江西农业大学生物科学与工程学院

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微生物发酵产阿卡波糖的研究进展

微生物发酵产阿卡波糖的研究进展

微生物发酵产阿卡波糖的研究进展彭卫福;程新;李昆太【摘要】阿卡波糖系由游动放线菌产生的C7N-氨基环醇类假性四糖物质,可与α-葡萄糖苷酶发生竞争性抑制作用而被广泛应用于Ⅱ型糖尿病的治疗,以达到降低糖尿病患者餐后高血糖的目的.本文对阿卡波糖的生物合成途径及其发酵工艺控制等方面的研究进展进行了综述.【期刊名称】《中国抗生素杂志》【年(卷),期】2014(039)001【总页数】5页(P1-5)【关键词】游动放线菌;阿卡波糖;生物合成;发酵工艺【作者】彭卫福;程新;李昆太【作者单位】江西农业大学生物科学与工程学院,南昌330045;江西农业大学生物科学与工程学院,南昌330045;江西农业大学生物科学与工程学院,南昌330045【正文语种】中文【中图分类】R151.2阿卡波糖(acarbose)是一种C7N-氨基环醇类的假性四糖物质[1],可与α-葡萄糖苷酶发生竞争性抑制作用而被广泛应用于Ⅱ型糖尿病的治疗,以达到降低糖尿病患者餐后高血糖的目的。

除了具有良好的降血糖效果外,阿卡波糖还具有调节体内脂类代谢并改善动脉硬化的作用,可全面降低糖尿病患者因高脂血症而诱发心脑血管疾病的危险性[2-3]。

加之与西方膳食相比,中国患者饮食中碳水化合物所占比例更高,这更是给使用阿卡波糖获得良好疗效带来了很好的基础[4-5]。

因此,阿卡波糖是一种理想的Ⅱ型糖尿病治疗药物,在我国的销售额已超越传统的磺酰脲类、双胍类降糖药物。

由于阿卡波糖结构复杂,其化学合成步骤相对繁琐且成本高昂,因此目前几乎都是通过微生物发酵法来生产阿卡波糖。

本文对阿卡波糖的生物合成途径及其发酵工艺控制等方面的研究进展进行了综述。

1.1 阿卡波糖的化学结构阿卡波糖分子式为C25H43NO18,其化学结构式图1所示。

由图1可以看出,阿卡波糖是典型的C7N-氨基环醇类假性四糖物质,它由氨基环醇、4-氨基-4,6-二脱氧葡萄糖和一分子麦芽糖三部分组成[6],理论上形成一分子的阿卡波糖需要二分子的葡萄糖和一分子的麦芽糖[7-9]。

统计软件R及其在_生物统计学_实验教学中的应用(1)

统计软件R及其在_生物统计学_实验教学中的应用(1)

如下:
〉x<- seq(0.5,1.4,length=100) # 给定 x 的取值范围
〉y<- seq(0.01,0.08,length=100) # 给定 y 的取值范围
〉r<- function(x,y)

- 0.7251+1.6335*x+9.9932*y- 0.7121*x*x- 90.5602*y*y-
一、R 软件及其特点
R 是 属 于 GNU 系 统 的 自 由 、免 费 、源 代 码 开 放 的 软 件 , 它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。由于其开 放性和自由灵活的特点, 在国内外的学术界得到了广泛的 应用。与国内目前大量采用的各种统计软件相比较, 利用 R 进行科研和教学具有如下优势:
教学参考
统计软件 R 及其在 《生物统计学》实验教学中的应用
文/ 程 新 魏赛金 江 莉 涂国全
摘 要: 自由软件 R 是一种在统计学及其他科研领域应 用非常广泛的 软 件 。 自 2005 年 开 始 , 在 生 物 工 程 与 生 物 技 术专业的学生的生物统计学课程中采用自由软件 R 作为教 学辅助工具。结果表明, 采用 R 进行教学, 激发了学生的学 习积极性, 提高了学生掌握统计学知识的能力, 教学效果比 以前有了显著提高。因此, 在统计学教学中采用自由软件 R 作为教学辅助工具, 值得推广。
表1
2005- 2006 年本学院《生物统计学》课程考试成绩
2003 级生物技术专业
2004 级生物技术专业
2003 级生物工程专业
本科阶段, 生物工程和生物技
使用软件 SPSS
使用软件 R
使用软件 R
术 专 业 学 生 《生 物 统 计 学 》课 程 一 共 成绩 人数 百分比( %) 成绩 人数 百分比( %) 成绩 人数 百分比( %)

