PDE_for_Cumene_Concept_Paper
Synthesis and characterization of novel systems fo
专利内容由知识产权出版社提供
专利名称:Synthesis and characterization of novel systems for guidance and vectorization of molecules of therapeutic interest towards target cells
发明人:Pascal Dumy,Marie-Christine Favrot,Didier Boturyn,Jean-Luc Coll
申请号:US10528320 申请日:20030919 公开号:US07531622B2 公开日:20090512
摘要:A method for preparing a grafted homodetic cyclopeptide forming a framework that defines a grafted upper face and grafted lower face, including synthesizing a linear peptide from modified or unmodified amino acids, some of which carry orthogonal protective groups; intramolecular cyclizing the resulting protetuting some or all of orthogonal protective groups with a protected precursor; and grafting at least one molecule of interest onto one and/or the other face of the framework via an oxime bond.
呼和浩特市空气质量状况及影响因素分析
狀→ ∞
犻=1
狀
∑ 狀-1 狓犻狓犻犜 .给定分位数回归参数估计量的渐近协方差矩阵,就可以构造 Wald形式的统计量进行各种约 犻=1
束形式的参数检验.斜率相等性检验判断不同分位数回归方程中解释变量斜率是否相等.零假 设 为:犎0:
β1(τ1)=β1(τ2)=… =β1(τ犿 ),其中β1 指常数项以外的解释变量所对应的(犽-1)维参数列向量,(犽-1)
据世界卫生组织(WHO)2014年3月发布的报告,大 气污染 已 经 成 为 全 球 最 大 的 环 境 健 康 风 险,采 取行动改善空气质量迫在眉睫.大气 污 染 是 指 由 于 人 类 活 动(如 工 业 废 气、燃 料、汽 车 尾 气 和 核 爆 炸 等) 或自然过程(如火山爆发、森林灾害、岩 石 风 化 等)导 致 大 气 中 污 染 物 质 的 浓 度 达 到 有 害 程 度,对 人 体 和 环境造成危害的现象.大气污染物 既 包 括 粉 尘、烟、雾 等 小 颗 粒 状 的 污 染 物,也 包 括 二 氧 化 碳、一 氧 化 碳 等气态污染物.近年来,我国频繁爆发 大 规 模 的 雾 霾 污 染,已 对 社 会 经 济 可 持 续 发 展 和 人 民 群 众 身 心 健 康造成严重威胁[1].空气质量分布特征及大气污染影 响 因 素 得 到 广 泛 关 注 和 探 讨.马 盼 等 基 [2] 于 北 京 市 三年的空气质量指数和气象观测日值数据,分季节探讨了两者 的关系,并 应用 分布 滞后 非线 性模 型和 广 义加模型定量计算了 AQI对呼吸系统急诊人数的影 响 及 滞 后 效 应.姜 新 华 等 采 [3] 用 主 成 分 分 析 法 对 呼 和浩特市空气质量影响因素研究结果表明,影响呼和浩特市 AQI的 大 气 污 染 物 包 括 PM10、SO2 和 CO, 气象因素有气温、相对湿度和风速.许 燕 婷 等 基 [4] 于 城 市 空 气 质 量 指 数 日 值 数 据,运 用 一 系 列 空 间 统 计 模型探究了中国城市空气质量的时 空 分 布 变 化 与特 征.林 静 怡 等 对 [5] 重 庆 市 空 气 质 量 指 数 及 6 种 大 气 污染物浓度分月度、季度、年度进行了 描 述 性 统 计 分 析,再 运 用 多 元 回 归 分 析 和 分 位 数 回 归 建 立 了 回 归 方程.
非线性偏微分方程 偏微分方程数值方法
非线性偏微分方程偏微分方程数值方法非线性偏微分方程偏微分方程数值方法非线性偏微分方程定义:各阶微分项有次数高于一的,该微分方程即为非线性微分方程(一)主要研究内容非线性偏微分方程是现代数学的一个重要分支,无论在理论中还是在实际应用中,非线性偏微分方程均被用来描述力学、控制过程、生态与经济系统、化工循环系统及流行病学等领域的问题。
利用非线性偏微分方程描述上述问题充分考虑到空间、时间、时滞的影响,因而更能准确的反映实际。
本方向主要研究非线性偏微分方程、H-半变分不等式、最优控制系统的微分方程理论及其在电力系统的应用。
1.非线性偏微分方程的研究:我们主要研究偏微分方程解的存在唯一性(和多解性)及稳定性;偏微分方程的初值问题、初边值问题的整体解(包括周期解和概周期解)的存在性及渐近性;平衡解的存在性,尤其是当问题依赖于某些参数时平衡解的分叉结构,以及平衡解的稳定性问题;非线性方程的数值解。
2.H-半变分不等式的研究:建立具有极大单调算子扰动的多值(S)型和伪单调型映象的广义度理论,广义不动点指标理论和具有非凸、不可微泛函的非线性发展型H-半变分不等式理论,由此来研究含间断项的非线性偏微分方程。
3.最优控制系统的微分方程理论及其在电力系统的应用:主要研究与电力生产有关的控制系统的理论和应用。
首先提出了对Banach空间中抽象非线性发展方程所描述的最优控制系统的研究。
引进非光滑分析,研究最优控制系统的微分方程,利用变分不等式理论研究多值问题、数值计算等,所获理论成果应用于电力系统的许多最优控制问题(如:电力系统励磁调节器传递函数的辨识、牛顿最优潮流的数学模型等)。
(二)研究方向的特色1.变分不等式理论与能量泛函的凸性密切相关,由于现代科学技术的需要,特别是研究自由边界和固体力学问题的需要,传统的方法往往都无法解决这类问题,人们对H-半变分不等式进行研究,研究涉及现代分析及应用、偏微分方程以及科学计算等众多领域中亟待解决和发展的重要课题。
小波域中的PDE指纹图像增强
小波域中的PDE指纹图像增强项明;吴小培;汤婷;孙林森【摘要】提出了一种基于偏微分方程的小波域指纹增强算法.分析了一致性扩散方程的缺陷,改为使用方向扩散使方程严格沿着指纹纹路扩散;进而提出了一种基于方向扩散的小波域指纹增强算法.该算法利用小波域低频系数图增强指纹,抑制了噪声的影响,将增强子图利用小波逆变换实现重构.通过对FVC2002的dB4指纹库中部分低质量图像的增强结果比较,表明该算法对低质量指纹图像的增强效果明显,且处理速度比现存的基于PDE的增强方法快.【期刊名称】《计算机工程与应用》【年(卷),期】2010(046)027【总页数】4页(P188-190,219)【关键词】方向扩散;指纹图像;小波;图像增强【作者】项明;吴小培;汤婷;孙林森【作者单位】安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室,合肥,230039;安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室,合肥,230039;安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室,合肥,230039;安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室,合肥,230039【正文语种】中文【中图分类】TP3911 引言指纹识别作为主要的生物识别技术之一,被广泛应用于司法、公安和各种安全防护系统。
指纹识别是模式识别最先涉足的领域之一,发展极为迅猛,它是图像处理技术、模式识别技术与计算机数据库技术的综合应用,是目前模式识别研究的热点之一。
采集指纹图像的时候易受许多因素的影响,例如手指的太干或湿、手指皮肤本身的纹路系乱、手指上有皱纹、手指在采集窗口上的移动和不正确的压力,导致采集的指纹图像质量较低。
大多数特征提取算法为了能够准确地提取低质量指纹图像的特征都采用了增强算法。
绝大多数的指纹增强算法都使用纹线方向和纹线频率作为增强算法的参数。
这类算法只有正确地求出这些信息,才能对指纹图像取得良好的增强效果。
其中有代表性的是L Hong等提出的使用加博函数增强指纹图像的方法[1]。
基于PDEs的二维条形码图像预处理方法
基于PDEs的二维条形码图像预处理方法谢晗昕, 张勇(北京航空航天大学精密仪器与光电工程学院,北京,100083)摘要:目前二维条形码在各领域得到了广泛地应用,但实际环境中受图像采集设备的限制,译码图像中通常混有较大的噪声,导致经常出现误码。
为了进一步提高二维码译码的可靠性,必须对图像进行有效地预处理。
本文根据条形码边界具有方向性的特点,将基于偏微分方程的Perona & Malik模型应用到二维条形码的图像预处理中,并对Perona & Malik模型的缺点进行了算法改进,通过合理地设计和选择参数,能很好地适应所有二维条码的图像特征,实际计算结果表明该方法对二维条形码图像的处理能得到令人满意的效果。
