巴西橡胶树HbR3HP1的克隆及表达分析
巴西橡胶树HbHEX1基因的克隆及表达分析
农 部 带 物物 术 点放 验 ’ 7 1 裹 奈 鲂 秉 黧 耋 口51 业 热作 生技 重 开 实 室 0 曼 囊 嚣 羞 蓥 妻 莽 篓 墨海 1
2 海 南大学农 学 院 .海 1 5 0 2 : 728 7
含有由 6 0个氨基 酸组 成 的高度保 守 的结 构域一 同源 异型域 (o o ed m i .HD)】 h m m o o an 【 l 。第一个 编码同源异型 盒 蛋 白的基 因在果 蝇 中 被发 现 .因其 突变 或 异位 表达 均 能 引起 同源 异 型 突变 而 得名 。随 后在 其 它 动物 、 植物 和真 菌 中相继 发现 了类 似的 同源异 型盒蛋 白基 因[ ] 2 - 3 K OT E ( N1 m N1 是第一 个从植 物 中分离 出来 的同源 异型盒 基 因 .该 基 因突变 造成 叶脉 附近 N T D1K 或Z K ) 形成 手指状 突起结 构[ 目前从 拟南 芥 、水 稻 、大麦 、番茄 等植物 中克 隆到大 量 同源异 型盒基 因[o 4 1 。 s] - 。在植 l 物 中 ,同源异 型盒 蛋 白除 了 H D结 构域外 .还 包 含 了其 他保 守结 构域 。根 据植 物 HB蛋 白中 H D基序 的位
d i 1. 6/i n10 - 5 1 0 0 30 3 o 03 9 .s.00 2 6 . 1 . .1 9 js 2 0
中凋 分类 号 ¥9. 7 41
同源异 型盒 (o eb x h r oo ,HB 蛋 白是 一类与发 育有关 的重要转 录 因子 这类转 录 因子 的一个 显著特征是 n )
重 要 的作用 ,如维 管发 育 、器官 形成 、分 生组 织 的维持 和 逆境 应答 等[1 目前 在橡 胶树 中还 未 见到 相关 86 - 1
巴西橡胶树Profilin基因克隆及生物信息学分析
巴西橡胶树Profilin基因克隆及生物信息学分析
李德军;刘向红;邓治
【期刊名称】《中国农学通报》
【年(卷),期】2011(27)30
【摘要】为了研究橡胶树中Profilin蛋白的功能,利用橡胶树Profilin基因部分已知序列设计引物,采用3′-RACE技术获得Profilin基因完整开放阅读框,该基因编码131个氨基酸,含有一个保守的PROF结构域。
在HbPro1蛋白中没有预测到跨膜区和信号肽,二级结构分析表明HbPro1属于混合型蛋白。
对25个Profilin蛋白系统进化分析表明,HbPro1在进化上具有保守性,属植物类Profilin蛋白家族。
HbPro1基因的克隆和生物信息学分析为深入研究其功能奠定了基础。
【总页数】5页(P187-191)
【关键词】巴西橡胶树;Profilin蛋白;基因克隆;序列分析
【作者】李德军;刘向红;邓治
【作者单位】中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学重点开放实验室;海南大学农学院
【正文语种】中文
【中图分类】S562
【相关文献】
1.巴西橡胶树HbUBC5基因克隆、生物信息学及表达分析 [J], 李德军;刘向红;邓治;刘辉
2.一个巴西橡胶树过氧化物酶基因克隆与生物信息学分析 [J], 邓玉杰;余海洋;张宇;王萌
3.巴西橡胶树HbUBC14基因克隆、生物信息学及表达分析① [J], 李德军;邓治;刘向红;刘辉
4.巴西橡胶树β-木糖苷酶基因的克隆与生物信息学分析 [J], 古小玲;涂敏
5.巴西橡胶树磷饥饿调控基因 HbPHR1克隆与生物信息学分析 [J], 高乐;覃怀德;何鹏;曾日中
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
巴西橡胶树生长素响应HbJAR1基因克隆与表达分析
巴西橡胶树生长素响应HbJAR1基因克隆与表达分析Gene Cloning and Expression Analysis of AuxinResponsive HbJAR1 in Rubber TreeLI Xiaona1,XIAO Houzhen3,WAN Sanlian4,ZHANG Dong2,ZHANG Yu2 *1 Institute of Scientific and Technical Information,CATAS,Haikou,Hainan *****,China2 Hainan Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bio-resources / College of Tropical Agriculture and Forestry,Hainan University,Haikou,Hainan *****,China3 College of Materials and Chemical Engineering,Hainan University,Haikou,Hainan *****,China4 Sanya City Modern Agricultural Inspection and Warning Center for the Prevention and Control,Sanya,Hainan *****,ChinaAbstract JAR1,a auxin response gene,maintains dynamic balance of auxin concentration in plant,strengthens plant tolerance ability stress. To clarify the gene structure and function of JAR1 in rubber tree(Hevea brasiliensis Müll. Arg.),HbJAR1 gene was cloned in the leaves of rubber tree CATAS7-33-97 by RT-PCR. The deduced amino acid of HbJAR1 protein has special GH3 superfamily domain structure,no signal peptide,no transmembrane region,located in the cytoplasm. The gene expression of HbJAR1 in the leaves of rubber tree was significantly affected by light intensity,mechanical wounding