除了MTT和CCK8,你还有SRB可以选择!
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除了MTT和CCK8,你还有SRB可以选择!
相信养过细胞的小伙伴们一定离不开做增殖曲线,然而每个人恐怕都遇到过做MTT重复性不好,换成CCK8又不舍得的心理纠结过程(土豪实验室请止步,下文不适合阅读),事实上除了这两种方法检测增殖外,你还有另外一种重复性好又经济的方法。
虽然步骤稍微繁琐,但其在增殖检测中具有独特的存在意义。
这一方法叫做SRB增殖检测。
SRB就是磺酰罗丹明B,确切的说是一种染料。
这种方法首次详细报道是在2006年,发表于Nature Protocol上1。
尽管这个方法似乎有些小众,但事实上确实经济划算效果好,在多次实践掌握方法后,做出来的增殖曲线可以说是误差线小到看不见,而且最为关键的一点是,重复性特别好!唯一的缺点就是步骤有些繁琐,但是其优良的重复性以及结果的稳定性,一定会让你觉得是非常值得的。
除了重复性好这一巨大优点,SRB在增殖检测中具有独特的意义。
这种意义主要体现于在做代谢相关课题的时候。
比如这篇发表于Nature Cell Biology的文章就大量用了SRB的方法来检测增殖2。
这篇文章主要是关于谷氨酰胺代谢,在这篇文章中大量运用SRB的原因主要在于其检测肿瘤增殖的机制。
这儿不得不提的是各个增殖检测方法的检测原理,MTT是通过活细胞线粒体中的琥珀酸脱氢酶将外源性MTT还原为水不溶性的蓝紫色结晶甲瓒,CCK8是通过细胞中的脱氢酶还原为具有高度水溶性的黄色甲瓒产物,另外一种更昂贵的检测细胞增殖的方法cell titer则是通过检测ATP反映细胞活力。
这些方法均与细胞代谢相关,当你不明确你做的基因或者药物是否会影响这些环节的时候,SRB应该相对来说是比较理想的方法。
SRB是一种能与生物大分子的碱性氨基酸结合的水溶性蛋白染料,其结合于细胞中量的多少可以反映总蛋白量进而反映细胞数的多少。
如果你的研究是关于肿瘤代谢的,那么SRB将是最为理想的检测方法。
下面简单介绍一下SRB的实验方法:
1)首先是利用10%三氯乙酸(有腐蚀性,注意点就行,没那么恐怖)进行固定,在4度中过夜(其实可以放很久,经常攒了好多板了一起做,固定时间不一样对结果没有什么影响)
2)之后用蒸馏水洗干净(固定后细胞还是很稳定的,基本不会被冲掉,不用太温柔,我一般都是甩掉,这一步其实自来水也没啥影响,不过还是推荐用纯水)
3)后晾干过夜(这一步可以在烘箱中37度烘干三十分钟,不着急就直接过夜就行了)
4)第二天开始染色,用0.4%浓度的SRB染色20分钟就足够了,然后用1%的乙酸洗干净(一定要洗的没有残留染料)
5)再次过夜晾干(还是可以烘干)
6)之后用10mM Trisbase 溶解后用510nm或570nm检测吸光度(颜色很深的时候推荐用510nm,其他时候建议570nm)
到这儿就结束了,虽然有点麻烦,但是确实重复性非常好,结果也非常稳定,当你需要有大量的板要测又苦于实验经费的时候,强烈建议使用这一方法,本人在做的时候往往一次会做50块板以上,习惯了其实很简单。
再提醒大家一下,买试剂的时候是用磺酰罗丹明B,而不是罗丹明B,这两个东西不一样。
参考文献
1. Vichai V, Kirtikara K. Sulforhodamine B colorimetric assay for cytotoxicity screening[J]. Nature protocols, 2006, 1(3): 1112-
1116.
2. Lien E C, Lyssiotis C A, Juvekar A, et al. Glutathione biosynthesis is a metabolic vulnerability in PI (3) K/Akt-driven breast cancer[J]. Nature cell biology, 2016, 18(5): 572-578.
华丽丽的分割线
李莫愁博士:感谢Sean的投稿,说实话,这种方法确实还挺麻烦的,但是如果实验结果好的话,这点耗时其实还是能忍受的。
好了,祝大家实验愉快,今天,呃,不是,是差不多今年就要策到这里了,接下去大家都没心思做实验了吧。