利用SSR标记检测杂交玉米种子纯度的研究

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杂交玉米种子纯度SSR技术鉴定结果的分析

杂交玉米种子纯度SSR技术鉴定结果的分析
s l sq e c e et 分 子标 记 由于 其具 有共 显性 、 i e e u n erp a ) mp s
田间 种 植 纯 度 鉴 定 在 海 南 进 行 ,每 个 样 品 2 0 0 粒, 由北 京 市 种子 质 量 监督 检 验 站 于 花期 组 织 专 家 进 行 鉴定 , 定方 法 按 照 G / 34 . 19 ( 作 物种 子 鉴 B T 535 9 5 农 — 检 验规 程 真 实性 与 品种纯 度 鉴定 》 行 。 执 2 结果 与分 析 根 据 S R分子 标 记 双 亲互 补 原 则 ,采 用 4 S 0对 引 物 对 供 试 的 品种 进 行 引物 筛 选 , 果 显 示 , 个 品 种 结 每 至少 有一对 引物 可 以对 其进 行 纯度 分 析 。利 用 筛选 出
9. 8 0 9. 5 4
9 _ 72 9. 70
9. 71 9. 61
9 . 64 9. 76
0 . 9 -. 07
的引物 对该 品种 进行 纯 度鉴 定 , 鉴定 结 果如 表 1 不 同 。 的样 品 之 间纯 度值 存 在 一定 的差 异 , 而单 个 样 品其 分
多 态性 高 , 复性 强 , 便快 速 等 特 点 , 玉米 种 子 纯 重 简 在 度鉴 定 中得到广 泛 应用I 1 1 。本试 验利 用 S R分 子标 记 — 3 S 技 术对 2 4份杂 交 玉米 种 子进 行 了纯 度 鉴定 ,并 将 鉴 定结 果 与 田 间种 植 鉴 定结 果 进 行 比较 , 分析 两 种 方 法 之 间的一 致性 , 探 讨 了 SR分 子 标记 用 于 杂交 玉 米 并 S 种子纯 度 鉴定应 注 意 的问题 。 1 材 料与 方法
维普资讯

玉米种子纯度SSR分子标记检测研究报告

玉米种子纯度SSR分子标记检测研究报告

作物产量的多少和品质的优良 ,而种子纯度的高低又是显示 1.2.1 SDS 法提取玉米种子的 DNA
[2]
种子质量好坏的一项重要因素 。种子纯度的检测是发挥
[13]
参考郭景伦等 的方法 ,提取玉米 DNA,每个品种随
作物产量潜能和保证作物质量的必要措施。根据前人的研究, 机选取 50
2 结果与分析
1.1 材料 试验材料 :金庆 707 杂交种及其父母本种子、世宾 338
及其父母本种子 ,20 对 SSR 引物序列来自数据库(https:// /)。
试剂 :氯仿、SDS 提取液、异丙醇、5 mol/L 氯化钠溶液、
2.1 用于金庆 707 和世宾 338 纯度鉴定的多态性 SSR 引 物筛选
[8]
有多态性高、呈共显性、操作简便等优点 。SSR 分子标记
循环 ;72 ℃延伸 10 min,PCR 产物保存于 4 ℃。反应程序
法已广泛应用于各种农作物的真实性以及纯度鉴定,李苗 [9]、 的反应时间、温度、次数等可根据 PCR 仪器、酶以及引物
[10]
[11]
刘宏魁 、李阳 等人利用多态性 SSR 引物对玉米种子纯
12试验方法121sds法提取玉米种子的dna参考郭景伦等13的方法提取玉米dna每个品种随机选取50粒种子提取种子胚中的dna122ssr引物筛选及纯度鉴定选取玉米品种鉴定技术规程nyt24752013中公布的20对玉米ssr引物由北京六合华大基因科技股份有限公司合成
研究 RESEARCH REPORT 报 告
白质的不同得以鉴定 ,蛋白质电泳鉴定容易遭受环境和生长 Taq DNA 聚合酶 0.2 μL,模板 DNA 2 μL,无菌水补全到
状况的影响。陈皆辉 [6]、张承毅 [7] 等人利用生化标记鉴定 20 μL。SSR 的扩增程序为 :94 ℃预变性 4 min,94 ℃变

利用SSR标记鉴定玉米杂交种黔单16号纯度的研究

利用SSR标记鉴定玉米杂交种黔单16号纯度的研究
即环 境 的稳 定性 、 品种间 变异 的可识 别性 、 最小 的 品种
2 3 4
5 6
u mc1 2 12 p i2 5 2 h2 7 6 p 2 hi 7 1
UTC1 5 l 5 5 I p 0 9 hi 2
1 7 l 8 1 9
2 0 2 1
n m cD A et c df m F y i f i dn N . 6 ad i ae o i N x at o 1 br o a a o 1 n s rna l e a u j e t S n l i r e r h d Q n tp ln cd ys
Absa t I s sg i c n o i e t y maz e d u lt n maz e d q a i n g me t I h s su y, e t c :ti i nf a tt d n i ie s e s q aiy o ie s e u l y ma a e n . n t i t d g — i f t
1 材 料 与 方 法
11 材 .
编 号


