值大于4/n-k -1,则表明它是强影响点,其中n 为样本量大小, k 是预测变量数目;例:cutoff <- 4/nrowstates - lengthfit$coefficients - 2plotfit, which = 4, cook.levels = cutoffablineh = cutoff, lty = 2, col = "red"1、influencePlot:car包:离群点、杠杆值和强影响点的信息整合到一幅图形中例:influencePlotfit, id.method = "identify", main = "Influence Plot",sub = "Circle size is proportial to Cook's Distance"纵坐标超过+2或小于2的州可被认为是离群点,水平轴超过0.2或0.3的州有高杠杆值通常为预测值的组合;圆圈大小与影响成比例,圆圈很大的点可能是对模型参数的估计造成的不成比例影响的强影响点变量变换1、powerTransform:car包:函数通过λ 的最大似然估计来正态化变量 x;例:librarycarsummarypowerTransformstates$Murder2、boxTidwell:car包:通过获得预测变量幂数的最大似然估计来改善线性关系例:librarycarboxTidwellMurder ~ Population + Illiteracy, data = states模型比较1、anova:基础包:比较两个嵌套模型的拟合优度例:fit1 <- lmMurder ~ Population + Illiteracy + Income +Frost, data = statesfit2 <- lmMurder ~ Population + Illiteracy, data = statesanovafit2, fit12、AIC:AIC值越小的模型可以不嵌套要优先选择,它说明模型用较少的参数获得了足够的拟合度;例:fit1 <- lmMurder ~ Population + Illiteracy + Income +Frost, data = statesfit2 <- lmMurder ~ Population + Illiteracy, data = statesAICfit1, fit2变量选择1、stepAIC:MASS包:逐步回归模型例:libraryMASSfit1 <- lmMurder ~ Population + Illiteracy + Income +Frost, data = statesstepAICfit, direction = "backward"2、regsubsets:leaps包:全子集回归例:libraryleapsleaps <- regsubsetsMurder ~ Population + Illiteracy +Income + Frost, data = states, nbest = 4plotleaps, scale = "adjr2"交叉验证1、crossval 函数:bootstrap 包:实现k 重交叉验证例:shrinkage <- functionfit, k = 10 {requirebootstrapdefine functionstheta.fit <- functionx, y {lsfitx, y}theta.predict <- functionfit, x {cbind1, x %% fit$coef}matrix of predictorsx <- fit$model, 2:ncolfit$modelvector of predicted valuesy <- fit$model, 1results <- crossvalx, y, theta.fit, theta.predict, ngroup = kr2 <- cory, fit$fitted.values^2r2cv <- cory, results$cv.fit^2cat"Original R-square =", r2, "\n"catk, "Fold Cross-Validated R-square =", r2cv, "\n"cat"Change =", r2 - r2cv, "\n"}2、shrinkage:交叉验证;R平方减少得越少,预测则越精确;例:fit <- lmMurder ~ Population + Income + Illiteracy +Frost, data = statesshrinkagefit相对重要性1、scale:将数据标准化为均值为0、标准差为1的数据集,这样用R回归即可获得标准化的回归系数;注意, scale函数返回的是一个矩阵,而lm函数要求一个数据框例:zstates <- as.data.framescalestateszfit <- lmMurder ~ Population + Income + Illiteracy +Frost, data = zstatescoefzfit2、relweights :相对权重例:relweights <- functionfit, ... {R <- corfit$modelnvar <- ncolRrxx <- R2:nvar, 2:nvarrxy <- R2:nvar, 1svd <- eigenrxxevec <- svd$vectorsev <- svd$valuesdelta <- diagsqrtevcorrelations between original predictors and new orthogonal variableslambda <- evec %% delta %% teveclambdasq <- lambda^2regression coefficients of Y on orthogonal variablesbeta <- solvelambda %% rxyrsquare <- colSumsbeta^2rawwgt <- lambdasq %% beta^2import <- rawwgt/rsquare 100lbls <- namesfit$model2:nvarrownamesimport <- lblscolnamesimport <- "Weights"plot resultsbarplottimport, names.arg = lbls, ylab = "% of R-Square",xlab = "Predictor Variables", main = "Relative Importance of Predictor Variables",sub = paste"R-Square = ", roundrsquare, digits = 3,...returnimport}using relweightsfit <- lmMurder ~ Population + Illiteracy + Income +Frost, data = statesrelweightsfit, col = "lightgrey"方差分析1、aov =lm单因素方差分析2、plotmeans:绘制带置信区间的图形例:librarymultcompattachcholesteroltabletrtaggregateresponse, by = listtrt, FUN = meanaggregateresponse, by = listtrt, FUN = sdfit <- aovresponse ~ trtsummaryfitlibrarygplotsplotmeansresponse ~ trt, xlab = "Treatment", ylab = "Response", main = "Mean Plot\nwith 95% CI"detachcholesterol多重比较1、TukeyHSD:对各组均值差异的成对检验例:TukeyHSDfitparlas = 2parmar = c5, 8, 4, 2plotTukeyHSDfitparopar2、glht:multcomp包:多重均值比较例:librarymultcompparmar = c5, 4, 6, 2tuk <- glhtfit, linfct = mcptrt = "Tukey"plotcldtuk, level = 0.05, col = "lightgrey"paropar评估检验的假设条件1、正态检验:librarycarPlotlmresponse ~ trt, data = cholesterol, simulate = TRUE,main = " Plot", labels = FALSE2、方差齐性检验:bartlett.testresponse ~ trt, data = cholesterol3、检测离群点:outlierTest car包librarycaroutlierTestfit单因素协方差分析例:datalitter, package = "multcomp"attachlittertabledoseaggregateweight, by = listdose, FUN = meanfit <- aovweight ~ gesttime + dosesummaryfit1、effects :effects包:计算调整的均值例:libraryeffectseffect"dose", fit2、ancova :HH包:绘制因变量、协变量和因子之间的关系图例:libraryHHancovaweight ~ gesttime + dose, data = litter3、interaction.plot:函数来展示双因素方差分析的交互效应例:interaction.plotdose, supp, len, type = "b", col = c"red", "blue", pch = c16, 18,main = "Interaction between Dose and Supplement Type"4、plotmeans:gplots包:展示交互效应例:librarygplotsplotmeanslen ~ interactionsupp, dose, sep = " ",connect = listc1, 3, 5, c2, 4, 6,col = c"red", "darkgreen",main = "Interaction Plot with 95% CIs",xlab = "Treatment and Dose Combination"5、interaction2wt:HH包:可视化结果例:libraryHHinteraction2wtlen ~ supp dose6、colMeans:计算每列的平均值7、nrow/ncol :计算数组额行数和列数8、mahalanobis:用协方差来计算两点之间距离的方法稳健多元方差分析Wilks.test :稳健单因素MANOV A。
R语言的内存(小总结)
ห้องสมุดไป่ตู้
第一个应该是异质性检验qe服从k1的卡方分布其中k是纳入研究的个数第二个是检验调节因素对效应量的影响因变量为效应量自变量为你所认为的调节因素如年龄性别什么的qm是原假设为回归方程中
R语 言 的 内 存 ( 小 总 结 )
memory.size()----->查看当前的内存的使用情况。 memory.limit()------->当前的工作空间的最大内存容量。 ls()-------->查看当前的内存中的对象。 rm(object)------------->在内存中删除某个对象。 rm(list = ls())-------------->将内存中的对象全部删除 gc()------------------>垃圾回收,释放内存,一般在rm()之后,使用gc().全称为garbage collection. Ctral+L----------------->控制台清空。
r语言mindr包总结
r语言mindr包总结随着大数据时代的到来,数据分析和处理成为科研与工作中不可或缺的一部分。
