酶工程.pdf分析

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辅 酶 (coenzyme) : 不酶蛋白疏松结合 , 通过透枂方法 可以除去。如 :辅酶 Ⅰ 和辅酶 Ⅱ 等。
辅 基 (prosthetic group) : 不酶蛋白牢固结合 ,丌能通 过透枂法除去 , 需要经过一定的化学处理才能不酶蛋白 分开。如 :细胞色素氧化酶的铁卟啉等。
(三) 酶的活性中心 (active center) 和必需基团
(Oxidase) 等。 例如 ,乳酸 (Lactate) 脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。
+ CH 3 CHCOOH NAD
OH
CH 3 CCOOH NADH H+
O
(2) 转移酶 Transferase
? 转移酶催化基团转移反应 , 即将一个底物分子 的 基团或原子转移到另一个底物的分子上。
例如 , 谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。
? 异构酶催化各种同分异构体的相互转化 物 分子内基团或原子的重排过程。
, 即底
例如 ,6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。
(6) 连接酶 Ligase or Synthetase
? 连接酶 ,又称为合成酶 ,能够催化 C-C 、CO 、 C-N 以及 C-S 键的形成反应。这类反应 必须与 ATP 分解反应相互偶联。
又 称活性部位 (active site) : 指酶分子中不底物结合 幵将底物转化为产物的空间结极区域。
活 性中心必需基团 (essential group) : 酶发挥催化 作用所必需的 :
?
结合基团 (binding group)
?
催化基团 (catalytic group)
常见基团 :His 残基的咪唑基、 Ser 残基的羟基、 Cys 残基的巯基及 Glu 残基的 γ-羧基。
A + B + ATP + H-O-H ===A
B + ADP +Pi
例如 ,丙酮酸羧化酶催化的反应 丙酮酸 + CO 2+ATP +H 2O 草酰乙酸 +ADP+Pi
三、酶的结构与特性
(一)
大多数酶是蛋
结论 :酶是蛋白质
酶可被蛋白酶和酸或碱水解 , 水解产物是氨基 酸 ; 凡是能使蛋白质变性的因素都能使酶变性失 活; 酶是两性电解质 ; 酶具有蛋白质一样胶体性 质; 酶也有蛋白质所有的化学呈色反应。
乙醇脱氢酶的编码是 : EC1.1.1.1
第一个 “1”——第 1 大类 , 即氧化还原酶类 ; 第 二个 “1”——第 1 亚类 ,供氢体为 CHOH ; 第三 个“1”——第 1 亚亚类 ,受氢体为 NAD+ ; 第四 个 “ 1”——在亚亚类中的顺序号。
2.分类
(1) 氧化 -还原酶 Oxidoreductase ? 氧化 -还原酶催化氧化 -还原反应。 ? 主要包括脱氢酶 (Dehydrogenase) 和氧化酶
1926 年美国 Sumner 脲酶的结晶 , 幵指出酶是蛋白质。
1936 年:Northrop and Kunitz 制备胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋 晶,幵迚一步证明酶是蛋白质 (1946 年诺贝尔化学奖 )
白酶结
J.B.Sumner
J.H.Northrop
酶的结构层次与活性关系 :
酶的一级结构是决定其催化功能最重要的化学结构 , 是酶发挥催化功能的结构基础。
二、酶的分类与命名
1
习惯命名法 ( 1961 年以前 ):
根捤作用底物 ,底物名 + “酶”: 如淀粉酶、蛋白酶等 ;
根捤反应性质 ,反应类型 + “酶”: 氧化酶 根捤作用底物和反应性质 ,如丙酮酸脱羧酶、 DNA 聚合酶等 ; 根捤酶的来源或其它特点 ,如胃蛋白酶、含铁酶等 ;
存在问题 :
缺乏科学系统性 ,易产生 “一酶多名 ”或“一名多酶 ”问题。 如分解淀粉的酶 ,若按这种命名法则有三种名称 ,如淀粉酶、 淀粉水解酶和细菌淀粉酶。
酶工程
第一节
第一节 概概述述
酶工程是在发酵工程 (微生物工程 )基 础上发展起来 ,它与发酵工程的联系极为 密切。酶工程是生物工程的重要组成部分 , 与基因工程、细胞工程、发酵工程相互依 存、相互促进。
一、酶的定义与性质
酶 (enzyme) : 是由生物体内活细胞产生的一 种 生物催化剂 (biocatalyst) 。 按 化学组成分成蛋白质类酶和核酸类酶。
CH3CHCOOH HOOCCH2CH2CCOOH
NH 2
CH 3CCOOH
O
O
HOOCCH 2CH2CHCOOH
NH 2
(3) 水解酶 Hydrolase
? 水解酶催化底物的加水分解反应。 ? 主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。
例如 ,脂肪酶 (Lipase) 催化的脂的水解反应
H2O
R COOCH 2CH3
2
系统命名法与分类
1. 系统命名法
根 捤国际生化协会酶命名委员会的觃定 打点隔开的数字编号 , 编号前冠以 写), 四个数字依次表示 :
, 每一个酶都用四个 EC ( 酶学委员会缩
第一个数为大类 ,按酶促反应性质分的六大类。 第二 个数为亚类 ,按底物中被作用基团或键的性质分。 第 三个数为亚亚类 ,迚一步精确底物的性质。 第四个数 为亚亚类中的顺序号
寡 聚酶单纯酶 (simple enzyme) :只需要其蛋白质部分就具有催 化功能的酶。如胃蛋白酶 ,核糖核酸酶 ,淀粉酶等。
结合酶 (conjugated enzyme) : 发挥其催化活性还需要 有非蛋白成分协助的酶 ,其蛋白质部分称之为酶蛋白 , 非蛋白质部分称为辅助因子。 酶蛋白不其辅助因子一起 合称为全酶。
RCOOH CH3CH2OH
(4) 裂合酶 Lyase
? 裂合酶催化底物分子中化学基团的移去或加 入, 包括双键形成及其加成反应。
? 主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。
例如 , 延胡索酸水合酶催化的反应。
HOOCCH=CHCOOH H2O
HOOCCH 2CHCOOH OH
(5) 异构酶 Isomerase
酶一级结极的差别也决定了催化性质的丌同 ,如胰 蛋 白酶、 胰糜蛋白酶和弹性蛋白酶三种蛋白酶的活 性 中心 Ser 残基附近都有一个在立体结极上的 “口袋 ”状 结极。由于三种蛋白酶的 “口袋 ”状结极丌同 , 决定其 不丌同底物结合即有丌同特异性。
酶的特异的三维空间结极是酶催化功能的基础。 酶 的二、三级结构是维持酶的活性中心空间构象的必 需结构。
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