and powdery mildew infection. IAA,GA3,ET,JA and ABA treatments alsoinduced HbJAR1 expression at different levels. The results suggested that HbJAR1 is a member of plant JAR1 gene family,involved in stress response such as light and wounding signal in rubber tree,etc.Key words Hevea brasiliensis Müll. Arg.;HbJAR1;gene clone;bioinformatics;expression analysisdoi 10.3969/j.issn.1000-2561.2017.08.017JAR1(*****TE *****NT 1)基因是植物生长素早期响应基因之一,这类基因与植物的生长发育密切相关。
巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌Hog1同源基因的克隆和序列分析
巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌Hog1同源基因的克隆和序列分析王延丽;林春花;时涛;李博勋;黄贵修【摘要】In order to understand the roles of hogl Gene in invasion process of Corynespora cassiicola into Hevea brasiliensis, hogl gene of CC01 was amplified by PCR and RT-PCR methods and the degenerate primers were designed according to hogl gene of several filamentous fungi. The amplification products were sequenced, the amino acid sequence were aligned and phylogenetic clustering analysis were done. Sequence analysis extrapolated that the open reading frame of this gene was 915 bp with 6 introns, encoding a putative protein of 304 amino acids. Phylogenetic clustering suggested that the sequence of CCHOG1 showed higher similarity to MAPK HOG1 of Pyrenophora tritici , MAP kinase C1K1 of Cochliobolus lunatus.%为了解MAPK信号途径中hog1基因在多主棒孢病菌(Corynespora cassiicola)侵染橡胶树过程中的作用,根据几种丝状真菌的hog1基因设计简并引物,采用PCR和RT-PCR的方法扩增巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌CC01的hog1基因,并对其扩增产物进行测序,同时还对该基因编码的蛋白进行氨基酸序列比对和系统发育分析.结果表明:该基因开放阅读框架为915 bp,编码304个氨基酸残基,包含6个内含子;该基因的氨基酸序列与小麦黄斑叶枯病菌(Pyrenophora tritici)MAPK HOG1(XP_001935555.1)、谷子弯孢病菌(Cochliobolus lunatus)MAP kinase ClK1(AFJ42499.1)等高度同源.【期刊名称】《热带作物学报》【年(卷),期】2013(034)003【总页数】5页(P424-428)【关键词】多主棒孢;Hog1基因;基因克隆;序列分析【作者】王延丽;林春花;时涛;李博勋;黄贵修【作者单位】中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室海南海口571101【正文语种】中文【中图分类】Q785由多主棒孢(Corynespora cassiicola)引起的橡胶树棒孢霉落叶病(Corynespora leaf fall disease,CLFD)现已成为南亚、东南亚和中非橡胶树最具破坏性的叶部病害,是继南美叶疫病之后第2个威胁世界天然橡胶生产的重要病害[1]。
巴西橡胶树HbbHLH转录因子的克隆及表达研究的开题报告
巴西橡胶树HbbHLH转录因子的克隆及表达研究的开题报告研究背景和意义:巴西橡胶树是一种重要的能源作物,其乳胶含有丰富的橡胶,被广泛用于制造橡胶制品。
而橡胶树在生产过程中存在许多问题,如病虫害的影响、产量的不稳定性等,这些问题直接影响着其生产效益。
因此,对橡胶树的研究具有重要意义。
植物中的基因调控对植物的生长发育、适应环境等具有重要作用。
转录因子作为基因调控的重要参与者,在植物中发挥着重要的调控作用。
目前已经有许多植物转录因子基因的研究成果,但是,在巴西橡胶树中,转录因子基因的研究还相对较少。
本研究将克隆巴西橡胶树HbbHLH基因,并研究其在橡胶树生长发育过程中的表达情况和调控作用,为进一步了解橡胶树的基因调控机制提供一定的理论支持。
研究内容:1、克隆巴西橡胶树HbbHLH基因;2、对HbbHLH基因进行序列分析;3、利用RNA-Seq等方法研究HbbHLH基因在不同生长期巴西橡胶树中的表达情况;4、利用VIGS等技术研究HbbHLH基因在橡胶树生长发育过程中的调控作用;5、分析HbbHLH基因的生物学功能和作用机制。
研究方法:根据大豆bHLH基因家族设计一对引物,通过RT-PCR方法进行HbbHLH基因的克隆。
利用SMART软件对HbbHLH基因序列进行分析。
运用qRT-PCR和RNA-Seq方法研究HbbHLH基因在不同生长阶段巴西橡胶树中的表达情况。
利用VIGS等技术研究HbbHLH基因在橡胶树生长发育过程中的调控作用。
预期结果:1、成功克隆巴西橡胶树HbbHLH基因;2、获得HbbHLH基因的完整序列;3、揭示HbbHLH基因在橡胶树生长发育过程中的表达情况和调控作用;4、分析HbbHLH基因的生物学功能和作用机制。
研究展望:本研究有望为巴西橡胶树的基因调控研究提供理论支持,为橡胶树的生产提供技术支持,对于推动巴西橡胶树的发展具有重要意义。
