烤烟品种南江3号均一化全长cDNA文库构建
拟南芥全长cDNA研究进展

拟南芥全长cDNA研究进展【摘要】全长cdnas是基因组序列注释和基因及其产物功能分析的基础。
目前共分离了155,144个riken拟南芥全长(raf)cdna 克隆。
将得到的155,144个rafl cdnas进行了3’端表达序列标签聚类成14,668个非冗余cdna类,其中60%预测到基因。
同时已从14,034个非冗余cdna类中获得了5’ests,并构建成启动子文库。
rafl cdnas序列数据库的建立有助于启动子分析、预测出转录本单元的正确注释和基因产物的注释。
而且,全长cdnas还为表达谱分析、功能分析和植物蛋白结构分析提供了宝贵的资源。
【关键词】拟南芥;cdna拟南芥因其具有个体小,世代周期短和转化率高等特点,因此在植物研究中被广泛的作为一种模式生物。
为了将拟南芥的小基因组测序,日本、欧洲和美国的科学家共同合作完成了拟南芥基因组测序工程。
拟南芥5条染色体中的2条(2号和4号染色体,不包括核仁组织区和着丝点区)在1991年进行了测序,其余3条染色体在2000年进行了测序。
2001年5月,大约127,000个拟南芥表达序列标签(ests)被提交到est数据库(dbest)。
其中的序列来自法国,美国和日本共同合作的大范围est工程。
这些工程已从不同的组织、器官、种子和发育阶段的拟南芥中获得est数据。
然而,这些基于cdna文库的est工程中的大部分的插入片段都不是全长的。
ests有助于为表达基因提供标签,大圣无法进行基因功能的进一步研究。
因此,全基因组范围的获得表达基因的全长cdna,对于在功能基因组学领域中分析基因及其产物的表达标签和功能是十分重要的。
1.拟南芥全长cdna文库的构建目前已应用biotinylated cap trapper法建立了拟南芥的全长cdna文库。
最近,研究人员有将trehalose-ther-moactivated 反转录酶应用到cap trapper法中,构建了不同处理的拟南芥全长cdna文库。
利用SMART技术构建烟草茎全长cDNA文库

约为 12 c 随机挑取部分克隆进行 测序 , .l. b 并进行生 物信 息学分析 ,75 的序列 烟草 已有 报道 , .% 为烟草 未报道 的基 3 .% 6 5 2 因 ,58 4 .%是未知功 能的基 因 , 明所构建文 库达到了用于 目的基 因分离筛选 和新基 因克隆的建库要求 . 表
8 = 0c保存备用. 【
11 主要试剂 胶 回收试剂盒 和质粒提取试剂盒购 于博 日科技有 限公 司. r e Sr t .. 2 P m r c p 逆转录酶 , i i R ae ni t , fI,x N s I b o S E ,N P D 2 0 和 D 10 0 h ir i d T 、 L0 0 L50 分子标准等购 自大连宝生物公司( A A A , T K R ) 连
关键词 :烟草 ; ;S: A 文章编 号 :6 15 7 (0 2 0 -0 30 17 - 0 2 1 ) 10 5 -5 4
Co sr cin o b c o se I 1 e gh d) i r r t n tu t ft a c tm f l 1n t NA l a y wi S o o I. b h
k o n fn t ng n s h er ut s o a tecn t c dl r ys o db u l e r h q i m n f o iga dsre n n w c o e e.T s s h w t t h s u t b a u eq a f f e u r e t r ln e n g u i  ̄l h o r e i r hl id o t r e i e c n n c T技术 [ 的一种 以采收叶片为主的重要经济作物[ , 7 因此叶片是 主要的研究对象. ] 目前 , 对烟草茎提取物 质已有研究. 如王家隆 研究发现 , 烟草茎秆 含有极 为丰富的糖分、 白质 、 肪、 蛋 脂 无氮浸 出物等 营养物 质, 可以作为饲料 ; 岑小惜等 研究发现 , 烟草茎秆经浸渍法粗提取后含有石油醚、 乙醇、 苯、 丙酮 等成分 ,
烤烟新品种南江3号的特征特性研究

烟 叶烘烤特性等性状 上与原品种红花大金元 有明显差异 , 单株 有效叶数较 多, 叶片较 大 , 色浓绿 , 长势较 强 , 叶 生 叶片 分层 落 黄, 易烘烤; 经贵 州省烟 草科 学研 究所抗 性鉴 定和 多年 田间 自
较远 ( .5 ) 同南 江 3号农 艺 性 状 鉴定 相 符 , 传性 068 , 遗
浓 。与 对 照 K36相 比, 2 新
品种 ( ) 江 3号 的外 观 系 南
品质略优 于对 照 K3 6 。 2
熟度 多数 烟 叶为成熟 , 量 叶片 尚熟 ; 少 中部 烟叶 叶片结
收稿 日期 :0 0—1 —l 21 l 6
作者简介 : 肖丽娜 (9 4一) 女 , 17 , 贵州遵 义人 ; 农艺师 , 主要从事 品种研 究及病虫害防治工作。
构多 为疏松 , 别 叶片 尚疏松 , 部 烟 叶疏松 . 个 上 尚疏 松 ;
Su yo h rcei iso lec rdNe ait N nin o 3 td nC aatr t fFu —ue w V r y aj gN . sc e a
XI AO . a ,TAN in ,LI Li1 l Ja AO n Yo g ,ZHU .a ,YANG o we Zu f Gu - n
表 3 贵 州省 生产 试 验 主 要 农 艺 性 状 (07— 0 8年 ) 2 0 20
高、 叶数 与原 品种有 明显 差 异 , 表 1所示 : 红 花 大 如 与 金元 相 比 , 南江 3号 大 田生 育 期 短 3 0d 打 顶 株 高 高 . 、
1 . m, 效 叶 数 多 3 0片 , 围 大 0 4c 节 距 长 5 7c 有 . 茎 . m 0 7c 最 大叶 面积 大 2 4 3c . m, 7 . m 。主要 农 艺 性状 与红
铁皮石斛均一化全长cDNA文库的构建与序列分析

