FENE链分子相图的分子动力学研究
分子动力学 流固耦合-概述说明以及解释
分子动力学流固耦合-概述说明以及解释1.引言1.1 概述概述分子动力学和流固耦合是两个在物理学和工程领域中具有重要意义的研究领域。
分子动力学是一种模拟原子和分子在时间和空间上的运动规律的方法,通过数值计算来模拟和预测材料的性质和行为。
而流固耦合则是研究流体和固体之间相互作用的现象,包括了在流体中移动的固体物体受到的流体作用力,以及固体物体对流体流场的影响。
分子动力学和流固耦合的结合,即分子动力学流固耦合方法,能够更加全面地理解材料的性能和行为。
通过这种方法,可以研究材料在流体环境中的行为,如颗粒在流体中的运动、材料在流体中的应力和形变等。
这种研究方法在许多领域中都具有潜在的应用价值,如生物医学、材料科学、环境工程等。
本文将探讨分子动力学和流固耦合的基础理论、方法和应用,旨在深入了解这两个研究领域的关联性和重要性。
同时,我们也将展望未来在分子动力学流固耦合领域的研究方向,希望能够为相关领域的研究工作提供一定的参考和启发。
文章结构部分的内容可以如下编写:1.2 文章结构本文将分为三个主要部分,分别是引言、正文和结论。
在引言部分,我们将概括性地介绍分子动力学与流固耦合的概念和重要性,并说明本文的目的和结构安排。
在正文部分,我们将详细探讨分子动力学基础和流固耦合理论,以及它们在实际应用中的关系和作用。
最后,在结论部分,我们将总结分子动力学与流固耦合的重要性,并展望未来研究方向,以期为相关领域的研究和发展提供一些启示和建议。
通过这样的结构安排,读者可以清晰地了解本文的主要内容和逻辑脉络,从而更好地理解和掌握分子动力学与流固耦合的知识。
1.3 目的本文的目的是探讨分子动力学与流固耦合的关系,以及它们在科学研究和工程应用中的重要性。
通过深入分析分子动力学基础知识和流固耦合理论,结合实际应用案例,我们将展示二者之间的密切关联和互相促进的作用。
同时,我们也将讨论未来研究的方向,以期为相关领域的研究人员提供一些启发和参考,推动这一领域的发展和进步。
分子动力学模拟研究线型聚乙烯链在强电场中的取向行为
在 这些方法 中 , 可被 应用 到高分 子体 系且计 算结 果准 确度 和 C U时 问平衡性 较好 的是 Q q方 法. P E 本文通 过 MD模 拟对 非极性 高分 子线 型 聚 乙烯 ( E) 电场 中 的取 向行 为进 行 研 究 ,旨在 认 识其 P 在
1 2 模拟 方法 .
12 1 真 空 中 P . . E单链 电荷 分布 的计 算和取 向过程 的 MD模 拟 首先 将 长度 为 10个 C 的全 原子 5 H
收 稿 日期 : 0 00 —2 2 1-3 1. 基 金 项 目 :国家 自然科 学 基 金 ( 准 号 : 0 7 17 资 助 . 批 28 4 0 )
分子链上 电荷分布 的不均匀性.
关键 词 电荷 平 衡 法 ;聚 乙烯 ;电 场 ; 向 取 中 图分 类 号 0 3 . 6 12 3 文献标识码 A 文章编号 0 5 - 9 (0 10 -100 2 1 7 0 2 1 ) 1 8 —5 0 0
处 于 电场 中的分 子受 到静 电力 的作用 , 发生物 理性 质 的变化 .高 分子 在受 到静 电场 或交 变 电场 会 作 用 时 , 力学性 质 I、电学性 质 其 2 J 物 、 浓度 分布 及 取 向结构 等均会 发生 改变 .目前对 高分 子在 电 场 中取 向行 为 的 研 究 工 作 很 多 ,但 大 部 分 偏 重 于 极 性 高 分 子 , m 、液 晶 高 分 子 卜 及 嵌 段 共 聚 J J 而对 非极性 高分 子 涉及 不多 .也 有部 分理论 工作 对理想 化 的柔 性 链在 电场 中取 向进 行 ,
计算材料学第一性原理密度泛函理论分子动力学ppt课件
波恩-奥本海默近似
因为原子核的质量为电子的1000倍左右,因此其速度比电子慢得多; 那么,可以将电子运动分为两个部分:考虑电子运动时,原子核处于 其瞬时的位置,而考虑核的运动时不考虑电子在空间的具体分布。这 样可以将原子核与电子分离求解。
将上式代人薛定谔方程,电子部分:
哈密顿量:
23
Thomas-Fermi-Dirac近似
非自旋极化系统, 自旋极化系统,
电子气关联能的表达式,
35
交换关联函数, GGA
在L(S)DA的基础上,人们又进一步发展了广义梯度近似(GGA)。GGA 在L(S)DA的基础上,认为交换关联能 不但是电子密度的函数,而且 还是其梯度的函数。其表达式为:
--到此为止,整个过程就只有一次近似,即局域密度近似;那么这个计算 结果的正确与否就决定了LDA(GGA)的合理与否。
交换项
动能项
外场项
库仑项
丢失了很多重要的物理量,如原子的壳层信息
24
Hohenberg-Kohn 定理
定理一: 粒子数密度函数是一个决定系统基 态物理量性质的基本变量。
定理二: 在粒子数不变条件下能量泛函对密 度函数的变分就得到系统基态的能量
25
定理一
定理一: 粒子数密度函数是一个决定系统基 态物理量性质的基本变量。
