高二生物人教版选修一教学案:专题5 课题2 多聚酶链式反应扩增DNA片段
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一、PCR扩增的原理和过程(阅读教材P58~62)
1.细胞内DNA复制的条件
2.PCR
(1)PCR(多聚酶链式反应):一种体外迅速扩增DNA片段的技术。
它能以极少量的DNA 为模板,在短时间内复制出上百万份的DNA拷贝。
(2)原理:DNA的热变性原理,即:
(3)扩增方向:总是从子链的5′端向3′端延伸。
(4)条件
①模板:DNA。
②引物:能分别与DNA两条模板链相结合的物质。
③原料:4种脱氧核苷酸。
④酶:耐高温的DNA聚合酶,一般用Taq DNA聚合酶。
⑤其他条件:需要稳定的缓冲溶液和能自动调控温度的温控设备。
(5)引物
一小段DNA或RNA,能与DNA母链的一段碱基序列互补配对,用于PCR引物的长度通常为20~30个核苷酸。
3.PCR的反应过程
(1)变性:温度上升到90 ℃以上时,双链DNA解聚为单链。
(2)复性:温度下降到50 ℃左右,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合。
(3)延伸:温度上升到72 ℃左右时,溶液中的四种脱氧核苷酸(A、T、C、G)在DNA聚合酶的作用下,根据碱基互补配对原则合成新DNA链。
二、实验操作及DNA含量的测定
(阅读教材P62~63)
1.实验操作程序
准备―→移液―→混合―→离心―→反应。
2.DNA含量的测定
(1)原理:利用DNA在260_nm的紫外线波段的吸收峰曲线来测定相应含量。
(2)计算公式:DNA含量(μg/mL)=50×(260 nm处紫外分光光度计的读数)×稀释倍数。
注:在标准厚度为1 cm的比色杯中,OD260为1相当于50 μg/mL的双链DNA。
[共研探究]
多聚酶链式反应简称PCR,是一种体外迅速扩增DNA片段的技术,这项技术中DNA 复制的过程和细胞内DNA复制的过程是类似的。
请结合已学过的DNA分子结构和复制的相关知识,回答下列问题。
1.PCR技术
(1) PCR的原理:在80~100_℃的温度范围内,DNA的双螺旋结构将解体,双链分开,这个过程称为变性。
当温度缓慢降低后,两条彼此分离的DNA链又会重新结合成双链。
(2)子链扩增:需要引物,合成方向总是从子链的5′端向3′端延伸。
(3)条件
①模板:DNA。
②引物:分别与DNA两条模板链相结合的两种小的核酸片段。
③原料:A、T、G、C四种脱氧核苷酸。
④酶:耐热DNA聚合酶,一般用耐高温的Taq_DNA聚合酶。
⑤其他条件:需要一定的缓冲溶液和能严格控制温度的温控设备。
(4)PCR扩增中的重点解读
①DNA聚合酶不能从头开始合成DNA,只能从引物的3′端延伸DNA链,因此扩增DNA 时应加入两种引物。
②PCR扩增DNA过程中不需要解旋酶。
③利用PCR技术扩增1个DNA分子n次,所得DNA分子中,不含引物的脱氧核苷酸链所占的比例是1/2n。
含引物的DNA分子所占的比例是100%。
2.PCR技术的过程
(1)变性:当温度上升到90 ℃以上时,双链DNA解聚为单链。
(2)复性
温度下降到50 ℃左右,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合。
(3)延伸
温度上升到72 ℃左右,溶液中的四种脱氧核苷酸(A,T,C,G)在DNA聚合酶的作用下,根据碱基互补配对原则合成新的DNA链。
3.PCR扩增的理论计算
PCR扩增时,DNA数目呈指数形式扩增。
若只有一条DNA模板,则复制n次后有2n 条DNA;若一开始有a条模板,则复制n次后有a×2n条DNA。
[总结升华]
生物体内的DNA复制与PCR反应的比较
【易错易混】关于PCR技术的4个易误点
(1)DNA母链的3′端对应着子链的5′端,即DNA的两条链是反向平行的。
(2)解旋酶的作用是使DNA两条链的氢键断开,DNA聚合酶、DNA连接酶催化形成磷酸二酯键。
(3)DNA聚合酶是将单个核苷酸加到已有的单链片段的3′端上,需要模板;而DNA连接酶连接的是两条DNA片段的缺口,不需要模板。
