树脂型基因组DNA提纯试剂盒

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树脂型™基因组DNA提纯试剂盒
操作方法
1.将全血轻轻混匀,转移0.5ml全血到1ml纯化树脂中,颠倒混匀5~6次。


温下放置3分钟,其间颠倒混匀一次,5,000rpm离心3秒,收集沉淀。

2.用1ml GN结合液将纯化树脂悬浮,颠倒混匀,5,000rpm离心3秒,收集沉
淀。

3.用0.5ml漂洗液漂洗纯化树脂两次,颠倒混匀,5,000rpm离心3秒,收集沉
淀。

如果纯化树脂仍然呈现黄色或褐色,重复第3步一次。

4.用0.8ml无水乙醇悬浮纯化树脂,装入离心纯化柱,13,000rpm离心1分钟,
倒掉废液收集管中的乙醇,13,000rpm再离心1分钟,尽量除尽乙醇。

5.将离心纯化柱套入一个干净的1.5ml或2ml离心管中,开盖放置2~3分钟使
乙醇挥发干净。

加入100µl TE缓冲液于纯化树脂上(不能粘在管壁上),室温下放置3分钟,13,000rpm离心2分钟。

如果对基因组DNA的需求量较大的话,则重复第5步1~2次,这样可以获得高产量的基因组DNA。

TE缓冲液的用量视用户对浓度的要求而定。

离心柱放入离心管中,若盖不上盖子,亦没有关系,可开盖离心。

6.离心管中收集的液体即是洗脱下来的基因组DNA,取2µl电泳(1%琼脂糖,
120V,20分钟)检测。

-20℃保存备用。

补充说明
本系统不仅用于从全血中快速提纯基因组DNA,而且还可以从细菌培养液、动物组织培养细胞、动物组织、植物细胞中提纯基因组DNA。

从细菌培养液中提纯基因组DNA
A.对于革兰氏阴性菌,将1.5ml培养过夜的菌液(约5×106培养细胞)13,000rpm
离心30秒,收集菌体,将菌体悬浮于0.5ml PBS缓冲液或TE缓冲液中,然后与1ml纯化树脂混匀。

后续实验操作与从全血中提纯基因组DNA的操作方法相同。

B.对于革兰氏阳性菌,由于革兰氏阳性菌细胞壁比较厚,肽聚糖含量很高,破
壁比较困难,从而影响基因组DNA的得率,甚至提纯失败。

因此,对于革兰氏阳性菌要进行特殊的破壁处理。

将1.5ml菌液(收集过多会影响破壁效果)离心收集菌体,将菌体重悬于400µl50mM EDTA溶液,加入50μl溶菌酶(100mg/ml)(溶菌酶的质量和浓度会影响破壁效果)混匀,37℃温育30~60分钟,其间缓慢摇动,然后加入250μl STEP溶液,50℃缓慢摇动至少2小时,后续实验操作与从全血中提纯基因组DNA的操作方法相同。

(若离心管容量不够可分两管操作)葡萄球菌株要用溶葡萄球菌素(Malatesta M.L.et.al.,1992, Biotechniques 12,70)处理,处理这类菌株一般不能仅用溶菌酶。

为使革兰氏阳性菌株有效裂解,建议将这两种酶混合使用。

从动物组织(肝脏、脾脏、脊髓等)与动物组织培养细胞中提纯基因组DNA A.对于动物组织,将约20mg~50mg的动物组织置于匀浆器中,用1ml的纯化树
脂使其匀浆化;或者用液氮将约20mg~50mg的动物组织研磨为细粉后,与1ml 的纯化树脂混匀。

后续实验操作与从全血中提纯基因组DNA的操作方法相同。

B.对于动物组织培养细胞,将1.5ml培养细胞(约5×106培养细胞)13,000rpm
离心30秒,收集培养细胞,将培养细胞重悬于500µl PBS缓冲液或TE缓冲液中,与1ml纯化树脂混匀。

后续实验操作与从全血中提纯基因组DNA的操作方法相同。

从植物细胞中提纯基因组DNA
将约50mg~100mg的植物组织置于预冷匀浆器中,用0.5ml CTAB萃取缓冲液使其匀浆化;或者用液氮将50mg~100mg的植物组织研磨为细粉,转移到已预热至65℃的0.5ml CTAB萃取缓冲液中。

65℃温育15~20分钟,其间颠倒混匀几次,然后与1ml纯化树脂混匀。

后续实验操作与从全血中提纯基因组DNA的操作方法相同。

缓冲液的配制
TE缓冲液:总体积100ml
将1ml 1mol/L Tris-HCl(pH7.6)和0.2ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)混匀,补超纯水至100ml,高压灭菌,室温保存。

PBS缓冲液:总体积100ml
在80ml超纯水中溶解0.8g NaCl、0.02g KCl、0.144g Na
2HPO
4
和0.024g KH
2
PO
4

用HCl调节溶液的pH值至7.4,补超纯水至100 ml,高压灭菌,室温保存。

CTAB萃取缓冲液:总体积100ml
将10ml 1mol/L Tris-HCl(pH7.6),14ml 5mol/L NaCl,4.0ml 0.5mol/L EDTA (pH8.0),1g DTT和1g CTAB混匀,补超纯水至100ml,过滤灭菌,室温保存。

STEP溶液:
SDS 0.5%
Tris-HCl(pH8.0)150mM
EDTA 400mM
蛋白酶K 0.25mg/mL
常见问题及参考意见。

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