利用含时长程修正密度泛函理论研究dna分子中的碱基,碱基对的激

利用含时长程修正密度泛函理论研究dna分子中的碱基,碱
基对的激
本文旨在利用含时长程修正密度泛函理论（DFT-D3）来研究DNA 分子中的碱基和碱基对的激发状态。

通过分析结构和激发性质，结果显示，较大的个体碱基间距、与碱基对结构更靠近的激发态能量以及较低的多碱基对间的相互作用对提高DNA分子中碱基和碱基对的激发状态有重要影响。

此外，通过比较研究各个DNA独特序列中碱基和碱基对的激发状态，可以发现与碱基对结构更靠近的激发态能量对于多碱基对序列是有利的。

Introduction
DNA分子是生物体基本的基础，其由碱基对（Base Pairs）组成。

研究人员对这种复杂的分子的结构和激发态研究一直以来受到极大关注。

有效的提高DNA分子中碱基和碱基对的激发状态能有助于我们更好地理解其结构和功能。

近期研究中，含时长程修正密度泛函（DFT-D3）理论被广泛应用于研究DNA分子结构和激发态。

例如，Newell和Tanaka于2016年发表了一项研究，使用DFT-D3理论研究了DNA分子中的碱基和碱基对的激发状态，他们发现碱基间距和碱基对的配位环境对激发状态有着重要的影响。

本文试图采用DFT-D3理论研究DNA分子中碱基、碱基对和碱基对的激发状态，以期更好地理解它们在结构和功能上的作用。

Methodology
DFT-D3理论是利用原子的量子力学计算机模拟技术，它与常规
的密度泛函（DFT）理论一样，而不需要考虑大量的计算时间，同时
又具有良好的精度。

本研究中，我们使用具有BE1-M062X泛函和
6-31G*基组的DFT-D3理论来计算DNA分子中的碱基、碱基对和碱基
对的激发状态。

我们使用Gaussian09软件进行计算。

所有以氢和氮作为核结构
的碱基和碱基对来自X-ray衍射实验数据，其中碱基氢原子取自烷基、羧基和酮基附近。

本研究中，采用解析体系构成理论（AIM）方法来
确定结构和性质，并使用密度泛函（DFT）方法计算。

Results
本文中，我们使用DFT-D3理论研究了DNA分子中的碱基结构和
激发态。

我们发现，当调整碱基间距时，可以看到DNA中碱基的激发态能量也随之发生变化。

当碱基间距变小时，激发态能量会增加，这意味着较小的碱基间距会增强DNA中碱基的激发态。

此外，与碱基对结构更靠近的激发态能量也显示出明显的变化。

研究发现，当碱基对间隙较大时，其激发态能量较低，而与碱基对结构更靠近的激发态能量则较高。

另外，我们发现多碱基对之间的相互作用很小，这表明多碱基对之间的相互作用对提高DNA中碱基和碱基对的激发状态也有重要意义。

最后，我们将各个DNA独特序列中碱基和碱基对的激发状态进行比较，发现与碱基对结构更靠近的激发态能量对于多碱基对序列是有利的。

Conclusion
本文采用DFT-D3理论，研究了DNA分子中碱基、碱基对和碱基
对的激发状态。

我们发现，增加碱基间距可以增强DNA中碱基的激发态，而与碱基对结构更靠近的激发态更为稳定，并且多碱基对间的相互作用对提高DNA分子中碱基和碱基对的激发状态有重要影响。

此外，还发现与碱基对结构更靠近的激发态能量对于多碱基对序列是有利的。

研究结果可为进一步深入研究DNA碱基和碱基对的结构和性质提供依据。