同时,本研究对于植物基因调控研究也会具有一定的参考价值,有利于进一步深入了解植物的基因调控机制。
巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌Hog1同源基因的克隆和序列分析
巴西橡胶树HbSERK1启动子的克隆及功能鉴定
个 植 物 缺 失 表 达 载 体 。利 用 真 空 渗 透 法 和 农 杆 菌 介 导 法 将 植 物 缺 失 表 达 载 体 转 化 烟 草 ,对 烟 草 转 化 植 株 进 行 G U S活 性 定 量 分 析 结 果 表 明 ,除 了 S P 5外 ,其 它 缺 失 表 达 载 体 均 可 以 驱 动 G U S蛋 白 的 表 达 ,说 明 在 H b S E R K1 启动子一 1 3 9 5 —. 2 5 2 b p区域 可 以驱 动 G U S的 表 达 ,表 明 Hb S E R KJ 启 动 子 是 具 有 生 物 活 性 的启 动 子 。 关 键 词 巴 西 橡胶 树 :Hb S E R KJ 启 动 子 ;功 能鉴 定
W ANG Yi n g ,J I A Ru i ,L I Hu i l i a n g ,GUO Do n g , Z HU J i a h o n g ,CHEN Xi o n g t i n g H ,P E NG S h i q i n g
1 I n s t i t u t e o f T r o p i c a l B os i c i e n c e a n d Bi o t e c h n o l o g y ,C h i n e s e A c a d e m y o f T r o p i c a l A g r i c u l t u r a l S c i e n c e s / K e y L a b o r a t o r y f o B i o l o g y a n d G e et n i c Re s o u r c e s f o T r o p i c a l C r o p s , Mi n i s t y r o f A g r i c u l t u r e ,Ha i k o u ,Ha i n a n 5 7 1 1 0 1 ,C h i n a 2 C o l l e g e f Ag o r o n o m y ,Ha i n a n U n i v e r s i t y ,H a i k o u ,Ha i n a n 5 7 0 2 2 8 ,C h i a n
巴西橡胶树磷饥饿调控基因HbPHR1克隆与生物信息学分析
巴西橡胶树磷饥饿调控基因HbPHR1克隆与生物信息学分析作者:高乐覃怀德何鹏曾日中来源:《热带农业科学》2014年第10期摘要天然橡胶主要来源于巴西橡胶树。
海南植胶土壤磷素缺乏,而缺磷会导致橡胶树生长缓慢、干胶产量降低。
本文通过RT-PCR技术从橡胶树中克隆了一个磷饥饿信号关键调控基因HbPHR1,基因全长1 560 bp,包含一个1 476 bp的完整读码框(ORF),编码491个氨基酸,分子量约为53.48 kD。
HbPHR1具有MYB结构域和CC结构域,属于MYB-CC家族成员,为酸性不稳定蛋白,具有较强的亲水性。
进化树分析表明,HbPHR1与拟南芥AtPHR1、油菜BnPHR1归为一个亚类。
HbPHR1的克隆对解析橡胶树磷信号转导机制、创制磷营养高效利用橡胶树材料具有重要意义。
关键词橡胶树;磷饥饿;HbPHR1 ;生物信息学分类号 S794.1天然橡胶是重要的工业原料和国防战略物资,主要来源于热带树种——巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)。
中国是橡胶消费大国,国内橡胶市场缺口巨大。
磷对橡胶树生长发育、产排胶具有重要的作用。
供磷不足,会致使橡胶幼树叶片数量明显减少,根系生长不发达,干围增长十分缓慢;对于已开割橡胶树,会导致乳胶机械稳定性下降,出现早凝减产,及胶乳干胶产量降低[1]。
海南植胶土壤大部分pH值约4.7,属于典型的酸性土壤,磷肥利用有效性低,低于我国平均利用率15%~25%[2]。
以土壤全磷含量低于0.8~1.0 g/kg、速效磷含量50~80 mg/kg的标准来衡量海南胶园土壤磷素供应水平,目前胶园土壤磷素供应水平仍然处于较差状态[3]。
因此提高橡胶树磷营养的利用效率对提高橡胶树的产量具有重要作用。
前人研究表明,AtPHR1在拟南芥磷信号系统中起关键作用。
AtPHR1具有MYB结构域(MYB domain)和卷曲螺旋结构域[coiled-coil (CC) domain],属于MYB-CC转录因子家族成员。
巴西橡胶树中碱性转化酶HbNINa基因的克隆和表达模式分析
重要 作 用 。
关 键 词 巴西 橡 胶 树 ; 中碱 性 转 化 酶 ;基 因 结 构 ;表 达 分 析 ;叶 片发 育
中图分类号 ¥ 7 9 4 . 1 文 献 标 识 码 A
Cl o n i n g a n d Ex p r e s s i o n An a l y s i s o f a n Al k a l i n e / N e u t r a l I n v e r t a s e Ge n e i n v e a b r a s l i e n s
肖小 虎・ 一,戚 继艳z ,方 永 军 ,曹 冰 , 龙翔 宇 ,唐 朝 荣
1 海南 大学农 学 院 .海 南海 口 5 7 0 2 2 8 2 中 国热 带农 业科 学 院橡 胶研 究所 .海 南儋 州 5 7 1 7 3 7
摘 要 检 索橡胶树 E S T和 基 因组 数 据 库 . 发 现 了 1 个 在 叶片 中 高 丰 度 表 达 的 中碱 性 转 化 酶 基 因 。 采 用 R T —
守结 构域。基因组结构分析显示 日6 M№ 基因包含 4个外显子和 3个 内含子 。Q P C R分析结果表 明 ,日6 Ⅳ, Ⅳ Ⅱ基 l
因 在 在 胶 乳 中表 达 水 平 极 低 .而 在 其 他 组 织 如 树 皮 、树 叶 和 雌 花 中 的表 达 丰 度 相 对 较 高 。 在 叶 片 发 育 过 程 中 , 6 在 叶 片 发育 的初 期 高 丰 度 表 达 .推 测 日 6 可 能 参 与 叶 片 蔗 糖 利 用 .进 而 在 橡 胶 树 叶 片 发 育 过 程 中起
P C R和 R AA 和 基 因 组 序 列 ,命 名 为 H b N I N a 。 序 列 分 析 结 果 显 示 ,日6 Ⅳ , Ⅳ Ⅱ基 因
巴西橡胶树环锌指蛋白基因克隆及其分子特性