关键词:二维条形码;偏微分方程;各向异性扩散;Perona & Malik模型;2-dimensional bar code Preprocessing Method Based on PDEsXIE hanxin, ZHANG yong(School of Instrumentation & Optoelectronics Engineering,Beijing University of Aeronautics and Astronautics, Beijing, 100083, China) Abstract: The 2-D bar codes are used wildly in many fields, but due to the acquiring equipment which results in noisy images, some mistakes appear. The bar codes images must be preprocessed to improve the quality of translation. Perona-Malik model was introduced. The method was improved and applied to 2-D bar code images. By chosing appropriate parameters, its results were encouraging.Key Words: 2-dimensional bar code; PDE; anisortopic diffusion;Perona-Malic model 1.背景介绍条形码技术起源于20世纪70年代,发展迅速,80年代末诞生了二维条形码。
Projected gradient methods for non-negative matrix factorization
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Introduction
Non-negative matrix factorization (NMF) (Paatero and Tapper, 1994; Lee and Seung, 1999) is useful for finding representations of non-negative data. Given an n × m data matrix V with Vij ≥ 0 and a pre-specified positive integer r < min(n, m), NMF finds two non-negative matrices W ∈ Rn×r and H ∈ Rr×m such that V ≈ W H. If each column of V represents an object, NMF approximates it by a linear combination of r “basis” columns in W . NMF has been applied to many areas such as finding basis vectors of images (Lee and Seung, 1999), document clustering (Xu et al., 2003), molecular pattern discovery (Brunet et al., 2004), etc. Donoho and 1
Stodden (2004) have addressed the theoretical issues associated with the NMF approach. The conventional approach to find W and H is by minimizing the difference between V and W H : min
成都2024年05版小学四年级K卷英语第3单元期末试卷
成都2024年05版小学四年级英语第3单元期末试卷考试时间:90分钟(总分:120)A卷一、综合题(共计100题)1、What is the capital of Slovakia?A. PragueB. BratislavaC. BudapestD. Ljubljana答案:B. Bratislava2、What type of animal is a dolphin?A. FishB. MammalC. ReptileD. Amphibian答案: B3、听力题:The symbol for barium is _____.4、How do you say "good morning" in Italian?A. BuongiornoB. BuonaseraC. BuonanotteD. Ciao5、填空题:The ________ is a tiny creature that flies.6、What is the term for the distance around a circle?A. DiameterB. RadiusC. CircumferenceD. Area答案:C7、听力题:The _____ (市场) has fresh produce.8、What kind of animal is an octopus?A. MammalB. FishC. ReptileD. Mollusk答案: D9、填空题:My uncle is a skilled __________ (修理工).10、What do you use to write on paper?A. PaintB. PencilC. GlueD. Scissors答案:B11、听力题:I have a _____ of jellybeans. (bag)12、听力题:My ______ tells me about different cultures.13、听力题:The first permanent English settlement in America was _______.14、What is the name of the famous American author known for his works on adventure?A. Mark TwainB. Ernest HemingwayC. F. Scott FitzgeraldD. John Steinbeck答案:A15、听力题:The ______ is a great motivator.16、听力题:The sun is ________ in the sky.17、What do we call the process of breaking down food in the body?A. DigestionB. AbsorptionC. AssimilationD. Ingestion答案: A18、填空题:The ______ (香味) of fresh herbs can enhance cooking.19、Which animal can fly?A. FishB. BirdC. DogD. Cat20、What do we celebrate on July 4th in the USA?A. ThanksgivingB. Independence DayC. ChristmasD. New Year答案:B21、填空题:The __________ (森林) helps clean the air.22、What is the opposite of ‘big’?A. LargeB. SmallC. HugeD. Tall23、填空题:I love to play ________ (桌游) with my family.24、Which animal is known for its ability to fly south for the winter?A. PenguinB. EagleC. SparrowD. Dolphin答案:C25、填空题:He is _______ at playing soccer.We should always be ________ (尊重) to others.27、听力题:The bumblebee collects pollen from _______.28、听力题:The Earth is the _____ planet from the sun.29、听力题:I like to _____ (ride/drive) my bike.30、What do we call the light given off by the sun?A. MoonlightB. StarlightC. SunlightD. Firelight答案:C31、填空题:The turtle is slow but very _______ (智慧).32、Which of these is a frozen dessert?A. CakeB. Ice creamC. CookieD. Pie答案:B33、填空题:My mother is a _____ (作家) and publishes books.34、选择题:What is the name of the famous painter known for his artwork of the Mona Lisa?A. Vincent van GoghB. Pablo PicassoC. Leonardo da VinciD. Claude Monet35、What is the name of the famous television show featuring a group of friends living in New York City?A. FriendsB. SeinfeldC. How I Met Your MotherD. The Office答案: AWe share our ___ (toys).37、Sea is a ________ (盐水湖). 