创新制药工程及牛物工程等工科专业的实践教学体系——以培养学生应用统计软件主动设计试验的能力为目标

创新制药工程及牛物工程等工科专业的实践教学体系——以培养学生应用统计软件主动设计试验的能力为目标

目( 3 0 9 2 3 5 ) 的阶段性研究 作者简介 : 黄星( 1 9 6 3 一 ) , 女, 江苏南京人. 广西医科大 学 临 床 医学 院主 任 医师 ,硕 士研 究 生 导 师 ;罗 殿 中 ( 1 9 5 6 一 ) , 男, 广西资源人 , 广西医科大学基础医学院教授 , 博士研究生导师 ; 韦东梅( 1 9 8 0 一 ) , 女, 广西南宁人 , 广西医
结 果 如表2 所示
( 一) 统计软件在实践教学中的作用 在制药工作和生物工程这两个专业的实践教学过程
表1 发 酵培 养基 正 交试验 的 因素 和水 平
F a c t o r s L e v e l s A B C D
g l u c o s e 门 L ) Y e a s t e x l l r a c t( ) C o r n s t e e p l i q u o r( 8 几 》 x n ;  ̄ o 4
关键 词 : 统 计软 件 ; 实践 教 学 ; 试验 设 计 ; 制 药工程 专 业 ; 生物 工程 专业 中 图分 类号 : G 6 4 2 . 0 文献标 志 码 : A 文章 编 号 : 1 6 7 4 — 9 3 2 4 ( 2 0 1 3 ) 0 5 — 0 0 6 7 — 0 2
新素质【 l 1 2 1 。因此 , 在培养制药工程和生物工程专业本科生 实践能力和创新素质的过程 中, 对学生能否熟练且主动地 运用科学 的方法来设计试验提出了要求 。
众所周知, 统计学课程不仅具有严谨 的理论性和科学
性, 更是兼具极强的应用性和实践性网 , 它涵盖试验的科学 设计 、 试验方案 的具体实施 以及实验数据 的收集 、 整理 、 分 析等各个环节[ 4 1 。 因而, 在专业化统计分析软件 日 益渗透于 科学试验设计 以及实验数 据统计分析等各个 环节 的大环 境下[ 5 1 , 引入适当的统计学软件来辅助学生专业技能的培 养, 尤其是如何利用统计软件构建与理论教学相衔接的实 践教学体系 , 将主导着整个工科专业实践教学效果好 与坏

放线菌资源及其活性物质研究概述

放线菌资源及其活性物质研究概述

放线菌资源及其活性物质研究概述杨勇;李昆太【摘要】放线菌是一类(G+C)含量高的革兰氏阳性细菌,以丰富的次级代谢产物出名,在医药、农林业等方面具有重要利用价值.简要概述了放线菌的资源分布、分类方法及其代谢产物生物学功能,讨论了目前放线菌开发领域存在的问题及解决办法,以期为放线菌的开发应用研究提供参考.【期刊名称】《生物灾害科学》【年(卷),期】2019(042)001【总页数】8页(P7-14)【关键词】放线菌;次级代谢产物;资源分布;分类方法;生物学功能【作者】杨勇;李昆太【作者单位】江西农业大学生物科学与工程学院/江西省农业微生物资源开发与利用工程实验室,江西南昌 330045;江西农业大学生物科学与工程学院/江西省农业微生物资源开发与利用工程实验室,江西南昌 330045【正文语种】中文【中图分类】S476.1我国是一个人口资源众多的农业大国,农业发展具有十分重要的经济基础地位,关系着国计民生与社会稳定[1]。

然而,随着植物病害的频发,农作物生长受阻、产量和品质降低,再加上人口资源不断增加,可耕地面积急剧减少,导致全世界粮食的供给问题日益突出。

植物病害主要包括细菌、真菌和病毒性病害3种,其中真菌性病害占主导地位[2],是影响世界农作物产量的重要因素。

随着工业科学的进步,化学农药对农业生产带来巨大经济效益的同时,却也导致了诸多问题,如:环境污染、人类健康日益恶化、病虫耐药性增强和破坏生态平衡等。

这些危害的恶性循环,不仅增加了农业生产成本,破坏环境生态系统,还给病虫害防治带来了极大的困难。

微生物农药是指利用微生物及其代谢物和基因产物作为防治病虫草等有害生物、促进植物生长的生物制剂,利用其进行植物病害生防具有高效、无污染、无残留等优点,且不易产生抗性,是生物防治的重要手段[3]。

放线菌是一类(G+C)含量高的生防菌,广泛分布于自然界中,具有复杂的次级代谢系统,能产生诸多结构新颖、生物活性显著的代谢产物,是新医药和新农药研制的源头,在植物病害生防中具有重要意义。

第三章 培养基的灭菌

第三章 培养基的灭菌

ln (
K2 K `2 ) ln > ( ) K1 K `1
ln (
K `2 ) ∆E ` K `1
即随着温度的上升,微生物的死亡速率常数增加倍数 微生物的死亡速率常数增加倍数要大于培养基成分的破坏速 微生物的死亡速率常数增加倍数 率的增加倍数。也就是说, 结论1:当灭菌温度上升时, 结论 :当灭菌温度上升时,微生物死亡速率的提高要超过培养基成分的破坏速率 的增加。 的增加。 从上述的分析可知,在热灭菌过程中,同时会发生微生物死亡和培养基破坏这 两种过程,且这两种过程的进行速度都随温度的升高而加速,但微生物的死亡速率 随温度的升高更为显著。据测定,每升高10℃时一般化学反应的反应
5、过滤除菌法 、
利用过滤方法阻留微生物 适用范围: 适用范围:制备无菌空气
6、火焰灭菌法 、
火焰 适用范围:接种针、玻璃棒、 适用范围:接种针、玻璃棒、三角瓶口 酒精灯
二、湿热灭菌原理
湿热灭菌原理
由于蒸汽具有很强的穿透能力,而且在冷凝时 会放出大量的冷凝热(潜热),很容易使蛋白质 凝固而杀死各种微生物。
速率的增加倍数是1.5-2.0,而杀死芽孢为5-10,杀死微生物细 胞为35左右。 。
灭菌温度℃
灭菌时间(分) 400 36 15 4 0.5 0.08 0.01
营养成分破坏量% 99.3 67.0 50.0 27.0 8.0 2.0 1.0
再看表3-21灭菌温度、 时间与营养成分破坏量的 关系(N/No=0.001) 同样的灭菌效果
一、灭菌的原理和方法
消毒与灭菌的区别?
消毒与灭菌在发酵工业中均有广泛应用。 消毒与灭菌在发酵工业中均有广泛应用。 消毒是指用物理或化学方法杀死物料 容器、 是指用物理或化学方法杀死物料、 消毒是指用物理或化学方法杀死物料、容器、器具内 外的病源微生物。 外的病源微生物。一般只能杀死营养细胞而不能杀死细菌 芽孢。例如,用于消牛奶、 芽孢。例如,用于消牛奶、啤酒和酿酒原汗等的巴氏消毒 是将物料加热至60℃维持30min,以杀死不耐高温的 法,是将物料加热至 ℃维持 , 物料中的微生物营养细胞。 物料中的微生物营养细胞。 灭菌是用物理或化学方法杀死或除去环境中所有微生 灭菌是用物理或化学方法杀死或除去环境中所有微生 包括营养细胞、细菌芽孢和孢子。 物,包括营养细胞、细菌芽孢和孢子。 消毒不一定能达到灭菌要求, 消毒不一定能达到灭菌要求,而灭菌则可达到消毒的 目的。 目的。