铁皮石斛均一化全长cDNA文库的构建与序列分析目的:为了获得药用植物铁皮石斛功能基因的信息和筛选功能基因。
方法:以SMART(switching mechanism at 5′ end of RNA transcript)方式合成全长cDNA,结合DSN(duplex-specific nuclease)均一化技术,构建铁皮石斛茎组织的均一化全长cDNA 文库。
结果:该文库重组率为93.9%,文库滴度1.3×106 cfu·mL-1,插入片段平均大小1.5 kb 左右。
随机挑取163个阳性克隆进行单侧测序,通过生物信息学分析,获得150个单一序列,其中147个序列与相应的同源蛋白匹配,GO(gene ontology)分类表明这些序列参与各种生化途径。
8个序列包含了完整编码框,可判断为全长基因。
结论:成功构建了铁皮石斛茎组织均一化全长cDNA 文库,为满足铁皮石斛代谢途径等功能基因筛选和基因信息研究奠定了基础。
标签:铁皮石斛;均一化;cDNA 文库;序列分析铁皮石斛Dendrobium officinale Kimura et Migo是兰科Orchidaceae石斛属多年生草本植物,具有独特的药用价值,为我国名贵中药材。
铁皮石斛以其茎入药,其主要药用成分是石斛多糖、石斛碱、石斛次碱及多种氨基酸及微量元素,有生津益胃、清热养阴及增强人体免疫活性等功效,主要分布于我国云南、广西、浙江、安徽、福建、四川等省区[1]。
铁皮石斛种子小无胚乳,自身繁殖力低,在自然条件下需与某些真菌共生才能萌发,加上人为的过度采挖,其自然资源濒临枯竭[2]。
近些年铁皮石斛的组织培养与栽培管理技术的突破性发展[3],使得人工栽培铁皮石斛逐渐成为一个新兴产业。
由于对天然药物需求的不断增加,解决药物资源匮乏问题一直存在,从20世纪90 年代开始,药用植物功能基因的克隆呈现发展势头[4]。
通过确定药用植物的功能基因,发展药用植物的基因工程,获取药用植物的药用成分,这些都依赖药用植物的功能基因研究开发。
烤烟品种的抗病性鉴定

HY 9 7 中烟 2 1 云 烟 2 2 C 2 8 C 33 云烟 8 -- 0 0 4 8 4 l1 7 5 9
0
5 4
0
5 5
0
5 6
O
5 6
0
5 5
O
5 3
0 5 6O Nhomakorabea5 69
6 0
次, 按调查株数 、 发病株 数 、 病级进行记载 , 计算 病指 , 以病情稳定期 的 病指作为抗性鉴定依 据。 1. . 4抗性鉴定分析 2 对各处理品种在发病 稳定期 的病指进 行抗 性鉴定分 析,按病指高 低 确定 抗性 强弱 , : 即 0~2 : 5 高抗 ,5—5 : 2 O 中感 ,O~7 : 5 5 中感 ,5— 7
1材 料 与 方 法 .
查株数 、 发病株数 、 级进行记载 , 病 计算病指 。 1 3青 枯病 、 . 2 黑胫病的抗性鉴定 利用常年发病 的烟 田的 自然病源观测 比较各烟草 品种分别对青 枯 病、 黑胫病 的抗性强弱 , 鉴定各品种对青枯病和黑胫病的抗性I 于 5月 2 ] 。 1 6月 7日对各处理小区 内的烟草进行定点发病情况调查 , 81 3、 按调查 株数 、 发病株数 、 病级进行记载。 在发病 中后期进行定点发病情况调查 ,
调 查 日期 品种 序 号 品种 名 调 查 株 数
1
5月 1 日 8 1 2 3 4 5 6 湘 一 5 7
O
7
8
9
】 O
1 】
1 2
云烟 9 K 2 南江 3 7 36 号 粤 烟 9 K K 6 7 R 2 5 6
于 5月 1 8日 、 6月 7 日、 6月 2 日对 各 处 理 小 区 内 的烟 草 病 情 各 查 一 5
一套适合烤烟3种RNA病毒的RT-PCR检测方法

2021年第2期GUANGXI PLANT PROTECTION2021,Vol.34.No.2一套适合烤烟3种RNA病毒的RT-PCR检测方法祖庆学1,李宏江2,聂忠扬1,于晓飞2,张翼飞1,李昊熙2*(1.贵州省贵阳市烟草公司开阳县分公司贵阳市550300;2.贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室贵阳市550025)摘要:烤烟是贵州省的重要经济作物,但是烟草花叶病毒(TMV)、黄瓜花叶病毒(CMV)和马铃薯Y病毒(PVY)3种RNA病毒在贵州烤烟产区造成巨大损失。
3种病毒引起的症状相似性造成了田间诊断的困难。
针对贵州烟区的样品,开发了一套包含了靶向3种病毒外壳蛋白基因特异性片段的RT-PCR检测方法。
3对引物涵盖的基因片段长度分别为:TMV-120bp,CMV-240bp,PVY-660bp,退火温度均为55˚C。
通过1次PCR反应,就可以根据扩增条带的大小判断病毒的种类,还可以检测复合侵染的样品中2种病毒与3种病毒混合DNA的种类。
该方法非常适合基层检测站点快速和高效地检测大批量烟叶样品,指导后续防控工作的开展。
关键词:烤烟;烟草花叶病毒;黄瓜花叶病毒;马铃薯Y病毒;检测中图分类号:S432.4+1文章标识码:B文章编号:1003-8779(2021)02-0027-05烤烟是贵州省的一种重要经济作物,但是烤烟生产受到多种病虫害的威胁。
烟草花叶病毒(To⁃bacco mosaic virus,TMV)、黄瓜花叶病毒(Cucum⁃ber mosaic virus,CMV)和马铃薯Y病毒(P otato vi⁃rus Y,PVY)3种正义单链核糖核酸(+ssRNA)病毒长期困扰了贵州各个主要烟区[1-4]。
病毒病不仅降低了烤烟产量,还影响了产品的质量和分级,造成了巨大的经济损失[5]。
由于植物病毒的治疗手段非常有限,抗病毒品种的选育和早期染病植株的清除是控制病毒病的主要手段[6]。
3种病毒中,CMV和PVY主要经过蚜虫等介体昆虫进行非持续性传播,而TMV则主要依靠机械摩擦传播,因此,针对性开展的阻断传播的防控手段就不尽相同。
烤烟良种良法配套技术简介(二)