33
K-S方程求解 (SCF)
求解条件:用来构造有效势的 电荷密度与解Kohn-Sham方程 得来的电荷密度一致。
解Kohn-Sham方程,这一步 计算量最大,里面需要用到许 多技巧,比如平面波展开,赝 势等。
SCF:自洽求解
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交换关联函数, LDA
交换关联势在意义上是非局域的,我们前面提到这一部分包含两部分 交换相互作用和关联作用(即是有相互作用粒子和无相互作用粒子的
AMBER分子动力学简例
AMBER分子动力学简例AMBER分子动力学简例(一)概述以下是使用AMBER包的简单教程,希望对开始学习分子动力学的同学有用处。
申明一下,以下教程原版来自网上,是最最基本的教程,同时也非常实用,有非常好的借鉴意义。
AMBER分子动力学程序包是加州圣弗兰西斯科大学(University of California San Francisco,UCSF)的Peter A Kollman和其同事编的,程序很全,现在已经发展到版本9.0。
AMBER功能涵盖种类非常多的生物分子,包括蛋白、核算以及药物小分子。
软件详细情况请浏览.以下是AMBER软件包中四个主要的大程序:Leap:用于准备分子系统坐标和参数文件,有两个程序:xleap:X-windows版本的leap,带GUI图形界面。
tleap:文本界面的Leap。
Antechamber:用于生成少见小分子力学参数文件的。
有的时候一些小分子Leap程序不认识,需要加载其力学参数,这些力学参数文件就要antechamber生成。
Sander:MD数据产生程序,即MD模拟程序,被称做AMBER的大脑程序。
Ptraj:MD模拟轨迹分析程序。
学习项目本教程研究的题目是脑下垂体荷尔蒙之一的oxytocin,需要X光衍射晶体结构文件1NPO.PDB。
该文件包含了该荷尔蒙和其运载蛋白的复合物,可以从蛋白数据库下载。
PDB文件是不包含氢原子的,Leap程序会自动的加上PDB文件缺少的东西。
当第一次使用PDB文件的时候,要十分留意文件包含的信息,所以PDB文件缺少的残疾、侧链或者添加的变异都在这个地方记录。
可以用文本阅读程序阅读PDB文件头部的信息,即以REMARKS开头的信息文本行。
PDB一个重要的信息是SSBOND记录,该记录说明结构中二硫键的位置,这样的信息在使用Leap程序建立分子结构的时候需要。
在本教程中,我们将比较oxytocin在真空和溶液中分子动力学的差异,如果没有二硫键,将影响整个结果。
分子动力学析出相
分子动力学析出相分子动力学析出相是一种重要的物理理论,一般用于研究分子或原子的运动,也可以用于研究固态物质的相态。
史上,分子动力学析出相已经发挥了重要作用,因为它引发了数学、物理和其他领域的发展,并且已创造出许多新的实验结果和数据,为物理学的理论提供了一个新的方向。
第一部分:理论分子动力学析出相的基本思想是在具有一定形状的容器中,不同的原子和分子以一定的动能形式移动,这会导致系统的相变。
于析出相的研究,需要将稳定的时间均衡理论与瞬态研究结合起来,以求得具有实际意义的结果。
稳定时间均衡理论以Maxwell-Boltzmann分布为基础,它描述了不同动能下原子或分子的分布情况。
于这一理论,可以推算出在一定条件下,原子或分子之间在特定空间体积内的反应和分布规律。
瞬态研究是指在特定时间间隔内,原子或分子之间的反应和物质结构变化。
于这一理论,可以推算出原子或分子之间在各种条件下的相变,并以此为基础推断出适合局部相变的参数,从而可以预测整体的系统状态。
第二部分:方法为了探究分子动力学析出相的本质,必须使用有效的实验方法,并以此结果作为基础来分析和验证分子动力学析出相的理论。
前,许多实验室及研究机构都采用了以下几种实验方法来研究分子动力学析出相:(1)热力学分析法:通过热力学分析,可以确定分子析出的相的形状、尺寸、组成等,同时确定析出相的形状、尺寸、组成等参数;(2)控制变量法:可以调节温度、压力、添加剂等变量,来控制分子析出相的形状及结构;(3)系统性研究法:通过不同析出条件及析出时间、析出环境等变量,可以确定不同析出情况下的分子动力学析出相;(4)后处理法:通过对实验数据进行分析,可以获得分子析出相的相第三部分:成果经过多年的研究,分子动力学析出相已经取得了很大的成果,其中包括有关体系结构、组成、相变条件等的理论研究,也包括了对实验研究成果的验证和运用。
举例来说,根据分子动力学析出相的理论,研究人员通过实验发现,高压、高温条件下,海水中的某些离子可以凝结成“气液”的析出相。
聚14-丁二烯分子链导热性能的分子动力学模拟
r e l a t i o n s h i p b e t we e n t he r e c i p mc a l t h e r ma 1 c o n d u c t i v i t y a n d r e c i p r o ca l c h a i n l e ng t h.