填空题:The Dead38、What do you call a person who repairs computers?A. TechnicianB. EngineerC. ProgrammerD. Developer答案:A39、填空题:My __________ (玩具名) is great for __________ (活动).40、What is the color of a typical eggplant?A. GreenB. YellowC. PurpleD. Red答案:C41、填空题:The kangaroo keeps its baby in its _________ (育儿袋).42、听力题:A __________ is a geological feature that can shape human activities.43、选择题:Which creature is known for spinning webs?A. AntB. SpiderC. BeeD. Fly44、How many colors are in the flag of Canada?A. OneB. TwoC. ThreeD. Four45、填空题:I love going to the ______ (艺术展) to see incredible works. It inspires my creativity.古代的________ (cultures) 通过艺术和宗教信仰表达自我。
21世纪是生命科学的世纪20世纪后叶分子生物学的突破性...
第一章绪论一简答题1. 21世纪是生命科学的世纪。
20世纪后叶分子生物学的突破性成就,使生命科学在自然科学中的位置起了革命性的变化。
试阐述分子生物学研究领域的三大基本原则,三大支撑学科和研究的三大主要领域?答案:(1)研究领域的三大基本原则:构成生物大分子的单体是相同的;生物遗传信息表达的中心法则相同;生物大分子单体的排列(核苷酸,氨基酸)导致了生物的特异性。
(2)三大支撑学科:细胞学,遗传学和生物化学。
(3)研究的三大主要领域:主要研究生物大分子结构与功能的相互关系,其中包括DNA和蛋白质之间的相互作用;激素和受体之间的相互作用;酶和底物之间的相互作用。
2. 分子生物学的概念是什么?答案:有人把它定义得很广:从分子的形式来研究生物现象的学科。
但是这个定义使分子生物学难以和生物化学区分开来。
另一个定义要严格一些,因此更加有用:从分子水平来研究基因结构和功能。
从分子角度来解释基因的结构和活性是本书的主要内容。
3 二十一世纪生物学的新热点及领域是什么?答案:结构生物学是当前分子生物学中的一个重要前沿学科,它是在分子层次上从结构角度特别是从三维结构的角度来研究和阐明当前生物学中各个前沿领域的重要学科问题,是一个包括生物学、物理学、化学和计算数学等多学科交叉的,以结构(特别是三维结构)测定为手段,以结构与功能关系研究为内容,以阐明生物学功能机制为目的的前沿学科。
这门学科的核心内容是蛋白质及其复合物、组装体和由此形成的细胞各类组分的三维结构、运动和相互作用,以及它们与正常生物学功能和异常病理现象的关系。
分子发育生物学也是当前分子生物学中的一个重要前沿学科。
人类基因组计划,被称为“21世纪生命科学的敲门砖”。
“人类基因组计划”以及“后基因组计划”的全面展开将进入从分子水平阐明生命活动本质的辉煌时代。
目前正迅速发展的生物信息学,被称为“21世纪生命科学迅速发展的推动力”。
尤应指出,建立在生物信息基础上的生物工程制药产业,在21世纪将逐步成为最为重要的新兴产业;从单基因病和多基因病研究现状可以看出,这两种疾病的诊断和治疗在21世纪将取得不同程度的重大进展;遗传信息的进化将成为分子生物学的中心内容”的观点认为,随着人类基因组和许多模式生物基因组序列的测定,通过比较研究,人类将在基因组上读到生物进化的历史,使人类对生物进化的认识从表面深入到本质;研究发育生物学的时机已经成熟。
【国家自然科学基金】_pde_基金支持热词逐年推荐_【万方软件创新助手】_20140803
科研热词 脉冲爆震发动机 偏微分方程 磷酸二酯酶 水平集方法 自适应参数计算 脉冲爆轰发动机 环磷腺苷 彩色图像滤波 大鼠 图像分割 去噪 两相爆轰 pde模型 黏性流 麻醉 高效液相色谱 骨骼肌 颤振 预爆器 非线性微分方法 非局部扩散 震动滤波 障碍期权 降阶模型 阴茎海绵体 迭代有限差分法 运动性 过渡面 边缘强化 输液管 起爆 调控作用 计算机应用 视频编码 蒸发 航空航天推进系统 自适应调整 腺苷酸环化酶 脑 脉冲爆震燃烧室 脉冲爆震发动机(pde) 脉冲爆震-涡扇组合发动机 能量约束 肺微血管内皮细胞 肝 缺血-再灌注损伤 缓燃向爆震转捩 线性热流 线性微分方法 纹理细节保持 糖尿病 管径
1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
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பைடு நூலகம்
再装股票期权 公司债券 全变差模型 全变分方法 信号转导 俄罗斯期权 人参皂苷rg1 亥姆霍兹涡量方程 乘性噪声 丙烯醛 不稳定流形 三维pde本征问题 三变量jacobi正交多项式 一致锐度 ⅰ型胶原 tv滤波器 pde6b pde p-creb monge-ampère方程 lp范数 level set方法 knight不确定性 cml模型 chebyshev多项式legendre多项式 ce/se方法 camp bsde
酿酒酵母pdes基因缺失对蓝莓果酒抗氧化及挥发性物质的影响
第37卷第6期2019年11月食品科学技术学报Journal of Food Science and TechnologyVol.37No.6Nov.2019 doi:10.3969/j.issn.2095⁃6002.2019.06.010文章编号:2095⁃6002(2019)06⁃0071⁃10引用格式:马国为,姚婷,谈太聪,等.酿酒酵母PDEs基因缺失对蓝莓果酒抗氧化及挥发性物质的影响[J].食品科学技术学报,2019,37(6):71-80.MA Guowei,YAO Ting,TAN Taicong,et al.Effects of PDEs gene deletion in Saccharomyces cerevisiae on antioxidant and volatile compounds in blueberry wine[J].Journal of Food Science and Technology,2019,37(6):71-80.酿酒酵母PDEs基因缺失对蓝莓果酒抗氧化及挥发性物质的影响马国为1, 姚 婷1, 谈太聪2, 何欣萌1, 张亮然2, 王友升1,*(1.北京工商大学北京食品营养与人类健康高精尖创新中心,北京 100048;2.山东大学微生物技术国家重点实验室,山东济南 250100)摘 要:比较野生型酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)与环核苷酸磷酸二酯酶PDE1和PDE2基因敲除的突变菌株(PDE1/Δpde1㊁Δpde1/Δpde1㊁PDE2/Δpde2和Δpde2/Δpde2)对蓝莓果酒发酵特性及品质的影响㊂测定了蓝莓果酒发酵醪液总糖㊁酒精度㊁总酸㊁pH值㊁DPPH自由基清除能力㊁羟自由基清除能力㊁ABTS自由基清除能力㊁总酚㊁总黄酮和花青素等指标㊂采用顶空固相微萃取技术(HS⁃SPME)与气相色谱-质谱联用(GC-MS)相结合的方法对蓝莓果酒挥发性物质进行比较㊂探究了PDE1和PDE2基因对酿酒酵母的发酵特性的影响㊂结果表明:Δpde1/Δpde1菌株能有效提高蓝莓果酒发酵速度,酿造的蓝莓果酒活性物质含量最高,抗氧化能力最强;PDE1和PDE2基因的缺失会降低发酵蓝莓果酒的抗氧化能力,且敲除PDE2的酿酒酵母酿造的蓝莓果酒的抗氧化能力比敲除PDE1的更弱,而Δpde1/Δpde1突变菌株酿造的果酒中香气成分含量较多㊂关键词:酿酒酵母;环核苷酸磷酸二酯酶;蓝莓果酒;抗氧化能力;挥发性物质中图分类号:TS255.1;TS262.7 文献标志码:A收稿日期:20190122基金项目:国家自然科学基金资助项目(31972127);北京市教育委员会科研计划重点项目(KZ201910011013)㊂第一作者:马国为,女,硕士研究生,研究方向为食品生物技术㊂ *通信作者:王友升,男,教授,博士,主要从事食品生物技术方面的研究㊂ 