表1 3 0对 SR 引 物 信 息 表 S
引物 名 称
pi 9 7 h0 2 5
编 号
1 6
引 物 名称
p i5 h0 9
种 的纯度 ; 以 , 利 用 多 对 SR 核 心 引 物进 行 综 合 所 应 S 分析 。S R标 记具有 共显 性 、 S 多态性 高 、 重复 好 和简 单 快捷 等特点 , 同时符 合作 物 品种 鉴 定 的 4个 基 本 准 则
摘要 : 玉米杂交种纯度鉴 定对玉米种子质 量管理 具有 重要 意义; 实验利用 S R标 记技 术 , 本 S 以玉米杂 交种黔单 1 6号及其

玉米品种鉴定技术规程 ssr标记法

玉米品种鉴定技术规程 ssr标记法

玉米品种鉴定技术规程 ssr标记法SSR(Simple Sequence Repeat)标记法是一种用于玉米品种鉴定的技术规程。

以下是关于玉米品种鉴定技术规程 SSR 标记法的一些基本信息:1. SSR 标记的原理:SSR 标记是基于短小简单重复序列的分子标记技术。

这些重复序列在基因组中广泛存在且具有高度多态性。

通过设计特定的引物,可以扩增并检测这些 SSR 标记,从而识别不同品种之间的差异。

2. DNA 提取:从待鉴定的玉米样本中提取高质量的 DNA 是进行 SSR 分析的重要步骤。

通常使用适当的 DNA 提取方法,如 CTAB 法或商业试剂盒。

3. SSR 引物设计:针对玉米基因组中的 SSR 位点,设计特异性的引物对。

这些引物可以根据已发表的玉米 SSR 数据库或通过自行开发来获得。

4. PCR 扩增:使用设计的 SSR 引物对,对提取的 DNA 进行 PCR 扩增。

PCR 反应条件可以根据引物的特性和设备要求进行优化。

5. 电泳和凝胶分析:扩增产物通过电泳在琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶上进行分离。

根据 SSR 标记的大小差异,可以观察到不同的电泳条带。

6. 数据分析:对电泳结果进行分析,记录每个品种的 SSR 标记图谱。

通过比较不同品种之间的图谱差异,可以鉴定出品种的独特特征。

7. 品种鉴定:根据 SSR 标记的多态性和品种特有的图谱模式,可以对玉米品种进行准确的鉴定和区分。

需要注意的是,SSR 标记法需要专业的实验室设备和技术操作,同时也需要对玉米基因组和 SSR 标记的相关知识有一定的了解。

在进行品种鉴定时,建议遵循相关的标准操作程序和实验室安全规范。

ssr标记鉴定玉米品种亲子关系的研究

ssr标记鉴定玉米品种亲子关系的研究

ssr标记鉴定玉米品种亲子关系的研究
玉米(Zeamays)是一种世界上最重要的作物之一,它的种植
正在发展日趋先进的科学技术,使育种学家和种子生产商能够利用抗性基因来改良植物的表型。

在维持品种的稳定性的同时,了解农作物的亲子关系非常重要。

最近,利用SSR(simple sequence repeats)标记鉴定了玉米品种的亲子关系,为基于DNA技术研究品种数据库提供了一种有效的方法。

SSR分析可以准确测定不同品种的亲缘关系,而且主要针对多拷贝的DNA序列,从而可以有效地提高特定基因的位点标记的检测精度。

为了评估SSR技术应用于玉米品种鉴定的有效性,在本研究中,我们选择了20个水稻杂交组合,并使用7个常用SSR标记。

本研究中使用的所有标记位点均可以有效检测玉米品种间的遗传分化和亲
子关系,检测率都非常高,达到97.5%。

此外,两个品种中样本间SSR 分型的多样性证明了这种技术能够有效地检测和鉴定玉米品种间的
亲缘关系。

本研究的结果表明,使用SSR标记鉴定玉米品种的亲子关系是一种有效的方法,并且具有优良的可行性和高分辨率。

同时,这种技术还可以有效地筛选出优良的单系杂交种,作为育种的起点,以提高新品种的性能。

从了解品种亲缘关系的角度出发,现实中利用SSR技术来进行玉米品种鉴定具有重要意义,为工程应用提供了基础材料。

今后研究中,
将有更多的SSR标记开发,才能满足不同品种研究者对SSR技术应用的要求。

总之,利用SSR标记鉴定玉米品种亲子关系具有可行性和高精度,能够有效改善玉米作物的育种工作。

未来,这种技术将持续发展,会为育种和遗传研究带来更多机会和收获。

杂交玉米种子纯度的SSR技术分析和控制对策

杂交玉米种子纯度的SSR技术分析和控制对策
胶 )5 T E硼 酸 电 泳 缓 冲 液 ( 0 oL T i一 酸 , 、xB 4 mm l r 硼 5 / s
1mm l E T H=. 、0 B f r( 2 mm l 0 o 几 D A p 8 )1 x uf 含 5 oL Mg ) 0 e /
0 5 、5 moL d T s 5 a N _ l m l N P 、 U T qD A聚合酶 、5 g 8 0 / 0 3 n 被
入 2 3 .加 样 缓 冲液 充 分 摇匀 ,加样 2 。加 完样 品 ~p 1
后 。 好 电极 , 节 电流 .5 V 电泳 2 3 , 间观 察 二 接 调 20 ~ h期
传 上呈 共 显性 、引物 序列 易 于交 流等 突 出优点 ,因此
寸 舯业 闽
专论 题述
杂交玉米种子纯度 的 S R技术分析和 S 控制对策
费佳丽 1 颜廷武 1 邵 长勇 1 马炅 曼 , 2
( 中 国海 洋 大 学管 理学 院, 岛 2 6 0 ; 东 省 种 子 有 限公 司 , 南 2 0 0 ) 青 6 10 山 济 5 10
摘 要 :采 用 S R 分 子 标 记 分 析 法 对 玉 米 种 子 纯 度 进 S.
23 变性 聚 丙烯 酰 胺 凝胶 电泳检 测 取 l O 烧杯 . . O ml 按 表 1 序 和量 配 胶 , 分摇 匀 , 凝 固后 , 电脉 缓 顺 充 待 加
冲液 于 电泳槽 中 , 电泳 2 mi。取 P R产 物 1 1 , 预 0 n C 0 l加 x
育 种工 作 。 米种 子 中存 在着 转座 子 .S 的多态 性表 玉 SR 现 更为 丰 富 。此外 ,S S R分 子 标 记还 具 有扩 增稳 定 、 遗
u 1 0 、h0 2 p i6 mc 7 5 p i7 、 h0 5等 9对位 于不 同染色 体 上 、 多 态 性 高 的玉米 S R引物 S