交选 育而 成 的烤
烟 新 品 种 , 于
20 11 年 22 月 通过 全 国烟草 品种 审 定委员会审定 " 1. 特征特性 " 株式塔 形 , 叶片长 椭 圆形 !叶色绿 !茎 叶角 度 中等 !主脉稍 粗 ; 田间长势 强 , 整齐 度较好 , 移栽 至 现蕾需 6 0 天左右 , 分层落 黄特征 明显 " 大 田生育期 1加 一 3 0 天 , 可 采收 烟 叶 1 18一 20 片 , 着生叶比K326 少2 一 3 片 "最 大 腰叶 长 69 ~7 5 厘米 ! 宽 28 ~35 厘米 , 比 K326 稍长 ! 稍宽 " 烤后 烟叶多为金 黄 色 , 成 熟度好 !油分 多 , 总体 外观 质 量 优于 K 3 2 6 " 云烟 9 适应性较广 , 综合经 济性状优于 K32 6 和 目前主栽 品种 " 2 杭病性 "中抗黑胫病和赤星病 , 感 烟草花叶病毒病 ( TMV )和根结线虫病 , 对主要病害的综合抗性与K3 2 6 相似 " 3. 栽培技 术要 点 "需 氮 量 与 K 咒6 相近 , 氮磷 钾 比例以 l : l ( . = 2 5一 ) 为宜 " 3 注意在烟草普通花 叶病 高发 区慎 重选
烤 烟 良 种 良法 配 套 技 术 简 介
云 烟, S 云 烟 98 系 选 用 Spe ight ( 美 国
(二)
云 烟9 云 烟 99 是 云
种子公 司 )G7 0 为
母 本 , CV89 为 父
南 省烟 草农业 科 学研 究 院 ! 中 国 烟 草育 种研 究 ( 南 方 ) 中心 采用
云 烟 85 与 9 147 杂
本 , 经系 谱 选择 育 成 ,2004 年 7 月 通 过 云南 省烟 草 品种审 评 委 员会 审定 " 1. 特征 特性 " 株型塔型 , 茎围9 . 6厘米 , 平均封顶株高 9 3 厘米 ; 叶片长椭 圆形 , 有效叶 2 0 1 片, 节距 4.1 厘米 , 腰 叶长 6 2 . 6 厘米,宽2 . 9 厘米 , 叶片厚薄均匀 , 分层 落黄好 " 大 田生育期 12 8 天 , 生长整齐 !势强 " 原烟 外观品质较 好 , 烟 叶香气质较好 , 香气 量较足 " . 杭病性 "抗黑胫病 , 低抗赤星病 , 2 中抗根结线虫病 , 感烟草花叶病毒 " 3. 栽培技 术要 点 "云 烟 9 8 综合 性 状优 良 , 具广泛的适应性 , 适 宜在云 南 ! 贵州 !四川等地推 广种 植 " 适宜 中 等肥力地块 , 一般亩施纯 氮7一 8千克 , 氮磷钾 比例 为 1: . 5一 0 l: . 5一 2 3 " 留叶数 18一 1 片 " 叶片较耐成熟 , 中部 叶成熟 2 采收 , 上部叶 充分成熟采 收 , 上部 4 一 6 片叶充分成熟后 , 可一次性采收烘烤 " 4 . 烘烤技 术要 .氛 "可 采用 三段 式 烘烤工艺 , 一次性采收烘 烤 " 其下部叶 片大小 适 中 , 叶片较薄 , 含水 量较 高 , 在烘烤过程 中变黄快 !定色慢 ; 中部叶 片厚薄适 中 , 烘烤特性 好 ; 上部叶 片较 厚 , 含水量较少 , 烘烤时容易干燥 " 烘烤方法参考云烟9 7 "
烤烟新品种南江3号需水特征分析

农艺学现代农业科技2014年第12期摘要分析南江3号需水特性,结果表明:烤烟田间烟株间蒸发量为前期大于后期,蒸腾差异主要表现在对照烟田伸根期蒸腾值大,团棵以后直到采收完毕蒸腾值均小于控水处理。
经测定,伸根期的蒸腾小于蒸发速率,a<0.5,团棵以后a 值在0.75左右,成熟后期a 值在0.5左右。
烤烟在适宜水分状态下的需水量为502.53mm ,伸根期需水量为87.85mm 、旺长期需水量为232.14mm 、成熟前期需水量为123.99mm 、成熟后期需水量为58.55mm 。
整个烤烟生育期内,伸根期和成熟后期需水与降雨较为吻合,中间2个时期吻合程度较差,尤其以旺长期突出。
关键词烤烟品种;南江3号;需水特征中图分类号S572文献标识码A 文章编号1007-5739(2014)12-0022-03Analysis of Water Requirement Characteristic of New Flue-cured Tobacco Variety Nanjiang 3DIAO Chao-qiang 1QIAN Xiao-gang 2HUANG Ning 1ZHOU Jian-yun 1(1Guiyang Branch of Tobacco Company in Guizhou Province ,Guiyang Guizhou 550001;2Guizhou University )Abstract The water requirement characteristic of Nanjiang 3was studied ,the results showed that field evaporation of flue-cured tobacco in early period was more than that in late period.The transpiration difference main showed the evapotraspiration of CK :in root enlongate stage was more ,its evapotraspiration after rosette stage was less than the treatment of water controlling.According to the determination ,evapotraspiration of root enlongate stage was less than evaporation rates ,a<0.5,a value was about 0.75after rosette ,a value was about 0.5in the mature stage.The water requirement of flue -cured tobacco in appropriate water moisture condition was 502.53mm ,the water requirement in root extending stage ,fast growing period ,prematuration period and late maturation period was 87.85mm ,232.14mm ,123.99mm ,58.55mm ,respectively.During the whole growing period of flue-cured tobacco ,in root extending stage and mature stage ,water requirement and rainfall was consistent ,the middle two periods coincide with the extent of poor ,especially in the prosperous long-term outstanding.Key words flue-cured tobacco varieties ;Nanjiang 3;water requirement characteristic烤烟新品种南江3号需水特征分析刁朝强1钱晓刚2黄宁1周建云1(1贵州省烟草公司贵阳市公司,贵州贵阳550001;2贵州大学)烤烟生长季内的降雨总量比较充足,从量上来说基本可以满足烤烟生长发育所需的水分,但是存在与烤烟各个时期需水不吻合的时空分布不均制约烤烟生产的问题[1-2]。
DNA和CDNA文库构建