蓝莓果实富含矿物质㊁微量元素㊁维生素以及多酚类物质等,具有抗氧化㊁保护视力㊁增强心脏功能㊁软化血管㊁增强人体免疫力等功能[1-2]㊂蓝莓生产的季节性和区域性限制了蓝莓的贮藏和销售,因此蓝莓的生产和加工引起了生产者和消费者的广泛关注[3]㊂蓝莓果酒的加工不仅解决蓝莓储藏的问题,还可以有效保留果实原有的营养价值,提高其附加值[4]㊂在果酒酿造过程中,酿酒酵母菌种㊁糖度㊁酸度㊁温度和SO2浓度是影响果酒发酵质量的重要因素[5]㊂已有研究表明,酵母菌种是影响果酒风味的关键因素之一[6]㊂酿酒酵母的生存活力以及发酵特性主要受高酒精度㊁高渗透压㊁氧化胁迫㊁低pH值等胁迫条件的影响[7];而酿酒酵母内环磷酸腺苷(cyclic adenosinemonophosphate,cAMP)和环磷酸鸟苷(cyclicguanosine monophosphate,cGMP)信号转导通路在调控细胞的增殖㊁分化㊁代谢以及对胁迫条件的抗性发挥着至关重要的作用[8]㊂环核苷酸磷酸二酯酶(cy⁃clic nucleotide phosphodiesterase,PDEs)通过自身的磷酸化调节细胞内第二信使cAMP或cGMP的信号传导过程[9]㊂PDEs超家族可分I型和II型两大类,酵母中含有yPDE1(Ⅱ型)和yPDE2(Ⅰ型)两种PDEs,yPDE1和yPDE2在酵母细胞中发挥着不同的生理功能[10-11]㊂在对cAMP/cGMP信号通路调控17酿酒酵母生存活力的研究中发现,yPDE1在反馈抑制葡萄糖诱导的cAMP信号通路发挥着特定功能[12],yPDE2过量表达可提高酵母对氧化胁迫和酒精胁迫的耐受性[13-14]㊂由此可见,PDEs基因缺失能够影响酿酒酵母的活性㊂已有研究表明,PDEs突变菌株能提高果酒发酵速率[15],但对于利用PDEs 基因缺失的酿酒酵母进行蓝莓果酒发酵特性的研究目前未见相关报道㊂本研究拟采用蓝莓果实为原料,通过比较野生型酿酒酵母与PDEs基因缺失菌株酿造的果酒理化特性㊁抗氧化能力㊁活性物质和挥发性物质含量,探究PDE1和PDE2基因对酿酒酵母的发酵特性的影响,以期为筛选优良酿酒酵母提供参考依据㊂1 材料与方法1.1 材料与试剂1.1.1 实验材料菌株:野生型酿酒酵母(Saccharomyces cerevisi⁃ae),为本实验室保存菌株㊂结合同源重组原理和醋酸锂酵母高效转化实验进行基因敲除㊂PDE1和PDE2基因单拷贝敲除菌株分别为PDE1/Δpde1和PDE2/Δpde2突变菌株,PDE1和PDE2基因双拷贝敲除菌株分别为Δpde1/Δpde1和Δpde2/Δpde2突变菌株㊂蓝丰蓝莓:山东蓝莓生产基地提供,蓝莓初始可溶性固形物含量(SSC)为10.6°Brix,总酸质量浓度为6.87g/L㊂1.1.2 实验试剂引物由Invitrogen公司负责合成;DNA分子质量标准2×Taq PCR Master Mix㊁6×loading buffer(溴酚蓝)以及MarkerⅦ,天根生化试剂公司;Deoxyribo⁃nucleic acid sodium salt from salmon testes㊁polyethy⁃lene glycol和lithium acetate dihydrate,美国Sigma公司;三羟甲基氨基甲烷(tris methyl aminomethane, Tris)㊁hygromycin B㊁十二烷基硫酸钠(sodium dode⁃cyl sulfate,SDS)㊁G418sulfate㊁Triton⁃X100和乙二胺四乙酸钠(ethylenediaminetetraacetic acid,EDTA),美国Amresco公司;偏重亚硫酸钾㊁偏重亚硫酸钠㊁果胶酶(30000Da)等均为食品级,上海和氏璧化工有限公司;磷酸二氢钠㊁磷酸氢二钠㊁结晶紫㊁葡萄糖等均为分析纯;酵母浸粉㊁蛋白胨㊁琼脂均为生物试剂㊂1.2 仪器与设备HQ45型恒温摇床,武汉中科科仪技术发展有限公司;5810R型高速离心机,美国Eppendorf公司;生物安全柜,美国Thermo公司;PCR仪,美国Bio-Rad公司;QP2010型气相色谱-质谱联用仪,日本岛津公司;PC-420D型固相微萃取工作台,Corning公司;PR-201型数字式糖度计,上海右一公司;Mole⁃cular Devices SpectraMax190型酶标仪,上海艾研生物科技有限公司;T6型新世纪分光光度计,北京普析通用仪器有限责任公司㊂1.3 实验方法1.3.1 蓝莓果酒酿造挑选成熟度高㊁无腐烂变质的新鲜蓝莓,用清水洗净㊁打浆㊂向果浆中加入100mg/L果胶酶,酶解2h,用纱布过滤除去残渣,添加蔗糖将蓝莓汁的SSC调至22°Brix㊂蓝莓汁中加入200mg/L偏重亚硫酸钾进行4h杀菌,最后将野生型酿酒酵母(WT)及4株PDE1/Δpde1㊁Δpde1/Δpde1㊁PDE2/Δpde2和Δpde2/Δpde2突变菌株分别接种到等量蓝莓汁中,接种量均为2×107CFU/mL㊂将发酵罐放置在20℃条件下进行恒温发酵,每天搅拌2次㊂发酵结束后,将蓝莓酒进行皮渣分离,果酒滤液密封保存进入陈酿期,陈酿结束后再进行过滤灌装即得成品㊂1.3.2 蓝莓果酒发酵特性测定1.3.2.1 理化指标测定pH:采用酸度计测㊂总酸:采用碱式滴定法测定㊂酒精度:采用比色法测定[16]㊂糖度:采用硫酸-苯酚比色法测定[17]㊂每项测定各重复3次㊂1.3.2.2 抗氧化能力测定DPPH自由基清除能力的测定参考文献[18]方法;羟自由基清除能力的测定参照文献[19]方法; ABTS自由基清除能力的测定参考文献[20]方法㊂各项实验均将自由基清除率为50%定义为1个活性单位(U),样品自由基清除能力表示为单位质量(g)新鲜样品中含有的活性单位(U/g)㊂1.3.2.3 活性物质含量测定总酚的测定参照文献[21]方法,并略有改进:以没食子酸作标准曲线,总酚含量换算为每100g 新鲜样品中没食子酸当量值(mg/100g)㊂总黄酮含量测定参考文献[22]方法:以芦丁标准品制作标准曲线,总黄酮含量换算为每100g新鲜样品中芦丁当量值(mg/100g);花青素含量的测定参照文献[23]方法㊂1.3.2.4 挥发性物质测定采用SPME-GC/MS法测定蓝莓果酒的挥发性27食品科学技术学报 2019年11月物质㊂取3g 待测样品,装入15mL 样品瓶,加0.9g 氯化钠和转子,密封后50℃㊁400r /min 条件下平衡20min,75μm CAR /PDMS 萃取头进行萃取,50℃萃取30min 后,GC 进样口解析3min,同时启动仪器采集数据㊂色谱柱:SPB -50毛细管柱(30m ×0.32mm ×0.25μm)㊂升温程序:初温50℃,保持2min,以3℃/min 升温至150℃,再以5℃/min 的速度升温至250℃保持5min㊂载气(He )流速为1.0mL /min,不分流进样㊂质谱条件:接口温度为250℃,离子源温度220℃,电离方式EI,电子能量70eV,扫描质量范围为50~600u㊂利用质谱与保留指数两者结合定性,采用TIC 峰面积归一化法对果酒中挥发性物质进行定量分析㊂2 结果与分析2.1 野生型及突变体菌株酿造的蓝莓果酒品质指标比较图1 不同酿酒酵母发酵的蓝莓果酒的品质变化Fig.1 Change of quality in blueberry wine fermented by different Saccharomyces cerevisiae接种不同酿酒酵母的蓝莓果酒发酵过程中pH 值㊁酒精度㊁总糖㊁总酸的变化情况见图1㊂野生型酿酒酵母以及4株PDEs 基因缺失菌株发酵的蓝莓果酒在发酵过程中总糖㊁酒精度㊁总酸㊁pH 值的变化趋势基本一致㊂由图1(d)可知,Δpde 1/Δpde 1菌株利用糖的效率最高,而PDE 1/Δpde 1菌株利用糖的效率最低㊂Δpde 1/Δpde 1菌株在发酵前6d 酒精度增加速度最快,PDE 1/Δpde 1菌株增加速度最慢,与利用糖的效率呈正相关㊂Δpde 2/Δpde 2菌株发酵结束后总酸度最高,为7.18g /L,是野生型的1.2倍㊂实验结果表明,与野生型酿酒酵母相比,PDE 1/Δpde 1菌株降低蓝莓果酒的发酵速度,而Δpde 1/Δpde 1㊁Δpde 2/Δpde 2和PDE 2/Δpde 2菌株均会提高蓝莓果酒发酵速度,其中Δpde 1/Δpde 1菌株的发酵速度最快㊂2.2 野生型及突变体菌株酿造的蓝莓果酒的抗氧化能力比较比较不同酵母菌株发酵的蓝莓果酒的抗氧化能力差异,结果见图2㊂由图2(a)可知,野生型发酵的蓝莓果酒对DPPH 自由基的清除能力为942.76U /g,PDE 1/Δpde 1㊁Δpde 1/Δpde 1㊁PDE 2/Δpde 2和Δpde 2/Δpde 2菌株发酵的果酒清除能力分别是野生型的55%㊁42%㊁51%和31%;同时,图2(b)结果显示,野生型酵母发酵的蓝莓果酒ABTS 自由基清除能力为2387.92mg /100g,PDE 1/Δpde 1和PDE 2/Δpde 2发酵的果酒ABTS 自由基清除能力与野生型能力接近,而Δpde 1/Δpde 1和Δpde 2/Δpde 2菌株的37第37卷第6期 马国为等:酿酒酵母PDEs 基因缺失对蓝莓果酒抗氧化及挥发性物质的影响不同小写字母代表不同菌株发酵的蓝莓果酒的抗氧化能力之间差异显著㊂图2 不同酿酒酵母发酵的蓝莓果酒抗氧化指标的变化Fig.2 Changes of antioxidant index in blueberry wine fermented by different strains of Saccharomyces cerevisiae 