蛋白酶高产菌株的筛选鉴定与酶学特性研究

蛋白酶高产菌株的筛选鉴定与酶学特性研究

蛋白酶高产菌株的筛选鉴定与酶学特性研究赵晓艳;曾志驰;穆丽丽;邓悦;王飞【摘要】以酪蛋白水解圈为筛选标记,在以酪蛋白为唯一氮源的平板上,从土壤中分离筛选到3株高产蛋白酶的菌株,经形态学鉴定和16S rRNA分析,将其分别鉴定为Bacillus sp.G1、Bacillus sp.G2、Stenotrophomonas sp.V1。

将这3株菌株的发酵液通过硫酸铵分级沉淀初步纯化后,其比酶活分别为22.21、19.10和16.03 U/mg。

菌株Bacillus sp.G1和Ba-cillus sp.G2所产蛋白酶的最适反应温度和最适反应pH值均为40℃和7.0;菌株Stenotrophomonas sp.V1所产蛋白酶的最适反应温度为70℃,最适酶反应pH值为7.5。

%Three bacteria strains producing protease were screened and isolated from soil by observation of clearing zones on casein agar plates, based on phenotypic and 16S rRNA gene phylogenetic analysis, G1, G2 and V1 were preliminary classed and named as Bacillus sp.G1, Bacillus sp.G2 and Stenotrophomonas sp.V1.Bacill us sp.G1, Bacillus sp.G2 and Stenotrophomonas sp.V1 were all aerobic strains.The proteases from Bacillus sp.G1, Bacillus sp.G2 and Stenotrophomonas sp.V1 were purified by the methods of ammonium sulfate precipitation, the specific activities of three proteases were up to 22.21 U/mg, 19.10 U/mg and 16.03 U/mg, respectively.The enzymes from Bacillus sp.G1 and G2 were optimally active at 40℃and in 20 mmol/L phosphate buffered saline buffer( PBS, pH 7.0) , and the alkaline protease from Stenotrophomonas sp.V1 was optimally active at 70℃and in 20 mmol/L PBS buffer ( pH 7.5) .【期刊名称】《江西农业学报》【年(卷),期】2016(028)004【总页数】7页(P32-38)【关键词】蛋白酶;筛选;鉴定;酶学特性;Bacillus sp.G1;Bacillussp.G2;Stenotrophomonas sp.V1【作者】赵晓艳;曾志驰;穆丽丽;邓悦;王飞【作者单位】江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045;江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045;江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045;江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045;江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045【正文语种】中文【中图分类】TQ925.2蛋白酶(Protease, EC 3.4)属于水解酶类,是最重要的三大工业用酶之一,销售额约占全球酶制剂市场的60%[1],被广泛应用于食品、酿造、医药、纺织、皮革、日用化学、洗涤剂、饲料以及水产加工等多个行业,在我国国民经济的发展中起着重要的作用[2]。

现有教学仪器设备利用情况

现有教学仪器设备利用情况

现有教学实验仪器设备利用情况江西农业大学生物科学与工程学院制药工程专业现有教学班级5个(2014、2015和2016级各1个班,2017级2个班),学生200余人。

本学院可供制药工程专业使用的教学实验仪器设备共有402台(套),总价值近850万元,其中2010年后新进仪器设备149台(套),总价值超过388万元。

目前这些新进仪器设备均处于良好的运行情况。

现将教学实验仪器设备利用情况汇报如下:一、新进教学仪器设备的具体情况江西农业大学生物科学与工程学院制药工程专业开办于2009年。

由于实验实践教学的需要,2010年后新进仪器设备较多,且大部分为制药工程专业专用仪器设备。

新进的仪器设备主要有:-86℃超低温保存箱,20L小型多功能提取浓缩回收机组,50260式动物麻醉,Biorad蛋白质纯化系统,不锈钢手提式压力蒸汽灭菌器,低速离心机,冷冻干燥机,凝胶成像系统,半干电转仪,半自动胶囊充填机,单人双面超净台,厌氧工作站,双光束紫外可见分光光度计,可见光分光光度计,台式微量离心机,垂直电泳仪,大容量冷冻恒温摇床,实验室中药粉碎机,实验室用反应釜,实验室管式离心机,对开门冰箱,小容量低温高速离心机,层析柜,平板式人工上部卸料离心机,恒压过滤实验装置,恒温振荡器,恒温摇床,恒温水浴锅,恒温金属浴,换热器传热系数测定实验装置,数控计滴自动部分收集器,旋转蒸发仪,梯度PCR仪,流体流动阻力测定实验装置,流化床干燥实验装置,混匀小精灵,熔点仪,熔点仪,片剂四用测试仪,生化培养箱,生理药理实验多用仪,电子分析天平,电子天平,电洗脱仪,电热鼓风干燥箱,电穿孔仪,立式双层大容量恒温振荡器,立式双层智能精密型摇床(恒温带制冷),紫外扫描仪,红外水分测定仪,细胞破碎仪,胶体磨,超声波清洗机,超纯水仪,酸度计,金属浴加热器,雪花制冰机,颗粒机,高速冷冻离心机,Biorad凝胶成像系统,Biorad垂直电泳槽,Biorad通用电泳仪电源,TDP单冲压片机,凝胶成像系统,大容量低速离心机,旋转蒸发仪(5L),琼脂糖水平电泳仪(小号),糖衣机,脱色摇床,Agilent气相色谱仪,Waters高效液相色谱仪,全自动凯氏定氮仪,恒压过滤实验装置,数字熔点仪,旋光仪,电子计重计数秤,电热蒸馏水器,石墨淌解仪,自动旋光仪,pH计,分析型色谱柱,制备型色谱柱,半制备梯度高效液相系统,板框压滤机,梯度混合器,真空干燥箱,自动液相色谱分析离纯化层析,冷冻干燥器,分析式色谱柱,半制备式色谱柱,半制备式高效液相色谱柱,恒温干燥箱,氢气发生器,蒸馏水发生器,一体台式机电脑,制冷/加热循环器,单冲压片机,双人超净工作台,导流型层析柱,导流型层析柱,小型微滤/超滤膜分离,数显粘度计,液萃取分离设备(管式分离机),片剂四用测定仪,生化培养箱,真空干燥箱,磁力搅拌器,糖衣机,紫外可见分光光度计,胶体磨,真空干燥箱,超净工作台和高速离心机等共114类仪器设备。

