第九章 酶反应动力学
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5)根据Km大小,可以判断某一代谢途径的方向和途 径。GDH之NAD+ Km=2.5x10-5;NADH为1.8x10-5 对于一系列反应来说,Km大小可以判断反应的限速 步骤。 6)可用于判断反应级数:当[S]<0.01Km时,反应为一 级反应; 当[S]>100Km时,ν=Vmax,反应为零级反应; 当0.01Km<[S]<100Km时,为混合级反应。 Vmax的意义:同一种酶,但底物不同,则Vmax也不 同,并且受pH,温度,离子强度的影响。
酶促反应速度受各种因素影响:底物浓度、酶浓 度、温度、pH值、激活剂、抑制剂等。 酶促反应动力学是研究酶促反应的速度以及影响 酶反应速度的各种因素的科学。 The study of enzyme kinetics addresses the biological roles of enzymatic catalysts and how they accomplish their remarkable feats. 意义?
第一节 概念 一、反应速率:单位时间内反应物或生成 物的浓度变化,通常用瞬时速率表示反应 速率。 V=-dc/dt,负号表示反应物浓度的减小; 或v=+dc/dt 二、反应分子数:是在反应中真正相互作 用的分子数目。一般为单分子反应,2分 子反应,3分子少见,大于3分子未发现。
元素衰变,分子重排,异构体互变是单分子反应, 符合:v=dc/dt=kc,其中c为mol/l,k是比例常数,谓 之反应速率常数。单位:s-1
当S很大时,Vmax=k3[E],此时,酶被底物饱和, k3表示酶被底物饱和时,每个酶分子转换底物的 分子数,又谓之转换数(TN),又常常被称为催 化常数kcat. kcat数值越大,则酶的催化效率越高。 生理条件下,大多数酶不会被底物所饱和, [S]/Km一般介于0.01-0.1之间,根据 Vmax=k3[ET]=kcat[ET],当[S]<<Km,则有:
双分子反应很多,符合v=dc/dt=kc1c2, c1,c2分别 代表两种反应物的浓度。即与A、B成正比
三、反应级数:根据整个化学反应的速率服从哪 种分子反应速率方程式,则这个反应即为几级反 应。 如果反应速率能用单分子反应的速率方程式表示, 该反应即为一级反应;反应速率与反应物浓度无 关的反应谓之零级反应。 凡是反应速率能用双分子速率方程描述,则为二
二、酶促反应动力学方程式
1913年,德国化学家Michaelis和Menten根据中间产物 学说对酶促反应的动力学进行研究, 推导出了表示整个反应中底物 浓度和反应速度关系的著名公 式,称为米氏方程。
V=
Vmax [S] Km + [S]
1925, Briggs and Haldane修正: •根据中间产物学说,酶促反应分两 步进行:
3)根据Km=(k2 + k3)/k1,若k3<<k2时,Km=Ks,则 ES分解即为反应的限速步骤,此时,Km值表示酶与 底物之间的亲和程度:成反比关系,Km值大表示亲 和程度小,酶的催化活性低; Km值小表示亲和程度 大,酶的催化活性高。 4)如果已知Km,可以计算某一底物浓度下,反应 速率相当于Vmax的百分率,生产上,底物浓度太小, 不经济,太大浪费底物。当v=Vmax时,反应速率与 [E0]成正比,如果某一酶Km已知,则任何底物下, 酶被底物饱和百分数为: fES=v/Vmax=[S]/(Km+[S])
显然kcat/Km是E 和S反应 形成产物的二级速率常数。
3. Km和Vmax的求法,米氏方程的作图:基本原则: 将米氏方程变化成相当于y=ax+b的直线方程,再用作 图法求出Km。
By rearrangements of the M-M eq, the hyperbolic Curve can be transformed into a straight-line equation. These transformation include (1) the Lineweaver-Burk double-reciprocal plot, the best know transformation
一级反应半衰期与初始浓度无关, 与速率常数成反比。
二级反应:反应物浓度二次方或两个反应物浓度
乘积成正比的反应。最常见的反应。
二级反应半衰期与初始浓度成反比,即初始浓 度越大则半衰期越短,这是二级反应的重要特 征。 零级反应速率与初始浓度无关,半衰期与初始 浓度成正比,即初始浓度越高,则半衰期越长。
非正比 不再增加速率
底物对酶促反应的饱和现象
证据:EM和X-ray diffraction observation, 如DNA polymerase I; 荧光光谱的变化p356; 物理性质如溶解度在形成 复合物后产生变化;分 离得到胰凝乳蛋白酶和底 物复合物的结晶;透析 和超速离心证据
总的酶量
当反应速度等于最大速度一半时,即 V = 1/2 Vmax, Km = [S] 上式表示,米氏常 数是反应速度为 最大值的一半时 的底物浓度。单位是mol/L
2. 动力学参数的意义 米氏常数的意义:
1)它是酶的一个重要的特征物理常数,其大小与 酶的性质有关而与酶浓度无关。Km值只是在固定的 底物,一定的温度和pH条件下,一定的缓冲体系中 测定的,不同条件下具有不同的Km值。不同的酶具 有不同Km值,它是酶的一个重要的特征物理常数。 2)Km可以判断酶的专一性和天然底物。一个酶有几 个底物,就由几个Km,其中Km最小的底物为其最适 底物,即天然底物。
级反应。
但还需要区别对待,如蔗糖水 解: 蔗糖 + H2O 葡萄糖 + 果糖,由于稀溶液水比蔗糖多 的多,故可以视为一级反应。 故反应速率只决定于蔗糖浓度: v=kcsucrose。 四、各级反应的特征:
一级反应:反应速率只与反应物 浓度一次方成正比的反应。
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t 1/2为一般反应物转变为产物所 需要的时间,谓之半衰期
第二节 底物浓度对反应速率的影响 一、中间复合物学说 Henri 1903年蔗糖酶水解实验:酶浓度不变,改 变底物浓度,开始为一级反应,中间为混合级反 应,最后,底物浓度无论如何增加,反应速率不 再增加,为零级反应。 表明酶可以被饱和,形成 中间产物: S+E ES P+E 。 正比关系