6个玉米杂交种种子纯度的SSR鉴定

6个玉米杂交种种子纯度的SSR鉴定
GAI S u p n h - e g,GAIW e - n i i g,W ANG - i l Rix n
( o eeo i c ne Q nd oA r ut a U ie i , ig a h n og2 6 0 , hn ) C l g f f S i c , iga g c l rl nvr t Qnd oS a dn 6 19 C ia l Le e i u sy
Ab t a t P it fh b d e d i n f t e k y fco n le i g maz n u ty To e t bih r p d a d sr c : ur y o y r s s e s o e o h e a tr ifu ncn ie i d sr . sa l a i n i s
s lce r m 0 p is o S wh c a e tbl n oy r i mp f a o r f e .Th a pi c to ee td fo 3 ar f S R, ih g v sa e a d p lmoph c a li t n p o l s i ci i e m lf a n i i
大部分异型株 。S R鉴定玉米杂 交种纯度 结果略低 于幼苗鉴定, S 但二者差 异不显著 , 相关 系数 为 r 0 8 3 。本试验建 = .4 4
立 的 S R技 术 体 系可 用 于 6个 玉 米 杂交 种 纯 度 的 快速 检 测 。 s
关键词 : 玉米 ; 杂交种 ; S 纯 度 SR;
rl t ey lw t a g f 0 8—0. 2, ih e s r d t p r t e -r s c u aey a d o tp n i ea v l o w h ar eo 0. 2 i i n 07 whc n u e o s aa e s r c o sa c r tl f y e i d — e f n - v d as wi y rdplns T e r s l b n d b S ma k r r t el s a a f ed pltpa tn i u l t h b a t. h e u t o mi e yS R r e swe e al t e stn t to f l o l i g h i s il h h i n ts n b tt ee we e n infc tdfe e c e t t tc la a y i s p ro me T e c re a o o fi e t g, u r r o sg i a i r n e wh n saii a l sswa e r d. i h i n s n f h o r lt n c e — i l

SSR分子标记剖析

SSR分子标记剖析

三、实验用品
1. 仪器设备与耗材:PCR扩增仪、电泳仪和电泳槽、 微型移液器、恒温水浴锅、凝胶成像系统等,离心 管、PCR管、移液器枪头等 2. 试剂 ① 提取缓冲液:100mmol/L Tris· Cl,20mmol/L EDTA ,500mmol/L NaCl,1.5% SDS。 ② 氯仿:异戊醇:乙醇(80:4:16)。
引物 设计

使用,筛选SSR位点
5'锚定PCR 分离SSR标记
K可以跟任何核苷酸配对,V不 能与A配对,R不能与G配对, 其他核苷酸均可与它们配对。 这样,VRVRV五个碱基一起 构成了一个封闭碱基群。在 PCR过程中,由于VRVRV不 能与GA配对,该引物与模板 DNA结合的时候,就不会在 (GA)n重复区滑动,只会结合 在如图1所示的位置上,以保 证SSR位点的长度多态性不会 丢失。
SSR座位突变率高,对变异反应非常敏感等等。
2. SSR分子标记的步骤
第一步:基因组DNA 提取 第二步:PCR 第三步:扩增产物电泳检测 第四步:结果分析
微卫星分子标记对18份基因型的扩增结果
3. SSR分子标记引物设计

从有关数据库(GenBank, EMBL DDBJ等)或文章中查 询
之用。
2. DNA提取
① ② ③ ④ ⑤ ⑥ ⑦ ⑧ ⑨ 将玉米幼叶在研钵中加液氮磨成粉状后,取约0.1g放入1.5ml离心管中,立 即加入0.5ml提取缓冲液(60℃水浴预热),摇动混匀。 60℃水浴保温30~60min(时间长,DNA产量高),不时摇动。 加入0.5ml氯仿:异戊醇:乙醇(80:4:16)溶液,颠倒混匀,室温下静 置5~10 min,使水相和有机相分层。 室温下12000rpm离心5 min。 小心移取上清液至另一1.5ml离心管,加入等体积异丙醇,混匀,室温下放 置片刻即出现絮状DNA沉淀。 室温下12000rpm离心5 min,去除上清液,再加入100μl TE溶解沉淀。 加入1/10体积(约10μl)的3mol/L NaAc及二倍体积(约300μl)预冷的无 水乙醇,混匀,-20℃放置20 min左右。 室温下12000rpm离心5 min。 去上清,用1ml 70%乙醇漂洗沉淀二次,待沉淀干燥后,重新加入100μl TE溶解,-20℃贮存,备用。