(4)从第二轮循环开始,上一次循环的产物也作为模板参与反应,并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA单链会与引物Ⅱ结合,进行DNA的延伸。
这样,DNA聚合酶只能特异地复制处于两个引物之间的DNA序列,使这段固定长度的序列呈指数形式扩增。
[对点演练]
1.近20年来,PCR技术(多聚酶链式反应)成为分子生物学实验室的一种常规实验手段,其原理是利用DNA半保留复制,在试管中进行DNA的人工复制(如图),在短时间内,将DNA扩增几百万倍甚至几十亿倍,从而使实验室所需要的遗传物质不再受限于活的生物体。
(1)加热使DNA双链间的__________键完全打开,称为________;而在细胞中是在________酶的作用下进行的。
(2)如果只需要大量克隆模板DNA中间的某个特定区段,应该加入________种特定的引物。
当温度降低至55 ℃时,引物与两条“舒展”的模板的特定位置结合,在DNA聚合酶的作用下,只能在引物的________端连接脱氧核苷酸,两条子链的延伸方向都是________________。
(3)PCR技术的必需条件,除了模板、原料、酶之外,至少还有三个条件,即液体环境、适宜的________和________,前者由________自动调控,后者则靠________来维持。
(4)通过PCR技术使DNA分子大量复制,如果将一个用15N标记的DNA分子放入试管中,以14N 标记的脱氧核苷酸为原料,连续复制四次之后,则15N 标记的DNA分子占全部DNA分子总数的比例是________。
解析:(1)PCR技术利用热变性原理使DNA双链之间的氢键断裂,称为解旋,而在细胞内是在解旋酶的作用下使氢键断裂。
(2)PCR分为三个基本反应步骤:变性(95 ℃)、复性(55 ℃)、延伸(72 ℃),其特异性依赖于与靶序列互补的引物,引物是两段与待扩增DNA序列互补的片段,两引物之间的距离决定扩增片段的长度。
由于DNA聚合酶只能从引物的3′端延伸DNA链,则DNA的合成方向总是从子链的5′端向3′端延伸。
(3)PCR技术与细胞内的DNA复制不完全相同,除了需要模板、原料、酶以外,还需要液体环境(稳定的缓冲溶液),每一个步骤都需要适宜的温度和酸碱度等。
(4)一个DNA分子连续复制四次之后,形成16个DNA分子,15N标记的DNA分子有2个,则15N标记的DNA分子占全部DNA分子总数的比例为1/8。
答案:(1)氢解旋解旋(2)两3′从子链的5′端向3′端延伸(3)温度酸碱度PCR仪缓冲液
(4)1/8
[共研探究]
PCR是在PCR仪中完成的,经过多次的循环使DNA片段得以大量地扩增,这个过程有严格的操作规程。
1.结合下面实验操作过程,回答下列问题:
(1)实验操作过程
准备:按照PCR反应体系的配方将所需试剂摆放于实验桌上
↓
移液:用微量移液器按照配方向微量离心管中依次加入各组成成分
↓
混合:盖严离心管口的盖子,用手指轻轻弹击管的侧壁
↓
离心:将微量离心管放在离心机上,离心约10 s,使反应液集中在离心管底部
↓
反应:将离心管放入PCR仪中进行反应
(2)注意事项
①避免外源DNA污染:所用离心管、缓冲液、蒸馏水等使用前必须进行高压灭菌。
②缓冲液和酶分装成小份,并在-20_℃储存。
③每添加一种反应成分,更换一个移液器上的枪头。
④混匀后离心处理,使反应液集中在离心管底部。
2.实验中DNA含量的测定
理论上DNA呈指数增长,但实际可能会有诸多因素影响DNA含量,所以需要对DNA 含量进行测定。
(1)原理:DNA在260 nm的紫外线波段有一强烈的吸收峰。
峰值的大小与DNA的含量有关,可以利用DNA的这一特点进行DNA含量的测定。
(2)过程
①稀释:取2 μL PCR反应液,加入98 μL蒸馏水,即将样品进行50倍稀释。
②对照调零:以蒸馏水作为空白对照,在波长260 nm 处,将紫外分光光度计的读数调节至零。
③测定:取DNA稀释液100 μL至比色杯中,测定260 nm 处的光吸收值。
④计算:DNA含量(μg/mL)=50×(260 nm的读数)×稀释倍数。
[总结升华]
1.PCR过程用到的重要仪器
(1)PCR仪:该仪器能自动调控温度,实现DNA的扩增。