能力分别是野生型的76%和67%;此外,野生型酵母发酵的蓝莓果酒羟自由基清除能力为141.72U/g,Δpde1/Δpde1菌株发酵的果酒羟自由基清除能力达到野生型的1.3倍,而PDE1/Δpde1㊁PDE2/Δpde2和Δpde2/Δpde2发酵的果酒羟自由基清除能力仅为野生型的49%㊁75%和24%㊂结果表明,与野生型酿酒酵母相比,PDEs基因缺失菌株会降低蓝莓果酒对DPPH和ABTS自由基的清除能力,且Δpde1/Δpde1和Δpde2/Δpde2菌株的清除能力低于PDE1/Δpde1和PDE2/Δpde2的清除能力;Δpde1/Δpde1菌株会提高对羟自由基的清除能力㊂综合比较,Δpde1/Δpde1菌株的抗氧化能力强于Δpde2/Δpde2菌株的抗氧化能力㊂2.3 野生型及突变体菌株酿造的蓝莓果酒中活性物质含量的比较比较接种不同酿酒酵母的蓝莓果酒中总酚㊁总黄酮和花青素含量的差异,结果见图3㊂PDEs基因缺失菌株发酵的蓝莓果酒的总酚与总黄酮含量与野生型相比差异显著㊂野生型酿酒酵母发酵的蓝莓果酒总酚质量比为3.24mg/100g,Δpde1/Δpde1㊁PDE2/Δpde2和Δpde2/Δpde2菌株发酵的蓝莓果酒总酚含量分别为野生型的1.5,1.3和1.15倍,而PDE1/Δpde1菌株发酵的蓝莓果酒中总酚含量低于野生型㊂同时,野生型发酵的蓝莓果酒的总黄酮质量比为20.53mg/100g,4株突变体发酵的蓝莓果酒中总黄酮含量均低于野生型,依次是野生型的63%㊁65%㊁69%和18%㊂相比而言,Δpde2/Δpde2菌株发酵的蓝莓果酒中花青素含量是野生型的1.03,PDE1/Δpde1菌株发酵的蓝莓果酒中花青素含量与野生型菌株无显著性差异,Δpde1/Δpde1㊁PDE2/Δpde2菌株发酵的果酒中花青素含量低于野生菌株,依次是野型菌株的92%和90%㊂结果表明,与野生型酿酒酵母相比,Δpde1/Δpde1㊁PDE2/Δpde2和Δpde2/Δpde2菌株会提高蓝莓果酒的总酚含量;PDEs基因缺失会降低蓝莓果酒中总黄酮含量,且Δpde2/Δpde2菌株酿造的蓝莓果酒中总黄酮47食品科学技术学报 2019年11月不同小写字母代表不同菌株发酵的蓝莓果酒中活性物质之间差异显著㊂图3 接种野生型和突变菌株的蓝莓发酵醪液中活性物质含量Fig.3 Content of active substances of fermented mash with wild and mutant strains含量最低;PDEs 基因缺失对蓝莓果酒中花青素含量影响较小㊂2.4 蓝莓果酒抗氧化能力与活性物质的相关性分析对蓝莓果酒的抗氧化能力与活性物质含量进行相关性分析,结果见表1㊂由表1可知,蓝莓果酒的抗氧化能力与总黄酮含量呈正相关,其中ABTS 自由基清除能力与总黄酮含量的正相关性达到显著水平;相比而言,羟自由基清除能力与总 酚含量呈正相关,但不显著,而DPPH 自由基清除能力和ABTS 自由基清除能力均与总酚含量呈负相关;DPPH 自由基清除能力与花青素含量呈正相关,而ABTS 自由基清除能力和羟自由基清除能力与花青素含量呈负相关㊂分析结果表明,总黄酮可能是蓝莓果酒抗氧化能力的关键活性物质,而且也可能存在其他活性物质对蓝莓果酒的抗氧化能力起重要作用㊂表1 果酒抗氧化能力与活性物质的相关性分析Tab.1 Correlation analysis between antioxidant capacity and active components of blueberry wine指标DPPH 自由基清除能力ABTS 自由基清除能力羟自由基清除能力总酚含量总黄酮含量花青素含量DPPH 自由基清除能力10.83510.3729-0.50870.86780.0998ABTS 自由基清除能力10.3028-0.43170.889*-0.3110羟自由基清除能力10.52780.6860-0.5701总酚含量1-0.1525-0.6247总黄酮含量1-0.3849花青素含量157第37卷第6期 马国为等:酿酒酵母PDEs 基因缺失对蓝莓果酒抗氧化及挥发性物质的影响2.5 野生型和突变菌株酿造的蓝莓果酒挥发性物质比较从5种不同菌株发酵的蓝莓果酒中共检测到33种挥发性物质,实验结果见表2㊂表2中,包括10种醇类物质㊁11种酯类物质㊁4种酸类物质㊁3种酚类物质㊁3种醛类物质㊁1种酮类物质和1种烃类物质㊂图4为不同酿酒酵母发酵的蓝莓果酒中挥发性物质含量,PDE1/Δpde1菌株发酵的果酒中醛类物质为主要成分,其次是醇类物质;而其他4种菌株发酵的蓝莓果酒中醇类物质含量最高,Δpde1/Δpde1菌株发酵的果酒中醇类物质高达83%,其次为酸类物质㊂表2 野生型和突变菌株酿造的蓝莓果酒挥发性物质的种类和含量Tab.2 Species and contents of volatile substances of blueberry wine fermented by wild type and mutant strains种类化合物名称相对含量/%WT PDE1/Δpde1PDE2/Δpde2Δpde1/Δpde1Δpde2/Δpde2异辛醇2.29 3.440.411.07桉树醇3.46 辛醇0.690.550.69 0.23丙三醇 4.25醇类芳樟醇11.044.5714.591.773.72 4⁃萜烯醇4.232.33 0.731.51香叶醇1.64.312.740.991.47苯乙醇26.6522.5132.0574.4865.45松油醇8.595.7413.440.635.59香茅醇0.12 丙二酸二乙酯 0.17 辛酸乙酯1.52 0.560.580.89苯甲酸乙酯0.42 0.770.380.16苯乙醇乙酸酯0.72 1.720.94癸酸乙酯0.59 0.270.540.38酯类丁酸己酯0.5 0.25乙酸丁香酚酯 0.180.25己二酸二丁酯 0.04 肉豆蔻酸异丙酯0.440.320.280.10.18癸酸酯0.27棕榈酸乙酯0.33 0.170.20.12辛酸17.394.9614.623.277.67酸类壬酸 0.89 癸酸1.680.833.070.180.44棕榈酸0.351.07 0.180.08愈创木酚6.153.397.171.211.65酚类丁香酚0.831.51 异丁香酚 0.2壬醛0.260.120.08醛类苯乙醛7.081.012.20.913.2 5⁃羟甲基糠醛 44.071.675.11.98酮类4⁃羟基⁃3⁃甲基苯乙酮2.140.370.481.582.69烃类对伞花烃 1.19 0.41 ”表示未检测到该物质㊂67食品科学技术学报 2019年11月图4 5种菌株发酵的蓝莓果酒中挥发性物质含量Fig.4 Volatile components in blueberry winefermented by five strains 醇类物质是产生果酒香气的主要成分,目前在5种蓝莓果酒中检测到的醇类物质主要有芳樟醇㊁苯乙醇㊁松油醇(表2)㊂研究表明,苯乙醇和香叶醇具有玫瑰花香,苯乙醇可在发酵期间产生㊂芳樟醇㊁松油醇和香茅醇能增加果酒的果香和甜香的特征[24]㊂PDE1/Δpde1酿造的蓝莓果酒中的醇类物质低于野生菌株,PDE2/Δpde2菌株发酵的蓝莓果酒的醇类物质高于野生菌株㊂Δpde1/Δpde1和Δpde2/Δpde2菌株发酵的蓝莓果酒中的苯乙醇含量明显高于其他菌株㊂在突变菌株发酵的蓝莓果酒中未检测到桉树醇和香茅醇㊂从醇类物质的变化情况可以看出,Δpde1/Δpde1菌株发酵的蓝莓果酒醇类物质含量最高㊂酯类物质是果实发酵过程中醇类物质和酸类物质发生酯化反应形成的,也是果酒香气的主体成分[25]㊂突变菌株酿造的果酒中酯类物质含量低于野生菌株,尤其PDE1/Δpde1酿造的蓝莓果酒只存在肉豆蔻酸异丙酯(表2)㊂在突变菌株中,Δpde1/Δpde1菌株发酵的蓝莓果酒醇类物质含量最高,其次为Δpde2/Δpde2㊂苯甲酸乙酯㊁苯乙醇乙酸酯㊁癸酸乙酯㊁乙酸丁香酚酯具有果香和花香的特征㊂Δpde1/Δpde1和Δpde2/Δpde2菌株发酵过程中产生了乙酸丁香酚酯并增加了苯乙醇乙酸酯的合成㊂检测得到的酸类物质中,辛酸占总酸类物质的60%~90%㊂突变菌株发酵的果酒中酸类物质总含量明显低于野生菌株,其中Δpde1/Δpde1菌株发酵的蓝莓果酒中酸类物质含量最少㊂酚类物质主要是愈创木酚㊁丁香酚和异丁香酚,其中愈创木酚含量最高㊂愈创木酚具有独特的芬香气味,丁香酚和异丁香酚均具有浓烈的丁香香气和辛香香气㊂除了PDE2/Δpde2菌株,其余3株突变菌株发酵的蓝莓果酒中愈创木酚含量低于野生菌株㊂Δpde1/Δpde1菌株发酵过程中产生了异丁香酚㊂醛类物质主要检测到壬醛㊁苯乙醛和5⁃羟甲基糠醛㊂苯乙醛具有水果的甜香气味,突变菌株发酵的蓝莓果酒中苯乙醛的含量低于野生菌株,在突变菌株中,Δpde2/Δpde2菌株酿造的蓝莓果酒中的苯乙醛含量最高㊂4种突变菌株发酵过程产生5⁃羟甲基糠醛,其中PDE1/Δpde1酿造的蓝莓果酒中含量最高㊂3 讨 