t h e r ma l c o n du c t i o n p r o c e s s o f c i s 一1. 4 一p o l y b u t a di e n e i S e x pl o r e d.T he s i mu l a t i o n r e s u l t s s ho w t ha t t h e t he r ma l
Ab s t r a c t Ru b b e r c h a i n s t e n d t o o r d e r e d a r r a n g e me n t a n d c r y s t a l l i z a t i o n i n t h e ma e h i n i n g p r o c e s s ,a n d t h i s o r i e n t a t i o n
c i s 一 1 , 4 一 P o l y b u t a d i e n e ( c i s 一 1 , 4 一 P B)
Ya n g L u x i a
( S c h o o l o f I n f o r ma t i o n , B u s i n e s s C o l l e g e o f S h a n x i Un i v e r s i t y , S h a n x i T a i y u a n 0 3 0 0 3 1 )
c o nd u c t i v i t y i nc r e a s e s a s t h e c h a i n l e n g t h i n c r e a s e s .a n d t h e n t h i s t r e n d i S g r a du a l l y s l o w. I t i S f o u nd t ha t t h e r e i S a 1 i n e a r
基于分子动力学方法模拟聚合物稀溶液喷泉流动
Modeling and Simulation 建模与仿真, 2023, 12(2), 1058-1068 Published Online March 2023 in Hans. https:///journal/mos https:///10.12677/mos.2023.122100基于分子动力学方法模拟聚合物稀溶液喷泉 流动柴茂轩,曹 伟,申长雨郑州大学橡塑模具国家工程研究中心,河南 郑州收稿日期:2023年1月22日;录用日期:2023年3月9日;发布日期:2023年3月16日摘要本文基于分子动力学原理利用FENE 哑铃模型对聚合物稀溶液流动前沿喷泉效应开展数值模拟。
利用欧拉法求解力学模型在简单剪切流场下的构型方程和哑铃分子的位形方程,获取示踪流线和流动前沿哑铃分布,计算应力场,分析流变演化规律,研究温度和剪切速率等参数对该模型的影响,分析FENE 哑铃分子模型模拟喷泉效应的有效性。
结果表明,在喷泉效应的作用下,随着剪切速率的升高哑铃分子的伸展变大,流动前沿聚合物应力会出现应力过冲,随后趋于稳定的复杂变化,哑铃分子沿喷泉流线取向。
关键词喷泉效应,FENE 哑铃模型,流变,流动前沿Simulation of Fountain Flow Based on Molecular Dynamics MethodMaoxuan Chai, Wei Cao, Changyu ShenNational Engineering Research Center for Advanced Polymer Processing Technology, Zhengzhou University, Zhengzhou HenanReceived: Jan. 22nd , 2023; accepted: Mar. 9th , 2023; published: Mar. 16th , 2023AbstractIn this paper, numerical simulations of the fountain effect on the flow front of polymer dilute solu-tions are carried out based on molecular dynamics principles and the FENE dumbbell model. The Euler method is used to solve the constitutive equations of the mechanical model for the simple shear flow field and the dislocation equations of the dumbbell molecules, and subsequently obtain柴茂轩等the tracer flow lines and the dumbbell distribution of the flow front. The results are used to calcu-late the stress field, analyze the rheological evolution law, study the effect of temperature and shear rate and other parameters on the model and analyze the effectiveness of the FENE dumbbell molecular model for the fountain effect. The study shows that due to the fountain effect, the dumb-bell molecules stretch more with increasing shear rate, the polymer stress at the flow front will show a complex change of stress overshoot and then stabilize, and the dumbbell molecules are oriented along the fountain flow line.KeywordsFountain Effect, FENE Dumbbell Model, Rheology, Flow FrontThis work is licensed under the Creative Commons Attribution International License (CC BY 4.0)./licenses/by/4.0/1. 引言大多数聚合物溶液都属于黏弹性流体,对黏弹性流体的研究关键在于确定聚合物的微观信息,采用传统的连续介质力学方法无法得到聚合物分子微观运动的信息,为了得到聚合物分子微观运动信息,可以采用聚合物分子力学模型来探究高聚物体系的流变性能,从而揭示分子的微观结构与形态,以及和宏观流变性能之间的内在联系。
07高分子物理课件第五章非晶2最终
松弛
松弛过程:高聚物分子从一种非衡态过 渡到一种平衡态需进行的过程,这个过 程进行的快慢可以用一个随时间变化的 物理量A(t)来表示,通常有:
A(t ) A0 e
t /t
松弛时间(Relaxation time) t :物理 量A(t)变到A0/e时所需的时间
意义: 高弹形变的恢复过程也是一个松弛过程: 柔顺性好,恢复得快,柔顺性差,恢复就 慢; 温度高,恢复得快,温度低,恢复就慢。 高聚物流动的这个特点,在成型加工 过程中必须予以充分重视,否则就不可能 得到合格的产品。
弹性:分子链构象不断变化 高聚物流体 黏性:流动中分子链相对移动 —— 非牛顿流体
非牛顿流体的流变行为用幂律方程表示
n = 1, 牛顿流体 n > 1, 膨胀性流体
n与1相差越大, 偏 离牛顿流体的程 度越强
K, n = const.