(4)阳性重组菌落或噬菌斑的选择。基因组DNA基因cDNA
基因组与cDNA最大的区别在于cDNA具 有时空特异型
一般覆盖倍数达到是基因组的 某一区段,如基因组某一特定大小酶切片段的组合, 一条染色体或更小的区段(如一个YAC或BAC克隆 等)。
例如:将基因组 DNA用多种限制性 内切酶切割, Southern杂交
显示目标基因在片段)第二链cDNA的合成
氢氧化钠消化杂合双链中的 mRNA 链 第一链 cDNA 的 3'-末端就会形成一个发夹环 合成第二链cDNA S1 核酸酶消化连接处
自身引导法合成cDNA第二链
常用方法PCR合成法是构建cDNA的一种新策略, 已得到广泛应用。优点:
如果电泳观察到的28SrRNA条带的亮度约为18SrRNA条 带亮度的两倍,说明RNA样品完整,降解不多,如果两条带 的亮度反过来,说明部分28SrRNA已降解;如无清晰条带, 表明样品己严重降解。
mRNA的富集对低丰度mRNA显得特别重要。
2)第一链 cDNA 合成 由mRNA到cDNA的过程称反转录,由反转录酶催化。 反转录酶:依赖RNA的 DNA聚合酶,需要引物 反转录引物:oligo(dT)引物和随机引物(不能产取和 mRNA 分离; 第二,第一链 cDNA 合成; 第三,第二链 cDNA 合成; 第四,双链 cDNA 克隆进质粒或噬菌体载体
并导入宿主中繁殖。
插
1)mRNA的完整性及mRNA的富集
通常是根据28sRNA和18sRNA条带的亮度判断RNA的 完整性,间接判断mRNA的完整性。
则可将Spel酶切的 基因组DNA中或这一时期的特殊组织。
根 叶 花 花药 茎 穗下节cDNA 第一链的合成、c的基因组DNA或cDarbon公式:
烤烟品种南江3号烟叶油分成分的初步研究

烤烟品种南江3号烟叶油分成分的初步研究冷璐;陆引罡【摘要】通过对南江3号新鲜烟叶表面化学成分和烤后烟叶石油醚提取物的研究表明,新鲜烟叶表面化学成分可能含有吡啶、4,8,13-西柏三烯-1,3-二醇、环己烷、西柏三烯二醇、萘烷、丁香烯、二十七烷、二十烷,主要为氮杂环类、烷烃类和西柏烷类.其中确定含有的成分为吡啶、二十七烷和二十烷.烤后烟叶石油醚提取物中鉴定出或含豆蔻酸、蒎烷、4,8,13-西柏三烯-1,3-二醇、5-十二炔、菜油甾醇、植物甾醇、1,4-二(三甲基硅烷基)苯、1-甲基-2-苯基吲哚、维生素E等化合物,其中确定含有豆蔻酸、甾醇、维生素E等.【期刊名称】《浙江农业科学》【年(卷),期】2014(000)012【总页数】4页(P1899-1901,1910)【关键词】烤烟;南江3号;油分;石油醚提取物【作者】冷璐;陆引罡【作者单位】贵州大学农学院,贵州贵阳550025;贵州大学农学院,贵州贵阳550025【正文语种】中文【中图分类】S572烟叶油分含量是衡量烟叶外观质量和内在品质的重要指标,而烟叶油分的成分至今尚未完全明确。
苏德成等[1]指出,烟叶油分通常指烟叶组织细胞内含有的一种柔软半液体或液体物质,使烟叶外观上有油润和丰满的感觉。
油分好的烟叶则香气质好,香气量足。
已有文献对于烤烟油分的研究并未明确提出其成分及产生的机制,本文通过气质联用仪(GC-MS)初步分析新鲜烟叶表面油分和烤后烟叶油分(石油醚提取物)的成分,对烤烟油分进行辅助分析。
1.1 试验材料试验在贵州省烟草公司贵阳市分公司开阳县龙岗试验基地进行,地理坐标107°06′899″E,26°52′360″N,海拔1 125 m。
试验用烤烟品种为南江3号,由贵州省烟草公司贵阳市分公司自主培育,并于2008年通过贵州省品种审定委员会审定。
供试肥料包括烟草专用基肥(N 10%,P2O510%,K2O 26%)和专用追肥(N 13%,K2O 26%)。
烟草减害降焦的途径研究