论本研究结果表明,与野生型酿酒酵母相比,突变菌株Δpde1/Δpde1㊁Δpde2/Δpde2和PDE2/Δpde2均会提高蓝莓果酒发酵速度,其中Δpde1/Δpde1菌株在发酵过程中糖的消耗速度以及酒精度的上升速度最快,最能有效提高蓝莓果酒发酵速度㊂研究表明, PDE1对控制葡萄糖和细胞内酸化反应起着重要的生理作用,且敲除PDE1会导致酿酒酵母在添加葡萄糖后cAMP积聚更高[26],由此可以说明,敲除PDE1基因的酿酒酵母细胞内cAMP水平会升高,信号传导速度更快,从而利用糖的速度更快㊂Δpde1/Δpde1菌株发酵的蓝莓果酒的羟自由基清除能力高于野生型菌株,Δpde2/Δpde2菌株发酵的蓝莓果酒对DPPH㊁ABTS和羟自由基清除能力与其他菌株相比均最弱,而且Δpde1/Δpde1和Δpde2/Δpde2菌株发酵的蓝莓果酒对DPPH和ABTS自由基清除能力分别低于PDE1/Δpde1和PDE2/Δpde2菌株的能力㊂可以推断,PDEs基因的缺失会降低酿酒酵母发酵蓝莓果酒的抗氧化能力,且PDE2基因影响大于PDE1基因,PDEs基因双敲的影响大于PDEs基因单敲㊂有研究指出,PDE2缺失会影响许多不同功能类别的基因,也会明显影响细胞壁的完整性[26-27]㊂同时,酵母细胞在以葡萄糖为碳源时,其时序寿命与Ras-cAMP信号通路的活性呈负相关[28],因此,当PDEs基因被敲除后,细胞内信号通路活性增强,而细胞的时序寿命缩短,生成的活性物质会相应减少,从而抗氧化能力下降㊂又因为PDE1对cAMP亲和力和特异性低于PDE2,且有报道称酿酒酵母细胞内单独破坏PDE1基因观察不到PDE2基因被破坏时的一些表型[11],进一步说明PDE2基因影响大于PDE1基因㊂77第37卷第6期 马国为等:酿酒酵母PDEs基因缺失对蓝莓果酒抗氧化及挥发性物质的影响Δpde1/Δpde1菌株酿造的蓝莓果酒中总酚含量最高,PDEs基因缺失会降低蓝莓果酒中总黄酮含量,而PDEs基因缺失对蓝莓果酒中花青素含量影响较小㊂综合比较,Δpde1/Δpde1菌株的活性物质含量最高且抗氧化能力最强㊂PDEs基因缺失菌株酿造的蓝莓果酒香气成分种类和含量存在差异,突变菌株发酵的蓝莓果酒中的醇类㊁醛类㊁酮类以及烃类物质高于野生型菌株发酵的果酒,但酯类㊁酸类和酚类物质低于野生型菌株发酵的果酒㊂此外,PDEs 基因双敲菌株发酵的果酒中醇类㊁酯类和酮类等香气成分高于PDEs基因单敲菌株,其中Δpde1/Δpde1菌株发酵的果酒中香气种类较多,醇类和酯类物质含量最高㊂4 结 论通过考察野生型与PDEs基因缺失酿酒酵母对蓝莓果酒发酵特性及品质的影响,发现突变菌株中Δpde1/Δpde1菌株最能有效提高蓝莓果酒的发酵速度,PDE1和PDE2基因的缺失会降低酿酒酵母发酵蓝莓果酒的抗氧化能力,且敲除PDE2的酿酒酵母酿造的蓝莓果酒的抗氧化能力比敲除PDE1的更弱㊂PDEs基因双敲菌株发酵的蓝莓果酒中香气物质种类以及含量高于PDEs基因单敲菌株,其中Δpde1/Δpde1菌株发酵的蓝莓果酒中芳樟醇㊁苯乙醇㊁松油醇和苯乙醇乙酸酯等香气成分含量较多㊂由此可知,酿酒酵母中PDEs基因敲除显著影响果酒发酵的特性,PDE2基因的敲除影响大于PDE1基因,且PDEs基因双敲的影响大于PDEs基因单敲㊂参考文献:[1] CASTREJÓN A D R,EICHHOLZ I,ROHN S.Phenolicprofile and antioxidant activity of highbush blueberry(Vaccinium corymbosum L.)during fruit maturation andripening[J].Food Chemistry,2008,109(3):564-572.[2] 张杨,谢笔钧,孙智达.蓝莓酒渣㊁果酒中花色苷成分鉴定及酒渣与果中花色苷抗氧化活性比较[J].食品科学,2016,37(2):165-171.ZHANG Y,XIE B J,SUN Z position analysis ofanthocyanidins in blueberry wine lees,blueberries andblueberry wine and comparison of antioxidant activity ofanthocyanidins in blueberries and wine lees[J].FoodScience,2016,37(2):165-171.[3] 何欣萌,安琳,陈玉娟,等.减压处理对蓝莓果实品质影响的多变量分析[J].食品科学技术学报,2014,32(4):28-34.HE X M,AN L,CHEN Y J,et 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基于条件生成对抗网络的乳腺上皮和间质区域自动分割
2020⁃10⁃10计算机应用,Journal of Computer Applications2020,40(10):2910-2916ISSN 1001⁃9081CODEN JYIIDU http ://基于条件生成对抗网络的乳腺上皮和间质区域自动分割张泽林,徐军*(江苏省大数据分析技术重点实验室(南京信息工程大学),南京210044)(∗通信作者电子邮箱xujung@ )摘要:乳腺病理组织图像中上皮和间质区域的自动分割对乳腺癌的诊断和治疗具有非常重要的临床意义。
但是由于乳腺组织病理图像中上皮和间质区域具有高度复杂性,因此一般的分割模型很难只根据提供的分割标记来有效地训练,并对两种区域进行快速、准确的分割。
为此,提出一种基于条件对抗网络(cGAN )的上皮和间质分割条件对抗网络(EPScGAN )模型。
在EPScGAN 中,判别器的判别机制为生成器的训练提供了一个可训练的损失函数,来更加准确地衡量出生成器网络的分割结果输出和真实标记之间的误差,从而更好地指导生成器的训练。
从荷兰癌症研究所(NKI )和温哥华综合医院(VGH )两个机构提供的专家标记的乳腺病理图像数据集中随机裁剪出1286张尺寸为512×512的图像作为实验数据集,然后将该数据集按照7∶3的比例划分为训练集和测试集对EPScGAN 模型进行训练和测试。
结果表明,EPScGAN 模型在测试集的平均交并比(mIoU )为78.12%,和其他6种流行的深度学习分割模型相比较,提出的EPScGAN 具有更好的分割性能。
关键词:深度学习;条件生成对抗网络;乳腺病理组织图像;上皮和间质区域;图像分割中图分类号:TP391.41文献标志码:AAutomatic segmentation of breast epithelial and stromal regions based onconditional generative adversarial networkZHANG Zelin ,XU Jun *(Jiangsu Key Laboratory of Big Data Analysis Technology(Nanjing University of Information Science and Technology ),Nanjing Jiangsu 210044,China )Abstract:The automatic segmentation of epithelial and stromal regions in breast pathological images has very importantclinical significance for the diagnosis and treatment of breast cancer.However ,due to the high complexity of epithelial and stromal regions in breast tissue pathological images ,it is difficult for general segmentation models to effectively train the model based on the provided segmentation labels only ,and perform fast and accurate segmentation of the two regions.Therefore ,based on conditional Generative Adversarial Network (cGAN ),the EPithelium and Stroma segmentationconditional Generative Adversarial Network (EPScGAN )model was proposed.In EPScGAN ,the discrimination mechanismof the discriminator provided a trainable loss function for the training of the generator ,in order to measure the error betweenthe segmentation result outputs of the generator and the real labels more accurately ,so as to better guide the generatortraining.Total of 1286images with the size of 512×512were randomly cropped as an experimental dataset from the expert -labeled breast pathological image datasets provided by the Netherlands Cancer Institute (NKI )and the Vancouver General Hospital (VGH ).Then the dataset was divided into the training set and the test set according to the ratio of 7∶3to train and test the EPScGAN model.Experimental results show that ,the mean Intersection over Union (mIoU )of the EPScGAN model on the test set is 78.12%,and compared with other 6popular deep learning segmentation models ,EPScGAN model has better segmentation performance.Key words:deep learning;conditional Generative Adversarial Network (cGAN);breast tissue image;epithelial andstromal region;image segmentation引言上皮和间质区域是病理组织图像中的两种基本结构,在乳腺病理图像中,约有80%的肿瘤起源于上皮组织[1],并且上皮−间质转化(Epithelial -Mesenchymal Transition ,EMT )过程参与了肿瘤的恶性进展[2],因此上皮和间质区域的自动分割对乳腺癌的诊断和预后具有重要的临床价值。