n < 1, 假塑性流体
零切黏度(η 0):剪切速率趋于零时的流体黏度,又称为零切 速率黏度。此时非牛顿流体可表现出牛顿性。
表观黏度的特点:聚合物的流动过程中同时含有不 可逆的黏性流动和可逆的高弹形变,总形变增大, 牛顿黏度指的是不可逆的黏性流动部分,因而表观 黏度比牛顿黏度小 表观黏度大,流动性小;表观黏度小,则流动性大
表观黏度和剪切速率的关系
Ideal Bingham liquid 假塑性流体 Newton liquid 膨胀性流体
蛇形与管道模型的结合
De Gennes 借用Ewards管道概念提出:高分子链在 管道中以蛇行的方式前进或后退,创造出一段新的 管道,同时,旧的管道消失。
5.4度Tf是高聚物重要的工艺参数
Tf < 加工成型温度 < Td(分解温度)
高分子物理3-1高分子链的聚集态结构
2—3 高聚物的非晶态结构
完全无序 (Flory) 无规线团模型
局部有序 (Yeh) 两相球粒模型
无规线团模型(实验依据)
X光小角散射测得:PS分子在本体和在溶液中 均方旋转半径相近表明分子链具有相近的构象 在非晶高聚物的本体和溶液中,分别用高能辐 射交联,结果两者交联的倾向相同。 表明并不存在排列紧密的局部有序结构 中子小角散射的实验结果也证实了非晶高聚物 形态是无规线团
内聚能: △E = △Hv – RT 内聚能密度:CED = △E / V △E为1moL分子凝聚体汽化时所吸收的能量 (克服分子间的作用力) V为1moL分子体积
次价力的作用强度~主价力的1/10 次价力的作用强度与分子量有关 分子量很大时化学键会先发生断裂
次价力的影响
CED<70 cal/cm3 (290J/cm3 ) 分子链间相互作用小 分子链柔软、宏观为橡胶材料 CED>100 cal/cm3 (400J/cm3 ) 分子链间相互作用大 分子链硬、宏观为纤维材料 CED 介于之间、宏观为塑料
第三章 高分子链的聚集态结构
高聚物分子间的相互作用 晶态高聚物的结构特征 高聚物的结晶过程 高聚物的结晶度及其测定 高聚物的结晶热力学 高聚物的取向态结构 共混高聚物的织态结构
§ 1 高聚物分子间的相互作用
主价力(化学键联结) 相互作用 次价力(范德华力和氢键)
次价力——非键合原子或基团间的作用力
Avrami方程
t = 0 时 Vt = V0
则有C = 0
t → ∞ 时 Vt = V∞ 则有C = 1(100%)
多组分聚合物体系相分离动力学的研究(理科)
博士掌位论文线型ABC三嵌段高分子散相分离机理相,柱状相,双连续相以及层状相【l”。
对于三嵌段共聚高分子来说,存在着比两嵌段共聚高分子更多以及更加复杂的形态,例如层状相.球状相相间相,层状相.柱状相相间相,以及编织相【1w…。
然而,三嵌段共聚高分子的微相分离机理直到现在仍然未见报道。
显然对于三嵌段共聚高分子,由于共价键相连而导致的嵌段间的长程相互作用和由于化学性质不同而导致的嵌段问短程相互作用之间的竞争要比两嵌段共聚高分子复杂的多。
当熔融无序的线型的ABC三嵌段共聚高分子淬冷下来时,可能的相分离机理为一步相分离和两部相分离,如图2.1所示。
如果在淬冷后,三嵌段共聚高分子的三个嵌段同时分离,我{f1认为这是一步相分离机理,以MI符号表示。
而当其中的一个嵌段先于其他的两个嵌段分离,然后才是余下的两个嵌段之间的分离,我们把这个机理称为两步相分离机理,用符号M11表示。
对于第二步机理,按照组成和嵌段之间的相互作用,我们可以迸一步的划分为三个机理,M1IA,MlIB,Mttc。
三嵌段共聚高分子中的两步相分离机理的重要意义在于每个嵌段的可控的自组装能够实现,有利于对嵌段进行不同的功能化修饰。
MDl”rd口埘ph∞oOrder蝴puaseABCFigure2.1Schematicillustrationofpossibleorderingmechanismsforthedisorder-to—ordertransitioninlinearABCtriblockcopolymermelts.Forone.steDorderingmechanism,Mz,thethreecomponentsseparatesimultaneously.Thetwo—steporderingmechanismisclassifiedintothreesub.types:inMII^andMIIConeendofthetriblock(eitherAorC1separatesfromtheothertwoblocksfirst,followedbysegregationof血eresttwoblocks;inMtmthemiddleblockBseparatesfromthetwoendblocksfirst,thensegregationofthetwoendblocksoccurs.Threedifferentcolors.blue,green,andred,areassignedtoA,B,andCblocks。
