实验五、动物细胞DNA的提取与鉴定
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DNA酚抽提法示意图
主要试剂的作用:
EDTA:(乙二胺四乙酸)
EDTA起两个作用:(1)鳌合细胞膜和骨架上的Ca2+、Mg2+ ,从而使细胞
更易破碎;(2)鳌合Mg2+ 使得内源性DNase没有Mg2+ 不能发挥作用,保持DA
的稳定性,Tris起缓冲pH值的作用
SDS :十二烷基硫酸钠
SDS是离子型表面活性剂,主要作用是:(1)破坏细胞膜及核膜;(2)解聚细 胞中的核蛋白;(3)与蛋白质结合,使蛋白质变性而沉淀下来;(4)抑制DNA酶 活性,使DNA分子尽量完整地分离出来
蛋白酶K:
水解蛋白质的作用,消化DNA酶和细胞中的蛋白质。
苯酚:蛋白质强变性剂
主要用于DNA提取时蛋白的去除,抑制DNA酶活性;
苯酚溶于有机溶剂,微溶于水;
提取DNA前苯酚用Tris-Hcl饱和,防止吸收过多DNA,降低DNA的 损失率; 氧化苯酚会破坏DNA。
氯仿:异戊醇(23:1):
主要用于DNA或者RNA提取时蛋白的去除; DNA提取时候,氯仿起变性蛋白质和将第一次抽提后的水相中的 酚带走的作用。异戊醇能降低分子表面张力,能减少抽提过程中 的泡沫产生,同时异戊醇有助于分相,增加界面的稳定性。
实验五 动物细胞DNA的 抽取与鉴定
指导:刘满清
一 实验目的
了解并掌握提取动物基因组DNA的原理和常用 方法; 掌握琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA的原理和方法, 增强实验室安全意识。
二 实验原理
动物DNA的提取是分子遗传学的基本操作。DNA提取的 基本程序包括细胞破碎、蛋白质变性并去除、沉淀DNA 并去除其他杂质3步;
不同生物(植物、动物、微生物)的基因组DNA的提取 方法有所不同; 不同种类或同一种类的不同组织因其 细胞结构及所含的成分不同,分离方法也有差异;
本实验介绍用酚抽提法提取血液基因组DNA。
酚抽提法:
先用EDTA、SDS、蛋白酶K破碎细胞,消化蛋白, 然后用pH8.0的Tris饱和酚或酚-氯仿抽提DNA,最 后乙醇或异丙醇进行沉淀 。获DNA大小为100- 150kb。
冰无水乙醇:
可以吸收分子之间的水,使DNA沉淀析出,无水乙醇使用前冰冻,
可以减少DNA沉淀析出洗涤DNA的作用,主要去盐和有机杂质。
三、实验仪器和试剂
主要的试验仪器:
主要的试剂及配制
DNA提取液SET:
10mmol/LTris·Cl(pH8.0),100mmol/LEDTA,500mmol/L NaCl, 20% SDS;
琼脂糖凝胶电泳
全血提取的基因组DNA电泳
动物组织提取基因组DNA
DNA降解电泳结果
五、作业
1、思考在整个基因组提取过程中,为什么要缓慢操 作?这与DNA本身的性质有什么联系? 2、对所得实验结果进行合理分析。
TE缓冲液(pH8.0) :
100mmol/LTris·Cl(pH8.0),1mmol/LEDTA(pH8.0), 室温保存;
氯仿-异戊醇(23:1):体积23:1 其它试剂:Tris饱和酚(购买)、无水乙醇、75%乙醇,琼脂糖粉。
四、实验方法与步骤
1.30-40ul血液+470ulSET+12.5ul20%SDS+6ul蛋白酶K 摇匀,55℃水浴过夜(按顺序加); 2.加苯酚500ul,10min摇匀,离心10000r/min 10min; 3.抽上清,加500ul氯仿异戊醇(23:1),20min摇匀,离心 10000r/min 10min;(重复1次) 4.抽上清,加无水乙醇(冰冻)1000ul,摇匀,冷冻于-20℃ (20分钟以上),离心10000r/min 2min; 5.弃上清,75%乙醇1000ul,离心10000r/min 2min; 6.弃上清,55℃烘干,加TE300ul溶解DNA沉淀或(加300ul 去离子水,溶解后电泳),4℃保存或电泳。 冷冻20min-2h,烘干30min左右,TE(可换做的ddH2O)