巴西橡胶树环锌指蛋白基因克隆及其分子特性朱家红;李辉亮;屠发志;田维敏;彭世清【期刊名称】《植物生理与分子生物学学报》【年(卷),期】2006(32)6【摘要】Using the information about the sequence from a differentially expressed clone (designated as HbSSH10)encodes a protein specifying a cysteine-rich sequence containing a putative "RING finger" or "C3HC4" consensus motif that was cloned recently by the subtractive hybridization between latex and leaves from rubber tree (Hevea brasiliensis). A full-length cDNA encoding C3HC4 type zinc-finger protein was isolated and characterized from rubber tree. Sequence analysis revealed that the ORFs of HbRZF encode 156 amino acid residues with a total predicted molecular mass of 17.2 kD,HbRZF protein having a putative "RING finger" segment (amino acid residues 100-144). The deduced amino acid sequences of HbRZF showed high identities of 48%,52% and 50% to those of the ring zinc protein from Poncirus trifoliata, Arabidopsis thaliana, Thellungiella halophila. The result of Northern blot analysis indicated that the transcripts of the HbRZF were expressed more in the latex than in the leaves, whereas little expression was detected in roots and flowers. The transcription of HbRZF was induced by jasmonic acid, whereas ethylene had little effect.%在先前的研究中通过抑制缩减杂交获得了一个在巴西橡胶树胶乳中特异表达的片段(HbSSH10),该片段含有"RING finger"或"C3HC4"保守序列.根据HbSSH10的序列信息设计引物并通过3'-RACE和5'-RACE的方法,获得了一个全长的cDNA(HbRZF).该cDNA含有589个核苷酸,含有完整的阅读框架,编码156个氨基酸.从它推导出的氨基酸序列中含有"RING finger"或"C3HC4"保守区(氨基酸100~144).该氨基酸序列与Poncirus trifoliata、Arabidopsis thaliana和Thellungiella halophila的环锌指蛋白的同源性分别为48%、52%和50%.Northern杂交分析表明HbRZF在胶乳中大量表达,在叶片中微量表达,而在根和花中几乎没有表达.茉莉酸处理可以诱导胶乳中HbRZF的表达,而乙烯对胶乳中HbRZF的表达基本上没有影响.【总页数】7页(P627-633)【作者】朱家红;李辉亮;屠发志;田维敏;彭世清【作者单位】中国热带农业科学院热带生物技术研究所热带作物生物技术国家重点实验室,海口,571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所热带作物生物技术国家重点实验室,海口,571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所热带作物生物技术国家重点实验室,海口,571101;中国热带农业科学院橡胶研究所热带作物栽培生理农业部重点实验室,儋州,571737;中国热带农业科学院热带生物技术研究所热带作物生物技术国家重点实验室,海口,571101【正文语种】中文【中图分类】Q94【相关文献】1.巴西橡胶树锌指蛋白基因的克隆及功能鉴定 [J], 肖华;林云蒸;姚笛;欧阳沫;黄惜2.山羊PPARα基因克隆、分子特性及组织差异表达分析 [J], 饶辽源;周靖宣;王林杰;李利;张红平;仲涛3.类乌齐牦牛ACTA1基因克隆、分子特性及差异表达分析 [J], 杨勤;柴志欣;王会;王吉坤;信金伟;姬秋梅;张成福;钟金城;罗晓林4.棉铃虫鞣化激素基因克隆及分子特性分析 [J], 马星宇; 嵇玉洁; 薛玉莹; 杜孟芳; 魏纪珍; 尹新明; 刘晓光; 安世恒5.苹果蠹蛾几丁质脱乙酰基酶2的基因克隆、表达模式和分子特性 [J], 石国良;武强;杨念婉;黄聪;刘万学;钱万强;万方浩因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
巴西橡胶树HbCXE1基因克隆及其生物信息学分析
陈月 异② 赵 悦 田维 敏③
( 国热带农 业科 学院橡胶 研 究所/ 中 农业 部橡胶 树 生物 学重 点开放 实验 室/
省部 共 建 国 家重 点 实验 室培 育基 地一 南省 热带 作物 栽培 生理 学重点 实验 室 海
海 南儋 州 5 13 ) 7 7 7 摘 要 采用 PR和 R C C AE技术从 巴西橡胶树无 性系热研 7 3 — 7的乳 管细胞中克隆到一条 C E羧酸 —39 X
21 年 1 01 1月
NO .2 1 V 01
热 带 农 业 科 学
CHI NES OURNAL OF TROP CAL AGRI EJ I CUI URE
第 3 卷第 l l l期
Vo . .No 1 131 .1
巴西橡胶树类甜味蛋白基因HbTLP1的克隆及表达分析
1 &a e ooa rf r w£ f Uizt no o iaBoeore H ia nvri , io Ha nK yLb rt y o n e tiao T pcl irsuc, an nU i st Haku,H n 5 0 2 , hn o S l i fr e y m 7 2 8 C ia
.