如何提升地方农业院校在区域农业经济发展中的科技协同创新作用

如何提升地方农业院校在区域农业经济发展中的科技协同创新作用

1高校协同创新的提出背景及内涵2011年4月24日,胡锦涛同志在庆祝清华大学建校100周年大会上的讲话中强调,在“积极提升原始创新、集成创新和引进消化吸收再创新能力”的同时,要“积极推动协同创新,促进高等教育与科技、经济、文化的有机结合,大力提升高等学校的创新能力,支撑创新型国家和人力资源强国建设”,第一次从国家战略的高度对产学研协同创新提出新的要求。

为了充分发挥高校在“科学技术前沿和社会发展重大问题、行业产业经济发展的核心共性问题、区域发展的重大需求以及我国社会主义文化建设的迫切需求”等方面的作用,2012年教育部、财政部决定启动实施“高等学校创新能力提升计划”(简称“2011计划”),并在2012年3月23日召开的全面提高高等教育质量工作大会上,联合颁布了《关于实施高等学校创新能力提升计划的意见》。

《国家中长期教育改革和发展规划纲要(2010-2020年)》也强调,“探索高等学校与行业、企业密切合作共建的模式,推进高等学校与科研院所、社会团体的资源共享,形成协调合作的有效机制,提高服务经济建设和社会发展的能力”。

如何提升地方农业院校在区域农业经济发展中的科技协同创新作用HowtoImprovetheRolesofLocalAgriculturalUniversityintheLocalAgriculturalandEconomicDevelopment李昆太Li Kuntai(江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌330045)(College of Biological Science and Engineering,Jiangxi Agriculture University,Jiangxi Nanchang330045)摘要:如何发挥高校在“科学技术前沿和社会发展重大问题、行业产业经济发展的核心共性问题、区域发展的重大需求以及我国社会主义文化建设的迫切需求”等方面的作用,是当前各高校在科技协同创新大背景下必须思考的论题。

三校生必学江农2016-2018各专业录取分数

三校生必学江农2016-2018各专业录取分数

496
生物工程
45
545 529
\
45
526
生物科学与工程学院
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
生物技术 生物科学
86
522 501
\
75
528 501
\
66
501
64
502
制药工程
30
527 508
\
53
500
生物科学与工程学院 汇总
236
545 501
\
228
526
轻化工程
25
516 501
\
停招
食品科学与工程学院
食品科学与工程
茶学
77
554 501
\
76
501
动植物检疫
51
520 501
\
52
493
农学院
农学 园艺
50
546 529
\
48
541 525
\
50
533
50
518
植物保护
23
539 521
\
27
514
种子科学与工程
20
521 505
\
20
491
农学院 汇总
269
554 501
\
275
533
法学
26
\
526 513
旅游管理
(茶文化与休闲旅游方
30
512 502 515 511
30
491
向) 农业水利工程
30
518 507
\
31
502
农业资源与环境
66
524 501

江西农业大学简史(附:江西农业大学历任校长)

江西农业大学简史(附:江西农业大学历任校长)

江西农业大学,前身为国立中正大学,自1940年办学至今,春秋更替,风雨沧桑,历经1949年更名的国立南昌大学,1952年以南昌大学农学院为主体成立的江西农学院和1958年创立的受到毛泽东主席高度赞扬的江西共产主义劳动大学,发展成为今天一所以农为优势,以生物技术为特色,理、工、农、经、管、文、法、教多学科协调发展的教学研究型大学。