第五章 高聚物的分子运动和热转变
第五章 高聚物的分子运动和热转变
第二节 高聚物的力学状态和热转变
高聚物的温度形变曲线
非结晶性高 聚物的温度 -形变曲线
第五章 高聚物的分子运动和热转变
第二节 高聚物的力学状态和热转变
非结晶性高聚物的温度形变曲线解释
(1) 玻璃态下,由于温度较低,分子热运动 的能量很低,链段处于被“冻结”的状态, 仅有分子键长、键角的变化,形变量很小, 约0.1%—1%,难以用肉眼观察,且为可逆 的普弹形变。常温下处于玻璃态的高聚物通 常用作塑料,如PS、PMMA等。
第五章 高聚物的分子运动和热转变
第五章 高聚物的分子运动和热转变
第一节 高聚物分子运动的特点
1. 分子运动单元的多重性
几种主要运动单元示意图
第五章 高聚物的分子运动和热转变
第一节 高聚物分子运动的特点
1. 分子运动单元的多重性
1) 整个分子链的运动 大分子与大分子间产生相对滑移,如熔体 流动,溶液中分子从聚集到分散。
4 原子在平衡位臵附近的振动 5 晶区的运动 包括晶型的转变、晶区缺陷的运动、折 叠链的“手风琴式”运动。
小尺寸运动单元 (链段尺寸以下)
多种运动方式
大尺寸运动单元 (链段尺寸以上)
第五章 高聚物的分子运动和热转变
第一节 高聚物分子运动的特点
2. 分子运动单元的时间依赖性
松弛特性: 具有时间依赖性的性质。 松弛时间: 在外立场作用下,物体从一种平衡态通 过分子运动而过渡到另一种平衡态所需要 的时间。
2) 链段运动 在整个大分子中,部分链段由于单键内旋转而 相对于另一部分链段做独立运动,使大分子卷曲 或扩张。如橡皮的拉伸、回缩过程。 3 支链、链节、侧基等尺寸小的单元的运动 链节的曲柄运动、侧基的转动和振动。
分子动力学von_mises_解释说明
分子动力学von mises 解释说明1. 引言1.1 概述本篇文章旨在探讨分子动力学中的von Mises解释说明,并着重介绍分子动力学在材料科学领域的应用以及与实验的对比与验证技术。
通过深入研究分子动力学的基本原理、动力学模拟方法和Von Mises解释说明,我们可以更好地理解和预测材料的力学性质、界面和缺陷行为,提高新材料设计与优化方法的效率。
1.2 文章结构本文分为五个主要部分:引言、分子动力学、分子动力学在材料科学中的应用、分子动力学与实验的对比与验证技术以及结论与展望。
每个部分将详细介绍相关领域的概念、原理、方法和未来发展趋势。
1.3 目的本文旨在给读者提供关于分子动力学和von Mises解释说明的全面了解。
通过介绍该领域在材料科学中广泛应用的具体案例,并对其与实验结果进行对比和验证,我们希望读者能够认识到分子动力学方法在材料科学中的巨大潜力,并了解未来机器学习方法在该领域的应用前景。
最终,我们希望本文能够为相关领域的研究者提供指导和启发,促进分子动力学在材料科学中的进一步发展。
2. 分子动力学:2.1 基本原理:分子动力学是一种计算方法,用于模拟原子和分子在时间和空间上的运动轨迹。
它基于牛顿力学定律和统计物理学的原理,通过求解粒子之间相互作用力的方程来描述系统的演化过程。
在分子动力学中,系统中的每个粒子(如原子)都被视为一个质点,并根据其质量、位置和速度来描述。
通过定义势能函数,可以计算出粒子之间的相互作用力。
然后使用数值积分方法,如Verlet算法或Leapfrog算法,来求解Newton第二定律的微分方程。
通过不断更新各个粒子的位置和速度,就可以模拟出系统随时间演化的情况。
2.2 动力学模拟方法:在分子动力学模拟中,需要确定体系中原子或分子之间相互作用所遵循的势能函数。
常见的势能函数包括Lennard-Jones势、Coulomb势、键角势等。
这些势能函数可以根据实际问题进行选择和调整。
均四嗪热分解机理的从头算分子动力学模拟及密度泛涵理论研究
文章编号:100629941(2006)0620421204均四嗪热分解机理的从头算分子动力学模拟及密度泛涵理论研究熊 鹰1,舒远杰1,周 歌2,王新锋1,田安民2(1.中国工程物理研究院化工材料研究所,四川绵阳621900;2.四川大学化学院,四川成都610064)摘要:运用从头算分子动力学(A I M D )方法对均四嗪分子的热分解轨迹进行了模拟,用密度泛涵理论在B3LYP /62311G (d,p )水平下计算了极小点和过渡态的几何结构和能量性质。