日6 .T e s q e cn e u t h we t a h o e e d n a f H6 化 h e u n ig r s l s o d h t t e p n r a i g f me o 化 r
a i wi a o s r e THAUM ATI —Li d m an i i r cds t h c n e v d N ke o i sm l wi a t h TLP r m o h r fo t e pln s Bii frnai s nay i at o n oi tc a l ss
过 R —C T P R方 法 扩 增 巴西 橡 胶 树 T P同源 基 因 的 c N 片段 .命 名 为 Hb L 1 该 片 段 包 含 一 个 94b L D A TP 。 8 D的 开 放 阅读 框 .编 码 37个 氨 基 酸 的 多 肽 生 物 信 息 学 分 析 结 果 表 明 .该 氨 基 酸 序 列 含 有 一 个 超 级 T A MA I — ie 2 H U T N Lk 结 构 域 .与 杨 树 、大 豆 、葡 萄 和 拟 南 芥 的 T L蛋 白有 较 高 的 同 源 性 。半 定 量 分 析结 果 表 明 .该 基 因 的表 达 受水 P
b tn tJ u o n. A l h d t idc td h t 1 te aa n iae ta Hb P1 s h T P o lg i rb e n i eae t S me itd i te L h moo n u b r a d S ltd 0 A r dae
巴西橡胶树铁螯合物还原酶基因(HbFRO)的克隆及表达
铁 在植 物 与病原 菌 的相互作 用 中起 着 重要 作 用 J 。病 原 菌 可 以利 用 铁 载体 和其 他 铁 吸 收 系统 增 强 自身 的毒力 J , 例如 , 在 培养 丁香 假单 胞 杆 菌 的培 养基 中加 入 微摩 尔 级 的 铁 离子 能 够 使植 物 毒 素一 丁 香
霉素的产量达到最高 。水稻黄单胞杆菌 r p f e基 因敲除突变体毒力降低 , 表现为铁载体蛋 白过分表达
域; H b F R O蛋 白的氨基 酸序 列与木薯 、 蓖麻 、 杨树 和拟南芥 的 F R O蛋 白同源 , 同源性分别为 8 5 %, 8 0 %, 7 3 % 和6 3 % 。半定量分析结果表 明, Hb F R O基 因在胶乳 、 花和叶片 中的表达丰度 明显 高于在树皮 和芽 中的表达 ;
中 图分 类 号 : S 7 9 4 0 . 1 文 献 标 志 码 :A
铁 是酶 、 激素 、 维 生素 、 核酸 的组 成部 分 , 参 与 生命 的正 常 代谢 过 程 J 。作 为植 物 必 需 的微 量 矿 质 营
养 元素 之一 , 铁在 植 物 的 光 合 作 用 、 呼吸作用 、 氮 的 固定 等 诸 多 生 理 代 谢 过 程 中发 挥 着 极 为 重 要 的作
用 J 。虽然铁在地壳 中的含量非 常丰富 , 但 是在水 中的溶解度 非常低 , 因此 , 植物 吸收利用 的比例很
小l 3 J 。为 了适 应 自然环境 , 许 多植 物在 长 期 进 化 过 程 中逐 渐 形 成 了 一些 适 合 自身生 长 的铁 高 效 吸 收 机
制l 4 J 。其 中 3价 铁螯 合还 原酶 ( f e r r i c . c h e l a t e r e d u c t a s e s , F R O s ) 家族属 于 f l a v o c y t o c h r o m e s 超家族 中的 1 个
巴西橡胶树SUMO活化酶基因HbSAE1的克隆及表达
巴西橡胶树SUMO活化酶基因HbSAE1的克隆及表达郭冬;李辉亮;彭世清【期刊名称】《热带作物学报》【年(卷),期】2010(031)009【摘要】根据一个从巴西橡胶树胶乳cDNA文库中获得的EST片段的序列设计引物,通过RACE的方法获得了橡胶树编码SUMO活化酶(SUMO-activating enzyme,SAE)的cDNA,命名为HbSAE1.序列分析结果表明HbSAE1长为2 411 bp,含有1917 bp的阅读框,214 bp的5'-UTR和280 bp的3'-UTR,编码638个氨基酸,分子量为70.79 ku,等电点为5.41.半定量RT-PCR分析结果表明HbSAE1基因在花、树皮、叶、胶乳中均有表达,其中在胶乳中表达量最高.【总页数】6页(P1446-1451)【作者】郭冬;李辉亮;彭世清【作者单位】中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海南海口,571101;中国热带农业科学院科学技术处,海南海口,571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海南海口,571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海南海口,571101【正文语种】中文【中图分类】S794.1【相关文献】1.巴西橡胶树铁螯合物还原酶基因(HbFRO)的克隆及表达 [J], 方佳俊;黎秀琼;罗红丽2.巴西橡胶树葡萄糖/核糖醇脱氢酶基因的克隆和表达分析 [J], 朱晋恒;戚继艳;肖小虎;唐朝荣3.荔枝SUMO活化酶基因LcSAE2的克隆及表达分析 [J], 吕科良;程春振;陈裕坤;林玉玲;郑诚乐;陈桂信;赖钟雄;4.荔枝SUMO活化酶基因LcSAE2的克隆及表达分析 [J], 吕科良;程春振;陈裕坤;林玉玲;郑诚乐;陈桂信;赖钟雄5.巴西橡胶树氰丙氨酸合成酶基因HbCAS的克隆与表达分析 [J], 张议文;刘辉;冯成天;胡义钰;王真辉;袁坤因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
巴西橡胶树磷转运蛋白基因的克隆及生物信息学分析
第 5期
热 带 作 物 学 报
C NE E OURNAL HI S J OF T P C C RO I AL ROP S
Vo . l o5 1 N . 3
Ma 2 0 v. 01
21 0 0年 5月
巴西橡胶树磷 转运蛋 白基 因的 克隆及 生物信息学分 析
缺乏 和 提高磷 肥 利 用效 率 的有 效途 径 之 ~ 近 年来 ,已有 一些 关 于 编码磷 转 运 蛋 白 的基 因克 隆 和表 达 调
控 的研究 .为 了解 高等 植 物复 杂 的磷 素 吸收 和转 运 机制 提 供 了大量 的分 子生 物 学基 础 。 目前 ,对 编 码 磷
转运 蛋 白的研 究 主要集 中在 一年 生 草本 植物 .在 高 大乔 木上 的报道 较 少 。本 文根 据
低产 树 的较 低 ,中产 树 无机 磷含 量接 近 高产 树 的含量 水平 _ 因此 ,研 究 高效 吸 收和 利用 土壤 磷素 营养 能 9 1 。 力 的分 子机 制 .挖 掘控 制 高效 吸 收利 用磷 素 营养 的基 因资 源 ,遗传 改 良橡 胶 树磷 营养 性 状是 缓解 磷 资 源
基 金 项 目 :公 益性 科 研 院所 基 本 科 研 业 务 费专 项 资 金 “ 胶 树 磷 营 养 生理 特 性 的研 究 ” 【WF X 0 0 1 ( ] 助 。 橡 Y Z 2 1— O N)资