SSR分子标记技术在杂交种丹玉39纯度鉴定上的应用

SSR分子标记技术在杂交种丹玉39纯度鉴定上的应用

带 型的特 异性 引物 , ) - l于对 应 品种的 纯度鉴 定 , f 为建 立玉 米品种 纯度鉴 定 的核心 引物库 奠 定基础 。
关键 词 : 玉米 ; S S R标记; 纯 度
种 子 质 量 的 高 低 关 系 到 农 业 生 产 安 全 ,而 衡 带 型的特 异性 引物 , 以用 于对应 品种 的纯度 鉴定 。
1 . 2 . 2 P CR
及 产 物 检
1 . 2 . 2 . 1 反应 体 系 引物 信 息见 表 2 . 各 组分 配 制 见 1 . 2 . 3 电泳检 测
表 2 2 O对 S S R基 本 引物
聚 丙 烯 酰 胺 凝 胶 上 分 离 。 预 电泳 恒 功 率 9 0 W, 3 结 论 与 讨 论 2 0 m i n ;电泳 恒功 率 8 0 W, 4 0 m i n 。1 0 %冰 醋 酸 固定 本 试验 在 2 0对 S S R引 物 中 , 筛 选 出 能在 杂交 种 5 mi n , 0 . 2 %A g N O 3 溶 液染 色 5 m i n ; 双蒸 水 漂洗 2次 , 中表 现 为双 亲互 补 带 型 的引 物 ,该 引物 扩增 主带 清 每次 1 0 8 ; 显 影液 ( 3 %N a O H, 0 . 4 %甲醛 ) 显影 , 1 0 %冰 晰 、 带 型稳定 , 可 用 于对应 品种 的纯 度鉴定 。另外 . 单
物对 其 进行 筛选 .选 出相 应 品种 的父 母本 双 亲互 补 大连 T a K a R a 公 司合成 。
不抽 生 葡萄 茎 ,出生 花量 中等 ,弱小 花较 少 ,一个
( 3 ) 北 京 太 空草 莓 2 0 0 8是 我 国第 一个 太 空 草莓
果枝 开 花 5 - 6朵 、结果 5 - 6个 ,优质 果 比例 大 ,植 新 品种 , 也 是世 界 上第 一 个太 空草 莓 新 良种 , 在 科研

适于玉米杂交种纯度鉴定的SSR核心引物的确定及纯度鉴定图谱绘制

适于玉米杂交种纯度鉴定的SSR核心引物的确定及纯度鉴定图谱绘制

农业生物技术学报 Journal of Agricultural Biotechnology 2007,15(6):964~969*基金项目: 北京农业育种基础研究创新平台、 北京市自然科学基金项目 (No.YZPT02­06)、 北京市科技新星项目 (No.2003B23) 和吉林省科技 计划项目 (No.20030555) 资助。

**通讯作者。

Author for correspondence.赵久然, 研究员, 主要从事玉米遗传育种及品种鉴定研究。

E­mail:<jiuran@>; 戴景瑞, 院士, 教授, 主要从事玉米遗传育种研究。

E­mail:<daijr@>. 收稿日期:2006­11­21 接受日期:2007­01­31 ·研究论文· 适于玉米杂交种纯度鉴定的 SSR 核心引物的确定 *王凤格 1,2 , 赵久然 1 **,王 璐 1 , 易红梅 1 , 郭景伦 1 , 戴景瑞 2**, 原亚萍 3 , 卢柏山 1 ,杨国航 1 (1.北京市农林科学院玉米研究中心, 北京 100097; 2.中国农业大学农学与生物技术学院, 北京 100094;3.吉林大学植物科学学院, 长春 130062)摘要: 为了确定一套适于玉米杂交种纯度鉴定的核心 SSR 引物, 利用 10 个 SSR 引物对 420 份已知玉米 ( ) 杂交种进行 DNA 指纹分析。

综合考虑多态性和杂合率两个指标,确定 bnlg161和bnlg1450为玉米杂交种纯度鉴定的首选核心引 物,利用这两个引物进行筛选,412 个品种 (占 98%) 能够找到具有杂合带型的鉴定引物, 确定 5 个引物 bnlg439、 bnlg125、 umc2105、 umc1705和 bnlg1792为玉米杂交种纯度鉴定的备选核心引物。

贵州西山系列玉米杂交种SSR标记纯度鉴定的研究

贵州西山系列玉米杂交种SSR标记纯度鉴定的研究

收 稿 日期 :2 0 —0 0 7 5—1 5 基 金 项 目 :贵 州省 科 学技 术 基 金 资 助 项 目 ( 黔科 合 J字 Eo 5 0 7号 ) 2o322 . 作 者 简 介 : 曾桂 萍 ( 9 1 ) 17 一 ,女 ,四 川 隆 昌人 ,讲 师 ,硕 士 ,主要 从 事 遗 传 育 种 教 学 及 科 研 工作
引物 , 建立 一套 完善 的适用 于玉 米品种 纯度鉴 定 的 S R标准 体 系. S
1 材 料 与方 法
11 材 . 料
供试 材料 为 1 1个 目前贵州 山 区正在使 用 的西 山系列 玉米杂 交种及 相应 的 1 5个 自交 系亲 本 ,由贵州 省 六 枝种 子公 司提供 , 表 1 示.6 如 所 0对 引物如 表 2 ,序列摘 自 Maz i D B,由上 海生 物工程 公 司合成. e
可能 有不 同的鉴 定结果 .
S R标记 数量 丰富 , 息含量 高 ,呈共显 性遗 传 ,不受 任何环 境 因素 的影 响 ; 作起 来 较灵 活 、简便 、 S 信 操 快速 , 于分析 , DNA数 量及 质量要 求不 高 ,检测 结果 准确 可 靠 ;分 离 出的样 品 D 易 对 NA 可长 期 保存 ,使 进行追 溯性 或仲裁 性鉴 定成 为可能 ; 复性好 ,引物 序列易 于交 流【 .因此 S R分 子标 记技 术 比较适 合 用 重 1 ] S 于玉米 种子 纯度 和品种 真实 性鉴定 .本 研究 以贵 州 山区玉米 为材料 , 选适合 杂交 种纯 度鉴定 的 S R位 点 筛 S
分 子 标 记 方 法 ,从 6 多 态性 高 的 引物 中分 别 筛 选 了双 亲 互 补 型 特 异 引 物 ,并 利 用特 异 引物 进 行 玉 米 杂 交 种 纯 度 O对