江西农业大学至今已走过了68年的发展历程,是江西省办学历史最悠久的大学之一。

在江西农业大学各个办学时期学习和工作过的校友和同仁们,在他们所处的时代,“忠诚国家,献身教育,服务人民,建设家乡”,做出了无愧于时代的奉献。

他们做出的成绩与贡献,铸就的精神,是一笔宝贵的财富,是学校不断发展的原动力。

一、国立中正大学国立中正大学创建于1940年10月,是以蒋介石(蒋中正)的名字命名的中央教育部直属高校。

校址设在当时江西省国民政府所在地——江西省泰和县,后因战乱迁校至宁都长胜,抗日战争胜利后迁校于南昌市望城岗。

国立中正大学创办时分设三处三院一部,即教务处、训导处、总务处、;文法学院、工学院、农学院和研究部。

学校设校务委员会,由校长、“三处”处长、“三院”院长和各系主任及教授代表若干人组成,是学校最高决策机构。

1940年10月初,由国民政府任命享誉国内外的著名学者胡先肃为国立中正大学的首任校长。

胡先肃,早年留学美国,获加州柏克莱大学农学学士学位,后又出国深造,获美国哈佛大学博士学位,植物分类学家。

他在就职典礼上说,“本人治校,‘教’与‘育’并重,希望造就多数专家”,在教学方法上,“不竞务新奇,亦不拘守陈说”。

他要求:“从校长以至同学,每一个人都应有这样一个目标,就是要使本校成为国内外一个最好的大学。

”他精心擘划、筚路篮缕、励精图治,凭借他在学术界的地位和声望,请到了许多出色的教授、学者,中正大学已初步实现“名校名师”。

1944年4月胡先肃因学潮不愿开除学生自动辞职。

1944年5月,国内外著名的经济学家肖蘧教授担任校长,到校履职。

Meta分析_一种新的文献综述方法

Meta分析_一种新的文献综述方法

Meta分析_⼀种新的⽂献综述⽅法Meta分析:⼀种新的⽂献综述⽅法程新,黄林,李昆太(江西农业⼤学⽣物科学与⼯程学院,江西南昌330045)摘要:Meta分析是⼀种新的⽂献综述分析⽅法,它⽐传统的⽂献综述有更好的分析效果。

在教育学、⼼理学、医学等领域已得到⼴泛的应⽤,但是在⽣物⼯程和⽣物技术领域还较为少见。

通过实例,详细介绍了Meta分析的基本内容、分析⽅法及RevMan 软件的使⽤。

关键词:Meta分析;⽂献综述;RevMan中图分类号:G202⽂献标识码:A⽂章编号:1004-874X(2010)06-0376-03Meta-Analysis:A new method in reviewCHENG Xin,HUANG Lin,LI Kun-tai(College of Biological Science and Engineering,Jiangxi Agriculture University,Nanchang330045,China)Abstract:Meta-Analysis is a new method to synthesize literature under a same subject,it had more merits than traditional reviews,and had been widely used in Education,Psychology and Medicine,but was new in biotechnology and bioengineering.Basal conceptions and methods of meta-Analysis and RevMan software were introduced with an example in this paper.Key words:Meta-Analysis;review;RevMan在科学研究中,研究⽬的相同的试验多达⼏⼗个、⼏百个、甚⾄⼏千个。

地方本科高校生物信息学课程教学现状与改革初探

地方本科高校生物信息学课程教学现状与改革初探

地方本科高校生物信息学课程教学现状与改革初探李婷婷,陶文静,柯清林,王飞,崔立操(江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌330045)生物信息学是一门集数学、生物学及计算机学等多学科,交叉形成的新兴前沿学科,旨在利用计算机科学技术解决生物学问题[1]。

随着高通量测序技术的出现和蓬勃发展,生命科学已经迈入大数据时代,通过整合多种技术手段,发掘、解析关键基因的作用机制及调控机理已成为解决生物学问题最高效、便捷的研究方式之一[2]。

因此,系统掌握生物信息学技术原理和分析手段,是生物类专业本科生的必备素养。

自2002年起,多数院校的生物学相关专业都相继开设生物信息学课程[3],其中部分高等院校甚至开设生物信息学本科专业。

笔者根据所在地方本科院校生物信息学教学中遇到的问题,提出针对性改革建议,以期为提高课程教学质量提供一定的借鉴和参考。

一、生物信息学课程教学中存在的问题(一)师资力量薄弱,队伍建设滞后作为一门发展迅速、体系综合的交叉学科,生物信息学教师不仅需掌握数学、生物和计算机等学科专业知识,而且应具备敏锐的洞察力,把握学科发展动态,紧跟国际前沿趋势。

然而,受区位因素、经济现状及引人、落户政策的限制,地方院校对人才缺乏吸引力,大量具有专业背景的博士毕业生被一二线城市的高校、研究所及有实力的企业挖走,留任教师大都未接受过专业的生物信息学培训,知识体系不够完整,难以胜任教学任务,无法达成预期教学目标。

此外,生物信息学通常作为选修课开设,在学科建设及人才培养方案中,相关部门及领导重视不够。

(二)教学内容陈旧,教学大纲不合理生物信息学发展日新月异,其研究内容和方向也在持续不断地丰富和完善。

2010年兴起的以HiSeq平台为代表的高通量测序技术,极大地推动了生物学研究从分子水平向基因组水平的转变[4]。

在此基础上,千美元个人基因组、风险评估及精准医疗等均成为可能[5]。

然而,纵观当前可征订的教材和网络上的教学资源,仍投入大量篇幅介绍生物信息学的发展历程、数据库检索及基本算法等传统内容,有关高通量测序的基本原理、研究思路及分析工具等前沿领域知识,仅在最后章节以较小篇幅做简单介绍,教学内容明显落后。