第 一 作 者 简 介 :汤银 辉 ,男 ,1 8 9 4年 生 ,在 读 硕 士 研 究 生 。研 究 方 向 :植 物 功 能 基 因 组 。E m i l n 1 @ms. n。 — al v 2 5 :e e nc o 通 讯 作 者 ,何 鹏 ,男 , 17 94年 生 ,博 士 ,助 理 研 究 员 。 研 究 方 向 :土壤 与 植 物 营 养 。E m i eg e ct. uo 。 - al :p nh@suae . d n 收 稿 日期 :2 1— 3 1 000— 2 修 回 1 :2 1— 4 1 3期 000— 4
巴西橡胶树胶乳表达ABC转运蛋白HbGCN1的克隆与表达研究
巴西橡胶树胶乳表达ABC转运蛋白HbGCN1的克隆与表达研究聂智毅;黎瑜;李波;夏可灿;段翠芳【期刊名称】《热带作物学报》【年(卷),期】2012(033)009【摘要】橡胶生物合成是一种典型的植物类异戊二烯次生代谢,它是影响橡胶产量的首要因素.ABC转运蛋白(ATP Binding Cassette transporter,ABC transporter)是一类与植物次生代谢密切相关的蛋白大家族.筛选已构建的茉莉酸诱导橡胶树胶乳消减文库,并克隆了1个GCN(general control non-repressible)亚族ABC转运蛋白基因EST,通过RACE技术获得其全长cDNA序列,命名为HbGCN1.该基因开放阅读框共1 815 bp,编码605个氨基酸残基.表达分析表明:HbGCN1主要在橡胶树树皮及胶乳中表达,且在乙烯、茉莉酸或伤害诱导下上调表达,推测其可能与橡胶生物合成相关.原核表达该基因,为进一步的研究奠定基础.%Rubber biosynthesis, a typical isoprenoid biosynthesis pathway, has been the key important factor limiting rubber latex yield. ABC (ATP-BindingCassette)transporters are a large protein family which is closely involved in the plant secondary metabolites. Through screening a jasmonic -induced latex SSH cDNA library combined with RACE, one EST encoding ABC transporter of GCN subgroup and its full-length cDNA, named as HbGCNl were obtained. HbGCNl contains a ORF with 1 815 bp and encodes a polypeptide of 605 amino acids. The expression patterns show that HbGCNl is primarily expressed in latex or bark. Under ethylene,jasmonic acid and wounding induction, its expression is up-regulated. Based on the above analysis, it is speculated that HbGCNl may be closely correlated to the rubber biosynthesis. Moreover, the prokaryotie expression of the gene lay the foundation for further research.【总页数】5页(P1598-1602)【作者】聂智毅;黎瑜;李波;夏可灿;段翠芳【作者单位】中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室省部共建国家重点实验室培养基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室海南儋州571737;中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室省部共建国家重点实验室培养基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室海南儋州571737;海南大学农学院,海南海口570228;海南大学农学院,海南海口570228;中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室省部共建国家重点实验室培养基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室海南儋州571737【正文语种】中文【中图分类】S794.1【相关文献】1.一个新的巴西橡胶树胶乳UEP基因的克隆与表达分析 [J], 杨云;张治礼;刘宽灿;李维国;苏火生2.一种测定巴西橡胶树胶乳中过氧化氢含量及其在胶乳各组分中分布的方法研究[J], 蔡甫格; 王立丰; 史敏晶; 田维敏3.一种测定巴西橡胶树胶乳中过氧化氢含量及其在胶乳各组分中分布的方法研究[J], 蔡甫格; 王立丰; 史敏晶; 田维敏4.巴西橡胶树氰丙氨酸合成酶基因HbCAS的克隆与表达分析 [J], 张议文;刘辉;冯成天;胡义钰;王真辉;袁坤5.橡胶树一个胶乳高表达MDR型ABC转运蛋白的克隆与表达研究 [J], 聂智毅;李波;白瑞璞;黎瑜因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
巴西橡胶树生长素响应HbJAR1基因克隆与表达分析
4 三亚 ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ现代 农 业检验 检 测预 警 防控 中心 ,海 南三 亚
摘 要
5 7 2 0 0 0
. RJ基 因 是 植 物 生 长 素 响 应 基 因 ,具 有 维 持 植 物 体 内 生 长 素 浓 度 动 态 平 衡 和 增 强 植 物 抗 逆 性 的 功 能 。
p l a n t t o l e r a n c e a b i l i t y s t r e s s . T o c l a r i f y t h e g e n e s t r u c t u r e a n d f u n c t i o n o f J A R 1 i n ub r b e r t r e e( H e v e a b r c a  ̄ i l i e n s i s
Re s p o n s i v e Hb J AR1 i n Ru b b e r Tr e e
LI Xi a o n a ,XI AO Ho u z he n ,W AN Sa n l i a n ,ZHANG Do n g ,ZHANG Yu