R语言作为一种开源的统计分析编程语言,深受广大数据爱好者的喜爱。
今天,我们将介绍一款在R语言中广泛应用的包——MINDR。
1.R语言简介R语言是由统计学家Ross Ihaka和Robert Gentleman于1995年创建的。
它具有丰富的函数库,强大的数据处理和可视化能力,成为数据科学领域的重要工具。
2.MINDR包概述MINDR(Molecular Interaction Network Data Analysis Package)是一款基于R语言的生物信息学包,主要用于分析蛋白质互作网络数据。
它提供了多种功能,包括蛋白质互作网络的构建、可视化、拓扑分析以及功能富集分析等。
3.MINDR包主要功能与特点(1)网络构建:MINDR支持多种输入文件格式,如Cytoscape的CYS 文件、GraphML文件等,方便用户导入数据。
(2)网络优化:MINDR提供了多种网络优化算法,如基于模块度的网络划分、网络剪枝等。
(3)拓扑分析:MINDR支持多种拓扑指标,如度中心性、接近中心性、介数中心性等,以评估节点在网络中的重要性。
(4)功能富集分析:MINDR可以对蛋白质互作网络中的功能模块进行功能富集分析,帮助用户挖掘生物意义。
4.MINDR包的应用领域MINDR广泛应用于生物信息学、Systems Biology等领域,特别是在研究蛋白质互作网络、基因调控网络等方面具有重要应用价值。
5.实战案例展示以下是一个简单的实战案例,展示如何使用MINDR分析蛋白质互作网络:```R# 加载MINDR包library(MINDR)# 读取蛋白质互作数据protein_interaction_data <- read.csv("interaction_data.csv")# 构建蛋白质互作网络protein_interaction_network <-build_network(protein_interaction_data)# 进行网络拓扑分析topological_analysis <-analyze_network(protein_interaction_network)# 输出拓扑指标print(topological_analysis)# 进行功能富集分析function_enrichment_analysis <-enrichment_analysis(protein_interaction_network)# 输出功能富集结果print(function_enrichment_analysis)```6.总结与展望MINDR包为R语言用户提供了强大的蛋白质互作网络分析功能。
r语言作业个人总结与心得
r语言作业个人总结与心得在学习R语言的过程中,我遇到了许多挑战和困惑,但同时也收获了很多知识和经验。
通过这次作业,我对R语言的应用和数据分析有了更深入的了解。
下面我将总结我在这次作业中遇到的问题、解决方法以及个人心得体会。
我遇到的第一个问题是如何读取和处理数据。
在这次作业中,我需要分析一份包含大量数据的CSV文件。
我通过使用R语言中的read.csv()函数成功读取了文件,并将其转换为数据框的形式。
接着,我遇到了数据清洗的问题,其中包括处理缺失值、异常值和重复值。
我学习并使用了R语言中的函数如is.na()、complete.cases()和duplicated()来处理这些问题。
我面临的另一个挑战是如何进行数据分析和统计。
在这次作业中,我需要计算数据的均值、中位数、标准差等统计指标,并绘制相关的图表。
我学习并使用了R语言中的函数如mean()、median()、sd()、hist()和plot()来完成这些任务。
同时,我也学习了如何使用R语言中的包(package)来扩展R的功能,比如使用ggplot2包绘制更美观和灵活的图表。
我还遇到了数据可视化的问题。
在这次作业中,我需要将数据以柱状图、散点图和折线图的形式展示出来,以便更直观地理解数据的分布和趋势。
通过学习和使用ggplot2包,我成功绘制了这些图表,并通过调整颜色、标题、坐标轴等参数使其更具可读性和美观性。
在解决问题的过程中,我意识到编程思维的重要性。
在处理数据和进行分析时,我需要清晰地定义问题,找到合适的方法和函数,并按照一定的逻辑顺序编写代码。
我学会了使用注释来解释代码的含义和目的,以及使用变量和函数命名来提高代码的可读性。
此外,我还学会了调试代码,通过输出变量的值和使用print()函数来查找错误和改进代码。
通过这次作业,我不仅学会了R语言的基本语法和常用函数,还学会了如何处理和分析数据,以及如何将结果可视化。
我深刻体会到了数据分析的重要性和应用价值,也更加清晰地认识到自己在学习和实践中的不足之处。
R语言 时间序列有关各种函数总结
一、基础篇1、安装程序包install.packages('程序包名字')例:install.packages('TSA') //安装TSA程序包注:直接输入install.packages() 可弹出程序包窗口,若未选择镜像,会先弹出镜像窗口,选择镜像后再弹出程序包窗口2、加载程序包library(程序包名字)例:library(TSA) 加载TSA程序包注:程序包名字前后不需要打引号3、加载程序包内数据data(数据名)例:data(larain) //加载larain数据注:加载之后才可以使用此数据,否则会提示数据不存在4、构建时间序列时间序列名字=ts(数据名,freq=单位时间内的数据个数,start=第一个数据对应的时间)例:a=ts(larain,freq=12,start=2000) //将larain转化成从2000年1月开始的月度数据注:freq=4表示季度数据,12表示月度数据;start可以等于一个数,表示年份,即数据是从该年第一月开始的,也可以等于c(年份,月份),表示从某年某月开始5、从TXT文档读取单变量数据数据名=scan('文件名字.txt')例:a=scan('file1.txt') //读取file1中的变量,并命名为a注:读取的文档需放到工作目录之下6、从TXT文档读取多变量数据数据名=read.table('文件名字.txt',header=T/F)attach(数据名字)例:a= read.table ('file2.txt', header=F) //将file2中数据命名为a,系统自带列标V1,V2……attach(a) //打开a,之后可以直接调用a中各变量V1 //输出a中第一列数据注:读取的文档需放到工作目录之下,header=T表示文档中第一行是各列数据的名字,第二行开始是数据,header=F表示系统会自动给各列数据命名,调用数据之前必须先打开它7、从CSV格式的表格文件中读取数据数据名=read.csv('文件名字.csv',header=T/F)attach(数据名)例:a=read.csv('file3.csv', header=T) //将file3中数据命名为a,第一行为各列数据的名字attach(a) //打开a,之后可以直接调用a中各变量X //输出a中第一列数据(假如表中第一列第一行为X)注:读取的文件需放到工作目录之下,header参数含义同上,调用数据之前也必须先打开8、导出数据write.table (需要导出的数据名,file ="生成的文件名.txt",sep="数据分隔符号",s =T/F,s =T/F, quote =T/F)例:write.table (larain, file ="file4.txt",s =F, s =F, quote =F)//将larain导出到file4文档中,没有分隔符,行标不导出,列标也不导出,数据不加引号注:生成的文件在工作目录下,sep参数在多列数据导出时,可以用到来间隔各列数据,如果是单列数据,可以省略。
R语言常用语法总结
R语言常用语法总结
一、基本信息
2.命令行:R语言使用命令行来实现算法、数据处理和绘图等任务,
是操作R语言最常用的方式。
3.包:R语言有很多种不同功能的包,可以方便的拓展R语言的功能。
4. 数据结构:R语言使用vector,matrix,list等数据结构存储数据,并供后续使用。
二、数据操作
1. 读取数据:R语言可以使用read.table,read.csv,read.arff
等命令把数据读取到R环境中。
2.预处理:R语言可以对数据进行缺失值检测、类别变量的编码和数
值变量的标准化等预处理操作。
3. 查看数据:R语言可以使用head,tail,str等函数查看数据结
构和数据条目,以及summary函数查看数据基本统计量等。
4.建立模型:R语言可以使用统计学中的算法,如逻辑回归,决策树,支持向量机等,来建立数据分析模型。
5.模型验证:R语言可以使用均方误差,AUC值等指标,对模型的效
果进行定量和定性验证。
6. 可视化:R语言可以使用ggplot2,plotly,wordcloud等绘图函数,对数据进行可视化分析。
三、编程
1. 条件判断:R语言可以使用if,elseif,else语句。
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Lec00## 八、关于Markdown语言的简洁说明1. 一个#表示一级标题,二个#表示二级标题,依次类推;2. 空一段表示断行,而不是简单的敲一个回车表示断行;3. *斜体* (一对星号)表示斜体,**加粗** (一对双星号)表示加粗;4. Markdown语言兼容Latex语言。
可处理数学公式Lec01## 1 数据的基本形式所有R处理的内容都叫对象(object)。
进行统计分析时,我们的对象自然就是数据(data)。
在R中,数据的基本格式分为以下5种:标量(scalar),向量(vectors),矩阵(matrices),数据框(data frames),因子(factors),及列表(lists)。
●所谓**向量**,就是一维的数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组a <- c(1, 2, 3, 4, -2, -5, 6) # 数值型,其中c表示concatenate(连结,串联),c()称为combine function, <-表示赋值a # 显示向量ab <- c("one", "two", "three") # 字符型,需要使用“”c <- c(TRUE, TRUE, TRUE, FALSE, TRUE, FALSE) # 逻辑型d <- c(1:5) # :表示产生一个系列,元素默认按列填充●矩阵是一个二维数组,但要求其中的每个元素具有相同的模式(同为数值型、字符型或逻辑型)注意:每个元素的数据格式必需相同.y <- matrix(1:20, nrow=4, ncol=5) #定义4行5列y[1,] ; y[,2] ; y[1,2] ; y[1,c(2,3)] ; y[c(2,3),2] # 显示矩阵y内的不同元素#### 定义名为matrix1的2×2矩阵,定义行列名,按行填充cells <- c(1,-2,3,-4) ; rnames <- c("R1", "R2") ; cnames <- c("C1", "C2")matrix1<- matrix(cells, nrow=2, ncol=2, byrow=TRUE,dimnames=list(rnames, cnames))●数组(Array):三维或高维数据。
数组与矩阵类似,但维度高于2维。
array()函数的格式为: _array(vector, dimensions, dimnames)_ ,其中* vector表示向量,* dimensions表示每个维度下的向量“长度”(元素个数),* dimnames表示维度名。
dim1 <- c("A1", "A2") ; dim2 <- c("B1", "B2", "B3") ; dim3 <- c("C1", "C2", "C3", "C4")z <- array(1:24, c(2, 3, 4), dimnames=list(dim1, dim2, dim3)) # c(2, 3, 4)中的数字,表示dim1, dim2, dim3的长度●数据框(dataframe):包含不同类型数据的数据。