江西农业大学生物科学与工程学院学生素质综合测评办法

江西农业大学生物科学与工程学院学生素质综合测评办法

江西农业大学生物科学与工程学院学生素质综合测评办法目录一、学生素质综合测评的指标体系和权重 (2)二、思想道德素质测评(20%) (2)1.省级、校级、院级通报表扬和批评类奖惩分标准 (2)2.校纪、团纪处分惩罚标准 (2)3.早检升旗、上课、晚自习出勤奖惩分标准 (2)三、专业素质类(60%) (3)1.日常学习奖惩分标准 (3)2.学习竞赛类、课外科技竞赛及公开发表学术论文加分标准 (3)四、身心素质测评(10%) (3)1.体育竞赛类奖惩分标准 (3)2.卫生检查类奖惩分标准 (3)五、文化素质测评(10%) (4)1.社会工作奖惩分标准 (4)2.社会实践、文艺作品及竞赛活动奖惩分标准 (5)六、综合测评要求 (5)一、学生素质综合测评的指标体系和权重注:学期综合测评分=想道德素质分×20%+专业素质分×60%+身心素质分×10%+文化素质分×10%;二、思想道德素质测评(20%)(60分≤基础分≤80分,奖励分≤20分,惩罚分≤80分)1.省级、校级、院级通报表扬和批评类奖惩分标准级别名次省级校级院级校学生会院学生会表扬 20 10 5 2 1 批评10521(注:国旗仪仗队成员每人每学期加6分) 2.校纪、团纪处分惩罚标准等级 警告 严重警告记过或撤销团内职务留校(团)察看扣分152025303.早检升旗、上课、晚自习出勤奖惩分标准(1)早检先进个人:每人每次加0.5分,5分封顶;(2)早检缺检:缺检扣0.3分/次(扣身心素质分,不封顶);学生综合素质思想道德素质(占20%)专业素质(占60%)身心素质(占10%)文化素质(占10%)基础分(60-80分)奖励分≤20分,惩罚分≤80分课程成绩平均分基础分(40-60分)基础分(40-60分)奖励分≤20分奖励分≤40分,惩罚分≤60分奖励分≤40分,惩罚分≤60分(3)升旗缺到人员:每人每次扣5分;(4)查课、晚自习缺勤人员每人每次扣2分,请假但未交请假条者每人每次扣1分。

江西庐山自然保护区大型真菌资源收集及调查

江西庐山自然保护区大型真菌资源收集及调查

江西庐山自然保护区大型真菌资源收集及调查张俊波;江可;刘祈猛;肖梦萍;胡颂平;胡殿明【摘要】对江西庐山自然保护区内大型真菌资源进行调查,共采集标本270余份,采用经典分类学与分子系统学研究方法,鉴定子囊菌门4目4科5属8种,担子菌门9目32科69属170种,合计178种;其中腐生菌78种,寄生菌3种,菌根菌97种;食用菌79种,药用菌13种,食药两用菌9种,毒菌31种;通过分离纯化共获得菌株74株.重复多次调查以及整合现有庐山大型真菌研究报道,对摸清江西省大型真菌家底具有重要意义.【期刊名称】《生物灾害科学》【年(卷),期】2018(041)004【总页数】11页(P275-285)【关键词】分类;担子菌;子囊菌;真菌多样性【作者】张俊波;江可;刘祈猛;肖梦萍;胡颂平;胡殿明【作者单位】江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045;江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045;江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045;江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045;江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045;江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌 330045【正文语种】中文【中图分类】Q949.32江西省庐山自然保护区自古以来就有“匡庐奇秀甲天下”的美誉,是我国著名的风景区和旅游圣地[1]。

地处于江西省北部,东经115°52′~116°04′,北纬29°25′~29°40′[2-3]。

北临长江,鄱阳湖东南方,长约25 km,宽约10 km,总面积达250 km2,区域内达99座山峰,主峰为大汉阳峰,海拔1 474 m[4-6]。

庐山属于东部亚热带东南季风气候,整个区域内众多湖泊,且地势陡峻,沟谷交替,致使其具有许多气候上的特征,一般山麓和低丘陵属于长江流域的湿润气候区,雨量充沛,在海拔800 m以上的丘陵则属于山地温和气候区,年均降水量在1 900 mm以上,其中在5—8月期间,占全年降水量的70%左右,年平均气温为11.4 ℃[1-2,4]。

PPC复合酶解制备海藻有机液肥工艺参数的研究(可编辑)

PPC复合酶解制备海藻有机液肥工艺参数的研究(可编辑)

PPC复合酶解制备海藻有机液肥工艺参数的研究中国雇亏曼搪 , :? 复合酶解制备海藻有机液肥工艺参数的研究刘培京 ,王飞。

,张树清中国农业科学院农业资划与农业区划研究所,北京; 江西农业大学生物科学与工程学院,南昌摘要:为了探索海藻有机液肥的酶解制备工艺,采用复合酶水解海藻生产有机液肥,对影响酶解过程的温度、、酶添加量和反应时间等主要因素分别作为单因素控制条件进行了实验,并通过正交试验得到优化工艺参数组合。

结果表明,较为理想的复合酶水解生产海藻有机液肥的工艺组合条件为:温度%,复合酶添加量. %,条件下反应时间 ,所得海藻有机液肥的海藻酸含量. / 。

关键词:复合酶;海藻;工艺参数中图分类号: . 文献标志码: 论文编号: .‘, , , ; ,: , , , , , . .:℃ . %, , . / .: ; ; 引言的各种生理机能。

海藻中所特有的海藻多糖、高度海藻肥通常是以生长在海洋中的大型速生褐藻为不饱和脂肪酸和多种天然植物生长调节剂,如植物生原料,通过化学或物理或生物的方法,提取海藻中的有长素、赤霉素、类细胞分裂素、多酚化合物及抗生素类效成分,制成具有活性物质的肥料,并提供植物生长养物质等。

这些物质具有很高的生物活性,可刺激植分。

海藻肥含有吲哚有机酸生长素、细胞激动素、赤物体内非特异活性因子的产生和调节内源激素的平衡】,能促进植物生长【】 ,提高产量 ,改善农产品霉素、植物碱以及陆生植物无法比拟的维生素维生素、维生素、维生素、余种矿物元素和种氨品质 ,用海藻肥对种子进行处理后能提高种子发芽基酸等多种天然生物活性物质,可综合调节作物生长率,促进幼苗生长。

基金项目:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金 . 。

第一作者简介:刘培京,男,年出生,北京人,助理研究员,在读硕士,主要从事新型肥料研制与废弃资源利用研究。

通信地址: 北京市海淀区中关村南大街号中国农业科学院农业资源与农业区划研究所, :?, ? : . .。

基于专业课程融合的案例式教学模式实践

基于专业课程融合的案例式教学模式实践

基于专业课程融合的案例式教学模式实践生物统计学是生物工程及其他相关专业的一门重要基础课程,主要讲授研究中常用的试验设计、统计方法以及搜集和整理、分析和解释试验结果的科学方法[1]。