烟草减害降焦的途径研究摘要:烟草减害降焦与人类的健康和环境保护息息相关,已成为烟草行业和医学界关注的焦点。
目前,我们可以通过农业和工业两个方面来实现减害降焦。
现就这两个方面的具体有效措施进行综述,并对其未来发展趋势进行展望。
关键词:烟草减害降焦途径研究在构成烟气总量中,粒相物质占8%,除去水分和烟碱这些粒相物质,就是我们通常所说的焦油。
它是卷烟烟丝中的有机物质在缺氧条件下不完全燃烧产生的,由多种烃类及烃的氧化物、硫化物和氮化物等组成的复杂化合物。
在吸烟过程中,除了纸烟的外层部分外,基本上都是供氧不足条件下燃烧的,不仅产生大量的一氧化碳,而且随着焦化温度的升高,生成多环芳烃的种类增多,如苯、荼、芘、酚等致癌物,多在700—900℃生成,而苯酚类和富马酸等促癌物,则在500—700℃低温度条件下生成。
但焦油又与卷烟的香气有一定关系,彻底除去既无必要又不可能,因此,降焦要把握“高香气、低焦油、低危害”原则[1]。
1、农业方面1.1选育推广低焦油烟草品种培育焦油和其他有害物质生成量较少的优质、高抗烟草新品种一直是烟草农业技术研究的重要目标之一。
目前国际上通过各种育种途径培育出一些焦油产出量低的烟草品种,如美国维克特烟草公司(VectorTobacco)培育出低亚硝胺和低烟碱的烟草新品种,并已开始大田生产。
这种烟草烟碱和亚硝胺含量很低,用其生产的卷烟含烟碱约0.25mg/支,其烟气烟碱量小于0.03mg/支[2,3]。
另外,Sato先生从烤烟品种Hicks与低生物碱的雪茄烟品种NFT706杂交后代中选育出3个低焦油品系。
根据烟叶中有机钾含量与焦油含量呈负相关的研究结果,中国农业科学院烟草研究所已找出富钾的育种材料,并着手进行烟草钾积累效率的遗传规律研究,为富钾烟草品种的培育作准备。
培育富钾烟草的目的是发挥烟草品种吸钾能力强的遗传特性,充分利用土壤肥料中的钾素,从而生产出钾含量高的烟叶,降低烟叶焦油生成量。
烟草基因组计划进展篇:1.烟草全长cDNA文库的构建及分析

计3 1 7 1 7 5 条普通烟草 E S T拼接成至少包含 4 个读长的重叠群 1 5 4 2 9 个 ,鉴定出 5 3 4 7 7 个冗余度大于 2 的候选 S N P ,烟草中出现 S N P的频率为 O . 3 4 %。其 中 S N P的转换率大于颠换率 ,插入/ 删除表现出 A / T偏
中国烟草科学
C h i n e s e T o b a c c o S c i e n c e
烟 草基 因组 计 划 进 展 篇 :
1 . 烟草全长 c D N A 的构建及分 析 龚达平
( 中国农业科学 院烟草研究所 ,青 岛 2 6 6 1 能提供完整 的基 因编码区信息,揭示基因的表达水平, 特别 是 基 因组测 序完成 后对 辅助基 因注释 和开展 功能基 因研究具 有重要 作用 。普 通烟草 ( N i c o t i a n a
( s i n g l e t s ) 4 2 9 3 条, 共得到 5 7 0 1 个非冗余基因, 其 中全长基 因数量为 1 6 1 1 条。 对绒毛状烟草共测序 1 1 2 9 3 个克隆 , 获得长度大于 1 0 0 b p的高质量序列 1 0 4 5 0 条, 平均序列长度为 6 4 1 b p ; 通过组装得到重叠群 1 2 0 2 条 ,单一序列 3 6 0 6 条 ,共得到 4 8 0 8 个非冗余基 因,其 中全长基因数量为 1 6 3 9 条。
烟草材料 因信息和筛选重要功能基因, 同时还开展 了绒毛状烟草、 林烟草、 耳状烟草
( Ⅳo t o p h o r a ) 和栽培烟草的根 、茎 、叶、花等主要组织共 1 6 个样品的转录组测序及分析。
烤烟新品种南江3号的特征特性研究

烤烟新品种南江3号的特征特性研究肖丽娜;谭建;廖勇;朱祖发;杨国文【摘要】贵州省是种烟历史长、种烟面积广、品种更迭较快的烤烟大省,独特的海拔立体气候为外引品种变异提供了良好条件.南江3号就是贵州省贵阳市开阳县在红花大金元品种中发现的自然变异株,该品种农艺性状叶片形态特性与红花大金元相似,遗传性状稳定,田间生长整齐一致.在株高、叶片数、叶色、烟叶烘烤特性等性状上与原品种红花大金元有明显差异,单株有效叶数较多,叶片较大,叶色浓绿,生长势较强.叶片分层落黄,易烘烤;经贵州省烟草科学研究所抗性鉴定和多年田间自然发病调查结果表明,该品种中抗黑胫病和青枯病,感烟草花叶病,气候斑点病轻,杭叶斑类病害的能力优于对照;主要经济性状产童、产值和上等烟率显著高于对照;初烤烟叶外观质童总体略好于对照,主要化学成分含量适宜;比例较协调;感官品质与对照K 326相当.【期刊名称】《种子》【年(卷),期】2011(030)002【总页数】4页(P89-91,93)【关键词】南江3号;农艺性状;抗病性;经济性状;外观质量;化学成分;感官品质【作者】肖丽娜;谭建;廖勇;朱祖发;杨国文【作者单位】贵州省烟草公司贵阳市公司,贵阳,550001;贵州省烟草公司贵阳市公司,贵阳,550001;贵州省烟草公司贵阳市公司,贵阳,550001;贵州省开阳县烟草分公司,贵州,开阳,550300;贵州省开阳县烟草分公司,贵州,开阳,550300【正文语种】中文【中图分类】S5721.1 农艺性状鉴定南江3号叶片形态特征与红花大金元相似。
在株高、叶数与原品种有明显差异,如表1所示:与红花大金元相比,南江3号大田生育期短3.0 d、打顶株高高15.7 cm,有效叶数多 3.0 片,茎围大 0.4 cm 节距长0.7 cm,最大叶面积大274.3 cm2。
主要农艺性状与红花大金元有明显差异。
1.2 DNA 鉴定贵州省烟草科学研究所通过RAPD(随机扩增多态型DNA)分子标记技术从DNA水平上鉴定对应亲本的亲缘关系,如表2所示,得出南江3号与红花大金元亲缘关系较近(0.816),与NC 82的亲缘关系相对较远(0.658),同南江3号农艺性状鉴定相符,遗传性状稳定。
烤烟新品种南江3号在豫西丘陵山区栽培试验初报