数值pde实例 -回复
数值pde实例-回复问题:如何使用数值偏微分方程(Numerical Partial Differential Equations, PDE)解决实际问题?引言:数值偏微分方程是一种重要的数值计算方法,可以用于解决各种实际问题,如流体力学、结构力学、量子力学等。
本文将以数值偏微分方程的应用为主题,介绍解决实际问题的步骤及其实施方法。
正文:第一步:问题建模在使用数值偏微分方程解决实际问题之前,首先需要将问题建模,即将实际问题转化为数学模型。
建模的关键是确定问题的边界条件、初始条件和方程形式。
在选择方程形式时,需要根据实际问题的特点来确定,例如,如果问题涉及到物质的传输,可能需要使用对流扩散方程;如果问题涉及到波动现象,可能需要使用波动方程。
第二步:离散化接下来,需要将连续的数学模型离散化,将时间和空间上的变量进行离散处理。
离散化可以分为时间离散和空间离散两个方面。
对于时间离散,可以使用不同的时间步长,将问题的求解范围分为多个时间区间,并逐步求解。
对于空间离散,可以将问题域分割成多个小区间,并在每个小区间上进行近似计算。
第三步:数值求解一旦完成了离散化,就可以使用数值方法求解问题。
常见的数值方法包括有限差分法、有限元法、有限体积法等。
这些方法通过将问题转化为代数问题,使用差分或积分近似的方式来求解,得到离散点处的数值解。
第四步:验证和分析在得到数值解之后,需要对其进行验证和分析。
验证的方法包括将数值解与已知的解析解进行比较,检查其误差大小;分析的方法包括计算网格收敛性、稳定性等指标,进一步评估数值解的可靠性和准确性。
第五步:结果可视化最后,将得到的数值解以可视化的方式展示出来。
可以使用图形绘制技术,将数值解在问题域上进行绘制,以观察问题的特点和行为。
例如,如果解决的是流体力学问题,可以绘制流速、压力分布的等高线图;如果解决的是结构力学问题,可以绘制应力、位移分布的图形。
结论:通过以上步骤,我们可以使用数值偏微分方程解决实际问题。
融合卡方累积分布函数和PDE的曲波阈值去噪法
融合卡方累积分布函数和PDE的曲波阈值去噪法
崔华;严玍伻
【期刊名称】《西安电子科技大学学报(自然科学版)》
【年(卷),期】2014(000)004
【摘要】针对硬阈值函数不连续导致视觉失真和软阈值函数存在恒定重构偏差的
问题,依据噪声的曲波系数分布特性以及理想阈值函数特性,提出了基于卡方累积分布函数的新阈值函数。
为了克服阈值去噪法固有的环绕效应和难以兼顾细节保持与去噪效果的性能缺陷,将偏微分方程去噪图像中包含的有益信息融合进新阈值函数去噪图像中,提出了新去噪方法。
理论分析和仿真结果一致表明,较软、硬阈值去噪法,文中采用卡方累积分布函数和偏微分方程改进的曲波阈值去噪方法,可以有效地改善去噪效果和视觉质量。
【总页数】4页(P108-110,172)
【作者】崔华;严玍伻
【作者单位】长安大学信息工程学院,陕西西安 710064;长安大学信息工程学院,陕西西安 710064
【正文语种】中文
【中图分类】TP751
【相关文献】
1.一种曲波域蒙特卡罗阈值去噪算法 [J], 陈思雅;谢凯;阮宁君;张龙;龚康奕;沈政春;李纪成
2.曲波域统计量自适应阈值探地雷达数据去噪技术 [J], 李静和; 何展翔; 杨俊; 孟淑君; 李文杰; 廖小倩
3.基于自适应小波阈值与曲波变换的SAR图像去噪 [J], 杨哲;邵哲平
4.曲波阈值法地震弱信号识别及去噪方法研究 [J], 刘磊;刘振;张军华
5.船联网中曲波阈值图像去噪自适应算法研究 [J], 林泓恺;胡智锋
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清洁验证pde方法
清洁验证pde方法引言偏微分方程(Partial Differential Equation, PDE)是描述自然界中许多现象的重要数学工具。
数值模拟是研究PDE解的一种常用方法。
然而,由于数值计算的误差和不稳定性,数值解常常无法准确地反映实际问题的特征。
为了确保数值解的正确性和可靠性,清洁验证PDE方法应运而生。
本文将介绍清洁验证PDE方法的基本思想、步骤和应用。
清洁验证PDE方法的基本思想清洁验证PDE方法是一种数值误差分析方法,旨在评估数值模拟结果的准确性。
它的基本思想是通过增加或删除清洁项来改变问题的性质,并验证结果是否随着清洁项的变化而相应改变。
清洁项是一种已知精确解的函数形式,其作用是恢复原始问题的准确性。
通过引入清洁项,我们可以分析数值解中的误差成分,从而评估数值模拟结果的可靠性。
清洁验证PDE方法的步骤清洁验证PDE方法的具体步骤如下:1. 确定原始PDE问题:首先确定待求解的PDE问题,并得到其数值解。
2. 设计清洁项:根据已知精确解的函数形式,设计一个或多个清洁项。
3. 引入清洁项:将清洁项添加到原始PDE问题中,形成新的扩展问题。
4. 求解扩展问题:对扩展问题使用数值方法求解,得到相应的数值解。
5. 分析结果:比较原始问题的数值解和扩展问题的数值解,观察离散误差的变化情况,评估数值模拟结果的准确性。
6. 调整参数:根据观察到的误差变化情况,调整数值方法的参数,重新求解扩展问题,直到满足精度要求为止。
清洁验证PDE方法的应用清洁验证PDE方法广泛应用于科学计算和工程领域的数值模拟。
以下是一些常见的应用场景:1. 流体力学模拟:在流体力学的数值模拟中,清洁验证PDE方法可以用于评估数值方法对流体流动特性的准确性,帮助优化模拟结果。
2. 热传导模拟:在热传导现象的数值模拟中,可以通过清洁验证PDE 方法评估数值方法对温度分布的准确性,从而改进热传导模拟的结果。
3. 结构力学模拟:在结构力学的数值模拟中,清洁验证PDE方法可以用来评估数值方法对结构变形和应力分布的准确性,提高模拟结果的可靠性。
整合素α5和PDE4D相互作用调节内皮细胞的炎症信号
整合素α5和PDE4D相互作用调节内皮细胞的炎症信号范冲竹
【期刊名称】《中国病理生理杂志》
【年(卷),期】2017(033)003
【总页数】1页(P522)
【作者】范冲竹
【作者单位】
【正文语种】中文
动脉粥样硬化是一种以脂代谢紊乱和炎症为主要表现的疾病,然而它也与内皮细胞外基质(extracellular matrix, ECM)的重塑和纤维连接蛋白(fibronectin)在层粘连蛋白(laminin)-胶原基底膜间的沉积密切相关。
为了研究纤维连接蛋白如何调节动脉中的炎症,Yun等将纤维连接蛋白受体整合素α5的胞质尾区替换为胶原/层粘连蛋白受体整合素α2的胞质尾区。
这一嵌合体抑制了内皮细胞表面纤维连接蛋白和基因敲入小鼠体内的炎症信号。
纤维连接蛋白通过抑制抗炎因子环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate, cAMP)而发挥促炎症作用。
cAMP通过内皮前列环素的分泌而被激活;然而,这些并不依赖于ECM。
相反,细胞表面纤维连接蛋白通过增强磷酸二酯酶(phosphodiesterase, PDE)的活性而抑制cAMP,通过整合素α5与磷酸二酯酶4D5(phosphodiesterase-4D5, PDE4D5)的直接结合诱导了Ser651抑制位点上的PDE4D5 发生PP2A依赖性去磷酸化。
体内研究发现,敲低PDE4D5基因可以抑制动脉粥样硬化易发位点的炎症。
这些研究数据阐明了一个连接ECM重塑和炎症的分子机制,从而确立了一类新的治疗靶点。
基于方向场的指纹图像偏微分方程修补模型
基于方向场的指纹图像偏微分方程修补模型
韩志科;王贵
【期刊名称】《计算机应用》
【年(卷),期】2013(33)10
【摘要】提出一个用于指纹图像修复的新的偏微分方程(PDE)模型,该模型对指纹图像的缺损区域能进行有效的修补.通过分析比较现有的技术方案对指纹图像修补的不足:一般常见的图像修复模型由于缺乏方向场的几何信息,对于指纹图像,这些模型不能给出满意的修补结果;或者虽然引入了方向场的几何信息,但在具体修补时会出现将不同的脊线连到一起不同的错误结果.该模型采用方向场作为扩散方向,在扩散过程中灰度信息沿着表征脊线方向的局部固定方向传播到待修复区域中,改进了一般PDE模型不能用于修复指纹图像的不足.数值实验结果表明在修复指纹图像时提出的模型优于一般的模型.