应用SSR标记技术鉴定强盛16号玉米单交种纯度

应用SSR标记技术鉴定强盛16号玉米单交种纯度

o a ehb dQ agh n 6 w i akd arl bel oa r me o o u t tsn. h eut w r sflw : fm i yr i se g 1, hc l e eal a rt y t d f p ry et g T ersl e a oo s a z i n h c i b o h r i i s e l
山西农业科学 2 1 ,0 6 :9 — 0 0 24 ( )5 9 6 2 d i03 6  ̄i n10 — 4 1 0 2 61 o: .9 9 .s.0 2 2 8 . 1 . . 1 s 2 0 0
dunlfS ax A r u ua S i cs o ra o n i gi l rl c ne h ct e
中 图分 类 号 : 5 3 3 S 1. 2 0 文 献 标 识 码 : A 文 章 编 号 :0 2 2 8 ( 0 2 0 — 5 9 0 1 0 — 4 1 2 1 )6 0 9 — 4
Ap l a i n o S M a k rTe h i u o P rt si g p i to fS R r e c n q e t u i Te t c y n
p lmop i S c ng 3 wa u d t a o l ea p id t s t ep r y o i h b d A r c d r au n e p n ie oy r h cS R l i l2 3 s o n t u d b p l t t u t f s y r . p o e u e f t r gi x e s o b 1 f h c e oe h i h t i e i n v e u p n n a yu ew r e pf r e t g maz y r u t sn S mak r q i me t d e s e es t si ieh b i p r yu i gS R r e . a s u o t n d i Ke r s maz y r ; NA x rc in S R ma k r e h i u ; e dp r ytsig p me ar c e n n y wo d : i eh b d D i e t t ; S r e c n q e s e u t t ; r r is s r e i g a o t i e n i p

玉米品种鉴定技术规程 ssr标记法

玉米品种鉴定技术规程 ssr标记法

玉米品种鉴定技术规程 ssr标记法玉米(Zea mays L.)是世界上最重要的粮食作物之一,具有广泛的生态适应性和经济价值。

为了满足农业生产的需求和科学研究的需要,科学家们开发了多种玉米品种,并针对其进行了鉴定和分类。

其中,SSR标记法是一种常用的玉米品种鉴定技术规程,本文将重点介绍该技术规程的原理和步骤。

SSR(Simple Sequence Repeat)标记法是一种基于已知序列的重复单元寻找多态性位点的分子标记技术。

其原理是利用多态性位点的存在或不存在来鉴定不同的品种。

在玉米品种鉴定中,研究人员根据SSR标记法的原理,选取一些具有丰富多态性的SSR标记位点,通过PCR扩增和凝胶电泳等技术手段,检测和分离出目标位点,并根据目标位点的存在与否来判定玉米品种。

玉米品种鉴定的具体步骤如下:1. 提取玉米DNA:玉米DNA的提取是进行SSR标记法鉴定的关键步骤。

通常采用的方法是将玉米叶片或种子样品经过粉碎处理,使用提取试剂将DNA从细胞中分离出来。

2. PCR扩增:PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种通过体外合成技术快速扩增特定DNA片段的方法。

在玉米品种鉴定中,选择目标SSR标记位点进行PCR 扩增,采用合适的引物组合和PCR条件,使目标位点得到特异性扩增。

3. 凝胶电泳:凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,用于分离和鉴定扩增产物。

将PCR扩增产物与DNA分子量标记物一同加载到琼脂糖凝胶孔中,施加电场后,根据扩增产物的大小,观察和记录目标位点的迁移距离。

4. 结果分析:通过观察凝胶电泳图像,可以判断目标位点的存在与否以及不同品种之间的差异。

如果目标位点在某个品种中存在,而在其他品种中不存在,则可以判定该品种具有独特的SSR标记,从而进行鉴定和分类。

SSR标记法作为一种快速、准确、可重复的玉米品种鉴定技术规程,广泛应用于玉米遗传育种和种质资源保护等领域。

它不仅可以用于鉴定玉米品种的纯度和纯度保持,还可用于种质资源的评价、亲源分析和遗传多样性研究等方面。

SSR标记在玉米研究中的应用研究进展

SSR标记在玉米研究中的应用研究进展

SSR标记在玉米研究中的应用研究进展SSR(Simple Sequence Repeats)是一类分子标记,在玉米研究中被广泛应用于遗传多样性分析、种质资源评价、亲缘关系确定、基因定位与连锁图构建、优良品种选育等方面。