掌握生物统计学的知识并运用它去解决实际工作中出现的问题,对于生物学及相关研究领域的学生来说,具有十分重要的意义[2]。

当前,生物统计学教学存在教学课时少、知识点多且分散、与实践结合不紧密、学生无法将所学内容与专业课程相联系等问题。

如果按照传统照本宣科式课堂授课模式,不仅会割裂教学内容的关联和交叉,同时也会忽视课程之间的相互促进作用,无法使学生掌握综合性分析和解决问题的能力,难以达到培养应用型创新型人才的目标。

近年来,如何提高专业课程教學效果的有关研究不断涌现。

自2015年开始,江西农业大学生物科学与工程学院开始在生物统计学课程教学中采用与专业课程相融合的案例式教学模式,即通过案例式教学将生物统计学课程中零散的知识点进行融会贯通,使学生能够通过若干教学实例综合掌握学科中所需要使用的统计方法和统计原理,缩短学习周期,提高实践能力。

同时,在案例设计中贯彻多学科交叉融合的理念,结合学生所学专业课程来设计教学案例。

此模式不仅提高了学生的学习积极性,同时也收到了促进学生专业学习的良好效果。

一、教学模式的设计与优化(一)理论教学课程的精简与优化在学生课程体系不断被修正的基础上,我院生物统计学课程的教学时间不断被压缩,其中理论课时从45个课时逐步压缩到32个课时,实验课程的时间也大大减少。

在如此短的时间内,很难完整地讲授生物统计学课程的全部内容。

为了在现有基础上实现课程教学的良好运行,我们对原有的教学内容进行了精简和优化,重新编写了教学大纲,并根据生物工程、生物技术等专业的特点,适当删除了部分与专业内容相关但不密切的内容(如非参数检验、百分数资料分析等),并增加了一些与发酵工程等专业核心课程密切相关的内容(如生物过程非线性拟合等)。

考虑到现有教材基本上都是以统计方法为授课重点,缺乏与学生专业课程的融合,我们在编写教学内容时,将部分学科前沿内容,例如转基因食品的安全评价、微生物组学大数据分析、发酵过程的数学建模等,有机地融入课程教学中,使学生能清晰地了解本课程在专业中的应用,达到了提高学生实践能力的目的。

江西大型真菌名录调查初报

江西大型真菌名录调查初报

江西大型真菌名录调查初报张俊波;宋海燕;胡殿明【摘要】报道江西省大型真菌共2门、5亚门、10纲、24目、69科、659种,其中可食用种类164种,主要调查报道地包括:峰山森林公园、齐云山自然保护区、官山自然保护区、铜拔山、武夷山自然保护区、梅岭东南麓、三清山、武功山、云居山、赣江源等10余个保护区。

【期刊名称】《生物灾害科学》【年(卷),期】2016(039)001【总页数】13页(P1-13)【关键词】蘑菇;担子菌;子囊菌;食用菌;药用菌【作者】张俊波;宋海燕;胡殿明【作者单位】江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌330045【正文语种】中文【中图分类】Q949.3张俊波, 宋海燕, 胡殿明. 江西大型真菌名录调查初报[J]. 生物灾害科学, 2016,39(1): 1­13.江西地处长江中下游南岸的鄱阳湖流域至南岭山地的范围内,气候温暖,雨量充沛,夏冬季长而春秋季短,具亚热带湿润气候特色,植被类型丰富,包括亚热带常绿阔叶林、针阔混交林、落叶阔叶树、针叶林、竹林等[1]。

优越的气候条件和丰富的植被类型使江西省成为大型真菌生长繁殖的天然温床。

然而,相对我国其他省份,江西省大型真菌资源调查工作进展非常缓慢,调查报道相对较少。

在多数省份都已经开展地方真菌志编研的背景下,江西省大型真菌迄今为止未有系统的调查研究。

江西大型真菌目录详见表 1。

江西省已知大型真菌 659 种,包括多种食用、药用种类,其中食用菌种类达到164 种,占全国已知食用菌种类 936 种[24]的 17.5%,可见江西大型真菌资源极为丰富。

然而,江西省大型真菌研究工作却相对滞后,主要问题归结如下:(1)大型真菌资源调查研究的调查面较窄。

现有研究主要调查地点包括:峰山森林公园、齐云山自然保护区、官山自然保护区、铜拔山、武夷山自然保护区、梅岭东南麓、三清山、武功山、云居山、赣江源等 10 余个保护区。

根据中华人民共和国环境保护部的数据,截止 2012年,江西省自然保护区为 200个,现有大型真菌资源报道只涉及其中的 5%左右。

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江西农业大学生物科学与工程学院
微生物学绪论练习题题(C卷)
班级:___________学号:___________姓名:___________得分:___________
题目部分,(卷面共有42题,119.0分,各大题标有题量和总分)
一、选择(9小题,共9.0分)
[1.0分]1.荷兰的列文虎克最早观察到细菌的年代是:
A.15世纪;
B.16世纪;
C.17世纪;
D.18世纪。

答:()
[1.0分]2.被誉为“细菌学奠基人”的微生物学家是:
A.列文虎克;
B.巴斯德;
C.科赫;
D.伊凡诺夫斯基。

答:()
[1.0分]3.德国医生Domagk等发现的“百浪多息”,主要用于治疗:
A.梅毒螺旋体病;
B.细菌性传染病;
C.霉菌性传染病;
D.病毒性传染病。

