RNA提取操作要领
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RNA提取
实验材料
实验耗材:1.5ml灭菌EP管、去RNA酶枪头、、高速低温离心机
试剂:Trizol、氯仿(三氯甲烷)、异丙醇、DEPC水、无水乙醇
实验步骤:
1.对于培养细胞样品:
贴壁细胞:
1)去除培养液,加PBS清洗,按照6孔板每孔加入500μl Trizol细胞裂解
液,移液枪反复吹打至细胞完全脱落后,将细胞裂解液转移至1.5ml 去
RNA EP管中(可置-80℃保存);
2)每管加入100μl氯仿(三氯甲烷),轻柔的上下颠倒混匀,冰上静置10
分钟,置12000转4℃离心15分钟;小心取出EP管,可清楚看到管内
3分层,从上到下依次为:上层无色透明液体(RNA层)、中层白色沉
淀(脂质层)、下层粉红色油状液体(苯酚-氯仿层);
3)尽可能多的取出上层无色透明液体(200~300μl)至一新的1.5ml EP管中,
若取出沉淀,需重新离心再取;
4)每管加入等体积异丙醇,振荡、混匀,4℃静置10分钟。
12000转4℃离
心10分钟,取出EP管可见下层白色沉淀,弃上清液;
5)加入500μl 75%无水乙醇(无水乙醇与DEPC水,现配现用),上下颠倒、
摇晃EP管至白色沉淀漂浮,7500转4℃离心5分钟,弃上清,75%无水
乙醇重复清洗一次。
弃上清,瞬时离心数秒,移液枪小心去除多余上清
液,打开EP管盖置超净台风干;
6)至管内白色沉淀消失完全,加20-50μl DEPC水,轻轻振荡溶解RNA。
置-80℃保存一段时间后,用NanoDrop2000测样品RNA浓度,加适量
DEPC水稀释RNA至200或500ng/μl。
2.悬浮细胞:
2000rpm离心3min收集细胞,去上清,加入PBS洗1次,离心去除PBS(尽
量去除干净),加入相应量的Trizol试剂吹打混匀。
其他步骤同贴壁细胞RNA 提取操作。
3.组织样本:
取50~100mg的组织加入1 ml Trizol试剂,用匀浆器打匀(Trizol 先放于冰上)。
其余步骤同贴壁细胞RNA提取操作。
注意事项:
1.RNA提取尽可能在冰上操作,所用器材及试剂为去RNA处理;
2.Trizol、氯仿、异丙醇、DEPC等试剂对于人体危害较大,使用过程中应注意
个人安全防护;
3.提前将离心机设置成4℃;
4.75%乙醇用无水乙醇与DEPC水配置,且现配现用;
5.在使用75%乙醇清洗完成后尽可能完全的去除乙醇液体残留,这样可以加快
样本中乙醇的完全挥发;
6.RNA在纯化过程中容易受到DNA、蛋白质及有机溶剂的影响,这些残存物
将会影响以后的操作。
光谱分析(Nanodrop)利用物质对不同波长光的吸收度的不同,可以鉴别出溶液纯度及浓度。
RNA溶液的A260/A280的比值是一种RNA纯度检测方法,比值范围一般为1.8-2.0。
7.Nanodrop使用前使用后必须用ddH2O清洗干净,且为保证测量准确使用前
必须空白调零至±0.1范围内。