然后在多种理论水平下(包括B3LYP /62311+G (2df,2p )、G3MP2B3、G3B3、CCS D (T )/62311G (d,p )、CCS D (T )/62311+G (2df,2p ))计算了反应物、产物和过渡态的单点能,并运用微正则变分过渡态理论(μVT )计算了均四嗪的热分解反应速率常数,得到较为准确可靠的反应信息。
研究结果表明:均四嗪分子的热分解机理为协同的三键断裂,生成1个N 2和2个HCN,此机理与均四嗪的光分解机理一致。
关键词:物理化学;均四嗪;密度泛函理论(DFT );从头算分子动力学(A I M D );热分解机理中图分类号:T J55;O643.1 文献标识码:A收稿日期:2006207206;修回日期:2006209201基金项目:国家自然科学基金2中物院NS AF 联合基金(No .10576030)作者简介:熊鹰(1978-),女,在读硕士,主要从事含能材料的相关理论计算研究。
e 2mail:bearha wk1@ 通讯联系人:舒远杰,研究员,syjfree@s ohu .com1 引 言四嗪是一类含四个氮原子的六员杂环化合物,在三种同分异构体中均四嗪(1,2,4,52四嗪,或s 2四嗪)最稳定。
1900年德国化学家Hantgsch 首先合成了s 2四嗪,20世纪50年代后人们发现此类化合物有很好的生物活性,可以用做杀虫剂、除草剂,还有抗菌、抗肿瘤的作用[13]。
天然橡胶热解行为的分子动力学模拟研究
天然橡胶热解行为的分子动力学模拟研究作者:魏鑫张正林杨启容赵之端来源:《青岛大学学报(工程技术版)》2018年第01期摘要:为了了解天然橡胶热解过程及其热解产物,本文基于AMBER力场,对聚合度为10的橡胶模型的热解过程进行分子动力学模拟。
建立周期性边界条件,分子力场采用谐振子模型计算键角弯曲能和键伸缩能,并通过Hyperchem软件进行热解模拟。
模拟结果表明,在低温加热过程中,原子内部结构发生了一些物理变化,原子之间的键长变大,键角变得弯曲,原子间二面角增大,但由于范德华力与静电的限制,没有出现化学键的断裂;当温度达到600 K 左右时,分子键会发生断裂,形成各种大分子碎片,产物主要以液态油形式存在,粘性大,随着温度进一步升高,大分子碎片会分解成小分子碎片,气体产物增加,粘性变小。
由此说明,温度对橡胶产物的影响较大,不同的温度下所获得的产物不同,因此,可以通过控制温度来获得所需的物质。
该研究对于回收利用废橡胶具有重要意义。
关键词:天然橡胶;分子动力学模拟;热解;产物机理; AMBER力场中图分类号: TK124; O357.5+3文献标识码: A通讯作者:杨启容(1970),女,博士,教授,主要研究方向为能源开发与利用中的传热传质,Email: luyingyi125@随着经济及汽车工业的发展,我国汽车保有量呈快速增长趋势,每年产生的废旧轮胎以8%~10%的速度急剧增加,成了一种新的污染——“黑色污染”[1]。
由于橡胶属于热固性聚合物材料,在自然条件下很难发生降解,填埋的废橡胶不易腐烂。
废轮胎堆积在一起也会滋生蚊虫,危害居民的身体健康,容易发生火灾,释放大量的SO2、CO等有害气体及Pb、Zn等重金属污染物,而且在天然橡胶少的国家,生产轮胎需要消耗大量原油,废轮胎也具有很高的发热量(31 kJ/kg)[2]。
因此,回收利用废橡胶意义重大。
目前,废旧轮胎的再利用方式有轮胎翻新、再生胶、胶粉制造和废旧轮胎的热裂解4种[3]。
4 聚合物的分子运动
多种运动方式
小尺寸运动单元 (链段尺寸以下) 大尺寸运动单元 (链段尺寸以上)
分子运动单元
•链段的运动——主链中碳-碳单键的内旋转,使得高
分子链有可能在整个分子不动,即分子链质量中心不变 的情况下,一部分链段相对于另一部单元
•侧基的运动——侧基运动是多种多样的,如转动,内
分子运动机制:整个分子链解冻,可以运动,使 高分子链质量中心发生位移的运动
模量的高低、运动能力的大小与运动单元有关
玻璃态
橡胶态
粘流态
运动单元 小单元
链段
整链
模量
~109Pa
~105Pa
<103Pa
运动能力 难变形 小应力大形变 流动
故此三态称为运动状态
4.两个转变
A: Glass transition 玻璃化转变:玻璃态和高弹 态之间的转变。对应的温度为Tg
以六次甲基四胺(乌洛托品)固化酚醛树脂的温 度-形变曲线:
形
变
只有粘流态(2%固化剂含量)
只有高弹态(3%)
高弹态变小(5%)
高弹态消失(11%)
温 度
三、 聚合物 次级弛豫
• 高分子的玻璃化转变和结晶熔融转变称为主转变,玻璃化转变的 内耗峰记作α松弛;
• 低于主转变温度以下的其他松弛统称为次级松弛,并依据出现的 内耗峰的温度高低依次标记为β、γ、δ松弛。