烤烟新品种南江3号在豫西丘陵山区栽培试验初报摘要对南江3号、中烟103、改良K326、韭菜坪2号、云烟87(CK)5个品种(系)进行小区对比试验,结果表明:南江3号的外观质量、农艺性状和经济性状均优于云烟87,在适应性、抗病性及烘烤特性等方面综合表现良好,在豫西烟区具有较好的推广前景。
关键词烤烟;新品种;南江3号;豫西丘陵山区品种是影响烤烟产量和质量的重要因素之一[1]。
烤烟新品种南江3号是从红花大金元品种中获得的自然变异株,经贵阳市烟草公司系统选择培育而成。
通过研究引进新品种南江3号在三门峡烟区的适应性及配套栽培技术措施,筛选出适合烟区生态条件的烤烟优良品种,从而为烟区烤烟品种布局优化提供依据。
1材料与方法1.1试验地概况试验地设在三门峡市卢氏县宋家村,坡平地形,黄壤土质,中等肥力,前茬作物为烟草。
1.2供试品种试验品种为南江3号、中烟103、改良K326、韭菜坪2号、云烟87。
1.3试验设计试验设5个处理,即每个品种为1个处理,3次重复,以云烟87为对照(CK)。
小区面积100 m2,试验地0.2 hm2,植株行距1.2 m,株距0.5 m,施肥(N∶P∶K=1∶1.5∶3)用氮量为60 kg/hm2,其他田间管理措施按常规进行[2-4]。
1.4调查内容及方法采取定株观测的方法调查各品种的农艺性状、植物学性状等[5-6]。
取烤后烟叶样品B2F(上桔二)、C3F(中桔三)、X2F(下桔二)各1.5 kg,烘干,粉碎过筛,检验烟叶化学成分。
产质结果按照计产数据分析。
2结果与分析2.1气候状况对烤烟的影响3月上旬至5月上旬烟叶育苗期光照充足,日照时数累计达269.9 h,高出常年日照时数57.3个百分点,有利于培育壮苗。
5月上旬至下旬烟苗移栽期降水充分,降水量164.3 mm,较常年多159.6个百分点,有利于烟苗的移栽、成活。
6月中旬至7月上旬烟苗旺长期降水只有56.7 mm,较常年低25.3个百分点,不利于烟苗的旺长。
小麦创新种质烟1933、烟1934的应用

本 复 合 杂 交 创 制 而 成 的 优 质 高 产 尧抗 倒 耐 肥 抗 病 尧粒 南 审 渊认 冤定 7 次 袁河 北 审 渊认 冤定 4 次 袁山 西 尧北 京 审
多 穗 大 尧综 合 性 状 突 出 的 两 个 小 麦 新 种 质 袁两 姊 妹 系 渊认 冤定 各 3 次 袁新 疆 尧青 海 审 定 各 1 次 袁共 计 国 审
17 个 袁安 徽 16 个 单 位 育 成 16 个 袁江 苏 5 个 单 位 育 成 89.3 万 hm2尧135.6 万 hm2尧181 万 hm2 和 1 177 万 hm2
5 个 袁 河 南 2 个 单 位 育 成 1 个 袁 新 疆 2 个 单 位 育 成 渊见 表 圆冤遥
1 个 袁山 西 尧河 北 尧青 海 各 有 一 个 单 位 育 成 1 个 遥 这 些 3 讨论与建议
作 者 简 介 院赵 明 渊1983-冤袁女 袁本 科 袁农 艺 师 袁从 事 科 研 管 理 工 作 遥 电 话 院18505355087曰E-mail院 mm453836637@ 通 讯 作 者 院王 新 语 遥
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粮食作物 2020.1
表 1 以烟 1933尧1934 为亲本育成的小麦新品种
长 相 表 现 类 似 袁株 高 80 cm 左 右 袁抗 冻 性 较 好 袁分 蘖 11 次 袁省 级 审 渊认 冤定 71 次 遥
力 强 袁成 穗 率 低 袁株 型 紧 凑 袁穗 层 整 齐 袁光 能 利 用 效 率 2 烟 1933尧1934 育成品种的推广应用
高 袁长 芒 白 壳 白 粒 袁角 质 饱 满 袁根 系 发 达 袁茎 秆 粗 壮 袁
2020.1 粮食作物
小麦创新种质烟 1933、烟 1934 的应用
宜宾烟区主推烤烟品种和储备品种对根黑腐病的抗性研究

宜宾烟区主推烤烟品种和储备品种对根黑腐病的抗性研究一、根黑腐病概述根黑腐病是由根黑腐霉菌引起的一种烟草根系病害,主要发生在土壤排水不良、通风不畅的低洼地块上。
根黑腐病病菌可通过土壤和种子传播,在烟田中迅速扩散,造成严重的经济损失。
病害发生后,烟株的根系会逐渐变黑,严重影响养分的吸收和传输,导致植株生长受阻,最终影响烟叶的产量和品质。
二、宜宾烟区主推烤烟品种和储备品种1. 宜宾烤烟品种宜宾烟区主推的烤烟品种有宜宾烟一号、宜宾烟二号、宜宾烟三号等,这些品种在宜宾烟区的种植面积较大,产量和品质稳定,深受农民青睐。
这些品种对根黑腐病的抗性能力如何,一直是农民和科研人员关注的焦点问题。
2. 宜宾烟区储备品种为了应对烟草种植的多样化需求,宜宾烟区还根据当地的气候和土壤条件,培育了一批具有抗病性和适应性强的烟草储备品种。
这些品种在品质、抗病性和产量方面都有着独特的优势,受到了广泛的关注和应用。
三、宜宾烤烟品种和储备品种对根黑腐病的抗性研究1. 田间观察为了研究宜宾烤烟品种和储备品种对根黑腐病的抗性,我们选择了宜宾烟区的不同烟田进行田间观察。
通过对病害症状的观察和统计,我们发现一些烟田中确实存在根黑腐病的发生,而另一些烟田中则基本没有发现病害严重的烟株。
这说明宜宾烟区的烟田存在一定的抗病性差异性,这为我们进一步的研究提供了重要的数据基础。
2. 病原鉴定通过对不同烤烟品种和储备品种烟根组织中病原菌的鉴定和分离培养,我们确定了病害的致病真菌,进一步明确了根黑腐病的病原学特征。
这为我们后续的研究奠定了重要的理论基础。
四、研究成果与展望通过对宜宾烤烟品种和储备品种对根黑腐病抗性的研究,我们初步确认了宜宾烟区的一些烟种具有较强的抗病性,而另一些烟种则存在一定的抗病弱势。
这为今后选择和培育抗病性品种提供了科学依据和技术支撑。
下一步,我们将继续深入研究宜宾烤烟品种和储备品种的抗病机制,寻找抗病性状的遗传基础,通过分子标记辅助育种等手段,加快选育出更加抗病、高产、优质的烟草新品种,为宜宾烟区的烟草产业发展做出更大的贡献。
烟草绿原酸生物合成途径关键酶基因的研究进展