【总页数】5页(P2886-2890)
【作者】韩志科;王贵
【作者单位】浙江大学城市学院,杭州310015;浙江大学城市学院,杭州310015【正文语种】中文
【中图分类】TP391.41
【相关文献】
1.一种改进的基于方向场的指纹图像增强算法 [J], 祁亚萍
2.基于方向场和频率场的指纹图像增强改进算法 [J], 黄毅;鲁周迅;陆建华
3.基于方向场的指纹图像处理算法 [J], 段沛沛;院鑫;侯娜;
4.基于方向场和频率场的自适应指纹图像增强算法 [J], 何洋;欧宗瑛;郭浩
5.基于局部方向场的非局部指纹图像去噪研究 [J], 魏挺
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PDE Toolbox和最小二乘法在导热问题中的应用
PDE Toolbox和最小二乘法在导热问题中的应用
朱秋旻;陈晓平
【期刊名称】《自动化仪表》
【年(卷),期】2011(032)006
【摘要】设计金属加热的控制策略,首先要获得金属导热体的开环系统模型.针对一个带有矩形孔的金属薄板上的热传导问题,采用PDE Toolbox进行求解和仿真,并用最小二乘方法进行热传导系统的建模与仿真,以获得模型中的参数.将此参数与求解微分方程方法所得到的数据进行对比,结果表明,采用最小二乘法可以更清楚地了解金属板的外部特性,并获得输入输出信号的差分方程,而求解微分方程的方法则显示了金属板的内部特性,两种方法是等效的.
【总页数】4页(P26-28,31)
【作者】朱秋旻;陈晓平
【作者单位】江苏大学电气信息工程学院,江苏镇江212013;江苏大学电气信息工程学院,江苏镇江212013
【正文语种】中文
【中图分类】TH811;TP15
【相关文献】
1.MATLAB PDE工具箱在Stokes第一问题中的应用 [J], 张纯静;申龙涉;纪富强;于丽丽
2.采用序列函数法在身管导热反问题中的应用 [J], 周渊键;陈刚;徐春雨
3.MATLAB PDE-tool在热传导问题中的应用 [J], 熊静;张薇
4.PDE工具箱在弹性力学平面问题中的应用 [J], 吴金洪
5.最小二乘法及其在大地变形反演问题中的应用 [J], 陈军红
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一种基于曲率驱动的四阶PDE图像去噪模型
一种基于曲率驱动的四阶PDE图像去噪模型王相海;刘颖男;张冲【期刊名称】《辽宁师范大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2014(000)003【摘要】噪声的存在降低了图像中信息的有效性,图像降噪显得尤为重要。
针对曲率驱动模型和四阶偏微分方程去噪方法的各自特性,提出了一种新的混合去噪模型,把CDD和四阶PD E通过某一权函数进行组合,很好地保持了二者的优势,在有效去除图像噪声的同时,很好地保留了图像的纹理细节和轮廓信息。
%T he existence of noise can reduce the effectiveness of the image information ,so image noise reduction is particularly important .In this paper ,based on the respective characteristics of denoising method using curvature driven model and fourth order partial differential equation ,we propose a new hybrid de-noise model which combines the CDD and fourth order PDE via a weight function ,the method well retains the advantages of both methods .While it effectively remove the noise of the im-age ,it well retained texture details and contour information of the image .Its de-noising results have greatly improved compared with the classic filtering .【总页数】6页(P346-351)【作者】王相海;刘颖男;张冲【作者单位】辽宁师范大学计算机与信息技术学院,辽宁大连 116029; 智能计算与信息处理教育部重点实验室,湖南湘潭 411105;辽宁师范大学数学学院,辽宁大连 116029;辽宁师范大学数学学院,辽宁大连 116029【正文语种】中文【中图分类】TP391【相关文献】1.一种改进的非线性四阶PDE去噪模型 [J], 王德华;靳永军;李晓明2.基于PDE和几何曲率流驱动扩散的图像分析与处理 [J], 高鑫;刘来福;黄海洋3.一种改进的基于PDE的图像去噪模型 [J], 刘晓娜;刘朝霞4.基于四阶PDEs和对比度增强的荧光显微图像去噪 [J], 王瑜;张慧妍5.一种基于平均曲率的彩色图像去噪分裂模型 [J], 孙莉因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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I
R
Final Concept Paper
Q3C(R5): Impurities : Guideline for Residual Solvents
(Revision of the ICH Q3C(R4) Guideline to account for new toxicity data related to
cumene)
14 May 2009
Endorsed by the Steering Committee on 10 June 2009
Type of Harmonisation Action Proposed
Maintenance of ICH Q3C.
Statement of the Perceived Problem
The ICH Q3C guidance reached Step 5 in December of 1997. It had been agreed by the members of the Expert Working Group (EWG) that the permissible daily exposure (PDE) could be modified if reliable and more relevant toxicity data was brought to the attention of the group. In 1999, a maintenance agreement was instituted and a Maintenance EWG was formed. The agreement provided for the re-visitation of solvent PDEs and allowed for minor changes to the guidance that included the existing PDEs. It was also agreed that new solvents and PDEs could be added based upon adequate toxicity data.
Solvents with Low Toxic Potential - Solvents in Class 3 (shown in Table 3) may be regarded as less toxic and of lower risk to human health. Class 3 includes no solvent known as a human health hazard at levels normally accepted in pharmaceuticals. However, there are no long-term toxicity or carcinogenicity studies for many of the solvents in Class 3. Available data indicate that they are less toxic in acute or short-term studies and negative in genotoxicity studies. It is considered that amounts of these residual solvents of 50 mg per day or less (corresponding to 5000 ppm or 0.5% under Option 1) would be acceptable without justification. Higher amounts may also be acceptable provided they are realistic in relation to manufacturing capability and good manufacturing practice.
Issues to be Resolved
Cumene, synonyms: Cumol; isopropylbenzene; isopropylbenzol; (1-methyl/ethyl)benzene; 2-phenylpropane is listed in Class 3 solvents with low toxicity. New toxicity data occurs for cumene. Male and female F344/N rats and B6C3F1 mice were exposed to cumene (greater than 99.9% pure) by inhalation for 2 weeks, 3 months, or 2 years.
Under the conditions of these 2-year inhalation studies, there was clear evidence of carcinogenic activity of cumene in male F344/N rats based on increased incidences of respiratory epithelial adenoma in the nose and renal tubule adenoma or carcinoma (combined). There was some evidence of carcinogenic activity of cumene in female F344/N rats based on the incidences of respiratory epithelium adenoma in the nose. There was clear evidence of
Paper Endorsed: 10 June 2009
Concept
FINAL Q3C(R5)
carcinogenic activity of cumene in male B6C3F1 mice based on increased incidences of alveolar/bronchiolar neoplasms. There was clear evidence of carcinogenic activity of cumene
in female B6C3F1 mice based on increased incidences of alveolar/bronchiolar neoplasms. Increased incidences of hepatocullar adenoma or carcinoma (combined) in female mice were also considered to be related to exposure to cumene. In addition genetic alterations in K-ras and p53 cancer genes in lung neoplasms from B6C3F1 mice exposed to cumene were detected.
Background to the Proposal
1.U. S. National Toxicology Program (NTP).TR-542 /go/29250;
2.Hong et AL. Genetic Alterations in K-ras and p53 Cancer Genes in Lung Neoplasms
from B6C3F1 Mice Exposed to Cumene. Toxicol Pathol2008; 36: 720-726.
Type of Expert Working Group
The Q3C EWG will be comprised of two members (one chemist and one toxicologist) nominated by the six sponsors of the ICH and one member nominated by IGPA, WSMI and by each pharmacopeia.。