不同支化度聚乙烯的松弛转变212223tg橡胶名称7050120顺14聚丁二烯10570140丁苯橡胶75256050140聚异丁烯7050150聚2氯丁二烯含14反854535180丁腈橡胶70304135175乙丙橡胶50506040150聚二甲基硅氧烷12070275偏氟乙烯全氟丙烯共聚物55503001将试样先装入安培瓶中2然后抽真空3将水银或与试样不相溶的高沸点液体充入瓶中至满液面达到细管内一定高度4用水浴或油浴以每分钟12的升温速度加热安培瓶同时记录温度和毛细管内液面高度聚合物样品受热体积要改变使毛细管内液体高度发生改变作液面高度温度曲线图曲线转折处的温度即为t温度液面高度h液面高度液面高度温度曲线图温度曲线图dscdscmin185kgcm12015mm021mm22foxfloryfoxflory温度t曲线在tg处发生转折wlfmlwilliamsrflandeljdferry红线平衡线测不出冷却速度无限长pe
《分子动力学》课件
它基于经典力学原理,采用数值方法 求解分子体系的运动方程,模拟分子 的运动轨迹和相互作用,从而得到体 系的宏观性质和微观结构信息。
分子动力学的发展历程
分子动力学的起源可以追溯到20世纪50年代,当时科学家开始尝试使用计算机模拟 分子体系的运动行为。
随着计算机技术和算法的发展,分子动力学模拟的精度和规模不断得到提高,应用 领域也日益广泛。
详细描述
水分子动力学模拟可以揭示水分子在不同环境下的动态行为,例如在生物膜、催化剂表面或纳米孔中 的水分子行为。通过模拟,可以深入了解水分子与周围物质的相互作用,从而为理解生命过程、药物 设计和纳米技术提供重要依据。
蛋白质折叠模拟
总结词
预测蛋白质的三维结构
详细描述
蛋白质折叠模拟是利用分子动力学模拟预测蛋白质的三维结 构的过程。通过模拟蛋白质在溶液中的动态行为,可以预测 其可能的折叠方式,从而为理解蛋白质的功能和设计新药物 提供帮助。
目前,分子动力学已经成为材料科学、化学、生物学、药物设计等领域的重要研究 工具。
分子动力学模拟的应用领域
01
02
03
04
材料科学
研究材料的力学、热学、电学 等性质,以及材料的微观结构
和性能之间的关系。
化学
研究化学反应的机理和过程, 以及化学键的性质和变化规律
。
生物学
研究生物大分子的结构和功能 ,以及蛋白质、核酸等生物大
高分子材料模拟
总结词
优化高分子材料的性能和设计
VS
详细描述
高分子材料模拟利用分子动力学模拟来研 究高分子材料的结构和动态行为。通过模 拟,可以深入了解高分子材料的性能和行 为,从而优化其性能、提高稳定性或开发 新型高分子材料。这对于材料科学、化学 工程和聚合物科学等领域具有重要意义。
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而任意两个链节点的作用则为 12-6 的 lennard-Jones 相互作用
σ σ φ (rij ) = 4ε [( )12 − ( )6 ]
rij rij
为体现相图的普适性,采用了约化单位(reduced units),并以粒子半径σ,粒子 间相互作用能量ε和粒子质量 m 作为基本单位。 模拟方法与过程简述如下:首先,两个箱中分别均匀放置 N 个链分子,链的 5 各节点初始速度由 Maxwell-Bolzmann 分布给出。然后每个箱进行 10 步 NVT 模 拟(无链分子交换) ,以消除模型建构中形成的局部不平衡。接着允许链分子交 换,进行 MD 模拟。模拟箱中的粒子(各个链节点)位移由作用的运动方程决定, 在三维周期性边界条件下,力与势能的计算采用最小镜像约定[2,3]。粒子速度及 位置的改变由差分法求解牛顿方程来实现,为保证模拟的稳定性,采用了跳蛙算 [3] [4] 法 (leap-frog algorithm)及 Berendsen 热浴及压力浴弱耦合方法 。每 2000 步模拟,被允许可以进行一次链分子的交换,以确保在链交换前模拟箱各自已达 到平衡。链的交换由两箱中链分子的化学势决定(每次交换,从化学势大的箱中 随机选择一条链移入另一箱中) 。这里,我们用 Rosenbluth 方法来计算链分子的 [5] 化学势 。 模拟计算了不同链长 n = 2 到 n = 10 下的链分子相图。Fig.1 给出了 n = 4
临界温度 Tc 随链长的变化有一定的的标度关系。实验和理论都表明,在临界 温度和链长之间有一标度关系
1 1 1 ∝ + Tc n 2n
模拟的结果与实验和理论吻合的很好。 致谢:国家自然科学基金面上项目 (50373044) 、重大项目( 20490220 ,
50390090) ,重大基础研究前期研究专项(2002CCAD4000),中国科学院院方向性 项目 (KJCX2-SW-H07) 和 973 国家重点基础研究发展规划项目 (2003CB615600) 。