如果没有PCR仪,可用3个恒温水浴锅代替,操作时按程序在3个水浴锅中来回转移PCR反应的微量离心管。
(2)微量离心管:总容积为0.5 mL,实际上是进行PCR反应的场所。
(3)微量移液器:用于向微量离心管中转移PCR配方中的液体。
2.PCR技术的应用
(1)医学上用该技术分析人的精液,对细菌、病毒感染进行早期诊断。
(2)对单细胞中的DNA进行扩增,用于遗传病的基因诊断,并在此基础上进一步制备无突变的DNA片段供遗传病患者基因治疗时使用。
(3)法医学用此技术来鉴别罪犯或进行亲子鉴定。
(4)古生物学用此技术分析古生物化石样品,追溯其生存年代或迁徙踪迹。
(5)在农业生物技术中,可运用此技术检测目的基因是否已经成功导入目标生物等。
[对点演练]
2.下列对PCR的实验操作顺序的叙述,正确的是()
A.准备→移液→混合→离心→反应
B.准备→移液→离心→混合→反应
C.离心→移液→混合→反应
D.移液→离心→混合→反应
解析:选A PCR的实验操作中,首先是准备,即按照PCR反应体系的配方将需要的试剂摆放在实验桌上;其次是移液,即用微量移液器按照配方在微量离心管中依次加入各组分;然后是混合,即盖严离心管口的盖子,用手指轻轻弹击管壁,使反应液混合均匀;接着是离心,即将微量离心管放在离心机上,离心约10 s;最后是反应。
1.PCR技术扩增DNA,需要的条件是()
①目的基因②引物③四种脱氧核苷酸④耐热的DNA聚合酶⑤mRNA⑥核糖体
A.①②③④B.②③④⑤
C.①③④⑤D.①②③⑥
解析:选A PCR技术扩增DNA需要DNA模板(目的基因)、两种引物、四种脱氧核苷酸和耐热的DNA聚合酶等。
2.下列有关PCR技术的叙述,不正确的是()
A.PCR技术利用的是碱基互补配对原则
B.PCR技术可用于基因诊断,判断亲缘关系等
C.PCR技术需在体内进行
D.PCR技术可分为变性、复性、延伸三个阶段
解析:选C PCR技术是聚合酶链式反应的简称,是在体外快速大量复制DNA片段的一种新技术。
3.DNA的复制需要引物,主要原因是()
A.可加快DNA的复制速度
B.引物可与DNA母链通过碱基互补配对结合
C.引物的5′端有助于DNA聚合酶延伸DNA链
D.DNA聚合酶只能从3′端延伸DNA链
解析:选D DNA聚合酶不能从5′端开始合成DNA,而只能从3′端延伸DNA链,因此,DNA复制需要引物。
当引物与DNA母链通过碱基互补配对结合后,DNA聚合酶就能从引物的3′端开始延伸DNA链,DNA的合成方向总是从子链的5′端向3′端延伸。
4.PCR技术有效地解决了因为样品中DNA含量太低而难以对样品进行研究的问题,而被广泛应用,与细胞内的DNA复制相比,PCR可以快速扩增所需的DNA片段,请分析回答下列有关问题:
(1)体内DNA复制过程中用解旋酶打开双链DNA,而PCR技术中的解旋原理是________________________________。
(2)此过程需要一种Taq DNA聚合酶,该酶是从__________________中分离的。
(3)与普通DNA聚合酶相比,Taq DNA聚合酶具有的特性是____________。
(4)与体内DNA复制相比较,PCR反应要在________________中才能进行,并且要严格控制________条件。
(5)PCR中加入的引物有________种,加入引物的作用是_____________________。
解析:(1)PCR技术中用高温使DNA分子中的氢键打开,从而解旋,其原理是DNA的热变性原理。
(2)Taq DNA聚合酶是从水生耐热细菌Taq中提取的。
(3)与普通DNA聚合酶相比,Taq DNA聚合酶在90 ℃以上的环境中不变性,具有耐高温的特性。
(4)PCR反应需要适宜的温度和pH,因此PCR反应要在一定的缓冲溶液中进行,并需要严格控制好温度条件。
(5)PCR需要两种引物,引物的识别位点决定了PCR扩增的DNA片段。
PCR中加入的引物是小段单链DNA或RNA,作用是引导DNA复制,可以使游离的脱氧核苷酸与之结合形成磷酸二酯键,成为DNA复制的起点。
答案:(1)DNA的热变性原理(2)水生耐热细菌Taq(3)耐高温(4)一定的缓冲溶液温度(5)2作为DNA复制的起点。