1 I n s t i t u t e o f S c i e n t fc i w t d T e c h n i c a l I n f o r ma t i o n ,C A T AS ,H a i k o u ,Ha i n a n 5 7 1 1 0 1 ,C h i n a 2 H a i n a n Ke y L a b o r a t o r y f o r S u s t a i n bl a e U t i l i z t a i o n o f T r o p i c a l B i o — r e s o u r c e s / C o l l e g e o f T r o p i c l a A g r i c u l t u r e
巴西橡胶树HbMCSl基因的克隆及表达分析
巴西橡胶树HbMCSl基因的克隆及表达分析雷美玉;李辉亮;彭世清【期刊名称】《农业生物技术学报》【年(卷),期】2009(017)003【摘要】2C-甲基-D-赤藓糖醇-2,4-环化磷酸合成酶(2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphat synthase,MCS)是异戊烯基焦磷酸合成途径之一.甲基赤藓糖磷酸(methylerythritol phosphate,MEP)途径中的第5个酶.催化2-磷酸-4-(胞苷-5'-二磷酸)-2-C-甲基-D-赤藓糖醇生成2-C-甲基-D-赤藓糖醇-2-4-环化磷酸.根据植物MCS的同源序列设计引物,通过RT-PCR结合RACE的方法在橡胶树(Hevea brasiliensis)中获得了与其相应的MCS基因,命名为HbMCSl(GenBank 登录号:FJl96164).序列分析表明HbMCSI长965 bp,编码241个氨基酸,该氨基酸序列与长春花(Catharanthus roseus)、拟南芥(Arabidopsisthaliana)、水稻(Oryza sativa)、银杏(Ginkgo biloba)和三尖杉(Cephalotaxus fortunei)的MCS 同源性分别达到70.8%、69.4%、64.9%和63.3%和62.2%.半定量RT-PCR结果显示,割胶诱导胶乳HbMCSI的表达,乙烯对HbMCSI的表达几乎没有影响;HbMCSI的表达具有组织差异性,在愈伤组织中大量表达,在叶片和胶乳中微量表达.【总页数】6页(P482-487)【作者】雷美玉;李辉亮;彭世清【作者单位】中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海口571101;海南大学农学院,海口,570228;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海口571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海口571101【正文语种】中文【中图分类】S188【相关文献】1.巴西橡胶树HbGSK1的基因克隆与表达分析 [J], 杨署光;吴绍华;陈月异;李言;张世鑫;史敏晶;田维敏2.巴西橡胶树HbAIH基因的克隆及表达分析 [J], 杨洪; 岳镒繁; 胡燕玲; 邓治; 代龙军; 李德军3.巴西橡胶树HbGRF基因的克隆、物理定位及表达分析 [J], 张宇航;潘冉冉;李飞;陶志强;王英;高和琼;庄南生4.巴西橡胶树转录中介体HbMed25基因克隆与表达分析 [J], 张世鑫;吴绍华;杨署光;晁金泉;李招娣;田维敏5.巴西橡胶树氰丙氨酸合成酶基因HbCAS的克隆与表达分析 [J], 张议文;刘辉;冯成天;胡义钰;王真辉;袁坤因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
橡胶树F3’H基因克隆及其功能分析
橡胶树F3’H基因克隆及其功能分析作者:范月婷辛士超 NAYCHIKoko 畅娇黄天带黄华孙华玉伟来源:《热带作物学报》2020年第09期摘要:从橡胶树叶片转录组数据库中调取花青素合成途径中的关键酶类黄酮3’-羟化酶(F3’H)基因序列信息,通过RT-PCR扩增得到2个橡胶树F3’H基因,分别命名为HbF3’H1和HbF3’H2。
通过荧光定量PCR分析发现,只有HbF3’H1基因在不同发育时期的橡胶树叶片和嫩茎中的表达水平与花青素的合成积累趋势完全一致。
HbF3’H1所编码的蛋白属于P450超家族,具有保守的F3’H结构域,而且HbF3’H1基因的启动子中包含多种环境效应元件,说明HbF3’H1基因的表达受环境因子调控。
通过农杆菌转化烟草发现,过表达HbF3’H1基因的烟草花瓣大量累积花青素,其颜色较非转基因烟草显著加深,同时,荧光定量PCR发现HbF3’H1表达水平与转基因烟草花瓣颜色呈正相关,说明HbF3’H1基因表达促进花青素的累积。
本研究为阐明橡胶树花青素代谢途径奠定基础。
关键词:橡胶树;花青素;类黄酮3’-羟化酶;转基因烟草中图分类号:S794.1 文献标识码:AAbstract: Based on the transcriptome database of rubber tree (Hevea brasiliensis) leaf tissues,we retrieved the nucleotide sequences of flavonoid 3’-hydroxylase (F3’H) gene, which is the key enzyme in anthocyanin biosynthesis pathways. Two rubber tree F3’H genes,HbF3’H1 and HbF3’H2 were amplified by RT-PCR. The ex pression levels of the HbF3’H genes were analyzed by quantitative real-time PCR and the expression of HbF3’H1 were shown to be completely correlated with the anthocyanin contents in the deffirent developmental stage of leaves and stems. Amino acid sequence analysis results showed that HbF3’H1 belonged to the super-family of cytochrome P450,and consisted of typical F3’H conserved domains. In the promoter region of HbF3’H1 gene, we observed multiple environment response elements, which revealed the possible role of HbF3’H1 in environment stress resistance in rubber trees. HbF3’H1 was over-expressed in tobacco (Nicotiana tabacum ‘Samsun NN’) by Agrobacterium tumefaciens mediated transformation for further functional verifications. Compared with the wild type