2.4
Tc
2.3
2.2
T
2.1 2.0 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6
ρ
Fig. 2 Phase diagram of n = 4 chain. Squares: phase of liquid and gas; Triangles: average densities; dashed line: fitted the law of rectilinear diameters; solid circles: the estimate of the critical point. solid line: the fitted scaling law diagram.
FENE 链分子相图的分子动力学研究
欧阳文泽 1 孙昭艳 1 吕中元 2 安立佳 1 (1 中国科学院长春应用化学研究所高分子物理与化学国家重点实验室,长春, 130022)
2 ( 吉林大学理论化学研究所,理论化学计算国家重点实验室,长春,130023)
利用计算机模拟方法研究流体的气液相图,在科学及工业上都有着重要的意 义。模拟相图一般有几种方法:传统的模拟方法,它要求体系包含大量粒子,并 且对每个状态点都要进行单独的模拟,因此从算法的角度来看,非常不经济;吉 布斯系综蒙特卡罗方法(GEMC) ,该方法中某一给定温度下的气液相平衡可以利 用一次模拟直接完成,使计算时间大大缩短;与 GEMC 相对应的分子动力学模拟 方法,使之具有 GEMC 的优点并且可以描述体系的动力学。 本文中我们采用了一种链分子输运的分子动力学方法来模拟计算链分子的 相图。在模拟中,我们的链分子模型为珠簧模型(bead-spring model),即把链 分子看成一个个被弹簧连接的接点, 键作用即同一条链内相邻的链节点间的作用 [1] 用 FENE(finitely extensible nonlinear elastic)来描述 ,
0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0.0 0.0
ρHale Waihona Puke 0.51.01.5
2.0
t / 106
Fig.1 Time dependence of reduced densities ρ in each box for n =4, T = 2.2 over the course of the entire simulation. Solid line: density of gas box; dotted line: density of liquid box.
参考文献 1. Bishop M., Kalos M. H., Frisch H. L., J. Chem. Phys., 1979, 70, 1299. 2. Allen M. P. and Tildesley D. J., Computer Simulation of Liquids, 1987, Clarendon Press, Oxford. 3. Rapaport D. C., The Art of Molecular Dynamics Simulation, 1995, Cambridge University Press, Cambridge. 4. Berendsen H. J. C., Postma J. P. M., van Gunsteren W. F., Dinola A. and Haak J. R., J. Chem. Phys., 1984, 81, 3684. 5. Frenkel D., Mooij G. C. A. M., Smit B., J. Phys.: Condens. Matter, 1991, 3, 3053. 6. Frenkel D. and Smit B., Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to Applications, 1996, Academic Press, San Diego. 7. Siepmann J. I., Karabornl S. and Smit B., Nature, 1993, 365, 330.
下的链分子在 T = 2.2 时的相分离过程。在此温度下,相分离进行得非常迅速, 两个模拟箱中的粒子密度很快就分别达到了一个动力学稳定值。随着模拟的进 行,两个箱中的粒子密度只是在其平衡值附近波动。Fig.2 给出了该链分子的不 [6] 同温度下的相分离密度,即相应的相图,其临界温度 Tc 可由直线对径律估算 。