答:()
[1.0分]4.在微生物学史上,曾显赫一时的寻找重要病原菌的“黄金时期”发生在:
A.初创期;
B.奠基期;
C.发展期;
D.成熟期。

答:()
[1.0分]5.在人类历史上首次接种牛痘苗以预防天花并取得成功的人是:
A.Jenner;
B.Berring;
C.Ehrlich;
D.Lister。

答:()
[1.0分]6.在应用了以下某微生物作为遗传规律的研究对象后,很快就开创了生化遗传学,并提出“一个基因一个酶”的学说,这种微生物就是:
A.脉孢菌;
B.E.coli;
C.T系噬菌体;
D.酵母。

答:()
[1.0分]7.法国人Calmette因从中国的小曲中分离到一株糖化力糖强的微生物,故发明了称作“阿米露法”的酒精发酵,这种微生物就是:
A.红曲霉;
B.黄曲霉;
C.毛霉;
D.黑根霉。

答:()
[1.0分]8.大规模液体深层通气搅拌培养技术的成功是由于以下有一种发酵的推动,即:
A.谷氨酸;
B.单细胞蛋白;
C.青霉素;
D.酶制剂。

答:()
[1.0分]9.测量病毒大小用的纳米(nm)单位,其长度为:
A.10-6m;
B.10-8m;
C.10-9m;
D.10-10m。

答:()
二、填空(13小题,共33.0分)
[3.0分]1.先后发明重要化学治疗剂的学者是__A___国的_______B_________所发明的____C_______,以及___D___国的_____E_______所发明的______F__________________。

[3.0分]2.人类在未认识病原微生物之前,在世界范围内曾遭受多次瘟疫流行,例如____A_____、_____B______、_____C_____、_____D_____和____E_______等,直到今天,也还有______F______等新的严重传染病在流行。

[1.0分]3.我国古代劳动人民在应用微生物领域中的最突出贡献是在_____A________方面采用独特的_____B_____法工艺。

[3.0分]4.我国古代劳动人民在酿酒中创造许多酒曲品种,例如__A______、__B______、___C_____、_____D______、____E_______和____F________等多种。

[1.0分]5.遗传工程是生物工程的_____A_____,而微生物工程则是生物工程的______B______。

[4.0分]6.微生物学是整个生物科学中第一门具有整套自己独特操作技术的学科,这些技术如:
A._________________________________________________,
B._________________________________________________,
C._________________________________________________,
D._________________________________________________,
E.__________________________________________________,
F.__________________________________________________,
G.__________________________________________________,
H.__________________________________________________。

[2.0分]7.观察微生物的常用工具是_____A_________和_____B__________,测量其大小常用单位相应是________C______和_______D______。

[2.0分]8.微生物的种类多主要体现在以下4个方面,即_____A____________,________B________,____________C______________和_________D________________。

[1.0分]9.利用巴斯德所提出的微生物学原理创立外科消毒术的是______A____国外科医生______B__________。

[2.0分]10.微生物难以被人们所认识的主要原因是___A________,_____B______,______C______和_________D_______。

[5.0分]11.我国劳动人民在“史前期”时就在工、农、医等实践领域广泛应用了有益微生物的生命活动,例如______________A_____________、____B____、_____C____、_______D____________、_____________E_________、________F____________、__G_______、_____H_____、_____I_____和__________J____________。

[3.0分]12.微生物学史上的“初创期”是从_____A______年到_____B_____年,其特点是__________________C_____________________和_____________D___________________,本期的代表人物是_____E_____国的______F_________。

[3.0分]13.微生物的5大共性是_____A______、______ ___,______B_____、______ ______,_______C____、____________,_____D_______、____________,________E______、_______ _____。

其中尤以______F_____、___________为最重要。

三、是非(8小题,共8.0分)
[1.0分]1.我国古代先进的酿酒技艺最早是由名叫仪狄和杜康等代表人物发明的。

答:()
[1.0分]2.在酒精发酵技术——阿米露法中,所采用的糖化菌是米根霉。

答:()
[1.0分]3.微生物对环境所具有的极强适应性,与其微小的细胞体积密不可分。

答:()
[0.0分]4.人类对微生物的利用,多数是利用其细胞物质。

答:()
[1.0分]5.微生物是由全部原核类生物和部分小型真核生物所构成的一个低等生物群。

答:()
[1.0分]6.病毒是一类原核生物。

答:()
[1.0分]7.1935年,德国Domagk等直接合成了一种能治疗链球菌感染的红色的化学治疗剂——磺胺。

答:()
[1.0分]8.在工业微生物学发展过程中,厌氧纯种发酵技术要比液体深层通气发酵技术出现得早。

答:()
四、名词解释(2小题,共6.0分)
[3.0分]1.比面值(specific surface;surface-to-volume ratio)
[3.0分]2.胚种学说(germtheory)
五、问答(10小题,共63.0分)
[4.0分]1.试简介李斯特(J.Lister,1827~1912),并说明他在发展医学微生物学方面的贡献。

[10.0分]2.微生物学对生物学基础理论的研究有何重大贡献?为什么微生物可以发挥这种作用?
[8.0分]3.试举出5方面的事实来阐明微生物学确是一门“后起之秀”的前沿学科。

[8.0分]4.由巴斯德设计的著名曲颈瓶试验,有何重大的理论与实际意义?
[5.0分]5.微生物学史上的“成熟期”始于何时、何人?试简述本期的特点。

[8.0分]6.什么是生物工程(学)?它由哪5大具体工程组成?它们间的相互关系是怎样的?[4.0分]7.简述微生物在生态平衡和环境保护中的作用。

[8.0分]8.微生物界有哪几项特点可称得上是“生物界之最”?(应答10项)
[5.0分]9.如何理解“在近代科学中,对人类福利最大的一门科学要算是微生物学了”?
[3.0分]10.我们学习微生物学的根本目的是什么?。

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