control, the petals of transgenic tobacco lines exhibited enhanced red color pigmentation, which was positively correlated with the expression levels of HbF3’H1. The results demonstrated that HbF3’H1 played an important role in the biosynthesis of anthocyanin. The study would lay a foundation for understanding the anthocyanin biosynthesis pathways in rubber trees.Keywords:rubber tree; anthocyanin; flavonoid 3’-hydroxylase; transgenic tobaccoDOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.09.002花青素属类黄酮化合物,作为在植物中广泛存在的水溶性天然色素,花青素的积累使花瓣和果实呈现多种颜色来吸引动物进行授粉和种子的传播[1-2]。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
码 的蛋 白 质 由 3 5 1 个 氨基 酸组 成 ,分 子 量 为 4 0 。 2 3 k u .等 电 点 为 8 . 2 9 。H b R 3 H P 1含 有 保 守 的 R 3 H 结 构 域 ,与 1 个 蓖麻 、1 个 蒺 藜 苜 蓿 和 3个 拟 南 芥 的含 有 R 3 H结构域蛋白的同源性分别为 8 2 % 、6 4 % 、6 5 % 、5 6 %和 5 4 %。
t r e e b a s e d o n t h e i n f o r ma t i o n a b o u t t h e s e q u e n c e f r o m a d i i f e r e n t i a l l y e x p r e s s e d c l o n e( d e s i g n a t e d a s Hb S S H3 0)
裹 农 . 业 墨 部 热 带 舞 作 物 生 物 学 黑 与 釜 遗 传 资 源 利 莆 用 重 点 实 验 望海 室 例 南 海 口5 7 1 1 0 1
摘 要 根 据 已 获 得 的 1 个 在 巴西 橡 胶 树 自根 幼 态 无 性 系 与 老 态 无 性 系 之 间差 异 表 达 的 S S H 片 段 的 序 列 信 息 设 计 引 物 .通 过 R A C E方 法 获 得 了 1 个 橡胶 树 编 码 含 有 R 3 H结 构 域 蛋 白 的 c D N A( 命 名 为 Hb R 3 H P 1 ) 。序 列 分 析 结 果 表 明 :Hb R 3 长为 1 2 8 6 b p , . 含有 1 0 5 6 b p的 阅读 框 、3 0 b p的 5 ' - U T R和 1 6 0 b p的 3 ' - U T R,m 3 编
t He y e a b r a s i l i e n s i s 、 .S e q u e n c e a n a l y s i s r e v e a l e d t h a t t h e ORF o f Hb R3 HPl e n c o d e d 3 5 、 a mi n o a c i d r e s i d u e s w i t h a t o t a l p r e d i c t e d mo l e c u l a r ma s s o f 4 0 . 2 3 k u .Hb R3 日P7 s h a r e d t h e c o n s e r v e d R3 H- d o ma i n a n d s h o we d h i g h e r i d e n t i t i e s wi t h o t h e r p l a n t R3 H d o ma i n — c o n t a i n i n g p r o t e i n s .T h e r e s u l t s o f r e a l t i me P C R a n a l y s i s i n d i c a t e d
定量 P C R分 析 结 果 表 明 ,Hb R 3 HP 1在 橡 胶 树 的 根 、花 、 叶 、树 皮 、胶 乳 中均 有 表 达 ,在 树 皮 和 胶 乳 中表 达 量
相 对较 高 :茉 莉 酸 可 以诱 导 H b R3 H P 1的表 达 . 乙烯 对 H b R 3 H P 1的表 达 基 本 无 影 响 。 关键 词 巴西 橡 胶 树 ;R 3 H 结 构 域 ;特 异 表 达 ;茉 莉 酸 ; 乙烯
热带作 物 学 报 2 0 1 3 ,3 4 ( 8 ) :1 4 7 8 — 1 4 8 2
C h i n e s e J o u r n a l o f T r o p i c a l C r o p s
巴西橡胶树 Hb R 3 HP 1的克 隆及表达分析
李辉 亮 , 郭 冬 ,彭 世 清
中 图分 类号 ¥ 7 9 4 . 1 文献标识码 A
Cl o n i n g a n d Ex p r e s s i o n o f Hb R3 HP1 f r o m He v e a b r a s i l i e n s i s
L I Hui l i a n g ,GUO Do n g, P ENG S h i q i n g I n s t i t u t e o f T r o p i c a l B i o s c i e n c e a n d B i o t e c h n o l o g y ,C AT A S / K e y L a b o r a t o r y f o B i o l o g y a n d G e n e t i c R e s o u r c e s o f T r o p i c a l C r o p s ,Mi n i s t r y f o Ag r i c u h u r e ,Ha i k o u ,H a i n n a 5 7 1 1 0 1 ,C h i n a
t h a t w a s c l o n e d b y tห้องสมุดไป่ตู้h e s u b t r a c t i v e h y b i r d i z a t i o n b e t we e n i u v e n i l e c l o n e a n d t h e d o n o r c l o n e s f ro m r ub b e r t r e e
Ab s t r a c t T h e f u l l — l e n g t h c DNA e n c o d i n g a R 3 H— d o ma i n p r o t e i n d e s i g n a t e d Hb R3 HP 1.wa s s o l a t e d f r o m r u b b e r