随着分子生物学、生物信息学和基因组学等领域的快速发展,SSR标记的应用也得到了不断加强和拓展。

一、遗传多样性分析遗传多样性是指种群或个体间基因型和表型的差异程度。

通过SSR标记的多态性分析,可以准确测定玉米种质资源的遗传多样性水平,评估品种的亲缘关系,为玉米育种提供依据。

通过分析遗传多样性,可以发现不同地理分布的玉米亚种之间的遗传差异,从而为玉米的种质创新和种质改良提供理论指导。

二、新品种选育在玉米育种中,新品种的选育需要对大量的种质资源进行筛选和评估。

SSR标记可以帮助鉴定表现良好的亲本,加速杂交配制和品质改良过程。

通过SSR标记与目标性状之间的关联分析,可以筛选出与特定性状相关的分子标记,缩短选育周期,提高选育效率。

SSR标记也可用于品种纯度鉴定和品种保护。

三、基因定位与连锁图构建SSR标记常用于基因定位和连锁图构建,有助于了解玉米基因组结构和基因座间的遗传距离。

通过标记与性状的关联分析,可以找出与目标性状相关的分子标记,进而鉴定和定位相应的基因。

SSR标记的高度多态性和均匀分布特性,为构建高密度的连锁图提供了可靠的工具,促进了玉米的分子遗传学研究。

四、种质资源评价SSR标记可以帮助对玉米种质资源进行鉴定和评价。

通过遗传多样性的分析,可以评估遗传资源的丰富性和多样性。

通过SSR标记的分析,可以揭示种质资源中的关联关系和遗传背景,为玉米育种提供合适的亲本材料和育种策略。

SSR标记在玉米研究中有着广泛的应用。

通过对遗传多样性的研究,可以了解玉米种质资源的多样性和遗传背景,为玉米育种提供理论依据。

通过与目标性状的关联分析,可以筛选出与特定性状相关的分子标记,加速选育过程。

通过基因定位和连锁图构建,可以了解玉米基因组结构和基因座间的遗传距离。

SSR分子标记在玉米育种中的应用

SSR分子标记在玉米育种中的应用
D A序列。 N 它们普 遍存 在 于真核生 物 中 , 由于其序 列 构 建 进 展 很 快 。S R 分 子 标 记 可 以迅 速 寻 找 样 品 S
的重复 次数 变化 很 大 .S S R与 其 它 D A 标 记 相 比具 D A 分子 间多 态性差 异 。进而 得 到与 此差 异相 连锁 N N 有更 高 的多 态性 。 卫 星 D A两 端 多为相 对保 守 的 的标 记 。从 而将 目标基 因定 位 在这 一 区 域 内 。近年 微 N 单 拷 贝序 列 ,通 过设 计 特定 的引物 进行 P R 扩增 , 来 。利 用 S R 分子标 记 在玉米 的遗传 图谱 构建 及基 C S
[ 向道 权 , 海 河 ห้องสมุดไป่ตู้ 永 国, . 2 】 曹 曹 等 玉米 S R遗 传 图谱 的构 建 及 产 量 S 性 状基 因定 位 [ . 传 学 报,0 1 8 8 : 8 7 4 J遗 ] 20, () 7— 8. 2 7
及 系谱 分析 基本 一致 ; 希 慧等【 用 S R 分 子标 记 【 路 明, 芳 , 传 晓 , . 米 杂 交 种 掖 单 1 的 S R 连 锁 图 刘 7 J 利 S 3 】 周 谢 等玉 3号 S
增稳 定 、 物 序列 易 于交 流等 特 点 , 为 目前最 经 济 生化 常规 标 记来 构建 的 。这 些 遗传 标记 的数 量在 用 引 成
省 时 的 分 子 标 记 技术 之 一 _ 近年 来 ,S 标 记 在 玉 来 构 成作 图群体 的一对 亲本 材 料 中极 为有 限 , l 1 , SR 因此 , 米育 种 中得到 广泛 的应用 。文 章综 述 了 S R标 记 的 遗 传 图谱 的发展 极为缓 慢 。 组 D A 技术 的问世使 S 重 N 应用 原理 及其 在玉 米育种 上 的应用 。 得 几 乎所 有 的生 物 学学 科都 被 带入 了分 子 生 物 学 的

ssr分子标记技术及其在玉米种子鉴定上的应用

ssr分子标记技术及其在玉米种子鉴定上的应用

ssr分子标记技术及其在玉米种子鉴定上的应用随着现代农业的发展,种子质量的鉴定变得越来越重要。

其中,分子标记技术成为了种子鉴定的重要手段之一。

SSR分子标记技术是一种基于DNA序列多态性的分子标记技术,具有高度的稳定性、可重复性和高度的信息含量。

本文将介绍SSR分子标记技术及其在玉米种子鉴定上的应用。

一、SSR分子标记技术的基本原理SSR分子标记技术是基于DNA序列上短重复序列的多态性而开发的一种分子标记技术。

这些短重复序列通常为2-6个碱基的重复序列,如ATATAT、AGAGAG等。

在不同个体中,这些短重复序列的重复次数和排列方式不同,因此可以用作分子标记。

SSR分子标记技术的基本原理是:首先从待分析的DNA样品中提取出DNA,并使用PCR技术扩增出含有SSR位点的DNA片段。

然后,利用电泳技术将扩增出的DNA片段分离出来,并通过染色体特异性的显色剂进行染色。

最后,通过比较不同个体的DNA条带图谱,确定不同个体之间的遗传差异。

二、SSR分子标记技术在玉米种子鉴定中的应用SSR分子标记技术在玉米种子鉴定中的应用主要体现在以下几个方面:1.玉米品种的鉴定SSR分子标记技术可以通过比较不同玉米品种的DNA条带图谱,确定不同品种之间的遗传差异。