烟草绿原酸生物合成途径关键酶基因的研究进展杨银菊;陈爱国;刘光亮;张彦;王树声【摘要】Chlorogenic acid is one of the important phenylpropanoids formed by plants secondary metabolism,which is closely related to plant food flavor and medical biological activity.Accordingly,the researches on the chlorogenic acid biosynthetic pathway and its regulation have been the focus of researchers.In this paper,considering the biosynthesis pathway of tobacco chlorogenic acid,we described the molecular regulations of the key nodes containing phenylalanine ammonia-lyase gene,cinnamic acid 4-hydroxylase gene,4-coumarate-CoA ligase gene,Hydroxycinnamoyl-CoA:quinate hydroxycinnamoyl transferase gene,hydroxycinnamoyl CoA shikimate/quinate hydroxycinnamoyltransferase gene,andρ-coumaroylester 3'-hydroxylases gene.Additionally,the future researches on metabolic regulation of tobacco chlorogenic acid biosynthesis were further prospected,in order to provide reference for better understand the biosynthetic mechanism of tobacco chlorogenic acid and its regulation.%绿原酸是重要的植物苯丙素类次生代谢产物之一,与植物的食品风味和药用生物活性等密切相关,其生物合成与调控研究一直是科研人员所关注的焦点.本文综述了烟草绿原酸生物合成途径中关键节点苯丙氨酸解氨酶基因、肉桂酸-4-羟化酶基因、对-香豆酸辅酶A连接酶基因、羟基肉桂酰辅酶A:奎尼酸羟基肉桂酰转移酶基因、羟基肉桂酰辅酶A莽草酸/奎尼酸羟基肉桂酰转移酶基因、对-香豆酸3'-羟化酶基因的研究进展,并进一步展望了烟草绿原酸生物合成代谢调控的研究方向,旨在为烟草绿原酸生物合成途径的深入研究和定向调控提供参考.【期刊名称】《现代农业科技》【年(卷),期】2018(000)013【总页数】5页(P5-8,10)【关键词】烟草;绿原酸;生物合成;关键酶;基因【作者】杨银菊;陈爱国;刘光亮;张彦;王树声【作者单位】中国农业科学院烟草研究所,山东青岛266101;农业部烟草生物学与加工重点实验室;中国农业科学院研究生院;中国农业科学院烟草研究所,山东青岛266101;农业部烟草生物学与加工重点实验室;中国农业科学院烟草研究所,山东青岛266101;农业部烟草生物学与加工重点实验室;中国农业科学院烟草研究所,山东青岛266101;农业部烟草生物学与加工重点实验室;中国农业科学院烟草研究所,山东青岛266101;农业部烟草生物学与加工重点实验室【正文语种】中文【中图分类】S572绿原酸(chlorogenic acid,CGA)在植物界中广泛存在,主要分布于忍冬科、菊科、杜仲科和茄科[1]。
烟草基因组知识篇:2. 基因组测序