数据框的数据形式,就是常见的excel,spss,stata中的数据表单形式,它可以用来同时储存多种不同模式的数据。
数据框函数:*data.frame() function* ,其格式如下:*mydata <- data.frame(col1, col2, col3,…)*其中,col1, col2, col3, …是任意类型的列向量名(需提前定义)。
patientID <- c(1, 2, 3, 4) # 数值型向量; age <- c(25, 34, 28, 52) # 数值型向量; diabetes <- c("Type1", "Type2", "Type1", "Type1") # 字符型; status <- c("Poor", "Improved", "Excellent", "Poor") # 字符型patientdata <- data.frame(patientID, age, diabetes, status,s=patientID) # 以上述向量,建立数据框上述命令中,s=patientID为指定“实例标识符”(case identifier)。
设定此选项后,使用s(patientdata)命令,就可以以patientID为标记输出各个体的编号(ID)。
#### 观测与变量patientdata[1:2] # 显示数据框中的第1至2列(第1至2个变量)patientdata[2,4] # 显示第2行第4列的数据patientdata[c("diabetes", "status")] # 显示数据框中的指定列(变量)patientdata$age # “$”符号表示使用数据框中的某一变量,结果以行方式呈现。
一般地,“A$x”表示“数据据A中的变量x”.#### 绑定数据框每次使用数据框时,都使用“$”的方式,显得太过麻烦。
为此,可事先绑定某一数据,此后即使省略这一符号的方式使用数据框中的变量,待分析完这一数据框后再解除绑定。
命令:attach, detachattach(mtcars) # 绑定数据mtcars,该数据为R自带数据str(patientdata) # str()函数用于给出数据数据对象的信息summary(mpg) # 提供mpg变量的五数概要(Five number summary) 即最小值(Min)、第1四位数(1st Quartile)、中位数(Median)、第3四分位数(3rd Quartile)和最大值(Max)。
plot(mpg, disp) # 绘制mpg, disp两个变量的二维散点图detach(mtcars) # 解除绑定attach命令的缺陷在于,如果同时使用了不同的数据框,或者变量的命名有重复,则会出现错误。
为避免这一不足,可使用with()命令进行数据框绑定。
with( mtcars, {summary(mpg, disp, wt)plot(mpg, disp)plot(mpg, wt)})只要保证输入的命令在with()函数内,则不论前面是否有定义重名的变量,均可以只针对with()内的数据框进行处理。
●因子(factor)在R中,定类数据(nominal data)和定序数据(ordinal data)称为因子。
R中使用factor()函数储存因子型数据。
diabetes <- c("Type1", "Type2", "Type1", "Type1") # 定义定类向量diabetesdiabetes <- factor(diabetes) # 将向量diabetes储存为因子型数据,默认按按字母序进行分类status <- c("Poor", "Improved", "Excellent", "Poor")status <- factor(status, ordered=TRUE) # 按字母序将定序向量status定义为因子型数据,默认按字母序进行从低至高的排序,并用1、2、3……等正整数形式储存。
status <- factor(status, order=TRUE,levels=c( "Poor", "Improved","Excellent")) # 使用levels()命令,指定向量的从低至高次序,并用1、2、3……等正整数形式储存。
或者:status <- factor(status, order=TRUE,levels=c( "Poor", "Improved","Excellent")) # 使用levels()命令,指定向量的从低至高次序,并用1、2、3……等正整数形式储存。
●列表(List):复杂的数据。
列表(List)是R中最复杂的数据结构,它是一系列数据对象的组合体,可将不同类型的数据对象置于同一数据名之下。
其函数为list(),格式如右:mylist <- list(object1, object2, …)g <- "My First List" ; h <- c(25, 26, 18, 39) ; j <- matrix(1:10, nrow=5) ; k <- c("one", "two", "three") mylist <- list(title=g, ages=h, j, k)mylist[[2]] # 显示列表中第2个数据对象mylist[["ages"]] # 显示指定名称的数据对象## 数据的导入⏹### 直接输入smalldata<-data.frame(age=numeric(0), gender=character(0),weight=numeric(0))# smalldata<-edit(smalldata) # 在编辑器中编辑数据其中,类似age=numeric(0)表示建立指定模式、但不包含实际数据的变量。
⏹### 从带分隔符的文本文件中导入数据使用read.table函数。
注意“带分隔符的文本文件”的含义csv。
grades<-read.table("students.csv",header=T,sep=",")其中,sep=""表示分隔符的类型。