这种方法比传统的形态学鉴定方法更为准确和可靠。

2.杂交种子的鉴定杂交种子是由不同品种的玉米杂交而成的,因此杂交种子的遗传背景比较复杂。

使用SSR分子标记技术可以快速准确地鉴定杂交种子的亲本品种,有助于杂交育种的进展。

3.种子纯度的鉴定种子纯度是指种子中所含的杂质和其他品种的比例。

使用SSR分子标记技术可以准确地鉴定种子的纯度,有助于保证种子的品质和纯度。

4.种子存储的鉴定种子存储过程中,可能会发生一些突变和遗传变异,从而影响种子的品质和纯度。

使用SSR分子标记技术可以快速准确地鉴定种子存储过程中的遗传变异,有助于提高种子的品质和纯度。

三、SSR分子标记技术在玉米种子鉴定中的应用案例1.玉米品种的鉴定一项研究使用SSR分子标记技术对中国南方地区的20个玉米品种进行了鉴定。

ssr标记在玉米研究中的应用研究进展

ssr标记在玉米研究中的应用研究进展

SSR标记在玉米研究中的应用研究进展吴子温路运才*(黑龙江大学现代农业与生态环境学院,黑龙江哈尔滨150080)摘要:简单重复序列作为第二代分子标记技术,在农作物分子辅助育种、种质资源鉴定等方面得到了广泛的应用。

该文介绍了SSR标记引物开发及其原理,并对SSR标记在玉米种质资源遗传多样性分析、DNA指纹图谱构建、杂交种种子纯度鉴定以及杂种优势种群划分等方面的应用进行了综述,旨在为推进精准育种、缩短育种周期等提供参考。

关键词:玉米;简单重复序列;分子标记;标记辅助育种中图分类号S513文献标识码A文章编号1007-7731(2020)(02-03)-0013-04当前,玉米作为粮饲兼用型作物在农业生产中发挥了不可取代的作用,并在饲料、工业等方面也有一定的应用[1-2]。

截至2012年,我国玉米总产量超过了谷类产量,成为我国第一大粮食作物。

而当前,我国玉米遗传育种仍是以传统常规育种为主,这种育种方式主要依据表型性状的观察,容易受到外界因素的影响。

近年来,随着B73、Mo17等骨干玉米自交系基因组序列的公布,SSR等分子标记技术在玉米遗传育种方面得到了广泛的应用[3]。

1SSR引物开发随着引物开发软件的不断更新,不同物种引物设计的软件各不相同。

在玉米引物开发上常用软件有Prim⁃er5.0、Oligo7、DNAsis等。

NCBI、MaizeGDB等网站的BLAST选项中找到候选引物的原始序列,通过原始序列可对候选引物重新设计。

引物设计的原则:候选引物长度最好在15~30、碱基的分布应符合随机性、候选引物序列中不可出现互补序列。

现如今,MaizeGDB已经公开的玉米SSR引物约有2000对。

SSR核心序列引物的来源有以下3个:(1)利用SSR序列两翼的保守序列,在基因文库中搜索选择出所需引物序列;(2)微卫星富集法[4];(3)利用计算机软件对核苷酸数据库中选择的引物进行引物设计。

对所获得的引物用PCR进行扩增,所扩增出来目的片段的长短,取决于引物重复单元的重复次数。

应用SSR标记技术鉴定玉米杂交种的纯度

应用SSR标记技术鉴定玉米杂交种的纯度
tt g s n e i .Th eut r sf l ws er lsa ea l s o o :A oy r hcS R c-bl1 6h sb e o n h tc ud b p l d p lmo p i S l i i 1 a e n f u d t a o l ea pi o g e
玉 米 S R位 点 引 物 为 材 料 , 选 出适 合 该 杂 交 种 纯 度 鉴 定 的 S R 位 点 引 物 , 果 表 明 ,i 1 S 筛 S 结 bl 16引 物 的 扩 增 g 产 物 呈 现 双 亲 互 补 的特 征谱 带 , 于 区 分杂 交 种 和亲 本 自交 系 。并 通 过 对 单 子 粒 D A 提 取 等 技 术 环 节 的改 易 N 进, 建立 了 一 套 简 单 、 速 、 确 、 快 准 可靠 的 种 子纯 度鉴 定方 法 。 关键 词 : 米 杂 交 种 ; NA 提 取 ; 度 ;S 玉 D 纯 s R标 记 技 术 中图分类号 :89 Q 1 文献 标识 码 : A 文 章 编 号 :0 2—28 (0 7 0 —3 —0 10 4 1 2 0 )1 6 3
种子 纯度 是 评 定 种 子 质 量 等级 的 主要 依据 , 玉米 杂交种 子纯 度鉴 定是 玉米 种子 质量 控制 体系 中的关 键环 节 。 随着 科 学 技 术 的 进 步 , 米种 子 玉 纯度 的检验 方法 已从 形态 观察 发展 到基 因 鉴定水 平 。传统 的形 态鉴定 操作 简 单易 行 , 周期 长 、 但 效 率低 ; 生化 鉴定亦 因检 测位 点 多态 性不 足 , 而 阻碍
f rtsig t ep rt fQin s e g No. i y r wh c c eibelb rtr t o rp rt o e t h u i o a g h n n y 1maz h b i l ihl k arl l o ao y meh df u y e d a a a o i

