MALDI-TOF质谱技术在化脓性链球菌鉴定和分型中的应用

MALDI-TOF质谱技术在化脓性链球菌鉴定和分型中的应用邱军岭;秦娟秀;杨俊;张灏旻
【期刊名称】《检验医学与临床》
【年(卷),期】2018(15)A01
【摘要】目的以基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术用于化脓性链球菌的快速鉴定,并利用主成分聚类分析构建树状图区分不同emm分型
的化脓性链球菌菌株,探索MALDI-TOF MS方法对化脓性链球菌菌株鉴定和分型
的可行性。

方法复苏临床分离到的49株化脓性链球菌,使用MALDI-TOF MS采
集蛋白质质量图谱,用biotyper软件进行菌种鉴定,利用主成分(PCA)聚类分析构建树状图(Dendrogram)对菌株分型,同时应用PCR扩增emm基因,测序确定化脓性链球菌的emm基因型别,将主成分聚类分析结果与化脓性链球菌emm分型结果
比对。

结果 MALDI-TOF MS方法鉴定结果均为化脓性链球菌,与传统方法鉴定结
果均符合。

emm基因测序结果显示49株化脓性链球菌中emm1为13
株,emm12型为36株。

通过对各菌株蛋白质质量图谱进行主成分聚类分析,在相
对距离为1.1的情况下,分为A组(13株emm1型)和B组(36株emm12型),与测序结果一致。

通过ClinproTools软件对A组和B组化脓性链球菌质谱图分析,有5个离子峰作为其分型的主要依据,分别是在5 545.89、6 912.47、6 898.61、5 518.51和2 978.02(m/z)离子质荷比处。

结论实验室可使用已知分型的菌株使用MALDI-TOF MS采集蛋白质质量图谱并构建相应分型质谱图库,将待测菌株图谱与图库进行主成分聚类分析,通过构建树状图,可快速对化脓性链球菌emm进行分型。

【总页数】3页(P88-90)
【关键词】化脓性链球菌;MALDI-TOF;MS;emm基因
【作者】邱军岭;秦娟秀;杨俊;张灏旻
【作者单位】上海交通大学医学院附属仁济医院检验科,上海200127
【正文语种】中文
【中图分类】R977.15
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