烟草基因组知识篇:2. 基因组测序孙玉合【摘要】@@ 基因组计划的最终目标是获取所研究生物体的全部DNA序列,一般包括三个图谱,即遗传图谱、物理图谱和基因组全序列图谱,并将基因以及其他有意义的特征定位于DNA序列中.人以及模式生物的染色体都不能直接进行DNA测序,因此首先必须将它们随机地"敲碎"(通过限制性内切酶酶切或超声波处理或DNA酶Ⅰ降解)变成成千上万的小片段,构建成不同水平和类型的基因组文库,例如YAC(yeast artificial chromosome,酵母人工染色体)文库、BAC(bacterial artificial chromosome,细菌人工染色体)文库和cDNA文库等.然后对文库中的每个克隆片段进行DNA测序,再对所有测定的每条序列经过计算机程序处理装配成染色体上完整的DNA序列.【期刊名称】《中国烟草科学》【年(卷),期】2010(031)002【总页数】2页(P76-77)【作者】孙玉合【作者单位】中国农业科学院烟草研究所,青岛,266101【正文语种】中文基因组计划的最终目标是获取所研究生物体的全部DNA序列,一般包括三个图谱,即遗传图谱、物理图谱和基因组全序列图谱,并将基因以及其他有意义的特征定位于DNA序列中。
人以及模式生物的染色体都不能直接进行DNA测序,因此首先必须将它们随机地“敲碎”(通过限制性内切酶酶切或超声波处理或 DNA酶Ⅰ降解)变成成千上万的小片段,构建成不同水平和类型的基因组文库,例如 YAC (yeast artificial chromosome,酵母人工染色体)文库、BAC(bacterial artificial chromosome,细菌人工染色体)文库和cDNA文库等。
然后对文库中的每个克隆片段进行DNA测序,再对所有测定的每条序列经过计算机程序处理装配成染色体上完整的DNA序列。
1 DNA测序方法两种不同的快速有效的传统 DNA测序方法于上世纪 70年代中期几乎同时发表。
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2011年21(2)生物技术45
烤烟品种南江3号均一化全长cDNA文库构建
蔡刘体,胡重怡,张永眷,韩晓红
(贵州省烟草科学研究所,贵州贵阳550018)
摘要:目的:为了获得功能基因的信息,构建烤烟品种南江3号的均一化eDNA文库。
方法:用RNensyPlantMiniKit提取烤烟南江3号叶片和花的RNA,用反转录酶逆转录合成第一链eDNA。
以LD—PCR扩增获得的双链eDNA为模板,采用基于双链特异性核酸酶(Duplex—SpecificNuclease,DSN)的均一化eDNA文库技术,构建南江3号盛花期的均一化eDNA文库。
结果:构建了南江3号盛花期的均一化eDNA文库,文库重组率大为97.47%,库容量约为1.26×106,插入片段平均长度大于1.2kb。
从文库中随机48个克隆进行PCR检测,挑取20个克隆进行测序,序列通过BLAST比对结果显示文库可能包含大量基因和ESTs序列。
结论:该文库为研究南江3号的基因功能和资源提供材料来源。
关键词:烤烟;基因;均一化;cDNA文库;表达序列标签
中图分类号:¥572.032文献标识码:Adoi:10.3969/j.issn.1004—3lIX.2011.02.045
ConstructionNormalizedFull——lengthcDNAlibraryofFlue—.cured
TobaccoVarietyofNanjiang—-3
CAILiu—ti,HUZhong—yi,ZHANGYong—chun,HANXiao—hong
(GuizhouTobaccoResearchInstitute,Guiyang550018。
China)
Abstract:Objective:InordertOobtaininformationoffunctionalgenes。
anormalizedeDNAlibrayfromFlue—cnredtobaccovarietyofN鲫jiang一3(Nicotianatobacumcv.Nanjiang一3)Wagconstructed.Method:RNAWfl¥extractedfromlea、ri铭andflowersofNanjiang一3accordingtORNeasyPlantMiniKitmanipulation.thefirstcDNAw豳synthesizedbyIt'evelp∞transcriptase.DoubleeDNAobtianedthroughlong—distancepCR(LD—pCR)amplificationmethod髓template,thenormalizedeDNAlibraryofNanjiang一3w鹅constructedbytheSMARTtechnologywhichbasedonthedoublestrandspecificnuclease(Duplex—SpecificNuclease,DSN).Result:Thenormal-izedeDNAlibrary哪constructed,whichcontained1.26×106independentclones,itsrecombinationratiowas97.47%,averageinsertionsizeWaSabove1.2kb.Randomselected48clonesweretestedbyPCR。
then20positivecloneswemseqnencedandBLAST。
theresultsshowedthatmanygenesandexpressionsequencetags(EsTB)werecontainedintheeDNAp001.Conclusion:Basismaterialinformationofresearchforgenetici'eso蝴andgenefunctionofNanjiang-3wereprovidedbythecDNAlibrary.
Keywords:Flue—c删tobacco;gene;normalization;eDNAlibrary;expressedsequencetag
0引言
烤烟新品种南江3号(审定号)是从烤烟栽培品种红花大金元品种中通过系统选择培育获得的,它具有适应性强,易烘烤,中抗赤星病和青枯病等优良农艺性状;而且烟叶外观品质好,烟碱含量适中。
化学成分协调,其主要经济性状与K326比较,产量提高15.71%.产值增加33.93%,符合中式卷烟发展对原料的需求,具有生产应用价值。
也可以作为优异种质在烟草育种中研究和利用…。
均一化eDNA文库技术可以克服基因转录水平上巨大差异给文库筛选和分析带来的障碍,增加克隆低丰度mRNA的机会,有利于研究基因的表达和序列分析。
因此,基于均一化文库技术构建全长cDNA文库被广泛应用,如在植物中构建的水稻全生育期均一化eDNA文库悼】,棉花腺体形成时期的cD-NA文库【3】。
玉米杂交种雌穗均一化eDNA文库H1;亚洲棉全生育期均一化全长eDNA文库”’;玉米MOl7的均一化文
收稿日期:2010—10—26:修回日期:2011—03一03
资助项目:贵州省烟草专卖局项目(“烟草病圃微生物多样性分析及烟草抗病性基因研究”,黔烟科2009—015);国家烟草专卖局项目(“烟草eDNA文库构建及重要基因表达谱研究”,l10200701021)资助
作者简介:蔡刘体(1974一),男,博士,助理研究员,研究方向:烟草发育分子生物学,Email:cailiutiOl@163m,Tel:0851—41i7089。
Fax:0851—41169呻库№J。
烤烟新品种南江3号的基因资源文库资源未见报道,为挖掘其基因信息和保存基因资源,本文采用均一化文库技术构建烤烟新品种南江3号盛花期的均一化eDNA文库。
l材料与方法
1.1材料
1.1.I植物材料
烟草品种南江3号(Nicotiana脚蝴CV.Nanjiang3),取南江3号盛花期的幼叶和花蕾,液氮速冻,-80。
C保存备用。
1.1.2试剂1RNA提取试剂盒RNeasyPlantMiniKit和文库构建试剂盒SMARTeDNALibraryConstructionKit为QIANGEN公司产品;DNA纯化回收试剂盒为大连TaKaRa宝生物公司产品;反转录酶、DNaseI、DL2000和蛋白酶K等试剂为上海生物有限公司产品。
1.2方法
1.2.1RNA提取纯化
南江3号叶片和花蕾的总RNA的提取按照RNeasyPlantMiniKit说明书操作,通过DNaseI消除DNA纯化回收后,用琼脂糖凝胶电泳和紫外分析检测。
1.2.2均一化eDNA文库构建
文库构建按照SMARTeDNALibraryConstructionKit说明。