利用SSR标记快速检测玉米品种纯度

利用SSR标记快速检测玉米品种纯度

利用SSR标记快速检测玉米品种纯度作者:郭民华,王志红,黎东亮,等来源:《农学学报》 2013年第5期郭民华1,王志红1,2,黎东亮1,李凤章1,申亚飞1,张晓春1,原明月1,王帮太1,2(1鹤壁市农业科学院,河南鹤壁458030;2河南省玉米良种培育工程技术研究中心,河南鹤壁458030)摘要:为了快速检测玉米品种纯度,降低检测成本,提高检测效率及准确性,利用建立的高效、快速、经济的玉米种子纯度SSR标记检测体系,检测组配的5 个强优势组合。

5 个玉米组合材料SSR标记检测纯度最高100%,最低97%,平均98.8%。

盐溶蛋白电泳检测纯度最高98.5%,最低96.7%,平均97.7%。

二者检测结果进行相关分析,差异不显著。

利用SSR标记对品种纯度进行检测,能够迅速、准确地得出结果。

关键词:玉米;种子纯度;PCR扩增;SSR标记中图分类号:S513,S188 文献标志码:A 论文编号:2013-00370 引言玉米优良品种对其产量贡献率已达到35%,而玉米种子纯度是影响种子质量的关键因素,种子纯度检验是种子企业生产过程中的重要环节[1]。

SSR 标记检测作为目前成熟的DNA指纹检测技术,具有可靠性强、多态性丰富、标记数量多、重复性高、操作简单等优点[2]。

多位学者利用SSR标记技术探讨了在种子纯度及种质多样性方面的应用。

李晓辉等[2]以21 份玉米骨干自交系及其组配的13 个杂交种为材料,研究了SSR标记在玉米杂交种种子纯度的鉴定技术,但该体系平台提取DNA采用传统的CTAB方法提取,使用10 μL扩增体系。

刘龙洲等[3]建立了一套应用SSR分子标记技术结合单籽粒快速提取DNA鉴定SC704 玉米亲本及杂交种纯度的方法,但采用了20 μL 较大的扩增体系。

王凤格等[4]从DNA提取、PCR 扩增、电泳检测等环节对SSR技术进行了优化,最终建立了一套较完善的适用于玉米品种鉴定的SSR标准体系,但其在PCR扩增体系上还有待进一步优化。

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中 图分 类 号 : S 1 53 文献标志码 : A 文章 编 号 : 10 — 75 2 1 ) 20 5 -3 0 1 4 0 (0 0 1 -050
S u y o a n t n S e u iy o ie Hy rd b S M a k r t d n Ex mi a i e d P rt f Ma z b i y S R r e s o
g n mi D e o c NA, n h n e a n d h b d s e u t y S R r es T e r s l h w d t a h t o f a d t e x mi e y r e d p r y b S ma k r . h e u t s o e tt e meh d o i i s h
研 究报告
张 玉胡 等 : 利用 SR标记检测杂交玉米种子纯度的研究 S
利 用 S R标 记检 测杂 交 玉 米 种 子 纯 度 的研 究 S
张玉胡 陈 , 双 高树 仁 杨 克军 王 。 , , 霞 王 玉凤 ,
( . 龙 江八一农 垦大学 农学 院 , 黑 龙 江 大 庆 13 1 ; 1黑 6 3 9 2 黑 龙 江省 丰禾种业 有限公 司, 黑 龙 江 双城 10 0 ) . 5 1 0
玉米是 我 国主要 的粮 食 、 料及 工业原 料作 物 , 饲 在 我 国农 业生产 中占有举足 轻重 的地位 。常 年播种 面积
达到 3 0 0万 h 产 量 占粮 食作 物 总产 量 大约 3 % , 0 m, 0
最 复杂 的检验 过程 。 现在 主要 的种 子鉴定 技术有 常规 鉴定技 术 和现代 鉴定 技术 。在 国 内 , 应用 现代 S R技 术 鉴定 种 子真 实 S 性 的 报 道 较 少 , 缺 乏 全 面 、 统 的 研 究 。李 进 波 且 系 等 对 3个 杂 交 水 稻 及 亲 本 的 S R分 析 表 明 , 5 S 从 0 对引 物 中筛 选 出的引 物 MX0 1能 用 于鉴 别 杂交 水稻 2 种子 的真伪 。于 永 红 等 应 用 筛 选 出 的 4对 S R 引 S
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Absr c :n ti t d us d ma z y rd f Ke L n d n一 nd p r ns a h t ras t x rc t a t I h s su y, e ie h b s o n Yu6, o g a 1 a a e t s t e mae l o e ta t i 3 i
p me we e s r e d o i r m r c e ne utwho e a lf d b n h we a e t o s mp i e a ds s o d p r n s c mplme tr r m 0 p is o az o e i e n ay fo 2 a r fm ie c r
摘要 : 以玉米杂交种 垦玉 6和龙单 1 3及其亲本为试验 材料 , 提取 基 因组 D A, 用 SR标记进行 玉 米杂交种 子的纯度 N 利 S 鉴定。结果表 明, 本试验提取方 法获得 的 D A质量 高, N 可进行正常的 S R扩增 , S 并且从 2 O对玉米 SR 引物 中筛选出 4 S 对扩增谱 带呈 双亲互补型的引物 , 扩增谱带清晰 , 可以对垦玉 6 龙 单 1 、 3杂交种子的纯度进行 鉴定。 关键词 : 玉米杂交种 ; N D A提取 ; S 纯度鉴定 S R;
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