华细辛实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择

华细辛实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择
赵晓冰;潘磊;柳威;林懋怡;李宏庆;刘忠
【期刊名称】《生物技术通报》
【年(卷),期】2017(033)011
【摘要】Selecting appropriate reference gene is key step for the accurate analysis of the expression variations of target ing several common-used reference genes of SAND-1,ACT,18S rRNA,CYP2,GAPDH and TUB as candidate genes and quantitative realtime PCR analysis of gene expression,the expression stabilities of these 6 candidate genes in various samples from roots,rhizomes,leaves,petioles and flowers in different growth stages of nutrition growth,flowering and post-flowering were assessed,with a set of approaches such as
geNorm,NormFinder,BestKeeper and Delta CT,representatively.It is for screening the appropriate reference genes in analysing gene expressions ofAsarum sieboldii Miq.in varied tissues at different growth stage.The results demonstrated that 18S rRNA was the optimal object to act as a proper reference gene in this species because it displayed the most stable expression in almost all samples.This study will provide a feasible and valid calibrate not only for gene function characterization concerning chemical compound biosynthesis but also for gene differential expression analysis in A.sieboldii,ensuring the accuracy and reliability of results.%选择合适的内参基因是准确分析目标基因表达水乎变化的重要条件.选取SAND-1、ACT、
18SrRNA、CYP2、GAPDH、TUB 6个常用的内参基因作为候选内参基因,利用实时荧光定量PCR技术,通过geNorm、NormFinder、BestKeeper、DeltaCT等软件分析和评价6个候选内参基因在牟细辛营养生长期、花期和花后期等不同生长阶段的根、根茎、叶片、叶柄等不同组织中的表达稳定性,筛选适宜华细辛不同生长阶段不同组织基因表达水平分析的内参基因.结果表明,18S rRNA在华细辛所有样品中表达最为稳定,是进行华细辛基因表达水平分析的适宜的内参基因.研究结果可为华细辛重要活性成分生物合成途径相美基因的功能分析,以及基因差异表达的研究提供有效的校正工具,确保基因表达分析结果的准确性与可靠性.
【总页数】6页(P174-179)
【作者】赵晓冰;潘磊;柳威;林懋怡;李宏庆;刘忠
【作者单位】华东师范大学生命科学学院,上海200241;上海交通大学药学院,上海200240;上海交通大学药学院,上海200240;上海交通大学药学院,上海200240;上海交通大学药学院,上海200240;华东师范大学生命科学学院,上海200241;上海交通大学药学院,上海200240
【正文语种】中文
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